SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010439643.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_010439643.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4uqvG Methanococcus jannaschii serine hydroxymethyl-transferase in complex with plp (see paper)
33% identity, 88% coverage: 50:433/435 of query aligns to 23:415/429 of 4uqvG

query
sites
4uqvG
E
 
E
C
 
S
F
 
I
N
 
K
L
 
L
N
 
I
P
 
A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
N
 
S
P
 
L
K
 
A
A
 
V
E
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
C
S
 
A
S
 
T
G
 
D
I
 
F
G
 
M
S
 
H
R
 
R
P
x
Y
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
L
E
 
Y
M
 
Q
G
 
G
M
 
C
E
 
K
A
 
Y
I
 
I
E
 
D
Q
 
E
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
C
A
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
L
F
 
F
D
 
K
A
 
A
R
 
E
F
 
H
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
T
S
 
S
G
|
G
A
x
V
I
 
V
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Y
 
A
G
 
V
F
 
F
M
 
F
A
 
A
T
 
E
C
 
T
K
 
K
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
L
I
 
M
A
 
A
P
 
L
P
 
S
G
 
V
S
 
P
I
 
D
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
I
T
 
S
H
 
H
H
 
W
A
 
K
A
 
V
G
 
S
C
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
F
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
H
P
 
P
V
 
F
N
 
D
A
 
P
D
 
E
G
 
E
Y
 
M
T
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
R
 
V
A
 
K
L
 
K
A
 
I
K
 
L
T
 
E
E
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
L
I
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
N
 
F
L
 
P
F
 
F
E
 
P
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
A
R
 
Y
A
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
Q
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
M
 
A
F
 
Y
D
|
D
A
 
G
A
|
A
H
|
H
Q
 
V
C
 
L
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
W
 
F
S
 
Q
N
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
E
F
 
Y
M
 
L
T
 
M
M
 
G
S
|
S
T
 
T
Y
x
H
K
|
K
S
 
T
L
 
F
G
 
F
G
 
G
P
 
P
A
x
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
T
D
 
K
E
 
E
E
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
D
A
 
K
L
 
I
D
 
D
A
 
S
I
 
H
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
F
 
H
D
 
H
A
 
L
A
 
H
K
 
H
T
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
T
 
A
M
 
L
L
 
A
D
 
E
W
 
M
K
 
L
A
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
K
E
 
Q
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
Y
T
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
F
P
 
N
V
 
V
F
 
L
S
 
C
G
 
E
T
 
H
R
 
K
G
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
-
 
V
-
 
I
F
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
E
A
 
S
A
 
S
P
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
E
Y
 
F
G
 
S
G
 
A
G
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
-
K
 
K
Q
 
M
L
 
Y
R
 
E
K
 
E
C
 
A
G
 
N
F
 
I
L
 
I
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
W
E
 
D
L
 
D
V
 
V
E
 
N
G
 
N
D
 
S
M
 
D
N
 
N
-
 
P
-
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
Q
E
 
E
L
 
C
V
 
T
R
 
R
W
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
K
S
 
E
G
 
K
D
 
E
A
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
F
I
 
M
M
 
K
R
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
D
G
 
K
L
 
E
G
 
K
G
 
P
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
Q
 
R
S
 
E
E
 
D
V
 
V
S
 
K
A
 
E
W
 
F
R
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
Y
D
 
S
T
 
T
L
 
I
H
 
H
Y
 
Y

4bhdB Methanococcus jannaschii serine hydroxymethyl-transferase, apo form (see paper)
33% identity, 80% coverage: 88:433/435 of query aligns to 46:381/395 of 4bhdB

query
sites
4bhdB
M
 
M
G
 
G
M
 
C
E
 
K
A
 
Y
I
 
I
E
 
D
Q
 
E
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
C
A
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
L
F
 
F
D
 
K
A
 
A
R
 
E
F
 
H
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Y
 
A
G
 
V
F
 
F
M
 
F
A
 
A
T
 
E
C
 
T
K
 
M
A
 
A
G
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
I
 
L
A
 
S
P
 
V
P
 
P
G
 
D
S
 
-
I
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
I
T
 
S
H
 
H
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
W
E
 
N
A
 
H
P
 
P
V
 
F
N
 
D
A
 
P
D
 
E
G
 
E
Y
 
M
T
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
A
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
R
 
V
A
 
K
L
 
K
A
 
I
K
 
L
T
 
E
E
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
L
I
 
F
G
 
G
G
 
G
S
|
S
L
 
L
N
 
F
L
 
P
F
 
F
E
 
P
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
A
R
 
Y
A
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
Q
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
M
 
A
F
 
Y
D
|
D
A
 
G
A
 
A
H
|
H
Q
 
V
C
 
L
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
W
 
F
S
 
Q
N
 
D
P
 
P
L
 
L
K
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
E
F
 
Y
M
 
L
T
 
M
M
 
G
S
|
S
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
F
G
 
F
G
 
G
P
 
P
A
x
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
T
D
 
K
E
 
E
E
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
D
A
 
K
L
 
I
D
 
D
A
 
S
I
 
H
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
F
 
H
D
 
H
A
 
L
A
 
H
K
 
H
T
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
T
 
A
M
 
L
L
 
A
D
 
E
W
 
M
K
 
L
A
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
K
E
 
Q
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
Y
T
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
F
P
 
N
V
 
V
F
 
L
S
 
C
G
 
E
T
 
H
R
 
K
G
 
D
F
 
F
T
 
T
N
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
-
 
V
-
 
I
F
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
E
A
 
S
A
 
S
P
 
P
-
 
D
-
 
I
-
 
E
Y
 
F
G
 
S
G
 
A
G
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
-
K
 
K
Q
 
M
L
 
Y
R
 
E
K
 
E
C
 
A
G
 
N
F
 
I
L
 
I
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
W
E
 
D
L
 
D
V
 
V
E
 
N
G
 
N
D
 
S
M
 
D
N
 
N
-
 
P
-
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
Q
E
 
E
L
 
C
V
 
T
R
 
R
W
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
K
S
 
E
G
 
K
D
 
E
A
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
F
I
 
M
M
 
K
R
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
D
G
 
K
L
 
E
G
 
K
G
 
P
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
Q
 
R
S
 
E
E
 
D
V
 
V
S
 
K
A
 
E
W
 
F
R
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
Y
D
 
S
T
 
T
L
 
I
H
 
H
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q5SI56 Serine hydroxymethyltransferase; SHMT; Serine methylase; EC 2.1.2.1 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
31% identity, 87% coverage: 34:412/435 of query aligns to 10:385/407 of Q5SI56

query
sites
Q5SI56
A
 
A
R
 
L
I
 
F
E
 
E
N
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
-
H
 
-
E
 
Q
H
 
R
E
 
E
C
 
G
F
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
I
P
 
A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
F
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
Q
A
 
V
E
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
Y
S
 
A
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
R
Y
 
Y
E
 
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
C
E
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
A
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
 
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
A
T
 
L
C
 
M
K
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
S
A
 
R
G
 
V
C
 
N
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
L
L
 
Y
R
 
K
T
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
G
V
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
D
G
 
T
Y
 
E
T
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
E
E
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
P
F
 
R
E
 
F
H
 
W
P
 
D
V
 
F
A
 
K
E
 
A
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
V
D
 
D
A
 
M
A
 
A
H
|
H
Q
 
F
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
G
A
 
L
W
 
H
S
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
V
T
 
T
M
 
S
S
 
T
T
 
T
Y
x
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
L
A
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
I
T
 
Q
A
 
G
N
x
G
F
 
P
D
 
L
A
 
E
A
 
H
K
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
A
M
 
F
L
 
F
D
 
E
-
 
A
W
 
L
K
 
Q
A
 
P
F
 
E
G
 
F
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
S
N
 
R
E
 
L
M
 
V
I
 
V
A
 
E
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
A
N
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
A
T
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
P
 
R
V
 
I
F
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
G
R
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
T
N
 
D
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
L
 
D
A
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
S
 
E
K
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
K
 
A
C
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
T
A
 
V
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
F
E
 
D
L
 
P
V
 
K
E
 
P
G
 
P
D
 
R
M
 
V
-
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
T
W
 
R
G
 
G
M
 
F
T
 
T
S
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
P
R
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
M
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
L

8suiB Joint x-ray/neutron structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (tthshmt) in internal aldimine state with l- ser bound in a pre-michalis complex (see paper)
31% identity, 87% coverage: 34:412/435 of query aligns to 5:380/402 of 8suiB

query
sites
8suiB
A
 
A
R
 
L
I
 
F
E
 
E
N
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
-
H
 
-
E
 
Q
H
 
R
E
 
E
C
 
G
F
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
I
P
 
A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
F
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
Q
A
 
V
E
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
 
Y
S
 
A
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
R
Y
|
Y
E
x
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
C
E
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
A
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
A
T
 
L
C
 
M
K
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
S
A
 
R
G
 
V
C
 
N
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
L
L
 
Y
R
 
K
T
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
G
V
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
D
G
 
T
Y
 
E
T
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
E
E
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
P
F
 
R
E
 
F
H
 
W
P
 
D
V
 
F
A
 
K
E
 
A
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
V
D
 
D
A
 
M
A
 
A
H
 
H
Q
 
F
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
G
A
 
L
W
 
H
S
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
V
T
 
T
M
 
S
S
 
T
T
 
T
Y
 
H
K
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
L
A
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
I
T
 
Q
A
 
G
N
 
G
F
 
P
D
 
L
A
 
E
A
 
H
K
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
A
M
 
F
L
 
F
D
 
E
-
 
A
W
 
L
K
 
Q
A
 
P
F
 
E
G
 
F
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
S
N
 
R
E
 
L
M
 
V
I
 
V
A
 
E
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
A
N
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
A
T
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
P
 
R
V
 
I
F
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
G
R
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
T
N
 
D
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
L
 
D
A
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
S
 
E
K
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
K
 
A
C
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
T
A
 
V
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
F
E
 
D
L
 
P
V
 
K
E
 
P
G
 
P
D
 
R
M
 
V
-
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
T
W
 
R
G
 
G
M
 
F
T
 
T
S
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
P
R
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
M
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
L

8ssyA Room-temperature x-ray structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (shmt) bound with d-ser in a pseudo- michaelis complex (see paper)
31% identity, 87% coverage: 34:412/435 of query aligns to 5:380/402 of 8ssyA

query
sites
8ssyA
A
 
A
R
 
L
I
 
F
E
 
E
N
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
-
H
 
-
E
 
Q
H
 
R
E
 
E
C
 
G
F
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
I
P
 
A
A
x
S
T
 
E
N
 
N
V
 
F
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
Q
A
 
V
E
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
 
Y
S
 
A
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
R
Y
 
Y
E
 
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
C
E
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
A
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
A
T
 
L
C
 
M
K
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
S
A
 
R
G
 
V
C
 
N
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
L
L
 
Y
R
 
K
T
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
G
V
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
D
G
 
T
Y
 
E
T
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
E
E
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
P
F
 
R
E
 
F
H
 
W
P
 
D
V
 
F
A
 
K
E
 
A
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
V
D
 
D
A
 
M
A
 
A
H
|
H
Q
 
F
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
G
A
 
L
W
 
H
S
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
V
T
 
T
M
 
S
S
 
T
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
L
A
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
I
T
 
Q
A
 
G
N
 
G
F
 
P
D
 
L
A
 
E
A
 
H
K
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
A
M
 
F
L
 
F
D
 
E
-
 
A
W
 
L
K
 
Q
A
 
P
F
 
E
G
 
F
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
S
N
 
R
E
 
L
M
 
V
I
 
V
A
 
E
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
A
N
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
A
T
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
P
 
R
V
 
I
F
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
G
R
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
T
N
 
D
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
L
 
D
A
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
S
 
E
K
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
K
 
A
C
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
T
A
 
V
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
F
E
 
D
L
 
P
V
 
K
E
 
P
G
 
P
D
 
R
M
 
V
-
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
T
W
 
R
G
 
G
M
 
F
T
 
T
S
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
P
R
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
M
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
L

2dkjA Crystal structure of t.Th.Hb8 serine hydroxymethyltransferase
31% identity, 87% coverage: 34:412/435 of query aligns to 5:380/402 of 2dkjA

query
sites
2dkjA
A
 
A
R
 
L
I
 
F
E
 
E
N
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
L
E
 
E
N
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
-
H
 
-
E
 
Q
H
 
R
E
 
E
C
 
G
F
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
I
P
 
A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
F
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
Q
A
 
V
E
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
V
S
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
Y
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
R
Y
 
Y
E
 
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
C
E
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
A
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
M
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
A
T
 
L
C
 
M
K
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
S
A
 
R
G
 
V
C
 
N
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
L
L
 
Y
R
 
K
T
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
G
V
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
D
G
 
T
Y
 
E
T
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
E
E
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
P
F
 
R
E
 
F
H
 
W
P
 
D
V
 
F
A
 
K
E
 
A
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
V
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
 
H
Q
 
F
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
G
A
 
L
W
 
H
S
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
V
T
 
T
M
 
S
S
x
T
T
 
T
Y
x
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
P
E
 
E
I
 
L
A
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
L
A
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
I
T
 
Q
A
 
G
N
 
G
F
 
P
D
 
L
A
 
E
A
 
H
K
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
A
M
 
F
L
 
F
D
 
E
-
 
A
W
 
L
K
 
Q
A
 
P
F
 
E
G
 
F
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
S
N
 
R
E
 
L
M
 
V
I
 
V
A
 
E
M
 
N
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
S
 
A
N
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
A
T
 
R
K
 
R
G
 
G
V
 
Y
P
 
R
V
 
I
F
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
G
R
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
T
N
 
D
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
L
 
D
A
 
L
A
 
R
P
 
P
Y
 
K
G
 
G
-
 
L
G
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
S
 
E
K
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
D
K
 
A
C
 
V
G
 
G
F
 
I
L
 
T
A
 
V
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
A
L
 
I
P
 
P
V
 
F
E
 
D
L
 
P
V
 
K
E
 
P
G
 
P
D
 
R
M
 
V
-
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
T
W
 
R
G
 
G
M
 
F
T
 
T
S
 
P
G
 
E
D
 
E
A
 
M
E
 
P
R
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
L
I
 
I
M
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
L

6ti4A Shmt from streptococcus thermophilus tyr55ser variant in complex with plp/d-serine/lys230 gem diamine complex
32% identity, 82% coverage: 57:412/435 of query aligns to 29:384/410 of 6ti4A

query
sites
6ti4A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
 
T
G
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
S
S
x
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
|
Y
E
x
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
T
T
 
T
M
 
T
S
x
T
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
x
G
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

6ti3A Apo-shmt from streptococcus thermophilus tyr55ser variant in complex with d-threonine
32% identity, 82% coverage: 57:412/435 of query aligns to 29:384/410 of 6ti3A

query
sites
6ti3A
A
 
S
T
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
 
T
G
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
S
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
Y
E
 
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
 
A
H
 
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
T
T
 
T
M
 
T
S
x
T
T
 
T
Y
x
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
x
G
-
x
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
 
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

6tghC Shmt from streptococcus thermophilus tyr55thr variant in complex with d-serine both as external aldimine and as non-covalent complex
33% identity, 81% coverage: 59:412/435 of query aligns to 31:384/410 of 6tghC

query
sites
6tghC
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
 
T
G
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
T
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
Y
E
 
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
T
T
 
T
M
 
T
S
x
T
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
x
G
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6tghA Shmt from streptococcus thermophilus tyr55thr variant in complex with d-serine both as external aldimine and as non-covalent complex
33% identity, 81% coverage: 59:412/435 of query aligns to 31:384/410 of 6tghA

query
sites
6tghA
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
 
T
G
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
T
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
Y
E
x
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
 
A
H
 
H
F
 
V
M
 
T
T
 
T
M
 
T
S
x
T
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4wxgA Crystal structure of l-serine hydroxymethyltransferase in complex with a mixture of l-threonine and glycine (see paper)
32% identity, 82% coverage: 57:412/435 of query aligns to 29:384/410 of 4wxgA

query
sites
4wxgA
A
x
S
T
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
x
T
G
 
L
I
x
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
Y
S
 
A
L
x
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
Y
E
x
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
|
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
|
A
H
 
H
F
 
V
M
x
T
T
 
T
M
 
T
S
x
T
T
 
T
Y
 
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
x
G
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

4wxfA Crystal structure of l-serine hydroxymethyltransferase in complex with glycine (see paper)
32% identity, 82% coverage: 57:412/435 of query aligns to 29:384/410 of 4wxfA

query
sites
4wxfA
A
x
S
T
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
V
N
 
S
P
 
K
K
 
A
A
 
V
E
 
M
A
 
A
L
 
A
L
 
Q
S
 
G
S
x
T
G
 
L
I
x
L
G
 
T
S
 
N
R
 
K
P
x
Y
S
 
A
L
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
K
K
 
R
Y
 
Y
E
x
Y
M
 
G
G
 
G
M
 
T
E
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
D
Q
 
V
I
 
V
E
 
E
V
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
R
C
 
A
A
 
K
E
 
K
V
 
L
F
 
F
D
 
G
A
 
A
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
Q
V
 
P
P
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
I
 
Q
A
 
A
N
 
N
L
 
A
Y
 
A
G
 
V
F
 
Y
M
 
M
A
 
S
T
 
L
C
 
I
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
M
A
 
G
P
 
M
P
 
D
G
 
L
S
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
G
A
 
A
A
 
P
G
 
V
C
 
S
A
 
F
G
 
S
L
 
G
F
 
K
G
 
T
L
 
Y
R
 
N
T
 
F
I
 
V
E
 
S
A
 
Y
P
 
N
V
 
V
N
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
S
Y
 
E
T
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
Q
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
T
 
E
E
 
V
R
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
L
 
A
N
 
Y
L
 
S
F
 
R
E
 
I
H
 
I
P
 
D
V
 
F
A
 
A
E
 
K
V
 
F
R
 
R
A
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
V
G
|
G
A
 
A
K
 
Y
V
 
L
M
 
M
F
 
V
D
|
D
A
 
M
A
|
A
H
|
H
Q
 
I
C
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
V
A
 
A
G
 
S
R
 
G
A
 
H
W
 
H
S
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
P
E
 
Y
G
 
-
A
|
A
H
 
H
F
 
V
M
x
T
T
 
T
M
 
T
S
 
T
T
 
T
Y
x
H
K
|
K
S
 
T
L
 
L
G
 
R
G
 
G
P
 
P
A
x
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
A
 
S
I
 
A
A
 
V
F
 
F
P
 
P
G
 
G
M
 
L
T
 
Q
A
x
G
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
N
 
H
F
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
-
T
 
E
M
 
A
L
 
L
D
 
D
W
 
-
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
-
S
 
K
A
 
E
Y
 
Y
A
 
G
N
 
E
E
 
N
M
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
N
A
 
A
K
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
N
T
 
Q
K
 
H
G
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
D
F
 
F
S
 
R
G
 
V
T
 
I
R
 
S
G
 
G
F
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
N
H
 
H
Q
 
L
F
 
F
A
 
L
V
 
V
-
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
K
P
 
V
Y
 
V
G
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
Q
 
V
L
 
L
R
 
E
K
 
E
C
 
V
G
 
N
F
 
I
L
 
T
A
 
L
C
 
N
G
 
K
I
 
N
G
 
S
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
-
 
Q
L
 
L
V
 
S
E
 
P
G
 
F
D
 
K
M
 
T
N
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
I
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
S
W
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
G
S
 
E
G
 
A
D
 
E
A
 
S
E
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
W
I
 
M
M
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
L

7x5nA Crystal structure of e. Faecium shmt in complex with (+)-shin-1 and plp-ser (see paper)
33% identity, 86% coverage: 41:412/435 of query aligns to 16:384/409 of 7x5nA

query
sites
7x5nA
E
 
E
E
 
E
N
 
E
R