SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010442419.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_010442419.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1worA Crystal structure of t-protein of the glycine cleavage system (see paper)
29% identity, 42% coverage: 416:748/799 of query aligns to 6:329/362 of 1worA

query
sites
1worA
C
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
K
H
 
H
T
 
V
R
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
 
K
F
 
M
V
 
V
E
 
D
Y
x
F
N
 
A
G
 
G
Y
 
W
W
 
E
L
 
M
P
 
P
N
 
L
T
 
Y
M
 
Y
T
 
T
N
 
S
H
 
-
G
 
-
A
 
I
I
 
F
A
 
E
E
 
E
Y
 
V
W
 
M
A
 
A
C
 
V
R
 
R
D
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
M
M
 
F
D
 
D
L
 
V
S
 
S
P
 
H
L
 
M
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
E
 
L
V
 
V
V
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
V
E
 
S
L
 
F
M
 
I
Q
 
D
L
 
F
C
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
N
N
 
D
M
 
F
K
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
P
V
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
T
 
S
A
 
V
M
 
M
C
 
C
Y
 
N
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
D
 
D
D
|
D
G
 
L
T
 
V
I
 
V
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
I
E
 
E
T
 
K
N
 
D
F
 
F
R
 
N
W
 
W
I
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
K
A
 
S
R
 
H
K
 
S
H
 
K
N
 
N
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
E
V
 
V
R
 
S
N
 
N
S
 
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
T
L
 
T
H
 
A
N
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
F
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
A
R
 
Q
D
 
E
I
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
E
I
 
L
F
 
V
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
E
P
 
D
T
 
G
I
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
P
 
A
W
 
Y
F
 
Y
R
 
S
L
 
F
T
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
K
G
 
S
D
 
I
V
 
V
R
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
E
V
 
T
V
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
D
G
 
G
Y
 
F
E
 
E
I
 
L
F
 
M
C
 
L
H
 
E
P
 
A
K
 
K
D
 
N
A
 
A
V
 
P
E
 
K
I
 
V
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
M
E
 
N
V
 
L
G
 
L
Q
 
R
D
 
K
Y
 
I
G
 
D
I
 
G
A
 
R
P
 
P
L
 
A
G
 
G
L
|
L
A
 
G
A
 
A
L
x
R
D
|
D
M
 
V
L
 
C
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
A
G
 
T
L
 
Y
I
 
L
F
x
L
A
 
Y
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
F
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
N
T
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
S
F
 
W
T
 
V
V
 
V
P
 
K
L
 
L
K
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
L
E
 
K
R
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
K
P
 
V
H
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
D
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
G
 
K
T
 
R
V
 
I
P
 
A
S
 
R
P
 
K
G
 
G
D
 
Y
C
 
E
V
 
V
R
 
L
I
 
K
G
 
N
K
 
G
A
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
N
K
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
S
S
 
K
T
 
S

1wopA Crystal structure of t-protein of the glycine cleavage system (see paper)
29% identity, 42% coverage: 416:748/799 of query aligns to 6:329/362 of 1wopA

query
sites
1wopA
C
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
K
H
 
H
T
 
V
R
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
 
K
F
 
M
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
N
 
A
G
 
G
Y
 
W
W
 
E
L
 
M
P
 
P
N
 
L
T
 
Y
M
 
Y
T
 
T
N
 
S
H
 
-
G
 
-
A
 
I
I
 
F
A
 
E
E
 
E
Y
 
V
W
 
M
A
 
A
C
 
V
R
 
R
D
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
M
M
 
F
D
 
D
L
 
V
S
 
S
P
 
H
L
x
M
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
E
x
L
V
 
V
V
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
V
E
 
S
L
 
F
M
 
I
Q
 
D
L
 
F
C
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
N
N
 
D
M
 
F
K
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
P
V
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
I
Y
|
Y
T
 
S
A
 
V
M
 
M
C
 
C
Y
 
N
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
D
 
D
D
|
D
G
 
L
T
x
V
I
 
V
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
D
-
x
E
-
 
A
-
x
L
-
 
M
-
x
V
-
 
V
-
x
N
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
I
E
 
E
T
 
K
N
 
D
F
 
F
R
 
N
W
 
W
I
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
K
A
 
S
R
 
H
K
 
S
H
 
K
N
 
N
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
E
V
 
V
R
 
S
N
 
N
S
x
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
T
L
 
T
H
 
A
N
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
F
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
A
R
 
Q
D
 
E
I
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
E
I
 
L
F
 
V
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
x
E
P
 
D
T
 
G
I
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
P
 
A
W
x
Y
F
x
Y
R
 
S
L
 
F
T
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
V
x
K
G
x
S
D
x
I
V
 
V
R
 
A
G
 
G
T
 
V
S
x
E
V
x
T
V
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
D
G
 
G
Y
 
F
E
|
E
I
 
L
F
x
M
C
 
L
H
 
E
P
 
A
K
 
K
D
 
N
A
 
A
V
 
P
E
 
K
I
 
V
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
M
E
 
N
V
 
L
G
 
L
Q
 
R
D
 
K
Y
 
I
G
 
D
I
 
G
A
 
R
P
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
x
R
D
 
D
M
 
V
L
 
C
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
A
G
 
T
L
x
Y
I
 
L
F
 
L
A
 
Y
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
F
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
N
T
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
S
F
 
W
T
 
V
V
 
V
P
 
K
L
 
L
K
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
L
E
 
K
R
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
K
P
 
V
H
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
D
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
G
 
K
T
 
R
V
 
I
P
 
A
S
 
R
P
 
K
G
 
G
D
 
Y
C
 
E
V
 
V
R
 
L
I
 
K
G
 
N
K
 
G
A
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
N
K
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
S
S
 
K
T
 
S

Sites not aligning to the query:

1wooA Crystal structure of t-protein of the glycine cleavage system (see paper)
29% identity, 42% coverage: 416:748/799 of query aligns to 6:329/362 of 1wooA

query
sites
1wooA
C
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
K
H
 
H
T
 
V
R
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
 
K
F
 
M
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
N
 
A
G
 
G
Y
 
W
W
 
E
L
 
M
P
 
P
N
 
L
T
 
Y
M
 
Y
T
 
T
N
 
S
H
 
-
G
 
-
A
 
I
I
 
F
A
 
E
E
 
E
Y
 
V
W
 
M
A
 
A
C
 
V
R
 
R
D
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
G
V
 
M
M
 
F
D
 
D
L
 
V
S
 
S
P
 
H
L
x
M
R
 
G
K
 
E
Y
 
F
E
 
L
V
 
V
V
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
V
E
 
S
L
 
F
M
 
I
Q
 
D
L
 
F
C
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
N
N
 
D
M
 
F
K
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
P
V
 
D
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
I
Y
|
Y
T
 
S
A
 
V
M
 
M
C
 
C
Y
 
N
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
I
I
 
I
D
 
D
D
|
D
G
 
L
T
x
V
I
 
V
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
M
-
x
V
-
 
V
-
x
N
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
I
E
 
E
T
 
K
N
 
D
F
 
F
R
 
N
W
 
W
I
 
I
G
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
K
A
 
S
R
 
H
K
 
S
H
 
K
N
 
N
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
E
V
 
V
R
 
S
N
 
N
S
 
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
T
L
 
T
H
 
A
N
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
F
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
A
R
 
Q
D
 
E
I
 
T
L
 
L
S
 
Q
Q
 
E
I
 
L
F
 
V
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
E
P
 
D
T
 
G
I
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
P
 
A
W
x
Y
F
x
Y
R
 
S
L
 
F
T
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
K
G
 
S
D
 
I
V
 
V
R
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
E
V
 
T
V
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
D
G
 
G
Y
 
F
E
|
E
I
 
L
F
 
M
C
 
L
H
 
E
P
 
A
K
 
K
D
 
N
A
 
A
V
 
P
E
 
K
I
 
V
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
M
E
 
N
V
 
L
G
 
L
Q
 
R
D
 
K
Y
 
I
G
 
D
I
 
G
A
 
R
P
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
R
D
 
D
M
 
V
L
 
C
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
A
G
 
T
L
x
Y
I
 
L
F
 
L
A
 
Y
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
F
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
N
T
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
L
G
 
S
F
 
W
T
 
V
V
 
V
P
 
K
L
 
L
K
 
-
S
 
-
K
 
-
T
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
F
I
 
V
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
L
E
 
K
R
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
K
P
 
V
H
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
A
F
 
L
D
 
E
I
 
L
E
 
S
G
 
G
G
 
K
T
 
R
V
 
I
P
 
A
S
 
R
P
 
K
G
 
G
D
 
Y
C
 
E
V
 
V
R
 
L
I
 
K
G
 
N
K
 
G
A
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
N
K
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
S
S
 
K
T
 
S

Sites not aligning to the query:

1pj7A Structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folinic acid (see paper)
32% identity, 43% coverage: 441:787/799 of query aligns to 486:827/827 of 1pj7A

query
sites
1pj7A
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
A
 
K
C
 
T
R
 
R
D
 
T
K
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
M
 
Y
D
 
D
L
 
M
S
 
T
P
 
P
L
|
L
R
 
K
K
 
R
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
L
E
 
K
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
L
 
E
C
 
L
V
 
T
T
 
T
R
 
A
N
 
D
M
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
-
S
 
K
V
 
P
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
V
 
T
Y
|
Y
T
 
T
A
 
L
M
 
L
C
 
L
Y
 
D
E
 
H
H
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
R
D
 
S
D
|
D
G
 
I
T
|
T
I
 
V
Y
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
D
N
 
T
F
 
F
R
 
Q
W
 
-
I
 
L
G
|
G
G
 
A
N
 
N
D
 
G
T
 
N
S
 
I
G
 
D
L
 
T
W
 
A
L
 
Y
Q
 
F
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
A
K
 
R
H
 
H
N
 
Q
M
 
T
N
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
W
V
 
V
W
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
D
S
 
T
T
 
T
D
 
G
Q
 
G
L
 
T
H
 
C
N
 
C
I
 
I
A
 
G
V
 
L
Q
 
W
G
 
G
R
 
P
Y
 
L
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
S
 
S
Q
 
K
I
 
V
F
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
S
P
 
D
Q
 
D
Q
 
D
P
 
F
T
 
T
I
 
N
E
 
D
E
 
G
L
 
L
P
 
K
W
 
Y
F
|
F
R
 
R
L
 
A
T
 
K
V
 
N
A
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
T
I
 
A
S
 
M
R
 
R
T
 
L
G
 
S
Y
|
Y
S
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
|
E
I
 
L
F
 
Y
C
 
T
H
 
S
P
 
A
K
 
D
D
 
N
A
 
G
V
 
Q
E
 
R
I
 
L
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
P
Y
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
I
P
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
M
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
x
Y
I
 
R
F
 
S
A
 
W
G
 
G
S
 
T
E
 
D
F
 
M
D
 
T
D
 
T
Q
 
E
T
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
V
 
V
P
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
M
K
 
A
T
 
K
D
 
E
N
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
E
E
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
E
H
 
E
P
 
A
H
 
S
-
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
R
G
 
C
F
 
L
D
 
T
I
 
I
E
 
D
G
 
D
G
 
G
T
 
R
V
 
S
P
 
I
S
 
V
P
 
L
G
 
G
D
 
K
C
 
E
V
 
P
R
 
V
I
 
F
G
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
-
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
M
 
A
K
 
Y
S
 
G
P
 
Y
I
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
K
V
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
Y
V
 
L
A
 
P
S
 
G
T
 
T
H
 
V
A
 
S
L
 
V
E
 
-
G
 
G
H
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
E
Q
 
Y
L
 
F
D
 
G
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
R
R
 
R
L
 
I
K
 
T
A
 
A
K
 
T
I
 
V
V
 
T
P
 
E
F
 
D
P
 
P
H
 
L
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
M
E
 
T
R
 
R
V
 
L
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1pj6A Crystal structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folic acid (see paper)
32% identity, 43% coverage: 441:787/799 of query aligns to 487:828/828 of 1pj6A

query
sites
1pj6A
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
A
 
K
C
 
T
R
 
R
D
 
T
K
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
M
 
Y
D
 
D
L
 
M
S
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
K
K
 
R
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
L
E
 
K
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
L
 
E
C
 
L
V
 
T
T
 
T
R
 
A
N
 
D
M
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
-
S
 
K
V
 
P
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
V
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
L
M
 
L
C
 
L
Y
 
D
E
 
H
H
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
R
D
 
S
D
|
D
G
 
I
T
 
T
I
 
V
Y
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
D
N
 
T
F
 
F
R
 
Q
W
 
-
I
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
N
D
 
G
T
 
N
S
 
I
G
 
D
L
 
T
W
 
A
L
 
Y
Q
 
F
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
A
K
 
R
H
 
H
N
 
Q
M
 
T
N
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
W
V
 
V
W
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
D
S
 
T
T
 
T
D
 
G
Q
 
G
L
 
T
H
 
C
N
 
C
I
 
I
A
 
G
V
 
L
Q
 
W
G
 
G
R
 
P
Y
 
L
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
S
 
S
Q
 
K
I
 
V
F
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
S
P
 
D
Q
 
D
Q
 
D
P
 
F
T
 
T
I
 
N
E
 
D
E
 
G
L
 
L
P
 
K
W
 
Y
F
 
F
R
 
R
L
 
A
T
 
K
V
 
N
A
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
T
I
 
A
S
 
M
R
 
R
T
 
L
G
 
S
Y
 
Y
S
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
 
E
I
 
L
F
 
Y
C
 
T
H
 
S
P
 
A
K
 
D
D
 
N
A
 
G
V
 
Q
E
 
R
I
 
L
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
P
Y
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
I
P
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
M
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
Y
I
 
R
F
 
S
A
 
W
G
 
G
S
 
T
E
 
D
F
 
M
D
 
T
D
 
T
Q
 
E
T
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
V
 
V
P
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
M
K
 
A
T
 
K
D
 
E
N
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
E
E
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
E
H
 
E
P
 
A
H
 
S
-
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
R
G
 
C
F
 
L
D
 
T
I
 
I
E
 
D
G
 
D
G
 
G
T
 
R
V
 
S
P
 
I
S
 
V
P
 
L
G
 
G
D
 
K
C
 
E
V
 
P
R
 
V
I
 
F
G
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
-
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
M
 
A
K
 
Y
S
 
G
P
 
Y
I
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
K
V
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
Y
V
 
L
A
 
P
S
 
G
T
 
T
H
 
V
A
 
S
L
 
V
E
 
-
G
 
G
H
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
E
Q
 
Y
L
 
F
D
 
G
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
R
R
 
R
L
 
I
K
 
T
A
 
A
K
 
T
I
 
V
V
 
T
P
 
E
F
 
D
P
 
P
H
 
L
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
M
E
 
T
R
 
R
V
 
L
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9AGP8 Dimethylglycine oxidase; DMGO; EC 1.5.3.10 from Arthrobacter globiformis (see 2 papers)
32% identity, 43% coverage: 441:787/799 of query aligns to 489:830/830 of Q9AGP8

query
sites
Q9AGP8
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
A
 
K
C
 
T
R
 
R
D
 
T
K
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
M
 
Y
D
 
D
L
 
M
S
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
K
K
 
R
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
L
E
 
K
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
L
 
E
C
 
L
V
 
T
T
 
T
R
 
A
N
 
D
M
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
-
S
 
K
V
 
P
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
V
 
T
Y
|
Y
T
 
T
A
 
L
M
 
L
C
 
L
Y
 
D
E
 
H
H
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
R
D
 
S
D
|
D
G
 
I
T
 
T
I
 
V
Y
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
D
N
 
T
F
 
F
R
 
Q
W
 
-
I
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
N
D
 
G
T
 
N
S
 
I
G
 
D
L
 
T
W
 
A
L
 
Y
Q
 
F
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
A
K
 
R
H
 
H
N
 
Q
M
 
T
N
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
W
V
 
V
W
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
D
S
 
T
T
 
T
D
 
G
Q
 
G
L
 
T
H
 
C
N
 
C
I
 
I
A
 
G
V
 
L
Q
 
W
G
 
G
R
 
P
Y
 
L
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
S
 
S
Q
 
K
I
 
V
F
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
S
P
 
D
Q
 
D
Q
 
D
P
 
F
T
 
T
I
 
N
E
 
D
E
 
G
L
 
L
P
 
K
W
 
Y
F
 
F
R
 
R
L
 
A
T
 
K
V
 
N
A
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
T
I
 
A
S
 
M
R
 
R
T
 
L
G
 
S
Y
 
Y
S
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
 
E
I
 
L
F
 
Y
C
 
T
H
 
S
P
 
A
K
 
D
D
 
N
A
 
G
V
 
Q
E
 
R
I
 
L
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
P
Y
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
I
P
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
M
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
Y
I
 
R
F
 
S
A
 
W
G
 
G
S
 
T
E
 
D
F
 
M
D
 
T
D
 
T
Q
 
E
T
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
V
 
V
P
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
M
K
 
A
T
 
K
D
 
E
N
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
E
E
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
E
H
 
E
P
 
A
H
 
S
-
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
R
G
 
C
F
 
L
D
 
T
I
 
I
E
 
D
G
 
D
G
 
G
T
 
R
V
 
S
P
 
I
S
 
V
P
 
L
G
 
G
D
 
K
C
 
E
V
 
P
R
 
V
I
 
F
G
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
-
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
M
 
A
K
 
Y
S
 
G
P
 
Y
I
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
K
V
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
Y
V
 
L
A
 
P
S
 
G
T
 
T
H
 
V
A
 
S
L
 
V
E
 
-
G
 
G
H
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
E
Q
 
Y
L
 
F
D
 
G
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
R
R
 
R
L
 
I
K
 
T
A
 
A
K
 
T
I
 
V
V
 
T
P
 
E
F
 
D
P
 
P
H
 
L
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
M
E
 
T
R
 
R
V
 
L
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3gsiA Crystal structure of d552a dimethylglycine oxidase mutant of arthrobacter globiformis in complex with tetrahydrofolate (see paper)
31% identity, 43% coverage: 441:787/799 of query aligns to 486:827/827 of 3gsiA

query
sites
3gsiA
A
 
A
I
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
A
W
 
W
A
 
K
C
 
T
R
 
R
D
 
T
K
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
M
M
 
Y
D
 
D
L
 
M
S
 
T
P
 
P
L
|
L
R
 
K
K
 
R
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
G
A
 
A
E
 
L
E
 
K
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
L
 
E
C
 
L
V
 
T
T
 
T
R
 
A
N
 
D
M
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
-
S
 
K
V
 
P
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
V
 
T
Y
|
Y
T
 
T
A
 
L
M
 
L
C
 
L
Y
 
D
E
 
H
H
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
R
D
 
S
D
x
A
G
 
I
T
|
T
I
 
V
Y
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
D
N
 
T
F
 
F
R
 
Q
W
 
-
I
 
L
G
|
G
G
 
A
N
 
N
D
 
G
T
 
N
S
 
I
G
 
D
L
 
T
W
 
A
L
 
Y
Q
 
F
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
A
K
 
R
H
 
H
N
 
Q
M
 
T
N
 
Q
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
W
V
 
V
W
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
D
S
 
T
T
 
T
D
 
G
Q
 
G
L
 
T
H
 
C
N
 
C
I
 
I
A
 
G
V
 
L
Q
 
W
G
 
G
R
 
P
Y
 
L
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
S
 
S
Q
 
K
I
 
V
F
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
S
P
 
D
Q
 
D
Q
 
D
P
 
F
T
 
T
I
 
N
E
 
D
E
 
G
L
 
L
P
 
K
W
 
Y
F
|
F
R
 
R
L
 
A
T
 
K
V
 
N
A
 
V
R
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
T
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
T
I
 
A
S
 
M
R
 
R
T
 
L
G
 
S
Y
|
Y
S
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
|
E
I
 
L
F
 
Y
C
 
T
H
 
S
P
 
A
K
 
D
D
 
N
A
 
G
V
 
Q
E
 
R
I
 
L
F
 
W
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
P
Y
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
I
P
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
M
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
x
Y
I
 
R
F
 
S
A
 
W
G
 
G
S
 
T
E
 
D
F
 
M
D
 
T
D
 
T
Q
 
E
T
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
A
V
 
V
P
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
M
K
 
A
T
 
K
D
 
E
N
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
E
E
 
G
R
 
R
K
 
T
A
 
E
H
 
E
P
 
A
H
 
S
-
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
R
G
 
C
F
 
L
D
 
T
I
 
I
E
 
D
G
 
D
G
 
G
T
 
R
V
 
S
P
 
I
S
 
V
P
 
L
G
 
G
D
 
K
C
 
E
V
 
P
R
 
V
I
 
F
G
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
-
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
M
 
A
K
 
Y
S
 
G
P
 
Y
I
 
T
L
 
V
G
 
A
K
 
K
V
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
Y
V
 
L
A
 
P
S
 
G
T
 
T
H
 
V
A
 
S
L
 
V
E
 
-
G
 
G
H
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
E
Q
 
Y
L
 
F
D
 
G
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
R
R
 
R
L
 
I
K
 
T
A
 
A
K
 
T
I
 
V
V
 
T
P
 
E
F
 
D
P
 
P
H
 
L
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
M
E
 
T
R
 
R
V
 
L
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8GAI3 4-methylaminobutanoate oxidase (formaldehyde-forming); MABO; Demethylating gamma-N-methylaminobutyrate oxidase; Gamma-N-methylaminobutyrate oxidase 1; EC 1.5.3.19 from Paenarthrobacter nicotinovorans (Arthrobacter nicotinovorans) (see paper)
31% identity, 43% coverage: 444:787/799 of query aligns to 490:824/824 of Q8GAI3

query
sites
Q8GAI3
E
 
E
Y
 
H
W
 
K
A
 
A
C
 
A
R
 
R
D
 
E
K
 
G
V
 
V
A
 
V
V
 
L
M
 
F
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
L
 
F
R
 
A
K
 
K
Y
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
P
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
C
Q
 
Q
L
 
M
C
 
A
V
 
A
T
 
T
R
 
A
N
 
D
M
 
I
K
 
D
K
 
-
L
 
V
S
 
E
V
 
T
G
 
D
Q
 
K
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
L
M
 
F
C
 
L
Y
 
N
E
 
D
H
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
E
D
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
T
I
 
I
Y
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
L
T
 
D
N
 
R
F
 
F
R
 
L
W
 
V
I
 
V
G
 
T
G
 
P
N
 
S
D
 
F
T
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
K
S
 
T
G
 
A
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
Q
 
K
E
 
R
Q
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
G
H
 
K
N
 
A
M
 
A
N
 
A
V
 
V
W
 
F
V
 
-
R
 
-
N
 
D
S
 
C
T
 
T
D
 
A
Q
 
A
L
 
L
H
 
A
N
 
T
I
 
I
A
 
G
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
S
R
 
R
D
 
E
I
 
L
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
I
 
I
F
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
D
W
 
W
T
 
S
P
 
D
P
 
E
Q
 
A
Q
 
Q
P
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
F
 
-
R
 
R
L
 
Y
T
 
T
V
 
H
A
 
G
R
 
R
V
 
M
G
 
V
D
 
E
V
 
I
R
 
A
G
 
D
T
 
G
S
 
Y
V
 
A
V
 
Y
I
 
S
S
 
L
R
 
R
T
 
V
G
 
S
Y
 
F
S
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
I
 
L
F
 
Y
C
 
P
H
 
S
P
 
A
K
 
D
D
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
N
I
 
V
F
 
L
D
 
D
R
 
A
V
 
L
W
 
W
E
 
E
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
K
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
Y
A
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
S
E
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
R
F
 
H
A
 
L
G
 
G
S
 
H
E
 
D
F
 
I
D
 
G
D
 
P
Q
 
I
T
 
D
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
E
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
R
F
 
F
T
 
T
V
 
I
P
 
S
L
 
M
K
 
-
S
 
D
K
 
K
T
 
P
D
 
G
N
 
G
F
 
F
I
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
L
E
 
K
R
 
L
K
 
D
-
 
P
A
 
T
H
 
A
P
 
P
H
 
D
R
 
H
K
 
R
L
 
T
V
 
V
G
 
Y
F
 
V
D
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
D
G
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
P
S
 
D
P
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
V
-
 
H
G
 
D
D
 
E
C
 
T
V
 
V
R
 
Y
I
 
C
G
 
N
K
 
G
A
 
L
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
R
I
 
M
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
S
K
 
Y
S
 
G
P
 
H
I
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
R
V
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
A
V
 
L
A
 
E
S
 
P
T
 
D
H
 
A
A
 
D
L
 
L
E
 
S
G
 
G
H
 
-
D
 
D
I
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
-
Q
 
Q
L
 
C
D
 
K
G
 
G
Q
 
-
Q
 
-
K
 
R
R
 
L
L
 
Y
K
 
P
A
 
A
K
 
K
I
 
V
V
 
S
P
 
R
F
 
R
P
 
P
H
 
F
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
L
K
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3a8iA Crystal structure of et-ehred-5-ch3-thf complex (see paper)
31% identity, 41% coverage: 416:745/799 of query aligns to 13:329/363 of 3a8iA

query
sites
3a8iA
C
 
C
F
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
M
V
 
V
E
 
D
Y
 
F
N
 
H
G
 
G
Y
 
W
W
 
M
L
 
M
P
 
P
N
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
L
N
 
H
H
 
Y
G
 
G
A
 
S
-
 
Q
I
 
I
A
 
D
E
 
E
Y
 
H
W
 
H
A
 
A
C
 
V
R
 
R
D
 
T
K
 
D
V
 
A
A
 
G
V
 
M
M
 
F
D
 
D
L
 
V
S
 
S
P
 
H
L
x
M
R
 
T
K
 
I
Y
 
V
E
 
D
V
 
L
V
 
R
G
 
G
P
 
S
D
 
R
A
 
T
E
 
R
E
 
E
L
 
F
M
 
L
Q
 
R
L
 
Y
C
 
L
V
 
L
T
 
A
R
 
N
N
 
D
M
 
V
K
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
T
-
 
K
V
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
L
Y
|
Y
T
 
S
A
 
G
M
 
M
C
 
L
Y
 
N
E
 
A
H
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
D
 
D
D
|
D
G
 
L
T
x
I
I
 
V
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
F
G
 
T
E
 
E
T
 
D
N
 
F
F
 
F
R
 
R
W
 
L
I
x
V
G
 
V
G
x
N
N
 
S
D
 
A
T
 
T
S
 
R
G
 
E
L
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
S
W
 
W
L
 
I
Q
 
T
E
 
Q
Q
 
H
A
 
A
R
 
E
K
 
P
H
 
F
N
 
G
M
 
I
N
 
E
V
 
I
W
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
-
S
 
-
T
 
-
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
H
 
S
N
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
N
S
 
A
R
 
Q
D
 
A
I
 
K
L
 
A
S
 
A
Q
 
T
I
 
L
F
 
F
W
 
N
T
 
D
P
 
A
P
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
P
 
A
T
 
V
I
 
E
E
 
G
E
 
M
L
 
K
P
 
P
W
x
F
F
 
F
R
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
G
V
 
V
R
 
Q
G
 
A
T
 
G
S
 
D
V
 
L
V
 
F
I
 
I
S
 
A
R
 
T
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
Y
E
|
E
I
 
I
F
 
A
C
 
L
H
 
P
P
 
N
K
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
D
I
 
F
F
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
W
 
W
E
 
R
V
 
A
G
 
L
Q
 
V
D
 
E
Y
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
K
P
 
P
L
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
x
R
D
 
D
M
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
A
G
 
G
L
x
M
I
 
N
F
 
L
A
 
Y
G
 
G
S
 
Q
E
 
E
F
 
M
D
 
D
D
 
E
Q
 
T
T
 
I
D
 
S
P
 
P
F
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
M
G
 
G
F
x
W
T
 
T
V
 
I
P
 
A
L
 
W
K
 
E
S
 
P
K
 
A
T
 
D
D
 
R
N
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
E
 
V
R
 
Q
K
 
R
A
 
E
H
 
H
P
 
G
H
 
T
R
 
E
K
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
L
D
 
V
I
 
M
E
 
T
G
 
E
G
 
K
T
 
G
V
 
V
P
 
L
S
 
R
P
 
N
G
 
E
D
 
L
C
 
P
V
 
V
R
 
R
I
 
F
G
 
T
K
 
D
A
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
-
 
Q
-
 
H
V
 
E
G
 
G
E
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
T
K
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
T
L
 
L
G
 
G
K
 
Y
V
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
V

3tfjA Dmsp-dependent demethylase from p. Ubique - with cofactor thf (see paper)
29% identity, 42% coverage: 427:758/799 of query aligns to 32:354/369 of 3tfjA

query
sites
3tfjA
Y
|
Y
N
 
N
G
 
H
Y
 
M
W
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
T
 
A
M
 
F
T
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
D
-
 
S
Y
 
Y
W
 
K
A
 
H
C
 
L
R
 
K
D
 
E
K
 
H
V
 
V
A
 
Q
V
 
I
M
 
W
D
 
D
L
 
V
S
 
A
P
 
A
L
x
E
R
 
R
K
 
Q
Y
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
S
G
 
G
P
 
K
D
 
D
A
 
S
E
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
V
Q
 
Q
L
 
L
C
 
M
V
 
T
T
 
C
R
 
R
N
 
D
M
 
L
K
 
S
K
 
K
L
 
S
S
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
C
V
 
Y
Y
|
Y
T
 
C
A
 
P
M
 
I
C
 
I
Y
 
D
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
N
M
 
L
I
 
V
D
 
N
D
|
D
G
 
P
T
x
V
I
 
V
Y
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
E
T
 
N
N
 
K
F
 
W
R
 
-
W
 
W
I
 
I
G
x
S
G
x
I
N
x
A
D
 
D
T
 
S
S
 
D
G
 
V
L
 
I
W
 
F
L
 
F
Q
 
A
E
 
K
-
 
G
Q
 
L
A
 
A
R
 
S
K
 
G
H
 
H
N
 
K
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
K
V
 
I
R
 
V
N
 
E
S
 
P
T
 
V
D
 
V
Q
 
D
L
 
I
H
 
-
N
 
-
I
 
M
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
S
R
 
F
D
 
A
I
 
L
L
 
M
S
 
E
Q
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
G
P
 
K
T
 
K
I
 
I
E
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
K
W
 
F
F
|
F
R
 
G
L
 
F
T
 
D
V
 
Y
A
 
F
R
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
F
R
 
E
G
 
G
T
 
T
S
 
K
V
 
H
V
 
L
I
 
I
S
 
A
R
 
R
T
 
S
G
 
G
Y
x
W
S
 
S
G
 
K
E
 
Q
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
|
E
I
 
V
F
 
Y
C
 
V
-
 
E
H
 
N
P
 
T
K
 
Q
D
 
S
A
 
G
V
 
Q
E
 
K
I
 
L
F
 
Y
D
 
D
R
 
H
V
 
L
W
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
D
 
E
Y
 
F
G
 
N
I
 
V
A
 
G
P
 
P
L
 
-
G
 
G
L
 
C
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
-
M
 
I
L
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
S
G
 
A
L
 
L
I
 
L
F
 
S
A
 
Y
G
 
G
S
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
D
D
 
N
Q
 
N
T
 
D
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
C
G
 
G
V
 
F
G
 
D
F
 
Q
T
x
Y
V
 
V
P
 
S
L
 
L
K
 
D
S
 
S
K
 
D
T
 
I
D
 
-
N
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
K
I
 
L
E
 
K
E
 
E
R
 
I
K
 
K
A
 
L
H
 
K
-
 
G
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
G
V
 
V
G
 
K
F
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
K
G
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
L
P
 
T
S
 
G
P
 
S
G
 
K
D
 
N
C
 
I
V
 
Y
R
 
D
I
 
E
G
 
N
K
 
N
A
 
N
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
T
 
R
S
 
S
A
 
A
M
 
C
K
 
Y
S
 
S
P
 
P
I
 
H
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
M
V
 
I
A
 
K
S
 
K
T
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
E
A
 
A
L
 
S
E
 
Q
G
 
G
H
 
F
D
 
K
I
 
I
E
 
Q
I
 
I

3tfiA Dmsp-dependent demethylase from p. Ubique - with substrate dmsp (see paper)
29% identity, 42% coverage: 427:758/799 of query aligns to 32:354/369 of 3tfiA

query
sites
3tfiA
Y
|
Y
N
 
N
G
 
H
Y
 
M
W
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
T
 
A
M
 
F
T
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
D
-
 
S
Y
 
Y
W
 
K
A
 
H
C
 
L
R
 
K
D
 
E
K
 
H
V
 
V
A
 
Q
V
 
I
M
 
W
D
 
D
L
 
V
S
 
A
P
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
Q
Y
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
S
G
 
G
P
 
K
D
 
D
A
 
S
E
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
V
Q
 
Q
L
 
L
C
 
M
V
 
T
T
 
C
R
 
R
N
 
D
M
 
L
K
 
S
K
 
K
L
 
S
S
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
C
V
 
Y
Y
 
Y
T
 
C
A
 
P
M
 
I
C
 
I
Y
 
D
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
N
M
 
L
I
 
V
D
 
N
D
|
D
G
 
P
T
 
V
I
 
V
Y
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
E
T
 
N
N
 
K
F
 
W
R
 
-
W
 
W
I
 
I
G
 
S
G
 
I
N
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
D
G
 
V
L
 
I
W
 
F
L
 
F
Q
 
A
E
 
K
-
 
G
Q
 
L
A
 
A
R
 
S
K
 
G
H
 
H
N
 
K
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
K
V
 
I
R
 
V
N
 
E
S
 
P
T
 
V
D
 
V
Q
 
D
L
 
I
H
 
-
N
 
-
I
 
M
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
S
R
 
F
D
 
A
I
 
L
L
 
M
S
 
E
Q
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
G
P
 
K
T
 
K
I
 
I
E
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
K
W
 
F
F
 
F
R
 
G
L
 
F
T
 
D
V
 
Y
A
 
F
R
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
F
R
 
E
G
 
G
T
 
T
S
 
K
V
 
H
V
 
L
I
 
I
S
 
A
R
 
R
T
 
S
G
 
G
Y
x
W
S
 
S
G
 
K
E
 
Q
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
F
 
Y
C
 
V
-
 
E
H
 
N
P
 
T
K
 
Q
D
 
S
A
 
G
V
 
Q
E
 
K
I
 
L
F
 
Y
D
 
D
R
 
H
V
 
L
W
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
D
 
E
Y
 
F
G
 
N
I
 
V
A
 
G
P
 
P
L
 
-
G
 
G
L
 
C
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
-
M
 
I
L
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
S
G
 
A
L
 
L
I
 
L
F
x
S
A
 
Y
G
 
G
S
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
D
D
 
N
Q
 
N
T
 
D
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
C
G
 
G
V
 
F
G
 
D
F
 
Q
T
 
Y
V
 
V
P
 
S
L
 
L
K
 
D
S
 
S
K
 
D
T
 
I
D
 
-
N
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
K
I
 
L
E
 
K
E
 
E
R
 
I
K
 
K
A
 
L
H
 
K
-
 
G
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
G
V
 
V
G
 
K
F
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
K
G
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
L
P
 
T
S
 
G
P
 
S
G
 
K
D
 
N
C
 
I
V
 
Y
R
 
D
I
 
E
G
 
N
K
 
N
A
 
N
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
T
 
R
S
 
S
A
 
A
M
 
C
K
 
Y
S
 
S
P
 
P
I
 
H
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
M
V
 
I
A
 
K
S
 
K
T
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
E
A
 
A
L
 
S
E
 
Q
G
 
G
H
 
F
D
 
K
I
 
I
E
 
Q
I
 
I

Q4FP21 Dimethylsulfonioproprionate demethylase DmdA; EC 2.1.1.269 from Pelagibacter ubique (strain HTCC1062) (see paper)
29% identity, 42% coverage: 427:758/799 of query aligns to 32:354/369 of Q4FP21

query
sites
Q4FP21
Y
 
Y
N
 
N
G
 
H
Y
 
M
W
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
A
T
 
A
M
 
F
T
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
A
 
E
E
 
D
-
 
S
Y
 
Y
W
 
K
A
 
H
C
 
L
R
 
K
D
 
E
K
 
H
V
 
V
A
 
Q
V
 
I
M
 
W
D
 
D
L
 
V
S
 
A
P
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
Q
Y
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
S
G
 
G
P
 
K
D
 
D
A
 
S
E
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
V
Q
 
Q
L
 
L
C
 
M
V
 
T
T
 
C
R
 
R
N
 
D
M
 
L
K
 
S
K
 
K
L
 
S
S
 
K
V
 
I
G
 
G
Q
 
R
V
 
C
V
 
Y
Y
 
Y
T
 
C
A
 
P
M
 
I
C
 
I
Y
 
D
E
 
E
H
 
N
G
 
G
G
 
N
M
 
L
I
 
V
D
 
N
D
 
D
G
 
P
T
 
V
I
 
V
Y
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
D
E
 
E
T
 
N
N
 
K
F
 
W
R
 
-
W
 
W
I
 
I
G
x
S
G
 
I
N
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
D
G
 
V
L
 
I
W
 
F
L
 
F
Q
 
A
E
 
K
-
 
G
Q
 
L
A
 
A
R
 
S
K
 
G
H
 
H
N
 
K
M
 
F
N
 
D
V
 
V
W
 
K
V
 
I
R
 
V
N
 
E
S
 
P
T
 
V
D
 
V
Q
 
D
L
 
I
H
 
-
N
 
-
I
 
M
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
R
 
P
Y
 
K
S
 
S
R
 
F
D
 
A
I
 
L
L
 
M
S
 
E
Q
 
K
I
 
V
F
 
F
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
Q
 
G
P
 
K
T
 
K
I
 
I
E
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
K
W
 
F
F
 
F
R
 
G
L
 
F
T
 
D
V
 
Y
A
 
F
R
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
V
 
F
R
 
E
G
 
G
T
 
T
S
 
K
V
 
H
V
 
L
I
 
I
S
 
A
R
 
R
T
 
S
G
 
G
Y
 
W
S
 
S
G
 
K
E
 
Q
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
E
|
E
I
 
V
F
x
Y
C
 
V
-
 
E
H
 
N
P
 
T
K
 
Q
D
 
S
A
 
G
V
 
Q
E
 
K
I
 
L
F
 
Y
D
 
D
R
 
H
V
 
L
W
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
Q
 
K
D
 
E
Y
 
F
G
 
N
I
 
V
A
 
G
P
 
P
L
 
-
G
 
G
L
 
C
A
 
P
A
 
N
L
 
L
D
 
-
M
 
I
L
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
S
G
 
A
L
 
L
I
 
L
F
 
S
A
 
Y
G
 
G
S
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
D
D
 
N
Q
 
N
T
 
D
D
 
N
P
 
P
F
 
F
E
 
E
A
 
C
G
 
G
V
 
F
G
 
D
F
 
Q
T
 
Y
V
 
V
P
 
S
L
 
L
K
 
D
S
 
S
K
 
D
T
 
I
D
 
-
N
 
N
F
 
F
I
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
E
A
 
K
I
 
L
E
 
K
E
 
E
R
 
I
K
 
K
A
 
L
H
 
K
-
 
G
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
K
 
K
L
 
L
-
 
R
-
 
G
V
 
V
G
 
K
F
 
I
D
 
D
I
 
I
E
 
K
G
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
L
P
 
T
S
 
G
P
 
S
G
 
K
D
 
N
C
 
I
V
 
Y
R
 
D
I
 
E
G
 
N
K
 
N
A
 
N
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
T
 
R
S
 
S
A
 
A
M
 
C
K
 
Y
S
 
S
P
 
P
I
 
H
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
M
V
 
I
A
 
K
S
 
K
T
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
E
A
 
A
L
 
S
E
 
Q
G
 
G
H
 
F
D
 
K
I
 
I
E
 
Q
I
 
I

Q63342 Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial; ME2GLYDH; EC 1.5.8.4 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
28% identity, 43% coverage: 443:786/799 of query aligns to 513:851/857 of Q63342

query
sites
Q63342
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
W
 
K
A
 
Q
C
 
V
R
 
M
D
 
Q
K
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
L
 
F
R
 
G
K
 
K
Y
 
F
E
 
N
V
 
I
V
 
K
G
 
G
P
 
Q
D
 
D
A
 
S
E
 
T
E
 
Q
L
 
L
M
 
L
-
 
D
Q
 
H
L
 
L
C
 
C
V
 
A
T
 
N
R
 
V
N
 
I
M
 
P
K
 
K
K
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
V
G
 
G
Q
 
F
V
 
T
V
 
N
Y
 
I
T
 
S
A
 
H
M
 
M
C
 
L
Y
 
T
E
 
P
H
 
R
G
 
G
G
 
R
M
 
V
I
 
Y
D
 
A
D
x
E
G
x
L
T
|
T
I
 
V
Y
 
S
R
 
H
L
 
Q
G
 
S
E
 
P
T
 
G
N
 
E
F
 
F
R
 
L
W
 
L
I
 
I
G
 
T
G
 
G
N
 
S
D
 
G
T
 
S
S
 
E
G
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
L
L
 
R
W
 
W
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
K
 
R
H
 
G
N
 
G
M
 
Y
N
 
D
V
 
V
W
 
E
V
 
I
R
 
R
N
 
N
S
 
I
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
H
 
G
N
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
R
 
P
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
D
 
R
I
 
V
L
 
L
S
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
Q
Q
 
K
P
 
L
T
 
T
I
 
S
E
 
E
E
 
D
L
 
L
P
 
S
-
 
D
-
 
D
W
 
V
F
 
F
R
 
K
L
 
F
T
 
L
V
 
Q
A
 
T
R
 
K
V
 
S
G
 
L
D
 
K
V
 
I
R
 
S
G
 
D
T
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
T
I
 
A
S
 
I
R
 
R
T
 
I
G
 
S
Y
|
Y
S
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
E
|
E
I
x
L
F
x
Y
C
 
H
H
 
R
P
 
R
K
 
E
D
 
D
A
 
S
V
 
A
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
D
 
E
R
 
R
V
 
I
W
 
M
E
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
Y
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
D
P
 
N
L
 
F
G
 
G
L
 
T
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
N
M
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
A
L
 
F
I
 
R
F
 
A
A
 
W
G
 
G
S
 
S
E
 
E
F
 
M
D
 
N
D
 
C
Q
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
D
F
x
Y
T
 
F
V
 
I
P
 
K
L
 
L
K
 
N
S
 
K
K
 
P
T
 
A
D
 
D
N
 
-
F
 
F
I
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
Q
R
 
I
K
 
K
A
 
A
H
 
K
P
 
G
-
 
L
H
 
K
R
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
C
F
 
L
D
 
T
I
 
L
E
 
A
G
 
T
G
 
D
T
 
D
V
 
V
-
 
D
P
 
P
S
 
E
P
 
G
G
 
N
D
 
E
C
 
S
V
 
V
R
 
W
I
 
Y
G
 
K
K
 
G
A
 
K
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
N
I
 
T
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
S
K
 
Y
S
 
S
P
 
Y
I
 
S
L
 
I
G
 
Q
K
 
K
V
 
S
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
A
R
 
Y
V
 
V
A
 
P
S
 
V
T
 
E
H
 
L
A
 
S
L
 
E
E
 
V
G
 
G
H
 
Q
D
 
Q
I
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
E
Q
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
K
R
 
N
L
 
Y
K
 
P
A
 
A
K
 
T
I
 
I
V
 
I
-
 
Q
-
 
E
P
 
P
F
 
L
P
 
V
H
 
L
F
 
T
D
 
E
P
 
P
A
 
T
K
 
R
E
 
T
R
 
R
V
 
L
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

4pabB Crystal structure of the precursor form of rat dmgdh complexed with tetrahydrofolate (see paper)
27% identity, 43% coverage: 443:786/799 of query aligns to 476:814/824 of 4pabB

query
sites
4pabB
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
W
 
K
A
 
Q
C
 
V
R
 
M
D
 
Q
K
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
L
 
F
R
 
G
K
 
K
Y
 
F
E
 
N
V
 
I
V
 
K
G
 
G
P
 
Q
D
 
D
A
 
S
E
 
T
E
 
Q
L
 
L
M
 
L
-
 
D
Q
 
H
L
 
L
C
 
C
V
 
A
T
 
N
R