SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010959663.1 NCBI__GCF_000008325.1:WP_010959663.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
70% identity, 96% coverage: 27:619/619 of query aligns to 1:562/563 of 6damA

query
sites
6damA
N
 
N
A
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
A
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
A
N
 
N
F
 
W
A
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
A
 
H
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
T
K
 
S
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
V
 
V
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
D
 
D
Q
 
Q
A
 
K
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
I
 
I
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
V
 
T
Y
 
-
A
 
-
P
 
P
D
 
Q
K
 
Q
G
 
D
T
 
A
D
 
D
Q
 
V
S
 
T
Q
 
-
V
 
-
I
 
I
S
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
A
 
T
T
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
R
V
 
V
W
 
W
K
 
S
V
 
V
K
 
Q
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
T
A
 
N
T
|
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
K
 
R
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
D
W
 
W
K
 
K
K
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
A
E
 
D
V
 
T
G
 
L
L
 
I
D
 
N
P
 
P
E
 
T
H
 
K
T
 
T
M
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
V
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
T
K
 
S
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
S
I
 
L
W
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
V
M
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
Q
 
Q
E
 
E
M
 
I
T
 
K
A
 
G
K
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
Q
H
 
M
S
 
R
K
 
K
L
 
T
L
 
A
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
M
 
M
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
N
 
V
P
 
S
K
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
H
 
Y
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
N
T
 
T
K
 
E
G
 
G
I
 
V
C
 
C
P
 
P
S
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
S
K
 
K
N
|
N
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
S
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
R
 
Q
T
 
T
K
 
G
L
 
Y
I
 
F
Y
 
Y
I
 
I
P
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
T
 
V
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
S
I
 
M
F
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
G
A
 
K
N
 
D
V
 
V
K
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
E
E
 
D
S
 
G
S
 
S
N
 
N
H
 
N
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
F
T
 
T
A
 
A
W
 
W
D
 
D
P
 
A
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
I
W
 
W
Q
 
S
F
 
N
D
 
K
E
 
E
P
 
Q
F
 
F
S
 
S
L
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
M
 
S
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
N
T
 
T
W
 
W
T
 
E
Y
 
Y
N
 
E
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
S
G
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
Y
T
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
T
F
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P

C5B120 Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase; Lanthanide-dependent MDH; Ln(3+)-dependent MDH; La(3+)- and PQQ-dependent MDH; La(3+)-dependent methanol dehydrogenase; La(3+)-dependent MDH; EC 1.1.2.10 from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see 2 papers)
61% identity, 96% coverage: 24:619/619 of query aligns to 19:599/601 of C5B120

query
sites
C5B120
S
x
A
F
x
L
A
|
A
N
 
N
A
 
E
E
 
S
V
 
V
E
 
L
A
 
K
L
 
G
T
 
V
K
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
A
N
 
E
F
 
Q
A
 
V
T
 
L
W
 
Q
G
 
T
G
 
V
N
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
K
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
A
K
 
S
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
Q
P
 
V
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
N
V
 
I
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
I
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
Q
 
D
A
 
Q
T
 
G
Q
 
A
S
 
K
V
 
I
I
 
V
W
 
W
E
 
K
Y
 
Y
V
 
E
Y
 
P
A
 
K
P
 
Q
D
 
D
K
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
P
Q
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
P
V
 
V
M
 
M
C
 
C
C
 
C
D
 
D
V
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
A
I
 
I
F
 
L
L
 
L
A
 
H
Q
 
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
N
W
 
W
K
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
S
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
N
T
|
T
N
 
A
A
 
T
P
 
V
L
 
L
V
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
G
 
C
F
 
H
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
L
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
K
V
 
V
W
 
W
K
 
R
K
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
G
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
H
 
K
T
 
T
M
 
T
T
 
S
W
 
L
T
 
-
D
 
-
G
 
G
K
 
K
M
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
V
 
K
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
L
I
 
T
D
 
D
Q
 
Q
E
 
K
M
 
F
T
 
D
A
 
G
K
 
K
D
 
D
G
 
-
S
 
-
K
 
-
H
 
-
S
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
F
D
 
D
K
 
P
A
 
V
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
D
T
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
N
 
V
P
 
S
K
 
K
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
H
 
Q
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
N
T
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
T
K
 
K
N
 
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
A
T
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
H
T
 
V
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
R
V
 
V
E
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
S
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
 
P
A
 
G
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
S
S
 
H
N
 
G
H
 
G
M
 
M
G
 
G
S
 
N
F
 
F
T
 
I
A
 
A
W
 
W
D
 
D
P
 
N
T
 
L
T
 
Q
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
W
 
W
Q
 
S
F
 
N
D
 
P
E
 
E
P
 
Q
F
 
F
S
 
S
L
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
A
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
S
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
E
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
I
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
D
D
 
P
T
 
N
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
K
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
Y
T
 
T
K
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
F
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6oc6A Lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylobacterium extorquens, in complex with lanthanum and pyrroloquinoline quinone (see paper)
62% identity, 93% coverage: 46:619/619 of query aligns to 20:578/579 of 6oc6A

query
sites
6oc6A
N
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
K
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
A
K
 
S
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
Q
P
 
V
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
N
V
 
I
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
I
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
Q
 
D
A
 
Q
T
 
G
Q
 
A
S
 
K
V
 
I
I
 
V
W
 
W
E
 
K
Y
 
Y
V
 
E
Y
 
P
A
 
K
P
 
Q
D
 
D
K
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
P
Q
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
P
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
A
I
 
I
F
 
L
L
 
L
A
 
H
Q
 
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
N
W
 
W
K
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
S
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
N
T
|
T
N
 
A
A
 
T
P
 
V
L
 
L
V
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
G
 
C
F
 
H
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
L
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
K
V
 
V
W
 
W
K
 
R
K
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
I
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
G
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
H
 
K
T
 
T
M
 
T
T
 
S
W
 
L
T
 
-
D
 
-
G
 
G
K
 
K
M
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
S
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
P
V
 
K
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
N
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
L
I
 
T
D
 
D
Q
 
Q
E
 
K
M
 
F
T
 
D
A
 
G
K
 
K
D
 
D
G
 
-
S
 
-
K
 
-
H
 
-
S
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
F
D
 
D
K
 
P
A
 
V
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
D
T
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
L
V
 
V
N
 
V
P
 
S
K
 
K
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
H
 
Q
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
N
T
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
A
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
T
K
 
K
N
x
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
A
T
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
H
T
 
V
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
R
V
 
V
E
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
S
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
 
P
A
 
G
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
S
S
 
H
N
 
G
H
 
G
M
 
M
G
 
G
S
 
N
F
 
F
T
 
I
A
 
A
W
 
W
D
 
D
P
 
N
T
 
L
T
 
Q
G
 
G
T
 
K
I
 
I
A
 
K
W
 
W
Q
 
S
F
 
N
D
 
P
E
 
E
P
 
Q
F
 
F
S
 
S
L
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
A
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
S
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
E
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
H
I
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
T
G
 
D
D
 
P
T
 
N
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
K
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
Y
T
 
T
K
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
F
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L
P
 
P

7ce5A Methanol-pqq bound methanol dehydrogenase (mdh) from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
50% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:573/573 of 7ce5A

query
sites
7ce5A
N
 
N
A
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
D
A
 
R
L
 
L
T
 
S
K
 
K
D
 
D
P
 
D
K
 
R
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
Q
G
 
T
G
 
K
N
 
D
Y
 
Y
A
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
T
 
R
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
F
 
S
K
 
H
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
K
P
 
V
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
D
D
 
G
V
 
I
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
-
 
L
Q
 
N
A
 
D
T
 
T
Q
 
R
S
 
K
V
 
M
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
Y
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
G
 
G
D
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
N
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
E
V
 
I
W
 
W
K
 
K
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
A
T
 
M
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
Q
V
 
E
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
D
W
 
N
T
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
K
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
M
 
G
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
T
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
L
S
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
E
 
F
K
 
K
F
 
I
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
I
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
N
T
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
I
V
 
E
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
D
T
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
F
Y
 
F
I
 
M
P
 
G
G
 
V
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
P
A
 
K
N
 
G
V
 
M
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
V
T
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
P
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
M
A
 
E
W
 
W
Q
 
E
F
 
V
D
 
P
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
A
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
T
K
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
K
Y
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
Y
T
 
Q
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
H
H
 
Y
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
S
F
 
V
T
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

7cdlC Holo-methanol dehydrogenase (mdh) with cys131-cys132 reduced from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
50% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:573/573 of 7cdlC

query
sites
7cdlC
N
 
N
A
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
D
A
 
R
L
 
L
T
 
S
K
 
K
D
 
D
P
 
D
K
 
R
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
Q
G
 
T
G
 
K
N
 
D
Y
 
Y
A
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
H
Y
 
F
S
 
S
T
 
R
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
I
 
I
N
 
N
F
 
S
K
 
H
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
L
Q
 
K
P
 
V
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
T
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
D
D
 
G
V
 
I
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
-
 
L
Q
 
N
A
 
D
T
 
T
Q
 
R
S
 
K
V
 
M
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
Y
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
H
G
 
G
D
 
P
G
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
N
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
E
V
 
I
W
 
W
K
 
K
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
A
T
 
M
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
x
A
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
Q
V
 
E
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
D
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
D
W
 
N
T
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
K
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
K
 
S
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
Y
M
 
M
M
 
G
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
T
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
L
S
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
L
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
N
A
 
A
E
 
F
K
 
K
F
 
I
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
I
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
N
T
 
A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
I
V
 
E
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
D
T
 
K
K
 
K
L
 
L
I
 
F
Y
 
F
I
 
M
P
 
G
G
 
V
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
P
A
 
K
N
 
G
V
 
M
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
V
T
 
K
A
 
A
W
 
M
D
 
N
P
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
M
A
 
E
W
 
W
Q
 
E
F
 
V
D
 
P
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
A
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
T
K
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
K
Y
 
W
R
 
Q
F
 
F
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
Y
T
 
Q
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
H
H
 
Y
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
S
F
 
V
T
 
F
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

6fkwA Europium-containing methanol dehydrogenase (see paper)
51% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:576/576 of 6fkwA

query
sites
6fkwA
N
 
N
A
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
I
A
 
K
L
 
L
T
 
E
K
 
K
D
 
E
P
 
P
K
 
G
N
 
Q
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
Q
G
 
N
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
T
K
 
K
N
 
N
A
 
V
K
 
S
H
 
R
L
 
L
Q
 
R
P
 
L
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
T
V
 
T
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
S
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
H
 
N
K
 
H
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
T
T
 
Q
Q
 
K
S
 
P
V
 
Y
I
 
A
W
 
I
E
 
K
Y
 
W
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
T
P
 
P
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
V
D
 
Q
Q
 
N
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
A
 
T
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
Q
L
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
K
V
 
M
K
 
K
N
 
H
G
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
T
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
I
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
R
L
 
V
A
 
G
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
R
V
 
V
W
 
W
K
 
L
K
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
E
W
 
F
T
 
P
D
 
Q
G
 
H
K
 
G
M
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
K
 
P
D
 
G
S
 
D
S
 
G
L
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
V
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
L
I
 
P
D
 
D
Q
 
-
E
 
-
M
 
L
T
 
T
A
 
V
K
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
G
K
 
K
H
 
K
S
 
T
K
 
P
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
E
 
Q
K
 
P
F
 
F
D
 
-
K
 
V
A
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
K
H
 
E
V
 
I
D
 
S
M
 
K
K
 
E
T
 
N
G
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
N
 
I
P
 
P
K
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
Q
 
K
H
 
Q
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
N
A
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
x
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
A
T
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
R
 
Q
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
N
T
 
M
C
 
C
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
N
 
L
I
 
M
F
 
Y
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
S
G
 
G
E
 
H
K
 
E
E
 
G
S
 
K
S
 
D
N
 
D
H
 
Y
M
 
Y
G
 
G
S
 
A
F
 
F
T
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
P
 
A
T
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
R
A
 
V
W
 
W
Q
 
E
F
 
I
D
 
H
E
 
E
P
 
H
F
 
F
S
 
P
L
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
M
 
P
V
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
I
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
F
T
 
L
-
 
G
Y
 
P
N
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
V
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
E
 
P
G
 
P
D
 
D
T
 
D
-
 
P
-
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
Q
-
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
P
S
 
K
H
 
A
T
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
E
F
 
L
T
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
A
L
 
L

4maeA Methanol dehydrogenase from methylacidiphilum fumariolicum solv (see paper)
51% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:576/577 of 4maeA

query
sites
4maeA
N
 
N
A
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
I
A
 
K
L
 
L
T
 
E
K
 
K
D
 
E
P
 
P
K
 
G
N
 
Q
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
Q
G
 
N
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
T
K
 
K
N
 
N
A
 
V
K
 
S
H
 
R
L
 
L
Q
 
R
P
 
L
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
T
V
 
T
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
S
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
H
 
N
K
 
H
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
A
 
T
T
 
Q
Q
 
K
S
 
P
V
 
Y
I
 
A
W
 
I
E
 
K
Y
 
W
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
T
P
 
P
D
 
-
K
 
-
G
 
-
T
 
V
D
 
Q
Q
 
N
S
 
S
Q
 
Q
V
 
A
I
 
V
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
M
A
 
T
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
Q
L
 
I
V
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
K
V
 
M
K
 
K
N
 
H
G
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
T
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
I
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
R
L
 
V
A
 
G
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
R
V
 
V
W
 
W
K
 
L
K
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
K
T
 
E
W
 
F
T
 
P
D
 
Q
G
 
H
K
 
G
M
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
K
 
P
D
 
G
S
 
D
S
 
G
L
 
T
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
P
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
W
 
W
K
 
K
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
T
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
G
 
S
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
T
W
 
W
N
 
N
P
 
A
V
 
E
Q
 
Q
R
 
R
P
 
K
-
 
G
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
R
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
W
D
 
D
E
 
S
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
L
I
 
P
D
 
D
Q
 
-
E
 
-
M
 
L
T
 
T
A
 
V
K
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
G
K
 
K
H
 
K
S
 
T
K
 
P
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
L
 
I
V
 
E
A
 
A
E
 
Q
K
 
P
F
 
F
D
 
-
K
 
V
A
 
Y
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
K
H
 
E
V
 
I
D
 
S
M
 
K
K
 
E
T
 
N
G
 
D
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
N
 
I
P
 
P
K
 
E
Y
 
K
S
 
R
T
 
T
Q
 
K
H
 
Q
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
T
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
N
A
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
x
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
A
T
 
A
Y
 
F
S
 
S
P
 
P
R
 
Q
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
N
T
 
M
C
 
C
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
F
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
N
 
L
I
 
M
F
 
Y
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
S
G
 
G
E
 
H
K
 
E
E
 
G
S
 
K
S
 
D
N
 
D
H
 
Y
M
 
Y
G
 
G
S
 
A
F
 
F
T
 
I
A
 
C
W
 
Y
D
 
D
P
 
A
T
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
R
A
 
V
W
 
W
Q
 
E
F
 
I
D
 
H
E
 
E
P
 
H
F
 
F
S
 
P
L
 
V
W
|
W
S
 
S
G
 
G
M
 
P
V
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
M
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
I
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
F
T
 
L
-
 
G
Y
 
P
N
 
D
G
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
F
G
 
G
V
 
I
G
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
L
 
L
E
 
P
G
 
P
D
 
D
T
 
D
-
 
P
-
 
Y
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
V
A
 
A
Y
 
Y
K
 
Q
-
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
P
S
 
K
H
 
A
T
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
E
F
 
L
T
 
Y
V
 
V
F
 
F
A
 
A
L
 
L

P16027 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see 3 papers)
49% identity, 96% coverage: 24:618/619 of query aligns to 25:607/626 of P16027

query
sites
P16027
S
x
A
F
x
Y
A
|
A
N
 
N
A
 
D
E
 
K
V
 
L
E
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
S
K
 
K
D
 
S
P
 
D
K
 
D
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
P
G
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
D
G
 
S
T
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
S
T
 
D
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
G
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
L
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
D
D
 
G
V
 
K
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
G
-
 
L
Q
 
D
A
 
D
T
 
P
Q
 
G
S
 
T
V
 
I
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
D
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
K
A
 
T
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
N
L
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
V
 
V
W
 
W
K
 
K
V
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
 
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
I
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
V
K
 
K
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
Q
V
 
V
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
A
P
 
S
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
I
T
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
N
A
 
P
P
 
H
V
 
Y
G
 
G
-
 
Q
K
 
K
D
 
G
S
 
L
S
 
G
L
 
T
K
 
G
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
G
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
A
S
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
D
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
E
 
N
K
 
K
F
 
L
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
T
 
K
H
 
S
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
L
T
 
A
K
 
K
G
 
D
I
 
I
C
|
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
 
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
H
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
R
K
 
E
L
 
L
I
 
F
Y
 
F
I
 
M
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
|
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
P
T
 
K
G
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
Q
S
 
N
S
 
Y
N
 
E
H
 
G
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
P
 
A
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
D
I
 
Y
A
 
K
W
 
W
Q
 
E
F
 
K
D
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
A
L
 
V
W
 
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
S
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
A
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
T
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
K
L
 
L
S
 
A
S
 
N
H
 
Y
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
V
T
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1w6sC The high resolution structure of methanol dehydrogenase from methylobacterium extorquens (see paper)
49% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:580/596 of 1w6sC

query
sites
1w6sC
N
 
N
A
 
D
E
 
K
V
 
L
E
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
S
K
 
K
D
 
S
P
 
D
K
 
D
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
P
G
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
D
G
 
S
T
 
N
R
 
N
Y
 
F
S
 
S
T
 
D
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
G
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
T
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
L
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
D
D
 
G
V
 
K
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
G
-
 
L
Q
 
D
A
 
D
T
 
P
Q
 
G
S
 
T
V
 
I
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
D
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
L
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
K
A
 
T
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
N
L
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
V
 
V
W
 
W
K
 
K
V
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
|
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
V
K
 
K
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
Q
V
 
V
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
A
P
 
S
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
I
T
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
N
A
 
P
P
 
H
V
 
Y
G
 
G
-
 
Q
K
 
K
D
 
G
S
 
L
S
 
G
L
 
T
K
 
G
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
G
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
A
S
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
D
G
 
G
E
 
A
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
E
 
N
K
 
K
F
 
L
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
T
 
K
H
 
S
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
L
T
 
A
K
 
K
G
 
D
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
H
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
R
K
 
E
L
 
L
I
 
F
Y
 
F
I
 
M
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
N
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
P
T
 
K
G
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
Q
S
 
N
S
 
Y
N
 
E
H
 
G
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
P
 
A
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
D
I
 
Y
A
 
K
W
 
W
Q
 
E
F
 
K
D
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
A
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
S
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
A
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
T
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
K
L
 
L
S
 
A
S
 
N
H
 
Y
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
V
T
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

P12293 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Paracoccus denitrificans (see 2 papers)
46% identity, 98% coverage: 10:618/619 of query aligns to 18:611/631 of P12293

query
sites
P12293
I
x
V
A
|
A
S
x
M
S
x
G
I
x
L
A
|
A
S
x
V
L
|
L
L
x
T
A
x
T
V
x
A
P
|
P
G
x
A
V
x
T
S
 
-
F
 
-
A
|
A
N
 
N
A
 
D
E
 
Q
V
 
L
E
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
A
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
T
G
 
G
G
 
R
N
 
D
Y
 
Y
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
L
 
M
D
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
E
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
D
V
 
R
I
 
M
Y
 
F
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
T
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
Q
 
N
A
 
E
T
 
P
Q
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
N
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
T
V
 
A
I
 
R
S
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
A
 
T
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
V
 
R
W
 
W
K
 
I
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
 
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
V
 
I
K
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
V
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
M
V
 
R
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
F
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
E
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
A
P
 
E
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
-
T
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
A
P
 
P
V
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
G
 
Q
K
 
K
D
 
N
S
 
L
S
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
A
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
V
 
A
D
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
-
T
 
-
A
 
D
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
S
 
-
K
 
Q
H
 
M
S
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
E
 
D
K
 
K
F
 
M
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
H
 
E
V
 
V
D
 
Q
M
 
L
K
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
K
T
 
A
K
 
R
G
 
D
I
 
I
C
|
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
 
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
H
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
R
K
 
K
L
 
V
I
 
F
Y
 
M
I
 
L
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
|
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
T
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
P
A
 
K
N
 
-
V
 
-
K
 
A
T
 
T
G
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
A
S
 
G
S
 
A
N
 
-
H
 
-
M
 
-
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
A
T
 
I
T
 
S
G
 
G
T
 
E
I
 
M
A
 
K
W
 
W
Q
 
E
F
 
K
D
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
V
W
 
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
T
I
 
F
Y
 
Y
G
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
S
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
K
Y
 
H
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
R
L
 
L
S
 
Q
S
 
E
H
 
F
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
V
T
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1lrwA Crystal structure of methanol dehydrogenase from p. Denitrificans (see paper)
46% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:580/600 of 1lrwA

query
sites
1lrwA
N
 
N
A
 
D
E
 
Q
V
 
L
E
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
A
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
T
G
 
G
G
 
R
N
 
D
Y
 
Y
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
T
 
E
L
 
M
D
 
T
Q
 
D
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
E
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
G
D
 
D
V
 
R
I
 
M
Y
 
F
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
T
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
Q
 
N
A
 
E
T
 
P
Q
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
N
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
N
S
 
P
Q
 
T
V
 
A
I
 
R
S
 
T
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
P
-
 
L
I
 
I
F
 
F
L
 
R
A
 
T
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
T
V
 
R
W
 
W
K
 
I
V
 
M
K
 
E
N
 
N
G
 
S
D
 
D
P
 
I
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
|
T
N
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
V
 
I
K
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
V
K
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
M
V
 
R
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
F
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
E
E
 
E
V
 
L
G
 
L
L
 
L
D
 
A
P
 
E
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
-
T
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
A
P
 
P
V
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
G
 
Q
K
 
K
D
 
N
S
 
L
S
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
A
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
E
V
 
A
D
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
E
M
 
-
T
 
-
A
 
D
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
S
 
-
K
 
Q
H
 
M
S
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
E
 
D
K
 
K
F
 
M
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
H
 
E
V
 
V
D
 
Q
M
 
L
K
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
M
D
 
D
V
 
H
D
 
K
T
 
A
K
 
R
G
 
D
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
 
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
H
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
R
K
 
K
L
 
V
I
 
F
Y
 
M
I
 
L
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
T
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
P
T
 
K
G
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
G
S
 
N
S
 
A
N
 
S
H
 
G
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
P
 
A
T
 
I
T
 
S
G
 
G
T
 
E
I
 
M
A
 
K
W
 
W
Q
 
E
F
 
K
D
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
T
I
 
F
Y
 
Y
G
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
S
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
K
Y
 
H
N
 
D
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
A
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
R
L
 
L
S
 
Q
S
 
E
H
 
F
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
V
T
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

4aahA Methanol dehydrogenase from methylophilus w3a1 (see paper)
49% identity, 93% coverage: 45:618/619 of query aligns to 19:571/571 of 4aahA

query
sites
4aahA
G
 
G
N
 
G
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
S
T
 
Q
R
 
H
Y
 
N
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
A
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
S
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
N
L
 
V
Q
 
K
P
 
A
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
N
 
G
D
 
D
V
 
M
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
S
G
 
A
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
D
 
N
-
 
L
Q
 
N
A
 
D
T
 
P
Q
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
V
W
 
W
E
 
Q
Y
 
H
V
 
K
Y
 
P
A
 
K
P
 
Q
D
 
D
K
 
A
G
 
S
T
 
T
D
 
K
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
A
V
 
V
M
 
M
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
D
 
A
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
F
 
V
L
 
K
A
 
K
Q
 
Q
G
 
A
D
 
N
A
 
G
T
 
H
L
 
L
V
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
N
W
 
W
K
 
E
V
 
V
K
 
E
N
 
V
G
 
C
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
S
T
 
T
A
 
L
T
 
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
V
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
M
G
 
G
I
 
C
S
|
S
G
 
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
A
L
 
V
A
 
N
A
 
A
Y
 
F
N
 
D
I
 
L
K
 
K
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
K
W
 
W
K
 
R
K
 
A
Y
 
F
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
S
V
 
V
G
 
R
L
 
L
D
 
A
P
 
K
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
A
W
 
N
T
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
F
P
 
G
V
 
L
G
 
G
K
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
M
A
 
A
K
 
K
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
Q
M
 
M
M
 
V
L
 
L
I
 
T
D
 
D
Q
 
Q
E
 
P
M
 
V
T
 
N
A
 
G
K
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
K
H
 
M
S
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
S
H
 
H
F
 
I
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
L
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
E
T
 
N
G
 
G
E
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
V
D
 
D
K
 
P
A
 
A
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
T
 
K
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
T
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
F
S
 
A
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
M
D
 
D
T
 
H
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
N
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
F
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
V
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
E
T
 
S
K
 
R
L
 
T
I
 
L
Y
 
Y
I
 
A
P
 
G
G
 
L
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
A
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
P
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
N
K
 
G
E
 
P
S
 
T
S
 
K
N
 
K
H
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
R
A
 
A
W
 
F
D
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
A
A
 
K
W
 
W
Q
 
T
F
 
K
D
 
W
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
A
L
 
A
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
L
S
 
Y
T
 
T
A
 
K
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
W
Y
 
Y
G
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
N
K
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
F
 
F
K
 
K
T
 
M
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
G
I
 
I
G
 
G
N
 
S
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
S
Y
 
F
N
 
K
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
 
S
L
 
M
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
T
G
 
D
D
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
Q
S
 
N
H
 
H
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
L
T
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

5xm3A Crystal structure of methanol dehydrogenase from methylophaga aminisulfidivorans (see paper)
48% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:580/596 of 5xm3A

query
sites
5xm3A
N
 
N
A
 
D
E
 
K
V
 
L
E
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
S
K
 
K
D
 
S
P
 
N
K
 
E
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
Q
G
 
G
G
 
K
N
 
D
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
H
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
L
 
A
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
K
K
 
D
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
K
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
S
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
N
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
G
V
 
T
I
 
M
Y
 
Y
I
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
N
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
T
 
E
Q
 
P
S
 
G
V
 
V
I
 
I
-
 
K
W
 
W
E
 
E
Y
 
H
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
K
 
K
G
 
P
T
 
K
D
 
Q
Q
 
D
S
 
P
Q
 
A
V
 
A
I
 
R
S
 
A
V
 
V
M
 
A
C
|
C
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
M
I
 
I
F
 
V
L
 
K
A
 
S
Q
 
L
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
E
V
 
Y
W
 
W
K
 
K
V
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
I
K
 
S
T
 
V
G
 
G
M
 
Q
T
 
T
A
 
E
T
|
T
N
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
V
V
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
L
V
 
V
L
 
I
T
 
Q
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
D
I
 
I
K
 
H
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
M
V
 
V
W
 
W
K
 
R
K
 
W
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
K
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
-
T
 
-
W
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
H
A
 
N
P
 
P
V
 
H
G
 
Y
K
 
G
D
 
Q
S
 
K
S
 
G
L
 
L
-
 
G
-
 
T
K
 
S
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
D
D
 
N
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
Q
L
 
L
N
 
D
L
 
M
V
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
W
A
 
G
R
 
R
D
 
D
V
 
L
D
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
L
A
 
A
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
M
M
 
M
L
 
L
I
 
S
D
 
E
Q
 
Q
E
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
D
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
M
S
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
I
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
S
A
 
A
E
 
N
K
 
K
F
 
M
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
A
N
 
N
W
 
W
A
 
V
T
 
K
H
 
K
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
I
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
H
 
M
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
D
 
S
V
 
R
D
 
D
T
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
V
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
F
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
F
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
R
K
 
E
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
L
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
L
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
N
L
 
V
N
 
W
I
 
T
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
P
T
 
K
G
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
Q
S
 
N
S
 
G
N
 
I
H
 
G
M
 
S
G
 
G
S
 
Q
F
 
V
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
P
 
A
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
I
 
F
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
F
 
K
D
 
M
E
 
E
P
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
T
S
 
A
T
 
T
A
 
E
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
A
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
H
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
T
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
N
S
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
N
G
 
D
D
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
K
H
 
N
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
V
T
 
M
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

2d0vA Crystal structure of methanol dehydrogenase from hyphomicrobium denitrificans (see paper)
48% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:580/597 of 2d0vA

query
sites
2d0vA
N
 
N
A
 
D
E
 
K
V
 
L
E
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
K
 
N
D
 
S
P
 
N
K
 
E
N
 
N
F
 
W
A
 
V
T
 
M
W
 
P
G
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
D
G
 
S
T
 
N
R
 
N
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
L
 
S
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
Q
 
K
P
 
H
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
E
L
 
L
R
 
H
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
N
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
H
T
 
S
G
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
K
 
K
V
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
L
Q
 
N
A
 
D
T
 
P
Q
 
G
S
 
H
V
 
I
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
H
V
 
S
Y
 
P
A
 
K
P
 
Q
D
 
D
K
 
P
G
 
A
T
 
A
D
 
R
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
S
V
 
V
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
V
 
L
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
-
 
W
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
D
K
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
L
I
 
I
F
 
I
L
 
K
A
 
T
Q
 
Q
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
E
V
 
F
W
 
W
K
 
K
V
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
I
K
 
K
T
 
V
G
 
G
M
 
Q
T
 
T
A
 
L
T
|
T
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
Y
V
 
V
V
 
V
K
 
H
D
 
D
K
 
L
V
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
I
 
S
S
|
S
G
|
G
G
x
A
E
|
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
H
L
 
V
A
 
T
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
V
K
 
R
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
Q
V
 
A
W
 
W
K
 
R
K
 
Y
Y
 
Y
S
 
A
M
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
A
E
 
E
V
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
A
P
 
D
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
A
W
 
N
T
 
P
D
 
H
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
K
P
 
G
V
 
L
G
 
G
K
 
T
D
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
K
 
A
T
 
T
W
 
W
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
K
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
 
N
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
A
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
E
V
 
T
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
T
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
V
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
A
 
M
K
 
K
W
 
F
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
E
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
V
M
 
I
M
 
M
L
 
L
I
 
-
D
 
-
Q
 
S
E
 
E
M
 
Q
T
 
T
A
 
D
K
 
K
D
 
T
G
 
G
S
 
K
K
 
K
H
 
R
S
 
-
K
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
F
 
P
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
I
G
 
V
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
E
T
 
N
G
 
G
E
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
S
A
 
A
E
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
D
K
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
V
A
 
F
T
 
K
H
 
T
V
 
V
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
P
Q
 
V
V
 
R
N
 
D
P
 
P
K
 
E
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
Q
 
R
-
 
M
-
 
D
H
 
H
G
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
-
D
 
-
T
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
I
C
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
N
|
N
E
 
Q
P
 
G
P
 
H
V
 
D
T
 
S
Y
 
Y
S
 
D
P
 
P
R
 
Q
T
 
K
K
 
Q
L
 
L
I
 
F
Y
 
F
I
 
M
P
 
G
G
 
I
N
 
N
H
 
H
T
 
I
C
 
C
M
 
M
N
 
D
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
M
V
 
L
E
 
P
Y
 
Y
T
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
W
I
 
M
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
P
T
 
K
G
 
G
E
 
D
K
 
R
E
 
Q
S
 
N
S
 
Y
N
 
L
H
 
G
M
 
L
G
 
G
S
 
Q
F
 
I
T
 
K
A
 
A
W
 
Y
D
 
N
P
 
A
T
 
I
T
 
T
G
 
N
T
 
E
I
 
Y
A
 
K
W
 
W
Q
 
Q
F
 
H
D
 
M
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
S
L
 
V
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
T
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
R
D
 
N
A
 
S
K
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
L
L
 
V
Y
 
W
R
 
K
F
 
H
K
 
K
T
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
Y
V
 
P
S
 
M
T
 
T
W
 
Y
T
 
E
Y
 
H
N
 
K
G
 
G
K
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
M
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
V
A
 
F
G
 
D
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
D
 
P
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
G
 
N
L
 
L
S
 
Q
S
 
N
H
 
Y
T
 
T
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
S
F
 
L
T
 
E
V
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
L

7o6zB Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
45% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:588/588 of 7o6zB

query
sites
7o6zB
N
 
N
A
 
D
E
 
D
V
 
V
E
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
K
N
 
N
F
 
W
A
 
A
T
 
A
W
 
P
G
 
G
G
 
K
N
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
T
K
 
Q
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
G
L
 
L
Q
 
H
P
 
M
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
|
E
G
 
G
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
N
 
G
D
 
D
V
 
R
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
V
T
 
T
G
 
P
Y
 
Y
P
 
P
H
 
N
K
 
I
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
I
A
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
N
T
 
S
Q
 
Y
S
 
E
V
 
V
I
 
L
W
 
W
E
 
K
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
P
A
 
R
P
 
Q
D
 
D
K
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
D
Q
 
K
V
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
T
M
 
A
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
T
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
A
A
 
S
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
V
L
 
F
A
 
N
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
Y
L
 
V
V
 
V
A
 
C
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
K
V
 
T
K
 
K
N
 
F
G
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
N
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
S
T
|
T
N
 
P
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
x
G
G
|
G
G
x
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
R
G
 
G
F
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
N
 
D
I
 
L
K
 
N
D
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
K
 
Q
K
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
N
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
S
E
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
L
D
 
G
P
 
P
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
K
W
 
H
T
 
P
D
 
E
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
A
P
 
-
V
 
-
G
 
G
K
 
Q
D
 
D
S
 
L
S
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
T
W
 
Y
Q
 
P
G
 
D
D
 
E
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
I
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
A
W
|
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
N
S
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
L
W
|
W
N
 
S
P
 
P
V
 
S
Q
 
Y
R
 
R
P
 
T
G
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
K
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
V
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
D
E
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
D
M
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
Q
 
I
E
 
T
M
 
V
T
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
S
K
 
K
H
 
K
S
 
P
K
 
-
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
C
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
T
T
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
R
A
 
A
E
 
N
K
 
K
F
 
F
D
 
-
K
 
V
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
E
H
 
K
V
 
I
D
 
D
M
 
M
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
K
N
 
V
P
 
K
K
 
E
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
Q
 
F
H
 
E
G
 
V
G
 
G
Q
 
K
D
 
A
V
 
V
D
 
Q
T
 
A
K
 
-
G
 
-
I
 
-
C
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
x
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
A
Y
 
V
S
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
E
-
 
P
K
 
N
L
 
V
I
 
F
Y
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
N
T
 
W
C
 
G
M
 
M
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
M
E
 
E
V
 
R
E
 
A
Y
 
H
T
 
T
-
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
F
A
 
A
T
 
N
L
 
V
N
 
L
I
 
M
F
 
K
P
 
P
A
 
E
R
 
K
A
 
P
N
 
G
V
 
V
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
M
 
M
G
 
G
S
 
R
F
 
F
T
 
K
A
 
A
W
 
F
D
 
D
P
 
V
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
A
A
 
R
W
 
W
Q
 
D
F
 
I
D
 
P
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
P
L
 
T
W
|
W
S
 
S
G
 
G
M
 
A
V
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
R
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
S
 
I
T
 
S
W
 
Y
T
 
E
Y
 
V
N
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
W
|
W
A
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
P
M
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
G
 
-
D
 
P
T
 
A
E
 
D
G
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Y
 
-
K
 
S
G
 
G
L
 
M
S
 
A
S
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
F
-
 
Y
H
 
N
T
 
I
K
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
T
F
 
L
T
 
Y
V
 
T
F
 
F
A
 
C
L
 
V

7o6zA Structure of a neodymium-containing, xoxf1-type methanol dehydrogenase (see paper)
45% identity, 96% coverage: 27:618/619 of query aligns to 1:588/588 of 7o6zA

query
sites
7o6zA
N
 
N
A
 
D
E
 
D
V
 
V
E
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
T
K
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
K
N
 
N
F
 
W
A
 
A
T
 
A
W
 
P
G
 
G
G
 
K
N
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
N
T
 
T
R
 
R
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
F
 
T
K
 
Q
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
G
L
 
L
Q
 
H
P
 
M
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
M
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
N
 
G
D
 
D
V
 
R
I
 
M
Y
 
Y
I
 
V
H
 
V
T
 
T
G
 
P
Y
 
Y
P
 
P
H
 
N
K
 
I
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
I
A
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
N
T
 
S
Q
 
Y
S
 
E
V
 
V
I
 
L
W
 
W
E
 
K
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
P
A
 
R
P
 
Q
D
 
D
K
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
D
Q
 
K
V
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
T
M
 
A
C
 
C
C
 
C
D
 
D
V
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
A
A
 
S
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
F
 
V
L
 
F
A
 
N
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
Y
L
 
V
V
 
V
A
 
C
L
 
L
D
 
D
A
 
A
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
E
V
 
L
W
 
W
K
 
K
V
 
T
K
 
K
N
 
F
G
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
N
T
 
K
G
 
G
M
 
E
T
 
T
A
 
S
T
 
T
N
 
P
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
 
G
G
 
G
G
 
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
R
G
 
G
F
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
N
 
D
I
 
L
K
 
N
D
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
K
 
Q
K
 
A
Y
 
Y
S
 
S
M
 
N
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
S
E
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
L
D
 
G
P
 
P
E
 
D
H
 
F
T
 
N
M
 
S
T
 
K
W
 
H
T
 
P
D
 
E
G
 
Y
K
 
G
M
 
Q
A
 
A
P
 
-
V
 
-
G
 
G
K
 
Q
D
 
D
S
 
L
S
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
T
W
 
Y
Q
 
P
G
 
D
D
 
E
Q
 
E
W
 
W
K
 
K
I
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
C
T
 
A
W
 
W
G
 
G
W
 
W
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
K
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
N
S
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
L
W
|
W
N
 
S
P
 
P
V
 
S
Q
 
Y
R
 
R
P
 
T
G
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
W
-
 
K
-
 
W
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
W
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
K
V
 
P
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
V
W
 
W
V
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
 
F
D
 
D
E
 
Q
W
 
W
D
|
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
M
 
D
M
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
Q
 
I
E
 
T
M
 
V
T
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
S
K
 
K
H
 
K
S
 
P
K
 
-
L
 
C
L
 
L
T
 
V
H
 
H
F
 
F
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
C
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
N
R
 
R
V
 
T
T
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
I
L
 
I
V
 
R
A
 
A
E
 
N
K
 
K
F
 
F
D
 
-
K
 
V
A
 
T
V
 
V
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
E
H
 
K
V
 
I
D
 
D
M
 
M
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
K
N
 
V
P
 
K
K
 
E
Y
 
H
S
 
S
T
 
P
Q
 
F
H
 
E
G
 
V
G
 
G
Q
 
K
D
 
A
V
 
V
D
 
Q
T
 
A
K
 
-
G
 
-
I
 
-
C
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
 
D
E
 
Q
P
 
Q
P
 
P
V
 
V
T
 
A
Y
 
V
S
 
D
P
 
P
R
 
K
T
 
E
-
 
P
K
 
N
L
 
V
I
 
F
Y
 
Y
I
 
A
P
 
P
G
 
T
N
 
N
H
 
N
T
 
W
C
 
G
M
 
M
N
 
T
Y
 
L
E
 
E
P
 
P
F
 
M
E
 
E
V
 
R
E
 
A
Y
 
H
T
 
T
-
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
F
A
 
A
T
 
N
L
 
V
N
 
L
I
 
M
F
 
K
P
 
P
A
 
E
R
 
K
A
 
P
N
 
G
V
 
V
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
M
 
M
G
 
G
S
 
R
F
 
F
T
 
K
A
 
A
W
 
F
D
 
D
P
 
V
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
K
I
 
A
A
 
R
W
 
W
Q
 
D
F
 
I
D
 
P
E
 
E
P
 
R
F
 
F
S
 
P
L
 
T
W
 
W
S
 
S
G
 
G
M
 
A
V
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
D
G
 
G
D
 
G
I
 
L
V
 
A
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
D
G
 
G
Y
 
W
L
 
F
K
 
K
V
 
A
R
 
V
D
 
D
A
 
R
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
K
E
 
V
L
 
L
Y
 
W
R
 
Q
F
 
Q
K
 
K
T
 
L
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
P
S
 
I
T
 
S
W
 
Y
T
 
E
Y
 
V
N
 
G
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
G
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
P
M
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
G
 
-
D
 
P
T
 
A
E
 
D
G
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Y
 
-
K
 
S
G
 
G
L
 
M
S
 
A
S
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
F
-
 
Y
H
 
N
T
 
I
K
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
T
F
 
L
T
 
Y
V
 
T
F
 
F
A
 
C
L
 
V

C5AXV8 Lanthanide-dependent ethanol dehydrogenase; Lanthanide-dependent EtDH; Ln-dependent EtDH; Lanthanide-dependent formaldehyde dehydrogenase; PQQ-dependent ethanol dehydrogenase; EC 1.1.2.-; EC 1.2.2.- from Methylorubrum extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / JCM 2805 / NCIMB 9133 / AM1) (Methylobacterium extorquens) (see paper)
39% identity, 92% coverage: 8:577/619 of query aligns to 7:553/587 of C5AXV8

query
sites
C5AXV8
W
 
F
L
 
L
I
 
T
A
 
A
S
 
V
S
 
G
I
 
L
A
 
A
S
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
G
 
A
V
 
I
S
 
A
-
 
E
F
 
V
A
 
T
N
 
E
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
E
 
L
A
 
N
L
 
D
T
 
A
K
 
K
D
 
T
P
 
T
K
 
D
N
 
D
F
 
V
A
 
V
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
G
 
L
N
 
G
Y
 
P
A
 
Q
G
 
A
T
 
Q
R
 
R
Y
 
F
S
 
S
T
 
P
L
 
I
D
 
K
Q
 
T
I
 
L
N
 
N
F
 
R
K
 
D
N
 
N
A
 
I
K
 
K
H
 
G
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
F
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
E
M
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
 
E
G
 
S
G
 
Q
P
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
L
Y
 
Y
I
 
V
H
 
-
T
 
T
G
 
G
Y
 
S
P
 
Y
H
 
S
K
 
R
V
 
L
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
D
 
D
Q
 
A
A
 
R
T
 
T
Q
 
G
S
 
E
V
 
K
I
 
K
W
 
W
E
 
E
Y
 
Y
V
 
N
Y
 
A
A
 
R
P
 
L
D
 
P
K
 
E
G
 
G
T
 
I
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
L
M
 
P
C
 
C
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
G
 
Y
D
 
K
G
 
D
K
 
K
I
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Q
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
R
V
 
K
K
 
D
N
 
I
G
 
D
D
 
D
P
 
F
K
 
K
T
 
S
G
 
G
M
 
Y
T
 
S
A
 
Y
T
 
T
N
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
M
V
 
I
V
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
F
 
R
L
 
V
A
 
E
A
 
A
Y
 
R
N
 
D
I
 
A
K
 
E
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
K
K
 
R
Y
 
P
S
 
V
M
 
I
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
E
H
 
G
T
 
H
M
 
M
T
 
G
W
 
E
T
 
L
D
 
N
G
 
G
K
 
K
M
 
P
A
 
S
P
 
T
V
 
M
G
 
T
K
 
G
D
 
K
S
 
A
S
 
N
L
 
-
K
 
E
T
 
S
W
 
W
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
T
W
 
W
K
 
K
I
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
W
 
W
G
 
L
W
 
G
Y
 
G
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
P
S
 
G
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
S
V
 
A
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
K
W
 
W
S
 
S
M
 
A
T
 
S
I
 
R
W
 
L
A
 
A
R
 
I
D
 
N
V
 
P
D
 
D
T
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
I
K
 
V
W
 
W
V
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
M
 
T
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
G
W
 
W
D
 
D
Y
 
Y
D
|
D
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
F
M
 
V
L
 
P
I
 
F
D
 
D
Q
 
M
E
 
Q
M
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
T
S
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
G
T
 
A
H
 
T
F
 
A
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
S
A
 
A
E
 
T
K
 
P
F
 
F
D
 
V
K
 
S
A
 
N
V
 
I
N
 
N
W
 
W
A
 
A
T
 
K
H
 
G
V
 
I
D
 
D
M
 
-
K
 
E
T
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
V
 
Y
N
 
D
P
 
D
K
 
A
Y
 
N
S
 
R
T
 
P
Q
 
G
H
 
D
G
 
P
G
 
A
Q
 
K
D
 
S
V
 
E
D
 
D
T
 
G
K
 
K
G
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
I
 
A
C
 
T
P
 
P
S
 
G
A
 
F
M
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
 
N
E
 
W
P
 
N
P
 
P
V
 
I
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
R
 
D
T
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
S
N
 
N
H
 
E
T
 
W
C
 
G
M
 
M
N
 
D
Y
 
I
E
 
W
P
 
N
F
 
E
E
 
P
V
 
V
E
 
N
Y
 
Y
T
 
K
A
 
K
G
 
G
Q
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
F
N
 
T
I
 
I
F
 
K
P
 
P
A
 
T
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
F
S
 
E
N
 
D
H
 
H
M
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
L
T
 
K
A
 
A
W
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
K
T
 
K
I
 
V
A
 
V
W
 
W
Q
 
E
F
 
Y
D
 
K
E
 
N
P
 
K
F
 
A
S
 
P
L
 
L
W
 
W
S
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
L
S
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
A
R
 
F
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
V
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
Q
T
 
V
P
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
A
N
 
S
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
E
Y
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
W
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
W
G
 
G
G
 
G

Q88JH0 Quinoprotein alcohol dehydrogenase PedH; Lanthanide-dependent pyrroloquinoline quinone-dependent alcohol dehydrogenase; Lanthanide-dependent PQQ-ADH; EC 1.1.2.- from Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / CFBP 8728 / NCIMB 11950 / KT2440)
37% identity, 93% coverage: 2:577/619 of query aligns to 3:556/595 of Q88JH0

query
sites
Q88JH0
K
 
R
K
 
S
P
 
P
V
 
R
K
 
R
S
 
P
W
 
L
L
 
F
I
 
A
A
 
V
S
 
S
S
 
L
I
 
V
A
 
L
S
 
S
L
 
A
L
 
M
A
 
L
V
 
L
P
 
A
G
 
G
V
 
A
S
 
A
F
 
H
A
 
A
N
 
A
A
 
V
E
 
S
V
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
I
T
 
L
K
 
Q
D
 
D
P
 
P
K
 
K
N
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
F
 
I
A
 
V
T
 
T
W
 
N
G
 
G
G
 
L
N
 
G
Y
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
I
 
L
N
 
N
F
 
V
K
 
N
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
E
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
W
 
W
T
 
A
F
 
F
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
E
M
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
x
Q
G
 
A
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
M
Y
 
Y
I
 
L
H
 
-
T
 
T
G
 
G
Y
 
S
P
 
Y
H
 
S
K
 
R
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
D
 
D
Q
 
A
A
 
R
T
 
T
Q
 
G
S
 
K
V
 
K
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
Y
-
 
D
V
 
A
Y
 
R
A
 
L
P
 
P
D
 
D
K
 
D
G
 
I
T
 
R
D
 
P
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
M
 
-
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
Y
D
 
G
G
 
N
K
 
L
I
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
K
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
S
V
 
K
K
 
K
N
 
V
G
 
A
D
 
D
P
 
H
K
 
K
T
 
E
G
 
G
M
 
Y
T
 
S
A
 
I
T
x
S
N
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
M
V
 
I
V
 
V
K
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
S
 
A
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
F
 
K
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
P
K
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
M
K
 
R
Y
 
P
S
 
T
M
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
E
P
 
G
E
 
H
H
 
M
T
 
G
M
 
Y
T
 
V
W
 
Y
T
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
A
A
 
I
P
 
E
V
 
N
G
 
G
K
 
I
D
 
S
-
 
G
-
 
G
S
 
E
S
 
A
L
 
G
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
K
 
K
I
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
A
T
 
P
W
|
W
G
 
L
W
 
G
Y
 
G
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
S
V
 
H
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
L
W
 
Y
S
 
S
M
 
S
T
 
S
I
 
R
W
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
N
V
 
P
D
 
D
T
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
I
K
 
K
W
 
W
V
 
H
Y
 
F
Q
 
Q
M
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
G
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
L
M
 
I
L
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
S
M
 
F
T
 
N
A
 
Y
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
K
 
K
H
 
E
S
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
A
T
 
A
H
 
T
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
R
A
 
G
E
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
G
V
 
L
D
 
D
M
 
-
K
 
K
T
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
V
 
Y
N
 
N
P
 
D
K
 
-
Y
 
-
S
 
A
T
 
S
Q
 
R
H
 
P
G
 
G
G
 
A
Q
 
P
D
 
G
V
 
S
D
 
E
T
 
A
K
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
F
I
 
V
C
 
A
P
 
P
S
 
A
A
x
F
M
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
N
|
N
E
 
W
P
 
M
P
 
P
V
 
M
T
 
A
Y
 
Y
S
 
N
P
 
K
R
 
D
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
S
N
 
N
H
 
E
T
 
W
C
 
G
M
 
M
N
 
D
Y
 
I
E
 
W
P
 
N
F
 
E
E
 
G
V
 
I
E
 
A
Y
 
Y
T
 
K
A
 
K
G
 
G
Q
 
A
P
 
A
Y
 
F
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
F
N
 
T
I
 
I
F
 
K
P
 
P
A
 
L
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
N
S
 
E
N
 
D
H
 
Y
M
 
I
G
 
G
S
 
V
F
 
L
T
 
R
A
 
A
W
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
V
T
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
E
A
 
V
W
 
W
Q
 
R
F
 
H
D
 
K
E
 
N
P
 
Y
F
 
A
S
 
P
L
 
L
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
V
V
 
L
S
 
T
T
 
T
A
 
K
G
 
G
D
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
Q
V
 
A
R
 
F
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
K
L
 
V
Y
 
W
R
 
E
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
 
S
V
 
P
S
 
V
T
 
T
W
 
W
T
 
E
Y
 
M
N
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
S
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
W
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6zcvA Crystal structure of lanthanide-dependent alcohol dehydrogenase pedh from pseudomonas putida kt2440
37% identity, 89% coverage: 24:577/619 of query aligns to 1:529/562 of 6zcvA

query
sites
6zcvA
S
 
A
F
 
V
A
 
S
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
I
E
 
L
A
 
Q
L
 
D
T
 
P
K
 
K
D
 
N
P
 
P
K
 
Q
N
 
Q
F
 
I
A
 
V
T
 
T
W
 
N
G
 
G
G
 
L
N
 
G
Y
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
I
 
L
N
 
N
F
 
V
K
 
N
N
 
N
A
 
V
K
 
K
H
 
E
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
V
 
V
W
 
W
T
 
A
F
 
F
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
E
M
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
x
Q
G
 
A
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
K
N
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
M
Y
 
Y
I
 
L
H
 
-
T
 
T
G
 
G
Y
 
S
P
 
Y
H
 
S
K
 
R
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
D
 
D
Q
 
A
A
 
R
T
 
T
Q
 
G
S
 
K
V
 
K
I
 
L
W
 
W
E
 
Q
Y
 
Y
-
 
D
V
 
A
Y
 
R
A
 
L
P
 
P
D
 
D
K
 
D
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
I
V
 
R
M
 
P
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
x
I
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
Y
D
 
G
G
 
N
K
 
L
I
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
K
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
S
V
 
K
K
 
K
N
 
V
G
 
A
D
 
D
P
 
H
K
 
K
T
 
E
G
 
G
M
 
Y
T
 
S
A
 
I
T
x
S
N
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
M
V
 
I
V
 
V
K
x
N
D
 
G
K
|
K
V
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
I
 
V
S
 
A
G
|
G
G
|
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
F
 
K
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
I
 
P
K
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
M
K
 
R
Y
 
P
S
 
T
M
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
V
D
 
E
P
 
G
E
 
H
H
 
M
T
 
G
M
 
Y
T
 
V
W
 
Y
T
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
M
 
A
A
 
I
P
 
E
V
 
N
G
 
G
K
 
I
D
 
S
-
 
G
-
 
G
S
 
E
S
 
A
L
 
G
K
 
K
T
 
T
W
 
W
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
K
 
K
I
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
T
 
A
T
 
P
W
|
W
G
 
L
W
 
G
Y
 
G
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
V
 
I
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
A
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
S
V
 
H
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
N
K
 
L
W
 
Y
S
 
S
M
 
S
T
 
S
I
 
R
W
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
N
V
x
P
D
|
D
T
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
I
K
 
K
W
 
W
V
 
H
Y
 
F
Q
 
Q
M
 
S
T
 
T
P
 
P
H
 
H
D
 
D
E
 
G
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
|
D
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
M
 
L
M
 
I
L
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
S
M
 
F
T
 
N
A
 
Y
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
G
K
 
K
H
 
E
S
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
A
T
 
A
H
 
T
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
T
T
 
N
G
 
G
E
 
K
L
 
F
L
 
I
V
 
R
A
 
G
E
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
G
V
 
L
D
 
D
M
 
-
K
 
K
T
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
V
 
Y
N
 
N
P
 
D
K
 
-
Y
 
-
S
 
A
T
 
S
Q
 
R
H
 
P
G
 
G
G
 
A
Q
 
P
D
 
G
V
 
S
D
 
E
T
 
A
K
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
F
I
 
V
C
 
A
P
 
P
S
 
A
A
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
N
|
N
E
 
W
P
 
M
P
 
P
V
 
M
T
 
A
Y
 
Y
S
 
N
P
 
K
R
 
D
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
S
N
 
N
H
 
E
T
 
W
C
 
G
M
 
M
N
 
D
Y
 
I
E
 
W
P
 
N
F
 
E
E
 
G
V
 
I
E
 
A
Y
 
Y
T
 
K
A
 
K
G
 
G
Q
 
A
P
 
A
Y
 
F
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
G
L
 
F
N
 
T
I
 
I
F
 
K
P
 
P
A
 
L
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
N
S
 
E
N
 
D
H
 
Y
M
 
I
G
 
G
S
 
V
F
 
L
T
 
R
A
 
A
W
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
V
T
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
E
A
 
V
W
 
W
Q
 
R
F
 
H
D
 
K
E
 
N
P
 
Y
F
 
A
S
 
P
L
 
L
W
|
W
S
 
G
G
 
G
M
 
V
V
 
L
S
 
T
T
 
T
A
 
K
G
 
G
D
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
K
 
Q
V
 
A
R
 
F
D
 
N
A
 
A
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
D
E
 
K
L
 
V
Y
 
W
R
 
E
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
 
S
V
 
P
S
 
V
T
 
T
W
 
W
T
 
E
Y
 
M
N
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
V
G
 
S
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
W
G
 
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

Q9Z4J7 Quinoprotein ethanol dehydrogenase; QEDH; Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c); Quinoprotein alcohol dehydrogenase (cytochrome c550); EC 1.1.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 4 papers)
38% identity, 92% coverage: 51:619/619 of query aligns to 63:614/623 of Q9Z4J7

query
sites
Q9Z4J7
R
 
R
Y
 
W
S
 
S
T
 
P
L
 
L
D
 
K
Q
 
Q
I
 
V
N
 
N
F
 
A
K
 
D
N
 
N
A
 
V
K
 
F
H
 
K
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
V
 
A
W
 
W
T
 
S
F
 
Y
S
 
S
T
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
E
M
 
K
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
Q
E
|
E
G
 
S
G
 
Q
P
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
S
N
 
D
D
 
G
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
I
 
V
H
 
T
T
 
A
G
 
S
Y
 
Y
P
 
-
H
 
S
K
 
R
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
A
 
K
T
 
T
Q
 
G
S
 
K
V
 
R
I
 
L
W
 
W
E
 
T
Y
 
Y
V
 
N
Y
 
H
A
 
R
-
 
L
P
 
P
D
 
D
K
 
D
G
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
I
V
 
R
M
 
P
C
|
C
C
|
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
N
 
N
R
|
R
G
 
G
L
 
A
A
 
A
-
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
-
K
 
K
I
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
G
Q
 
T
G
 
L
D
 
D
A
 
A
T
 
S
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
K
K
 
N
T
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
K
V
 
K
K
 
K
N
 
F
G
 
A
D
 
D
P
 
H
K
 
G
T
 
A
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
A
 
M
T
|
T
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
I
V
 
V
K
 
K
D
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
L
-
 
I
-
x
H
G
|
G
I
x
S
S
 
S
G
 
G
G
 
D
E
|
E
F
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
V
G
 
G
F
 
R
L
 
L
A
 
F
A
 
A
Y
 
R
N
 
D
I
 
P
K
 
D
D
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
E
V
 
I
W
 
W
K
 
M
K
 
R
Y
 
P
S
 
F
M
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
N
G
 
G
P
 
K
D
 
D
D
 
S
E
 
T
V
 
V
G
 
T
L
 
G
D
 
D
P
 
V
E
 
K
H
 
-
T
 
A
M
 
P
T
 
S
W
 
W
T
 
P
D
 
D
G
 
D
K
 
R
M
 
N
A
 
S
P
 
P
V
 
T
G
 
G
K
 
K
D
 
V
S
 
E
S
 
S
L
 
-
K
 
-
T
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
W
K
 
S
I
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
P
W
 
W
G
 
Q
W
 
S
Y
 
A
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
P
 
A
D
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
T
V
 
I
Y
 
I
Y
 
V
G
 
G
S
 
A
G
 
G
N
|
N
P
 
P
S
 
G
T
 
P
W
 
W
N
 
N
P
 
T
V
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
D
 
D
N
 
S
K
 
L
W
 
Y
S
 
T
M
 
S
T
 
G
I
 
Q
W
 
V
A
 
G
R
 
V
D
 
D
V
 
P
D
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
V
K
 
K
W
 
W
V
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
M
 
H
T
 
T
P
 
P
H
 
N
D
 
D
E
 
A
W
 
W
D
|
D
Y
 
F
D
 
S
G
 
G
I
 
N
N
 
N
E
 
E
M
 
L
M
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
D
Q
 
Y
E
 
K
M
 
-
T
 
-
A
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
-
K
 
K
H
 
I
S
 
V
K
 
K
L
 
A
L
 
T
T
 
A
H
 
H
F
 
A
D
 
D
R
|
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
F
Y
 
Y
T
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
K
L
 
L
L
 
Q
V
 
N
A
 
A
E
 
F
K
 
P
F
 
F
D
 
V
K
 
D
A
 
N
V
 
I
N
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
 
H
V
 
I
D
 
D
M
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
P
Q
 
V
V
 
E
N
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
P
 
P
K
 
E
Y
 
P
S
 
G
T
 
Q
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
K
T
 
A
K
 
V
G
 
E
I
 
V
C
 
S
P
 
P
S
 
P
A
 
F
M
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
N
 
N
E
 
W
P
 
N
P
 
P
V
 
M
T
 
A
Y
 
Y
S
 
S
P
 
Q
R
 
D
T
 
T
K
 
G
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
I
 
V
P
 
P
G
 
A
N
 
N
H
 
H
T
 
W
C
 
K
M
 
E
N
 
D
Y
 
Y
E
 
W
P
 
T
F
 
E
E
 
E
V
 
V
E
 
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
A
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
A
 
M
T
 
G
L
 
F
N
 
R
I
 
I
F
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
K
K
 
R
E
 
M
S
 
Y
S
 
D
N
 
D
H
 
H
M
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
L
T
 
R
A
 
A
W
 
M
D
 
D
P
 
P
T
 
V
T
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
V
A
 
V
W
 
W
Q
 
E
F
 
H
D
 
K
E
 
E
P
 
H
F
 
L
S
 
P
L
 
L
W
|
W
S
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
G
D
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
F
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
G
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
V
 
A
R
 
F
D
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
S
G
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
W
R
 
K
F
 
F
K
 
Q
T
 
T
P
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
S
N
 
P
V
 
P
S
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
E
Y
 
Q
N
 
D
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
T
S
 
V
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
W
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
M
 
-
A
|
A
A
 
V
G
 
P
L
 
L
E
 
W
G
 
G
D
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
D
Y
 
M
K
 
A
G
 
D
L
 
L
S
 
T
S
 
R
H
 
P
T
 
V
K
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
S
F
 
F
T
 
W
V
 
V
F
 
F
A
 
K
L
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_010959663.1 NCBI__GCF_000008325.1:WP_010959663.1
MKKPVKSWLIASSIASLLAVPGVSFANAEVEALTKDPKNFATWGGNYAGTRYSTLDQINF
KNAKHLQPVWTFSTGMLRGHEGGPLVVNDVIYIHTGYPHKVYALDQATQSVIWEYVYAPD
KGTDQSQVISVMCCDVVNRGLAYGDGKIFLAQGDATLVALDAKTGKIVWKVKNGDPKTGM
TATNAPLVVKDKVLTGISGGEFGVRGFLAAYNIKDGSLVWKKYSMGPDDEVGLDPEHTMT
WTDGKMAPVGKDSSLKTWQGDQWKIGGGTTWGWYSYDPDLNLVYYGSGNPSTWNPVQRPG
DNKWSMTIWARDVDTGEAKWVYQMTPHDEWDYDGINEMMLIDQEMTAKDGSKHSKLLTHF
DRNGFGYTLDRVTGELLVAEKFDKAVNWATHVDMKTGRPQVNPKYSTQHGGQDVDTKGIC
PSAMGAKNEPPVTYSPRTKLIYIPGNHTCMNYEPFEVEYTAGQPYVGATLNIFPARANVK
TGEKESSNHMGSFTAWDPTTGTIAWQFDEPFSLWSGMVSTAGDIVIYGTLEGYLKVRDAK
TGEELYRFKTPSGIIGNVSTWTYNGKQYIGVLSGIGGWAGVGMAAGLEGDTEGLGAVGAY
KGLSSHTKLGGVFTVFALP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory