SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010875848.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010875848.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ygrA Crystal structure of had phosphatase from thermococcus onnurineus (see paper)
31% identity, 86% coverage: 2:195/226 of query aligns to 1:186/215 of 4ygrA

query
sites
4ygrA
L
 
M
K
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
L
F
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
D
 
G
T
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
x
E
-
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
L
T
 
P
S
 
Q
G
 
V
F
 
Y
A
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
-
M
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
G
L
 
I
T
 
S
Q
x
K
E
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
R
-
 
E
K
 
R
L
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
E
I
 
I
I
x
L
S
 
G
E
 
R
K
x
R
G
 
D
S
 
S
N
 
-
Y
 
Y
D
 
D
R
x
W
H
 
H
-
 
D
-
x
W
-
 
N
-
 
F
-
 
F
F
 
F
N
 
K
V
 
L
L
 
F
T
 
D
K
 
L
T
 
D
V
 
L
F
 
K
G
 
Y
E
 
E
E
 
E
K
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
I
 
L
T
 
E
Y
 
R
H
 
Y
N
 
P
V
 
H
K
 
K
F
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
Q
P
 
V
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
T
 
T
T
 
I
S
 
P
T
 
T
L
 
L
I
 
E
D
 
W
L
 
L
K
 
R
S
 
D
K
 
T
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
S
x
T
N
x
S
G
|
G
I
 
P
T
 
K
I
 
Y
K
 
Q
Q
 
R
W
 
-
E
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
K
R
 
L
L
 
T
G
 
G
I
 
L
H
 
L
H
 
D
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
S
 
R
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
N
F
 
A
E
 
I
K
|
K
P
 
P
N
 
E
I
 
P
R
 
K
I
 
I
F
 
F
E
 
L
E
 
Y
A
 
T
L
 
I
R
 
E
R
 
R
M
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
E
P
 
P
E
 
G
R
 
E
S
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
|
G
N
x
D
K
 
S
F
x
L
N
 
S
E
x
Q
D
|
D
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
K
N
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
W
V
 
I
N
 
N

6q7oA Crystal structure of oe1 (see paper)
35% identity, 86% coverage: 1:195/226 of query aligns to 1:200/230 of 6q7oA

query
sites
6q7oA
M
 
M
L
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
D
|
D
I
 
S
D
x
L
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
N
D
 
S
T
 
V
S
 
E
G
 
G
F
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
S
A
 
H
R
 
L
K
 
K
A
 
I
A
 
M
L
 
E
N
 
E
V
 
V
M
 
L
I
 
G
D
 
D
A
 
Y
G
 
P
L
 
L
-
 
N
P
 
P
L
 
K
T
 
T
Q
 
L
E
 
L
E
 
D
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
A
I
 
F
S
 
S
E
 
N
-
 
Y
K
 
A
G
 
G
S
 
K
N
 
P
Y
 
Y
D
 
R
R
 
P
H
 
L
F
 
R
N
 
D
V
 
I
L
 
L
T
 
E
K
 
E
T
 
V
V
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
K
F
 
Y
G
 
G
E
 
F
E
 
K
K
 
Y
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
F
L
 
W
L
 
E
I
 
I
A
 
S
L
 
L
G
 
R
M
 
M
I
 
-
T
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
 
S
V
 
Q
K
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
E
L
 
L
R
 
-
P
 
-
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
T
 
V
T
 
V
S
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
G
K
 
K
G
 
-
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
G
 
G
V
 
M
I
 
I
S
 
T
N
 
D
G
 
S
I
 
D
T
 
T
I
 
E
K
 
Q
Q
 
A
W
 
M
E
 
A
K
 
F
L
 
L
I
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
K
H
 
D
F
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
E
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
F
K
 
K
P
 
P
N
 
H
I
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
A
G
 
G
C
 
V
K
 
K
P
 
G
E
 
E
R
 
E
S
 
A
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
x
D
K
 
N
F
 
P
N
 
V
E
 
K
D
 
D
I
 
C
L
 
G
G
 
G
A
 
S
T
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
L
N
 
D

6q7nA Crystal structure of bh32 alkylated with the mechanistic inhibitor 2- bromoacetophenone (see paper)
35% identity, 86% coverage: 1:195/226 of query aligns to 1:200/230 of 6q7nA

query
sites
6q7nA
M
 
M
L
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
S
D
 
L
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
N
D
 
S
T
 
V
S
 
E
G
 
G
F
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
S
A
x
H
R
 
L
K
 
K
A
 
I
A
 
M
L
 
E
N
 
E
V
 
V
M
 
L
I
 
G
D
 
D
A
 
Y
G
 
P
L
 
L
-
 
N
P
 
P
L
 
K
T
 
T
Q
 
L
E
 
L
E
 
D
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
A
I
 
F
S
 
S
E
 
N
-
 
Y
K
 
A
G
 
G
S
 
K
N
 
P
Y
 
Y
D
 
R
R
 
P
H
 
L
F
 
R
N
 
D
V
 
I
L
|
L
T
 
E
K
 
E
T
 
V
V
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
K
F
 
Y
G
 
G
E
 
F
E
 
K
K
 
Y
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
F
L
x
W
L
 
E
I
 
I
A
x
S
L
|
L
G
 
R
M
 
M
I
 
-
T
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
x
S
V
 
Q
K
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
E
L
 
L
R
 
-
P
 
-
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
T
 
V
T
 
V
S
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
G
K
 
K
G
 
-
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
G
 
G
V
 
M
I
 
I
S
 
T
N
 
D
G
 
S
I
 
D
T
 
T
I
 
E
K
 
Q
Q
 
A
W
 
M
E
 
A
K
 
F
L
 
L
I
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
K
H
 
D
F
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
E
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
F
K
 
K
P
 
P
N
 
H
I
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
A
G
 
G
C
 
V
K
 
K
P
 
G
E
 
E
R
 
E
S
 
A
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
D
K
 
N
F
 
P
N
 
V
E
 
K
D
 
D
I
 
C
L
 
G
G
 
G
A
 
S
T
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
L
N
 
D

8bp1A Crystal structure of bhmehis1.0, an engineered enzyme for the morita- baylis-hillman reaction (see paper)
35% identity, 86% coverage: 1:195/226 of query aligns to 1:200/231 of 8bp1A

query
sites
8bp1A
M
 
M
L
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
D
|
D
I
 
S
D
x
L
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
I
D
 
S
T
 
V
S
 
E
G
 
G
F
 
A
A
 
Y
K
 
K
L
 
V
A
 
H
R
 
L
K
 
K
A
 
I
A
 
M
L
 
E
N
 
E
V
 
V
M
 
L
I
 
G
D
 
D
A
 
Y
G
 
P
L
 
L
-
 
N
P
 
P
L
 
K
T
 
T
Q
 
L
E
 
L
E
 
D
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
A
I
 
F
S
 
S
E
 
N
-
 
Y
K
 
A
G
 
G
S
 
K
N
 
P
Y
 
Y
D
 
R
R
 
P
H
 
L
F
 
R
N
 
D
V
 
I
L
 
L
T
 
E
K
 
E
T
 
V
V
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
K
F
 
Y
G
 
G
E
 
F
E
 
K
K
 
Y
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
L
L
 
W
L
 
E
I
 
I
A
 
S
L
 
L
G
 
R
M
 
M
I
 
A
T
 
Q
Y
 
R
H
 
Y
N
 
G
V
 
-
K
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
E
P
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
E
T
 
V
T
 
V
S
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
G
K
 
K
G
 
-
Y
 
Y
R
 
H
L
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
x
L
N
|
N
G
x
R
I
 
D
T
 
T
I
 
E
K
 
P
Q
 
A
W
 
T
E
 
A
K
 
F
L
 
L
I
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
K
H
 
D
F
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
S
V
 
I
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
E
E
 
E
V
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
F
K
 
K
P
 
P
N
 
H
I
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
F
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
A
G
 
G
C
 
V
K
 
K
P
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
x
D
K
 
N
F
 
P
N
 
V
E
 
K
D
 
D
I
 
A
L
 
G
G
 
G
A
 
S
T
 
K
N
 
N
A
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
L
N
 
D

3vayA Crystal structure of 2-haloacid dehalogenase from pseudomonas syringae pv. Tomato dc3000 (see paper)
28% identity, 100% coverage: 1:226/226 of query aligns to 1:226/230 of 3vayA

query
sites
3vayA
M
 
M
L
 
I
K
 
K
A
 
L
V
 
V
F
 
T
F
 
F
D
|
D
I
 
L
D
|
D
D
 
D
T
 
T
L
 
L
Y
 
W
D
 
D
T
 
T
S
 
A
G
 
P
F
 
A
A
 
I
K
 
V
L
 
G
A
 
A
R
 
E
K
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
R
N
 
D
V
 
W
M
 
L
I
 
A
D
 
E
A
 
Q
G
 
A
L
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
G
P
 
P
L
 
V
T
 
P
Q
 
V
E
 
E
E
 
H
A
 
L
Y
 
W
K
 
E
L
 
I
L
 
R
R
 
S
E
 
R
I
 
L
I
 
L
S
 
D
E
 
E
K
 
D
G
 
P
S
 
S
N
 
F
Y
 
K
D
 
H
R
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
V
H
 
L
F
 
F
N
 
H
V
 
A
L
 
L
T
 
E
K
 
D
T
 
A
V
 
G
F
 
Y
G
 
D
E
 
S
E
 
D
K
 
E
P
 
A
L
 
Q
L
 
Q
I
 
L
A
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
L
 
V
G
 
F
M
 
L
I
 
H
T
 
G
Y
 
R
H
 
H
N
 
Q
V
 
V
K
 
Q
F
 
I
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
F
P
 
P
N
 
E
T
 
V
T
 
Q
S
 
P
T
 
T
L
 
L
I
 
-
D
 
E
L
 
I
K
 
L
S
 
A
K
 
K
G
 
T
Y
 
F
R
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
T
N
 
N
G
 
G
I
 
N
T
 
A
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
W
 
-
E
 
-
K
 
D
L
 
V
I
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
A
H
 
D
F
 
Y
F
 
F
D
 
A
E
 
F
V
 
A
V
 
L
T
 
C
S
 
A
D
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
F
 
I
E
 
G
K
 
K
P
 
P
N
 
D
I
 
P
R
 
A
I
 
P
F
 
F
E
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
A
G
 
K
C
 
V
K
 
D
P
 
A
E
 
S
R
 
A
S
 
A
V
 
V
M
 
H
V
 
V
G
 
G
N
x
D
K
 
H
F
 
P
N
 
S
E
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
N
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
M
S
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
W
V
 
Y
N
 
N
S
 
P
E
 
Q
L
 
G
T
 
K
E
 
A
A
 
W
E
 
D
R
 
A
D
 
D
H
 
R
V
 
L
E
 
P
K
 
D
N
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
A
V
 
E
I
 
I
D
 
H
D
 
N
I
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
L
K
 
P
E
 
E
I
 
V
L
 
L

4knvA The crystal structure of apo human hdhd4 from se-mad (see paper)
26% identity, 85% coverage: 2:193/226 of query aligns to 1:202/241 of 4knvA

query
sites
4knvA
L
 
M
K
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
F
D
|
D
I
x
L
D
|
D
D
 
N
T
 
T
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
T
 
T
S
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
K
 
K
L
 
Y
A
 
H
R
 
Y
K
 
K
A
 
E
A
 
E
L
 
A
N
 
E
V
 
I
M
 
I
I
 
C
D
 
D
A
 
K
G
 
V
L
 
Q
P
 
V
L
 
K
T
 
L
Q
 
S
E
 
K
E
 
E
A
 
C
Y
 
F
K
 
H
L
 
P
L
 
Y
R
 
N
E
 
T
I
 
C
I
 
I
S
 
T
E
 
D
-
 
L
K
 
R
G
 
T
S
 
S
N
 
H
Y
 
W
D
 
E
R
 
-
H
 
-
F
 
-
N
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
Q
K
 
E
T
 
T
V
 
K
F
 
G
G
 
G
E
 
A
E
 
A
K
 
N
P
 
R
L
 
K
L
 
L
I
 
A
A
 
E
L
 
E
G
 
C
M
 
Y
I
 
F
T
 
L
Y
 
W
H
 
K
N
 
S
V
 
T
K
 
R
F
 
L
A
 
Q
L
 
H
L
 
M
R
 
T
P
 
L
F
 
A
P
 
E
N
 
D
T
 
V
T
 
K
S
 
A
T
 
M
L
 
L
I
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
R
S
 
-
K
 
K
G
 
E
Y
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
L
V
 
L
I
 
L
S
x
T
N
|
N
G
 
G
I
 
D
T
 
R
I
 
Q
K
 
T
Q
 
Q
W
 
R
E
 
E
K
 
K
L
 
I
I
 
E
R
 
A
L
 
C
G
 
A
I
 
C
H
 
Q
H
 
S
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
S
 
G
D
 
G
E
 
E
V
 
Q
G
 
R
F
 
E
E
 
E
K
|
K
P
 
P
N
 
A
I
 
P
R
 
S
I
 
I
F
 
F
E
 
Y
E
 
Y
A
 
C
L
 
C
R
 
N
R
 
L
M
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
Q
P
 
P
E
 
G
R
 
D
S
 
C
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
 
G
N
x
D
K
 
T
F
 
L
N
 
E
E
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
Q
G
 
G
A
 
G
T
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
T
L
 
V

3qnmA Haloalkane dehalogenase family member from bacteroides thetaiotaomicron of unknown function
26% identity, 85% coverage: 3:195/226 of query aligns to 4:205/231 of 3qnmA

query
sites
3qnmA
K
 
K
A
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
D
|
D
I
 
L
D
|
D
D
 
D
T
 
T
L
 
I
Y
 
W
D
 
A
T
 
F
S
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
R
-
 
D
G
 
T
F
 
F
A
 
E
K
 
E
L
 
V
A
 
Y
R
 
Q
K
 
K
A
 
Y
A
 
S
L
 
F
N
 
D
V
 
R
M
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
H
G
 
Y
L
 
Y
P
 
T
L
 
L
T
 
Y
Q
 
Q
E
 
R
E
 
R
A
 
N
Y
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
W
R
 
L
E
 
E
I
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
K
I
 
V
S
 
T
E
 
K
K
 
E
G
 
E
S
 
L
N
 
N
Y
 
R
D
 
Q
R
 
R
H
 
F
F
 
F
N
 
Y
V
 
P
L
 
L
T
 
-
K
 
Q
T
 
A
V
 
V
F
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
D
K
 
E
P
 
A
L
 
L
L
 
A
-
 
E
-
 
R
I
 
F
A
 
S
L
 
E
G
 
D
M
 
F
I
 
F
T
 
A
Y
 
I
H
 
I
N
 
P
V
 
T
K
 
K
F
 
S
A
 
G
L
 
L
L
 
M
R
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
P
N
 
H
T
 
A
T
 
K
S
 
E
T
 
V
L
 
L
I
 
E
D
 
Y
L
 
L
K
 
A
S
 
P
K
 
Q
G
 
-
Y
 
Y
R
 
N
L
 
L
G
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
S
N
 
N
G
 
G
I
 
F
T
 
R
I
 
E
K
 
L
Q
 
Q
W
 
S
E
 
R
K
 
K
L
 
M
I
 
R
R
 
S
L
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
D
H
 
R
F
 
Y
F
 
F
D
 
K
E
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
G
F
 
V
E
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
R
I
 
P
R
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
H
E
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
S
R
 
A
M
 
T
G
 
Q
C
 
S
K
 
E
P
 
L
E
 
R
R
 
E
S
 
S
V
 
L
M
 
M
V
 
I
G
 
G
N
x
D
K
 
S
F
 
W
N
 
E
E
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
H
N
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
H
A
 
Q
I
 
A
L
 
F
V
 
Y
N
 
N

3i76B The crystal structure of the orthorhombic form of the putative had- hydrolase yfnb from bacillus subtilis bound to magnesium reveals interdomain movement
26% identity, 42% coverage: 103:198/226 of query aligns to 107:203/229 of 3i76B

query
sites
3i76B
L
 
L
I
 
I
D
 
S
L
 
N
K
 
L
S
 
Q
K
 
Q
G
 
Q
Y
 
F
R
 
D
L
 
L
G
 
Y
V
 
I
I
 
V
S
 
T
N
 
N
G
 
G
I
 
V
T
 
S
I
 
H
K
 
T
Q
 
Q
W
 
Y
E
 
K
K
 
R
L
 
L
I
 
R
R
 
D
L
 
S
G
 
G
I
 
L
H
 
F
H
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
K
E
 
D
V
 
I
V
 
F
T
 
V
S
 
S
D
 
E
E
 
D
V
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
K
 
K
P
 
P
N
 
M
I
 
K
R
 
E
I
 
Y
F
 
F
E
 
N
E
 
Y
A
 
V
L
 
F
R
 
E
R
 
R
M
 
I
-
 
P
G
 
Q
C
 
F
K
 
S
P
 
A
E
 
E
R
 
H
S
 
T
V
 
L
M
 
I
V
 
I
G
 
G
N
x
D
K
 
S
F
 
L
N
 
T
E
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
K
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
N
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
D
A
 
T
I
 
C
L
 
W
V
 
M
N
 
N
S
 
P
E
 
D
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Q51645 (S)-2-haloacid dehalogenase 4A; 2-haloalkanoic acid dehalogenase IVA; Halocarboxylic acid halidohydrolase IVA; L-2-haloacid dehalogenase IVA; EC 3.8.1.2 from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see 2 papers)
28% identity, 46% coverage: 93:197/226 of query aligns to 95:198/231 of Q51645

query
sites
Q51645
L
 
L
R
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
T
 
A
T
 
A
S
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
K
S
 
S
K
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
I
L
 
V
G
 
A
V
 
I
I
 
L
S
|
S
N
|
N
G
 
G
I
 
N
T
 
D
I
 
E
K
 
M
Q
 
L
W
 
Q
E
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
K
R
 
A
L
 
S
G
 
K
I
 
L
H
 
D
H
 
R
F
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
S
V
 
C
V
 
L
T
 
S
S
 
A
D
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
K
F
 
I
E
 
Y
K
 
K
P
 
P
N
 
D
I
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
E
 
Q
E
 
F
A
 
A
L
 
C
R
 
D
R
 
R
M
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
N
P
 
P
E
 
N
R
 
E
S
 
V
V
 
C
M
 
F
V
 
V
G
 
S
N
 
S
K
 
N
F
 
-
N
 
A
E
 
W
D
 
D
I
 
L
L
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
G
N
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
S
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
R
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

2no5B Crystal structure analysis of a dehalogenase with intermediate complex (see paper)
28% identity, 46% coverage: 93:197/226 of query aligns to 95:198/226 of 2no5B

query
sites
2no5B
L
 
L
R
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
T
 
A
T
 
A
S
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
K
S
 
S
K
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
I
L
 
V
G
 
A
V
 
I
I
 
L
S
|
S
N
|
N
G
 
G
I
 
N
T
 
D
I
 
E
K
 
M
Q
 
L
W
 
Q
E
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
K
R
 
A
L
 
S
G
 
K
I
 
L
H
 
D
H
 
R
F
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
S
V
 
C
V
 
L
T
 
S
S
 
A
D
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
K
F
 
I
E
 
Y
K
|
K
P
 
P
N
 
D
I
 
P
R
 
R
I
 
I
F
 
Y
E
 
Q
E
 
F
A
 
A
L
 
C
R
 
D
R
 
R
M
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
N
P
 
P
E
 
N
R
 
E
S
 
V
V
 
C
M
 
F
V
 
V
G
x
S
N
 
S
K
x
N
F
 
-
N
x
A
E
x
W
D
|
D
I
 
L
L
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
G
N
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
S
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
R
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3umbA Crystal structure of the l-2-haloacid dehalogenase rsc1362
25% identity, 86% coverage: 2:195/226 of query aligns to 3:198/227 of 3umbA

query
sites
3umbA
L
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
V
F
 
F
D
|
D
I
 
A
D
 
Y
D
 
G
T
|
T
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
T
 
V
S
 
Y
G
 
S
F
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
R
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
-
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
S
V
 
V
M
 
L
I
 
W
D
x
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
T
x
D
Q
 
R
E
 
Q
E
 
I
A
x
D
Y
 
Y
K
 
T
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
S
I
 
L
I
 
A
S
 
G
E
 
P
K
 
S
G
 
G
S
 
E
N
 
H
Y
 
Y
D
 
K
R
 
P
H
 
F
F
 
W
N
 
D
V
 
V
L
 
T
T
 
V
K
 
D
T
 
A
V
 
L
F
 
R
G
 
Y
E
 
A
E
 
C
K
x
A
P
 
R
L
 
L
L
x
N
I
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
G
M
 
N
I
 
H
T
 
A
Y
 
E
H
 
A
N
 
T
V
 
L
-
 
M
-
 
R
K
 
E
F
 
Y
A
 
A
L
 
C
L
 
L
R
 
S
P
 
A
F
 
F
P
 
P
N
 
E
T
 
N
T
 
V
S
 
P
T
 
V
L
 
L
I
 
R
D
 
Q
L
 
L
K
 
R
S
 
E
K
 
M
G
 
G
Y
 
L
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
S
|
S
N
|
N
G
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
M
-
 
L
-
 
E
I
 
I
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
S
W
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
L
 
A
G
 
G
I
 
M
H
 
S
H
 
G
F
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
H
V
 
V
V
 
L
T
 
S
S
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
V
G
 
R
F
 
L
E
 
Y
K
|
K
P
 
T
N
 
A
I
 
P
R
 
A
I
 
A
F
 
Y
E
 
A
E
 
L
A
 
A
L
 
P
R
 
R
R
 
A
M
 
F
G
 
G
C
 
V
K
 
-
P
 
P
E
 
A
R
 
A
S
 
Q
V
 
I
M
 
L
V
 
F
G
 
V
N
x
S
K
 
S
F
x
N
N
 
G
E
x
W
D
|
D
I
 
A
L
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
N
 
W
A
 
H
G
 
G
M
 
F
S
 
T
A
 
T
I
 
F
L
 
W
V
 
I
N
 
N

P95649 Protein CbbY; RuCbby; EC 3.1.3.- from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
27% identity, 98% coverage: 1:222/226 of query aligns to 1:217/230 of P95649

query
sites
P95649
M
 
M
L
 
I
K
 
E
A
 
A
V
 
I
F
 
L
F
 
F
D
 
D
I
 
V
D
|
D
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
E
T
 
T
S
x
E
G
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
E
L
 
L
A
x
H
R
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
N
N
 
E
V
 
T
M
 
F
I
 
A
D
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
D
-
 
W
L
 
F
T
 
W
Q
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
E
Y
|
Y
K
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
L
S
 
T
E
 
T
K
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
x
R
-
 
I
S
 
A
N
 
R
Y
 
F
D
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
Q
N
 
K
V
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
D
E
 
P
K
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
D
Y
 
I
H
 
H
N
 
R
V
 
A
K
|
K
-
 
T
-
 
E
-
 
R
-
 
F
F
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
A
P
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
L
F
 
R
P
 
P
N
 
G
T
 
I
T
 
A
S
 
D
T
 
L
L
 
I
I
 
A
D
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
R
K
 
A
G
 
G
Y
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
A
V
 
V
I
 
A
S
 
T
N
 
T
G
 
-
I
 
T
T
 
S
I
 
L
K
 
P
Q
 
N
W
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
C
R
 
R
L
 
A
G
 
C
I
 
F
H
 
G
H
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
E
F
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
A
S
 
G
D
 
D
E
 
M
V
 
V
G
 
A
F
 
E
E
 
K
K
 
K
P
 
P
N
 
S
I
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
Y
E
 
R
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
M
 
L
G
 
D
C
 
V
K
 
P
P
 
P
E
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
V
 
L
G
 
E
N
 
D
K
 
S
F
 
L
N
 
N
E
 
-
D
 
G
I
 
L
L
 
R
G
 
A
A
 
A
T
 
K
N
 
G
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
R
A
 
C
I
 
I
L
 
V
V
 
S
N
 
P
S
 
G
E
 
F
L
 
Y
T
 
T
E
 
R
A
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
H
V
 
E
E
 
E
K
 
F
N
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
V
 
-
T
 
R
V
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
F
S
 
A
Q
 
E
L
 
L

4uasA Crystal structure of cbby from rhodobacter sphaeroides in complex with phosphate (see paper)
27% identity, 98% coverage: 1:222/226 of query aligns to 1:217/225 of 4uasA

query
sites
4uasA
M
 
M
L
 
I
K
 
E
A
 
A
V
 
I
F
 
L
F
 
F
D
|
D
I
x
V
D
|
D
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
E
T
|
T
S
 
E
G
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
E
L
 
L
A
 
H
R
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
N
N
 
E
V
 
T
M
 
F
I
 
A
D
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
D
-
 
W
L
 
F
T
 
W
Q
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
K
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
L
S
x
T
E
 
T
K
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
I
S
 
A
N
 
R
Y
 
F
D
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
Q
N
 
K
V
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
D
E
 
P
K
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
D
Y
 
I
H
 
H
N
 
R
V
 
A
K
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
R
-
 
F
F
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
A
P
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
L
F
 
R
P
 
P
N
 
G
T
 
I
T
 
A
S
 
D
T
 
L
L
 
I
I
 
A
D
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
R
K
 
A
G
 
G
Y
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
A
V
 
V
I
 
A
S
x
T
N
x
T
G
 
-
I
 
T
T
 
S
I
 
L
K
 
P
Q
 
N
W
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
C
R
 
R
L
 
A
G
 
C
I
 
F
H
 
G
H
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
E
F
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
A
S
 
G
D
 
D
E
 
M
V
 
V
G
 
A
F
 
E
E
 
K
K
|
K
P
 
P
N
 
S
I
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
Y
E
 
R
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
M
 
L
G
 
D
C
 
V
K
 
P
P
 
P
E
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
V
 
L
G
x
E
N
x
D
K
 
S
F
 
L
N
 
N
E
 
-
D
 
G
I
 
L
L
 
R
G
 
A
A
 
A
T
 
K
N
 
G
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
R
A
 
C
I
 
I
L
 
V
V
 
S
N
 
P
S
 
G
E
 
F
L
 
Y
T
 
T
E
 
R
A
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
H
V
 
E
E
 
E
K
 
F
N
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
V
 
-
T
 
R
V
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
F
S
 
A
Q
 
E
L
 
L

Q3UGR5 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 from Mus musculus (Mouse)
47% identity, 21% coverage: 150:196/226 of query aligns to 179:225/259 of Q3UGR5

query
sites
Q3UGR5
K
 
K
P
 
P
N
 
E
I
 
K
R
 
T
I
 
F
F
 
F
E
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
D
M
 
A
G
 
D
C
 
C
K
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
E
S
 
A
V
 
V
M
 
M
V
 
I
G
 
G
N
 
D
K
 
D
F
 
C
N
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
V
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
N
 
N
A
 
I
G
 
G
M
 
M
S
 
L
A
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
K
S
 
T

Sites not aligning to the query:

P9WPI9 Tyrosine-protein kinase PtkA; Protein tyrosine kinase A; EC 2.7.10.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
25% identity, 98% coverage: 5:226/226 of query aligns to 82:289/291 of P9WPI9

query
sites
P9WPI9
V
 
V
F
 
I
F
 
F
D
|
D
I
 
L
D
 
D
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
T
D
 
D
T
 
S
S
 
A
G
 
R
F
 
G
A
 
I
K
 
V
L
 
S
A
 
S
R
 
F
K
 
R
A
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
H
M
 
I
I
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
A
P
 
P
L
 
V
T
 
P
Q
 
E
E
 
G
E
 
D
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
A
R
 
T
E
 
H
I
 
I
I
 
V
S
 
G
E
 
P
K
 
P
G
 
-
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
H
 
M
F
 
H
N
 
E
V
 
T
L
 
L
T
 
R
K
 
A
T
 
M
V
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
S
K
 
A
P
 
E
L
 
E
L
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
A
G
x
Y
M
 
R
I
 
A
T
 
D
Y
|
Y
H
 
S
N
 
A
V
 
R
K
 
G
F
 
W
A
 
A
L
 
M
L
 
N
R
 
S
P
 
L
F
 
F
P
 
D
N
 
G
T
 
I
T
 
G
S
 
P
T
 
L
L
 
L
I
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
K
 
A
G
 
G
Y
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
A
V
 
V
I
 
A
S
 
T
N
 
S
G
x
K
I
 
A
T
 
E
I
 
P
K
 
T
Q
 
A
W
 
R
E
 
R
K
 
I
L
 
L
I
 
R
R
 
H
L
 
F
G
 
G
I
 
I
H
 
E
H
 
Q
F
 
H
F
 
F
D
 
E
E
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
G
S
 
A
D
 
S
E
 
T
V
 
D
G
 
G
F
 
S
E
 
R
K
 
G
P
 
S
N
x
K
I
 
V
R
 
D
I
 
V
F
 
L
E
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
M
 
L
G
 
R
C
 
P
K
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
R
S
 
L
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
 
G
N
 
D
K
 
R
F
 
-
N
 
S
E
 
H
D
 
D
I
 
V
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
A
N
 
A
A
 
H
G
 
G
M
 
I
S
 
D
A
 
T
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
G
S
 
W
E
 
G
L
x
Y
T
 
G
E
 
R
A
 
A
E
 
-
R
 
-
D
 
D
H
 
F
V
 
I
E
 
D
K
|
K
N
 
T
G
 
S
L
 
T
D
 
T
-
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
H
I
 
A
D
 
A
D
 
T
I
 
I
S
 
D
Q
 
E
L
 
L
K
 
R
E
 
E
I
 
A
L
 
L

4uauA Crystal structure of cbby (mutant d10n) from rhodobacter sphaeroides in complex with xylulose-(1,5)bisphosphate, crystal form ii (see paper)
26% identity, 98% coverage: 1:222/226 of query aligns to 1:217/226 of 4uauA

query
sites
4uauA
M
 
M
L
 
I
K
 
E
A
 
A
V
 
I
F
 
L
F
 
F
D
|
D
I
x
V
D
x
N
D
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
E
T
|
T
S
x
E
G
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
E
L
 
L
A
x
H
R
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
N
N
 
E
V
 
T
M
 
F
I
 
A
D
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
D
-
 
W
L
 
F
T
 
W
Q
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
K
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
L
S
x
T
E
 
T
K
x
T
G
|
G
-
x
G
-
 
K
-
 
E
-
x
R
-
 
I
S
 
A
N
 
R
Y
 
F
D
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
Q
N
 
K
V
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
D
E
 
P
K
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
P
I
 
I
A
 
A
L
 
-
G
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
D
Y
 
I
H
|
H
N
 
R
V
 
A
K
|
K
-
 
T
-
 
E
-
 
R
-
 
F
F
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
A
P
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
L
F
 
R
P
 
P
N
 
G
T
 
I
T
 
A
S
 
D
T
 
L
L
 
I
I
 
A
D
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
R
K
 
A
G
 
G
Y
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
A
V
 
V
I
 
A
S
x
T
N
x
T
G
 
-
I
x
T
T
x
S
I
 
L
K
 
P
Q
 
N
W
 
V
E
 
E
K
 
A
L
 
L
I
 
C
R
 
R
L
 
A
G
 
C
I
 
F
H
 
G
H
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
E
F
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
A
S
 
G
D
 
D
E
 
M
V
 
V
G
 
A
F
 
E
E
 
K
K
|
K
P
 
P
N
 
S
I
 
P
R
 
D
I
 
I
F
 
Y
E
 
R
E
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
E
M
 
L
G
 
D
C
 
V
K
 
P
P
 
P
E
 
E
R
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
V
 
L
G
x
E
N
x
D
K
 
S
F
 
L
N
 
N
E
 
-
D
 
G
I
 
L
L
 
R
G
 
A
A
 
A
T
 
K
N
 
G
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
R
A
 
C
I
 
I
L
 
V
V
 
S
N
 
P
S
 
G
E
 
F
L
 
Y
T
 
T
E
 
R
A
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
H
V
 
E
E
 
E
K
 
F
N
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
V
 
-
T
 
R
V
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
F
S
 
A
Q
 
E
L
 
L

4o8cB Structure of the h170y mutant of thermostable p-nitrophenylphosphatase from bacillus stearothermophilus (see paper)
35% identity, 24% coverage: 150:203/226 of query aligns to 181:234/255 of 4o8cB

query
sites
4o8cB
K
|
K
P
 
P
N
 
E
I
 
P
R
 
I
I
 
I
F
 
M
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
V
M
 
L
G
 
G
C
 
T
K
 
N
P
 
K
E
 
N
R
 
E
S
 
T
V
 
I
M
 
M
V
 
V
G
 
G
N
x
D
K
 
N
F
 
Y
N
 
D
E
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
G
T
 
I
N
 
R
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
D
A
 
T
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
H
S
 
T
E
 
G
L
 
V
T
 
T
E
 
T
A
 
V
E
 
E
R
 
K

Sites not aligning to the query:

3ddhA The structure of a putative haloacid dehalogenase-like family hydrolase from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
26% identity, 98% coverage: 1:222/226 of query aligns to 5:227/229 of 3ddhA

query
sites
3ddhA
M
 
L
L
 
I
K
 
K
A
 
V
V
 
I
F
 
A
F
 
F
D
|
D
I
 
A
D
|
D
D
 
D
T
 
T
L
 
L
Y
 
W
D
 
S
T
 
N
S
 
E
G
 
P
F
 
F
A
 
F
K
 
Q
L
 
E
A
 
V
R
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
Y
L
 
T
N
 
D
V
 
L
M
 
L
I
 
K
D
 
P
A
 
Y
G
 
G
L
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
T
Q
 
S
E
 
K
E
 
E
A
 
I
Y
 
S
K
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
F
E
 
Q
I
 
-
I
 
-
S
 
T
E
 
E
K
 
M
G
 
N
S
 
N
N
 
L
Y
 
Q
D
 
I
R
 
L
H
 
G
F
x
Y
N
x
G
V
 
A
L
x
K
T
x
A
K
 
F
T
 
T
V
 
I
F
 
S
G
 
M
E
 
V
E
 
E
K
 
T
P
 
A
L
 
L
L
 
Q
I
 
I
A
 
S
L
 
N
G
 
G
M
 
K
I
 
I
T
 
A
Y
 
A
H
 
D
N
 
I
V
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
G
K
 
K
F
 
S
A
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
M
P
 
P
-
 
I
-
 
E
-
 
L
F
 
L
P
 
P
N
 
G
T
 
V
T
 
K
S
 
E
T
 
T
L
 
L
I
 
K
D
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
E
K
 
T
G
 
G
-
 
K
Y
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
V
V
 
V
I
 
A
S
 
T
N
 
K
G
 
G
I
x
D
T
 
L
I
 
L
K
 
D
Q
 
Q
W
 
E
E
 
N
K
 
K
L
 
L
I
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
I
 
L
H
 
S
H
 
P
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
E
 
H
V
 
I
-
 
E
V
 
V
T
 
M
S
 
S
D
 
D
E
 
K
V
 
T
G
 
-
F
 
-
E
 
E
K
 
K
P
 
E
N
 
Y
I
 
L
R
 
R
I
 
L
F
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
S
R
 
I
M
 
L
G
 
Q
C
 
I
K
 
A
P
 
P
E
 
S
R
 
E
S
 
L
V
 
L
M
 
M
V
 
V
G
 
G
N
|
N
K
 
S
F
 
F
N
 
K
E
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
Q
G
 
P
A
 
V
T
 
L
N
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
G
S
 
Y
A
 
G
I
 
V
L
 
H
V
 
I
N
 
P
S
 
F
E
 
E
L
 
V
T
 
M
E
 
W
A
 
K
E
 
H
R
 
E
D
 
T
H
 
F
V
 
A
E
 
H
K
 
E
N
 
R
G
 
L
L
 
K
D
 
Q
V
 
V
T
 
K
V
 
R
I
 
L
D
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
L
Q
 
S
L
 
L

Q53464 (S)-2-haloacid dehalogenase; 2-haloalkanoic acid dehalogenase; Halocarboxylic acid halidohydrolase; L-2-haloacid dehalogenase; L-DEX; EC 3.8.1.2 from Pseudomonas sp. (strain YL) (see 2 papers)
29% identity, 46% coverage: 93:195/226 of query aligns to 94:195/232 of Q53464

query
sites
Q53464
L
 
L
R
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
S
N
 
E
T
 
V
T
 
P
S
 
D
T
 
S
L
 
L
I
 
R
D
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
V
 
I
I
 
L
S
|
S
N
|
N
G
 
G
I
 
S
T
 
P
I
 
Q
K
 
S
Q
 
I
W
 
D
E
 
A
K
 
V
L
 
V
I
 
S
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
R
H
 
D
F
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
H
V
 
L
V
 
L
T
 
S
S
 
V
D
 
D
E
 
P
V
 
V
G
 
Q
F
 
V
E
 
Y
K
|
K
P
 
P
N
 
D
I
 
N
R
 
R
I
 
V
F
x
Y
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
Q
R
 
A
M
 
L
G
 
G
C
 
L
K
 
-
P
 
-
E
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
A
M
 
I
V
 
L
G
 
F
N
 
V
K
x
S
F
x
S
N
|
N
E
x
A
-
x
W
D
|
D
I
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
Y
A
 
F
G
 
G
M
 
F
S
 
P
A
 
T
I
 
C
L
 
W
V
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1zrmA Crystal structure of the reaction intermediate of l-2-haloacid dehalogenase with 2-chloro-n-butyrate (see paper)
29% identity, 46% coverage: 93:195/226 of query aligns to 92:193/220 of 1zrmA

query
sites
1zrmA
L
 
L
R
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
S
N
 
E
T
 
V
T
 
P
S
 
D
T
 
S
L
 
L
I
 
R
D
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
R
K
 
R
G
 
G
Y
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
V
 
I
I
 
L
S
|
S
N
|
N
G
 
G
I
 
S
T
 
P
I
 
Q
K
 
S
Q
 
I
W
 
D
E
 
A
K
 
V
L
 
V
I
 
S
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
R
H
 
D
F
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
H
V
 
L
V
 
L
T
 
S
S
 
V
D
 
D
E
 
P
V
 
V
G
 
Q
F
 
V
E
 
Y
K
|
K
P
 
P
N
 
D
I
 
N
R
 
R
I
 
V
F
 
Y
E
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
Q
R
 
A
M
 
L
G
 
G
C
 
L
K
 
-
P
 
-
E
 
D
R
 
R
S
 
S
V
 
A
M
 
I
V
 
L
G
 
F
N
 
V
K
x
A
F
 
S
N
|
N
E
 
A
-
x
W
D
|
D
I
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
Y
A
 
F
G
 
G
M
 
F
S
 
P
A
 
T
I
 
C
L
 
W
V
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_010875848.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010875848.1
MLKAVFFDIDDTLYDTSGFAKLARKAALNVMIDAGLPLTQEEAYKLLREIISEKGSNYDR
HFNVLTKTVFGEEKPLLIALGMITYHNVKFALLRPFPNTTSTLIDLKSKGYRLGVISNGI
TIKQWEKLIRLGIHHFFDEVVTSDEVGFEKPNIRIFEEALRRMGCKPERSVMVGNKFNED
ILGATNAGMSAILVNSELTEAERDHVEKNGLDVTVIDDISQLKEIL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory