SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010180305.1 NCBI__GCF_000255455.1:WP_010180305.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

2b33B Crystal structure of a putative endoribonuclease (tm0215) from thermotoga maritima msb8 at 2.30 a resolution
50% identity, 99% coverage: 2:126/126 of query aligns to 1:124/126 of 2b33B

query
sites
2b33B
K
 
K
Q
 
R
I
 
F
I
 
V
N
 
E
T
 
T
Q
 
D
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
K
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
V
N
 
G
D
 
N
T
 
M
L
 
M
Y
 
F
I
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
I
D
|
D
P
 
P
T
x
E
T
 
T
G
 
G
N
 
E
L
 
L
I
 
V
T
 
Q
D
 
G
A
 
T
I
 
I
T
 
E
L
 
E
E
 
K
T
 
T
K
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
L
T
 
E
E
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
F
T
 
S
F
 
L
E
 
K
N
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
V
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
T
T
 
T
N
 
S
M
 
M
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
Q
T
 
R
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
D
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
-
N
 
G
D
 
D
A
 
H
A
 
R
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
A
S
 
Q
L
 
L
P
 
P
K
 
R
G
 
N
V
 
V
N
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
K

5v4dA Crystal structure of the protein of unknown function of the conserved rid protein family yyfa from yersinia pestis
54% identity, 98% coverage: 2:124/126 of query aligns to 3:125/127 of 5v4dA

query
sites
5v4dA
K
 
K
Q
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
E
T
 
T
Q
 
K
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
S
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
C
T
 
F
N
 
N
D
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
D
T
 
T
G
 
G
N
 
D
L
 
L
I
 
V
T
 
E
D
 
N
A
 
D
I
 
I
T
 
E
L
 
K
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
K
N
 
N
L
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
T
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
T
T
 
T
F
 
K
E
 
D
N
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
L
 
I
T
 
T
N
 
N
M
 
I
E
 
N
Y
 
N
F
 
S
A
 
S
T
 
Q
V
 
V
N
 
N
E
x
D
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
D
|
D
Y
 
Y
F
 
F
S
 
K
N
 
G
D
 
T
A
 
I
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
S
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A

P52759 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Liver perchloric acid-soluble protein; L-PSP; Reactive intermediate imine deaminase A homolog; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen homolog; rp14.5; EC 3.5.99.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
48% identity, 100% coverage: 1:126/126 of query aligns to 5:129/137 of P52759

query
sites
P52759
M
 
I
K
 
R
Q
 
K
I
 
V
I
 
I
N
 
S
T
 
T
Q
 
S
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
A
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
L
T
 
V
N
 
D
D
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
P
T
 
S
T
 
S
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
I
 
V
T
 
P
D
 
G
A
 
G
I
 
V
T
 
A
L
 
E
E
 
E
T
 
A
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
C
T
 
D
F
 
F
E
 
T
N
 
N
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
T
I
 
V
F
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
M
 
I
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
G
T
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
 
K
D
 
T
Y
 
Y
F
 
F
S
 
Q
N
 
G
D
 
N
A
 
-
A
 
L
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
A
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
S
N
 
R
V
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

P80601 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; 14.3 kDa perchloric acid soluble protein; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen; EC 3.5.99.10; EC 3.1.-.- from Capra hircus (Goat) (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:126/126 of query aligns to 5:129/137 of P80601

query
sites
P80601
M
 
V
K
 
R
Q
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
S
T
 
T
Q
 
A
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
L
T
 
V
N
 
D
D
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
P
T
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
I
 
V
T
 
P
D
 
G
A
 
G
I
 
V
T
 
V
L
 
E
E
 
E
T
 
A
K
 
K
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
T
N
 
N
L
 
I
K
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
C
T
 
D
F
 
F
E
 
T
N
 
N
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
A
S
 
T
I
 
V
F
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
M
 
I
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
S
T
 
A
V
 
V
N
 
N
E
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
K
D
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
S
 
Q
N
 
S
D
 
-
A
 
S
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
A
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
G
N
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3k0tC Crystal structure of pspto -psp protein in complex with d-beta-glucose from pseudomonas syringae pv. Tomato str. Dc3000 (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:125/126 of query aligns to 1:122/124 of 3k0tC

query
sites
3k0tC
K
 
K
Q
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
T
T
 
S
Q
 
D
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
K
T
 
A
N
 
G
D
 
N
T
 
T
L
 
V
Y
 
Y
I
 
M
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
I
|
I
A
 
P
I
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
M
N
 
E
L
 
L
I
 
V
T
 
-
D
 
E
A
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
A
E
 
Q
T
 
I
K
 
T
Q
 
Q
V
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
S
I
 
V
L
 
A
T
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
G
T
 
S
F
 
F
E
 
K
N
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
L
S
 
N
I
 
I
F
 
F
L
 
L
T
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
G
Y
 
H
F
|
F
A
 
A
T
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Y
 
M
A
 
G
D
 
S
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
N
 
Q
D
 
P
A
 
-
A
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
A
T
 
A
V
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
x
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
V
 
V
E
|
E
I
 
M
S
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
L
V
 
V

7cd4A Crystal structure of the s103f mutant of bacillus subtilis (natto) yabj protein. (see paper)
48% identity, 96% coverage: 5:125/126 of query aligns to 4:122/124 of 7cd4A

query
sites
7cd4A
I
 
V
N
x
H
T
 
T
Q
 
K
N
x
H
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
L
 
I
T
 
V
N
 
N
D
 
N
T
 
M
L
 
F
Y
 
Y
I
 
S
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
L
D
 
T
P
 
P
T
 
S
T
 
-
G
 
G
N
 
E
L
 
M
I
 
V
T
 
N
D
 
G
A
 
D
I
 
I
T
 
K
L
x
E
E
 
Q
T
 
T
K
 
H
Q
 
Q
V
 
V
L
 
F
E
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
L
T
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
A
T
 
S
F
 
F
E
 
E
N
 
T
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
A
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
I
T
 
A
N
 
D
M
 
M
E
 
E
Y
 
Q
F
 
F
A
 
A
T
 
E
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
S
 
D
N
 
T
D
 
H
A
 
-
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
F
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
A
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
L

Q7CP78 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Enamine/imine deaminase; EC 3.5.99.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:126/126 of query aligns to 1:127/128 of Q7CP78

query
sites
Q7CP78
M
 
M
K
 
S
Q
 
K
I
 
T
I
 
I
N
 
A
T
 
T
Q
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
 
V
Q
 
Q
A
 
G
I
 
V
L
 
D
T
 
L
N
 
G
D
 
S
T
 
M
L
 
V
Y
 
I
I
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
K
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
V
I
 
A
T
 
E
D
 
D
A
 
-
I
 
V
T
 
S
L
 
A
E
 
Q
T
 
A
K
 
R
Q
 
Q
V
 
S
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
E
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
L
T
 
K
F
 
V
E
 
G
N
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
V
T
 
K
N
 
D
M
 
L
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
A
I
 
T
Y
 
Y
A
 
E
D
 
A
Y
 
F
F
 
F
S
 
T
N
 
E
D
 
H
A
 
N
A
 
A
-
 
T
-
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
S
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
I
E
|
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R

Q94JQ4 Reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic; 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; EC 3.5.99.10 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:124/126 of query aligns to 64:185/187 of Q94JQ4

query
sites
Q94JQ4
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
I
 
V
N
 
S
T
 
T
Q
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
K
T
 
A
N
 
N
D
 
N
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
A
 
G
I
 
L
D
 
I
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
F
I
 
V
T
 
S
D
 
E
A
 
S
I
 
V
T
 
E
L
 
D
E
 
Q
T
 
T
K
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
K
N
 
N
L
 
M
K
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
A
T
 
D
F
 
Y
E
 
S
N
 
S
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
M
 
L
E
 
A
Y
 
D
F
 
F
A
 
K
T
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
F
 
F
S
 
P
N
 
A
D
 
P
A
 
-
A
 
S
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
S
T
 
T
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
G
 
N
V
 
A
N
 
K
V
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

2uynA Crystal structure of e. Coli tdcf with bound 2-ketobutyrate (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:126/126 of query aligns to 1:126/127 of 2uynA

query
sites
2uynA
K
 
K
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
E
T
 
T
Q
 
Q
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
G
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
V
Q
 
Q
A
 
G
I
 
V
L
 
D
T
 
L
N
 
G
D
 
S
T
 
M
L
 
V
Y
 
F
I
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
V
D
 
C
P
 
P
T
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
E
L
 
I
I
 
P
T
 
A
D
 
D
A
 
-
I
 
V
T
 
Q
L
 
D
E
 
Q
T
 
A
K
 
R
Q
 
L
V
 
S
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
L
T
 
S
F
 
V
E
 
G
N
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
K
T
 
M
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
I
T
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
N
Y
 
D
F
|
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
K
D
 
Q
Y
 
F
F
 
F
S
 
D
N
 
E
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
E
x
S
T
x
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R

2uykC Crystal structure of e. Coli tdcf with bound serine (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:126/126 of query aligns to 1:126/127 of 2uykC

query
sites
2uykC
K
 
K
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
E
T
 
T
Q
 
Q
N
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
G
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
V
Q
 
Q
A
 
G
I
 
V
L
 
D
T
 
L
N
 
G
D
 
S
T
 
M
L
 
V
Y
 
F
I
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
V
D
 
C
P
 
P
T
 
Q
T
 
T
G
 
G
N
 
E
L
 
I
I
 
P
T
 
A
D
 
D
A
 
-
I
 
V
T
 
Q
L
 
D
E
 
Q
T
 
A
K
 
R
Q
 
L
V
 
S
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
L
T
 
S
F
 
V
E
 
G
N
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
K
T
 
M
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
I
T
 
T
N
 
D
M
 
L
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
K
D
 
Q
Y
 
F
F
 
F
S
 
D
N
 
E
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
E
x
S
T
x
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R

8yrcA Chlorinated yabj from staphylococcus aureus (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:124/126 of query aligns to 3:122/125 of 8yrcA

query
sites
8yrcA
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
Q
 
T
N
 
R
A
 
L
P
|
P
A
 
E
P
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
Q
x
H
A
 
A
I
 
T
L
 
V
T
 
V
N
 
N
D
 
G
T
 
M
L
 
V
Y
 
Y
I
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
|
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
L
D
 
N
P
 
-
T
 
V
T
 
D
G
 
G
N
 
K
L
 
I
I
 
V
T
 
S
D
 
A
A
 
D
I
 
V
T
 
Q
L
 
A
E
 
Q
T
 
T
K
 
K
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
S
T
 
D
F
 
L
E
 
N
N
 
S
I
 
V
V
 
A
K
 
K
T
 
A
S
 
T
I
 
I
F
 
F
L
 
I
T
 
K
N
 
D
M
 
M
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
Q
T
 
K
V
 
I
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
D
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
S
 
-
N
 
N
D
 
E
A
 
H
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
L
I
 
V
A
 
S

3vczB 1.80 angstrom resolution crystal structure of a putative translation initiation inhibitor from vibrio vulnificus cmcp6
41% identity, 98% coverage: 3:126/126 of query aligns to 2:127/127 of 3vczB

query
sites
3vczB
Q
 
K
I
 
V
I
 
L
N
 
H
T
 
T
Q
 
D
N
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
 
I
Q
 
Q
A
 
G
I
 
V
L
 
D
T
 
L
N
 
G
D
 
N
T
 
M
L
 
V
Y
 
L
I
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
P
I
 
V
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
E
L
 
V
I
 
P
T
 
A
D
 
D
A
 
-
I
 
I
T
 
A
L
 
A
E
 
Q
T
 
A
K
 
R
Q
 
Q
V
 
S
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
E
E
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
L
T
 
T
F
 
V
E
 
G
N
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
M
S
 
T
I
 
V
F
 
F
L
 
V
T
 
K
N
x
D
M
 
L
E
x
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
G
T
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
D
 
N
Y
 
F
F
 
F
S
 
D
N
 
E
D
 
H
A
 
N
A
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
C
V
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
A
S
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
V
N
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
R

A0A1J1DL12 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Allergen Der f 34; Enamine/imine deaminase; Allergen Der f 34.0101; EC 3.5.99.10 from Dermatophagoides farinae (American house dust mite) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:125/126 of query aligns to 4:126/128 of A0A1J1DL12

query
sites
A0A1J1DL12
K
 
K
Q
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
S
T
 
T
Q
 
P
N
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
L
 
Q
T
 
V
N
 
G
D
 
N
T
 
T
L
 
V
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
I
 
M
D
 
N
P
 
V
T
 
R
T
 
T
G
 
N
N
 
E
L
 
M
I
 
V
T
 
T
D
 
G
A
 
P
I
 
I
T
 
R
L
 
D
E
 
E
T
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
L
 
F
E
 
T
N
|
N
L
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
E
E
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
A
T
 
K
F
 
M
E
 
S
N
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
V
S
 
N
I
 
I
F
 
F
L
 
I
T
 
R
N
 
N
M
 
F
E
 
N
Y
 
D
F
 
F
A
 
P
T
 
A
V
 
I
N
|
N
E
 
D
I
 
V
Y
 
M
A
 
K
D
 
E
Y
 
F
F
 
F
S
 
Q
N
 
S
D
 
-
A
 
P
A
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
A
S
 
E
L
 
L
P
|
P
K
 
K
G
 
N
V
 
A
N
 
R
V
 
V
E
|
E
I
 
I
S
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5hp8A Crystal structures of rida in complex with pyruvate (see paper)
40% identity, 85% coverage: 18:124/126 of query aligns to 1:106/108 of 5hp8A

query
sites
5hp8A
N
 
S
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
K
T
 
A
N
 
N
D
 
N
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
A
 
G
I
 
L
D
 
I
P
 
P
T
 
E
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
F
I
 
V
T
 
S
D
 
E
A
 
S
I
 
V
T
 
E
L
 
D
E
 
Q
T
 
T
K
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
K
N
 
N
L
 
M
K
 
G
A
 
E
I
 
I
L
 
L
T
 
K
E
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
A
T
 
D
F
 
Y
E
 
S
N
 
S
I
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
M
 
L
E
 
A
Y
 
D
F
 
F
A
 
K
T
 
T
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
F
 
F
S
 
P
N
 
A
D
 
-
A
 
P
A
 
S
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
S
T
|
T
V
 
Y
A
 
Q
V
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
L
G
 
N
V
 
A
N
 
K
V
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
E
A
 
C
I
 
I
A
 
A

P0AFQ5 3-aminoacrylate deaminase RutC; 3-AA deaminase; EC 3.5.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:124/126 of query aligns to 3:124/128 of P0AFQ5

query
sites
P0AFQ5
K
 
K
Q
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
I
T
 
P
Q
 
A
N
 
G
A
 
S
P
 
S
A
 
A
P
 
P
I
 
L
G
 
A
P
 
P
Y
 
F
N
 
V
Q
 
P
A
 
G
I
 
T
L
 
L
T
 
A
N
 
D
D
 
G
T
 
V
L
 
V
Y
 
Y
I
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
I
 
L
A
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
Q
T
 
H
T
 
N
G
 
N
N
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
D
I
 
P
T
 
K
L
 
A
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
K
I
 
V
L
 
I
T
 
E
E
 
T
A
 
A
G
 
G
F
 
G
T
 
T
F
 
M
E
 
A
N
 
D
I
 
V
V
 
T
K
 
F
T
 
N
S
 
S
I
 
I
F
 
F
L
 
I
T
 
T
N
 
D
M
 
W
E
 
K
Y
 
N
F
 
Y
A
 
A
T
 
A
V
 
I
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
F
 
F
S
 
P
N
 
G
D
 
D
A
 
-
A
 
K
P
 
P
A
 
A
R
|
R
E
 
F
T
 
C
V
 
I
A
 
Q
V
 
C
N
 
G
S
 
L
L
 
V
P
 
K
K
 
P
G
 
D
V
 
A
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
A

9bk8A Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with 2-ketobutyric acid bound
31% identity, 85% coverage: 20:126/126 of query aligns to 15:115/116 of 9bk8A

query
sites
9bk8A
A
 
A
I
 
V
L
 
C
T
 
F
N
 
D
D
 
A
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
G
T
 
Q
G
 
A
N
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
D
I
 
I
T
 
H
L
 
G
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
S
T
 
R
F
 
K
E
 
E
N
 
R
I
 
I
V
 
L
K
 
S
T
 
A
S
 
T
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
T
 
K
N
 
D
M
 
I
E
 
A
Y
 
R
-
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
T
D
 
Q
Y
 
W
F
 
L
S
 
P
N
 
T
D
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
|
R
E
x
T
T
|
T
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
E
S
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
A
R
 
R

9bk4A Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with pyruvic acid bound
31% identity, 85% coverage: 20:126/126 of query aligns to 15:115/116 of 9bk4A

query
sites
9bk4A
A
 
A
I
 
V
L
 
C
T
 
F
N
 
D
D
 
A
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
G
T
 
Q
G
 
A
N
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
D
I
 
I
T
 
H
L
 
G
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
S
T
 
R
F
 
K
E
 
E
N
 
R
I
 
I
V
 
L
K
 
S
T
 
A
S
 
T
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
T
 
K
N
 
D
M
 
I
E
 
A
Y
 
R
-
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
T
D
 
Q
Y
 
W
F
 
L
S
 
P
N
 
T
D
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
|
R
E
x
T
T
|
T
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
E
S
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
A
R
 
R

9bjyA Crystal structure of rida family protein pa5083 from pseudomonas aeruginosa with tmao bound
31% identity, 85% coverage: 20:126/126 of query aligns to 13:113/113 of 9bjyA

query
sites
9bjyA
A
 
A
I
 
V
L
 
C
T
 
F
N
 
D
D
 
A
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
G
T
 
Q
G
 
A
N
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
D
I
 
I
T
 
H
L
 
G
E
 
Q
T
 
T
K
 
R
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
A
N
 
K
L
 
I
K
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
S
T
 
R
F
 
K
E
 
E
N
 
R
I
 
I
V
 
L
K
 
S
T
 
A
S
 
T
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
T
 
K
N
 
D
M
 
I
E
 
A
Y
 
R
-
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
N
 
N
E
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
T
D
 
Q
Y
 
W
F
 
L
S
 
P
N
 
T
D
 
G
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
S
R
 
R
E
x
T
T
|
T
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
N
 
E
S
 
L
L
 
A
P
 
R
K
 
P
G
 
S
V
 
V
N
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
A
R
 
R

Query Sequence

>WP_010180305.1 NCBI__GCF_000255455.1:WP_010180305.1
MKQIINTQNAPAPIGPYNQAILTNDTLYISGQIAIDPTTGNLITDAITLETKQVLENLKA
ILTEAGFTFENIVKTSIFLTNMEYFATVNEIYADYFSNDAAPARETVAVNSLPKGVNVEI
SAIAVR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory