SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009763936.1 NCBI__GCF_000262405.1:WP_009763936.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ykfA NADP-dependent alcohol dehydrogenase from thermoanaerobium brockii (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of 1ykfA

query
sites
1ykfA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
x
T
E
 
S
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
x
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
x
G
Q
x
I
G
|
G
P
|
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
|
S
L
x
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
x
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
x
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
 
V
G
x
N
V
 
-
Y
|
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

1bxzB Crystal structure of a thermophilic alcohol dehydrogenase substrate complex from thermoanaerobacter brockii (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of 1bxzB

query
sites
1bxzB
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
x
T
E
 
S
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
x
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
 
V
G
 
N
V
 
-
Y
 
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

P14941 NADP-dependent isopropanol dehydrogenase; EC 1.1.1.80 from Thermoanaerobacter brockii (Thermoanaerobium brockii) (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of P14941

query
sites
P14941
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
T
E
 
S
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
G
Q
x
I
G
|
G
P
|
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
x
G
S
|
S
L
x
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
x
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
x
V
G
x
N
V
 
-
Y
|
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
x
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

7f3pD Crystal structure of a NADP-dependent alcohol dehydrogenase mutant in apo form (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 4:349/355 of 7f3pD

query
sites
7f3pD
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
S
A
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
T
E
 
S
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
 
V
G
 
N
V
 
-
Y
 
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

3fpcA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-294 of t. Brockii adh by e. Histolytica adh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of 3fpcA

query
sites
3fpcA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
x
T
E
 
S
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
x
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
C
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
H
M
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
K
E
 
H
R
 
C
I
 
C
D
 
D
M
 
I
S
 
A
R
 
L
R
 
E
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
L
R
 
K
L
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
K
S
 
V
I
 
V
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
D
Q
 
V
Q
 
H
T
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
M
L
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
N
L
 
V
S
 
N
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
-
Y
 
-
S
 
E
G
 
G
D
 
D
-
 
N
L
 
I
R
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
D
 
H
Y
 
K
T
 
H
I
 
I
R
 
H
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

7uutA Ternary complex crystal structure of secondary alcohol dehydrogenases from the thermoanaerobacter ethanolicus mutants c295a and i86a provides better understanding of catalytic mechanism (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of 7uutA

query
sites
7uutA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
|
A
I
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
T
E
 
S
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
|
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
x
G
Q
 
I
G
|
G
P
|
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
|
S
L
x
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
|
A
L
x
G
G
|
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
x
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
x
V
G
x
N
V
 
-
Y
|
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
|
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
x
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

7ux4A Crystallographic snapshots of ternary complexes of thermophilic secondary alcohol dehydrogenase from thermoanaerobacter pseudoethanolicus reveal the dynamics of ligand exchange and the proton relay network. (see paper)
38% identity, 95% coverage: 13:352/357 of query aligns to 8:344/350 of 7ux4A

query
sites
7ux4A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
T
E
 
S
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
|
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
x
G
Q
x
I
G
|
G
P
|
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
x
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
|
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
x
V
G
x
N
V
 
-
Y
|
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
|
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

7xy9A Cryo-em structure of secondary alcohol dehydrogenases tbsadh after carrier-free immobilization based on weak intermolecular interactions (see paper)
38% identity, 95% coverage: 13:352/357 of query aligns to 11:339/344 of 7xy9A

query
sites
7xy9A
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
N
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
T
E
 
S
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
|
H
S
 
Q
Q
x
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
x
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
 
V
G
 
N
V
 
Y
Y
 
F
S
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
|
C
P
 
P
G
|
G
G
|
G
K
 
R
E
x
L
R
|
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

3fsrA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of t. Brockii adh by c. Beijerinckii adh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/352 of 3fsrA

query
sites
3fsrA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
S
P
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
E
A
 
R
P
 
H
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
x
T
E
 
S
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
x
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
V
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
E
L
 
I
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
P
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
M
G
 
G
D
 
S
T
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
P
E
 
I
R
 
C
I
 
V
D
 
E
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
F
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
F
 
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
H
P
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
M
R
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
R
S
 
V
I
 
I
E
 
M
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
S
V
 
M
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
L
 
I
S
 
S
S
 
N
L
 
I
G
 
N
V
 
Y
Y
 
H
-
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
-
 
A
L
 
L
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
V
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
L
I
 
V
A
 
F
S
 
Y
G
 
K
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
P
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
F
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

P35630 NADP-dependent isopropanol dehydrogenase; EhADH1; EC 1.1.1.80 from Entamoeba histolytica (strain ATCC 30459 / HM-1:IMSS / ABRM) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 7:352/366 of P35630

query
sites
P35630
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
L
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
G
P
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
K
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
L
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
T
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
W
K
 
A
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
H
G
 
D
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
E
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
R
Y
 
L
R
 
K
E
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
G
S
 
E
E
 
E
A
 
E
C
 
S
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
P
S
 
M
Q
 
H
D
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
G
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
V
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
E
A
 
A
M
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
K
D
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
L
P
 
S
D
|
D
I
 
M
L
 
V
S
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
C
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
H
M
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
K
E
 
H
R
 
C
I
 
C
D
 
D
M
 
I
S
 
A
R
 
L
R
 
E
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
L
R
 
K
L
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
K
S
 
V
I
 
V
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
D
Q
 
V
Q
 
H
T
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
M
L
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
N
L
 
V
S
 
N
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
-
Y
 
E
S
 
G
G
 
D
D
 
N
L
 
I
R
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
D
 
H
Y
 
K
T
 
H
I
 
I
R
 
H
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
V
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
L
I
 
I
A
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
E
-
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
K
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
L
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
N
Q
 
K
R
 
P
D
 
A
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K

1y9aA Alcohol dehydrogenase from entamoeba histolotica in complex with cacodylate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/360 of 1y9aA

query
sites
1y9aA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
L
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
G
P
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
K
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
C
G
 
G
P
|
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
L
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
T
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
W
K
 
A
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
x
D
A
 
R
P
x
H
G
 
D
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
E
 
V
K
 
K
L
 
V
G
|
G
S
|
S
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
R
Y
 
L
R
 
K
E
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
G
S
x
E
E
 
E
A
 
-
C
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
H
 
E
S
|
S
Q
 
Q
D
 
R
G
|
G
A
x
Y
G
 
-
T
 
P
K
x
M
H
 
H
G
x
S
W
 
G
K
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
G
G
 
G
W
|
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
V
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
E
A
 
A
M
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
K
D
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
L
P
 
S
D
|
D
I
 
M
L
 
V
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
x
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
C
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
H
M
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
K
E
 
H
R
 
C
I
 
C
D
 
D
M
 
I
S
 
A
R
 
L
R
 
E
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
L
R
 
K
L
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
K
S
 
V
I
 
V
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
D
Q
 
V
Q
 
H
T
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
M
L
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
N
L
 
V
S
 
N
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
-
Y
 
E
S
 
G
G
 
D
D
 
N
L
 
I
R
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
D
 
H
Y
 
K
T
 
H
I
 
I
R
 
H
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
V
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
L
I
 
I
A
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
E
-
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
K
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
L
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
N
Q
 
K
R
 
P
D
 
A
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

2ouiA D275p mutant of alcohol dehydrogenase from protozoa entamoeba histolytica (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:352/357 of query aligns to 1:346/360 of 2ouiA

query
sites
2ouiA
M
 
M
R
 
K
A
 
G
A
 
L
I
 
A
F
 
M
V
 
L
E
 
G
P
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
G
L
 
W
D
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
K
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
L
T
 
A
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
T
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
W
K
 
A
G
 
G
E
 
A
Y
 
I
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
H
G
 
D
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
E
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
R
Y
 
L
R
 
K
E
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
G
S
x
E
E
 
E
A
 
E
C
x
S
L
 
Q
C
 
R
G
 
G
C
 
Y
H
 
P
S
 
M
Q
 
H
D
x
S
G
 
G
A
 
G
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
M
M
 
L
G
 
G
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
S
E
 
E
Y
 
V
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
E
A
 
A
M
 
D
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
K
D
 
P
E
 
E
Q
 
D
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
L
P
 
S
D
|
D
I
 
M
L
 
V
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
C
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
H
M
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
K
E
 
H
R
 
C
I
 
C
D
 
D
M
 
I
S
 
A
R
 
L
R
 
E
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
N
F
 
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
L
R
 
K
L
 
A
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
K
S
 
V
I
 
V
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
D
Q
 
V
Q
 
H
T
 
T
F
 
F
E
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
M
L
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
N
L
 
V
S
 
N
S
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
-
Y
 
E
S
 
G
G
 
D
D
 
N
L
 
I
R
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
D
 
H
Y
 
K
T
 
H
I
 
I
R
 
H
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
V
R
 
R
M
 
M
R
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
L
I
 
I
A
 
S
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
D
T
 
T
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
E
-
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
K
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
L
D
 
M
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
N
Q
 
K
R
 
P
D
 
A
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K

3fplA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of c. Beijerinckii adh by t. Brockii adh (see paper)
37% identity, 94% coverage: 19:355/357 of query aligns to 16:349/351 of 3fplA

query
sites
3fplA
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
R
P
 
P
N
 
V
I
 
A
G
 
G
P
 
S
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
L
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
K
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
C
I
 
T
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
|
S
E
 
L
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
A
G
 
G
C
 
F
H
 
Q
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
Q
H
 
H
G
x
S
W
 
N
K
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
D
L
 
M
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
P
E
 
V
R
 
C
I
 
V
D
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
Y
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
T
 
-
K
 
K
A
 
D
D
 
G
P
 
P
V
 
I
E
 
E
-
 
S
E
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
N
L
 
L
T
 
T
D
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
I
E
 
I
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
N
Q
 
A
Q
 
D
T
 
I
F
 
M
E
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
S
 
A
S
 
N
L
 
V
G
 
N
V
 
-
Y
 
Y
S
 
F
G
 
G
D
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
L
 
L
R
 
P
I
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
L
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
A
R
 
E
R
 
M
L
 
L
I
 
R
S
 
D
A
 
M
I
 
V
A
 
V
S
 
Y
G
 
N
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
L
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
Y
K
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
 
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
35% identity, 99% coverage: 1:355/357 of query aligns to 2:341/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
P
 
G
K
 
S
M
 
M
R
 
K
A
 
A
A
 
Y
I
 
T
F
 
Y
V
 
V
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
L
I
 
A
V
 
S
L
 
F
D
 
V
E
 
D
K
 
V
P
 
D
I
 
K
P
 
P
N
 
V
I
 
I
G
 
R
P
 
K
L
 
P
D
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
S
 
V
T
 
K
T
 
T
T
 
T
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
|
T
D
 
D
I
 
L
H
|
H
I
 
I
L
 
I
K
 
K
G
 
G
E
 
D
Y
 
V
P
 
P
V
 
T
A
 
C
-
 
Q
P
 
S
G
 
G
L
 
T
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
P
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
G
 
N
Y
 
F
R
 
K
E
 
K
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
I
G
 
S
A
 
C
I
 
V
T
 
C
P
 
A
S
x
C
G
 
G
Y
 
K
S
x
C
E
 
Y
A
 
Y
C
|
C
L
 
K
C
 
K
G
 
G
C
 
I
H
 
Y
S
 
A
Q
 
H
D
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
W
x
C
K
 
E
A
 
D
M
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
W
K
 
I
F
 
F
G
 
-
N
 
-
T
 
-
I
 
I
D
 
D
G
 
G
C
 
M
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
D
 
H
A
 
A
M
 
D
A
 
N
N
 
T
L
 
L
A
 
Y
P
 
H
V
 
T
P
 
P
D
 
E
G
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
V
 
L
L
 
V
M
 
M
C
 
-
P
 
-
D
 
-
I
 
L
L
 
L
S
 
P
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
S
 
E
-
 
I
G
 
G
A
 
V
E
 
L
S
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
V
R
 
E
I
 
P
G
 
G
D
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
I
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
T
 
L
A
 
L
G
 
T
A
 
A
K
 
Q
L
 
F
M
 
Y
G
 
S
A
 
P
T
 
A
T
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
M
V
 
V
E
 
D
S
 
L
L
 
D
P
 
D
E
 
N
R
 
R
I
 
L
D
 
E
M
 
T
S
 
A
R
 
L
R
 
S
M
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
H
V
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
-
T
 
-
K
 
S
A
 
S
D
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
A
V
 
I
E
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
Y
R
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
I
Q
 
P
Q
 
A
T
 
T
F
 
F
E
 
D
A
 
F
A
 
C
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
L
 
I
R
 
G
P
 
V
G
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
V
S
 
A
S
 
N
L
 
C
G
 
G
V
 
V
Y
 
H
S
 
G
G
 
K
D
 
P
L
 
V
R
 
E
I
 
F
P
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
K
F
 
L
L
 
W
A
 
-
G
 
-
L
 
I
G
 
R
D
 
N
Y
 
I
T
 
N
I
 
V
R
 
T
T
 
T
T
 
G
L
 
L
C
 
V
P
 
-
G
 
-
G
 
S
K
 
T
E
 
N
R
 
T
M
 
T
R
 
P
R
 
Q
L
 
L
I
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
E
S
 
S
G
 
H
R
 
K
V
 
I
D
 
E
T
 
P
R
 
E
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
Y
F
 
F
K
 
K
L
 
L
D
 
S
Q
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
D
 
E
L
 
V
F
 
F
S
 
S
H
 
K
Q
 
A
R
 
A
D
 
D
G
 
H
V
 
H
L
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
I

1kevA Structure of NADP-dependent alcohol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 94% coverage: 19:355/357 of query aligns to 16:349/351 of 1kevA

query
sites
1kevA
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
R
P
 
P
N
 
V
I
 
A
G
 
G
P
 
S
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
L
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
K
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
C
I
 
T
T
 
T
P
 
P
S
x
D
G
 
W
Y
 
R
S
|
S
E
 
L
A
 
E
C
x
V
L
 
Q
C
 
A
G
 
G
C
 
F
H
 
Q
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
Q
H
 
H
G
x
S
W
 
N
K
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
D
L
 
M
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
M
G
 
G
D
 
S
T
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
x
I
G
|
G
P
 
A
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
G
S
|
S
L
x
R
P
 
P
E
 
I
R
 
C
I
 
V
D
 
E
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
F
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
F
x
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
H
P
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
M
R
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
R
S
 
V
I
 
I
E
 
M
A
|
A
L
 
G
G
|
G
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
S
V
 
M
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
L
 
I
S
 
S
S
 
N
L
 
I
G
x
N
V
x
Y
Y
 
H
-
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
-
 
A
L
 
L
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
V
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
A
R
 
E
R
 
M
L
 
L
I
 
R
S
 
D
A
 
M
I
 
V
A
 
V
S
 
Y
G
 
N
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
L
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
Y
K
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
x
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
|
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V

P25984 NADP-dependent isopropanol dehydrogenase; CbADH; EC 1.1.1.80 from Clostridium beijerinckii (Clostridium MP) (see 3 papers)
36% identity, 94% coverage: 19:355/357 of query aligns to 16:349/351 of P25984

query
sites
P25984
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
R
P
 
P
N
 
V
I
 
A
G
 
G
P
 
S
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
S
I
 
P
C
|
C
G
 
T
T
 
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
L
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
K
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
C
I
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
S
E
 
L
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
A
G
 
G
C
 
F
H
 
Q
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
Q
H
 
H
G
 
S
W
 
N
K
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
D
L
 
M
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
M
G
 
G
D
 
S
T
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
x
I
G
|
G
P
x
A
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
x
G
S
|
S
L
x
R
P
 
P
E
 
I
R
 
C
I
 
V
D
 
E
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
F
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
F
x
Y
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
H
P
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
M
R
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
R
S
 
V
I
 
I
E
 
M
A
 
A
L
 
G
G
 
G
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
S
V
 
M
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
L
 
I
S
 
S
S
 
N
L
x
I
G
x
N
V
x
Y
Y
 
H
-
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
-
 
A
L
 
L
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
V
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
A
R
 
E
R
 
M
L
 
L
I
 
R
S
 
D
A
 
M
I
 
V
A
 
V
S
 
Y
G
 
N
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
L
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
Y
K
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
x
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V

6schC Nadh-dependent variant of cbadh (see paper)
35% identity, 94% coverage: 19:355/357 of query aligns to 16:349/355 of 6schC

query
sites
6schC
E
 
E
K
 
K
P
 
E
I
 
R
P
 
P
N
 
V
I
 
A
G
 
G
P
 
S
L
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
P
S
 
L
T
 
A
T
 
V
T
 
S
I
 
P
C
|
C
G
x
T
T
x
S
D
 
D
I
 
I
H
|
H
-
 
T
I
 
V
L
 
F
K
 
E
G
 
G
E
 
A
Y
 
L
P
 
G
V
 
D
A
 
R
P
 
K
G
 
N
L
 
M
T
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
P
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
Y
 
F
R
 
K
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
P
A
 
C
I
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
D
G
 
W
Y
 
R
S
 
S
E
 
L
A
 
E
C
 
V
L
 
Q
C
 
A
G
 
G
C
 
F
H
 
Q
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
Q
H
 
H
G
 
S
W
 
N
K
 
G
A
 
M
M
 
L
G
 
A
G
 
G
W
|
W
K
 
K
F
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
F
I
 
K
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
G
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
P
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
D
A
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
A
P
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
K
G
 
D
L
 
M
T
 
P
D
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
A
L
 
V
M
 
M
C
 
I
P
 
T
D
|
D
I
 
M
L
 
M
S
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
S
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
L
G
 
A
R
 
D
I
 
I
R
 
Q
I
 
M
G
 
G
D
 
S
T
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
I
A
x
G
Q
 
I
G
 
G
P
 
A
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
x
D
S
x
Y
L
x
R
P
 
P
E
 
I
R
 
C
I
 
V
D
 
E
M
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
F
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
T
H
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
N
F
 
P
T
 
K
K
 
N
A
 
G
D
 
H
P
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
Q
I
 
V
R
 
M
R
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
R
S
 
V
I
 
I
E
 
M
A
|
A
L
x
G
G
|
G
R
 
G
Q
 
S
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
S
V
 
M
L
 
V
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
L
 
I
S
 
S
S
 
N
L
 
I
G
x
N
V
x
Y
Y
 
H
-
 
G
S
 
S
G
 
G
D
 
D
-
 
A
L
 
L
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
R
D
 
V
G
 
E
F
 
W
L
 
G
A
 
C
G
 
G
L
 
M
G
 
A
D
 
H
Y
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
K
T
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
E
 
L
R
 
R
M
 
A
R
 
E
R
 
M
L
 
L
I
 
R
S
 
D
A
 
M
I
 
V
A
 
V
S
 
Y
G
 
N
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
L
R
 
S
P
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
R
 
V
F
 
Y
K
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
F
 
M
S
 
K
H
 
D
Q
x
K
R
 
P
D
 
K
G
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
35% identity, 99% coverage: 4:355/357 of query aligns to 1:343/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
M
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
V
I
 
V
F
 
F
V
 
E
E
 
N
P
 
K
G
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
A
L
 
V
D
 
K
E
 
E
K
 
V
P
 
N
I
 
A
P
 
P
N
 
R
I
 
L
-
 
Q
G
 
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
I
 
V
S
 
H
T
 
L
T
 
A
T
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
x
S
D
 
D
I
 
L
H
|
H
I
 
L
L
 
Y
K
 
H
G
 
G
E
 
K
Y
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
S
T
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
F
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
I
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
D
Y
 
L
R
 
Q
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
R
 
W
V
 
V
I
 
V
A
 
G
G
 
P
A
 
F
I
 
H
T
 
I
P
 
A
S
x
C
G
 
G
Y
 
T
S
x
C
E
 
P
A
 
Y
C
|
C
L
 
R
C
 
R
G
 
H
C
 
Q
H
 
Y
S
 
N
Q
 
L
D
x
C
G
 
E
A
 
R
G
 
G
T
x
G
K
 
V
H
 
Y
G
 
G
W
 
Y
K
 
G
A
 
P
M
 
M
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
F
 
F
G
 
G
N
 
N
T
 
-
I
 
L
D
 
Q
G
 
G
C
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
L
 
L
R
 
R
V
 
V
P
 
P
D
 
F
A
 
S
M
 
N
A
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
R
P
 
K
V
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
N
L
 
L
T
 
S
D
 
P
E
 
E
Q
 
R
V
 
A
L
 
I
M
 
F
C
 
A
P
 
G
D
|
D
I
 
I
L
 
L
S
 
S
T
|
T
G
 
A
F
 
Y
S
 
G
G
 
G
A
 
L
E
 
I
S
 
Q
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
I
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
I
A
 
G
Q
 
A
G
|
G
P
|
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
C
 
M
A
 
A
T
 
I
A
 
E
G
 
V
A
 
A
K
 
Q
L
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
T
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
A
V
 
I
E
x
D
S
x
R
L
 
I
P
 
P
E
 
E
R
|
R
I
 
L
D
 
E
M
 
R
S
 
A
R
 
A
R
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
I
H
 
P
V
 
-
I
 
I
D
 
N
F
 
A
T
 
E
K
 
Q
A
 
E
D
 
N
P
 
P
V
 
V
E
 
R
E
 
R
I
 
V
R
 
R
R
 
S
L
 
E
T
 
T
D
 
N
G
 
D
R
 
E
G
 
G
V
 
P
D
 
D
V
 
L
S
 
V
I
 
L
E
 
E
A
|
A
L
x
V
G
 
G
R
 
G
Q
 
A
Q
 
A
T
 
T
F
 
L
E
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
V
 
M
L
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
R
L
 
V
S
 
S
S
 
A
L
x
V
G
 
G
V
|
V
Y
 
D
S
 
N
G
 
A
-
 
P
D
 
S
L
 
F
R
 
P
I
 
F
P
 
P
L
 
L
D
 
A
G
 
S
F
 
G
L
 
L
A
 
-
G
 
-
L
 
V
G
 
K
D
 
D
Y
 
L
T
 
T
I
 
F
R
 
R
T
 
I
T
 
G
L
|
L
C
x
A
P
 
-
G
 
N
G
 
V
K
 
H
E
 
L
R
 
Y
M
 
I
R
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
Q
T
 
P
R
 
E
P
 
R
L
 
I
V
 
V
T
 
S
H
 
H
R
 
Y
F
 
L
K
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
I
 
A
E
 
P
E
 
R
A
 
G
Y
 
Y
D
 
E
L
 
L
F
|
F
S
 
D
H
 
-
Q
 
-
R
 
R
D
 
K
G
 
E
V
 
A
L
 
L
K
|
K
V
 
V
A
 
L
I
 
L

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
30% identity, 97% coverage: 3:349/357 of query aligns to 4:341/348 of O58389

query
sites
O58389
K
 
K
M
 
M
R
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
M
F
 
K
V
 
T
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
-
 
G
I
 
A
V
 
E
L
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
V
P
 
D
I
 
V
P
 
P
N
 
K
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
G
D
 
E
A
 
V
L
 
L
V
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
L
T
 
A
T
 
T
T
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
|
T
D
 
D
I
 
L
H
 
H
I
 
I
L
 
Y
K
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
W
G
 
A
E
 
Q
Y
 
S
P
 
R
V
 
I
A
 
K
P
 
P
G
 
P
L
 
Q
T
 
I
I
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
I
G
 
G
S
 
P
A
 
G
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
Y
 
I
R
 
E
E
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
S
A
 
V
G
 
E
A
 
T
I
 
H
T
 
I
P
 
V
S
x
C
G
 
G
Y
 
K
S
x
C
E
 
Y
A
 
A
C
|
C
L
 
R
C
 
R
G
 
G
C
 
Q
H
 
Y
S
 
-
Q
 
H
D
 
V
G
x
C
A
 
Q
G
 
N
T
 
T
K
 
K
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
I
F
 
F
G
 
G
N
 
V
T
 
D
I
 
T
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
-
A
 
-
M
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
A
 
W
P
 
K
V
 
N
P
 
P
D
 
K
G
 
S
L
 
I
T
 
P
D
 
P
E
 
E
Q
 
Y
V
 
A
L
 
T
M
 
L
C
 
-
P
 
Q
D
x
E
I
 
P
L
 
L
S
 
G
T
 
N
G
 
A
F
 
V
S
 
D
G
 
T
A
 
V
E
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
P
I
 
I
R
 
S
I
 
-
G
 
G
D
 
K
T
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
I
F
 
T
A
 
G
Q
 
A
G
 
G
P
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
A
M
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
T
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
V
 
S
E
|
E
S
 
P
L
 
S
P
 
D
E
 
F
R
|
R
I
 
R
D
 
E
M
 
L
S
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
N
F
 
P
T
 
F
K
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
V
V
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
M
R
 
D
L
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
F
I
 
L
E
 
E
A
 
F
L
 
S
G
 
G
R
 
A
Q
 
P
Q
 
K
T
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
V
 
A
L
 
V
R
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
T
 
R
L
 
V
S
 
S
S
 
L
L
|
L
G
|
G
V
x
L
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
D
 
K
L
 
V
R
 
T
I
 
I
P
 
D
L
 
F
D
 
N
G
 
N
F
 
L
L
 
I
-
 
I
-
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
L
G
 
T
D
 
I
Y
 
Y
T
 
G
I
|
I
R
x
T
T
 
G
T
x
R
L
 
H
C
 
L
P
 
W
G
 
E
G
 
T
K
 
W
E
 
Y
R
 
T
M
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
S
 
Q
A
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
N
T
 
L
R
 
D
P
 
P
L
 
I
V
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
F
 
Y
K
 
K
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
K
I
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
D
 
E
L
 
L
F
 
M
S
 
R
H
 
A
Q
 
G
R
 
K
D
 
T
G
 
G

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
30% identity, 97% coverage: 3:349/357 of query aligns to 2:339/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
K
 
K
M
 
M
R
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
M
F
 
K
V
 
T
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
-
 
G
I
 
A
V
 
E
L
 
L
D
 
V
E
 
E
K
 
V
P
 
D
I
 
V
P
 
P
N
 
K
I
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
G
D
 
E
A
 
V
L
 
L
V
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
L
T
 
A
T
 
T
T
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
I
 
L
H
|
H
I
 
I
L
 
Y
K
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
W
G
 
A
E
 
Q
Y
 
S
P
 
R
V
 
I
A
 
K
P
 
P
G
 
P
L
 
Q
T
 
I
I
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
P
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
E
I
 
V
E
 
V
K
 
E
L
 
I
G
 
G
S
 
P
A
 
G
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
Y
 
I
R
 
E
E
 
V
G
 
G
Q
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
S
A
 
V
G
 
E
A
 
T
I
 
H
T
 
I
P
 
V
S
x
C
G
 
G
Y
 
K
S
x
C
E
 
Y
A
 
A
C
|
C
L
 
R
C
 
R
G
 
G
C
 
Q
H
 
Y
S
 
-
Q
 
H
D
 
V
G
x
C
A
 
Q
G
 
N
T
 
T
K
|
K
H
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
I
F
 
F
G
 
G
N
 
V
T
 
D
I
 
T
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
A
R
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
-
A
 
-
M
 
A
A
 
Q
N
 
N
L
 
I
A
 
W
P
 
K
V
 
N
P
 
P
D
 
K
G
 
S
L
 
I
T
 
P
D
 
P
E
 
E
Q
 
Y
V
 
A
L
 
T
M
 
L
C
 
-
P
 
Q
D
 
E
I
x
P
L
 
L
S
 
G
T
 
N
G
x
A
F
 
V
S
 
D
G
 
T
A
 
V
E
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
P
I
 
I
R
 
S
I
 
-
G
 
G
D
 
K
T
 
S
V
 
V
A
 
L
V
 
I
F
 
T
A
 
G
Q
 
A
G
|
G
P
|
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
C
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
A
M
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
T
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
V
V
 
S
E
|
E
S
x
P
L
 
S
P
 
D
E
 
F
R
|
R
I
 
R
D
 
E
M
 
L
S
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
N
F
 
P
T
 
F
K
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
V
V
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
V
R
 
M
R
 
D
L
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
F
I
 
L
E
 
E
A
x
F
L
x
S
G
 
G
R
x
A
Q
 
P
Q
 
K
T
 
A
F
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
V
 
A
L
 
V
R
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
G
T
 
R
L
 
V
S
 
S
S
 
L
L
|
L
G
|
G
V
x
L
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
D
 
K
L
 
V
R
 
T
I
 
I
P
 
D
L
 
F
D
 
N
G
 
N
F
 
L
L
 
I
-
 
I
-
 
F
A
 
K
G
 
A
L
 
L
G
 
T
D
 
I
Y
 
Y
T
 
G
I
|
I
R
x
T
T
 
G
T
 
R
L
 
H
C
 
L
P
 
W
G
 
E
G
 
T
K
 
W
E
 
Y
R
 
T
M
 
V
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
S
 
Q
A
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
N
T
 
L
R
 
D
P
 
P
L
 
I
V
 
I
T
 
T
H
 
H
R
 
K
F
 
Y
K
 
K
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
K
I
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
D
 
E
L
 
L
F
 
M
S
 
R
H
 
A
Q
 
G
R
 
K
D
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_009763936.1 NCBI__GCF_000262405.1:WP_009763936.1
MPKMRAAIFVEPGRIVLDEKPIPNIGPLDALVRISTTTICGTDIHILKGEYPVAPGLTIG
HEPVGIIEKLGSAVQGYREGQRVIAGAITPSGYSEACLCGCHSQDGAGTKHGWKAMGGWK
FGNTIDGCQAEYLRVPDAMANLAPVPDGLTDEQVLMCPDILSTGFSGAESGRIRIGDTVA
VFAQGPIGLCATAGAKLMGATTIIAVESLPERIDMSRRMGADHVIDFTKADPVEEIRRLT
DGRGVDVSIEALGRQQTFEAALRVLRPGGTLSSLGVYSGDLRIPLDGFLAGLGDYTIRTT
LCPGGKERMRRLISAIASGRVDTRPLVTHRFKLDQIEEAYDLFSHQRDGVLKVAIAP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory