SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009567628.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_009567628.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
49% identity, 96% coverage: 6:270/276 of query aligns to 3:268/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
G
V
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
K
A
 
N
L
 
L
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
Q
A
 
Q
H
 
T
P
 
G
-
 
G
E
 
A
L
 
A
Q
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
G
x
D
R
|
R
S
 
P
G
 
D
A
 
S
A
 
T
Y
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
G
A
 
R
L
 
I
G
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
L
T
 
S
A
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
K
A
 
V
L
 
C
A
 
E
D
 
E
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
H
V
 
P
E
 
S
A
x
V
A
 
T
L
 
L
A
 
K
H
 
N
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
C
 
C
V
 
R
A
 
K
V
 
A
A
 
R
K
 
R
P
 
A
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
S
M
 
A
N
 
D
Q
 
E
R
 
K
A
 
L
E
 
L
L
 
L
E
 
A
N
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
K
H
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
C
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
D
A
 
T
I
 
A
T
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
A
K
 
Q
G
 
A
R
 
L
G
 
G
Q
 
R
R
 
D
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
G
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
Q
P
 
T
G
 
G
P
 
A
R
 
R
M
 
A
A
 
R
G
 
E
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
T
V
 
V
W
 
L
M
 
F
A
 
A
G
 
A
T
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
R

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 3:269/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
x
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
x
E
R
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
x
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
|
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

P04036 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 7:273/273 of P04036

query
sites
P04036
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
x
E
R
|
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
 
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
|
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 4:270/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
x
E
R
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
x
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
 
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
L
 
M
N
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 4:270/270 of 1druA

query
sites
1druA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
x
E
R
|
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
x
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 4:270/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
 
G
V
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
R
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
 
F
G
 
T
P
 
R
V
 
P
E
 
E
A
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
 
A
N
 
N
M
 
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 6:272/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
x
E
R
|
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

1dihA Three-dimensional structure of e. Coli dihydrodipicolinate reductase (see paper)
49% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 6:272/272 of 1dihA

query
sites
1dihA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
L
P
 
E
E
 
G
L
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
R
|
R
S
 
E
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
Q
 
G
A
 
K
L
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
T
V
 
V
T
 
Q
A
 
S
D
 
S
L
 
L
G
 
D
G
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
D
D
 
D
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
R
V
 
P
E
 
E
A
x
G
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
F
C
 
C
V
 
R
A
 
Q
V
 
H
A
 
G
K
 
K
P
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
D
M
 
E
N
 
A
Q
 
G
R
 
K
A
 
Q
E
 
A
L
 
I
E
 
R
N
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
A
H
 
D
I
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
A
 
A
P
 
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
A
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
R
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
C
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
S
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
A
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
L

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 3:269/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
V
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
V
 
H
A
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
A
Q
 
K
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
S
G
x
E
R
|
R
S
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
Q
 
G
A
 
K
L
 
F
G
 
D
L
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
C
A
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
G
 
K
A
 
Q
L
 
I
A
 
D
D
 
Q
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
A
V
 
P
E
 
A
A
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
L
C
 
C
V
 
Q
A
 
Q
V
 
Y
A
 
G
K
 
K
P
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
E
N
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
E
 
Q
L
 
I
E
 
D
N
 
L
A
 
V
S
 
A
R
 
Q
H
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
G
G
 
A
R
 
M
G
 
G
Q
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
S
E
 
D
V
 
V
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
A
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
T
A
 
K
G
 
D
S
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
V
W
 
W
L
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
A
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
N
G
 
D
L
 
L

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 97% coverage: 6:272/276 of query aligns to 3:269/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
V
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
V
 
H
A
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
A
Q
 
K
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
S
G
x
E
R
|
R
S
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
Q
 
G
A
 
K
L
 
F
G
 
D
L
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
C
A
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
G
 
K
A
 
Q
L
 
I
A
 
D
D
 
Q
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
A
V
 
P
E
 
A
A
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
L
C
 
C
V
 
Q
A
 
Q
V
 
Y
A
 
G
K
 
K
P
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
E
N
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
E
 
Q
L
 
I
E
 
D
N
 
L
A
 
V
S
 
A
R
 
Q
H
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
 
N
M
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
G
G
 
A
R
 
M
G
 
G
Q
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
S
E
 
D
V
 
V
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
A
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
T
A
 
K
G
 
D
S
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
V
W
 
W
L
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
A
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
N
G
 
D
L
 
L

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 6:269/276 of query aligns to 3:266/266 of 5temA

query
sites
5temA
R
 
R
V
 
I
G
 
A
V
 
V
T
 
A
A
x
G
V
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
V
 
H
A
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
V
L
 
A
Q
 
K
L
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
S
G
x
E
R
|
R
S
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
Q
 
G
A
 
K
L
 
F
G
 
D
L
 
V
P
 
V
V
 
V
T
 
C
A
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
G
 
K
A
 
Q
L
 
I
A
 
D
D
 
Q
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
A
V
 
P
E
 
A
A
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
N
H
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
L
C
 
C
V
 
Q
A
 
Q
V
 
Y
A
 
G
K
 
K
P
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
E
N
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
E
E
 
Q
L
 
I
E
 
D
N
 
L
A
 
V
S
 
A
R
 
Q
H
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
A
 
K
F
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
K
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
G
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
G
G
 
A
R
 
M
G
 
G
Q
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
S
E
 
D
V
 
V
Q
 
A
C
 
V
L
 
Y
D
 
A
R
 
R
N
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
T
G
 
G
P
 
E
R
 
R
M
 
T
A
 
K
G
 
D
S
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
W
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
M
N
 
T
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
V
W
 
W
L
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
A
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

3ijpB Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:270/276 of query aligns to 3:267/267 of 3ijpB

query
sites
3ijpB
R
 
R
V
 
L
G
 
T
V
 
V
T
 
V
A
 
G
V
 
A
A
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
L
V
 
I
Q
 
T
A
 
A
I
|
I
V
x
Q
A
 
R
H
x
R
P
 
K
E
 
D
L
x
V
Q
x
E
L
 
L
V
 
C
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
V
R
 
R
S
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
F
L
 
V
G
 
D
E
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
R
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
S
Q
 
D
A
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
D
D
 
D
L
 
P
G
 
E
G
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
N
L
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
I
 
L
E
 
D
F
 
F
G
 
S
P
 
Q
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
L
H
 
Y
V
 
A
A
 
N
A
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
Q
V
 
K
A
 
S
K
 
L
P
 
I
V
 
H
V
 
I
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
S
M
 
K
N
 
T
Q
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
I
E
 
A
N
 
D
A
 
F
S
 
A
R
 
K
H
 
Y
I
 
T
P
 
T
L
 
I
V
 
V
L
 
K
A
 
S
P
 
G
N
 
N
M
 
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
K
A
 
R
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
G
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
G
R
 
R
G
 
N
Q
 
I
R
 
M
L
 
L
D
 
K
E
 
N
V
 
V
Q
 
S
C
 
V
L
 
N
D
 
G
R
 
R
N
 
S
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
K
R
 
R
M
 
E
A
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
S
V
 
I
W
 
T
M
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
H
R
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
L
 
S
N
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
A
R
 
K
G
 
N
R
 
H
A
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
S
M
 
M
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
N

3ijpA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:269/276 of query aligns to 3:266/266 of 3ijpA

query
sites
3ijpA
R
 
R
V
 
L
G
 
T
V
 
V
T
 
V
A
x
G
V
 
A
A
x
N
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
E
L
 
L
V
 
I
Q
 
T
A
 
A
I
|
I
V
x
Q
A
 
R
H
x
R
P
 
K
E
 
D
L
x
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
C
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
S
Y
 
