SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009780078.1 NCBI__GCF_000152985.1:WP_009780078.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ucwB Structure of mouse decr1 in complex with 2'-5' oligoadenylate (see paper)
46% identity, 95% coverage: 7:284/293 of query aligns to 17:281/281 of 7ucwB

query
sites
7ucwB
M
 
M
L
 
L
R
 
P
D
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
T
K
 
T
Y
 
F
F
 
L
M
 
S
E
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
C
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
|
N
L
 
I
E
 
D
K
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
I
E
 
S
A
 
S
E
 
K
T
 
T
C
 
G
G
 
N
T
 
K
C
 
V
F
 
H
P
 
A
V
 
I
Q
 
R
C
 
C
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
Y
 
P
E
 
D
Q
 
M
V
 
V
V
 
H
A
 
N
M
 
T
R
 
V
D
 
L
A
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
K
Q
 
V
F
 
A
G
 
G
S
 
H
V
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
I
N
 
N
N
 
N
A
|
A
A
|
A
G
 
G
N
 
N
F
 
F
I
 
I
S
 
S
P
 
P
T
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
T
A
 
P
N
 
N
A
 
G
F
 
W
D
 
K
V
 
T
V
 
I
I
 
T
D
 
D
I
|
I
V
 
V
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
A
N
 
Y
C
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
E
F
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
Q
W
 
L
I
 
I
D
 
-
K
 
K
K
 
A
V
 
Q
T
 
K
N
 
G
K
 
A
T
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
A
I
 
I
V
 
T
T
 
T
T
 
I
Y
 
Y
A
 
A
W
 
E
T
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
V
 
M
P
 
P
S
 
S
A
 
S
T
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
N
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M
R
 
R
S
 
F
N
 
N
A
 
I
I
 
I
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
P
F
 
I
P
 
-
T
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
R
W
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
E
L
 
M
S
 
I
K
 
D
K
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
C
R
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
M
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
T
Y
 
F
L
 
L
V
 
C
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
S
 
A
A
 
S
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
R
I
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
E
L
 
V
E
 
F
G
 
L
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
S
L
 
L
Q
 
K
D
 
K
I
 
V
P
 
T
E
 
K
E
 
E
L
 
E
W
 
W
D
 
D
Q
 
I
L
 
I
E
 
E

Q16698 2,4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing], mitochondrial; 2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]; 4-enoyl-CoA reductase [NADPH]; Short chain dehydrogenase/reductase family 18C member 1; EC 1.3.1.124 from Homo sapiens (Human) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:291/293 of query aligns to 47:333/335 of Q16698

query
sites
Q16698
F
 
L
K
 
Q
N
 
K
K
 
A
M
 
M
L
 
L
R
 
P
D
 
P
D
 
N
A
 
S
L
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
K
A
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
T
Y
 
L
F
 
L
M
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
C
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
 
S
R
|
R
N
 
K
L
 
M
E
 
D
K
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
I
E
 
S
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
C
 
G
G
 
N
T
 
K
C
 
V
F
 
H
P
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
 
C
D
|
D
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
 
P
E
 
D
Q
 
M
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
M
 
T
R
 
V
D
 
S
A
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
K
Q
 
V
F
 
A
G
 
G
S
 
H
V
 
P
D
 
N
V
 
I
L
 
V
L
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
|
N
F
|
F
I
 
I
S
 
S
P
 
P
T
 
T
E
 
E
R
 
R
L
 
L
S
|
S
A
 
P
N
 
N
A
 
A
F
 
W
D
 
K
V
 
T
V
 
I
I
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
A
N
 
F
C
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
E
F
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
Q
W
 
L
I
 
I
D
 
-
K
 
K
K
 
A
V
 
Q
T
 
K
N
 
G
K
 
A
T
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
I
 
I
V
 
T
T
 
T
T
 
I
Y
|
Y
A
 
A
W
 
E
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
|
S
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M
R
 
R
S
 
F
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
Q
P
|
P
G
|
G
P
|
P
F
x
I
P
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
A
W
 
F
E
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
D
P
 
P
G
 
T
D
 
G
L
 
T
A
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
-
D
 
E
L
 
M
S
 
I
K
 
G
K
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
C
R
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
V
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
V
 
C
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
S
 
A
A
 
S
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
K
I
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
E
L
 
V
E
 
L
G
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
K
I
 
V
P
 
T
E
 
K
E
 
E
L
 
Q
W
 
W
D
 
D
Q
 
T
L
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
L
V
 
I
K
 
R
A
 
K
K
 
T
R
 
K

1w6uA Structure of human decr ternary complex (see paper)
47% identity, 97% coverage: 3:286/293 of query aligns to 13:288/288 of 1w6uA

query
sites
1w6uA
F
 
L
K
 
Q
N
 
K
K
 
A
M
 
M
L
 
L
R
 
P
D
 
P
D
 
N
A
 
S
L
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
K
A
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
T
Y
 
L
F
 
L
M
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
V
 
C
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
x
K
L
 
M
E
 
D
K
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
I
E
 
S
A
 
S
E
 
Q
T
 
T
C
 
G
G
 
N
T
 
K
C
 
V
F
 
H
P
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
 
C
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
Y
 
P
E
 
D
Q
 
M
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
M
 
T
R
 
V
D
 
S
A
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
K
Q
 
V
F
 
A
G
 
G
S
 
H
V
 
P
D
 
N
V
 
I
L
 
V
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
G
 
G
N
|
N
F
|
F
I
 
I
S
 
S
P
 
P
T
 
T
E
 
E
R
 
R
L
 
L
S
|
S
A
 
P
N
|
N
A
 
A
F
 
W
D
 
K
V
x
T
V
 
I
I
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
K
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
A
N
 
F
C
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
E
F
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
Q
W
 
L
I
 
I
D
 
-
K
 
K
K
 
A
V
 
Q
T
 
K
N
 
G
K
 
A
T
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
S
I
|
I
V
x
T
T
 
T
T
 
I
Y
|
Y
A
|
A
W
 
E
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
V
|
V
V
 
V
P
|
P
S
 
S
A
 
A
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M
R
 
R
S
 
F
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
|
P
F
 
I
P
 
K
T
 
T
K
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
D
P
 
P
G
 
T
D
 
G
L
 
T
A
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
-
D
 
E
L
 
M
S
 
I
K
 
G
K
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
C
R
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
T
H
 
V
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
V
 
C
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
S
 
A
A
 
S
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
K
I
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
E
W
 
E
L
 
V
E
 
L
G
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
K
I
 
V
P
 
T
E
 
K
E
 
E
L
 
Q
W
 
W
D
 
D
Q
 
T
L
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
L

Q9NUI1 Peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing]; pDCR; 2,4-dienoyl-CoA reductase 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 17C member 1; EC 1.3.1.124 from Homo sapiens (Human) (see paper)
40% identity, 86% coverage: 11:263/293 of query aligns to 24:273/292 of Q9NUI1

query
sites
Q9NUI1
D
 
D
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
R
M
 
I
T
 
A
K
 
E
Y
 
I
F
 
F
M
 
M
E
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
Q
 
H
V
 
T
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
 
S
R
|
R
N
x
S
L
|
L
E
x
P
K
x
R
L
 
V
K
 
L
T
 
T
T
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
A
 
G
E
 
A
T
 
T
C
 
G
G
 
R
T
 
R
C
 
C
F
 
L
P
 
P
V
 
L
Q
 
S
C
 
M
D
|
D
V
 
V
R
 
R
D
 
A
Y
 
P
E
 
P
Q
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
M
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
Q
V
 
A
I
 
L
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
F
 
F
I
 
L
S
 
C
P
 
P
T
 
A
E
 
G
R
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
F
D
 
K
V
 
T
V
 
V
I
 
M
D
 
D
I
 
I
V
x
D
L
 
T
K
 
S
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
N
C
 
V
T
 
S
-
 
R
L
 
V
A
 
L
F
 
Y
G
 
E
K
 
K
H
 
F
W
 
F
I
 
R
D
 
D
K
 
H
K
 
-
V
 
-
T
 
-
N
 
G
K
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
T
T
 
A
T
 
T
Y
 
L
A
 
G
W
 
N
T
 
R
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
Y
 
L
V
 
Q
V
 
V
P
 
H
S
 
A
A
 
G
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
L
x
D
A
 
A
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
H
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
P
Y
 
Q
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
|
P
F
x
I
P
x
S
T
x
G
K
x
T
G
 
E
A
 
G
W
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
G
A
 
G
E
 
P
K
 
Q
F
 
A
D
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
T
K
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
N
H
 
K
Q
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
S
A
 
V
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
P
F
 
L
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
L
T
 
V
I
 
A
D
|
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
W
 
W
L
 
L

4fc6B Studies on dcr shed new light on peroxisomal beta-oxidation: crystal structure of the ternary complex of pdcr (see paper)
40% identity, 86% coverage: 11:263/293 of query aligns to 22:271/276 of 4fc6B

query
sites
4fc6B
D
 
D
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
R
M
 
I
T
 
A
K
 
E
Y
 
I
F
 
F
M
 
M
E
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
Q
 
H
V
 
T
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
x
S
L
 
L
E
 
P
K
x
R
L
 
V
K
 
L
T
 
T
T
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
A
 
G
E
 
A
T
 
T
C
 
G
G
 
R
T
 
R
C
 
C
F
 
L
P
 
P
V
 
L
Q
 
S
C
x
M
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
A
Y
 
P
E
 
P
Q
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
M
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
Q
V
 
A
I
 
L
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
x
C
A
|
A
A
|
A
G
|
G
N
|
N
F
|
F
I
 
L
S
 
C
P
 
P
T
 
A
E
 
G
R
 
A
L
 
L
S
|
S
A
 
F
N
|
N
A
|
A
F
 
F
D
 
K
V
x
T
V
 
V
I
 
M
D
 
D
I
|
I
V
 
D
L
 
T
K
 
S
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
N
C
 
V
T
 
S
-
 
R
L
 
V
A
 
L
F
 
Y
G
 
E
K
 
K
H
 
F
W
 
F
I
 
R
D
 
D
K
 
H
K
 
-
V
 
-
T
 
-
N
 
G
K
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
T
T
x
A
T
 
T
Y
x
L
A
 
G
W
 
N
T
 
R
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
Y
 
L
V
x
Q
V
 
V
P
x
H
S
x
A
A
 
G
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
L
 
D
A
 
A
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
H
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
P
Y
 
Q
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
P
F
 
I
P
 
S
T
 
G
K
x
T
G
x
E
A
x
G
W
 
L
E
 
R
R
|
R
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
G
A
 
G
E
 
P
K
 
Q
F
 
A
D
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
T
K
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
N
H
 
K
Q
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
S
A
 
V
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
P
F
 
L
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
L
T
 
V
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
W
 
W
L
 
L

4fc7A Studies on dcr shed new light on peroxisomal beta-oxidation: crystal structure of the ternary complex of pdcr (see paper)
40% identity, 86% coverage: 11:263/293 of query aligns to 21:270/274 of 4fc7A

query
sites
4fc7A
D
 
D
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
F
A
 
R
M
 
I
T
 
A
K
 
E
Y
 
I
F
 
F
M
 
M
E
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
Q
 
H
V
 
T
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
x
S
L
 
L
E
 
P
K
x
R
L
 
V
K
 
L
T
 
T
T
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
A
A
 
G
E
 
A
T
 
T
C
 
G
G
 
R
T
 
R
C
 
C
F
 
L
P
 
P
V
 
L
Q
 
S
C
 
M
D
|
D
V
|
V
R
|
R
D
 
A
Y
 
P
E
 
P
Q
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
M
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
Q
V
 
A
I
 
L
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
x
C
A
|
A
A
|
A
G
|
G
N
|
N
F
|
F
I
 
L
S
 
C
P
 
P
T
 
A
E
 
G
R
 
A
L
 
L
S
|
S
A
 
F
N
|
N
A
|
A
F
 
F
D
 
K
V
x
T
V
 
V
I
 
M
D
 
D
I
 
I
V
 
D
L
 
T
K
 
S
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
N
C
 
V
T
 
S
-
 
R
L
 
V
A
 
L
F
 
Y
G
 
E
K
 
K
H
 
F
W
 
F
I
 
R
D
 
D
K
 
H
K
 
-
V
 
-
T
 
-
N
 
G
K
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
T
T
x
A
T
 
T
Y
 
L
A
 
G
W
 
N
T
 
R
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
Y
 
L
V
x
Q
V
 
V
P
x
H
S
x
A
A
 
G
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
L
 
D
A
 
A
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
H
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
P
Y
 
Q
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
P
F
 
I
P
 
S
T
 
G
K
x
T
G
x
E
A
x
G
W
 
L
E
 
R
R
|
R
L
 
L
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
G
A
 
G
E
 
P
K
 
Q
F
 
A
D
 
S
L
 
L
S
 
S
K
 
T
K
 
K
V
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
N
H
 
K
Q
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
S
A
 
V
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
P
F
 
L
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
L
T
 
V
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
A
W
 
W
L
 
L

Q9BY49 Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase; TERP; 2,4-dienoyl-CoA reductase-related protein; DCR-RP; HPDHase; Short chain dehydrogenase/reductase family 29C member 1; pVI-ARL; EC 1.3.1.38 from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 90% coverage: 13:277/293 of query aligns to 16:295/303 of Q9BY49

query
sites
Q9BY49
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
I
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
I
T
 
V
K
 
K
Y
 
E
F
 
L
M
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
 
S
R
 
R
N
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
K
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
E
 
N
T
 
L
C
 
P
G
 
P
T
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
C
 
V
F
 
I
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
C
 
C
D
 
N
V
 
I
R
 
R
D
 
N
Y
 
E
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
N
A
 
N
M
 
L
R
 
V
D
 
K
A
 
S
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
I
D
 
N
V
 
F
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
G
A
 
G
G
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
A
E
 
E
R
 
H
L
 
I
S
 
S
A
 
S
N
 
K
A
 
G
F
 
W
D
 
H
V
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
E
I
 
T
V
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
Y
C
 
M
T
 
C
L
 
K
A
 
A
F
 
V
G
 
Y
K
 
S
H
 
S
W
 
W
I
 
M
D
 
-
K
 
-
K
 
K
V
 
E
T
 
H
N
 
G
K
 
G
T
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
I
T
 
V
T
 
P
Y
 
T
A
 
K
W
 
-
T
 
A
G
 
G
S
 
F
A
 
P
Y
 
L
V
 
A
V
 
V
P
 
H
S
 
S
A
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
Y
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
W
 
W
A
 
A
K
 
C
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
I
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
V
F
 
I
P
 
Y
T
 
S
K
 
Q
G
 
T
A
 
A
W
 
V
E
 
E
R
 
N
L
 
Y
L
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
S
L
 
W
A
 
G
E
 
Q
K
 
S
F
 
F
-
 
F
-
 
E
D
 
G
L
 
S
S
 
F
K
 
Q
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
P
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
S
N
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
C
Y
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
P
F
 
A
S
 
A
A
 
S
Y
 
F
I
 
I
N
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
H
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
N
W
 
W
L
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
F
 
L
N
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
K
D
 
K
I
 
M
P
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1yxmB Crystal structure of peroxisomal trans 2-enoyl coa reductase
33% identity, 90% coverage: 13:277/293 of query aligns to 9:280/283 of 1yxmB

query
sites
1yxmB
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
I
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
T
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
M
 
I
T
 
V
K
 
K
Y
 
E
F
 
L
M
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
L
K
 
K
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
E
 
N
T
 
L
C
 
P
G
 
P
T
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
C
 
V
F
 
I
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
C
|
C
D
x
N
V
x
I
R
 
R
D
 
N
Y
 
E
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
N
A
 
N
M
 
L
R
 
V
D
 
K
A
 
S
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
I
D
 
N
V
 
F
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
G
A
 
G
G
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
A
E
 
E
R
 
H
L
 
I
S
 
S
A
 
S
N
 
K
A
 
G
F
 
W
D
 
H
V
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
E
I
x
T
V
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
Y
C
 
M
T
 
C
L
 
K
A
 
A
F
 
V
G
 
Y
K
 
S
H
 
S
W
 
W
I
 
M
D
 
-
K
 
-
K
 
K
V
 
E
T
 
H
N
 
G
K
 
G
T
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
I
T
x
V
T
 
P
Y
 
T
A
 
K
W
 
-
T
 
A
G
|
G
S
 
F
A
 
P
Y
 
L
V
 
A
V
 
V
P
x
H
S
|
S
A
 
G
T
 
A
A
 
A
K
x
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
Y
A
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
W
 
W
A
 
A
K
 
C
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
I
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
V
F
 
I
P
 
Y
T
 
S
K
 
Q
G
 
T
A
 
A
W
 
-
E
 
Q
R
 
S
L
 
F
L
 
F
P
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
F
A
 
-
E
 
-
K
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
K
 
Q
K
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
P
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
S
N
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
C
Y
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
P
F
 
A
S
 
A
A
 
S
Y
 
F
I
 
I
N
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
S
V
 
V
T
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
H
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
N
W
 
W
L
 
P
E
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
D
F
 
L
N
 
S
L
 
V
L
 
V
Q
 
K
D
 
K
I
 
M
P
 
K
E
 
E

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
35% identity, 85% coverage: 13:260/293 of query aligns to 4:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
V
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
F
A
 
G
M
 
I
T
 
A
K
 
Q
Y
 
G
F
 
L
M
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
C
Q
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
T
 
A
S
|
S
R
|
R
N
 
N
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
A
K
 
S
T
 
E
T
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
L
 
L
E
 
T
A
 
E
E
 
K
T
 
Y
C
 
G
G
 
V
T
 
E
C
 
T
F
 
M
P
 
A
V
 
F
Q
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
N
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
K
A
 
K
M
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
K
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
V
L
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
A
x
G
G
x
I
N
 
N
F
 
R
I
 
R
S
 
H
P
 
P
T
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
F
S
 
P
A
 
L
N
 
D
A
 
E
F
 
F
D
 
R
V
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
E
I
x
V
V
 
N
L
 
L
K
 
F
G
 
G
S
 
T
K
 
Y
N
 
Y
-
 
V
C
 
C
T
 
R
L
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
S
K
 
-
H
 
-
W
 
-
I
 
L
D
 
L
K
 
R
K
 
E
V
 
S
T
 
D
N
 
N
K
 
P
T
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
V
 
G
T
x
S
-
 
L
T
 
T
Y
 
V
A
 
E
W
 
E
T
 
V
G
 
T
S
 
M
A
 
P
Y
 
N
V
x
I
V
 
S
P
 
A
S
x
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
W
F
x
Y
P
 
R
T
|
T
K
 
K
G
 
-
A
 
-
W
x
M
E
x
T
R
 
E
L
 
A
L
 
V
P
 
F
G
 
S
D
 
D
L
 
-
A
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
L
D
 
D
-
 
Y
L
 
M
S
 
L
K
 
K
K
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
V
 
T
G
 
G
A
 
V
H
 
P
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
K
N
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
E
F
 
E
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
T
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 86% coverage: 13:263/293 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
I
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
M
 
T
T
 
A
K
 
L
Y
 
R
F
 
F
M
 
A
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
N
S
x
D
R
x
I
N
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
R
T
 
A
T
 
T
A
 
V
E
 
D
A
 
E
L
 
F
E
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
G
C
 
H
G
 
R
T
 
V
C
 
L
F
 
G
P
 
A
V
 
V
Q
 
-
C
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
Y
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
V
D
 
K
A
 
Q
V
 
T
I
 
I
E
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
G
 
M
N
 
E
F
 
R
I
 
A
S
 
G
P
 
A
T
 
L
E
 
R
R
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
E
N
 
A
A
 
D
F
 
W
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
V
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
F
 
V
G
 
H
K
 
G
H
 
H
W
 
M
I
 
V
D
 
E
K
 
N
K
 
K
V
 
-
T
 
-
N
 
H
K
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
-
T
 
A
T
x
S
Y
 
R
A
 
A
W
 
W
T
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
A
Y
 
G
V
 
Q
V
 
T
P
 
P
S
x
Y
A
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
F
x
I
P
 
H
T
 
T
K
 
P
G
 
-
A
 
M
W
 
W
E
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
P
P
 
E
G
 
K
D
 
D
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
K
 
Q
F
 
F
D
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
R
K
 
Q
V
 
-
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
E
H
 
P
Q
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
N
 
N
L
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
D
D
 
D
F
 
D
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
R
W
 
S
L
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 86% coverage: 13:263/293 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
Q
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
I
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
K
 
K
A
 
Q
M
 
T
T
 
A
K
 
L
Y
 
R
F
 
F
M
 
A
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
N
S
x
D
R
 
I
N
 
D
L
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
R
T
 
A
T
 
T
A
 
V
E
 
D
A
 
E
L
 
F
E
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
G
C
 
H
G
 
R
T
 
V
C
 
L
F
 
G
P
 
A
V
 
V
Q
 
-
C
 
A
D
|
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
Y
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
V
D
 
K
A
 
Q
V
 
T
I
 
I
E
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
G
 
M
N
 
E
F
 
R
I
 
A
S
 
G
P
 
A
T
 
L
E
 
R
R
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
E
N
 
A
A
 
D
F
 
W
D
 
D
V
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
V
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
T
K
 
F
N
 
L
C
 
C
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
F
 
V
G
 
H
K
 
G
H
 
H
W
 
M
I
 
V
D
 
E
K
 
N
K
 
K
V
 
-
T
 
-
N
 
H
K
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
-
T
 
A
T
 
S
Y
 
R
A
 
A
W
 
W
T
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
A
Y
 
G
V
 
Q
V
 
T
P
 
P
S
x
Y
A
 
S
T
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
F
 
I
P
 
H
T
 
T
K
 
P
G
 
-
A
 
M
W
 
W
E
 
D
R
 
E
L
 
L
L
 
P
P
 
E
G
 
K
D
 
D
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
K
 
Q
F
 
F
D
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
R
K
 
Q
V
 
-
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
E
H
 
P
Q
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
N
 
N
L
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
D
D
 
D
F
 
D
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
R
W
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 85% coverage: 13:260/293 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
Q
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
M
 
A
T
 
A
K
 
R
Y
 
V
F
 
F
M
 
M
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
x
D
R
x
F
N
 
N
L
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
G
K
 
K
T
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
N
T
 
P
C
 
-
G
 
G
T
 
V
C
 
V
F
 
F
P
 
-
V
 
I
Q
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
Y
 
R
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
V
 
H
A
 
R
M
 
L
R
 
V
D
 
E
A
 
N
V
 
V
I
 
A
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
G
x
I
N
 
T
F
 
R
I
x
D
S
 
S
P
 
M
T
 
L
E
 
S
R
x
K
L
 
M
S
 
T
A
 
V
N
 
D
A
 
Q
F
 
F
D
 
Q
V
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
V
x
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
V
K
 
F
N
 
H
C
 
C
T
 
T
L
 
Q
A
 
A
F
 
V
G
 
L
K
 
P
H
 
Y
W
 
M
I
 
A
D
 
E
K
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
G
K
 
K
V
 
I
T
 
I
N
 
N
K
x
T
T
 
S
I
 
-
L
 
-
N
x
S
I
 
V
V
 
T
T
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
G
W
x
N
T
x
V
G
 
G
S
x
Q
A
 
T
Y
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
N
S
x
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
A
K
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
F
x
T
P
 
E
T
|
T
K
 
A
G
x
M
A
 
V
W
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
-
L
 
V
P
 
P
G
 
E
D
 
K
L
 
V
A
 
I
E
 
E
K
|
K
F
 
-
D
 
-
L
 
M
S
 
K
K
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
A
 
K
H
 
P
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
A
N
 
N
L
 
A
A
 
Y
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
H
F
 
E
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
V
V
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
32% identity, 85% coverage: 13:260/293 of query aligns to 11:255/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
V
Y
 
R
F
 
F
M
 
G
E
 
Q
L
 
E
G
 
E
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
N
S
 
Y
R
x
Y
N
 
N
L
 
N
E
 
E
K
 
E
L
 
E
K
 
A
T
 
L
T
 
D
A
 
A
E
 
K
A
 
K
L
 
E
E
 
V
A
 
E
E
 
E
T
 
A
C
 
G
G
 
G
T
 
Q
C
 
A
F
 
I
P
 
I
V
 
V
Q
 
Q
C
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
Y
 
E
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
N
M
 
L
R
 
V
D
 
Q
A
 
T
V
 
A
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
L
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
G
x
V
N
x
E
F
 
N
I
 
P
S
 
V
P
 
P
T
 
S
E
 
H
R
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
L
N
 
D
A
 
N
F
 
W
D
 
N
V
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
V
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
A
K
 
F
N
 
L
C
 
G
T
 
S
L
 
R
A
 
E
F
 
A
G
 
I
K
 
K
H
 
Y
W
 
F
I
 
V
D
 
E
K
 
N
K
 
D
V
 
I
T
 
K
N
 
G
K
 
-
T
 
N
I
 
V
L
 
I
N
 
N
I
x
M
V
 
S
T
x
S
T
 
V
Y
x
H
A
 
E
W
 
M
T
 
I
G
 
P
S
x
W
A
 
P
Y
 
L
V
 
F
V
 
V
P
 
H
S
x
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
L
 
K
A
 
L
M
 
M
T
 
T
R
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
K
 
P
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
P
 
A
F
x
M
P
 
N
T
|
T
K
x
P
G
x
I
A
x
N
W
 
A
E
 
E
R
x
K
L
 
F
L
 
-
P
 
-
G
 
A
D
 
D
L
 
P
A
 
V
E
 
Q
K
 
R
F
 
A
D
 
D
L
 
V
S
 
E
K
 
S
K
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
Y
V
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
P
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
N
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
S
F
 
Q
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
I
V
 
T
V
 
L
T
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
31% identity, 85% coverage: 13:260/293 of query aligns to 14:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
L
 
L
Q
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
G
S
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
T
M
 
L
T
 
A
K
 
R
Y
 
G
F
 
L
M
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
A
 
V
I
 
I
T
 
N
S
 
D
R
|
R
N
 
N
L
 
E
E
 
E
K
 
K
L
 
A
K
 
A
T
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
R
L
 
F
E
 
R
A
 
D
E
 
E
T
 
G
C
 
F
G
 
A
T
 
A
C
 
D
F
 
H
P
 
A
V
 
V
Q
 
-
C
 
F
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
E
Y
 
H
E
 
A
Q
 
Q
V
 
V
V
 
R
A
 
A
M
 
A
R
 
I
D
 
D
A
 
E
V
 
F
I
 
E
E
 
A
Q
 
R
F
 
V
G
 
G
S
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
G
 
I
N
 
Q
F
 
R
I
 
R
S
 
A
P
 
P
T
 
L
E
 
D
R
 
A
L
 
F
S
 
E
A
 
P
N
 
D
A
 
D
F
 
W
D
 
H
V
 
A
V
 
L
I
 
M
D
 
R
I
 
V
V
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
S
 
V
K
 
F
N
 
N
C
 
V
T
 
A
L
 
Q
A
 
A
F
 
V
G
 
A
K
 
R
H
 
H
W
 
M
I
 
I
D
 
A
K
 
R
K
 
G
V
 
-
T
 
-
N
 
H
K
 
G
T
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
V
 
C
T
x
S
T
 
V
Y
 
Q
A
 
S
W
 
E
T
 
L
G
 
A
S
 
R
A
 
P
Y
 
T
V
 
I
V
 
A
P
 
P
S
x
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
L
 
R
A
 
M
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
G
L
 
M
A
 
C
V
 
A
E
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
Q
S
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
Y
F
|
F
P
 
E
T
|
T
K
 
E
G
 
-
A
 
-
W
x
L
E
x
N
R
 
R
L
 
A
L
 
L
P
 
V
G
 
D
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
F
K
 
S
F
 
D
D
 
W
L
 
L
S
 
C
K
 
K
K
 
R
V
 
T
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
V
 
W
G
 
G
A
 
Q
H
 
V
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
C
N
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
I
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
A
F
 
A
S
 
S
A
 
D
Y
 
F
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
T
V
 
L
T
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7x5jC Acp-dependent oxoacyl reductase
32% identity, 85% coverage: 12:260/293 of query aligns to 1:250/256 of 7x5jC

query
sites
7x5jC
A
 
S
L
 
L
Q
 
Q
G
 
K
K
 
R
T
 
V
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
 
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
K
 
R
A
 
V
M
 
H
T
 
A
K
 
L
Y
 
T
F
 
L
M
 
A
E
 
Q
L
 
N
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
T
 
T
-
 
G
S
x
N
R
|
R
N
|
N
L
 
I
E
 
D
K
 
K
L
 
A
K
 
E
T
 
S
T
 
V
A
 
A
E
 
N
A
 
E
L
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
-
T
 
L
C
 
G
G
 
R
T
 
K
C
 
A
F
 
L
P
 
A
V
 
I
Q
 
K
C
 
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
N
Y
 
E
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
V
 
N
A
 
E
M
 
G
R
 
V
D
 
E
A
 
K
V
 
I
I
 
K
E
 
K
Q
 
E
F
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
G
 
S
N
 
G
F
 
I
I
 
V
S
 
R
P
 
A
T
 
T
-
 
L
-
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
T
S
 
A
A
 
K
N
 
E
A
 
D
F
 
W
D
 
D
V
 
Q
V
 
D
I
 
L
D
 
R
I
x
V
V
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
S
 
A
K
 
F
N
 
N
C
 
C
T
 
I
L
 
K
A
 
A
F
 
V
G
 
-
K
 
-
H
 
-
W
 
I
I
 
P
D
 
D
K
 
M
K
 
K
V
 
K
T
 
N
N
 
N
-
 
W
K
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
V
 
S
T
 
S
T
 
V
Y
 
T
A
 
G
W
 
T
T
 
M
G
 
G
S
 
G
A
 
S
Y
 
G
V
 
Q
V
 
C
P
 
S
S
x
Y
A
 
A
T
 
T
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
V
 
L
E
 
E
W
 
G
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
G
 
N
I
 
I
R
 
T
S
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
V
P
x
L
G
|
G
P
x
V
F
 
F
P
 
G
T
 
G
K
 
R
G
 
G
A
x
R
W
 
E
E
 
D
R
x
S
L
x
S
L
 
F
P
 
Y
G
 
-
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
P
F
 
F
-
 
R
-
 
E
D
 
R
L
 
I
S
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
T
P
 
A
L
 
M
R
 
R
R
 
R
V
 
P
G
 
G
A
 
D
H
 
P
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
S
N
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
F
 
E
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
A
V
 
I
T
 
V
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
32% identity, 85% coverage: 16:263/293 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
T
 
S
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
M
 
I
T
 
A
K
 
L
Y
 
Q
F
 
L
M
 
A
E
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
T
 
N
-
 
Y
S
 
A
R
 
G
N
 
S
L
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
K
 
E
T
 
A
T
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
K
T
 
G
C
 
V
G
 
D
T
 
S
C
 
-
F
 
F
P
 
A
V
 
I
Q
 
Q
C
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
V
 
K
A
 
A
M
 
M
R
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
G
 
I
N
 
T
F
 
R
I
 
D
S
 
N
P
 
L
T
 
L
E
 
M
R
 
R
L
 
M
S
 
K
A
 
E
N
 
Q
A
 
E
F
 
W
D
 
D
V
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
V
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
V
K
 
F
N
 
N
C
 
C
T
 
I
L
 
Q
A
 
K
F
 
A
G
 
T
K
 
P
H
 
Q
W
 
M
I
 
L
D
 
R
K
 
Q
K
 
R
V
 
-
T
 
-
N
 
S
K
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
I
N