SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_010964213.1 NCBI__GCF_000008765.1:WP_010964213.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2pq9A E. Coli epsps liganded with (r)-difluoromethyl tetrahedral reaction intermediate analog (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 2pq9A

query
sites
2pq9A
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

2aa9A Epsp synthase liganded with shikimate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 2aa9A

query
sites
2aa9A
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
 
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
 
S
S
 
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
 
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
 
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

1x8tA Epsps liganded with the (r)-phosphonate analog of the tetrahedral reaction intermediate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 1x8tA

query
sites
1x8tA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
 
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

1x8rA Epsps liganded with the (s)-phosphonate analog of the tetrahedral reaction intermediate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 1x8rA

query
sites
1x8rA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

1g6tA Structure of epsp synthase liganded with shikimate-3-phosphate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 1g6tA

query
sites
1g6tA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

1g6sA Structure of epsp synthase liganded with shikimate-3-phosphate and glyphosate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 1g6sA

query
sites
1g6sA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

P0A6D3 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase; 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase; EPSP synthase; EPSPS; EC 2.5.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of P0A6D3

query
sites
P0A6D3
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
 
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
x
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
 
H
R
 
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
|
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

3fjzA E. Coli epsp synthase (t97i) liganded with s3p and glyphosate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 3fjzA

query
sites
3fjzA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
I
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
-
 
R
-
 
L
D
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
x
I
N
x
G
I
 
R
S
 
N
S
|
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

7tm5B Crystal structure of shikimate-3-phosphate bound 3-phosphoshikimate 1- carboxyvinyltransferase from klebsiella pneumoniae
30% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 7tm5B

query
sites
7tm5B
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
E
G
 
G
D
 
T
I
 
V
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
R
E
 
G
E
 
T
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
S
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
Q
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
V
K
 
T
K
 
G
Q
 
N
-
 
G
-
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
R
S
 
S
K
 
A
E
 
A
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
E
 
Q
K
 
G
E
 
G
I
 
A
A
 
Q
Y
 
I
S
 
D
H
 
C
P
 
L
E
 
E
G
 
Q
K
 
E
-
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
R
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
Q
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
E
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
Q
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
V
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
H
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
D
N
 
N
K
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
R
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
R
G
 
G
N
 
K
Q
 
Q
K
 
Q
C
 
Y
K
 
Q
G
 
S
T
 
P
-
 
G
K
 
D
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
V
D
 
T
-
 
W
-
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
F
F
 
I
S
 
A
S
 
C
K
 
T
K
 
H
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
Y
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
G
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
 
H
R
 
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
 
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

7tm6A Crystal structure of shikimate-3-phosphate and glyphosate bound 3- phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase from klebsiella pneumoniae
30% identity, 95% coverage: 11:417/428 of query aligns to 11:422/426 of 7tm6A

query
sites
7tm6A
L
 
V
K
 
E
G
 
G
D
 
T
I
 
V
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
R
E
 
G
E
 
T
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
S
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
Q
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
V
K
 
T
K
 
G
Q
 
N
-
 
G
-
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
R
S
 
S
K
 
A
E
 
A
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
 
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
E
 
Q
K
 
G
E
 
G
I
 
A
A
 
Q
Y
 
I
S
 
D
H
 
C
P
 
L
E
 
E
G
 
Q
K
 
E
-
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
R
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
Q
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
E
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
Q
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
V
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
H
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
D
N
 
N
K
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
R
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
R
G
 
G
N
 
K
Q
 
Q
K
 
Q
C
 
Y
K
 
Q
G
 
S
T
 
P
-
 
G
K
 
D
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
V
D
 
T
-
 
W
-
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
F
F
 
I
S
 
A
S
 
C
K
 
T
K
 
H
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
Y
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
G
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
 
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

1q36A Epsp synthase (asp313ala) liganded with tetrahedral reaction intermediate (see paper)
31% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:423/427 of 1q36A

query
sites
1q36A
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
C
 
A
-
 
R
L
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
H
E
 
G
E
 
K
S
 
T
T
 
V
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
V
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
S
I
 
Y
I
 
T
E
 
L
D
 
S
A
 
A
K
 
-
D
 
D
N
 
R
S
 
T
T
 
R
L
 
C
K
 
E
I
 
I
-
 
I
-
 
G
K
 
N
K
 
G
Q
 
G
K
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
A
K
 
E
E
 
G
K
 
A
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
S
R
 
N
N
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
-
 
L
-
 
G
E
 
G
K
 
A
E
 
K
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
Y
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
R
 
G
L
 
F
K
 
T
A
 
G
G
 
G
M
 
N
F
 
V
N
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
V
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
T
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
P
G
 
E
D
 
D
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
R
I
 
I
T
 
K
T
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
N
M
 
L
L
 
M
K
 
K
K
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
Q
A
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F
F
 
V
I
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
-
 
S
-
 
Y
K
 
Q
C
 
S
K
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
-
Y
 
Y
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
R
S
 
N
S
 
S
L
 
M
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
R
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
T
I
 
I
-
 
C
-
 
W
D
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
I
S
 
S
S
 
C
K
 
T
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
M
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
x
A
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
T
I
 
L
V
 
R
N
 
N
A
 
I
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
H
D
 
D
G
 
Y
L
 
I
L
 
R
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
I
E
 
A
S
 
T
W
 
Y
N
 
N
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
A
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
E
D
 
Q
L
 
L
K
 
A
Q
 
R
L
 
I

3nvsA 1.02 angstrom resolution crystal structure of 3-phosphoshikimate 1- carboxyvinyltransferase from vibrio cholerae in complex with shikimate-3-phosphate (partially photolyzed) and glyphosate
30% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:424/426 of 3nvsA

query
sites
3nvsA
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
-
 
E
C
 
L
L
 
I
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
V
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
G
E
 
T
S
 
T
T
 
R
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
|
D
I
 
I
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
V
I
 
N
I
 
Y
E
 
R
D
 
L
A
 
S
K
 
A
D
 
D
N
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
C
K
 
E
I
 
V
K
 
E
K
 
G
-
 
L
-
 
G
Q
 
Q
K
 
A
L
 
F
V
 
H
S
 
T
K
 
T
E
 
Q
K
 
P
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
x
N
S
 
A
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
Q
R
 
G
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
x
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
x
E
R
|
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
x
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
E
x
Q
K
 
A
-
 
G
-
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
Y
|
Y
S
 
L
H
x
E
P
x
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
F
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
R
 
T
-
 
G
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
T
F
 
V
N
 
T
L
 
I
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
I
S
|
S
S
|
S
Q
|
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
F
M
 
L
F
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
S
 
V
I
 
T
I
 
I
N
 
K
I
 
I
T
 
V
T
 
G
N
 
E
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
|
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
H
M
 
I
L
 
M
K
 
E
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
I
 
V
E
 
I
N
 
N
K
 
H
A
 
D
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
E
F
 
F
F
 
V
I
 
I
K
 
P
G
 
A
N
 
G
Q
 
Q
K
 
S
-
 
Y
C
 
V
K
 
S
G
 
P
T
 
G
K
 
Q
Y
 
F
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
|
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
x
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
E
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
K
S
 
N
S
 
S
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
Q
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
D
 
E
-
 
W
-
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
V
S
 
I
S
 
A
K
 
R
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
F
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
T
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
A
I
 
I
V
 
R
N
 
N
A
 
V
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
L
K
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
F
L
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
T
K
 
K
L
 
L
K
 
I
G
 
H
G
 
A
E
 
A
V
 
I
E
 
D
S
 
T
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
S
K
|
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
D
D
 
K
L
 
F
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L

Q9KRB0 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase; 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase; EPSP synthase; EPSPS; EC 2.5.1.19 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961)
30% identity, 97% coverage: 1:417/428 of query aligns to 1:424/426 of Q9KRB0

query
sites
Q9KRB0
M
 
M
N
 
E
C
 
S
V
 
L
K
 
T
I
 
L
N
 
Q
P
 
P
C
 
I
-
 
E
C
 
L
L
 
I
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
V
K
 
N
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
|
K
S
|
S
L
 
V
G
 
S
H
 
N
R
|
R
A
 
A
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
G
E
 
T
S
 
T
T
 
R
I
 
L
E
 
T
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
D
S
 
S
K
 
D
D
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
H
T
 
M
C
 
L
I
 
N
G
 
A
M
 
L
S
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
V
I
 
N
I
 
Y
E
 
R
D
 
L
A
 
S
K
 
A
D
 
D
N
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
C
K
 
E
I
 
V
K
 
E
K
 
G
-
 
L
-
 
G
Q
 
Q
K
 
A
L
 
F
V
 
H
S
 
T
K
 
T
E
 
Q
K
 
P
V
 
L
Y
 
E
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
A
P
 
A
I
 
A
S
 
L
L
 
C
I
 
L
E
 
G
E
 
Q
R
 
G
N
 
D
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
P
K
 
R
L
 
M
S
 
K
Y
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I
D
 
G
S
 
H
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
A
F
 
L
D
 
R
E
 
Q
K
 
A
-
 
G
-
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
Y
 
Y
S
 
L
H
 
E
P
 
Q
E
 
E
G
 
-
K
 
N
V
 
F
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
R
 
T
-
 
G
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
T
F
 
V
N
 
T
L
 
I
P
 
D
G
 
G
N
 
S
I
 
I
S
|
S
S
|
S
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
F
M
 
L
F
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
Q
G
 
G
D
 
K
S
 
V
I
 
T
I
 
I
N
 
K
I
 
I
T
 
V
T
 
G
N
 
E
L
 
L
E
 
V
S
|
S
V
 
K
G
 
P
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
M
 
I
T
 
T
I
 
L
D
 
H
M
 
I
L
 
M
K
 
E
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
I
 
V
E
 
I
N
 
N
K
 
H
A
 
D
Y
 
Y
K
 
Q
S
 
E
F
 
F
F
 
V
I
 
I
K
 
P
G
 
A
N
 
G
Q
 
Q
K
 
S
-
 
Y
C
 
V
K
 
S
G
 
P
T
 
G
K
 
Q
Y
 
F
K
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
A
-
 
A
I
 
I
L
 
K
N
 
G
G
 
G
N
 
E
I
 
V
N
 
K
C
 
V
K
 
T
D
 
G
L
 
I
N
 
G
I
 
K
S
 
N
S
 
S
L
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
I
V
 
Q
I
 
F
L
 
A
D
 
D
I
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
D
 
E
-
 
W
-
 
G
E
 
D
K
 
D
S
 
Y
F
 
V
S
 
I
S
 
A
K
 
R
K
 
R
S
 
G
H
 
E
T
 
L
H
 
N
G
 
A
I
 
V
V
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
F
S
 
N
Q
 
H
C
 
I
P
 
P
D
|
D
L
 
A
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
I
S
 
A
V
 
T
V
 
T
A
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
A
E
 
K
G
 
G
T
 
T
T
 
T
K
 
A
I
 
I
V
 
R
N
 
N
A
 
V
A
 
Y
R
x
N
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
E
D
 
D
G
 
F
L
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
T
K
 
K
L
 
L
K
 
I
G
 
H
G
 
A
E
 
A
V
 
I
E
 
D
S
 
T
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
 
H
R
 
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
C
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
-
C
 
S
E
 
D
E
 
T
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
D
S
 
P
E
 
K
C
 
C
V
 
T
S
 
S
K
 
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
D
F
 
Y
W
 
F
S
 
D
D
 
K
L
 
F
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L

P11043 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase, chloroplastic; 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase; EPSP synthase; EC 2.5.1.19 from Petunia hybrida (Petunia) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:416/428 of query aligns to 85:512/516 of P11043

query
sites
P11043
L
 
I
K
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
V
K
 
K
I
 
L
P
 
P
P
 
G
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
S
H
 
N
R
 
R
A
 
I
I
 
L
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
G
E
 
T
S
 
T
T
 
V
I
 
V
E
 
D
N
 
N
I
 
L
S
 
L
Y
 
S
S
 
S
K
 
D
D
 
D
I
 
I
K
 
H
A
 
Y
T
 
M
C
 
L
I
 
G
G
 
A
M
 
L
S
 
K
K
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
H
I
 
V
I
 
E
E
 
E
D
 
D
A
 
S
K
 
A
D
 
N
N
 
Q
S
 
R
T
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
F
K
 
P
I
 
V
K
 
G
K
 
K
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
E
V
 
I
Y
 
Q
I
 
L
D
 
F
C
 
L
S
 
G
E
 
N
S
 
A
G
|
G
S
 
T
T
 
A
V
 
M
R
 
R
F
 
P
L
 
L
I
 
T
P
 
A
I
 
A
S
 
V
L
 
T
I
 
V
E
 
A
E
 
G
R
 
G
N
 
N
-
 
S
-
 
R
V
 
Y
V
 
V
F
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
G
 
P
K
 
R
L
 
M
S
 
R
Y
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
I
D
 
S
S
 
D
Y
 
L
F
 
V
N
 
D
I
 
G
F
 
L
D
 
K
E
 
Q
K
 
L
E
 
G
I
 
A
A
 
E
Y
 
V
S
 
D
H
 
C
P
 
F
E
 
L
G
 
G
-
 
T
K
 
K
V
 
C
L
 
P
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
I
 
I
-
 
V
-
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
G
L
 
L
K
 
P
A
 
G
G
 
G
M
 
K
F
 
V
N
 
K
L
 
L
P
 
S
G
 
G
N
 
S
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
Q
F
 
Y
I
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
M
S
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
L
L
 
A
E
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
V
I
 
E
I
 
I
N
 
E
I
 
I
T
 
I
T
 
D
N
 
K
L
 
L
E
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
P
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
L
D
 
K
M
 
L
L
 
M
K
 
E
K
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
E
 
S
I
 
V
E
 
E
N
 
H
K
 
S
A
 
S
-
 
S
Y
 
W
K
 
D
S
 
R
F
 
F
F
 
F
I
 
V
K
 
R
G
 
G
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
C
 
Y
K
 
K
G
 
S
T
 
P
-
 
G
K
 
K
Y
 
A
K
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
W
 
F
L
 
L
S
 
A
-
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
T
N
 
G
G
 
G
N
 
T
I
 
I
N
 
T
C
 
V
K
 
E
D
 
G
L
 
C
N
 
G
I
 
T
S
 
N
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
K
 
V
V
 
K
I
 
F
L
 
A
D
 
E
I
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
K
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
E
I
 
V
D
 
T
-
 
W
-
 
T
E
 
E
K
 
N
S
 
S
F
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
S
S
 
S
S
 
S
K
 
G
K
 
R
S
 
K
H
 
H
T
 
L
H
 
R
G
 
A
I
 
I
V
 
D
I
 
V
D
 
N
A
 
M
S
 
N
Q
 
K
C
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
V
V
 
A
P
 
M
I
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
L
L
 
Y
S
 
A
E
 
D
G
 
G
T
 
P
T
 
T
K
 
A
I
 
I
V
 
R
N
 
D
A
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
R
I
 
V
K
 
K
E
 
E
S
 
T
D
 
E
R
 
R
L
 
M
K
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
C
T
 
T
E
 
E
L
 
L
N
 
R
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
G
E
 
P
D
 
D
G
 
Y
L
 
C
L
 
I
I
 
I
E
 
T
G
 
P
K
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
G
 
V
G
 
T
E
 
D
V
 
I
E
 
D
S
 
T
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
 
H
R
 
R
I
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
C
R
 
-
C
 
A
E
 
D
E
 
V
S
 
P
V
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
D
S
 
P
E
 
G
C
 
C
V
 
T
S
 
R
K
 
K
S
 
T
Y
 
F
P
 
P
Q
 
N
F
 
Y
W
 
F
S
 
D
D
 
V
L
 
L
K
 
Q
Q
 
Q

Q9S400 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase; 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase; EPSP synthase; EPSPS; EC 2.5.1.19 from Streptococcus pneumoniae serotype 4 (strain ATCC BAA-334 / TIGR4) (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:417/428 of query aligns to 3:424/427 of Q9S400

query
sites
Q9S400
V
 
L
K
 
K
I
 
T
N
 
N
P
 
I
C
 
R
C
 
H
L
 
L
K
 
H
G
 
G
D
 
S
I
 
I
K
 
R
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
 
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
|
R
A
 
S
I
 
I
I
 
I
C
 
F
A
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
K
I
 
V
E
 
Y
N
 
D
I
 
I
S
 
L
Y
 
R
S
 
G
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
L
A
 
S
T
 
T
C
 
M
I
 
Q
G
 
V
M
 
F
S
 
R
K
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
V
I
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
D
A
 
K
K
 
D
D
 
G
N
 
V
S
 
I
T
 
T
L
 
I
K
 
Q
I
 
G
K
 
V
K
 
G
Q
 
M
K
 
A
L
 
G
V
 
L
S
 
K
K
 
A
E
 
P
K
 
Q
V
 
N
Y
 
A
I
 
L
D
 
N
C
 
M
S
 
G
E
 
N
S
 
S
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
I
I
 
S
P
 
G
I
 
V
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
A
E
 
D
R
 
F
N
 
E
V
 
V
V
 
E
F
 
M
D
 
F
G
 
G
Q
 
D
G
 
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
K
R
 
R
P
 
P
L
 
M
D
 
D
S
 
R
Y
 
V
F
 
T
N
 
L
I
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
K
K
 
M
E
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
I
S
 
S
-
 
G
H
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
R
K
 
D
V
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
R
A
 
P
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
I
I
 
A
S
|
S
S
x
A
Q
|
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
M
F
 
F
S
 
A
L
 
A
P
 
L
F
 
Q
L
 
A
E
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
I
E
 
E
S
 
K
V
 
E
G
 
Y
Y
 
T
V
 
R
D
 
N
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
G
E
 
H
I
 
L
E
 
S
N
 
V
K
 
D
A
 
G
Y
 
-
K
 
K
S
 
K
F
 
I
F
 
T
I
 
V
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
Q
 
Q
K
 
K
C
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
Y
 
V
K
 
V
V
 
V
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
W
L
 
L
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
A
G
 
P
N
 
N
I
 
S
N
 
R
C
 
L
K
 
V
D
 
L
L
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
 
I
L
 
N
Q
 
E
G
 
T
D
 
R
K
 
T
V
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
I
K
 
R
K
 
A
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
L
D
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
K
E
 
S
K
 
A
S
 
T
F
 
L
S
 
I
S
 
V
K
 
E
K
 
S
S
 
S
H
 
D
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
E
I
 
I
D
 
G
A
 
G
S
 
A
Q
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
R
L
 
L
V
 
I
-
x
D
-
 
E
-
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
T
 
T
K
 
V
I
 
I
V
 
K
N
 
D
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
T
D
 
D
R
 
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
V
M
 
V
A
 
A
T
 
D
E
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
T
E
 
P
L
 
T
E
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
M
L
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
G
K
 
K
E
 
S
K
 
A
L
 
L
K
 
H
G
 
G
G
 
A
E
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
T
W
 
F
N
 
G
D
 
D
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
G
M
 
M
A
 
M
L
 
T
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
L
C
 
V
E
 
A
E
 
D
S
 
G
-
 
E
V
 
V
T
 
E
I
 
L
N
 
D
G
 
R
S
 
A
E
 
E
C
 
A
V
 
I
S
 
N
K
 
T
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
S
F
 
F
W
 
F
S
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
S
L
 
L

1rf6A Structural studies of streptococcus pneumoniae epsp synthase in s3p- glp bound state (see paper)
30% identity, 97% coverage: 4:417/428 of query aligns to 3:424/427 of 1rf6A

query
sites
1rf6A
V
 
L
K
 
K
I
 
T
N
 
N
P
 
I
C
 
R
C
 
H
L
 
L
K
 
H
G
 
G
D
 
I
I
 
I
K
 
R
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
|
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
|
R
A
 
S
I
 
I
I
 
I
C
 
F
A
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
K
I
 
V
E
 
Y
N
 
D
I
 
I
S
 
L
Y
 
R
S
 
G
K
 
E
D
|
D
I
 
V
K
 
L
A
 
S
T
 
T
C
 
M
I
 
Q
G
 
V
M
 
F
S
 
R
K
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
V
I
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
D
A
 
K
K
 
D
D
 
G
N
 
V
S
 
I
T
 
T
L
 
V
K
 
Q
I
 
G
K
 
V
K
 
G
Q
 
M
K
 
A
L
 
G
V
 
L
S
 
K
K
 
A
E
 
P
K
 
Q
V
 
N
Y
 
A
I
 
L
D
 
N
C
 
M
S
 
G
E
x
N
S
 
S
G
|
G
S
x
T
T
 
S
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
I
I
 
S
P
 
G
I
 
V
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
A
E
 
D
R
 
F
N
 
E
V
 
V
V
 
E
F
 
M
D
 
F
G
 
G
Q
 
D
G
x
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
K
R
|
R
P
 
P
L
 
M
D
 
D
S
 
R
Y
 
V
F
 
T
N
 
L
I
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
K
K
 
M
E
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
I
S
 
S
-
 
G
H
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
R
K
 
D
V
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
R
A
 
P
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
I
I
 
A
S
|
S
S
 
A
Q
|
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
M
F
 
F
S
 
A
L
 
A
P
 
L
F
 
Q
L
 
A
E
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
I
E
 
E
S
 
K
V
 
E
G
 
Y
Y
 
T
V
x
R
D
 
N
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
L
K
 
Q
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
G
E
 
H
I
 
L
E
 
S
N
 
V
K
 
D
A
 
G
Y
 
-
K
 
K
S
 
K
F
 
I
F
 
T
I
 
V
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
Q
 
Q
K
 
K
C
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
Y
 
V
K
 
V
V
 
V
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
W
L
 
L
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
A
G
 
P
N
 
N
I
 
S
N
 
R
C
 
L
K
 
V
D
 
L
L
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
 
I
L
 
N
Q
 
E
G
 
T
D
 
R
K
 
T
V
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
I
K
 
R
K
 
A
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
L
D
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
K
E
 
S
K
 
A
S
 
T
F
 
L
S
 
I
S
 
V
K
 
E
K
 
S
S
 
S
H
 
D
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
E
I
 
I
D
 
C
A
 
G
S
 
A
Q
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
R
L
 
L
V
x
I
-
x
D
-
 
E
-
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
T
 
T
K
 
V
I
 
I
V
 
K
N
 
D
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
V
M
 
V
A
 
A
T
 
D
E
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
T
E
 
P
L
 
T
E
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
M
L
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
G
K
 
K
E
 
S
K
 
A
L
 
L
K
 
H
G
 
G
G
 
A
E
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
T
W
 
F
N
 
G
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
I
A
 
G
M
 
M
A
 
M
L
 
T
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
L
C
 
V
E
 
A
E
 
D
S
 
G
-
 
E
V
 
V
T
 
E
I
 
L
N
 
D
G
 
R
S
 
A
E
 
E
C
 
A
V
 
I
S
 
N
K
x
T
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
S
F
 
F
W
 
F
S
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
S
L
 
L

1rf4A Structural studies of streptococcus pneumoniae epsp synthase, tetrahedral intermediate bound state (see paper)
30% identity, 97% coverage: 4:417/428 of query aligns to 3:424/427 of 1rf4A

query
sites
1rf4A
V
 
L
K
 
K
I
 
T
N
 
N
P
 
I
C
 
R
C
 
H
L
 
L
K
 
H
G
 
G
D
 
I
I
 
I
K
 
R
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
|
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
|
R
A
 
S
I
 
I
I
 
I
C
 
F
A
 
G
A
 
S
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
E
S
 
T
T
 
K
I
 
V
E
 
Y
N
 
D
I
 
I
S
 
L
Y
 
R
S
 
G
K
 
E
D
|
D
I
 
V
K
 
L
A
 
S
T
 
T
C
 
M
I
 
Q
G
 
V
M
 
F
S
 
R
K
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
V
I
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
D
A
 
K
K
 
D
D
 
G
N
 
V
S
 
I
T
 
T
L
 
V
K
 
Q
I
 
G
K
 
V
K
 
G
Q
 
M
K
 
A
L
 
G
V
 
L
S
 
K
K
 
A
E
 
P
K
 
Q
V
 
N
Y
 
A
I
 
L
D
 
N
C
 
M
S
 
G
E
x
N
S
 
S
G
|
G
S
x
T
T
 
S
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
I
I
 
S
P
 
G
I
 
V
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
A
E
 
D
R
 
F
N
 
E
V
 
V
V
 
E
F
 
M
D
 
F
G
 
G
Q
 
D
G
x
D
K
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
K
R
|
R
P
 
P
L
 
M
D
 
D
S
 
R
Y
 
V
F
 
T
N
 
L
I
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
K
K
 
M
E
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
I
S
 
S
-
 
G
H
 
Q
P
 
T
E
 
E
G
 
R
K
 
D
V
 
L
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
T
-
 
K
R
 
N
L
 
L
K
 
R
A
 
P
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
E
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
I
I
 
A
S
|
S
S
x
A
Q
|
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
M
F
 
F
S
 
A
L
 
A
P
 
L
F
 
Q
L
 
A
E
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
S
I
 
V
I
 
I
N
 
-
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
I
E
 
E
S
 
K
V
 
E
G
 
Y
Y
 
T
V
x
R
D
 
N
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
L
K
 
Q
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
I
 
G
E
 
H
I
 
L
E
 
S
N
 
V
K
 
D
A
 
G
Y
 
-
K
 
K
S
 
K
F
 
I
F
 
T
I
 
V
K
 
Q
G
 
G
N
 
P
Q
 
Q
K
 
K
C
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
Y
 
V
K
 
V
V
 
V
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
W
L
 
L
S
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
A
G
 
P
N
 
N
I
 
S
N
 
R
C
 
L
K
 
V
D
 
L
L
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
 
I
L
 
N
Q
 
E
G
 
T
D
 
R
K
 
T
V
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
I
K
 
R
K
 
A
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
L
D
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
K
E
 
S
K
 
A
S
 
T
F
 
L
S
 
I
S
 
V
K
 
E
K
 
S
S
 
S
H
 
D
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
E
I
 
I
D
 
C
A
 
G
S
 
A
Q
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
R
L
 
L
V
 
I
-
x
D
-
 
E
-
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
T
L
 
Q
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
V
T
 
T
K
 
V
I
 
I
V
 
K
N
 
D
A
 
A
A
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
V
M
 
V
A
 
A
T
 
D
E
 
A
L
 
L
N
 
N
K
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
T
E
 
P
L
 
T
E
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
M
L
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
G
K
 
K
E
 
S
K
 
A
L
 
L
K
 
H
G
 
G
G
 
A
E
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
T
W
 
F
N
 
G
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
I
A
 
G
M
 
M
A
 
M
L
 
T
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
L
C
 
V
E
 
A
E
 
D
S
 
G
-
 
E
V
 
V
T
 
E
I
 
L
N
 
D
G
 
R
S
 
A
E
 
E
C
 
A
V
 
I
S
 
N
K
x
T
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
S
F
 
F
W
 
F
S
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
S
L
 
L

4egrA 2.50 angstrom resolution structure of 3-phosphoshikimate 1- carboxyvinyltransferase (aroa) from coxiella burnetii in complex with phosphoenolpyruvate
29% identity, 96% coverage: 11:421/428 of query aligns to 13:427/434 of 4egrA

query
sites
4egrA
L
 
L
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
K
 
C
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
|
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
Q
S
 
T
T
 
Q
I
 
V
E
 
D
N
 
G
I
 
F
S
 
L
Y
 
M
S
 
G
K
 
A
D
|
D
I
 
N
K
 
L
A
 
A
T
 
M
C
 
V
I
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
Q
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
-
I
 
S
I
 
I
E
 
Q
D
 
V
A
 
I
K
 
E
D
 
D
N
 
E
S
 
N
T
 
I
L
 
L
K
 
V
I
 
V
K
 
E
K
 
G
Q
 
V
K
 
G
L
 
M
V
 
T
S
 
G
K
 
L
E
 
Q
K
 
A
V
 
P
-
 
P
-
 
E
Y
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
G
E
x
N
S
 
S
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
L
I
 
S
P
 
G
I
 
L
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
Q
E
 
P
R
 
F
N
 
N
V
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
D
G
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
Q
Y
 
R
R
|
R
P
 
P
L
 
M
D
 
K
S
 
-
Y
 
-
F
 
-
N
 
R
I
 
I
F
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
L
E
 
T
I
 
L
-
 
M
-
 
G
A
 
A
Y
 
K
S
 
I
H
 
D
P
 
S
E
 
T
G
 
G
K
 
N
V
 
V
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
I
 
I
K
 
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
G
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
M
I
 
A
S
 
S
S
 
A
Q
 
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
C
L
 
L
M
 
L
F
 
L
S
 
A
L
 
G
P
 
L
F
 
Y
L
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
K
S
 
T
I
 
C
I
 
I
N
 
T
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
 
S
V
 
R
D
 
D
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
H
F
 
F
G
 
H
I
 
Y
E
 
T
I
 
L
E
 
Q
N
 
K
K
 
Q
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
S
 
S
F
 
I
F
 
C
I
 
V
K
 
S
G
 
G
N
 
G
Q
 
G
K
 
K
C
 
L
K
 
K
G
 
A
T
 
N
K
 
D
Y
 
I
K
 
S
V
 
I
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
F
L
 
I
S
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
T
L
 
I
N
 
T
G
 
P
N
 
G
I
 
S
N
 
A
C
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
C
N
 
R
I
 
V
S
 
G
S
 
V
L
 
N
Q
 
P
G
 
T
D
 
R
K
 
L
V
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
N
I
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
M
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
D
I
 
I
D
 
E
E
 
V
K
 
T
S
 
H
F
 
Y
S
 
T
S
 
E
K
 
K
K
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
H
S
 
A
H
 
R
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
D
I
 
I
D
 
P
A
 
P
S
 
D
Q
 
Q
C
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
I
D
|
D
L
 
E
V
 
F
P
 
P
I
 
V
L
 
L
S
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
K
T
 
T
K
 
V
I
 
L
V
 
R
N
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
K
 
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
I
K
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
D
E
 
G
L
 
L
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
I
E
 
A
V
 
A
V
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
K
 
G
E
 
-
K
 
T
L
 
L
K
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
N
S
 
S
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
T
R
 
L
C
 
A
E
 
K
E
 
G
S
 
P
V
 
V
T
 
R
I
 
I
N
 
R
G
 
N
S
 
C
E
 
D
C
 
N
V
 
V
S
 
K
K
x
T
S
 
S
Y
 
F
P
 
P
Q
 
N
F
 
F
W
 
V
S
 
E
D
 
L
L
 
A
K
 
N
Q
 
E
L
 
V
G
 
G
G
 
M
D
 
N
V
 
V

3slhD 1.70 angstrom resolution structure of 3-phosphoshikimate 1- carboxyvinyltransferase (aroa) from coxiella burnetii in complex with shikimate-3-phosphate and glyphosate
29% identity, 96% coverage: 11:421/428 of query aligns to 13:431/440 of 3slhD

query
sites
3slhD
L
 
L
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
K
 
C
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
|
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
Q
S
 
T
T
 
Q
I
 
V
E
 
D
N
 
G
I
 
F
S
 
L
Y
 
M
S
 
G
K
 
A
D
|
D
I
 
N
K
 
L
A
 
A
T
 
M
C
 
V
I
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
Q
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
-
I
 
S
I
 
I
E
 
Q
D
 
V
A
 
I
K
 
E
D
 
D
N
 
E
S
 
N
T
 
I
L
 
L
K
 
V
I
 
V
K
 
E
K
 
G
Q
 
V
K
 
G
L
 
M
V
 
T
S
 
G
K
 
L
E
 
Q
K
 
A
V
 
P
-
 
P
-
 
E
Y
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
G
E
x
N
S
 
S
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
L
I
 
S
P
 
G
I
 
L
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
Q
E
 
P
R
 
F
N
 
N
V
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
D
G
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
Q
Y
 
R
R
|
R
P
 
P
L
 
M
D
 
K
S
 
-
Y
 
-
F
 
-
N
 
R
I
 
I
F
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
L
E
 
T
I
 
L
-
 
M
-
 
G
A
 
A
Y
 
K
S
 
I
H
 
D
P
 
S
E
 
T
G
 
G
K
 
N
V
 
V
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
I
 
I
K
 
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
G
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
M
I
 
A
S
|
S
S
 
A
Q
|
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
C
L
 
L
M
 
L
F
 
L
S
 
A
L
 
G
P
 
L
F
 
Y
L
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
K
S
 
T
I
 
C
I
 
I
N
 
T
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
 
S
V
x
R
D
 
D
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
H
F
 
F
G
 
H
I
 
Y
E
 
T
I
 
L
E
 
Q
N
 
-
K
 
K
A
 
D
Y
 
K
K
 
Q
S
 
S
F
 
I
F
 
C
I
 
V
K
 
S
G
 
G
N
 
G
Q
 
G
K
 
K
C
 
L
K
 
K
G
 
A
T
 
N
K
 
D
Y
 
I
K
 
S
V
 
I
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
F
L
 
I
S
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
T
L
 
I
N
 
T
G
 
P
N
 
G
I
 
S
N
 
A
C
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
C
N
 
R
I
 
V
S
 
G
S
 
V
L
 
N
Q
 
P
G
 
T
D
 
R
K
 
L
V
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
N
I
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
M
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
D
I
 
I
D
 
E
E
 
V
K
 
T
S
 
H
F
 
Y
S
 
T
S
 
E
K
 
K
K
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
H
S
 
A
H
 
R
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
D
I
 
I
D
 
P
A
 
P
S
 
D
Q
 
Q
C
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
I
D
|
D
L
 
E
V
 
F
P
 
P
I
 
V
L
 
L
S
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
K
T
 
T
K
 
V
I
 
L
V
 
R
N
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
|
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
I
K
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
D
E
 
G
L
 
L
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
I
E
 
A
V
 
A
V
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
K
 
G
E
 
-
K
 
T
L
 
L
K
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
N
S
 
S
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
|
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
T
R
 
L
C
 
A
E
 
K
E
 
G
S
 
P
V
 
V
T
 
R
I
 
I
N
 
R
G
 
N
S
 
C
E
 
D
C
 
N
V
 
V
S
 
K
K
x
T
S
 
S
Y
 
F
P
 
P
Q
 
N
F
 
F
W
 
V
S
 
E
D
 
L
L
 
A
K
 
N
Q
 
E
L
 
V
G
 
G
G
 
M
D
 
N
V
 
V

Q83E11 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase; 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase; EPSP synthase; EPSPS; EC 2.5.1.19 from Coxiella burnetii (strain RSA 493 / Nine Mile phase I)
29% identity, 96% coverage: 11:421/428 of query aligns to 11:429/438 of Q83E11

query
sites
Q83E11
L
 
L
K
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
K
 
C
I
 
V
P
 
P
P
 
G
S
 
D
K
|
K
S
|
S
L
 
I
G
 
S
H
 
H
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
L
C
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
E
 
E
E
 
G
E
 
Q
S
 
T
T
 
Q
I
 
V
E
 
D
N
 
G
I
 
F
S
 
L
Y
 
M
S
 
G
K
 
A
D
 
D
I
 
N
K
 
L
A
 
A
T
 
M
C
 
V
I
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
Q
K
 
Q
L
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
-
I
 
S
I
 
I
E
 
Q
D
 
V
A
 
I
K
 
E
D
 
D
N
 
E
S
 
N
T
 
I
L
 
L
K
 
V
I
 
V
K
 
E
K
 
G
Q
 
V
K
 
G
L
 
M
V
 
T
S
 
G
K
 
L
E
 
Q
K
 
A
V
 
P
-
 
P
-
 
E
Y
 
A
I
 
L
D
 
D
C
 
C
S
 
G
E
x
N
S
|
S
G
|
G
S
x
T
T
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
L
L
 
L
I
 
S
P
 
G
I
 
L
S
 
L
L
 
A
I
 
G
E
 
Q
E
 
P
R
 
F
N
 
N
V
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
T
G
 
G
Q
 
D
G
 
S
K
 
S
L
 
L
S
 
Q
Y
 
R
R
|
R
P
 
P
L
 
M
D
 
K
S
 
-
Y
 
-
F
 
-
N
 
R
I
 
I
F
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
L
E
 
T
I
 
L
-
 
M
-
 
G
A
 
A
Y
 
K
S
 
I
H
 
D
P
 
S
E
 
T
G
 
G
K
 
N
V
 
V
L
 
P
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
I
 
I
K
 
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
G
G
 
I
M
 
H
F
 
Y
N
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
-
N
 
M
I
 
A
S
|
S
S
x
A
Q
|
Q
F
 
V
I
 
K
S
 
S
G
 
C
L
 
L
M
 
L
F
 
L
S
 
A
L
 
G
P
 
L
F
 
Y
L
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
K
S
 
T
I
 
C
I
 
I
N
 
T
I
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
S
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
 
S
V
 
R
D
 
D
M
 
H
T
 
T
I
 
E
D
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
H
F
 
F
G
 
H
I
 
Y
E
 
T
I
 
L
E
 
Q
N
 
-
K
 
K
A
 
D
Y
 
K
K
 
Q
S
 
S
F
 
I
F
 
C
I
 
V
K
 
S
G
 
G
N
 
G
Q
 
G
K
 
K
C
 
L
K
 
K
G
 
A
T
 
N
K
 
D
Y
 
I
K
 
S
V
 
I
E
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
I
S
 
S
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
W
 
F
L
 
I
S
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
T
L
 
I
N
 
T
G
 
P
N
 
G
I
 
S
N
 
A
C
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
C
N
 
R
I
 
V
S
 
G
S
 
V
L
 
N
Q
 
P
G
 
T
D
 
R
K
 
L
V
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
N
I
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
M
M
 
M
G
 
G
G
 
A
A
 
D
I
 
I
D
 
E
E
 
V
K
 
T
S
 
H
F
 
Y
S
 
T
S
 
E
K
 
K
K
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
 
H
S
 
A
H
 
R
T
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
D
I
 
I
D
 
P
A
 
P
S
 
D
Q
 
Q
C
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
I
D
|
D
L
 
E
V
 
F
P
 
P
I
 
V
L
 
L
S
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
T
 
K
T
 
T
K
 
V
I
 
L
V
 
R
N
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
K
|
K
E
 
E
S
 
T
D
 
D
R
|
R
L
 
I
K
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
D
E
 
G
L
 
L
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
I
E
 
A
V
 
A
V
 
E
E
 
S
L
 
L
E
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
I
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
K
 
G
E
 
-
K
 
T
L
 
L
K
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
N
S
 
S
W
 
Y
N
 
D
D
 
D
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
T
R
 
L
C
 
A
E
 
K
E
 
G
S
 
P
V
 
V
T
 
R
I
 
I
N
 
R
G
 
N
S
 
C
E
 
D
C
 
N
V
 
V
S
 
K
K
 
T
S
 
S
Y
 
F
P
 
P
Q
 
N
F
 
F
W
 
V
S
 
E
D
 
L
L
 
A
K
 
N
Q
 
E
L
 
V
G
 
G
G
 
M
D
 
N
V
 
V

Query Sequence

>WP_010964213.1 NCBI__GCF_000008765.1:WP_010964213.1
MNCVKINPCCLKGDIKIPPSKSLGHRAIICAALSEEESTIENISYSKDIKATCIGMSKLG
ALIIEDAKDNSTLKIKKQKLVSKEKVYIDCSESGSTVRFLIPISLIEERNVVFDGQGKLS
YRPLDSYFNIFDEKEIAYSHPEGKVLPLQIKGRLKAGMFNLPGNISSQFISGLMFSLPFL
EGDSIINITTNLESVGYVDMTIDMLKKFGIEIENKAYKSFFIKGNQKCKGTKYKVEGDFS
QAAFWLSAGILNGNINCKDLNISSLQGDKVILDILKKMGGAIDEKSFSSKKSHTHGIVID
ASQCPDLVPILSVVAALSEGTTKIVNAARLRIKESDRLKAMATELNKLGAEVVELEDGLL
IEGKEKLKGGEVESWNDHRIAMALGIAALRCEESVTINGSECVSKSYPQFWSDLKQLGGD
VHEWSLGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory