SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010442843.1 NCBI__GCF_000192475.1:WP_010442843.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P11653 Methylmalonyl-CoA mutase large subunit; MCM-alpha; EC 5.4.99.2 from Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (see 4 papers)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 82:707/728 of P11653

query
sites
P11653
R
|
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
I
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
V
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
 
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
 
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
 
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
 
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
 
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6reqA Methylmalonyl-coa mutase, 3-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 81:706/727 of 6reqA

query
sites
6reqA
R
|
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
I
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
V
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
x
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
|
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4reqA Methylmalonyl-coa mutase substrate complex (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 80:705/726 of 4reqA

query
sites
4reqA
R
|
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
I
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
|
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
|
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
x
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7reqA Methylmalonyl-coa mutase, 2-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 79:704/725 of 7reqA

query
sites
7reqA
R
|
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
I
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3reqA Methylmalonyl-coa mutase, substrate-free state (poor quality structure) (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 79:704/725 of 3reqA

query
sites
3reqA
R
 
R
P
 
P
W
 
W
L
 
T
I
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
 
R
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
 
E
A
|
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
|
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
|
P

Sites not aligning to the query:

2reqA Methylmalonyl-coa mutase, non-productive coa complex, in open conformation representing substrate-free state (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:631/655 of query aligns to 79:704/725 of 2reqA

query
sites
2reqA
R
|
R
P
 
P
W
 
W
L
 
T
I
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
A
Q
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
Q
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
-
 
G
R
 
E
V
 
S
P
 
V
A
 
G
E
 
L
D
 
N
F
 
V
P
 
D
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
 
R
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
V
 
R
D
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
V
Q
 
H
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
E
 
K
D
 
N
P
 
P
K
|
K
F
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
 
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
 
E
A
|
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
V
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
N
 
S
P
 
A
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
A
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
N
 
E
L
 
V
D
 
E
S
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
K
S
 
A
I
 
I
E
 
E
-
 
K
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
M
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
V
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
G
 
E
E
 
H
A
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
D
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
D
D
 
N
P
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
V
D
 
K
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
P
A
 
E
A
 
K
V
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
E
 
D
E
 
A
M
 
L
R
 
E
K
 
K
A
 
V
Y
 
F
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
G
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
Y
G
 
S
S
 
K
V
 
E
S
 
V
N
 
K
K
 
N
T
 
T
E
 
P
G
 
E
L
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
D
 
Q
R
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
F
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
T
V
 
A
S
 
R
A
 
Q
V
 
A
Q
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
D
A
 
V
H
 
H
V
 
V
I
 
V
G
|
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
x
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
P
D
 
A
V
 
L
M
 
R
T
 
K
R
 
E
L
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
I
 
T
V
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6oxdA Structure of mycobacterium tuberculosis methylmalonyl-coa mutase with adenosyl cobalamin (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:631/655 of query aligns to 92:713/736 of 6oxdA

query
sites
6oxdA
D
 
N
R
x
Q
P
 
P
W
 
W
L
x
T
I
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
A
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
T
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
D
S
 
S
N
 
N
A
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
T
 
P
L
 
R
A
 
V
R
 
Q
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
I
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
L
D
 
D
M
 
M
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
P
 
D
L
 
L
E
 
S
Q
 
T
M
 
V
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
T
 
A
A
 
V
P
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
V
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
A
V
 
P
S
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
L
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
 
Y
P
 
P
P
 
P
K
 
K
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
M
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
I
A
 
F
E
 
A
Y
 
Y
C
 
T
Y
 
S
E
 
A
N
 
K
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
Y
L
 
I
R
 
R
P
 
A
R
 
G
V
 
L
P
 
N
A
 
A
E
 
G
-
 
L
D
 
D
F
 
I
P
 
D
A
 
S
L
 
F
C
 
A
G
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
M
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
G
V
 
R
D
 
L
L
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
V
Q
 
A
R
 
-
R
 
Q
Y
 
F
G
 
A
V
 
P
E
 
K
D
 
S
P
 
A
K
 
K
F
 
S
R
 
L
R
 
S
F
 
L
R
|
R
Y
x
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
F
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
A
R
 
R
I
 
T
L
 
C
I
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
T
 
T
L
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
L
G
x
A
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
M
 
R
R
 
N
M
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
Y
 
P
G
 
I
D
 
D
L
 
P
F
 
W
D
 
G
G
 
G
N
 
S
P
 
Y
V
 
Y
V
 
V
D
 
E
A
 
W
K
 
L
V
 
T
E
 
H
E
 
R
L
 
L
K
 
A
N
 
R
G
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
H
L
 
I
A
 
A
N
 
E
L
 
V
D
 
A
S
 
E
M
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
A
 
Q
S
 
A
I
 
I
E
 
S
-
 
D
-
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
S
 
L
R
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
T
L
 
Q
N
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
D
R
 
S
N
 
G
E
 
Q
T
 
Q
V
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
Q
E
 
V
G
 
P
E
 
E
A
 
D
S
 
H
P
 
E
L
 
I
Q
 
E
T
 
V
E
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
K
V
 
V
V
 
E
D
 
N
P
 
S
A
 
R
V
 
V
E
 
R
Q
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
G
 
A
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
D
 
R
W
 
L
R
 
R
T
 
A
V
 
G
R
 
R
D
 
D
N
 
E
A
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
R
A
 
A
A