F
L
 
V
G
 
D
E
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
R
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
S
Q
 
D
A
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
R
V
 
I
T
 
T
A
 
D
D
 
D
L
 
P
G
 
E
G
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
N
L
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
I
 
L
E
 
D
F
|
F
G
x
S
P
x
Q
V
 
P
E
 
Q
A
|
A
A
 
S
L
 
V
A
 
L
H
 
Y
V
 
A
A
 
N
A
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
Q
V
 
K
A
 
S
K
 
L
P
 
I
V
 
H
V
 
I
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
S
M
 
K
N
 
T
Q
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
Q
L
 
I
E
 
A
N
 
D
A
 
F
S
 
A
R
 
K
H
 
Y
I
 
T
P
 
T
L
 
I
V
 
V
L
 
K
A
 
S
P
x
G
N
|
N
M
|
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
N
F
 
L
L
 
V
P
 
K
A
 
R
I
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
G
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
V
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
M
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
E
G
 
G
R
 
R
G
 
N
Q
 
I
R
 
M
L
 
L
D
 
K
E
 
N
V
 
V
Q
 
S
C
 
V
L
 
N
D
 
G
R
 
R
N
 
S
G
 
G
I
 
H
P
 
T
G
 
G
P
 
K
R
 
R
M
 
E
A
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
S
V
 
I
W
 
T
M
 
F
A
 
A
G
 
G
T
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
V
L
 
L
T
 
S
H
 
H
R
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
L
 
S
N
 
I
F
|
F
A
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
W
 
W
L
 
A
R
 
K
G
 
N
R
 
H
A
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
S
M
 
M
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 6:267/276 of query aligns to 2:212/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
R
 
K
V
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
-
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
I
 
V
V
 
F
A
 
S
H
 
E
P
 
K
E
 
G
L
 
H
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
A
 
K
I
 
V
G
 
D
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
V
A
 
N
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
S
P
 
P
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
D
F
 
F
G
 
S
P
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
L
L
 
P
A
 
K
H
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
L
C
 
C
V
 
K
A
 
K
V
 
Y
A
 
R
K
 
A
P
 
G
V
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
S
 
K
M
 
E
N
 
E
Q
 
H
R
 
L
A
 
Q
E
 
M
L
 
L
E
 
R
N
 
E
A
 
L
S
 
S
R
 
K
H
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
Q
A
|
A
P
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
S
A
 
E
I
 
L
T
 
V
A
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
E
D
 
D
G
 
-
Y
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
T
H
 
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
M
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
G
K
 
K
G
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
I
 
V
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
V
A
 
G
D
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
V
V
 
V
W
 
V
M
 
F
A
 
G
G
 
N
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
I
T
 
K
H
 
H
R
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
L
 
T
N
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
K
A
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
D
 
S
M
 
F
Q
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
33% identity, 95% coverage: 6:267/276 of query aligns to 7:217/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
R
 
K
V
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
V
A
x
G
V
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
-
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
I
 
V
V
 
F
A
 
S
H
 
E
P
 
K
E
 
G
L
 
H
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
A
 
K
I
 
V
G
x
D
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
L
x
V
A
 
N
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
S
P
 
P
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
S
P
x
S
V
 
P
E
|
E
A
|
A
A
 
L
L
 
P
A
 
K
H
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
L
C
 
C
V
 
K
A
 
K
V
 
Y
A
 
R
K
 
A
P
 
G
V
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
S
 
K
M
 
E
N
 
E
Q
 
H
R
 
L
A
 
Q
E
 
M
L
 
L
E
 
R
N
 
E
A
 
L
S
 
S
R
 
K
H
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
V
L
 
Q
A
 
A
P
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
S
A
 
E
I
 
L
T
 
V
A
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
E
D
 
D
G
 
-
Y
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
T
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
M
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
G
K
 
K
G
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
S
I
 
V
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
V
A
 
G
D
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
V
V
 
V
W
 
V
M
 
F
A
 
G
G
 
N
T
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
I
T
 
K
H
 
H
R
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
L
 
T
N
 
V
F
|
F
A
 
A
E
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
E
W
 
F
L
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
K
A
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
D
 
S
M
 
F
Q
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
23% identity, 95% coverage: 6:267/276 of query aligns to 4:265/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
G
A
 
G
V
 
P
A
x
R
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Q
 
H
A
 
T
I
 
V
V
 
M
A
 
N
H
 
N
P
 
E
E
 
N
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
x
D
R
x
H
S
x
K
G
 
D
A
 
I
A
 
G
Y
 
D
L
 
L
G
 
L
E
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
R
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
V
 
-
Q
 
-
A
 
S
L
 
Y
G
 
E
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
F
A
 
L
D
 
N
L
 
L
G
 
E
G
 
S
A
 
L
L
 
I
A
 
V
D
 
T
L
 
I
-
 
K
-
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
L
E
 
D
F
x
L
G
x
T
P
 
T
V
 
P
E
 
H
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
A
 
E
H
 
H
V
 
T
A
 
M
A
 
L
C
 
C
V
 
L
A
 
Q
V
 
N
A
 
N
K
 
V
P
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
D
N
 
E
Q
 
Q
-
 
L
-
 
Q
R
 
Q
A
 
C
E
 
T
L
 
I
E
 
L
N
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
N
H
 
K
I
 
L
P
 
G
L
 
C
V
 
I
L
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
M
L
 
M
A
 
K
F
 
F
L
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
A
D
 
A
G
 
A
Y
 
Y
-
 
F
-
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
|
H
R
 
D
H
 
Q
K
|
K
M
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
L
 
T
G
 
A
R
 
Q
A
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
E
G
 
V
R
 
R
G
 
P
Q
 
S
R
 
H
L
 
-
D
 
K
E
 
Q
V
 
G
Q
 
H
C
 
P
L
 
N
D
 
E
R
 
K
N
 
E
G
 
T
I
 
L
P
 
E
G
 
G
P
 
A
R
 
R
M
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
G
V
 
L
V
 
I
G
x
A
E
 
H
H
 
Q
T
 
Q
V
 
I
W
 
L
M
 
F
A
 
G
G
 
G
T
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
L
 
F
E
 
T
L
 
L
T
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
N
R
 
R
L
 
Q
N
 
S
F
 
F
A
 
M
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
T
R
 
F
A
 
S
A
 
I
S
 
N
W
 
Q
L
 
V
R
 
M
G
 
E
R
 
I
A
 
K
P
 
E
G
 
L
L
 
V
Y
 
Y
D
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
L

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
23% identity, 95% coverage: 6:267/276 of query aligns to 4:265/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
G
A
 
G
V
 
P
A
 
R
G
 
G
R
 
K
M
 
M
G
 
G
R
 
Q
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Q
 
H
A
 
T
I
 
V
V
 
M
A
 
N
H
 
N
P
 
E
E
 
N
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
L
G
 
D
R
 
H
S
 
K
G
 
D
A
 
I
A
 
G
Y
 
D
L
 
L
G
 
L
E
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
R
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
V
 
-
Q
 
-
A
 
S
L
 
Y
G
 
E
L
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
F
A
 
L
D
 
N
L
 
L
G
 
E
G
 
S
A
 
L
L
 
I
A
 
V
D
 
T
L
 
I
-
 
K
-
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
L
E
 
D
F
 
L
G
 
T
P
 
T
V
 
P
E
 
H
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
A
 
E
H
 
H
V
 
T
A
 
M
A
 
L
C
 
C
V
 
L
A
 
Q
V
 
N
A
 
N
K
 
V
P
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
D
N
 
E
Q
 
Q
-
 
L
-
 
Q
R
 
Q
A
 
C
E
 
T
L
 
I
E
 
L
N
 
A
A
 
E
S
 
V
R
 
N
H
 
K
I
 
L
P
 
G
L
 
C
V
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
N
M
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
M
L
 
M
A
 
K
F
 
F
L
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
A
D
 
A
G
 
A
Y
 
Y
-
 
F
-
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
|
H
R
 
D
H
 
Q
K
|
K
M
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
L
 
T
G
 
A
R
 
Q
A
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
E
G
 
V
R
 
R
G
 
P
Q
 
S
R
 
H
L
 
-
D
 
K
E
 
Q
V
 
G
Q
 
H
C
 
P
L
 
N
D
 
E
R
 
K
N
 
E
G
 
T
I
 
L
P
 
E
G
 
G
P
 
A
R
 
R
M
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
A
E
 
H
H
 
Q
T
 
Q
V
 
I
W
 
L
M
 
F
A
 
G
G
 
G
T
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
L
 
F
E
 
T
L
 
L
T
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
N
R
 
R
L
 
Q
N
 
S
F
 
F
A
 
M
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
T
R
 
F
A
 
S
A
 
I
S
 
N
W
 
Q
L
 
V
R
 
M
G
 
E
R
 
I
A
 
K
P
 
E
G
 
L
L
 
V
Y
 
Y
D
 
G
M
 
L
Q
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
L

5wolA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase dapb from coxiella burnetii
26% identity, 85% coverage: 6:239/276 of query aligns to 3:202/230 of 5wolA

query
sites
5wolA
R
 
N
V
 
V
G
 
I
V
 
I
T
x
N
A
 
G
V
 
I
A
 
N
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
V
V
 
K
Q
 
E
A
 
N
I
 
I
V
 
T
A
 
A
H
 
Q
P
 
S
E
 
D
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
S
 
Q
G
 
D
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
L
G
 
A
G
 
K
A
 
T
L
 
I
A
 
Q
D
 
T
L
 
T
-
 
H
-
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
x
T
V
 
P
E
 
Q
A
x
S
A
 
V
L
 
F
A
 
H
H
 
N
V
 
A
A
 
E
A
 
I
C
 
I
V
 
I
A
 
Q
V
 
S
A
 
G
K
 
A
P
 
R
V
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
L
S
 
T
M
 
L
N
 
E
Q
 
Q
R
 
I
A
 
A
E
 
L
L
 
L
E
 
D
N
 
K
A
 
Q
S
 
C
R
 
R
H
 
N
I
 
K
P
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
M
L
 
M
A
 
K
F
 
Y
L
 
A
P
 
K
A
 
E
I
 
A
T
 
A
A
 
H
A
 
Y
L
 
F
G
 
P
D
 
D
G
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
V
E
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
S
H
 
Q
K
|
K
M
 
I
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
x
K
L
 
T
G
 
A
R
 
Q
A
 
M
V
 
I
A
 
G
K
 
E
G
 
M
R
 
R
G
 
S
Q
 
S
R
 
R
L
 
A
D
 
R
-
 
G
E
 
E
V
 
I
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
K
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
P
G
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
I
A
 
H
T
 
S
L
 
I
R
 
R
G
 
L
A
 
P
D
 
G
V
 
L
V
 
F
G
 
S
E
 
H
H
 
Q
T
 
S
V
 
V
W
 
I
M
 
F
A
 
G
G
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
I
T
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
G
S
 
M
S
 
D
R
 
R

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
29% identity, 92% coverage: 6:260/276 of query aligns to 2:234/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
L
A
x
G
V
 
A
A
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
R
 
T
A
 
T
L
 
M
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
A
A
 
A
H
 
A
P
 
D
E
 
D
L
 
L
Q
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
D
|
D
A
|
A
G
 
G
R
 
D
L
 
P
A
 
L
G
 
S
V
 
L
Q
 
L
A
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
N
L
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
H
V
 
P
E
 
D
A
x
V
A
 
V
L
 
M
A
 
G
H
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
F
C
 
L
V
 
I
A
 
D
V
 
N
A
 
G
K
 
I
P
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
A
N
 
E
Q
 
R
R
 
F
A
 
Q
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
N
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
K
R
 
P
H
 
N
I
 
T
P
 
S
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
-
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
F
 
H
L
 
F
P
 
A
A
 
K
I
 
Q
T
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
F
G
 
F
D
 
D
G
 
S
Y
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
H
 
H
K
|
K
M
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
A
 
R
L
 
T
G
 
A
R
 
K
A
 
L
V
 
I
A
 
A
K
 
E
G
 
A
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
R
N
 
K
G
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
P
P
 
N
R
 
P
M
 
D
A
 
A
G
 
T
S
 
S
I
 
T
G
 
S
F
 
L
A
 
P
T
 
G
L
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
P
E
 
V
H
 
H
T
 
A
V
 
V
W
 
R
M
 
L
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
V
-
x
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
T
T
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
I
T
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
S
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
T
N
 
S
F
|
F
A
 
V
E
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
R
W
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
E
R
 
R
A
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
L

1c3vA Dihydrodipicolinate reductase from mycobacterium tuberculosis complexed with NADPH and pdc (see paper)
29% identity, 92% coverage: 6:260/276 of query aligns to 2:234/245 of 1c3vA

query
sites
1c3vA
R
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
L
A
 
G
V
 
A
A
x
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
R
 
T
A
 
T
L
 
M
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
A
A
 
A
H
 
A
P
 
D
E
 
D
L
 
L
Q
 
T
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
D
|
D
A
|
A
G
 
G
R
 
D
L
 
P
A
 
L
G
 
S
V
 
L
Q
 
L
A
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
N
L
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
E
 
D
F
|
F
G
x
T
P
 
H
V
 
P
E
 
D
A
x
V
A
 
V
L
 
M
A
 
G
H
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
F
C
 
L
V
 
I
A
 
D
V
 
N
A
 
G
K
 
I
P
 
H
V
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
T
M
 
A
N
 
E
Q
 
R
R
 
F
A
 
Q
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
N
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
S
 
K
R
 
P
H
 
N
I
 
T
P
 
S
L
 
V
V
 
L
L
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
-
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
F
 
H
L
 
F
P
 
A
A
 
K
I
 
Q
T
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
F
G
 
F
D
 
D
G
 
S
Y
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
 
H
R
 
P
H
 
H
K
|
K
M
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
A
 
R
L
 
T
G
 
A
R
 
K
A
 
L
V
 
I
A
 
A
K
 
E
G
 
A
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
R
N
 
K
G
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
P
P
 
N
R
 
P
M
 
D
A
 
A
G
 
T
S
 
S
I
 
T
G
 
S
F
 
L
A
 
P
T
 
G
L
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
P
E
 
V
H
 
H
T
 
A
V
 
V
W
 
R
M
 
L
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
V
-
x
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
T
T
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
T
L
 
I
T
 
R
H
 
H
R
 
D
A
 
S
S
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
T
N
 
S
F
|
F
A
 
V
E
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
R
W
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
E
R
 
R
A
 
-
P
 
P
G
 
G
L
 
L

Query Sequence

>WP_009567628.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_009567628.1
MAGVWRVGVTAVAGRMGRALVQAIVAHPELQLVAAIGRSGAAYLGEDAGRLAGVQALGLP
VTADLGGALADLDVLIEFGPVEAALAHVAACVAVAKPVVVGTTGFSMNQRAELENASRHI
PLVLAPNMSVGVNVLLAFLPAITAALGDGYDVEIVEAHHRHKMDAPSGTALALGRAVAKG
RGQRLDEVQCLDRNGIPGPRMAGSIGFATLRGADVVGEHTVWMAGTGERLELTHRASSRL
NFAEGALRAASWLRGRAPGLYDMQDVLGLKGLTALQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory