SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010877025.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010877025.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
57% identity, 95% coverage: 4:300/312 of query aligns to 6:304/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
N
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
R
D
 
D
F
 
F
K
 
S
R
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
E
 
E
F
 
T
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
R
M
 
L
E
 
E
P
 
R
F
 
E
A
 
L
S
 
K
G
 
E
E
 
K
K
 
G
S
 
Q
S
 
L
S
 
E
A
 
Y
L
 
A
R
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
M
 
T
M
 
L
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
S
A
 
A
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
D
 
E
T
 
A
G
 
S
A
 
T
T
 
S
S
 
S
A
 
V
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
R
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
K
M
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
M
 
I
K
 
K
R
 
K
F
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
D
S
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
F
F
 
Y
G
 
D
A
 
V
S
 
E
M
 
L
S
 
Y
F
 
L
V
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
E
V
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
R
N
 
H
I
 
I
I
 
V
H
 
E
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
M
E
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
T
 
T
E
 
T
R
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
G
E
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
P
 
E
E
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
L
R
 
K
I
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
H
 
Q
I
 
V
D
 
N
G
 
L
S
 
K
T
 
V
V
 
L
-
 
E
-
 
K
A
 
A
D
 
K
R
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
R
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
S
 
N
L
 
T
P
 
K
Q
 
H
A
 
A
M
 
I
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
F
 
F
Y
 
N
G
|
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
58% identity, 96% coverage: 3:302/312 of query aligns to 2:302/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
E
 
K
N
 
H
V
 
L
I
 
I
S
 
S
I
 
M
K
 
K
D
 
D
F
 
I
K
 
G
R
 
K
E
 
E
D
 
E
I
 
I
E
 
L
F
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
R
K
 
K
M
 
M
E
 
E
P
 
E
F
 
L
A
 
L
S
 
N
G
 
T
E
 
K
K
 
R
S
 
P
S
 
L
S
 
K
A
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
M
 
T
M
 
V
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
A
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
I
G
 
T
F
 
M
A
 
T
D
 
D
T
 
L
G
 
K
A
 
S
T
 
S
S
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
R
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
G
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
N
 
P
L
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
S
D
 
E
V
 
Y
V
 
S
D
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
M
 
I
K
 
M
R
 
R
F
 
E
F
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
D
S
 
G
L
 
I
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
L
F
 
F
-
 
E
G
 
N
A
 
V
S
 
E
M
 
M
S
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
K
V
 
E
L
 
L
R
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
K
N
 
D
I
 
I
I
 
I
H
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
K
G
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
F
K
 
Y
E
 
E
T
 
K
E
 
E
R
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
D
D
 
D
E
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
N
E
 
E
Y
 
Y
S
 
E
R
 
K
I
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
H
 
K
I
 
I
D
 
K
G
 
R
S
 
E
T
 
Y
V
 
V
A
 
E
D
 
G
R
 
K
D
 
K
L
 
F
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
D
P
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
D
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
M
 
K
Y
 
Y
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
Y
 
Y
G
|
G
V
 
I
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
L
R
 
K
L
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
E
E
 
D

2ipoA E. Coli aspartate transcarbamoylase complexed with n-phosphonacetyl-l- asparagine (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2ipoA

query
sites
2ipoA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2h3eA Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of n-phosphonacetyl-l-isoasparagine at 2.3a resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2h3eA

query
sites
2h3eA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2fzkA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.50 resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2fzkA

query
sites
2fzkA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2fzgA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.25 resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2fzgA

query
sites
2fzgA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2fzcA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.10 resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2fzcA

query
sites
2fzcA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2airA T-state active site of aspartate transcarbamylase:crystal structure of the carbamyl phosphate and l-alanosine ligated enzyme (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2airA

query
sites
2airA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

1za2A Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of ctp, carbamoyl phosphate at 2.50 a resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 1za2A

query
sites
1za2A
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

1r0cA Products in the t state of aspartate transcarbamylase: crystal structure of the phosphate and n-carbamyl-l-aspartate ligated enzyme (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 1r0cA

query
sites
1r0cA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

1r0bA Aspartate transcarbamylase (atcase) of escherichia coli: a new crystalline r state bound to pala, or to product analogues phosphate and citrate (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 1r0bA

query
sites
1r0bA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
|
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral ph (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2at1A

query
sites
2at1A
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
Q
F
 
T
F
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

1at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral p H (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 1at1A

query
sites
1at1A
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
Q
F
 
T
F
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
46% identity, 95% coverage: 3:299/312 of query aligns to 1923:2220/2225 of P20054

query
sites
P20054
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
F
S
 
S
I
 
V
K
 
K
D
 
Q
F
 
F
K
 
N
R
 
R
E
 
K
D
 
Q
I
 
L
E
 
H
F
 
A
I
 
L
L
 
F
R
 
G
E
 
I
A
 
A
E
 
H
K
 
E
M
 
M
E
 
R
P
 
I
F
 
L
A
 
V
S
 
K
G
 
R
E
 
S
K
 
G
S
 
G
S
 
S
S
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
A
M
 
T
M
 
L
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
L
 
C
S
 
S
F
 
F
E
 
T
T
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
T
F
 
-
A
 
V
D
 
D
T
 
N
G
 
V
A
 
S
T
 
S
S
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
Q
M
 
T
L
 
L
S
 
E
A
 
S
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
C
I
 
M
R
 
R
H
 
H
N
 
P
L
 
A
E
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
V
R
 
E
Y
 
S
I
 
A
S
 
I
D
 
Q
V
 
V
V
 
A
D
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
V
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
R
R
 
E
F
 
E
F
 
L
G
 
G
R
 
T
I
 
V
G
 
N
S
 
G
L
 
L
R
 
T
V
 
I
A
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
 
R
A
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
N
F
 
Y
G
 
Q
A
 
V
S
 
K
M
 
I
S
 
N
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
S
V
 
S
L
 
L
R
 
S
M
 
M
P
 
P
D
 
T
N
 
E
I
 
I
I
 
I
H
 
K
D
 
E
L
 
L
R
 
N
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
Q
K
 
K
E
 
E
T
 
Y
E
 
T
R
 
N
L
 
I
D
 
E
D
 
S
V
 
I
I
 
L
D
 
P
E
 
T
V
 
T
D
 
N
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
Q
D
 
S
P
 
I
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
S
 
E
R
 
K
I
 
V
R
 
K
G
 
D
A
 
S
Y
 
F
H
 
I
I
 
I
D
 
T
G
 
P
S
 
H
T
 
T
V
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
D
 
S
R
 
D
D
 
N
L
 
M
I
 
I
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
I
D
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
D
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
F
 
E
Y
 
N
G
 
G
V
 
L
P
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A786 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 8:306/311 of P0A786

query
sites
P0A786
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
 
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

Sites not aligning to the query:

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
|
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
A
D
 
-
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
|
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

2a0fA Structure of d236a mutant e. Coli aspartate transcarbamoylase in presence of phosphonoacetamide at 2.90 a resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 2a0fA

query
sites
2a0fA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
A
D
 
-
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

5vmqC Structure of the r105a mutant catalytic trimer of escherichia coli aspartate transcarbamoylase at 2.0-a resolution (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/309 of 5vmqC

query
sites
5vmqC
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
x
A
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
E
F
 
T
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
x
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
x
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

1acmA Arginine 54 in the active site of escherichia coli aspartate transcarbamoylase is critical for catalysis: a site-specific mutagenesis, nmr and x-ray crystallography study (see paper)
47% identity, 96% coverage: 3:301/312 of query aligns to 7:305/310 of 1acmA

query
sites
1acmA
E
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
K
 
N
D
 
D
F
 
L
K
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
I
 
L
E
 
N
F
 
L
I
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
F
 
N
A
 
P
S
 
Q
G
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
H
K
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
M
 
S
M
 
C
F
 
F
Y
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
x
A
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
T
 
T
A
 
S
M
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
D
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
S
D
 
D
T
 
S
G
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
S
-
 
L
A
 
G
V
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
S
M
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
P
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
I
 
A
S
 
T
D
 
E
V
 
F
V
 
S
-
 
G
D
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
G
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
Q
F
 
T
F
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
D
S
 
N
L
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
T
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
-
 
D
G
 
G
A
 
N
S
 
R
M
 
F
S
 
Y
F
 
F
V
 
I
S
 
A
P
 
P
P
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
D
D
 
M
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
A
V
 
W
K
 
S
E
 
L
T
 
H
E
 
S
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
S
 
A
R
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
Q
Y
 
F
H
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
A
S
 
S
T
 
D
V
 
L
-
 
H
-
 
N
A
 
A
D
 
K
R
 
A
D
 
N
L
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
A
P
 
T
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
K
L
 
T
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
M
 
W
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
F
 
G
Y
 
N
G
|
G
V
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
A
L
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
N

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
48% identity, 96% coverage: 2:300/312 of query aligns to 84:387/390 of P49077

query
sites
P49077
F
 
L
E
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
E
I
 
G
K
 
K
D
 
Q
F
 
F
K
 
D
R
 
R
E
 
E
D
 
M
I
 
L
E
 
S
F
 
A
I
 
I
L
 
F
R
 
D
E
 
V
A
 
A
E
 
R
K
 
E
M
 
M
E
 
E
P
 
K
F
 
I
A
 
E
S
 
K
G
 
S
E
 
S
K
 
S
S
 
Q
S
 
S
S
 
E
A
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
M
 
T
M
 
L
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
S
A
 
A
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
L
G
 
T
F
 
T
A
 
E
D
 
N
T
 
A
G
 
R
A
 
E
-
 
F
T
 
S
S
 
S
A
 
A
V
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
M
 
R
M
 
T
L
 
V
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
F
L
 
E
E
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
I
 
A
S
 
A
D
 
A
V
 
T
V
 
A
D
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
T
 
T
M
 
I
K
 
Q
R
 
S
F
 
E
F
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
D
S
 
G
L
 
I
R
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
K
F
 
F
G
 
K
-
 
D
A
 
V
S
 
K
M
 
I
S
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
E
V
 
I
L
 
V
R
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
N
 
D
I
 
I
I
 
K
H
 
D
D
 
Y
L
 
L
R
 
T
R
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
W
K
 
E
E
 
E
T
 
S
E
 
S
R
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
E
V
 
V
I
 
A
D
 
S
E
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
V
 
Q
T
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
D
 
E
P
 
R
-
 
L
E
 
D
E
 
L
Y
 
Y
S
 
E
R
 
A
I
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
K
Y
 
Y
H
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
K
S
 
D
T
 
L
-
 
L
-
 
G
V
 
V
A
 
M
D
 
Q
R
 
K
D
 
K
L
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
P
 
A
E
 
D
V
 
V
D
 
D
S
 
A
L
 
D
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
F
 
K
Y
 
N
G
 
G
V
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
L

Query Sequence

>WP_010877025.1 NCBI__GCF_000008645.1:WP_010877025.1
MFENVISIKDFKREDIEFILREAEKMEPFASGEKSSSALRGKILGMMFYEPSTRTRLSFE
TAMKRLGGDVVGFADTGATSAVKGESLADTAMMLSAYSDAIVIRHNLEGAARYISDVVDV
PVINAGDGAGQHPTQTLLDLYTMKRFFGRIGSLRVALVGDLKYGRTVHSLAYALAVFGAS
MSFVSPPVLRMPDNIIHDLRRAGVEVKETERLDDVIDEVDVLYVTRIQKERFPDPEEYSR
IRGAYHIDGSTVADRDLIVMHPLPRIDEISPEVDSLPQAMYFRQAFYGVPVRMALLRLLI
SERRGSENQKIV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory