SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010437890.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_010437890.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P77455 Bifunctional protein PaaZ; EC 3.3.2.12; EC 1.2.1.91 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
52% identity, 100% coverage: 3:674/674 of query aligns to 1:674/681 of P77455

query
sites
P77455
L
 
M
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
S
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
T
W
 
W
V
 
Q
A
 
S
P
 
G
G
 
R
E
 
G
G
 
R
A
 
S
R
 
R
T
 
L
I
 
I
A
 
H
S
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
A
F
 
L
A
 
W
S
 
E
A
 
V
G
 
T
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
L
 
R
D
 
Q
Y
 
F
A
 
A
R
 
I
N
 
E
T
 
K
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
M
T
 
T
F
 
F
H
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
H
L
 
L
S
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
K
Q
 
E
A
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Q
 
R
K
 
A
D
 
D
H
 
S
L
 
W
I
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
M
 
L
F
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
K
 
L
G
 
G
R
 
S
R
 
R
E
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
V
 
L
Y
 
W
L
 
P
D
 
E
G
 
D
D
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
G
F
 
F
L
 
A
G
 
A
Q
 
R
H
 
H
I
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
S
L
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
C
W
 
W
G
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
W
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
A
T
 
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
Q
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
A
A
 
M
V
 
V
R
 
K
I
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
L
L
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
C
 
S
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
N
 
A
T
 
T
A
 
G
L
 
Q
K
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
V
T
 
Q
P
 
P
A
 
N
I
 
I
L
 
V
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
I
R
 
P
F
 
F
V
 
T
A
 
M
E
|
E
Q
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
C
S
 
C
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
P
D
 
Q
S
 
A
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
S
S
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
G
T
 
V
R
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
G
 
E
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
G
 
G
Q
 
C
E
 
E
A
 
I
E
 
-
R
 
R
V
 
L
Y
 
G
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
S
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
C
 
C
A
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
K
 
E
A
 
T
Q
 
P
R
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
M
G
 
P
Y
 
A
R
 
Q
D
 
N
L
 
Q
D
 
R
H
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
C
R
 
A
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
A
D
 
D
T
 
P
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
F
V
 
I
M
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
Y
 
T
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
Y
 
Q
I
 
I
N
 
L
D
 
N
R
 
E
N
 
E
S
 
S
M
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Q
M
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
T
M
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
A
I
 
I
G
 
S
T
 
K
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
T
 
R
G
 
G
S
 
A
P
 
K
E
 
V
I
 
E
Q
 
E
G
 
D
P
 
R
A
 
I
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
R
R
 
K
K
 
Y
F
 
F
G
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
L
H
 
L
T
 
T
A
 
P
S
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
M
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
V
H
 
N
F
 
F
A
 
A
N
 
C
F
 
L
T
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
H
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
K
E
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
S
P
 
-
F
 
I
F
 
F
P
 
G
G
 
E
R
 
R
V
 
V
A
 
V
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
L
 
V
L
 
L
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
D
P
 
A
N
 
G
E
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
S
L
 
L
R
 
R
F
 
F
M
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
T
 
T
P
 
L
R
 
K
N
 
K
D
 
Q
D
 
R
Y
 
S
G
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
E
W
 
W
H
 
A
V
 
V
S
 
E
L
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
D
 
H
D
 
Q
E
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
L
Y
 
Y
E
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
L
N
 
V
A
 
A
R
 
R

6jqoA Structure of paaz, a bifunctional enzyme in complex with NADP+ and ccoa (see paper)
52% identity, 100% coverage: 4:674/674 of query aligns to 1:673/678 of 6jqoA

query
sites
6jqoA
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
S
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
T
W
 
W
V
 
Q
A
 
S
P
 
G
G
 
R
E
 
G
G
 
R
A
 
S
R
 
R
T
 
L
I
 
I
A
 
H
S
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
A
F
 
L
A
 
W
S
 
E
A
 
V
G
 
T
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
L
 
R
D
 
Q
Y
 
F
A
 
A
R
 
I
N
 
E
T
 
K
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
M
T
 
T
F
 
F
H
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
H
L
 
L
S
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
K
Q
 
E
A
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Q
 
R
K
 
A
D
 
D
H
 
S
L
 
W
I
x
V
D
 
D
I
 
I
D
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
M
 
L
F
|
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
|
S
K
 
L
G
 
G
R
 
S
R
 
R
E
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
V
 
L
Y
 
W
L
 
P
D
 
E
G
 
D
D
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
G
F
 
F
L
 
A
G
 
A
Q
 
R
H
 
H
I
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
S
L
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
I
 
I
N
|
N
A
 
A
F
|
F
N
|
N
F
|
F
P
 
P
V
 
C
W
|
W
G
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
W
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
A
T
|
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
Q
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
A
A
 
M
V
 
V
R
 
K
I
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
L
L
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
C
 
S
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
A
N
 
A
T
|
T
A
 
G
L
 
Q
K
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
V
T
 
Q
P
 
P
A
 
N
I
 
I
L
 
V
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
I
R
 
P
F
 
F
V
 
T
A
 
M
E
|
E
Q
x
A
D
|
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
C
S
 
C
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
P
D
 
Q
S
 
A
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
S
S
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
G
T
 
V
R
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
G
 
E
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
G
 
G
Q
 
C
E
 
E
A
 
I
E
 
-
R
 
R
V
 
L
Y
 
G
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
S
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
C
 
C
A
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
K
 
E
A
 
T
Q
 
P
R
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
M
G
 
P
Y
 
A
R
 
Q
D
 
N
L
 
Q
D
 
R
H
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
C
R
 
A
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
A
D
 
D
T
 
P
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
F
V
 
I
M
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
Y
 
T
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
Y
 
Q
I
 
I
N
 
L
D
 
N
R
 
E
N
 
E
S
 
S
M
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Q
M
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
E
E
 
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
T
M
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
A
I
 
I
G
 
S
T
 
K
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
T
 
R
G
 
G
S
 
A
P
 
K
E
 
V
I
 
E
Q
 
E
G
 
D
P
 
R
A
 
I
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
R
R
 
K
K
 
Y
F
 
F
G
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
L
H
 
L
T
 
T
A
 
P
S
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
M
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
V
H
 
N
F
 
F
A
 
A
N
 
C
F
 
L
T
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
H
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
K
E
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
S
P
 
-
F
 
I
F
 
F
P
 
G
G
 
E
R
 
R
V
 
V
A
 
V
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
L
 
V
L
 
L
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
D
P
 
A
N
 
G
E
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
S
L
 
L
R
 
R
F
 
F
M
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
T
 
T
P
 
L
R
 
K
N
 
K
D
 
Q
D
x
R
Y
 
S
G
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
E
W
 
W
H
 
A
V
 
V
S
 
E
L
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
D
 
H
D
 
Q
E
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
L
Y
 
Y
E
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
L
N
 
V
A
 
A
R
 
R

6jqnA Structure of paaz, a bifunctional enzyme in complex with NADP+ and ocoa (see paper)
52% identity, 100% coverage: 4:674/674 of query aligns to 1:673/678 of 6jqnA

query
sites
6jqnA
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
S
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
T
W
 
W
V
 
Q
A
 
S
P
 
G
G
 
R
E
 
G
G
 
R
A
 
S
R
|
R
T
 
L
I
 
I
A
 
H
S
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
A
F
 
L
A
 
W
S
 
E
A
 
V
G
 
T
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
L
 
R
D
 
Q
Y
 
F
A
 
A
R
 
I
N
 
E
T
 
K
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
M
T
 
T
F
 
F
H
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
H
L
 
L
S
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
K
Q
 
E
A
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Q
 
R
K
 
A
D
 
D
H
 
S
L
 
W
I
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
M
 
L
F
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
K
 
L
G
 
G
R
 
S
R
 
R
E
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
V
 
L
Y
 
W
L
 
P
D
 
E
G
 
D
D
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
G
F
 
F
L
 
A
G
 
A
Q
 
R
H
 
H
I
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
S
L
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
I
|
I
N
|
N
A
|
A
F
|
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
V
 
C
W
 
W
G
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
W
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
|
A
T
|
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
Q
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
A
A
 
M
V
 
V
R
 
K
I
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
L
L
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
C
 
S
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
A
N
 
A
T
|
T
A
 
G
L
 
Q
K
 
M
L
|
L
R
 
R
Q
 
V
T
 
Q
P
 
P
A
 
N
I
 
I
L
 
V
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
I
R
 
P
F
 
F
V
 
T
A
 
M
E
|
E
Q
x
A
D
|
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
C
S
 
C
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
P
D
 
Q
S
 
A
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
S
S
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
G
T
 
V
R
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
G
 
E
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
G
 
G
Q
 
C
E
 
E
A
 
I
E
 
-
R
 
R
V
 
L
Y
 
G
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
S
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
C
 
C
A
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
K
 
E
A
 
T
Q
 
P
R
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
M
G
 
P
Y
 
A
R
 
Q
D
 
N
L
 
Q
D
 
R
H
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
C
R
 
A
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
A
D
 
D
T
 
P
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
F
V
 
I
M
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
Y
 
T
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
Y
 
Q
I
 
I
N
 
L
D
 
N
R
 
E
N
 
E
S
 
S
M
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Q
M
 
L
V
 
V
H
|
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
E
E
 
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
T
M
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
A
I
 
I
G
 
S
T
 
K
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
T
 
R
G
 
G
S
 
A
P
 
K
E
 
V
I
 
E
Q
 
E
G
 
D
P
 
R
A
 
I
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
R
R
 
K
K
 
Y
F
 
F
G
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
L
H
 
L
T
 
T
A
 
P
S
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
M
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
V
H
 
N
F
 
F
A
 
A
N
 
C
F
 
L
T
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
H
F
|
F
Y
 
Y
A
 
A
H
|
H
M
 
M
D
 
D
E
 
K
E
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
S
P
 
-
F
 
I
F
|
F
P
 
G
G
 
E
R
 
R
V
 
V
A
 
V
H
 
H
G
|
G
Y
 
Y
L
 
F
L
 
V
L
 
L
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
V
|
V
E
 
D
P
 
A
N
 
G
E
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
|
A
N
|
N
T
x
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
S
L
 
L
R
 
R
F
|
F
M
x
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
T
 
T
P
 
L
R
 
K
N
 
K
D
 
Q
D
 
R
Y
 
S
G
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
E
W
 
W
H
 
A
V
 
V
S
 
E
L
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
D
 
H
D
 
Q
E
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
L
Y
 
Y
E
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
L
N
 
V
A
 
A
R
 
R

6jqmA Structure of paaz with NADPH (see paper)
52% identity, 100% coverage: 4:674/674 of query aligns to 1:673/678 of 6jqmA

query
sites
6jqmA
H
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
S
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
A
 
S
G
 
G
T
 
T
W
 
W
V
 
Q
A
 
S
P
 
G
G
 
R
E
 
G
G
 
R
A
 
S
R
|
R
T
 
L
I
 
I
A
 
H
S
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
A
F
 
L
A
 
W
S
 
E
A
 
V
G
 
T
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
M
Q
 
A
A
 
A
M
 
A
L
 
R
D
 
Q
Y
 
F
A
 
A
R
 
I
N
 
E
T
 
K
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
M
T
 
T
F
 
F
H
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
H
L
 
L
S
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
K
Q
 
E
A
 
R
L
 
F
Y
 
Y
D
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Q
 
R
K
 
A
D
 
D
H
 
S
L
 
W
I
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
M
 
L
F
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
K
 
L
G
 
G
R
 
S
R
 
R
E
 
E
M
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
V
 
L
Y
 
W
L
 
P
D
 
E
G
 
D
D
 
E
I
 
L
E
 
I
Q
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
E
G
 
G
T
 
G
F
 
F
L
 
A
G
 
A
Q
 
R
H
 
H
I
 
L
C
 
L
T
 
T
P
 
S
L
 
K
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
I
|
I
N
|
N
A
|
A
F
|
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
V
 
C
W
 
W
G
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
W
L
 
L
A
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
|
A
T
|
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
Q
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
A
A
 
M
V
 
V
R
 
K
I
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
L
L
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
L
 
L
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
H
L
 
L
S
 
D
C
 
S
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
A
N
 
A
T
|
T
A
 
G
L
 
Q
K
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
V
T
 
Q
P
 
P
A
 
N
I
 
I
L
 
V
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
I
R
 
P
F
 
F
V
 
T
A
 
M
E
|
E
Q
x
A
D
|
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
C
S
 
C
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
R
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
T
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
P
D
 
Q
S
 
A
Q
 
L
V
 
V
D
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
S
S
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
V
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
T
 
G
T
 
V
R
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
A
G
 
E
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
G
 
G
Q
 
C
E
 
E
A
 
I
E
 
-
R
 
R
V
 
L
Y
 
G
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
D
 
D
A
 
L
F
 
-
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
S
E
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
C
 
C
A
 
P
D
 
Q
P
 
P
D
 
D
K
 
E
A
 
T
Q
 
P
R
 
A
V
 
V
H
 
H
D
 
A
T
 
T
E
|
E
A
 
A
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
M
G
 
P
Y
 
A
R
 
Q
D
 
N
L
 
Q
D
 
R
H
 
H
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
C
R
 
A
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
H
 
A
D
 
D
T
 
P
E
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
V
 
F
V
 
I
M
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
Y
 
T
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
Y
 
Q
I
 
I
N
 
L
D
 
N
R
 
E
N
 
E
S
 
S
M
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
H
 
Q
M
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
E
E
 
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
P
 
P
R
 
T
M
 
M
L
 
L
S
 
A
S
 
A
I
 
I
G
 
S
T
 
K
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
T
 
R
G
 
G
S
 
A
P
 
K
E
 
V
I
 
E
Q
 
E
G
 
D
P
 
R
A
 
I
H
 
H
P
 
P
F
 
F
T
 
R
R
 
K
K
 
Y
F
 
F
G
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
L
H
 
L
T
 
T
A
 
P
S
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
M
T
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
V
H
 
N
F
 
F
A
 
A
N
 
C
F
 
L
T
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
H
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
K
E
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
N
 
S
P
 
-
F
 
I
F
 
F
P
 
G
G
 
E
R
 
R
V
 
V
A
 
V
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
L
 
V
L
 
L
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
V
E
 
D
P
 
A
N
 
G
E
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
S
L
 
L
R
 
R
F
 
F
M
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
T
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
T
 
T
P
 
L
R
 
K
N
 
K
D
 
Q
D
 
R
Y
 
S
G
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
V
V
 
V
R
 
E
W
 
W
H
 
A
V
 
V
S
 
E
L
 
V
T
 
F
N
 
N
Q
 
Q
D
 
H
D
 
Q
E
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
L
Y
 
Y
E
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
T
M
 
L
N
 
V
A
 
A
R
 
R

2y53A Crystal structure of e257q mutant of the box pathway encoded aldh from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
43% identity, 70% coverage: 6:477/674 of query aligns to 6:483/529 of 2y53A

query
sites
2y53A
I
 
L
S
 
K
S
 
N
F
 
H
A
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
W
 
W
V
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
T
E
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
T
S
 
D
A
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
V
P
 
A
F
 
L
A
 
V
S
 
R
A
 
V
G
 
S
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
L
Q
 
A
A
 
R
M
 
A
L
 
F
D
 
S
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
A
D
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
D
L
 
I
A
 
V
Q
 
K
E
 
L
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
H
 
K
K
 
R
Q
 
G
A
 
D
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
A
L
 
I
-
 
A
S
 
T
F
 
A
E
 
N
T
 
S
G
 
G
A
 
T
T
 
T
Q
 
R
K
 
N
D
 
D
H
 
S
L
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
F
T
 
T
M
 
L
F
 
S
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
K
K
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
-
E
 
S
M
 
L
P
 
G
D
 
E
A
 
V
Q
 
H
V
 
A
Y
 
L
L
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
S
I
 
A
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
D
G
 
R
T
 
S
F
 
F
L
 
S
G
 
A
Q
 
Q
H
 
H
I
 
V
C
 
L
T
 
S
P
 
P
L
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
L
H
 
F
I
|
I
N
|
N
A
 
A
F
|
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
V
 
S
W
 
W
G
 
G
M
 
L
L
 
W
E
 
E
K
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
|
A
T
|
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
R
A
 
M
V
 
V
R
 
A
I
 
D
I
 
V
L
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
x
S
G
 
A
D
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
Q
L
 
I
S
 
R
C
 
S
Q
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
|
A
N
 
D
T
|
T
A
 
A
L
 
A
K
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
T
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
F
L
 
V
Q
 
Q
N
 
R
S
 
G
V
 
A
R
 
R
F
 
L
V
 
N
A
 
V
E
x
Q
Q
x
A
D
|
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
S
S
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
C
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
D
 
E
S
 
A
Q
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
V
I
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
A
 
N
E
 
D
T
 
A
T
 
V
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
R
G
 
E
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
A
K
 
G
A
 
I
N
 
A
L
 
A
I
 
L
G
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
V
R
 
L
V
 
A
Y
 
Y
G
 
-
N
 
D
P
 
S
D
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
P
L
 
L
H
 
I
G
 
D
P
 
A
E
 
D
T
 
A
-
 
N
-
 
I
G
 
A
A
 
A
F
 
C
V
 
V
P
 
A
P
 
P
M
 
H
L
 
L
F
 
F
H
 
V
C
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
N
A
 
A
Q
 
T
R
 
L
V
 
L
H
 
H
D
 
D
T
 
V
E
|
E
A
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
S
L
 
V
M
 
A
G
 
P
Y
 
Y
R
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
T
D
 
D
L
 
L
D
 
P
-
 
E
-
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
R
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
I
I
 
Y
T
 
S
H
 
N
D
 
D
T
 
D
E
 
A
V
 
H
A
 
L
R
 
G
D
 
R
V
 
L
V
 
A
M
 
L
G
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
D
Y
 
S
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Y
 
H
I
 
A
N
 
I
D
 
S
R
 
P
N
 
S
S
 
V
M
 
Q
A
 
H
E
 
S
S
 
Q
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
N
P
 
V
L
 
M
P
 
P
H
 
M
M
 
S
V
 
L
H
 
H

Sites not aligning to the query:

2vroA Crystal structure of aldehyde dehydrogenase from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
42% identity, 70% coverage: 6:477/674 of query aligns to 6:484/521 of 2vroA

query
sites
2vroA
I
 
L
S
 
K
S
 
N
F
 
H
A
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
Q
W
 
W
V
 
I
A
 
A
P
 
G
G
 
T
E
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
T
S
 
D
A
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
V
P
 
A
F
 
L
A
 
V
S
 
R
A
 
V
G
 
S
N
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
L
Q
 
A
A
 
R
M
 
A
L
 
F
D
 
S
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
A
D
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
D
L
 
I
A
 
V
Q
 
K
E
 
L
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
H
 
K
K
 
R
Q
 
G
A
 
D
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
A
L
 
I
-
 
A
S
 
T
F
 
A
E
 
N
T
 
S
G
 
G
A
 
T
T
 
T
Q
 
R
K
 
N
D
 
D
H
 
S
L
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
F
T
 
T
M
 
L
F
 
S
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
K
K
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
-
E
 
S
M
 
L
P
 
G
D
 
E
A
 
V
Q
 
H
V
 
A
Y
 
L
L
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
S
I
 
A
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
D
G
 
R
T
 
S
F
 
F
L
 
S
G
 
A
Q
 
Q
H
 
H
I
 
V
C
 
L
T
 
S
P
 
P
L
 
T
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
L
H
 
F
I
|
I
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
V
 
S
W
 
W
G
 
G
M
 
L
L
 
W
E
 
E
K
 
K
L
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
V
I
 
I
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
 
T
N
 
A
S
 
T
C
 
A
Y
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
Q
L
 
R
A
 
M
V
 
V
R
 
A
I
 
D
I
 
V
L
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
C
G
 
G
G
 
S
L
x
S
G
 
A
D
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
Q
L
 
I
S
 
R
C
 
S
Q
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
A
 
A
N
 
D
T
|
T
A
 
A
L
 
A
K
 
T
L
|
L
R
 
R
Q
 
A
T
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
F
L
 
V
Q
 
Q
N
 
R
S
 
G
V
 
A
R
 
R
F
 
L
V
 
N
A
 
V
E
|
E
Q
 
A
D
 
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
S
S
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
C
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
T
P
 
P
G
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
V
S
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
V
K
 
K
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
D
 
E
S
 
A
Q
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
P
V
 
V
I
 
L
S
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
A
 
N
E
 
D
T
 
A
T
 
V
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
R
G
 
E
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
E
D
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
A
K
 
G
A
 
I
N
 
A
L
 
A
I
 
L
G
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
V
R
 
L
V
 
A
Y
 
Y
G
 
-
N
 
D
P
 
S
D
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
P
L
 
L
H
 
I
G
 
D
P
 
A
E
 
D
T
 
A
-
 
N
-
 
I
G
 
A
A
 
A
F
 
C
V
 
V
P
 
A
P
 
P
M
 
H
L
 
L
F
 
F
H
 
V
C
 
V
A
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
N
A
 
A
Q
 
T
R
 
L
V
 
L
H
 
H
D
 
D
T
 
V
E
|
E
A
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
S
L
 
V
M
 
A
G
 
P
Y
 
Y
R
 
R
D
 
V
L
 
T
D
 
T
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
R
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
S
L
 
I
I
 
Y
T
 
S
H
 
N
D
 
D
T
 
D
E
 
A
V
 
H
A
 
L
R
 
G
D
 
R
V
 
L
V
 
A
M
 
L
G
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
D
Y
 
S
N
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Y
 
H
I
 
A
N
 
I
D
 
S
R
 
P
N
 
S
S
 
V
M
 
Q
A
 
H
E
 
S
S
 
Q
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
 
G
S
 
N
P
 
V
L
 
M
P
 
P
H
 
M
M
 
S
V
 
L
H
 
H

Sites not aligning to the query:

3ty7B Crystal structure of aldehyde dehydrogenase family protein from staphylococcus aureus
30% identity, 45% coverage: 151:451/674 of query aligns to 139:435/454 of 3ty7B

query
sites
3ty7B
G
 
G
V
 
V
A
 
S
V
 
G
H
 
L
I
 
I
N
 
T
A
 
P
F
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
V
 
T
W
 
N
G
 
Q
M
 
T
L
 
S
E
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
A
T
 
A
L
 
F
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
S
P
 
P
A
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
T
 
E
N
x
E
S
 
T
C
 
P
Y
 
F
V
 
A
T
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
L
V
 
A
R
 
E
I
 
I
I
 
F
L
 
D
D
 
K
S
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
-
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
N
L
 
L
V
 
V
S
 
N
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
G
D
 
N
M
 
P
L
 
L
D
 
S
H
 
E
L
 
H
S
 
P
C
 
K
Q
 
V
D
 
R
V
 
M
V
 
M
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
G
N
 
P
T
 
T
A
 
G
L
 
S
K
 
K
L
 
I
R
 
M
Q
 
E
T
 
K
P
 
A
A
 
A
I
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
K
D
 
D
S
 
F
L
 
K
N
 
K
A
 
V
S
 
S
I
 
L
L
x
E
G
 
L
R
 
G
D
 
G
A
 
K
E
 
S
P
 
P
G
 
Y
T
 
I
P
 
V
E
 
L
F
 
D
D
 
D
L
 
V
F
 
D
V
 
I
K
 
K
E
 
E
V
 
A
S
 
A
R
 
K
E
 
A
M
 
T
T
 
T
T
 
G
K
 
K
A
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
T
G
 
G
Q
 
Q
K
 
V
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
N
S
 
K
Q
 
I
V
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
F
A
 
S
K
 
Q
I
 
V
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
N
P
 
P
R
 
R
A
 
E
E
 
D
T
 
G
T
 
T
R
 
Q
M
 
V
G
 
G
A
 
P
L
 
I
V
 
I
S
 
S
N
 
K
G
 
K
Q
 
Q
K
 
F
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
L
 
Q
E
 
N
K
 
Y
A
 
I
N
 
N
L
 
K
-
 
G
I
 
I
G
 
E
Q
 
E
E
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
L
V
 
F
Y
 
Y
G
 
G
N
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
K
F
 
-
D
 
-
L
 
P
H
 
E
G
 
G
P
 
L
E
 
E
T
 
K
G
 
G
A
 
Y
F
 
F
V
 
A
P
 
R
P
 
P
M
 
T
L
 
I
F
 
F
H
 
-
C
 
-
A
 
I
D
 
N
P
 
V
D
 
D
K
 
N
A
 
Q
Q
 
M
R
 
T
V
 
I
H
 
A
D
 
Q
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
M
T
 
S
L
 
V
M
 
I
G
 
T
Y
 
Y
R
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
D
G
 
T
Q
 
K
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
Y
L
 
V
I
 
I
T
 
G
H
 
K
D
 
D
T
 
K
E
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
S
V
 
I
V
 
E
M
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
V
A
 
E
Y
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
26% identity, 65% coverage: 62:499/674 of query aligns to 77:486/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
T
 
T
F
 
A
H
 
E
D
 
T
R
 
R
A
 
G
R
 
K
M
 
K
L
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
E
 
K
L
 
I
S
 
K
A
 
E
H
 
H
K
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
D
 
R
L
 
L
-
 
E
S
 
T
F
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
K
T
 
T
Q
 
L
K
 
E
D
 
E
H
 
S
L
 
Y
I
 
A
D
 
D
I
 
M
D
 
D
G
 
D
G
 
-
I
 
I
G
 
H
T
 
N
M
 
V
F
 
F
V
 
M
F
 
Y
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
L
A
 
A
S
 
D
K
 
K
G
 
D
R
 
G
R
 
G
E
 
E
M
 
M
P
 
I
D
 
D
A
 
S
Q
 
P
V
 
I
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
P
D
 
D
I
 
T
E
 
E
Q
 
S
L
 
-
S
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
K
I
 
I
C
 
V
T
 
K
P
 
E
L
 
P
Q
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
T
H
 
Q
I
 
I
N
 
T
A
x
P
F
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
W
 
L
G
 
Q
M
 
A
L
 
S
E
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
C
P
 
S
A
 
L
I
 
V
V
 
M
K
|
K
P
 
P
A
 
S
T
x
E
N
 
I
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
T
T
 
T
E
 
I
L
 
R
A
 
V
V
 
F
R
 
E
I
 
L
I
 
M
L
 
E
D
 
E
S
 
V
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
T
L
 
I
Q
 
N
L
 
L
V
 
I
S
 
L
G
 
G
G
 
A
-
x
G
-
 
S
-
 
E
L
 
V
G
|
G
D
 
D
M
 
V
L
 
M
D
 
S
H
 
G
L
 
H
S
 
K
C
 
E
Q
 
V
D
 
D
V
 
L
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
A
 
I
N
 
E
T
|
T
A
 
G
L
 
K
K
x
H
L
x
I
R
 
M
Q
 
K
T
 
N
P
 
A
A
 
A
I
 
-
L
 
-
Q
 
N
N
 
N
S
 
V
V
 
T
R
 
N
F
 
I
V
 
A
A
 
L
E
|
E
Q
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
N
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
F
D
 
E
L
 
L
F
 
A
V
 
V
K
 
D
E
 
Q
V
 
A
S
 
L
R
 
N
E
 
G
M
 
G
T
 
Y
T
 
F
K
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
V
C
|
C
T
 
S
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
V
P
 
Q
D
 
N
S
 
S
Q
 
I
V
 
K
D
 
D
A
 
K
V
 
F
I
 
E
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
I
E
 
D
R
 
R
L
 
V
A
 
K
K
 
K
I
 
I
T
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
G
R
 
F
A
 
D
E
 
A
T
 
D
T
 
T
R
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
P
L
 
V
V
 
I
S
 
S
N
 
T
G
 
E
Q
 
H
K
 
R
A
 
N
D
 
K
V
 
I
L
 
E
E
 
S
K
 
Y
A
 
M
N
 
D
L
 
V
I
 
A
G
 
K
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
T
V
 
I
Y
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
G
G
 
K
N
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
R
F
 
D
D
 
D
L
 
L
H
 
K
G
 
-
P
 
-
E
 
D
T
 
G
G
 
L
A
 
F
F
 
F
V
 
E
P
 
P
P
 
T
M
 
V
L
 
I
F
 
T
H
 
N
C
 
C
A
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
D
K
 
T
A
 
S
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
V
D
 
Q
T
 
E
E
|
E
A
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
V
T
 
T
L
 
V
M
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
E
D
 
T
L
 
E
D
 
Q
H
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
D
G
 
S
Q
 
I
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
S
H
 
K
D
 
D
T
 
I
E
 
G
V
 
K
A
 
A
R
 
Q
D
 
R
V
 
V
V
 
A
M
 
N
G
 
K
A
 
L
A
 
K
A
 
L
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
F
N
 
H
S
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
P
H
 
Y
M
 
F
V
 
A
H
 
Q
-
 
A
-
 
P
-
 
W
G
 
G
G
 
G
P
 
Y
G
 
K
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
G
 
I
G
 
G
E
 
R
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
K
V
 
-
R
 
E
G
 
G
V
 
L
K
 
E
H
 
E
Y
 
Y
M
 
L

8hapB Crystal structure of thermostable acetaldehyde dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon sulfolobus tokodaii (see paper)
26% identity, 65% coverage: 54:493/674 of query aligns to 35:449/466 of 8hapB

query
sites
8hapB
G
 
G
G
 
F
P
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
S
K
 
R
L
 
M
T
 
P
F
 
L
H
 
Y
D
 
K
R
 
R
A
 
T
R
 
A
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
E
E
 
I
L
 
L
S
 
E
A
 
R
H
 
E
K
 
Q
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
A
D
 
R
L
 
L
-
 
L
S
 
A
F
 
M
E
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
K
T
 
P
Q
 
I
K
 
K
D
 
D
H
 
S
L
 
R
I
 
V
D
 
E
I
 
V
D
 
M
G
 
R
G
 
A
I
 
-
G
 
S
T
 
R
M
 
L
F
 
F
V
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
Q
E
 
A
M
 
A
P
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
Y
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
A
I
 
Y
E
 
E
Q
 
Y
L
 
P
S
 
P
R
 
G
N
 
N
G
 
E
T
 
N
F
 
R
L
 
I
G
 
V
Q
 
I
H
 
S
I
 
T
C
 
R
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
T
H
 
A
I
|
I
N
x
L
A
 
P
F
|
F
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
I
W
 
N
G
 
S
M
 
F
L
 
A
E
 
H
K
 
K
L
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
S
A
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
x
S
T
x
I
N
 
S
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
I
L
 
E
A
 
M
V
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
L
L
 
V
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
L
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
Y
L
x
S
G
 
N
D
 
E
M
 
I
L
x
G
D
 
D
H
 
E
L
 
L
S
 
I
C
 
T
Q
 
H
D
 
P
V
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
I
S
 
T
F
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
Q
T
|
T
A
 
G
L
 
L
K
 
A
L
x
I
R
 
A
Q
 
S
T
 
K
P
 
A
A
 
V
I
 
S
L
 
L
Q
 
G
N
 
K
S
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
I
V
 
I
A
 
M
E
 
E
Q
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
S
N
 
D
A
 
P
S
 
I
I
 
I
L
 
V
G
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
I
D
 
D
L
 
R
F
 
A
V
 
S
K
 
S
E
 
I
V
 
A
S
 
V
R
 
R
E
 
A
M
 
R
T
 
Y
T
 
E
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
N
C
 
C
T
 
N
A
 
A
I
 
G
R
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
R
D
 
E
S
 
E
Q
 
I
V
 
Y
D
 
D
A
 
K
V
 
F
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
K
E
 
E
R
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
A
I
 
L
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
L
A
 
D
E
 
E
T
 
S
T
 
T
R
 
D
M
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
V
V
 
I
S
 
N
N
 
Q
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
E
V
 
S
L
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
L
N
 
N
L
 
K
I
 
A
G
 
L
Q
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
S
V
 
K
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
V
D
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
N
L
 
-
H
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
Y
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
-
M
 
-
L
 
L
F
 
S
H
 
L
C
 
V
A
 
T
D
 
N
P
 
P
D
 
S
K
 
L
A
 
D
Q
 
M
R
 
L
V
 
V
H
 
L
D
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
S
 
A
T
 
P
L
 
I
M
 
V
G
 
S
Y
 
V
R
 
K
D
 
S
L
 
D
D
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
S
G
 
T
Q
 
E
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
Q
T
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
F
T
 
S
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
V
A
 
N
R
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
K
M
 
I
G
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
L
Y
 
K
N
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
S
N
 
T
S
 
R
M
 
L
A
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
R
G
 
W
S
 
D
P
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
K
A
 
T
G
 
G
G
 
I
G
 
G
E
 
R
E
 
E
M
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
R

8hapA Crystal structure of thermostable acetaldehyde dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon sulfolobus tokodaii (see paper)
26% identity, 65% coverage: 54:493/674 of query aligns to 35:449/466 of 8hapA

query
sites
8hapA
G
 
G
G
 
F
P
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
S
K
 
R
L
 
M
T
 
P
F
 
L
H
 
Y
D
 
K
R
 
R
A
 
T
R
 
A
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
E
E
 
I
L
 
L
S
 
E
A
 
R
H
 
E
K
 
Q
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
A
D
 
R
L
 
L
-
 
L
S
 
A
F
 
M
E
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
K
T
 
P
Q
 
I
K
 
K
D
 
D
H
 
S
L
 
R
I
 
V
D
 
E
I
 
V
D
 
M
G
 
R
G
 
A
I
 
-
G
 
S
T
 
R
M
 
L
F
 
F
V
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
Q
E
 
A
M
 
A
P
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
Y
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
A
I
 
Y
E
 
E
Q
 
Y
L
 
P
S
 
P
R
 
G
N
 
N
G
 
E
T
 
N
F
 
R
L
 
I
G
 
V
Q
 
I
H
 
S
I
 
T
C
 
R
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
T
H
 
A
I
|
I
N
x
L
A
 
P
F
|
F
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
I
W
 
N
G
 
S
M
 
F
L
 
A
E
 
H
K
 
K
L
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
S
A
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
x
S
T
x
I
N
 
S
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
I
L
 
E
A
 
M
V
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
L
L
 
V
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
S
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
L
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
Y
L
x
S
G
 
N
D
 
E
M
 
I
L
x
G
D
 
D
H
 
E
L
 
L
S
 
I
C
 
T
Q
 
H
D
 
P
V
 
L
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
I
S
 
T
F
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
Q
T
|
T
A
 
G
L
 
L
K
 
A
L
x
I
R
 
A
Q
 
S
T
 
K
P
 
A
A
 
V
I
 
S
L
 
L
Q
 
G
N
 
K
S
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
I
V
 
I
A
 
M
E
 
E
Q
x
L
D
 
G
S
 
G
L
 
S
N
 
D
A
 
P
S
 
I
I
 
I
L
 
V
G
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
I
D
 
D
L
 
R
F
 
A
V
 
S
K
 
S
E
 
I
V
 
A
S
 
V
R
 
R
E
 
A
M
 
R
T
 
Y
T
 
E
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
N
C
|
C
T
 
N
A
 
A
I
 
G
R
 
K
R
 
R
I
 
I
I
 
I
A
 
V
P
 
R
D
 
E
S
 
E
Q
 
I
V
 
Y
D
 
D
A
 
K
V
 
F
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
F
S
 
K
E
 
E
R
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
A
I
 
L
T
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
L
A
 
D
E
 
E
T
 
S
T
 
T
R
 
D
M
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
V
V
 
I
S
 
N
N
 
Q
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
E
V
 
S
L
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
L
N
 
N
L
 
K
I
 
A
G
 
L
Q
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
S
V
 
K
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
V
D
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
N
L
 
-
H
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
Y
F
 
F
V
 
F
P
 
P
P
 
-
M
 
-
L
 
L
F
 
S
H
 
L
C
 
V
A
 
T
D
 
N
P
 
P
D
 
S
K
 
L
A
 
D
Q
 
M
R
 
L
V
 
V
H
 
L
D
 
K
T
 
T
E
|
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
S
 
A
T
 
P
L
 
I
M
 
V
G
 
S
Y
 
V
R
 
K
D
 
S
L
 
D
D
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
S
G
 
T
Q
 
E
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
Q
T
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
F
T
 
S
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
V
A
 
N
R
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
K
M
 
I
G
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
L
Y
 
K
N
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
Y
 
I
I
 
I
N
 
N
D
 
D
R
 
S
N
 
T
S
 
R
M
 
L
A
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
R
G
 
W
S
 
D
P
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
K
A
 
T
G
 
G
G
 
I
G
 
G
E
 
R
E
 
E
M
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
R

3b4wA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis aldehyde dehydrogenase complexed with NAD+
27% identity, 65% coverage: 64:504/674 of query aligns to 67:475/483 of 3b4wA

query
sites
3b4wA
H
 
H
D
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
A
M
 
V
L
 
I
K
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
K
E
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
E
H
 
R
K
 
K
Q
 
D
A
 
L
L
 
F
Y
 
T
D
 
K
L
 
L
-
 
L
S
 
A
F
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
-
T
 
-
Q
 
Q
K
 
P
D
 
P
H
 
T
L
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
T
M
 
M
F
 
H
V
 
W
F
 
M
A
 
G
S
 
S
K
 
M
G
 
G
R
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
A
Q
 
M
V
 
N
Y
 
Y
L
 
F
D
 
A
G
 
G
D
 
A
I
 
A
E
 
D
Q
 
K
L
 
V
S
 
T
-
 
W
-
 
T
-
 
E
-
 
T
R
 
R
N
 
T
G
 
G
T
 
S
F
 
Y
L
 
-
G
 
G
Q
 
Q
H
 
S
I
 
I
C
 
V
T
 
S
-
 
R
-
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
G
H
 
A
I
|
I
N
x
V
A
 
A
F
x
W
N
|
N
F
 
V
P
 
P
V
 
L
W
 
F
G
 
L
M
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
C
P
 
T
A
 
I
I
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
 
A
N
 
E
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
T
T
 
A
E
 
N
L
 
A
A
 
L
V
 
A
R
 
E
I
 
V
I
 
F
L
 
A
D
 
E
S
 
V
G
 
G
I
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
E
G
 
G
A
 
V
L
 
L
Q
 
S
L
 
V
V
 
V
S
 
P
G
 
G
G
 
G
L
x
I
-
 
E
-
 
T
G
|
G
D
 
Q
M
 
A
L
 
L
D
 
T
H
 
S
L
 
N
S
 
P
C
 
D
Q
 
I
D
 
D
V
 
M
V
 
F
S
 
T
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
N
 
A
T
x
V
A
 
G
L
 
R
K
x
E
L
 
V
R
 
G
Q
 
R
T
 
R
P
 
A
A
 
A
I
 
E
L
 
M
Q
 
L
N
 
K
S
 
P
V
 
C
R
 
T
F
 
L
V
 
-
A
 
-
E
|
E
Q
x
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
A
S
 
A
I
 
I
L
 
I
G
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
A
L
 
A
F
 
A
V
 
I
K
 
P
E
 
M
V
 
M
S
 
V
R
 
F
E
 
S
M
 
G
T
 
V
T
 
M
K
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
G
C
|
C
T
 
V
A
 
N
I
 
Q
R
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
R
S
 
S
Q
 
R
V
 
Y
D
 
D
A
 
E
V
 
I
I
 
V
S
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
T
E
 
N
R
 
F
L
 
V
A
 
T
K
 
A
I
 
L
T
 
P
I
 
V
G
 
G
D
 
P
P
 
P
R
 
S
A
 
D
E
 
P
T
 
A
T
 
A
R
 
Q
M
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
S
N
 
E
G
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
T
D
 
R
V
 
V
L
 
E
E
 
G
K
 
Y
A
 
I
N
 
A
L
 
K
I
 
G
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
L
Y
 
V
-
 
C
-
 
G
-
 
G
G
 
G
N
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
G
F
 
L
D
 
D
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
N
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
N
A
 
K
Q
 
M
R
 
T
V
 
I
H
 
A
D
 
Q
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
L
T
 
A
L
 
I
M
 
I
G
 
P
Y
 
Y
R
 
D
D
 
T
L
 
E
D
 
E
H
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
D
G
 
S
Q
 
V
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
G
S
 
S
L
 
V
I
 
W
T
 
T
H
 
-
D
 
-
T
 
T
E
 
D
V
 
V
A
 
P
R
 
K
D
 
G
V
 
I
V
 
K
M
 
I
G
 
S
A
 
Q
A
 
Q
A
 
I
Y
 
R
N
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
Y
Y
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
-
R
 
-
N
 
-
S
 
-
M
 
-
A
 
W
E
 
Y
S
 
A
T
 
F
G
 
D
H
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
F
P
 
G
H
 
G
M
 
Y
V
 
K
H
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
I
G
 
G
R
 
R
A
x
E
G
 
N
G
 
G
G
 
P
E
 
E
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
V
K
 
E
H
 
H
Y
 
F
M
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
K
A
 
S
I
 
V

Q63639 Retinal dehydrogenase 2; RALDH 2; RalDH2; Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2; ALDH1A2; Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2; RALDH(II); EC 1.2.1.36 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
24% identity, 66% coverage: 55:500/674 of query aligns to 91:505/518 of Q63639

query
sites
Q63639
G
 
G
P
 
S
A
 
V
L
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
M
T
 
D
F
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
R
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
E
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
R
H
 
D
K
 
R
Q
 
A
A
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
T
L
 
M
S
 
E
F
 
S
E
 
L
T
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
Q
 
P
-
 
F
-
 
L
K
 
Q
D
 
A
H
 
F
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
I
 
L
D
 
Q
G
 
G
G
 
V
I
 
I
G
 
K
T
 
T
M
 
L
F
 
R
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
W
G
 
A
R
 
D
R
 
K
E
 
-
M
 
I
P
 
H
D
 
G
A
 
M
Q
 
T
V
 
I
Y
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
E
 
F
Q
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
C
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
G
H
 
Q
I
 
I
N
x
I
A
x
P
F
x
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
L
W
 
L
G
 
M
M
 
F
L
 
T
E
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
C
A
 
C
G
 
G
V
 
N
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
|
P
A
|
A
T
x
E
N
 
Q
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
M
V
 
G
R
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
V
Q
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
T
G
 
A
L
 
G
G
 
A
D
 
A
M
 
I
L
 
A
D
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
G
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
K
V
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
T
N
 
E
T
 
V
A
 
G
L
 
-
K
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
L
E
 
E
Q
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
Y
F
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
V
 
A
S
 
H
R
 
Q
E
 
G
M
 
V
T
 
F
T
 
F
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
C
C
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
V
P
 
E
D
 
E
S
 
S
Q
 
I
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
V
S
 
K
A
 
R
L
 
S
S
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
K
K
 
R
I
 
R
T
 
I
I
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
R
 
F
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
T
R
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
P
L
 
Q
V
 
I
S
 
D
N
 
K
G
 
K
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
N
D
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
I
N
 
Q
L
 
S
I
 
G
G
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
K
V
 
L
Y
 
E
G
 
C
N
 
G
P
 
G
D
 
K
A
 
G
F
 
L
D
 
G
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
R
T
 
K
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
S
C
 
N
A
 
V
D
 
T
P
 
D
D
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
K
T
 
E
E
 
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
T
 
E
L
 
I
M
 
L
G
 
R
Y
 
F
R
 
K
D
 
T
L
 
M
D
 
D
H
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
N
G
 
S
Q
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
T
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
I
A
 
N
R
 
K
D
 
A
V
 
L
V
 
M
M
 
V
G
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
M
Y
 
Q
N
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
C
R
 
Y
N
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
N
E
 
A
S
 
Q
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
F
P
 
-
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
-
G
 
G
V
 
L
K
 
R
H
 
E
Y
 
Y
M
 
S
Q
 
E

6x9lA Crystal structure of aldehyde dehydrogenasE C (aldc) mutant (c291a) from pseudomonas syringae in complexed with NAD+ and octanal (see paper)
29% identity, 53% coverage: 151:506/674 of query aligns to 145:479/485 of 6x9lA

query
sites
6x9lA
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
A
H
 
L
I
|
I
N
x
T
A
 
P
F
x
W
N
|
N
F
x
W
P
 
P
V
 
L
W
 
Y
G
x
Q
M
 
I
L
 
T
E
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
C
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
S
T
x
E
N
 
L
S
 
S
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
L
A
 
F
V
 
A
R
 
Q
I
 
L
I
 
V
L
 
H
D
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
N
L
 
L
V
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
S
L
x
G
-
x
P
-
 
E
-
 
V
-
x
G
G
 
G
D
 
A
M
 
M
L
 
A
D
 
A
H
 
H
L
 
P
S
 
D
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
M
V
 
I
S
 
S
F
 
I
T
|
T
G
|
G
S
|
S
-
 
N
-
 
R
A
 
A
N
 
G
T
 
A
A
 
L
L
 
V
K
 
A
L
 
Q
R
 
A
Q
 
A
T
 
A
P
 
P
A
 
T
I
 
V
L
 
K
Q
 
-
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
Q
E
|
E
Q
x
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
L
G
 
L
R
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
F
D
 
A
L
 
N
F
 
A
V
 
V
K
 
P
E
 
P
V
 
G
S
 
V
R
 
M
E
 
A
M
 
A
T
 
F
T
 
R
K
 
N
A
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
x
S
C
x
A
T
 
S
A
 
A
I
 
P
R
 
T
R
 
R
I
 
M
I
 
I
A
 
V
P
 
P
D
 
R
S
 
N
Q
 
R
V
 
L
D
 
A
A
 
E
V
 
V
I
 
E
S
 
A
A
 
L
L
 
A
S
 
A
E
 
Q
R
 
T
L
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
A
 
L
E
 
E
T
 
H
T
 
T
R
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
P
L
 
I
V
 
A
S
 
N
N
 
E
G
 
A
Q
 
Q
K
 
F
A
 
H
D
 
R
V
 
V
L
 
Q
E
 
A
K
 
M
A
 
I
N
 
N
L
 
A
-
 
G
I
 
I
G
 
C
Q
 
E
E
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
L
V
 
V
Y
 
C
G
 
G
N
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
-
F
 
-
D
 
R
L
 
V
H
 
Q
G
 
G
P
 
H
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
A
 
F
F
 
Y
V
 
T
P
 
R
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
-
C
 
-
A
 
S
D
 
E
P
 
V
D
 
D
K
 
S
A
 
S
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
R
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
L
T
 
C
L
 
L
M
 
I
G
 
A
Y
 
Y
R
 
D
D
 
T
L
 
I
D
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
D
G
 
T
Q
 
V
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
G
T
 
A
S
 
H
L
 
V
I
 
Q
T
 
G
H
 
Q
D
 
D
T
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
S
V
 
V
V
 
A
M
 
S
G
 
R
A
 
I
A
 
R
A
 
A
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
Y
 
H
I
 
L
N
 
N
D
 
-
R
 
-
N
 
-
S
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
Y
G
 
P
S
 
S
P
 
W
L
 
N
P
 
P
H
 
M
M
 
A
V
 
P
H
x
F
G
 
G
G
 
G
P
 
Y
G
 
K
R
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
|
E
M
 
Y
G
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
H
G
 
G
V
 
F
K
 
E
H
 
E
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
E
R
 
T
T
 
K
A
 
A
I
 
I
Q
 
V
G
 
G

O94788 Retinal dehydrogenase 2; RALDH 2; RalDH2; Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2; ALDH1A2; Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2; RALDH(II); EC 1.2.1.36 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
24% identity, 66% coverage: 55:500/674 of query aligns to 91:505/518 of O94788

query
sites
O94788
G
 
G
P
 
S
A
 
V
L
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
M
T
 
D
F
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
R
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
|
A
Q
 
D
E
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
R
H
 
D
K
 
R
Q
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
A
D
 
T
L
 
M
S
 
E
F
 
S
E
 
L
T
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
Q
 
P
-
 
F
-
 
L
K
 
Q
D
 
A
H
 
F
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
Q
G
 
G
G
 
V
I
 
I
G
 
K
T
 
T
M
 
F
F
 
R
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
W
G
 
A
R
 
D
R
 
K
E
 
-
M
 
I
P
 
H
D
 
G
A
 
M
Q
 
T
V
 
I
Y
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
E
 
F
Q
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
C
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
G
H
x
Q
I
 
I
N
x
I
A
x
P
F
x
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
L
W
 
L
G
 
M
M
 
F
L
 
A
E
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
C
A
 
C
G
 
G
V
 
N
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
|
P
A
|
A
T
x
E
N
 
Q
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
M
V
 
G
R
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
I
Q
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
T
G
 
A
L
 
G
G
 
A
D
 
A
M
 
I
L
 
A
D
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
G
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
K
V
 
I
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
A
x
T
N
x
E
T
 
V
A
 
G
L
 
-
K
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
L
E
 
E
Q
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
Y
F
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
V
 
A
S
 
H
R
 
Q
E
 
G
M
 
V
T
 
F
T
 
F
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
C
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
V
P
 
E
D
 
E
S
 
S
Q
 
I
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
V
S
 
R
A
 
R
L
 
S
S
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
K
K
 
R
I
x
R
T
x
V
I
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
R
 
F
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
T
R
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
P
L
 
Q
V
 
I
S
 
D
N
 
K
G
x
K
Q
|
Q
K
x
Y
A
x
N
D
x
K
V
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
I
N
 
Q
L
 
S
I
 
G
G
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
x
A
R
 
K
V
 
L
Y
 
E
G
 
C
N
 
G
P
 
G
D
 
K
A
 
G
F
 
L
D
 
G
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
R
T
 
K
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
S
C
 
N
A
 
V
D
 
T
P
 
D
D
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
K
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
T
 
E
L
 
I
M
 
L
G
 
R
Y
 
F
R
 
K
D
 
T
L
 
M
D
 
D
H
 
E
A
 
V
V
 
I
A
x
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
N
G
 
S
Q
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
T
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
I
A
 
N
R
 
K
D
 
A
V
 
L
V
 
T
M
 
V
G
x
S
A
 
S
A
 
A
A
 
M
Y
 
Q
N
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
C
R
 
Y
N
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
N
E
 
A
S
 
Q
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
F
P
 
-
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
-
G
 
G
V
 
L
K
 
R
H
 
E
Y
 
Y
M
 
S
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6b5hA Aldh1a2 liganded with NAD and 1-(4-cyanophenyl)-n-(3-fluorophenyl)-3- [4-(methylsulfonyl)phenyl]-1h-pyrazole-4-carboxamide (compound cm121) (see paper)
24% identity, 66% coverage: 55:500/674 of query aligns to 65:479/492 of 6b5hA

query
sites
6b5hA
G
 
G
P
 
S
A
 
V
L
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
M
T
 
D
F
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
R
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
E
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
R
H
 
D
K
 
R
Q
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
A
D
 
T
L
 
M
S
 
E
F
 
S
E
 
L
T
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
Q
 
P
-
 
F
-
 
L
K
 
Q
D
 
A
H
 
F
L
 
Y
I
x
V
D
 
D
I
 
L
D
 
Q
G
|
G
G
 
V
I
 
I
G
 
K
T
 
T
M
 
F
F
 
R
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
W
G
 
A
R
 
D
R
 
K
E
 
-
M
 
I
P
 
H
D
 
G
A
 
M
Q
 
T
V
 
I
Y
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
E
 
F
Q
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
C
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
G
H
 
Q
I
|
I
N
x
I
A
 
P
F
x
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
V
 
L
W
 
L
G
 
M
M
 
F
L
 
A
E
x
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
C
A
 
C
G
 
G
V
 
N
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
 
E
N
 
Q
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
M
V
 
G
R
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
I
Q
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
x
G
-
 
P
-
 
T
G
 
A
L
x
G
G
 
A
D
 
A
M
 
I
L
 
A
D
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
G
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
V
A
 
G
L
 
-
K
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
L
E
|
E
Q
x
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
Y
F
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
V
 
A
S
 
H
R
x
Q
E
 
G
M
 
V
T
 
F
T
x
F
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
C
C
|
C
T
|
T
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
V
P
 
E
D
 
E
S
 
S
Q
 
I
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
V
S
 
R
A
 
R
L
 
S
S
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
K
K
 
R
I
 
R
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
R
 
F
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
T
R
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
P
L
 
Q
V
 
I
S
 
D
N
 
K
G
 
K
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
N
D
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
I
N
 
Q
L
 
S
I
 
G
G
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
K
V
 
L
Y
 
E
G
 
C
N
 
G
P
 
G
D
 
K
A
 
G
F
 
L
D
 
G
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
R
T
 
K
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
S
C
 
N
A
 
V
D
 
T
P
 
D
D
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
K
T
 
E
E
 
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
T
 
E
L
 
I
M
 
L
G
 
R
Y
 
F
R
 
K
D
 
T
L
 
M
D
 
D
H
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
N
G
 
S
Q
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
T
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
I
A
 
N
R
 
K
D
 
A
V
 
L
V
 
T
M
 
V
G
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
M
Y
 
Q
N
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
C
R
 
Y
N
|
N
S
 
A
M
x
L
A
x
N
E
 
A
S
 
Q
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
S
P
 
P
L
x
F
P
 
-
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
|
E
M
 
M
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
-
G
 
G
V
 
L
K
 
R
H
 
E
Y
 
Y
M
 
S
Q
 
E

6b5gA Aldh1a2 liganded with NAD and (3-ethoxythiophen-2-yl){4-[4-nitro-3- (pyrrolidin-1-yl)phenyl]piperazin-1-yl}methanone (compound 6-118) (see paper)
24% identity, 66% coverage: 55:500/674 of query aligns to 65:479/492 of 6b5gA

query
sites
6b5gA
G
 
G
P
 
S
A
 
V
L
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
M
T
 
D
F
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
R
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
E
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
R
H
 
D
K
 
R
Q
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
A
D
 
T
L
 
M
S
 
E
F
 
S
E
 
L
T
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
Q
 
P
-
 
F
-
 
L
K
 
Q
D
 
A
H
 
F
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
Q
G
 
G
G
 
V
I
 
I
G
 
K
T
 
T
M
 
F
F
 
R
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
W
G
 
A
R
 
D
R
 
K
E
 
-
M
 
I
P
 
H
D
 
G
A
 
M
Q
 
T
V
 
I
Y
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
E
 
F
Q
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
C
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
G
H
 
Q
I
|
I
N
x
I
A
x
P
F
x
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
V
 
L
W
x
L
G
x
M
M
 
F
L
 
A
E
x
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
C
A
 
C
G
 
G
V
 
N
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
x
E
N
 
Q
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
M
V
 
G
R
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
I
Q
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
x
G
-
 
P
-
 
T
G
 
A
L
x
G
G
 
A
D
 
A
M
 
I
L
 
A
D
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
G
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
V
A
 
G
L
 
-
K
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
L
E
|
E
Q
x
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
Y
F
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
V
 
A
S
 
H
R
 
Q
E
 
G
M
 
V
T
 
F
T
x
F
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
x
C
C
|
C
T
|
T
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
V
P
 
E
D
 
E
S
 
S
Q
 
I
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
V
S
 
R
A
 
R
L
 
S
S
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
K
K
 
R
I
 
R
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
R
 
F
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
T
R
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
P
L
 
Q
V
 
I
S
 
D
N
 
K
G
 
K
Q
 
Q
K
 
Y
A
 
N
D
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
I
N
 
Q
L
 
S
I
 
G
G
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
K
V
 
L
Y
 
E
G
 
C
N
 
G
P
 
G
D
 
K
A
 
G
F
 
L
D
 
G
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
R
T
 
K
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
S
C
 
N
A
 
V
D
 
T
P
 
D
D
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
K
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
T
 
E
L
 
I
M
 
L
G
 
R
Y
 
F
R
 
K
D
 
T
L
 
M
D
 
D
H
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
N
G
 
S
Q
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
T
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
I
A
 
N
R
 
K
D
 
A
V
 
L
V
 
T
M
 
V
G
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
M
Y
 
Q
N
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
C
R
 
Y
N
|
N
S
 
A
M
x
L
A
 
N
E
 
A
S
 
Q
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
F
P
 
-
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
|
E
M
 
M
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
-
G
 
G
V
 
L
K
 
R
H
 
E
Y
 
Y
M
 
S
Q
 
E

6aljA Aldh1a2 liganded with NAD and compound win18,446 (see paper)
24% identity, 66% coverage: 55:500/674 of query aligns to 65:479/492 of 6aljA

query
sites
6aljA
G
 
G
P
 
S
A
 
V
L
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
M
T
 
D
F
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
R
A
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
E
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
R
H
 
D
K
 
R
Q
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
A
D
 
T
L
 
M
S
 
E
F
 
S
E
 
L
T
 
N
G
 
G
A
 
G
T
 
K
Q
 
P
-
 
F
-
 
L
K
 
Q
D
 
A
H
 
F
L
 
Y
I
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
Q
G
|
G
G
 
V
I
 
I
G
 
K
T
 
T
M
 
F
F
 
R
V
 
Y
F
 
Y
A
 
A
S
 
G
K
 
W
G
 
A
R
 
D
R
 
K
E
 
-
M
 
I
P
 
H
D
 
G
A
 
M
Q
 
T
V
 
I
Y
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
I
 
Y
E
 
F
Q
 
T
L
 
F
S
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
C
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
G
H
 
Q
I
|
I
N
x
I
A
x
P
F
x
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
V
 
L
W
x
L
G
x
M
M
 
F
L
 
A
E
x
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
C
A
 
C
G
 
G
V
 
N
P
 
T
A
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
x
E
N
 
Q
S
 
T
C
 
P
Y
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
M
V
 
G
R
 
A
I
 
L
I
 
I
L
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
I
Q
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
x
G
-
 
P
-
 
T
G
 
A
L
x
G
G
 
A
D
 
A
M
 
I
L
 
A
D
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
G
C
 
I
Q
 
-
D
 
D
V
 
K
V
 
I
S
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
V
A
 
G
L
 
-
K
 
K
L
 
L
R
 
I
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
R
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
T
A
 
L
E
|
E
Q
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
K
N
 
S
A
 
P
S
 
N
I
 
I
L
 
I
G
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
Y
F
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
V
 
A
S
 
H
R
 
Q
E
 
G
M
 
V
T
 
F
T
 
F
K
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
x
C
C
|
C
T
 
T
A
 
A
I
 
G
R
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
F
A
 
V
P
 
E
D
 
E
S
 
S
Q
 
I
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
V
S
 
R
A
 
R
L
 
S
S
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
A
A
 
K
K
 
R
I
 
R
T
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
S
P
 
P
R
 
F
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
T
R
 
E
M
 
Q
G
 
G
A
 
P
L
 
Q
V
 
I
S
 
D
N
 
K
G
 
K
Q
|
Q
K
 
Y
A
 
N
D
x
K
V
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
I
N
 
Q
L
 
S
I
 
G
G
 
V
Q
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
A
R
 
K
V
 
L
Y
 
E
G
 
C
N
 
G
P
 
G
D
 
K
A
 
G
F
 
L
D
 
G
L
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
R
T
 
K
G
 
G
A
 
F
F
 
F
V
 
I
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
F
H
 
S
C
 
N
A
 
V
D
 
T
P
 
D
D
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
M
R
 
R
V
 
I
H
 
A
D
 
K
T
 
E
E
|
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
T
 
E
L
 
I
M
 
L
G
 
R
Y
 
F
R
 
K
D
 
T
L
 
M
D
 
D
H
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
N
G
 
S
Q
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
V
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
T
H
 
N
D
 
D
T
 
-
E
 
-
V
 
I
A
 
N
R
 
K
D
 
A
V
 
L
V
 
T
M
 
V
G
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
M
Y
 
Q
N
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
W
I
 
I
N
 
N
D
 
C
R
 
Y
N
 
N
S
 
A
M
x
L
A
x
N
E
x
A
S
 
Q
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
S
P
 
P
L
 
F
P
 
-
H
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
F
G
 
K
R
 
M
A
 
S
G
 
G
G
 
N
G
 
G
E
 
R
E
|
E
M
 
M
G
 
G
G
 
E
V
 
F
R
 
-
G
 
G
V
 
L
K
 
R
H
 
E
Y
 
Y
M
 
S
Q
 
E

1ky8A Crystal structure of the non-phosphorylating glyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase (see paper)
27% identity, 46% coverage: 151:458/674 of query aligns to 157:449/499 of 1ky8A

query
sites
1ky8A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
A
H
 
A
I
|
I
N
x
T
A
 
P
F
|
F
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
W
 
F
G
 
D
M
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
K
L
 
I
A
 
T
P
 
Y
T
 
S
L
 
F
L
 
I
A
 
Y
G
 
G
V
 
N
P
 
A
A
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
x
S
T
x
I
N
 
S
S
 
D
C
 
P
Y
 
L
V
 
P
T
 
A
E
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
P
P
 
P
-
 
D
A
 
A
G
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
L
 
N
V
 
L
S
x
P
G
|
G
G
 
K
L
 
E
G
x
A
D
x
E
M
 
K
L
 
I
D
 
V
H
 
A
L
 
D
S
 
D
C
 
R
Q
 
V
D
 
A
V
 
A
V
 
V
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
V
A
 
G
L
 
E
K
 
R
L
 
V
R
 
V
Q
 
K
T
 
V
P
 
G
A
 
G
I
 
V
L
 
K
Q
 
Q
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
Y
V
 
V
A
 
M
E
|
E
Q
x
L
D
x
G
S
 
G
L
 
G
N
 
D
A
 
P
S
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
A
V
 
A
K
 
D
E
 
K
V
 
I
S
 
A
R
 
R
E
 
G
M
 
I
T
 
Y
T
 
S
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
C
|
C
T
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
K
R
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
A
P
 
E
D
 
R
S
 
P
Q
 
V
V
 
Y
D
 
G
A
 
K
V
 
L
I
 
V
S
 
E
A
 
E
L
 
V
S
 
A
E
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
S
I
 
L
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
V
R
 
D
M
 
V
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
S
N
 
P
G
 
S
Q
 
A
K
 
V
A
 
D
D
 
E
V
 
M
L
 
M
E
 
A
K
 
A
A
 
I
N
 
E
L
 
D
I
 
A
G
 
V
Q
 
E
E
 
K
A
 
G
E
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
G
 
A
N
 
G
P
 
G
D
 
R
A
 
R
F
 
L
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
T
F
 
Y
V
 
V
P
 
Q
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
V
H
 
E
C
 
A
-
 
P
A
 
A
D
 
D
P
 
R
D
 
V
K
 
K
A
 
D
Q
 
M
R
 
V
V
 
L
H
 
Y
D
 
K
T
 
R
E
|
E
A
 
V
F
|
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
S
L
 
A
M
 
V
G
 
E
Y
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
G
G
 
R
Q
 
P
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
D
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
G
H
 
R
D
 
D
T
 
V
E
 
V
V
 
K
A
 
I
R
 
R
D
 
R
V
 
A
V
 
V
M
 
R
G
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
V
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
R
 
A
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
D
 
D

Sites not aligning to the query:

O57693 NAD(P)-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; Glyceraldehyde phosphate dehydrogenase (NAD(P)); GAPN; EC 1.2.1.90 from Thermoproteus tenax (see 2 papers)
27% identity, 46% coverage: 151:458/674 of query aligns to 159:451/501 of O57693

query
sites
O57693
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
A
H
 
A
I
 
I
N
x
T
A
 
P
F
 
F
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
W
 
F
G
 
D
M
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
K
L
 
I
A
 
T
P
 
Y
T
 
S
L
 
F
L
 
I
A
x
Y
G
 
G
V
 
N
P
 
A
A
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
|
P
A
x
S
T
x
I
N
 
S
S
 
D
C
 
P
Y
 
L
V
 
P
T
 
A
E
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
R
 
K
I
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
A
G
 
G
I
 
F
L
 
P
P
 
P
-
 
D
A
 
A
G
 
I
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
L
 
N
V
 
L
S
 
P
G
|
G
G
 
K
L
 
E
G
 
A
D
x
E
M
 
K
L
 
I
D
 
V
H
 
A
L
 
D
S
 
D
C
 
R
Q
 
V
D
 
A
V
 
A
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
 
V
A
 
G
L
 
E
K
 
R
L
 
V
R
 
V
Q
 
K
T
 
V
P
 
G
A
 
G
I
 
V
L
 
K
Q
 
Q
N
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
Y
V
 
V
A
 
M
E
 
E
Q
 
L
D
x
G
S
 
G
L
 
G
N
 
D
A
 
P
S
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
A
V
 
A
K
 
D
E
 
K
V
 
I
S
 
A
R
 
R
E
 
G
M
 
I
T
 
Y
T
 
S
K
 
Y
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
K
x
R
C
|
C
T
x
D
A
 
A
I
 
I
R
 
K
R
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
A
P
 
E
D
 
R
S
 
P
Q
 
V
V
 
Y
D
 
G
A
 
K
V
 
L
I
 
V
S
 
E
A
 
E
L
 
V
S
 
A
E
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
S
I
 
L
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
R
A
 
D
E
 
P
T
 
T
T
 
V
R
 
D
M
 
V
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
I
S
 
S
N
 
P
G
 
S
Q
 
A
K
 
V
A
 
D
D
 
E
V
 
M
L
 
M
E
 
A
K
 
A
A
 
I
N
 
E
L
 
D
I
 
A
G
 
V
Q
 
E
E
 
K
A
 
G
E
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
G
 
A
N
 
G
P
 
G
D
 
R
A
 
R
F
 
L
D
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
P
E
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
T
F
 
Y
V
 
V
P
 
Q
P
 
P
M
 
T
L
 
L
F
 
V
H
 
E
C
 
A
-
 
P
A
 
A
D
 
D
P
 
R
D
 
V
K
 
K
A
 
D
Q
 
M
R
 
V
V
 
L
H
 
Y
D
 
K
T
 
R
E
|
E
A
 
V
F
 
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
A
T
 
S
L
 
A
M
 
V
G
 
E
Y
 
V
R
 
K
D
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
G
G
 
R
Q
 
P
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
D
T
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
T
 
G
H
 
R
D
 
D
T
 
V
E
 
V
V
 
K
A
 
I
R
 
R
D
 
R
V
 
A
V
 
V
M
 
R
G
 
L
A
 
L
A
 
E
A
 
V
Y
 
-
N
 
-
G
 
G
R
 
A
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7uyyA The crystal structure of the pseudomonas aeruginosa aldehyde dehydrogenase encoded by the pa4189 gene in complex with nadh (see paper)
30% identity, 45% coverage: 151:451/674 of query aligns to 160:453/496 of 7uyyA

query
sites
7uyyA
G
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
G
H
 
L
I
x
V
N
x
L
A
x
P
F
x
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
L
W
 
L
G
 
M
M
 
L
L
 
A
E
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
G
P
 
P
T
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
C
P
 
S
A
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
T
 
P
N
 
E
S
 
T
C
 
S
Y
 
-
V
 
L
T
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
R
V
 
V
R
 
A
I
 
E
I
 
L
L
 
A
D
 
S
S
 
Q
G
 
A
I
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
F
Q
 
N
L
 
V
V
 
V
S
 
P
G
 
G
G
 
G
-
x
G
-
 
R
-
 
E
L
 
A
G
|
G
D
 
E
M
 
P
L
 
L
D
 
G
H
 
R
L
 
H
S
 
P
C
 
D
Q
 
V
D
 
A
V
 
M
V
 
V
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
A
T
|
T
A
 
G
L
 
-
K
 
R
L
|
L
R
x
F
Q
 
L
T
 
K
P
x
Y
A
 
A
I
 
A
L
 
E
Q
 
S
N
 
N
S
 
L
V
 
K
R
 
R
F
 
V
V
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
x
C
D
x
G
S
 
G
L
 
K
N
 
N
A
 
P
S
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
M
R
 
N
D
 
D
A
 
V
E
 
E
P
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
D
F
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
V
V
 
A
K
 
Q
E
 
H
V
 
V
S
 
V
R
 
N
E
 
G
M
 
A
T
 
F
T
 
W
K
 
N
A
 
M
G
 
G
Q
 
E
K
 
N
C
|
C
T
 
S
A
 
A
I
 
S
R
 
S
R
 
R
I
 
L
I
 
I
A
 
V
P
 
H
D
 
A
S
 
E
Q
 
V
V
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
L
I
 
L
S
 
E
A
 
R
L
 
I
S
 
G
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
K
 
E
I
 
W
T
 
R
I
 
M
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
L
A
 
D
E
 
P
T
 
R
T
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
P
G
 
A
Q
x
H
K
 
F
A
 
E
D
x
K
V
 
V
L
 
-
E
 
-
K
 
R
A
 
A
N
 
Y
L
 
L
I
 
D
G
 
Q
Q
 
A
E
 
R
A
 
T
E
 
E
R
 
R
V
 
L
Y
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
A
F
 
V
D
 
R
L
 
F
H
 
G
G
 
G
P
 
A
-
 
T
E
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
I
F
 
F
V
 
V
P
 
E
P
 
P
M
 
T
L
 
V
F
 
V
H
 
D
C
 
G
A
 
V
D
 
S
P
 
P
D
 
H
K
 
-
A
 
-
Q
 
S
R
 
R
V
 
L
H
 
F
D
 
R
T
 
E
E
 
E
A
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
S
 
L
T
 
S
L
 
V
M
 
T
G
 
S
Y
 
F
R
 
D
D
 
D
L
 
I
D
 
D
H
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
D
G
 
T
Q
 
V
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
A
S
 
S
L
 
A
I
 
Y
T
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
R
H
 
H
D
 
A
T
 
L
E
 
R
V
 
L
A
 
S
R
 
R
D
 
E
V
 
I
V
 
R
M
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
V
A
 
T
Y
 
V
N
 
N

Query Sequence

>WP_010437890.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_010437890.1
MSLHQISSFAAGTWVAPGEGARTIASAITGAPFASAGNTALDVQAMLDYARNTGGPALRK
LTFHDRARMLKALAQELSAHKQALYDLSFETGATQKDHLIDIDGGIGTMFVFASKGRREM
PDAQVYLDGDIEQLSRNGTFLGQHICTPLQGVAVHINAFNFPVWGMLEKLAPTLLAGVPA
IVKPATNSCYVTELAVRIILDSGILPAGALQLVSGGLGDMLDHLSCQDVVSFTGSANTAL
KLRQTPAILQNSVRFVAEQDSLNASILGRDAEPGTPEFDLFVKEVSREMTTKAGQKCTAI
RRIIAPDSQVDAVISALSERLAKITIGDPRAETTRMGALVSNGQKADVLEKANLIGQEAE
RVYGNPDAFDLHGPETGAFVPPMLFHCADPDKAQRVHDTEAFGPVSTLMGYRDLDHAVAL
ANRGQGSLVTSLITHDTEVARDVVMGAAAYNGRIYINDRNSMAESTGHGSPLPHMVHGGP
GRAGGGEEMGGVRGVKHYMQRTAIQGSPRMLSSIGTKWVTGSPEIQGPAHPFTRKFGELQ
VGETLHTASRVITLEDIEHFANFTGDTFYAHMDEEAAARNPFFPGRVAHGYLLLSFAAGL
FVEPNEGPVLANTGLDGLRFMKPVVAGDSIKVRLTVKQKTPRNDDYGEVRWHVSLTNQDD
EPVAEYELLTMNAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory