SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010876512.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010876512.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2bmuB Ump kinase from pyrococcus furiosus complexed with its substrate ump and its substrate analog amppnp (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:223/224 of query aligns to 2:226/226 of 2bmuB

query
sites
2bmuB
M
 
M
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
F
T
x
D
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
I
 
V
S
 
P
E
 
E
F
 
N
S
 
P
H
 
D
-
 
I
E
 
D
M
 
F
F
 
I
R
 
K
A
 
E
Y
 
I
A
 
A
D
 
Y
I
 
Q
L
 
L
N
 
T
S
 
K
L
 
V
R
 
S
D
 
E
E
 
D
H
 
H
D
 
E
L
 
V
F
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
G
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
F
G
 
N
A
 
S
S
 
S
E
 
E
A
 
T
R
 
F
C
 
K
D
|
D
D
 
F
I
 
I
G
|
G
I
|
I
D
 
Q
V
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
R
D
 
E
S
 
K
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
V
 
V
P
 
V
E
 
E
N
 
D
F
 
F
R
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
W
E
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
Q
T
 
L
G
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
P
V
 
V
M
 
M
G
 
G
G
|
G
T
|
T
E
x
H
P
 
P
A
 
G
H
|
H
S
x
T
T
|
T
D
|
D
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
F
V
 
L
E
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
I
T
|
T
S
x
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
x
V
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
|
D
P
|
P
A
 
K
K
 
K
Y
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
K
Y
 
I
P
 
K
E
 
K
I
 
M
T
 
K
A
 
P
S
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
I
L
 
V
R
 
G
G
 
K
S
 
G
D
 
I
V
 
E
R
 
K
A
|
A
G
 
G
T
 
S
Y
x
S
E
x
S
F
x
V
F
 
I
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
A
H
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
G
G
 
K
N
 
E
D
 
D
P
 
A
E
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
F
R
 
R
A
 
V
L
 
I
D
 
K
G
 
G
E
 
D
-
 
H
I
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
E
P
 
P

Q8U122 Uridylate kinase; UK; Uridine monophosphate kinase; UMP kinase; UMPK; EC 2.7.4.22 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:223/224 of query aligns to 1:225/225 of Q8U122

query
sites
Q8U122
M
 
M
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
F
T
x
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
I
 
V
S
 
P
E
 
E
F
 
N
S
 
P
H
 
D
-
 
I
E
 
D
M
 
F
F
 
I
R
 
K
A
 
E
Y
 
I
A
 
A
D
 
Y
I
 
Q
L
 
L
N
 
T
S
 
K
L
 
V
R
 
S
D
 
E
E
 
D
H
 
H
D
 
E
L
 
V
F
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
R
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
G
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
F
G
 
N
A
 
S
S
 
S
E
 
E
A
 
T
R
 
F
C
 
K
D
|
D
D
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
V
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
R
D
 
E
S
 
K
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
V
 
V
P
 
V
E
 
E
N
 
D
F
 
F
R
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
W
E
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
Q
T
 
L
G
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
P
V
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
G
T
|
T
E
x
H
P
|
P
A
x
G
H
|
H
S
x
T
T
|
T
D
|
D
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
F
V
 
L
E
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
I
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
K
Y
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
K
Y
 
I
P
 
K
E
 
K
I
 
M
T
 
K
A
 
P
S
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
I
L
 
V
R
 
G
G
 
K
S
 
G
D
 
I
V
 
E
R
 
K
A
 
A
G
|
G
T
 
S
Y
 
S
E
x
S
F
 
V
F
 
I
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
A
H
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
G
G
 
K
N
 
E
D
 
D
P
 
A
E
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
F
R
 
R
A
 
V
L
 
I
D
 
K
G
 
G
E
 
D
-
 
H
I
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
E
P
 
P

2ji5A Structure of ump kinase from pyrococcus furiosus complexed with utp
43% identity, 100% coverage: 1:223/224 of query aligns to 3:219/219 of 2ji5A

query
sites
2ji5A
M
 
M
R
 
R
I
 
I
V
 
V
I
 
F
T
 
D
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
I
 
V
S
 
P
E
 
E
F
 
N
S
 
P
H
 
D
-
 
I
E
 
D
M
 
F
F
 
I
R
 
K
A
 
E
Y
 
I
A
 
A
D
 
Y
I
 
Q
L
 
L
N
 
T
S
 
K
L
 
V
R
 
S
D
 
E
E
 
D
H
 
H
D
 
E
L
 
V
F
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
P
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
G
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
F
G
 
N
A
 
S
S
 
S
E
 
E
A
 
T
R
 
F
C
 
K
D
|
D
D
 
F
I
 
I
G
|
G
I
|
I
D
 
Q
V
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
M
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
R
D
 
E
S
 
K
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
V
V
 
V
P
 
V
E
 
E
N
 
D
F
 
F
R
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
W
E
 
K
V
 
A
A
 
V
A
 
Q
T
 
L
G
 
K
R
 
K
I
 
I
V
 
P
V
 
V
M
 
M
G
 
G
G
|
G
T
|
T
E
x
H
P
 
P
A
 
G
H
|
H
S
x
T
T
|
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
F
V
 
L
E
 
K
A
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
I
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
K
K
 
K
Y
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
K
Y
 
I
P
 
K
E
 
K
I
 
M
T
 
K
A
 
P
S
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
-
L
 
I
R
 
V
G
 
G
S
 
K
D
 
S
V
 
V
R
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
F
 
-
F
 
I
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
A
H
 
K
M
 
I
I
 
I
R
 
A
R
 
R
S
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
G
G
 
K
N
 
E
D
 
D
P
 
A
E
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
F
R
 
R
A
 
V
L
 
I
D
 
K
G
 
G
E
 
D
-
 
H
I
 
N
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
E
P
 
P

Q97ZE2 Uridylate kinase; UK; Uridine monophosphate kinase; UMP kinase; UMPK; EC 2.7.4.22 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
39% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 40:224/227 of Q97ZE2

query
sites
Q97ZE2
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
 
G
G
|
G
G
 
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
 
G
T
x
F
E
x
Q
P
|
P
A
x
G
H
x
Q
S
|
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
R
K
 
I
Y
 
Y
P
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
K
F
 
L
Y
 
I
P
 
P
E
 
H
I
 
L
T
 
T
A
 
T
S
 
Q
E
 
D
M
 
L
L
 
R
E
 
K
H
 
I
L
 
L
R
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
-
 
S
V
 
V
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

2j4jF Crystal structure of uridylate kinase from sulfolobus solfataricus in complex with ump and amppcp to 2.1 angstrom resolution (see paper)
39% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 39:223/226 of 2j4jF

query
sites
2j4jF
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
|
G
I
|
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
|
G
T
 
F
E
x
Q
P
 
P
A
 
G
H
x
Q
S
|
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
|
T
S
x
N
V
|
V
D
 
D
G
 
G
F
x
V
Y
|
Y
D
 
E
R
 
K
D
|
D
P
|
P
A
x
R
K
 
I
Y
 
Y
P
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
K
F
 
L
Y
 
I
P
 
P
E
 
H
I
 
L
T
 
T
A
 
T
S
 
Q
E
 
D
M
 
L
L
 
R
E
 
K
H
 
I
L
 
L
R
 
E
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
-
 
S
V
 
V
R
 
Q
A
|
A
G
|
G
T
|
T
Y
|
Y
E
 
E
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2j4jA Crystal structure of uridylate kinase from sulfolobus solfataricus in complex with ump and amppcp to 2.1 angstrom resolution (see paper)
37% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 39:213/216 of 2j4jA

query
sites
2j4jA
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
|
G
I
|
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
|
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
x
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
|
G
T
x
F
E
x
Q
P
 
P
A
 
G
H
x
Q
S
|
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
|
T
S
x
N
V
|
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
|
Y
D
 
E
R
 
K
D
|
D
P
|
P
A
 
R
K
 
I
Y
 
Y
P
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
K
F
 
L
Y
 
I
P
 
P
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
H
L
 
L
R
 
T
G
 
T
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
K
G
 
I
T
 
L
Y
 
E
E
|
E
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2j4lA Crystal structure of uridylate kinase from sulfolobus solfataricus in complex with utp to 2.8 angstrom resolution (see paper)
37% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 39:211/214 of 2j4lA

query
sites
2j4lA
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
|
G
I
|
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
|
G
T
 
F
E
x
Q
P
 
P
A
 
G
H
x
Q
S
|
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
R
K
 
I
Y
 
Y
P
 
A
D
 
D
A
 
V
R
 
K
F
 
L
Y
 
I
P
 
P
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
H
L
 
L
R
 
T
G
 
T
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
K
G
 
-
T
 
-
Y
 
I
E
 
E
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

2j4kC Crystal structure of uridylate kinase from sulfolobus solfataricus in complex with ump to 2.2 angstrom resolution (see paper)
35% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 39:203/206 of 2j4kC

query
sites
2j4kC
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
|
G
I
|
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
F
E
x
Q
P
 
P
A
 
G
H
x
Q
S
 
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
R
K
 
I
Y
 
Y
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
I
E
 
P
H
 
H
L
 
L
R
 
T
G
 
T
S
 
Q
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

2j4lH Crystal structure of uridylate kinase from sulfolobus solfataricus in complex with utp to 2.8 angstrom resolution (see paper)
33% identity, 82% coverage: 39:222/224 of query aligns to 17:168/171 of 2j4lH

query
sites
2j4lH
V
 
I
V
 
V
V
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
S
P
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
R
Y
 
Y
I
|
I
G
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
I
S
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
C
 
L
D
|
D
D
 
L
I
 
L
G
 
G
I
|
I
D
 
W
V
 
A
T
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
A
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
V
I
 
M
T
 
F
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
A
Y
 
Y
P
 
M
G
 
H
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
N
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
F
L
 
I
E
 
Q
V
 
D
A
 
W
A
 
S
T
 
H
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
T
G
 
G
G
|
G
T
 
F
E
x
Q
P
 
P
A
 
G
H
x
Q
S
|
S
T
|
T
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
T
 
A
V
 
S
E
 
S
A
 
S
D
 
K
L
 
T
M
 
L
I
 
V
N
 
V
L
 
A
T
 
T
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
V
L
 
I
E
 
P
H
 
H
L
 
L
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
E
F
 
L
F
 
L
D
 
D
H
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
H
 
K
M
 
I
I
 
V
R
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
V
M
 
I
I
 
V
V
 
M
N
 
N
G
 
Y
N
 
R
D
 
K
P
 
L
E
 
N
N
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
E
G
 
V
T
 
S
T
 
S
V
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P0A7E9 Uridylate kinase; UK; Uridine monophosphate kinase; UMP kinase; UMPK; EC 2.7.4.22 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
30% identity, 83% coverage: 39:224/224 of query aligns to 53:241/241 of P0A7E9

query
sites
P0A7E9
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
 
N
P
 
L
A
 
F
R
|
R
D
 
G
Y
 
A
I
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
L
 
-
G
 
G
A
 
M
S
 
N
E
 
R
A
 
V
R
 
V
C
 
G
D
|
D
D
 
H
I
 
M
G
 
G
I
 
M
D
 
L
V
 
A
T
 
T
R
 
V
L
 
M
N
 
N
A
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
M
-
x
R
-
x
D
-
x
A
-
x
L
-
x
H
R
 
R
L
 
A
L
 
Y
I
 
V
T
x
N
A
|
A
L
x
R
G
 
L
D
 
M
S
 
S
A
 
A
Y
 
I
P
 
P
-
 
L
-
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
C
E
 
D
N
 
S
F
 
Y
R
 
S
-
 
W
-
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
S
V
 
L
A
 
L
A
 
R
T
 
N
G
 
N
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
I
M
 
L
-
 
S
-
 
A
G
 
G
G
x
T
T
x
G
E
x
N
P
|
P
A
x
F
H
x
F
S
x
T
T
|
T
D
|
D
A
 
S
V
 
A
G
 
A
A
 
C
I
 
L
L
 
R
A
 
G
E
 
I
T
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
A
D
|
D
L
 
V
M
 
V
I
 
L
N
 
K
L
 
A
T
 
T
S
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
V
Y
 
F
D
 
T
R
 
A
D
|
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
Y
 
D
P
 
P
D
 
T
A
 
A
R
 
T
F
 
M
Y
 
Y
P
 
E
E
 
Q
I
 
L
T
 
T
A
 
Y
S
 
S
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
K
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
E
Y
 
L
E
 
K
F
 
V
F
 
M
D
|
D
H
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
T
M
 
L
I
 
A
R
 
R
R
 
D
S
 
H
G
 
K
I
 
L
R
 
P
T
 
I
M
 
R
I
 
V
V
 
F
N
 
N
G
 
M
N
 
N
D
 
K
P
 
P
E
 
G
N
 
A
L
 
L
L
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
V
D
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
K
G
 
E
T
 
G
T
 
T
V
 
L
I
 
I
P
 
T
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4a7wA Crystal structure of uridylate kinase from helicobacter pylori (see paper)
29% identity, 78% coverage: 45:218/224 of query aligns to 58:220/226 of 4a7wA

query
sites
4a7wA
R
 
R
P
 
T
A
 
S
R
 
G
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
N
E
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
M
S
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
-
C
 
L
D
 
E
D
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
-
T
 
T
R
|
R
L
 
V
N
 
Q
A
 
S
R
 
A
L
 
I
L
 
E
I
 
I
T
x
K
A
x
E
L
x
I
G
x
C
D
x
E
S
 
S
A
 
Y
Y
 
I
P
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
Y
R
 
R
E
 
K
A
 
A
L
 
I
E
x
R
V
x
H
A
 
L
A
 
E
T
x
K
G
 
G
R
|
R
I
 
V
V
 
V
V
 
I
M
 
F
G
 
G
-
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
E
 
N
P
 
P
A
 
F
H
 
F
S
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
T
V
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
I
T
 
E
V
 
I
E
 
G
A
 
S
D
 
D
L
 
L
M
 
I
I
 
I
N
 
K
L
 
A
T
 
T
S
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
N
K
 
K
Y
 
F
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
K
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
K
L
 
L
E
 
D
H
 
T
L
 
L
R
 
S
G
 
Y
S
 
N
D
 
D
V
 
A
R
 
L
A
 
I
G
 
G
T
 
D
Y
 
I
E
 
E
F
 
V
F
 
M
D
 
D
H
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
H
 
S
M
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
D
S
 
N
G
 
K
I
 
L
R
 
P
T
 
I
M
 
V
I
 
V
V
 
C
N
 
N
G
 
M
N
 
F
D
 
K
P
 
K
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
L
 
I
D
 
K
G
 
H
E
 
Q
I
 
Q
G
 
G

4a7xC Crystal structure of uridylate kinase from helicobacter pylori (see paper)
29% identity, 78% coverage: 45:218/224 of query aligns to 66:228/234 of 4a7xC

query
sites
4a7xC
R
 
R
P
 
T
A
 
S
R
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
M
G
|
G
-
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
T
V
 
V
A
 
I
R
 
N
E
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
M
S
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
-
C
 
L
D
 
E
D
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
-
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
Q
A
 
S
R
 
A
L
 
I
L
 
E
I
 
I
T
 
K
A
 
E
L
 
I
G
 
C
D
 
E
S
 
S
A
 
Y
Y
 
I
P
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
Y
R
 
R
E
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
R
V
 
H
A
 
L
A
 
E
T
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
I
M
 
F
G
 
G
-
 
A
G
|
G
T
|
T
-
 
G
E
x
N
P
 
P
A
 
F
H
x
F
S
 
T
T
|
T
D
 
D
A
 
T
V
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
I
T
 
E
V
 
I
E
 
G
A
 
S
D
 
D
L
 
L
M
 
I
I
 
I
N
 
K
L
 
A
T
 
T
S
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
N
K
 
K
Y
 
F
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
K
F
 
-
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
M
 
K
L
 
L
E
 
D
H
 
T
L
 
L
R
 
S
G
 
Y
S
 
N
D
 
D
V
 
A
R
 
L
A
 
I
G
 
G
T
 
D
Y
 
I
E
 
E
F
 
V
F
 
M
D
 
D
H
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
H
 
S
M
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
D
S
 
N
G
 
K
I
 
L
R
 
P
T
 
I
M
 
V
I
 
V
V
 
C
N
 
N
G
 
M
N
 
F
D
 
K
P
 
K
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
L
 
I
D
 
K
G
 
H
E
 
Q
I
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7z5jB The molybdenum storage protein loaded with tungstate (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 37:264/267 of 7z5jB

query
sites
7z5jB
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
|
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
x
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
x
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
 
P
A
 
V
L
x
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
 
G
Y
x
L
P
 
S
G
 
A
V
|
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
F
T
x
S
G
 
G
-
x
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
x
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
x
R
T
|
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
 
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
x
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
x
L
Y
|
Y
D
 
T
R
 
A
D
x
N
P
 
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
x
D
G
x
S
T
x
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6rkeB Molybdenum storage protein - p212121, adp, molybdate (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 6rkeB

query
sites
6rkeB
V
 
V
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
|
G
G
x
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
|
R
D
 
H
Y
 
L
I
x
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
 
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
x
P
A
 
V
L
x
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
 
G
Y
 
L
P
x
S
G
 
A
V
|
V
P
|
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
x
F
T
 
S
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
 
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
x
R
T
|
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
|
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
x
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
x
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
x
L
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
x
N
P
|
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
x
D
G
x
S
T
x
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6rkdB Molybdenum storage protein under turnover conditions (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 6rkdB

query
sites
6rkdB
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
Q
I
 
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
 
G
G
x
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
|
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
x
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
x
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
x
P
A
 
V
L
x
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
 
G
Y
 
L
P
x
S
G
 
A
V
|
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
x
F
T
x
S
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
x
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
x
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
|
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
x
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
x
D
V
x
E
D
 
D
G
 
G
F
x
L
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
x
N
P
|
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
x
D
G
 
S
T
x
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6h8hB Molybdenum storage protein - in a recombinant and in vivo-like form (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 6h8hB

query
sites
6h8hB
V
 
V
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
I
 
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
x
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
 
P
A
 
V
L
 
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
 
G
Y
 
L
P
x
S
G
 
A
V
|
V
P
|
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
x
F
T
 
S
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
x
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
|
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
x
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
 
K
S
 
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
L
Y
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
N
P
 
P
A
 
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
D
G
 
S
T
 
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6h8bB Molybdenum storage protein prepared under in vivo-like conditions and incubated with atp and molybdate at 303 k (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 6h8bB

query
sites
6h8bB
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
 
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
|
G
G
x
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
|
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
x
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
x
P
A
 
V
L
x
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
x
G
Y
x
L
P
 
S
G
 
A
V
|
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
F
T
x
S
G
 
G
-
x
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
x
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
x
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
x
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
 
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
L
Y
 
Y
D
 
T
R
 
A
D
 
N
P
 
P
A
 
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
D
G
 
S
T
 
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6gx4B The molybdenum storage protein: with atp/mn2+ and with pom clusters formed under in vitro conditions (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 6gx4B

query
sites
6gx4B
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
 
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
 
P
A
 
V
L
 
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
x
G
Y
x
L
P
x
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
F
T
 
S
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
x
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
 
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
x
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
L
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
x
N
P
|
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
x
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
D
G
x
S
T
x
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
x
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
x
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

4f6tB The crystal structure of the molybdenum storage protein (mosto) from azotobacter vinelandii loaded with various polyoxometalates (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 38:265/268 of 4f6tB

query
sites
4f6tB
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
|
G
G
 
A
G
|
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
 
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
 
P
A
 
V
L
 
V
G
|
G
D
x
G
S
x
A
A
 
G
Y
 
L
P
 
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
x
F
T
x
S
G
 
G
-
x
M
-
 
P
-
x
P
-
 
Y
R
 
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
|
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
x
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
x
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
L
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
x
N
P
|
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
D
G
x
S
T
x
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
 
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

6rj4B Molybdenum storage protein - p6422, adp (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:221/224 of query aligns to 39:266/269 of 6rj4B

query
sites
6rj4B
V
 
V
I
 
I
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
x
Q
I
x
S
I
 
V
I
 
I
S
 
D
E
 
R
F
 
G
S
 
R
H
 
A
E
 
A
M
 
V
F
 
Y
R
 
P
A
 
L
Y
 
V
A
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
S
 
A
L
 
-
R
 
R
D
 
K
E
 
N
H
 
H
D
 
K
L
 
L
F
 
L
V
 
I
V
 
G
V
 
T
G
 
G
G
x
A
G
 
G
R
 
T
P
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
H
Y
 
L
I
 
Y
G
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
S
 
P
E
 
A
A
 
G
R
 
V
C
 
L
D
 
A
D
 
Q
I
 
L
G
 
G
I
 
S
D
 
S
V
 
V
T
 
A
R
 
D
L
 
Q
N
 
N
A
 
A
R
 
A
L
 
M
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
I
 
I
T
 
P
A
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
G
S
 
A
A
 
G
Y
 
L
P
 
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
L
N
 
S
F
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
N
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
F
T
 
S
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
Y
R
 
K
I
 
L
V
 
W
V
 
M
M
 
R
G
 
P
G
 
A
T
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
I
P
 
P
A
 
P
H
 
Y
S
x
R
T
|
T
D
 
D
A
 
A
V
 
G
G
 
C
A
 
F
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
Q
V
 
F
E
 
G
A
 
C
D
 
K
L
 
Q
M
 
M
I
 
I
N
 
F
L
 
V
T
x
K
S
 
D
V
 
E
D
 
D
G
 
G
F
x
L
Y
|
Y
D
 
T
R
x
A
D
x
N
P
|
P
A
x
K
K
 
T
Y
 
S
P
 
K
D
 
D
A
 
A
R
 
T
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
E
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
V
S
 
D
E
 
E
M
 
M
L
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
K
G
 
A
S
 
K
D
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
D
G
x
S
T
 
I
Y
 
L
E
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
D
F
 
L
D
 
L
H
 
Q
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
H
 
H
M
 
-
I
 
V
R
|
R
R
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
E
T
 
V
M
 
Q
I
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
L
D
 
V
P
 
P
E
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
E
 
E
-
 
H
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_010876512.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010876512.1
MRIVITIGGSIIISEFSHEMFRAYADILNSLRDEHDLFVVVGGGRPARDYIGVARELGAS
EARCDDIGIDVTRLNARLLITALGDSAYPGVPENFREALEVAATGRIVVMGGTEPAHSTD
AVGAILAETVEADLMINLTSVDGFYDRDPAKYPDARFYPEITASEMLEHLRGSDVRAGTY
EFFDHTALHMIRRSGIRTMIVNGNDPENLLRALDGEIGTTVIPE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory