SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009544757.1 NCBI__GCF_000017845.1:WP_009544757.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

P74535 Bifunctional arginine dihydrolase/ornithine cyclodeaminase ArgZ; EC 3.5.3.27; EC 4.3.1.12 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
80% identity, 100% coverage: 1:703/703 of query aligns to 1:705/705 of P74535

query
sites
P74535
M
 
M
T
 
A
D
 
D
P
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
N
|
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
Q
D
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
Y
 
H
H
 
Q
A
 
T
I
 
I
K
 
K
E
 
E
R
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
M
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
E
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
|
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
|
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
N
H
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
A
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
V
V
 
R
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
L
E
 
P
E
 
D
V
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
T
T
 
V
P
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
R
 
R
T
 
V
I
 
I
Q
 
R
L
 
M
T
 
E
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
L
N
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
E
N
 
N
G
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
S
H
 
H
D
 
Q
V
 
I
M
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
M
T
 
T
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
P
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
V
 
L
C
 
C
D
 
D
I
 
I
N
 
N
T
 
T
E
 
E
T
 
T
V
 
V
T
 
T
K
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
C
 
C
E
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
Q
V
 
V
Q
 
T
N
 
G
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
T
P
 
S
Q
 
N
K
 
P
M
 
P
T
 
S
A
 
A
E
 
R
C
 
C
K
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
 
G
F
 
V
D
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
S
R
 
H
D
 
E
-
 
G
-
 
G
Q
 
T
R
 
R
N
 
K
G
 
E
K
 
N
K
 
K
E
 
E
F
 
F
T
 
A
F
 
F
M
 
M
G
 
A
S
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
W
 
W
E
 
E
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
H
L
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
M
 
T
M
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
H
L
 
L
K
 
K
V
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
S
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
G
I
 
I
A
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
F
I
 
I
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
C
 
C
V
 
V
K
 
K
H
 
N
N
 
N
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
V
 
C
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
D
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
D
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
D
 
D
M
 
M
I
 
I
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
S
T
 
S
M
 
M
L
 
L
H
 
H
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
D
 
D
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
Q
K
 
Q
L
 
L
T
 
T
H
 
R
P
 
P
Y
 
Y
P
 
S
L
 
L
V
 
A
G
 
E
T
 
T
V
 
L

Q8YMD9 Bifunctional arginine dihydrolase/ornithine cyclodeaminase AgrE; Arginine-guanidine removing enzyme; EC 3.5.3.27; EC 4.3.1.12 from Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) (see paper)
75% identity, 99% coverage: 1:697/703 of query aligns to 1:698/703 of Q8YMD9

query
sites
Q8YMD9
M
 
M
T
 
T
D
 
S
P
 
R
I
 
I
R
 
R
I
 
F
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
N
|
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
Q
Q
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
T
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
G
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
|
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
|
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
V
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
|
N
A
 
T
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
E
H
 
S
T
 
I
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
K
I
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
N
 
T
E
 
G
V
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
V
L
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
N
T
 
V
P
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
R
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
R
L
 
I
T
 
E
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
S
G
 
G
I
 
L
M
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
S
H
 
H
D
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
I
T
 
S
Q
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
V
 
E
C
 
R
D
 
D
I
 
A
N
 
K
T
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
T
 
I
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
G
E
 
Q
W
 
W
V
 
I
K
 
K
V
 
V
Q
 
E
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
Q
D
 
T
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
M
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
Q
C
 
C
K
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
M
 
I
V
 
V
G
 
D
F
 
V
D
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
T
E
 
E
D
 
S
R
 
R
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
N
 
N
G
 
-
K
 
T
K
 
Q
E
 
E
F
 
F
T
 
S
F
 
F
M
 
M
G
 
S
S
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
W
 
W
E
 
E
M
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
|
N
A
|
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
N
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
A
V
 
V
S
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
H
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
I
I
 
I
S
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
C
 
C
V
 
V
K
 
R
H
 
N
N
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
D
D
|
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
M
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
E
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
H
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
S
T
x
S
M
|
M
L
|
L
H
|
H
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
D
|
D
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
|
D
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
S
P
 
P
Y
 
Y

6lrgB Crystal structure of the ternary complex of agre with ornithine and NAD+ (see paper)
75% identity, 98% coverage: 5:694/703 of query aligns to 2:681/681 of 6lrgB

query
sites
6lrgB
I
 
I
R
 
R
I
 
F
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
Q
Q
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
T
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
L
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
G
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
V
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
T
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
E
H
 
S
T
 
I
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
K
I
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
N
 
T
E
 
G
V
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
V
L
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
N
T
 
V
P
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
R
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
R
L
 
I
T
 
E
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
S
G
 
G
I
 
L
M
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
S
H
 
H
D
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
I
T
 
S
Q
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
V
 
E
C
 
R
D
 
D
I
 
A
N
 
K
T
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
T
 
I
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
G
E
 
Q
W
 
W
V
 
I
K
 
K
V
 
V
Q
 
E
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
Q
D
 
T
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
M
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
Q
C
 
C
K
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
M
 
I
V
 
V
G
 
D
F
 
V
D
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
T
E
 
E
D
 
S
R
 
R
D
 
E
Q
 
Q
R
 
R
N
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
W
 
W
E
 
E
M
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
N
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
A
V
 
V
S
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
H
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
I
I
 
I
S
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
C
 
C
V
 
V
K
 
R
H
 
N
N
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
D
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
M
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
E
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
H
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
S
T
 
S
M
 
M
L
 
L
H
 
H
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
D
 
D
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
T
 
T

6lrgA Crystal structure of the ternary complex of agre with ornithine and NAD+ (see paper)
74% identity, 99% coverage: 2:697/703 of query aligns to 1:678/678 of 6lrgA

query
sites
6lrgA
T
 
T
D
 
S
P
 
R
I
 
I
R
 
R
I
 
F
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
Q
Q
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
T
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
L
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
G
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
V
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
T
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
E
H
 
S
T
 
I
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
K
I
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
N
 
T
E
 
G
V
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
V
L
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
N
T
 
V
P
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
R
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
R
L
 
I
T
 
E
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
S
G
 
G
I
 
L
M
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
S
H
 
H
D
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
I
T
 
S
Q
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
V
 
E
C
 
R
D
 
D
I
 
A
N
 
K
T
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
T
 
I
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
G
E
 
Q
W
 
W
V
 
I
K
 
K
V
 
V
Q
 
E
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
Q
D
 
T
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
M
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
Q
C
 
C
K
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
M
 
I
V
 
V
G
 
D
F
 
V
D
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
W
 
W
E
 
E
M
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
P
|
P
V
|
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
A
|
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
N
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
A
V
 
V
S
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
H
|
H
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
I
I
 
I
S
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
C
 
C
V
 
V
K
 
R
H
 
N
N
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
|
S
I
 
I
R
|
R
D
|
D
D
|
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
M
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
E
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
H
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
|
S
T
x
S
M
|
M
L
 
L
H
|
H
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
D
|
D
I
|
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
|
D
V
|
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
S
P
 
P
Y
 
Y

6lrhA Crystal structure of the binary complex of agre c264a mutant with l- arginine (see paper)
73% identity, 99% coverage: 2:696/703 of query aligns to 1:675/675 of 6lrhA

query
sites
6lrhA
T
 
T
D
 
S
P
 
R
I
 
I
R
 
R
I
 
F
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
R
D
 
D
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
Q
Q
 
G
L
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
A
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
T
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
L
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
G
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
|
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
A
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
V
P
 
A
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
I
E
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
T
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
E
H
 
S
T
 
I
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
K
I
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
S
L
 
L
N
 
T
E
 
G
V
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
x
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
V
L
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
N
T
 
V
P
 
Y
V
 
V
E
 
E
S
 
S
R
 
R
T
 
I
I
 
I
Q
 
R
L
 
I
T
 
E
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
S
G
 
G
I
 
L
M
 
I
N
 
N
K
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
V
E
 
D
N
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
F
E
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
E
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
S
H
 
H
D
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
E
 
E
I
 
I
M
 
I
T
 
S
Q
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
D
P
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
D
V
 
E
C
 
R
D
 
D
I
 
A
N
 
K
T
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
T
 
I
K
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
C
 
G
E
 
Q
W
 
W
V
 
I
K
 
K
V
 
V
Q
 
E
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
D
 
D
A
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
Q
D
 
T
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
M
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
Q
C
 
C
K
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
K
V
 
A
G
 
G
D
 
E
R
 
Q
V
 
V
M
 
I
V
 
V
G
 
D
F
 
V
D
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
R
Q
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
W
 
W
E
 
E
M
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
N
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
D
M
 
M
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
A
V
 
V
S
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
H
 
H
L
 
L
K
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
I
I
 
I
S
 
R
K
 
S
G
 
G
V
 
V
M
 
M
Y
 
Y
E
 
E
C
 
C
V
 
V
K
 
R
H
 
N
N
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
D
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
M
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
E
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
H
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
S
T
 
S
M
 
M
L
 
L
H
 
H
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
D
 
D
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
-
V
 
-
T
 
T
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
T
 
T
H
 
S
P
 
P

6jv0A Crystal structure of n-terminal domain of argz, bound to product, an arginine dihydrolase from the ornithine-ammonia cycle in cyanobacteria (see paper)
81% identity, 39% coverage: 3:274/703 of query aligns to 1:272/273 of 6jv0A

query
sites
6jv0A
D
 
D
P
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
W
 
W
M
|
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
Q
D
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
Y
 
H
H
 
Q
A
 
T
I
 
I
K
 
K
E
 
E
R
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
M
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
E
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
N
H
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
A
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
V
V
 
R
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
L

6juzA Crystal structure of n-terminal domain of argz(n71s) covalently bond to a reaction intermediate (see paper)
81% identity, 38% coverage: 5:274/703 of query aligns to 2:271/272 of 6juzA

query
sites
6juzA
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
M
 
M
C
 
C
A
 
P
P
 
P
D
 
D
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
|
I
N
 
N
P
 
P
W
 
W
M
 
M
E
 
E
G
 
G
N
 
N
I
 
I
H
 
H
K
 
K
S
 
S
T
 
S
R
 
Q
D
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
Y
 
H
H
 
Q
A
 
T
I
 
I
K
 
K
E
 
E
R
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
G
 
G
W
 
W
P
 
P
D
|
D
M
 
M
V
 
V
F
|
F
T
 
T
A
 
A
N
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
E
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
L
S
 
S
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
K
 
K
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
K
 
K
E
 
A
W
 
W
F
 
F
A
 
E
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
F
N
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
W
 
W
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
R
|
R
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
H
|
H
L
 
L
D
|
D
T
 
T
C
 
C
F
 
F
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
A
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
R
 
R
L
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
M
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Q
 
P
D
 
E
K
 
K
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
N
F
 
F
A
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
N
I
 
V
N
 
N
H
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
M
 
M
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
R
S
 
T
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
A
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
K
V
 
V
V
 
R
Q
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
L
K
 
K
A
|
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
V
 
V
N
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
L

Q9I4E3 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase; DDAH; Dimethylarginine dimethylaminohydrolase; Dimethylargininase; EC 3.5.3.18 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
22% identity, 35% coverage: 20:268/703 of query aligns to 14:253/254 of Q9I4E3

query
sites
Q9I4E3
V
 
L
I
 
V
N
 
D
P
 
G
W
 
L
M
 
T
E
 
S
G
 
S
N
 
H
I
 
L
H
 
G
K
 
K
S
 
P
T
 
D
R
 
Y
D
 
A
R
 
K
S
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
N
 
N
Q
 
A
L
 
Y
Y
 
I
H
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
E
 
T
R
 
C
A
 
D
I
 
V
-
 
D
V
 
I
E
 
T
L
 
L
V
 
L
E
 
P
P
 
P
Q
 
D
K
 
E
G
 
R
W
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
S
V
 
V
F
 
F
T
 
V
A
 
E
N
 
D
A
 
P
G
 
V
L
 
L
V
 
C
L
 
T
G
 
S
D
 
R
N
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
S
 
T
R
 
R
F
 
P
Y
 
G
H
 
A
K
 
E
E
 
S
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
T
P
 
E
Y
 
I
F
 
I
K
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
F
 
F
A
 
Y
A
 
P
N
 
G
G
 
K
F
 
V
N
 
E
V
 
R
Y
 
I
E
 
E
L
 
A
P
 
P
K
 
G
D
 
T
L
 
V
P
x
E
F
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
M
F
 
M
D
 
-
R
 
-
E
 
V
G
 
G
R
 
D
W
 
H
L
 
F
W
 
Y
A
 
I
G
 
G
Y
 
E
G
 
S
F
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
N
L
 
A
D
 
E
S
 
G
H
 
A
P
 
R
Y
 
Q
I
 
M
A
 
I
Q
 
A
W
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
K
E
 
H
V
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
G
R
 
S
L
 
V
I
 
V
D
 
R
-
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
V
Y
 
L
H
|
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
C
 
G
F
 
L
C
 
A
P
 
Y
L
 
L
T
 
E
G
 
H
G
 
N
Y
 
N
L
 
L
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
F
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
P
 
P
A
 
E
F
 
F
D
 
Q
A
 
D
Y
 
F
S
 
N
N
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
I
V
 
I
E
 
E
E
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
E
V
 
E
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
W
I
 
V
N
 
N
H
 
E
T
 
R
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
P
Q
 
A
I
 
G
S
 
Y
D
 
P
S
 
R
L
 
T
K
 
R
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
N
 
A
E
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
R
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
T
 
V
P
 
D
L
 
T
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
K
 
K
A
 
I
G
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
V
K
 
S
C
|
C
L
 
M
T
 
S
L
 
L
R
 
R

3rhyA Crystal structure of the dimethylarginine dimethylaminohydrolase adduct with 4-chloro-2-hydroxymethylpyridine (see paper)
22% identity, 34% coverage: 28:268/703 of query aligns to 16:247/248 of 3rhyA

query
sites
3rhyA
N
 
D
I
 
L
H
 
G
K
 
K
S
 
P
T
 
D
R
 
Y
D
 
A
R
 
K
S
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
N
 
N
Q
 
A
L
 
Y
Y
 
I
H
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
E
 
T
R
 
C
A
 
D
I
 
V
-
 
D
V
 
I
E
 
T
L
 
L
V
 
L
E
 
P
P
 
P
Q
 
D
K
 
E
G
 
R
W
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
S
V
 
V
F
|
F
T
 
V
A
 
E
N
 
D
A
 
P
G
 
V
L
 
L
V
 
C
L
 
T
G
 
S
D
 
R
N
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
S
 
T
R
 
R
F
 
P
Y
 
G
H
 
A
K
 
E
E
 
S
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
T
P
 
E
Y
 
I
F
 
I
K
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
F
 
F
A
 
Y
A
 
P
N
 
G
G
 
K
F
 
V
N
 
E
V
 
R
Y
 
I
E
 
E
L
 
A
P
 
P
K
 
G
D
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
M
F
 
M
D
 
-
R
 
-
E
 
V
G
 
G
R
 
D
W
 
H
L
 
F
W
 
Y
A
 
I
G
 
G
Y
 
E
G
 
S
F
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
N
L
 
A
D
 
E
S
 
G
H
 
A
P
 
R
Y
 
Q
I
 
M
A
 
I
Q
 
A
W
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
K
E
 
H
V
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
G
R
 
S
L
 
V
I
 
V
D
 
R
-
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
V
Y
 
L
H
|
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
C
 
G
F
 
L
C
 
A
P
 
Y
L
 
L
T
 
E
G
 
H
G
 
N
Y
 
N
L
 
L
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
F
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
P
 
P
A
 
E
F
 
F
D
 
Q
A
 
D
Y
 
F
S
 
N
N
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
I
V
 
I
E
 
E
E
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
E
V
 
E
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
W
I
 
V
N
 
N
H
 
E
T
 
R
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
P
Q
 
A
I
 
G
S
 
Y
D
 
P
S
 
R
L
 
T
K
 
R
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
N
 
A
E
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
R
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
T
 
V
P
 
D
L
 
T
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
K
 
K
A
 
I
G
x
D
G
 
G
A
 
G
A
 
V
K
 
S
C
|
C
L
 
M
T
 
S
L
 
L
R
 
R

Q9SMZ4 Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase; cAt-LKR/SDH; LKR/SDH; EC 1.5.1.8; EC 1.5.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 11% coverage: 288:361/703 of query aligns to 482:552/1064 of Q9SMZ4

query
sites
Q9SMZ4
I
 
V
Q
 
S
L
 
L
T
 
S
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
D
A
 
K
G
 
F
I
 
L
M
 
I
N
 
N
K
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
I
 
I
V
 
E
E
 
A
N
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
H
V
 
L
L
 
A
N
 
K
F
 
C
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
S
R
 
A
Q
 
D
S
 
A
T
 
E
S
 
S
A
 
Y
A
 
S
E
 
E
V
 
L
R
 
E
V
 
V
S
 
G
A
 
A
P
 
D
D
 
D
H
 
K
D
 
R
V
 
V
M
 
L
E
 
D
E
 
Q
I
 
I
M
 
I
T
 
D
Q
 
S
L
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
G
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
P
 
N
P
 
P
Q
x
N
E
|
E

Sites not aligning to the query:

1h70A Ddah from pseudomonas aeruginosa. C249s mutant complexed with citrulline (see paper)
21% identity, 35% coverage: 20:268/703 of query aligns to 15:254/255 of 1h70A

query
sites
1h70A
V
 
L
I
 
V
N
 
D
P
 
G
W
x
L
M
 
T
E
 
S
G
 
S
N
 
H
I
 
L
H
 
G
K
 
K
S
 
P
T
 
D
R
 
Y
D
 
A
R
 
K
S
 
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
Q
W
 
H
N
 
N
Q
 
A
L
 
Y
Y
 
I
H
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
E
 
T
R
 
C
A
 
D
I
 
V
-
 
D
V
 
I
E
 
T
L
 
L
V
 
L
E
 
P
P
 
P
Q
 
D
K
 
E
G
 
R
W
 
F
P
 
P
D
|
D
M
 
S
V
 
V
F
|
F
T
 
V
A
x
E
N
x
D
A
 
P
G
 
V
L
 
L
V
 
C
L
 
T
G
 
S
D
 
R
N
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
S
 
T
R
 
R
F
 
P
Y
 
G
H
 
A
K
 
E
E
 
S
R
|
R
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
T
P
 
E
Y
 
I
F
 
I
K
 
E
E
 
E
W
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
F
 
F
A
 
Y
A
 
P
N
 
G
G
 
K
F
 
V
N
 
E
V
 
R
Y
 
I
E
 
E
L
 
A
P
 
P
K
 
G
D
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
M
F
 
M
D
 
-
R
 
-
E
 
V
G
 
G
R
 
D
W
 
H
L
 
F
W
 
Y
A
 
I
G
 
G
Y
 
E
G
 
S
F
 
A
R
|
R
S
 
T
E
 
N
L
 
A
D
 
E
S
 
G
H
 
A
P
 
R
Y
 
Q
I
 
M
A
 
I
Q
 
A
W
 
I
L
 
L
D
 
E
T
 
K
E
 
H
V
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
G
R
 
S
L
 
V
I
 
V
D
 
R
-
 
L
E
 
E
R
 
K
F
 
V
Y
 
L
H
|
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
C
 
G
F
 
L
C
 
A
P
 
Y
L
 
L
T
 
E
G
 
H
G
 
N
Y
 
N
L
 
L
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
F
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
P
 
P
A
 
E
F
 
F
D
 
Q
A
 
D
Y
 
F
S
 
N
N
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
I
V
 
I
E
 
E
E
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
E
V
 
E
K
 
S
F
 
Y
A
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
W
I
 
V
N
 
N
H
 
E
T
 
R
I
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
P
Q
 
A
I
 
G
S
 
Y
D
 
P
S
 
R
L
 
T
K
 
R
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
N
 
A
E
 
R
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
R
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
T
 
V
P
 
D
L
 
T
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
K
 
K
A
x
I
G
x
D
G
 
G
A
 
G
A
 
V
K
 
S
C
x
S
L
 
M
T
 
S
L
 
L
R
 
R

Query Sequence

>WP_009544757.1 NCBI__GCF_000017845.1:WP_009544757.1
MTDPIRILMCAPDHYDVDYVINPWMEGNIHKSTRDRSVEQWNQLYHAIKERAIVELVEPQ
KGWPDMVFTANAGLVLGDNAIVSRFYHKERQGEEPYFKEWFAANGFNVYELPKDLPFEGA
GDALFDREGRWLWAGYGFRSELDSHPYIAQWLDTEVLSLRLIDERFYHLDTCFCPLTGGY
LLYYPPAFDAYSNRLIELRIPQDKRIVVEEPDAVKFACNAVNINHTIIMNQISDSLKQRL
NEVGFEVVQTPLSEFLKAGGAAKCLTLRVNEPVLEEVHASTPVESRTIQLTGHLLDAGIM
NKALDMIVENGGSFKVLNFELGLERQSTSAAEVRVSAPDHDVMEEIMTQLIDLGAVAPPQ
EVCDINTETVTKAGVAPDDFYVSTIYPTEVRVNCEWVKVQNQRMDAAIVVDPQKMTAECK
LLRDLAVGDRVMVGFDGIRTVRQVEDRDQRNGKKEFTFMGSGVSSERRVELLVEQIAWEM
RQVRDQGGKVVVTAGPVVIHTGGAQHLAKLIREGYVHALLGGNAIAVHDIEQAMMGTSLG
VDMQRGIPVSGGHRHHLKVINTVRRYGSIAQAVEQGAISKGVMYECVKHNVPFVLAGSIR
DDGPLPDTEMDLIKAQSRYAELIQGTDMILMLSTMLHSIGVGNMTPAGVKMVCVDINPAV
VTKLSDRGSVESVGIVTDVGLFLSLLVQQLDKLTHPYPLVGTV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory