SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009779343.1 NCBI__GCF_000152985.1:WP_009779343.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2rcyA Crystal structure of plasmodium falciparum pyrroline carboxylate reductase (mal13p1.284) with NADP bound
34% identity, 99% coverage: 1:265/268 of query aligns to 5:261/262 of 2rcyA

query
sites
2rcyA
M
 
I
K
 
K
V
 
L
L
 
G
V
 
F
L
 
M
G
 
G
A
 
L
G
|
G
N
x
Q
M
|
M
G
 
G
L
 
S
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
H
G
 
G
M
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
A
P
 
N
F
 
I
L
 
I
N
 
K
K
 
K
R
 
E
K
 
N
L
 
L
M
 
F
I
 
Y
F
 
Y
D
 
G
V
x
P
S
 
S
P
 
K
Q
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
-
A
 
T
L
 
L
S
 
N
T
 
Y
M
 
M
A
 
S
Q
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
S
I
x
N
E
 
E
E
 
E
C
 
L
V
 
A
P
 
R
K
 
H
A
 
C
D
 
D
V
 
I
I
 
I
F
 
V
I
 
C
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Y
 
D
H
x
I
S
 
A
Q
 
G
S
 
S
L
 
V
F
 
L
D
 
N
S
 
N
I
 
I
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
N
 
-
Q
 
S
E
 
S
Q
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
S
 
S
L
x
I
M
x
C
A
x
G
G
 
G
V
 
L
T
 
N
I
 
I
N
 
G
T
 
K
I
 
L
Q
 
E
E
 
E
G
 
M
L
 
V
G
 
G
V
 
S
K
 
E
-
 
N
K
 
K
V
 
I
I
 
V
R
 
W
T
 
V
M
|
M
P
 
P
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
C
K
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
G
V
 
S
T
 
F
S
 
I
F
 
Y
T
 
C
E
 
S
S
 
N
K
 
K
E
 
N
V
 
V
S
 
N
R
 
S
I
 
T
E
 
D
L
 
K
L
 
K
T
 
Y
V
 
V
R
 
N
S
 
D
L
 
I
L
 
F
D
 
N
T
 
S
T
 
C
G
 
G
E
 
-
S
 
I
I
 
I
H
 
H
V
 
E
E
 
I
T
 
K
E
 
E
Q
 
K
F
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
I
S
 
A
T
 
T
G
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
Y
Y
 
L
F
 
F
M
 
I
Q
 
E
S
 
S
M
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
N
G
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
R
N
 
E
D
 
L
S
 
S
K
 
K
V
 
N
L
 
L
V
 
V
S
 
L
Q
 
Q
T
 
T
F
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
V
K
 
E
L
 
M
F
 
V
N
 
K
E
 
K
S
 
S
D
 
D
L
 
Q
T
 
P
P
 
V
E
 
Q
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
x
I
A
 
V
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
T
 
T
R
 
A
A
 
V
A
 
G
L
 
L
D
 
Y
S
 
S
M
 
L
E
 
E
D
 
K
N
 
N
N
 
S
V
 
F
K
 
K
E
 
Y
L
 
T
I
 
V
K
 
M
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
C
D
 
E
R
 
K
A
 
S
T
 
K
E
 
A
L
 
M
G
 
G

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:267/268 of query aligns to 1:261/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
M
 
M
K
 
N
V
 
V
L
 
Y
V
 
F
L
|
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
G
 
A
L
 
A
T
 
A
Y
 
V
A
 
A
E
 
G
G
 
G
M
 
L
A
 
V
N
 
K
S
 
Q
P
 
-
F
 
-
L
 
-
N
 
G
K
 
G
R
 
Y
K
 
R
L
 
I
M
 
Y
I
 
I
F
x
A
D
x
N
V
x
R
S
x
G
P
 
A
Q
 
E
K
|
K
T
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
L
S
 
E
T
 
K
M
 
E
A
 
L
Q
 
G
F
 
V
D
 
E
A
 
T
Y
 
S
D
 
A
S
 
T
I
 
L
E
 
P
E
 
E
C
 
-
V
 
L
P
 
H
K
 
S
A
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
I
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Y
 
Q
H
 
D
S
 
M
Q
 
E
S
 
A
L
x
A
F
 
C
D
 
K
S
 
N
I
 
I
K
 
R
P
 
-
Y
 
-
I
 
-
N
 
T
Q
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
L
F
 
V
V
 
L
S
 
S
L
x
V
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
L
T
 
S
I
 
V
N
 
G
T
 
T
I
 
L
Q
 
S
E
 
R
G
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
G
V
 
T
K
 
R
K
 
R
V
 
I
I
 
V
R
 
R
T
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
G
K
 
K
V
 
I
G
 
G
K
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
S
S
 
G
F
 
M
T
 
Y
E
 
A
S
 
E
K
 
A
E
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
E
I
 
T
E
 
D
L
 
R
L
 
R
T
 
I
V
 
A
R
 
D
S
 
R
L
 
I
L
 
M
D
 
K
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
L
S
 
T
I
 
V
H
 
W
V
 
L
E
 
D
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
F
 
K
I
 
M
D
 
H
A
 
G
S
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
F
 
L
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
Q
E
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
R
M
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
D
P
 
M
N
 
A
D
 
E
S
 
A
K
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
S
S
 
L
Q
 
A
T
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
A
L
 
L
F
 
A
N
 
E
E
 
Q
S
 
T
D
 
G
L
 
E
T
 
D
P
 
F
E
 
E
K
 
K
W
 
L
M
 
Q
D
 
K
R
 
N
V
 
V
A
 
T
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
R
 
H
A
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
E
S
 
A
M
 
F
E
 
R
D
 
R
N
 
H
N
 
R
V
 
V
K
 
A
E
 
E
L
 
A
I
 
I
K
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
V
Y
 
C
A
 
A
A
 
C
F
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
S
T
 
Q
E
 
E
L
 
M
G
 
E
K
 
R
E
 
Q

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 3:267/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
-
F
 
-
D
 
A
V
 
S
S
 
S
P
 
P
Q
 
L
K
 
A
T
 
T
-
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
29% identity, 97% coverage: 6:266/268 of query aligns to 8:269/272 of 3triA

query
sites
3triA
L
 
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
G
 
A
L
 
R
T
 
N
Y
 
I
A
 
V
E
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
A
S
 
N
P
 
G
F
 
Y
L
 
-
N
 
D
K
 
P
R
 
N
K
 
R
L
 
I
M
 
C
I
 
V
F
 
T
D
x
N
V
x
R
S
|
S
P
 
L
Q
 
D
K
|
K
T
 
L
E
 
D
A
 
F
L
 
F
S
 
K
T
 
E
M
 
K
A
 
C
Q
 
G
F
 
V
D
 
H
A
 
T
Y
 
T
D
 
Q
S
 
D
I
x
N
E
 
R
E
 
Q
C
 
G
V
 
A
P
 
L
K
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
F
 
V
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Y
 
H
H
x
Q
S
 
I
Q
 
K
S
x
M
L
 
V
F
 
C
D
 
E
S
 
E
I
 
L
K
 
K
P
 
D
Y
 
I
I
 
L
N
 
S
Q
 
E
E
 
T
Q
 
K
L
 
I
F
 
L
V
 
V
-
 
I
S
 
S
L
|
L
M
x
A
A
x
V
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
T
N
 
P
T
 
L
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
W
L
 
L
G
 
G
-
 
K
V
 
A
K
 
S
K
 
R
V
 
I
I
 
V
R
 
R
T
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
S
K
 
S
V
 
V
G
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
G
F
 
L
T
 
F
E
 
A
S
 
N
K
 
E
E
 
T
V
 
V
S
 
D
R
 
K
I
 
D
E
 
Q
L
 
K
L
 
N
T
 
L
V
 
A
R
 
E
S
 
S
L
 
I
L
 
M
D
 
R
T
 
A
T
 
V
G
 
G
E
 
L
S
 
V
I
 
I
H
 
W
V
 
V
E
 
S
T
 
S
E
 
E
Q
 
D
F
 
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
K
S
 
I
T
 
A
G
 
A
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
Y
 
L
F
 
I
M
 
M
Q
 
E
S
 
A
M
 
L
L
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
E
K
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
L
S
 
T
P
 
K
N
 
E
D
 
T
S
 
A
K
 
E
V
 
L
L
 
L
V
 
T
S
 
E
Q
 
Q
T
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
R
L
 
M
F
 
A
N
 
L
E
 
E
S
 
T
D
 
E
L
 
Q
T
 
S
P
 
V
E
 
V
K
 
Q
W
 
L
M
 
R
D
 
Q
R
 
F
V
 
V
A
 
T
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
R
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
K
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
N
V
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
F
K
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
L
Y
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
A
T
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
S
K
 
K

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 2:269/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
x
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
x
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 3:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
x
R
K
x
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
x
S
T
x
S
T
 
V
G
|
G
E
x
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
x
L
E
x
H
S
|
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 3:270/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
x
R
K
x
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
x
S
T
 
S
T
 
V
G
|
G
E
x
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
x
L
E
x
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 1:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
x
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
|
E
T
 
-
E
|
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 2:269/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
x
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
x
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8td8A Structure of pycr1 complexed with nadh and 2s-hydroxy-3,3- dimethylbutyric acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 2:269/276 of 8td8A

query
sites
8td8A
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
x
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8td2A Structure of pycr1 complexed with nadh and cyclobutane-1,1- dicarboxylic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 2:269/276 of 8td2A

query
sites
8td2A
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
x
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
x
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
x
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 8:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdbA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1-hydroxyethane-1-sulfonate (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 1:268/275 of 8tdbA

query
sites
8tdbA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
x
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
x
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
x
T
N
 
N
L
x
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
|
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 7:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
 
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8td7A Structure of pycr1 complexed with 2s-hydroxy-3-methylbutyric acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 8:275/282 of 8td7A

query
sites
8td7A
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 8:275/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
 
S
-
 
P
D
 
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K
M
 
M
A
 
G
-
 
V
Q
 
K
F
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
 
H
D
 
N
S
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
E
C
 
T
V
 
V
P
 
Q
K
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
F
I
 
L
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Y
 
H
H
 
I
S
 
I
Q
 
P
S
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
E
I
 
I
K
 
G
P
 
A
Y
 
D
I
 
I
N
 
E
Q
 
D
E
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
S
T
 
S
I
 
I
Q
 
E
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
S
V
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
V
 
V
I
 
I
R
 
R
T
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
L
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
T
 
T
S
 
V
F
 
Y
T
 
A
E
 
T
S
 
G
K
 
T
E
 
H
V
 
A
S
 
Q
R
 
V
I
 
E
E
 
D
L
 
G
L
 
R
T
 
L
V
 
M
R
 
E
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
S
T
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
F
S
 
C
I
 
T
H
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
-
E
 
E
Q
 
D
F
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
S
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
Y
 
T
F
 
A
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
M
 
L
L
 
A
E
 
D
A
 
G
A
 
G
L
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
P
 
R
N
 
R
D
 
L
S
 
A
K
 
V
V
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
A
Q
 
Q
T
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
L
N
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
L
 
Q
T
 
H
P
 
P
E
 
G
K
 
Q
W
 
L
M
 
K
D
 
D
R
 
N
V
 
V
A
 
S
S
|
S
K
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
R
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
H
S
 
V
M
 
L
E
 
E
D
 
S
N
 
G
N
 
G
V
 
F
K
 
R
E
 
S
L
 
L
I
 
L
K
 
I
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
C
D
 
I
R
 
R
A
 
T
T
 
R
E
 
E
L
 
L

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:264/268 of query aligns to 5:272/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
M
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
L
 
F
T
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
G
M
 
F
A
 
T
N
 
A
S
 
A
P
 
G
F
 
V
L
 
L
N
 
A
K
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
I
M
 
M
I
 
A
F
 
S
-
x
S
-
x
P
D
|
D
V
 
M
S
 
D
P
 
L
Q
 
A
K
 
T
T
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
R
T
 
K