SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010875691.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010875691.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3aiiA Archaeal non-discriminating glutamyl-tRNA synthetase from methanothermobacter thermautotrophicus (see paper)
97% identity, 84% coverage: 87:553/553 of query aligns to 1:455/455 of 3aiiA

query
sites
3aiiA
L
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
P
 
P
N
|
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
N
H
 
H
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
L
 
L
R
 
R
I
 
I
E
 
E
D
 
D
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
I
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
W
 
W
D
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
R
 
R
M
 
M
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
|
C
T
 
T
C
|
C
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
F
R
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
|
C
H
 
H
C
|
C
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
R
 
R
E
 
E
M
 
M
F
 
F
E
 
E
M
 
M
K
 
K
E
 
E
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
V
K
 
K
T
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
S
 
S
M
 
M
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
M
 
M
N
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
A
N
 
N
R
 
R
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
L
 
L
G
 
G
W
 
W
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
E
F
 
F
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
L
 
L
K
 
K
M
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
T
|
T
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
K
 
K
L
 
L
M
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
S
T
 
T
M
 
M
S
 
S
W
 
W
K
 
K
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
N
R
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
E
I
 
I
G
 
G
N
 
N
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
M
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
I
M
 
M
P
 
P
D
 
D
A
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
K
 
K

4h3sA The structure of glutaminyl-tRNA synthetase from saccharomyces cerevisiae (see paper)
31% identity, 74% coverage: 95:502/553 of query aligns to 36:472/585 of 4h3sA

query
sites
4h3sA
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
R
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
I
I
 
M
L
 
V
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
K
 
Y
Y
 
H
D
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
C
I
 
Y
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
K
V
 
E
D
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
Y
Y
 
F
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
R
D
 
M
L
 
V
E
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
K
W
 
P
D
 
W
E
 
K
T
 
I
V
 
T
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
E
Y
 
L
Y
 
Y
E
 
R
Y
 
L
T
 
A
E
 
E
K
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
K
R
 
N
G
 
G
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
|
C
T
 
H
C
|
C
R
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
F
 
I
R
 
K
E
 
R
L
 
G
K
 
R
N
 
G
R
 
I
G
 
G
E
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
A
 
A
C
|
C
H
 
K
C
x
H
R
 
R
S
 
D
L
 
Q
G
 
S
F
 
I
R
 
E
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
F
R
 
R
E
 
D
M
 
M
F
 
R
E
 
D
-
 
G
-
 
K
M
 
Y
K
 
K
E
 
P
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
M
K
 
K
T
 
Q
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
S
P
 
P
N
 
S
P
 
P
A
 
Q
I
 
M
R
 
W
D
 
D
W
 
L
V
 
I
S
 
A
M
 
Y
R
 
R
I
 
V
V
 
L
E
 
N
A
 
A
E
 
P
H
 
H
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
K
Y
 
W
R
 
R
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
V
D
 
D
H
 
S
L
 
M
L
 
E
G
 
N
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
 
T
K
 
T
D
 
E
H
 
F
L
 
Y
A
 
L
N
 
S
R
 
R
E
 
E
K
 
S
Q
 
Y
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
Y
 
C
R
 
D
H
 
Q
L
 
V
G
 
H
W
 
V
E
 
F
P
 
R
P
 
P
E
 
A
F
 
Q
I
 
R
H
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
L
 
L
K
 
N
M
 
I
D
 
T
D
 
G
V
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
I
R
 
A
E
 
Q
G
 
L
I
 
V
L
 
D
R
 
E
G
 
K
E
 
F
Y
 
V
S
 
R
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
P
P
 
P
E
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
L
K
 
S
L
 
F
M
 
I
V
 
N
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
T
I
 
T
A
 
S
D
 
T
S
 
T
T
 
N
M
 
I
S
 
Q
W
 
V
K
 
V
K
 
R
I
 
F
Y
 
E
G
 
S
L
 
A
N
 
V
R
 
R
S
 
K
I
 
Y
L
 
L
E
 
E
E
 
D
E
 
T
A
 
T
R
 
P
R
 
R
Y
 
L
F
 
M
F
 
F
A
 
V
A
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
V
E
 
V
V
 
V
V
 
D
G
 
N
L
 
L
P
 
S
G
 
D
P
 
D
V
 
Y
R
 
E
-
 
E
-
 
L
V
 
A
E
 
T
R
 
I
P
 
P
L
 
Y
H
 
R
P
 
P
D
 
G
H
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
F
G
 
G
N
 
E
R
 
R
V
 
T
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
T
G
 
N
E
 
K
V
 
F
Y
 
Y
L
 
I
P
 
E
G
 
R
D
 
S
D
 
D
L
 
F
G
 
S
E
 
E
G
 
N
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
F
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
P
 
P
L
 
V
R
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
V
V
 
S
N
 
H
V
 
T
I
 
V
Y
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
K
E
 
I
L
 
I
R
 
R
Y
 
I
H
 
H
S
 
V
E
 
N
G
 
-
I
 
-
E
 
Y
E
 
D
A
 
N
R
 
K
E
 
K
L
 
K
G
 
P
A
 
K
S
 
T
M
 
Y
I
 
I
H
 
Q
W
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
I
E
 
S
S
 
S
A
 
K
L
 
Y
E
 
N
A
 
S

Q8CGC7 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
34% identity, 66% coverage: 89:452/553 of query aligns to 189:556/1512 of Q8CGC7

query
sites
Q8CGC7
E
 
E
L
 
L
A
 
P
G
 
G
V
 
A
K
 
E
-
 
M
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
N
 
N
H
 
Q
E
 
H
Y
 
Y
A
 
Q
R
 
V
K
 
N
Y
 
F
D
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
M
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
K
V
 
E
D
 
K
P
 
E
E
 
D
A
 
F
Y
 
E
D
 
K
M
 
V
I
 
I
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
A
W
 
M
L
 
L
G
 
H
V
 
I
E
 
K
W
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
F
V
 
T
I
 
Y
Q
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
H
M
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
I
Y
 
M
E
 
K
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
R
 
E
G
 
G
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
F
 
M
R
 
K
-
 
A
E
 
E
L
 
R
K
 
E
N
 
Q
R
 
R
G
 
T
E
 
E
A
 
S
C
 
K
H
 
H
C
 
-
R
 
R
S
 
K
L
 
N
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
M
W
 
W
R
 
E
E
 
E
M
 
M
F
 
K
E
 
K
M
 
G
K
 
S
E
 
Q
-
 
F
-
 
G
G
 
Q
S
 
S
A
 
C
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
S
H
 
S
P
 
N
N
 
N
P
 
G
A
 
C
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
T
S
 
L
M
 
Y
R
 
R
I
 
C
V
 
K
E
 
I
A
 
Q
E
 
P
H
 
H
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
Y
R
 
N
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
C
A
 
P
V
 
I
D
 
V
D
 
D
H
 
S
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
T
D
 
E
H
 
Y
L
 
H
A
 
D
N
 
R
R
 
D
E
 
E
K
 
Q
Q
 
F
E
 
Y
Y
 
W
L
 
I
Y
 
I
R
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
I
E
 
R
P
 
K
P
 
P
E
 
Y
F
 
I
I
 
W
H
 
E
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
N
M
 
L
D
 
N
D
 
N
V
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
T
E
 
W
G
 
F
I
 
V
L
 
N
R
 
E
G
 
G
E
 
L
Y
 
V
S
 
D
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
V
R
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
L
 
F
M
 
I
V
 
A
E
 
A
I
 
Q
G
 
G
V
 
S
K
 
S
I
 
R
A
 
S
D
 
V
S
 
V
T
 
N
M
 
M
S
 
E
W
 
W
K
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
W
G
 
A
L
 
F
N
 
N
R
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
V
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
F
 
V
F
 
A
A
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
L
K
 
K
L
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
R
 
N
V
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
K
E
 
E
R
 
V
P
 
A
L
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
D
I
 
V
G
 
G
N
 
L
R
 
K
V
 
P
L
 
V
E
 
W
L
 
Y
R
 
S
G
 
P
E
 
K
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
A
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P07814 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; Cell proliferation-inducing gene 32 protein; Glutamatyl-prolyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Homo sapiens (Human) (see 13 papers)
34% identity, 68% coverage: 78:452/553 of query aligns to 179:556/1512 of P07814

query
sites
P07814
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Q
 
Q
K
 
D
K
 
V
R
 
G
K
 
K
G
 
F
L
 
V
R
 
-
E
 
E
L
 
L
A
 
P
G
 
G
V
 
A
K
 
E
-
 
M
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
N
 
N
H
 
Q
E
 
H
Y
 
Y
A
 
Q
R
 
V
K
 
N
Y
 
F
D
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
M
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
K
V
 
E
D
 
K
P
 
E
E
 
D
A
 
F
Y
 
E
D
 
K
M
 
V
I
 
I
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
A
W
 
M
L
 
L
G
 
H
V
 
I
E
 
K
W
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
F
V
 
T
I
 
Y
Q
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
H
M
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
I
Y
 
M
E
 
K
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
R
 
E
G
 
G
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
P
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
F
 
M
R
x
K
-
 
A
E
 
E
L
 
R
K
 
E
N
 
Q
R
 
R
G
 
I
E
x
D
A
 
S
C
 
K
H
 
H
C
 
-
R
 
R
S
 
K
L
 
N
G
 
P
F
 
I
R
 
E
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
M
W
 
W
R
 
E
E
 
E
M
 
M
F
 
K
E
 
K
M
 
G
K
 
S
E
 
Q
-
 
F
-
 
G
G
x
Q
S
 
S
A
 
C
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
S
H
 
S
P
 
N
N
 
N
P
 
G
A
 
C
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
T
S
 
L
M
 
Y
R
 
R
I
 
C
V
 
K
E
 
I
A
 
Q
E
 
P
H
 
H
P
 
P
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
Y
R
 
N
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
C
A
 
P
V
 
I
D
 
V
D
 
D
H
 
S
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
T
D
 
E
H
 
Y
L
 
H
A
 
D
N
 
R
R
 
D
E
 
E
K
 
Q
Q
 
F
E
 
Y
Y
 
W
L
 
I
Y
 
I
R
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
I
E
 
R
P
 
K
P
 
P
E
 
Y
F
 
I
I
 
W
H
 
E
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
N
M
 
L
D
 
N
D
 
N
V
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
T
E
 
W
G
 
F
I
 
V
L
 
N
R
 
E
G
 
G
E
 
L
Y
 
V
S
 
D
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
V
R
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
L
 
F
M
 
I
V
 
A
E
 
A
I
 
Q
G
 
G
V
 
S
K
 
S
I
 
R
A
 
S
D
 
V
S
 
V
T
 
N
M
 
M
S
 
E
W
 
W
K
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
W
G
 
A
L
 
F
N
 
N
R
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
V
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
F
 
V
F
 
A
A
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
L
K
 
K
L
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
I
G
 
P
L
 
V
P
 
N
G
 
V
P
 
P
V
 
E
R
 
A
V
 
Q
E
 
E
R
 
E
-
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
V
P
 
A
L
 
K
H
 
H
P
 
P
D
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
L
R
 
K
V
 
P
L
 
V
E
 
W
L
 
Y
R
 
S
G
 
P
E
 
K
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
P
 
E
G
 
G
D
 
A
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P28668 Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase; Bifunctional aminoacyl-tRNA synthetase; EC 6.1.1.17; EC 6.1.1.15 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
33% identity, 75% coverage: 32:448/553 of query aligns to 149:558/1714 of P28668

query
sites
P28668
V
 
L
M
 
I
S
 
T
N
 
A
E
 
Q
P
 
P
E
 
L
L
 
I
R
 
Q
K
 
K
M
 
V
A
 
L
P
 
Q
Q
 
S
V
 
L
K
 
P
E
 
E
A
 
-
V
 
-
E
 
D
A
 
A
A
 
K
V
 
V
E
x
K
R
|
R
V
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
S
|
S
P
|
P
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
Q
x
S
E
x
S
M
x
K
E
|
E
R
x
Q
L
x
T
G
x
P
L
x
A
E
x
K
I
x
T
T
x
G
E
|
E
R
|
R
K
|
K
Q
|
Q
K
x
E
K
x
G
R
x
K
K
 
-
G
 
-
L
x
F
R
x
V
E
x
D
L
|
L
A
x
P
G
|
G
V
x
A
K
x
E
-
x
M
G
|
G
E
x
K
V
|
V
V
|
V
L
x
V
R
|
R
F
|
F
A
x
P
P
|
P
N
x
E
P
x
A
S
|
S
G
|
G
P
x
Y
L
|
L
H
|
H
I
|
I
G
|
G
H
|
H
A
|
A
R
x
K
A
|
A
A
|
A
I
x
L
L
|
L
N
|
N
H
x
Q
E
x
Y
Y
|
Y
A
|
A
R
x
L
K
x
A
Y
x
F
D
x
Q
G
|
G
R
x
T
L
|
L
I
|
I
L
x
M
R
|
R
I
x
F
E
x
D
D
|
D
T
|
T
D
x
N
P
|
P
R
x
A
R
x
K
V
x
E
D
x
T
P
x
V
E
|
E
A
x
F
Y
x
E
D
x
N
M
x
V
I
|
I
P
x
L
A
x
G
D
|
D
L
|
L
E
|
E
W
x
Q
L
|
L
G
x
Q
V
x
I
E
x
K
W
x
P
D
|
D
E
x
V
T
x
F
V
x
T
I
x
H
Q
x
T
S
|
S
D
x
N
R
x
Y
M
x
F
E
x
D
T
x
L
Y
x
M
Y
x
L
E
x
D
Y
|
Y
T
x
C
E
x
V
K
x
R
L
|
L
I
|
I
E
x
K
R
x
E
G
x
S
G
x
K
A
|
A
Y
|
Y
V
|
V
C
x
D
T
x
D
C
x
T
R
x
P
P
|
P
E
|
E
E
x
Q
F
x
M
R
x
K
-
x
L
E
|
E
L
x
R
K
x
E
N
x
Q
R
|
R
G
x
V
E
|
E
A
x
S
C
x
A
H
x
N
C
 
-
R
|
R
S
|
S
L
x
N
G
x
S
F
x
V
R
x
E
E
x
K
N
|
N
L
|
L
Q
x
S
R
x
L
W
|
W
R
x
E
E
|
E
M
|
M
F
x
V
E
x
K
M
x
G
K
x
S
E
|
E
G
x
K
S
x
G
A
x
Q
-
x
K
-
x
Y
V
x
C
V
|
V
R
|
R
V
x
A
K
|
K
T
x
I
D
|
D
L
x
M
N
x
S
H
x
S
P
|
P
N
|
N
P
x
G
A
x
C
I
x
M
R
|
R
D
|
D
W
x
P
V
x
T
S
x
I
M
x
Y
R
|
R
I
x
C
V
x
K
E
x
N
A
x
E
E
x
P
H
|
H
P
|
P
R
|
R
T
|
T
G
|
G
T
|
T
R
x
K
Y
|
Y
R
x
K
V
|
V
Y
|
Y
P
|
P
M
x
T
M
x
Y
N
x
D
F
|
F
S
x
A
V
x
C
A
x
P
V
x
I
D
x
V
D
|
D
H
x
A
L
x
I
L
x
E
G
x
N
V
|
V
T
|
T
H
|
H
V
x
T
L
|
L
R
|
R
G
x
T
K
x
T
D
x
E
H
x
Y
L
 
-
A
x
H
N
x
D
R
|
R
E
x
D
K
x
D
Q
|
Q
E
x
F
Y
|
Y
L
x
W
Y
x
F
-
x
I
R
x
D
H
x
A
L
|
L
G
x
K
W
x
L
E
x
R
P
x
K
P
|
P
E
x
Y
F
x
I
I
x
W
H
x
S
Y
|
Y
G
x
S
R
|
R
L
|
L
K
x
N
M
|
M
D
x
T
D
x
N
V
x
T
A
x
V
L
|
L
S
|
S
T
x
K
S
x
R
G
x
K
A
x
L
R
x
T
E
x
W
G
x
F
I
x
V
L
x
D
R
x
S
G
|
G
E
x
L
Y
x
V
S
x
D
G
|
G
W
|
W
D
|
D
D
|
D
P
|
P
R
|
R
L
x
F
G
x
P
T
|
T
L
x
V
R
|
R
A
x
G
I
|
I
A
x
I
R
|
R
R
|
R
G
|
G
I
x
M
R
x
T
P
x
V
E
|
E
A
x
G
I
x
L
R
x
K
K
x
E
L
x
F
M
x
I
V
x
I
E
x
A
I
x
Q
G
|
G
V
x
S
K
x
S
I
x
K
A
x
S
D
x
V
S
x
V
T
x
F
M
|
M
S
x
N
W
|
W
K
x
D
K
|
K
I
|
I
Y
x
W
G
x
A
L
x
F
N
|
N
R
x
K
S
x
K
I
x
V
L
x
I
E
x
D
E
x
P
E
x
I
A
|
A
R
x
P
R
|
R
Y
|
Y
F
 
-
F
x
T
A
|
A
A
x
L
D
x
E
P
x
K
V
x
E
K
|
K
L
x
R
E
x
V
V
x
I
V
|
V
G
x
N
L
x
V
P
x
A
G
|
G
P
x
A
V
x
K
-
x
V
-
x
E
R
|
R
V
x
I
E
x
Q
R
x
V
P
x
S
L
x
V
H
|
H
P
|
P
D
x
K
H
x
D
P
x
E
E
x
S
I
x
L
G
|
G
N
x
K
R
x
K
V
x
T
L
x
V
E
x
L
L
|
L
R
x
G
G
x
P
E
x
R
V
x
I
Y
|
Y
L
x
I

Sites not aligning to the query:

O13775 Probable glutamate--tRNA ligase, cytoplasmic; Glutamyl-tRNA synthetase; GluRS; EC 6.1.1.17 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
33% identity, 69% coverage: 69:452/553 of query aligns to 175:567/716 of O13775

query
sites
O13775
M
 
M
E
 
E
R
 
E
L
 
F
G
 
T
L
 
K
E
 
A
I
 
V
T
 
N
E
 
I
R
 
S
K
 
K
Q
 
K
K
 
Q
K
 
K
R
x
S
K
 
S
G
 
G
L
 
P
R
 
N
E
 
Y
L
 
E
A
 
I
G
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
A
V
 
I
K
 
D
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
N
 
N
H
 
Q
E
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
N
K
 
K
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
V
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
S
R
 
K
V
 
E
D
 
N
P
 
S
E
 
E
A
 
F
Y
 
Q
D
 
D
M
 
A
I
 
I
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
A
W
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
K
W
 
P
D
 
D
E
 
V
T
 
V
V
 
T
I
 
Y
Q
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
L
E
 
D
T
 
T
Y
 
I
Y
 
H
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
C
E
 
V
K
 
D
L
 
M
I
 
I
E
 
K
R
 
S
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
D
P
 
V
E
 
E
E
 
T
F
 
M
R
 
R
E
 
H
L
 
E
K
 
R
N
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
I
A
 
P
C
 
S
H
 
K
C
 
H
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
P
F
 
I
R
 
E
E
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
R
 
I
W
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
L
F
 
S
E
 
E
M
 
M
K
 
D
E
 
K
G
 
G
S
 
S
A
 
D
V
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
C
V
 
I
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
S
L
 
Y
N
 
E
H
 
N
P
 
P
N
 
N
P
 
K
A
 
A
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
I
M
 
Y
R
 
R
I
 
C
V
 
N
E
 
L
A
 
L
E
 
P
H
 
H
P
 
H
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
C
A
 
P
V
 
I
D
 
V
D
 
D
H
 
S
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
T
D
 
E
H
 
Y
L
 
R
A
 
D
N
 
R
R
 
N
E
 
P
K
 
L
Q
 
Y
E
 
Q
Y
 
W
L
 
M
Y
 
I
R
 
K
H
 
A
L
 
M
G
 
N
W
 
L
E
 
R
P
 
K
P
 
I
E
 
H
F
 
V
I
 
W
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
M
K
 
N
M
 
F
D
 
V
D
 
R
V
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
I
I
 
V
L
 
D
R
 
H
G
 
G
E
 
L
Y
 
V
S
 
W
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
V
R
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
T
P
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
Q
K
 
Q
L
 
Y
M
 
I
V
 
V
E
 
S
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
K
 
S
I
 
K
A
 
N
D
 
I
S
 
L
T
 
T
M
 
L
S
 
D
W
 
W
K
 
T
K
 
S
I
 
F
Y
 
W
G
 
A
L
 
T
N
 
N
R
 
K
S
 
K
I
 
I
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
V
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
H
F
 
T
F
 
A
-
 
V
-
 
E
A
 
S
A
 
G
D
 
D
P
 
V
V
 
V
K
 
K
L
 
A
E
 
T
V
 
I
V
 
V
G
 
N
L
 
G
P
 
P
-
 
A
G
 
A
P
 
P
V
 
Y
R
 
A
V
 
E
E
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
R
H
 
H
P
 
K
D
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
L
G
 
G
N
 
N
R
 
K
V
 
K
L
 
S
E
 
I
L
 
F
R
 
A
G
 
N
E
 
E
V
 
I
Y
 
L
L
 
I
P
 
E
G
 
Q
D
 
A
D
 
D

2re8A Glutaminyl-tRNA synthetase mutant c229r with bound analog 5'-o-[n-(l- glutamyl)-sulfamoyl]adenosine (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 2re8A

query
sites
2re8A
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
x
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
x
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
x
T
L
|
L
K
 
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
x
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
|
R
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
 
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
 
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
 
A
K
x
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
|
P
D
x
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
|
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1o0cA Crystal structure of l-glutamate and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 1o0cA

query
sites
1o0cA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
|
R
F
|
F
A
 
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
x
T
L
|
L
K
x
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
x
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
x
C
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
x
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
x
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
 
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
x
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
|
P
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
|
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1o0bA Crystal structure of l-glutamine and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 1o0bA

query
sites
1o0bA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
|
F
A
x
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
x
T
L
|
L
K
x
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
x
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
x
C
G
 
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
x
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
x
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
|
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
 
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
|
P
D
x
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
|
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1gtsA Structural basis for transfer RNA aminoaceylation by escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 1gtsA

query
sites
1gtsA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
 
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
 
T
L
|
L
K
 
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
x
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
 
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
 
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
x
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
 
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1exdA Crystal structure of a tight-binding glutamine tRNA bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 1exdA

query
sites
1exdA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
|
F
A
 
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
 
T
L
|
L
K
x
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
 
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
x
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
x
V
L
x
M
S
|
S
T
x
K
S
 
R
G
x
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
|
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
x
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
|
P
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1euqA Crystal structure of glutaminyl-tRNA synthetase complexed with a tRNA- gln mutant and an active-site inhibitor (see paper)
31% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 14:510/529 of 1euqA

query
sites
1euqA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
 
T
L
|
L
K
 
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
x
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
x
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
x
C
G
 
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
 
Q
A
 
D
N
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
 
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
 
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
 
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
x
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
x
N
A
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
Y
I
 
V
Y
 
I
S
 
K
G
 
A
G
 
E
E
 
R
L
 
V
R
 
E
Y
 
K
H
 
D
S
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
T
-
 
T
-
 
I
-
 
F
-
 
C
I
 
T
E
 
Y
E
 
D
A
 
A
R
 
D
E
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
S
 
-
M
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P00962 Glutamine--tRNA ligase; Glutaminyl-tRNA synthetase; GlnRS; EC 6.1.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
30% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 22:529/554 of P00962

query
sites
P00962
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
|
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
x
E
P
|
P
S
x
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
|
I
G
|
G
H
|
H
A
|
A
R
x
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
x
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
 
R
E
 
E
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
T
L
 
L
K
 
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
A
V
 
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
 
P
N
 
F
P
 
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
L
M
 
Y
R
 
R
I
 
I
V
 
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
x
C
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
 
F
L
 
Q
A
 
D
N
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
x
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
x
M
S
|
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
|
D
S
x
N
T
|
T
M
x
I
S
x
E
W
 
M
K
 
A
K
 
S
I
 
L
Y
 
E
G
 
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
 
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
Y
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
R
D
 
N
A
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
N
V
 
I
N
 
T
V
 
T
I
 
I
Y
 
F
S
 
C
G
 
T
G
 
Y
E
 
D
L
 
A
R
 
D
Y
 
T
H
 
L
S
 
S
E
 
K
G
 
D
I
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
G
R
 
R
E
 
K
L
 
V
G
 
K
A
 
G
S
 
-
M
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
R
 
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P46655 Glutamate--tRNA ligase, cytoplasmic; Glutamyl-tRNA synthetase; (c)ERS; GluRS; P85; EC 6.1.1.17 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
28% identity, 82% coverage: 95:549/553 of query aligns to 200:693/708 of P46655

query
sites
P46655
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
N
 
N
H
 
Q
E
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
Q
K
 
A
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
I
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
S
R
 
K
V
 
E
D
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
F
Y
 
Q
D
 
D
M
 
S
I
 
I
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
D
W
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
K
W
 
G
D
 
D
E
 
R
T
 
I
V
 
T
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
Q
T
 
E
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
D
Y
 
Y
T
 
C
E
 
V
K
 
Q
L
 
M
I
 
I
E
 
K
R
 
D
G
 
G
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
C
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
P
P
 
T
E
 
E
E
 
K
F
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
E
K
 
R
N
 
M
R
 
D
G
 
G
E
 
V
A
 
A
C
 
S
H
 
A
C
 
R
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
R
 
I
W
 
F
R
 
T
E
 
E
M
 
-
F
 
-
E
 
E
M
 
M
K
 
K
E
 
N
G
 
G
S
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
K
A
 
N
V
 
C
V
 
V
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
Y
N
 
K
H
 
A
P
 
L
N
 
N
P
 
K
A
 
T
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
I
M
 
Y
R
 
R
I
 
C
V
 
N
E
 
L
A
 
T
E
 
P
H
 
H
P
 
H
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
T
Y
 
W
R
 
K
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
C
V
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
V
D
 
D
H
 
A
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
I
D
 
E
H
 
Y
L
 
R
A
 
D
N
 
R
R
 
N
E
 
A
K
 
Q
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
M
Y
 
L
R
 
Q
H
 
A
L
 
L
G
 
R
W
 
L
E
 
R
P
 
K
P
 
V
E
 
H
F
 
I
I
 
W
H
 
D
Y
 
F
G
 
A
R
 
R
L
 
I
K
 
N
M
 
F
D
 
V
D
 
R
V
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
Q
E
 
W
G
 
M
I
 
V
L
 
D
R
 
K
G
 
D
E
 
L
Y
 
V
S
 
G
G
 
N
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
V
R
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
M
R
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
R
 
R
K
 
N
L
 
F
M
 
V
V
 
L
E
 
S
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
K
 
S
I
 
R
A
 
N
D
 
V
S
 
I
T
 
N
M
 
L
S
 
E
W
 
W
K
 
N
K
 
L
I
 
I
Y
 
W
G
 
A
L
 
F
N
 
N
R
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
I
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
H
F
 
T
F
 
A
A
 
I
A
 
V
D
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
I
E
 
H
V
 
L
V
 
E
G
 
G
L
 
S
P
 
E
G
 
A
P
 
P
V
 
Q
-
 
E
-
 
P
R
 
K
V
 
I
E
 
E
-
 
M
R
 
K
P
 
P
L
 
K
H
 
H
P
 
K
D
 
K
H
 
N
P
 
P
E
 
A
I
 
V
G
 
G
N
 
E
R
 
K
V
 
K
L
 
V
E
 
I
L
 
Y
R
 
Y
G
 
K
E
 
D
V
 
I
Y
 
V
L
 
V
P
 
D
G
 
K
D
 
D
D
 
D
L
 
A
G
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
V
E
 
D
G
 
E
P
 
E
L
 
V
R
 
T
L
 
L
I
 
M
D
 
D
A
 
W
V
 
G
N
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
I
S
 
T
G
 
K
-
 
K
-
 
N
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
M
-
 
V
G
 
A
E
 
K
L
 
L
R
 
N
Y
 
L
H
 
E
S
 
G
E
 
D
G
 
F
I
 
K
E
 
K
E
 
T
A
 
K
R
 
H
E
 
K
L
 
L
G
 
T
-
 
W
-
 
L
A
 
A
S
 
D
M
 
T
I
 
K
H
 
D
W
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
V
E
 
D
S
 
L
A
 
V
L
 
D
E
 
F
A
 
D
E
 
H
V
 
L
I
 
I
M
 
T
P
 
K
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
A
 
E
S
 
F
R
 
H
V
 
T
R
 
D
G
 
A
V
 
I
I
 
A
E
 
D
A
 
L
D
 
N
A
 
V
S
 
K
E
 
D
L
 
M
E
 
K
V
 
I
D
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
R
 
R
F
 
K
G
 
G
F
 
Y
A
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
D
S
 
A
A
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
D
G
 
G
P
 
K
G
 
P
M
 
Y
V
 
V
F
 
F
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

4jyzA Crystal structure of e. Coli glutaminyl-tRNA synthetase bound to atp and native tRNA(gln) containing the cmnm5s2u34 anticodon wobble base (see paper)
30% identity, 82% coverage: 91:541/553 of query aligns to 15:522/542 of 4jyzA

query
sites
4jyzA
A
 
S
G
 
G
V
 
K
K
 
H
G
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
H
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
x
S
A
 
I
I
 
C
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
|
T
D
x
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
E
D
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
Y
Y
 
V
D
 
E
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
R
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
H
E
 
A
Y
 
Y
T
 
A
E
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
R
 
K
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
E
C
 
L
R
 
T
P
|
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
I
R
|
R
E
 
E
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
x
T
L
|
L
K
 
T
N
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
K
A
 
N
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
D
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
K
M
 
M
F
 
R
E
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
F
K
 
E
E
 
E
G
|
G
S
 
K
A
 
A
V
x
C
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
M
N
 
A
H
 
S
P
|
P
N
x
F
P
x
I
A
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
|
V
S
 
L
M
 
Y
R
|
R
I
 
I
V
x
K
E
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
H
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
N
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
|
M
M
x
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
I
D
 
S
D
 
D
H
 
A
L
 
L
L
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
x
F
L
x
Q
A
x
D
N
 
N
R
 
R
E
x
R
K
 
L
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
L
R
 
D
H
 
N
L
 
I
G
 
T
W
 
I
E
 
P
-
 
V
P
 
H
P
 
P
E
 
R
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
N
M
 
L
D
 
E
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
L
x
M
S
 
S
T
x
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
N
E
 
L
G
 
L
I
 
V
L
 
T
R
 
D
G
 
K
E
 
H
Y
 
V
S
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
M
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
P
 
A
E
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
K
 
E
L
 
F
M
 
C
V
 
K
E
 
R
I
|
I
G
 
G
V
 
V
K
x
T
I
x
K
A
x
Q
D
|
D
S
x
N
T
|
T
M
 
I
S
x
E
W
 
M
K
x
A
K
x
S
I
 
L
Y
 
E
G
x
S
L
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
E
I
 
D
L
 
L
E
x
N
E
 
E
E
 
N
A
 
A
R
 
P
R
|
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
I
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
V
V
 
I
V
 
E
G
 
N
L
 
Y
P
 
Q
G
 
G
P
 
E
V
 
G
R
 
E
-
 
M
V
 
V
E
 
T
R
 
M
P
 
P
L
 
N
H
 
H
P
 
P
D
x
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
G
 
G
N
 
S
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
W
L
 
I
P
 
D
G
 
R
D
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
x
Q
-
 
Y
-
x
K
-
x
R
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
K
P
 
E
L
 
V
R
|
R
L
 
L
I
x
R
D
 
N
A
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
N
V
 
I
N
 
T
V
 
T
I
 
I
Y
 
F
S
 
C
G
 
T
G
 
Y
E
 
D
L
 
A
R
 
D
Y
 
T
H
 
L
S
|
S
E
x
K
G
 
D
I
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
G
R
 
R
E
 
K
L
 
V
G
 
K
A
 
G
S
 
-
M
x
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
A
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
V
 
V
I
 
I
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
S
S
 
L
R
 
V
V
 
I
R
 
K
-
 
Q
G
 
G
V
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
L
S
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
V
V
 
A
D
 
G
D
 
K
V
 
A
V
 
F
Q
|
Q
L
 
F
E
|
E
R
|
R
F
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8uk6A Candida albicans glutaminyl tRNA synthetase (gln4) in complex with n- pyrimidinyl-beta-thiophenylacrylamide (see paper)
31% identity, 66% coverage: 93:457/553 of query aligns to 35:407/573 of 8uk6A

query
sites
8uk6A
V
 
I
K
 
C
G
 
D
E
 
K
V
 
V
V
 
Y
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
x
F
L
 
L
H
|
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
I
I
 
M
L
 
V
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
K
 
F
Y
 
N
D
 
K
G
 
G
R
 
N
L
 
C
I
 
Y
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
A
V
 
E
D
 
E
P
 
E
E
 
V
A
 
Y
Y
 
F
D
 
N
M
 
S
I
 
I
P
 
K
A
 
E
D
 
M
L
 
V
E
 
S
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
W
 
P
D
 
W
E
 
K
T
 
I
V
 
T
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
E
Y
 
L
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
T
 
A
E
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
K
R
 
S
G
 
D
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
C
 
C
T
 
H
C
 
C
R
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
S
K
 
R
N
 
G
R
 
L
G
 
G
E
 
E
-
 
R
-
 
V
A
 
A
C
|
C
H
 
K
C
x
H
R
 
R
S
 
F
L
 
Q
G
 
T
F
 
V
R
 
E
E
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
W
 
F
R
 
E
E
 
N
M
 
M
F
 
K
E
 
N
M
 
G
K
 
K
E
 
Y
-
 
N
-
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
T
V
 
L
R
 
R
V
 
M
K
 
K
T
 
Q
D
 
D
L
 
L
N
 
N
H
 
S
P
 
P
N
 
S
P
 
P
A
 
Q
I
 
M
R
 
W
D
 
D
W
 
L
V
 
V
S
 
A
M
 
Y
R
 
R
I
 
V
V
 
L
E
 
N
A
 
T
E
 
P
H
 
H
P
 
H
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
D
R
 
K
Y
 
W
R
 
K
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
V
D
 
D
H
 
S
L
 
F
L
 
E
G
 
N
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
 
T
K
 
T
D
 
E
H
 
F
L
 
V
A
 
L
N
 
S
R
 
R
E
 
E
K
 
S
Q
 
Y
E
 
E
Y
 
W
L
 
L
Y
 
C
R
 
D
H
 
A
L
 
L
G
 
H
W
 
V
E
 
Y
P
 
R
P
 
P
E
 
A
F
 
Q
I
 
R
H
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
K
 
N
M
 
L
D
 
T
D
 
G
V
x
T
A
x
I
L
 
M
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
x
I
R
 
A
E
 
K
G
 
L
I
 
V
L
 
N
R
 
E
G
 
G
E
 
Y
Y
 
V
S
 
R
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
x
Y
T
|
T
L
 
L
R
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
P
P
 
P
E
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
L
K
 
S
L
 
F
M
 
I
V
 
N
E
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
T
I
 
T
A
 
S
D
 
T
S
 
T
T
 
N
M
 
I
S
 
Q
W
 
T
K
 
V
K
 
R
I
 
F
Y
 
E
G
 
S
L
 
A
N
 
V
R
 
R
S
 
N
I
 
Y
L
 
L
E
 
D
E
 
Q
E
 
T
A
 
T
R
 
P
R
 
R
Y
 
L
F
 
M
F
 
M
A
 
V
A
 
L
D
 
H
P
 
P
V
 
I
K
 
E
L
 
V
E
 
V
V
 
I
V
 
D
G
 
N
L
 
L
-
 
D
-
 
E
P
 
S
G
 
F
P
 
S
V
 
L
R
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
I
P
 
P
L
 
Y
H
 
K
P
 
P
-
 
G
-
 
K
D
 
D
H
 
E
P
 
K
E
 
S
I
 
M
G
 
G
N
 
Y
R
 
R
V
 
K
L
 
L
E
 
T
L
 
F
R
 
S
G
 
K
E
 
H
V
 
I
Y
 
Y
L
 
I
P
 
D
G
 
E
D
 
N
D
 
D
L
 
V
G
 
R
E
 
A
G
 
E
P
 
P

5zdkA Crystal structure analysis of ttqrs in complex with atp (see paper)
32% identity, 80% coverage: 92:536/553 of query aligns to 20:521/543 of 5zdkA

query
sites
5zdkA
G
 
G
V
 
K
K
 
Y
G
 
A
E
 
K
V
 
L
V
 
V
L
 
T
R
 
R
F
|
F
A
 
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
D
Y
 
Y
D
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
C
I
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
T
V
 
E
D
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
Y
Y
 
A
D
 
R
M
 
A
I
 
I
P
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
R
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
R
W
 
P
D
 
T
E
 
R
T
 
V
V
 
L
I
 
Y
Q
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
Q
Y
 
C
T
 
A
E
 
L
K
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
R
 
E
G
 
G
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
D
T
 
D
C
 
L
R
 
P
P
 
E
E
 
E
E
 
E
F
 
M
R
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
A
R
 
Q
G
 
G
E
 
K
A
 
P
C
 
S
H
 
P
C
 
Y
R
 
R
S
 
E
L
 
R
G
 
S
F
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
E
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
R
M
 
M
-
 
R
-
 
R
F
 
G
E
 
E
M
 
F
K
 
P
E
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
D
L
 
P
N
 
A
H
 
H
P
 
P
N
 
N
P
 
F
A
 
K
I
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
L
M
 
Y
R
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
H
A
 
A
E
 
P
H
 
H
P
 
Y
R
 
H
T
 
V
G
 
G
T
 
D
R
 
R
Y
 
W
R
 
V
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
H
A
 
P
V
 
L
D
 
E
D
 
D
H
 
F
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
x
T
K
 
L
D
 
E
H
 
F
L
 
E
A
 
N
N
 
N
R
 
R
E
 
T
K
 
V
Q
 
Y
E
 
D
Y
 
W
L
 
V
Y
 
I
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
K
W
 
G
E
 
K
P
 
C
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
R
P
 
P
E
 
H
F
 
Q
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
A
R
|
R
L
|
L
K
 
D
M
 
L
D
 
S
D
 
H
V
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
I
E
 
K
G
 
L
I
 
V
L
 
E
R
 
G
G
 
G
E
 
Y
Y
 
V
S
 
S
G
 
G
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
P
T
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
V
K
 
E
L
 
F
M
 
V
V
 
R
E
 
K
I
 
T
G
 
G
V
 
I
K
 
S
I
 
R
A
 
N
D
 
E
S
 
A
T
 
Q
M
 
I
S
 
E
W
 
M
K
 
D
K
 
L
I
 
F
Y
 
E
G
 
E
L
 
V
N
 
V
R
 
R
S
 
D
I
 
D
L
 
L
E
 
N
E
 
P
E
 
I
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
V
F
 
L
F
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
K
 
K
L
 
V
E
 
V
V
 
L
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
E
G
 
G
P
 
E
V
 
E
R
 
W
V
 
I
E
 
E
R
 
A
P
 
P
L
 
Y
H
x
W
P
|
P
-
 
R
D
 
D
H
x
I
P
 
P
E
 
K
I
x
E
G
 
G
N
 
T
R
 
R
V
 
P
L
 
L
E
 
P
L
 
F
R
 
S
G
 
P
E
 
E
V
 
L
Y
 
Y
L
 
I
P
 
E
G
 
R
D
 
T
D
 
D
L
 
F
G
 
S
E
 
L
G
 
N
P
 
P
L
 
P
R
 
K
-
 
G
-
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
L
 
V
I
 
I
D
 
E
A
 
L
V
 
E
N
 
D
V
 
V
I
 
V
Y
 
E
S
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
V
R
 
R
Y
 
L
H
 
L
S
 
K
E
 
A
G
 
R
I
 
I
E
 
V
E
 
P
A
 
G
R
 
-
E
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
P
-
 
K
-
 
G
M
 
V
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
R
S
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
P
A
 
V
E
 
E
V
 
F
-
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
I
 
L
M
 
N
P
 
P
D
 
E
A
 
A
S
 
L
R
 
V
V
 
V
-
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
F
I
 
I
E
 
E
A
 
P
D
 
S
A
 
V
S
 
A
E
 
Q
L
 
D
E
 
P
V
 
E
D
 
D
D
 
T
V
 
R
V
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
R
 
R
F
 
L
G
 
G
F
 
Y

7waoA Glutamyl-tRNA synthetase from plasmodium falciparum (pfers) in complex with mn (see paper)
31% identity, 62% coverage: 92:436/553 of query aligns to 5:355/502 of 7waoA

query
sites
7waoA
G
 
A
V
 
V
K
 
I
G
 
G
E
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
N
H
 
N
E
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
K
 
M
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
V
R
 
L
V
x
E
D
 
D
P
 
I
E
 
K
A
 
Y
Y
x
E
D
 
K
M
 
S
I
 
I
P
 
I
A
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
E
W
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
K
W
 
Y
D
 
E
E
 
K
T
 
I
V
 
S
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
H
M
 
F
E
 
D
T
 
L
Y
 
L
Y
 
E
E
 
K
Y
 
Y
T
 
C
E
 
I
K
 
D
L
 
M
I
 
I
E
 
K
R
 
M
G
 
N
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
G
P
 
V
E
 
E
E
 
D
F
 
M
R
 
R
E
 
N
L
 
-
K
 
-
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
G
C
 
-
H
 
-
C
 
I
R
 
E
S
 
S
L
 
I
G
 
N
F
 
R
R
 
N
E
 
N
N
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
N
R
 
L
E
 
E
M
 
L
F
 
F
-
 
N
E
 
E
M
 
M
K
 
R
E
 
K
G
 
G
S
 
T
A
 
E
V
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
N
-
 
C
V
 
I
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
N
L
 
M
N
 
Q
H
 
S
P
 
K
N
 
N
P
 
K
A
 
C
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
M
M
 
Y
R
 
R
-
 
C
I
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
V
E
 
P
H
 
H
P
x
H
R
 
K
T
 
H
G
 
Q
T
 
F
R
 
K
Y
 
Y
R
 
K
V
 
C
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
C
A
 
P
V
 
I
D
 
I
D
 
D
H
 
S
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
N
D
 
E
H
 
Y
L
 
S
A
 
D
N
 
R
R
 
I
E
 
E
K
 
Q
Q
 
Y
E
 
N
Y
 
W
L
 
F
Y
 
I
R
 
S
H
 
T
L
 
L
G
 
N
W
 
L
E
 
R
P
 
K
P
 
V
E
 
Y
F
 
I
I
 
Y
H
 
E
Y
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
A
M
 
F
D
 
V
D
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
K
E
 
W
G
 
F
I
 
V
L
 
E
R
 
N
G
 
N
E
 
V
Y
 
V
S
 
D
G
 
S
W
 
W
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
F
K
 
Q
L
 
F
M
 
I
V
 
L
E
 
E
I
 
Q
G
 
G
V
 
P
K
 
S
I
 
K
A
 
A
D
 
G
S
 
N
T
 
L
M
 
M
S
 
Q
W
 
W
K
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
W
G
 
S
L
 
I
N
 
N
R
 
K
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
I
A
 
I
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
F
 
-
F
 
A
A
 
A
A
 
V
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
S
P
 
S
V
 
I
K
 
L
L
 
L
E
 
I
V
 
L
V
 
T
G
 
D
L
 
L
P
 
T
G
 
D
P
 
Q
V
 
V
-
 
I
R
 
Q
V
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
D
L
 
L
H
 
H
P
 
M
D
 
K
H
 
N
P
 
K
E
 
S
I
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P47897 Glutamine--tRNA ligase; Glutaminyl-tRNA synthetase; GlnRS; EC 6.1.1.18 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
29% identity, 70% coverage: 73:457/553 of query aligns to 242:623/775 of P47897

query
sites
P47897
G
 
G
L
 
Y
E
 
V
I
 
V
T
 
T
E
 
P
R
 
H
K
 
T
Q
 
M
K
 
N
K
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
Q
L
 
H
R
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
T
G
 
G
V
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
V
 
R
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
P
N
 
E
P
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
I
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
I
I
 
N
L
 
F
N
 
N
H
 
F
E
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
K
 
A
Y
 
N
D
 
N
G
 
G
R
 
I
L
 
C
I
 
F
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
E
R
 
K
V
 
E
D
 
E
P
 
A
E
 
K
A
 
F
Y
 
F
D
 
T
M
 
A
I
 
I
P
 
C
A
 
D
D
 
M
L
 
V
E
 
A
W
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
E
 
T
W
 
P
D
 
Y
E
 
K
T
 
V
V
 
T
I
 
Y
Q
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
Y
M
 
F
E
 
D
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
Y
E
 
A
Y
 
W
T
 
A
E
 
V
K
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
R
R
 
R
G
 
G
G
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
C
 
C
T
 
H
C
 
Q
R
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
L
R
 
K
E
 
G
L
 
H
K
 
N
N
 
T
R
 
L
G
 
P
E
 
S
A
 
P
C
 
W
H
 
R
C
 
D
R
 
R
S
 
P
L
 
M
G
 
-
F
 
-
R
 
E
E
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
L
R
 
L
W
 
F
R
 
E
E
 
A
M
 
M
F
 
R
E
 
K
M
 
G
K
 
K
-
 
F
-
 
S
E
 
E
G
 
G
S
 
E
A
 
A
V
 
T
V
 
L
R
|
R
V
 
M
K
 
K
T
 
L
D
 
V
L
 
M
N
 
E
H
 
D
P
 
G
N
 
K
P
 
-
A
 
-
I
 
-
R
 
M
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
A
M
 
Y
R
 
R
I
 
V
V
 
K
E
 
Y
A
 
T
E
 
P
H
 
H
P
 
H
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
D
R
 
K
Y
 
W
R
 
C
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
Y
S
 
T
V
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
C
D
 
D
H
 
S
L
 
I
L
 
E
G
 
H
V
 
I
T
 
T
H
 
H
V
 
S
L
 
L
R
 
C
G
 
T
K
 
K
D
 
E
H
 
F
L
 
Q
A
 
A
N
 
R
R
 
R
E
 
S
K
 
S
Q
 
Y
E
 
F
Y
 
W
L
 
L
Y
 
C
R
 
N
H
 
A
L
 
L
G
 
D
W
 
V
E
 
Y
P
 
C
P
 
P
E
 
V
F
 
Q
I
 
W
H
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
K
 
N
M
 
L
D
 
H
D
 
Y
V
 
A
A
 
V
L
 
V
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
I
R
 
L
E
 
Q
G
 
L
I
 
V
L
 
A
R
 
T
G
 
G
E
 
A
Y
 
V
S
 
R
G
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
P
 
P
R
|
R
L
 
L
G
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
F
R
 
P
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
N
K
 
N
L
 
F
M
 
C
V
 
A
E
 
R
I
 
V
G
 
G
V
 
V
K
 
T
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
S
 
T
T
 
T
M
 
M
S
 
E
W
 
P
K
 
H
K
 
L
I
 
L
Y
 
E
G
 
A
L
 
C
N
 
V
R
 
R
S
 
D
I
 
V
L
 
L
E
 
N
E
 
D
E
 
T
A
 
A
R
 
P
R
 
R
Y
 
A
F
 
M
F
 
A
A
 
V
A
 
L
D
 
E
P
 
S
V
 
L
K
 
R
L
 
V
E
 
I
V
 
I
V
 
T
G
 
N
L
 
F
P
 
P
G
 
A
-
 
A
-
 
K
P
 
S
V
 
L
R
 
D
V
 
I
E
 
Q
R
 
V
P
 
P
L
 
N
H
 
F
P
 
P
D
 
A
H
 
D
P
 
E
E
 
T
I
 
K
G
 
G
N
 
F
R
 
H
V
 
Q
L
 
V
E
 
P
L
 
F
R
 
A
G
 
P
E
 
I
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
P
 
E
G
 
R
D
 
T
D
 
D
L
 
F
G
 
K
E
 
E
G
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7wajA Glutamyl-tRNA synthetase from plasmodium falciparum (pfers) complexed with atp and co (see paper)
27% identity, 82% coverage: 92:544/553 of query aligns to 5:480/492 of 7wajA

query
sites
7wajA
G
 
A
V
 
V
K
 
I
G
 
G
E
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
|
P
N
x
E
P
 
P
S
 
S
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
H
 
H
I
 
V
G
|
G
H
|
H
A
 
A
R
 
K
A
|
A
A
 
A
I
 
F
L
 
L
N
 
N
H
 
N
E
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
R
 
Q
K
 
M
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
F
E
 
D
D
 
D
T
 
T
D
 
N
P
 
P
R
 
V
R
 
K
V
 
Y
D
 
E
P
 
K
E
 
S
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
I
P
 
I
A
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
E
W
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
K
W
 
Y
D
 
E
E
 
K
T
 
I
V
 
S
I
 
Y
Q
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
H
M
 
F
E
 
D
T
 
L
Y
 
L
Y
 
E
E
 
K
Y
 
Y
T
 
C
E
 
I
K
 
D
L
 
M
I
 
I
E
 
K
R
 
M
G
 
N
G
 
K
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
C
 
D
T
 
D
C
 
T
R
 
G
P
 
V
E
 
E
E
 
D
F
 
M
R
 
R
E
 
N
L
 
-
K
 
-
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
G
C
 
-
H
 
-
C
 
I
R
 
E
S
 
S
L
 
I
G
 
N
F
 
R
R
 
N
E
 
N
N
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
N
R
 
L
E
 
E
M
 
L
F
 
F
-
 
N
E
 
E
M
 
M
K
 
R
E
 
K
G
 
G
S
 
T
A
x
E
V
 
I
-
 
G
-
x
Q
-
 
K
-
 
N
-
 
C
V
 
I
R
 
R
V
 
A
K
 
K
T
 
I
D
 
N
L
 
M
N
 
Q
H
 
S
P
 
K
N
 
N
P
 
K
A
 
C
I
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
P
V
 
V
S
 
M
M
 
Y
R
 
R
-
 
C
I
 
I
V
 
V
E
 
D
A
 
V
E
 
P
H
 
H
P
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
F
R
 
K
Y
 
Y
R
 
K
V
 
C
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
M
 
Y
N
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
C
A
 
P
V
 
I
D
 
I
D
 
D
H
 
S
L
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
T
K
 
N
D
 
E
H
 
Y
L
 
S
A
 
D
N
 
R
R
 
I
E
 
E
K
 
Q
Q
 
Y
E
 
N
Y
 
W
L
 
F
Y
 
I
R
 
S
H
 
T
L
 
L
G
 
N
W
 
L
E
 
R
P
 
K
P
 
V
E
 
Y
F
 
I
I
 
Y
H
 
E
Y
x
F
G
 
S
R
|
R
L
|
L
K
 
A
M
 
F
D
 
V
D
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
M
S
 
S
T
 
K
S
 
R
G
 
K
A
 
L
R
 
K
E
 
W
G
 
F
I
 
V
L
 
E
R
 
N
G
 
N
E
 
V
Y
 
V
S
 
D
G
 
S
W
 
W
D
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
F
G
 
P
T
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
F
K
 
Q
L
 
F
M
 
I
V
 
L
E
 
E
I
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
Q
S
 
N
T
 
L
M
 
M
S
 
Q
W
 
W
K
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
W
G
 
S
L
 
I
N
 
N
R
 
K
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
E
 
D
E
 
P
E
 
I
A
 
I
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
F
 
-
F
 
A
A
 
A
A
 
V
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
S
P
 
S
V
 
I
K
 
L
L
 
L
E
 
I
V
 
L
V
 
T
G
 
D
L
 
L
P
 
T
G
 
D
P
 
Q
V
 
V
-
 
I
R
 
Q
V
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
D
L
 
L
H
 
H
P
 
M
D
 
K
H
 
N
P
 
K
E
 
S
I
 
L
G
 
G
N
 
T
R
 
C
V
 
N
L
 
M
E
 
Y
L
 
Y
R
 
N
G
 
N
E
 
K
V
 
Y
Y
 
L
L
 
I
P
 
E
G
 
L
D
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
N
G
 
E
P
 
E
L
 
I
R
 
T
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
L
V
 
G
N
 
N
V
 
I
I
 
I
Y
 
I
S
 
K
G
 
N
G
 
I
E
 
E
L
 
K
R
 
E
Y
 
-
H
 
-
S
 
N
E
 
G
G
 
K
I
 
I
E
 
K
E
 
Q
A
 
I
R
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
T
A
 
K
S
 
K
M
 
K
I
 
I
H
 
H
W
 
W
V
 
L
P
 
P
A
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
Y
L
 
L
E
 
P
A
 
Q
E
 
Q
V
 
L
I
 
I
M
 
T
P
 
C
D
 
T
A
 
L
S
 
Y
R
 
E
V
 
Y
R
 
D
G
 
H
V
 
L
I
 
I
E
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
W
-
 
T
-
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
F
-
 
N
-
 
S
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
A
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
I
S
 
S
E
 
S
L
 
L
E
 
K
V
 
V
D
 
S
D
 
D
V
 
K
V
 
F
Q
 
Q
L
 
F
E
 
E
R
 
R
F
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
F
R
 
I
L
 
L
D
 
D
S
 
K
A
 
I
G
x
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_010875691.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010875691.1
MVPVEDLVYRYALLNAVKHRGRANPGAVMGAVMSNEPELRKMAPQVKEAVEAAVERVNSL
SPEEQQQEMERLGLEITERKQKKRKGLRELAGVKGEVVLRFAPNPSGPLHIGHARAAILN
HEYARKYDGRLILRIEDTDPRRVDPEAYDMIPADLEWLGVEWDETVIQSDRMETYYEYTE
KLIERGGAYVCTCRPEEFRELKNRGEACHCRSLGFRENLQRWREMFEMKEGSAVVRVKTD
LNHPNPAIRDWVSMRIVEAEHPRTGTRYRVYPMMNFSVAVDDHLLGVTHVLRGKDHLANR
EKQEYLYRHLGWEPPEFIHYGRLKMDDVALSTSGAREGILRGEYSGWDDPRLGTLRAIAR
RGIRPEAIRKLMVEIGVKIADSTMSWKKIYGLNRSILEEEARRYFFAADPVKLEVVGLPG
PVRVERPLHPDHPEIGNRVLELRGEVYLPGDDLGEGPLRLIDAVNVIYSGGELRYHSEGI
EEARELGASMIHWVPAESALEAEVIMPDASRVRGVIEADASELEVDDVVQLERFGFARLD
SAGPGMVFYYAHK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory