SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011021797.1 NCBI__GCF_000007345.1:WP_011021797.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
37% identity, 94% coverage: 1:454/481 of query aligns to 3:469/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
M
 
M
Q
 
Y
I
 
L
I
 
R
P
 
R
F
 
F
F
 
Y
V
 
D
R
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
A
H
 
H
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
A
 
G
G
 
C
K
 
Q
K
 
E
S
 
T
-
 
G
-
 
E
C
 
A
A
 
C
I
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
I
 
L
R
 
L
E
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
I
T
 
V
H
 
A
I
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
|
F
V
 
V
S
 
S
G
 
G
H
 
A
M
 
R
D
 
E
L
 
M
A
 
A
E
 
D
L
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
I
 
I
Y
 
C
A
 
V
P
 
S
E
 
D
A
 
E
A
 
G
K
 
P
C
 
P
E
 
E
F
 
W
E
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
H
 
H
V
 
R
G
 
L
L
 
L
V
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
E
F
 
L
E
 
H
I
 
F
E
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
R
V
 
I
K
 
V
V
 
V
L
 
M
E
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
Y
D
 
D
T
 
G
S
 
K
R
 
T
G
 
S
P
 
P
D
 
D
-
 
V
P
 
P
T
 
M
A
 
A
V
 
L
F
 
F
C
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
F
L
 
V
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
E
P
 
S
G
 
G
K
 
S
A
 
S
R
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
R
T
 
Q
L
 
M
Y
 
F
D
 
R
S
 
S
L
 
L
H
 
-
K
 
R
K
 
K
L
 
F
L
 
E
S
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
H
C
 
V
E
 
Q
V
 
V
Y
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
H
G
 
G
E
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
A
C
 
C
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
V
R
 
P
S
 
S
S
 
S
T
 
T
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
I
 
H
P
 
K
D
 
D
R
 
E
E
 
D
G
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
Q
N
 
A
L
 
L
T
 
L
T
 
A
D
 
G
M
 
Q
P
 
P
P
 
E
A
 
A
P
 
P
Y
 
I
H
 
Y
F
 
F
S
 
A
R
 
R
C
 
M
S
 
K
E
 
L
I
 
V
N
 
N
R
 
K
K
 
V
G
 
G
P
 
P
T
 
R
K
 
L
L
 
L
R
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
G
P
 
A
P
 
P
K
 
E
-
 
R
-
 
V
E
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
-
E
 
E
F
 
R
F
 
V
R
 
R
F
 
-
A
 
A
G
 
W
R
 
R
D
 
E
N
 
G
T
 
G
E
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
S
 
V
R
 
R
H
 
P
Y
 
A
D
 
D
N
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
K
E
 
R
H
 
H
V
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
S
W
 
L
C
 
N
I
 
I
D
 
P
L
 
W
R
 
N
S
 
K
N
 
S
F
 
F
A
 
V
T
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
A
E
 
D
R
 
R
Q
 
P
I
 
I
L
 
H
L
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
-
S
 
A
E
 
D
K
 
A
D
 
I
A
 
A
R
 
P
E
 
D
S
 
V
A
 
I
V
 
R
W
 
A
L
 
L
H
 
R
R
 
S
V
 
I
G
 
G
L
 
I
D
 
D
R
 
D
I
 
V
A
 
V
G
 
D
F
 
W
L
 
T
S
 
D
G
 
P
E
 
A
M
 
A
F
 
V
A
 
D
W
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
P
G
 
D
L
 
D
R
 
V
A
 
A
S
 
S
H
 
Y
V
 
-
S
 
A
Q
 
N
V
 
V
S
 
S
I
 
-
P
 
P
E
 
D
L
 
E
Y
 
V
E
 
R
W
 
G
V
 
A
R
 
L
S
 
A
K
 
Q
N
 
Q
P
 
G
P
 
L
L
 
W
I
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
N
S
 
V
S
 
D
E
 
E
Y
 
W
E
 
A
S
 
G
F
 
G
H
 
H
I
 
L
E
 
P
N
 
Q
A
 
A
L
 
H
N
 
H
I
 
I
Q
 
P
V
 
L
Q
 
S
D
 
K
L
 
L
R
 
A
K
 
A
R
 
H
Y
 
I
R
 
H
E
 
D
L
 
V
D
 
P
P
 
R
E
 
D
A
 
G
E
 
S
Y
 
V
A
 
C
V
 
V
I
 
Y
C
 
C
S
 
R
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
S
 
S
G
 
A
I
 
I
G
 
A
C
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
L
K
 
R
K
 
A
H
 
H
G
 
G
F
 
V
S
 
G
R
 
D
V
 
V
N
 
R
N
 
N
A
 
M
A
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
E
G
 
A
Y
 
W
N
 
R
A
 
G
A
 
K
G
 
G
F
 
F

3r2uA 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
34% identity, 69% coverage: 6:338/481 of query aligns to 8:344/348 of 3r2uA

query
sites
3r2uA
F
 
F
F
 
Y
V
 
D
R
 
K
G
 
H
I
 
L
A
 
S
H
 
Q
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
C
K
 
Q
K
 
K
S
 
T
-
 
G
-
 
E
C
 
A
A
 
M
I
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
L
E
 
S
I
 
S
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
V
A
 
A
K
 
D
S
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
I
T
 
T
H
 
H
I
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
|
F
V
 
A
S
 
S
G
 
G
H
 
I
M
 
R
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
I
L
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
V
P
 
S
E
 
G
A
 
E
A
 
S
K
 
D
C
 
D
E
 
T
F
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
K
-
 
N
-
 
M
-
 
P
E
 
N
H
 
H
V
 
T
G
 
H
L
 
F
V
 
V
E
 
Q
-
 
H
G
 
N
D
 
D
T
 
D
F
 
I
E
 
Y
I
 
V
E
 
G
D
 
N
M
 
I
T
 
K
V
 
L
K
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
S
I
 
I
S
 
S
Y
 
F
V
 
L
V
 
L
S
 
T
D
 
D
T
 
E
S
 
G
R
 
A
G
 
G
P
 
A
D
 
Q
-
 
V
P
 
P
T
 
M
A
 
G
V
 
L
F
 
F
C
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
F
L
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
L
P
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
S
R
 
E
E
 
I
L
 
G
A
 
A
S
 
K
T
 
Q
L
 
M
Y
 
F
D
 
K
S
 
S
L
 
I
H
 
-
K
 
E
K
 
S
L
 
I
L
 
K
S
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
Y
C
 
I
E
 
Q
V
 
I
Y
 
W
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
G
E
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
P
C
 
C
G
 
G
R
 
K
A
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
I
R
 
P
S
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
Q
Y
 
T
N
 
N
Y
 
W
A
 
A
L
 
F
Q
 
S
I
 
E
P
 
N
D
 
N
R
 
E
E
 
A
G
 
T
F
 
F
I
 
I
E
 
D
N
 
K
L
 
L
T
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
Q
P
 
P
P
 
A
A
 
P
P
 
P
Y
 
H
H
 
H
F
 
F
S
 
A
R
 
Q
C
 
M
S
 
K
E
 
K
I
 
I
N
 
N
R
 
Q
K
 
F
G
 
G
P
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
M
E
 
N
I
 
L
P
 
Y
P
 
Q
P
 
P
K
 
Y
E
 
T
L
 
V
P
 
Y
P
 
P
G
 
-
E
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
A
G
 
T
R
 
N
D
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
L
V
 
T
L
 
F
D
 
D
S
 
L
R
 
R
H
 
S
Y
 
K
D
 
E
N
 
A
F
 
Y
G
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
H
V
 
I
P
 
E
G
 
G
A
 
T
W
 
I
C
 
N
I
 
I
D
 
P
L
 
Y
R
 
D
S
 
K
N
 
N
F
 
F
A
 
I
T
 
N
Y
 
Q
A
 
I
G
 
G
W
 
W
L
 
Y
L
 
L
P
 
N
P
 
Y
E
 
D
R
 
Q
Q
 
E
I
 
I
L
 
N
L
 
L
V
 
I
S
 
G
D
 
D
S
 
Y
E
 
H
K
 
L
D
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
A
S
 
T
A
 
H
V
 
T
W
 
-
L
 
L
H
 
Q
R
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
R
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
Y

3r2uB 2.1 angstrom resolution crystal structure of metallo-beta-lactamase from staphylococcus aureus subsp. Aureus col
34% identity, 69% coverage: 6:338/481 of query aligns to 10:332/336 of 3r2uB

query
sites
3r2uB
F
 
F
F
 
Y
V
 
D
R
 
K
G
 
H
I
 
L
A
 
S
H
 
Q
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
C
K
 
Q
K
 
K
S
 
T
-
 
G
-
 
E
C
 
A
A
 
M
I
 
I
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
L
E
 
S
I
 
S
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
V
A
 
A
K
 
D
S
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
I
T
 
T
H
 
H
I
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
T
H
|
H
L
 
I
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
|
F
V
 
A
S
 
S
G
 
G
H
 
I
M
 
R
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
I
L
 
K
T
 
L
G
 
N
A
 
A
P
 
N
I
 
I
Y
 
Y
A
 
V
P
 
S
E
 
G
A
 
E
A
 
S
K
 
D
C
 
D
E
 
T
F
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
K
-
 
N
-
 
M
-
 
P
E
 
N
H
 
H
V
 
T
G
 
H
L
 
F
V
 
V
E
 
Q
-
 
H
G
 
N
D
 
D
T
 
D
F
 
I
E
 
Y
I
 
V
E
 
G
D
 
N
M
 
I
T
 
K
V
 
L
K
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
S
I
 
I
S
 
S
Y
 
F
V
 
L
V
 
L
S
 
T
D
 
D
T
 
E
S
 
G
R
 
A
G
 
G
P
 
A
D
 
Q
-
 
V
P
 
P
T
 
M
A
 
G
V
 
L
F
 
F
C
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
F
L
 
I
F
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
S
P
 
E
G
 
I
K
 
G
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
L
 
M
A
 
F
S
 
K
T
 
S
L
 
I
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
E
K
 
S
L
 
I
L
 
K
S
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
Y
C
 
I
E
 
Q
V
 
I
Y
 
W
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
G
E
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
-
C
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
I
R
 
P
S
 
T
S
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
Q
Y
 
T
N
 
N
Y
 
W
A
 
A
L
 
F
Q
 
S
I
 
E
P
 
N
D
 
N
R
 
E
E
 
A
G
 
T
F
 
F
I
 
I
E
 
D
N
 
K
L
 
L
T
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
Q
P
 
P
P
 
A
A
 
P
P
 
P
Y
 
H
H
 
H
F
 
F
S
 
A
R
 
Q
C
 
M
S
 
K
E
 
K
I
 
I
N
 
N
R
 
Q
K
 
F
G
 
G
P
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
M
E
 
N
I
 
L
P
 
Y
P
 
Q
P
 
P
K
 
Y
E
 
T
L
 
V
P
 
Y
P
 
P
G
 
-
E
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
A
G
 
T
R
 
N
D
 
T
N
 
N
T
 
R
E
 
L
V
 
T
L
 
F
D
 
D
S
 
L
R
 
R
H
 
S
Y
 
K
D
 
E
N
 
A
F
 
Y
G
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
H
V
 
I
P
 
E
G
 
G
A
 
T
W
 
I
C
 
N
I
 
I
D
 
P
L
 
Y
R
 
D
S
 
K
N
 
N
F
 
F
A
 
I
T
 
N
Y
 
Q
A
 
I
G
 
G
W
 
W
L
 
Y
L
 
L
P
 
N
P
 
Y
E
 
D
R
 
Q
Q
x
E
I
 
I
L
 
N
L
 
L
V
 
I
S
 
G
D
 
D
S
 
Y
E
 
H
K
 
L
D
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
A
S
 
T
A
 
H
V
 
T
W
 
-
L
 
L
H
 
Q
R
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
R
x
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
Y

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
33% identity, 42% coverage: 22:225/481 of query aligns to 24:210/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
K
 
R
S
 
Q
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
Q
 
L
R
 
E
D
 
Q
V
 
V
E
 
D
I
 
R
Y
 
D
I
 
L
R
 
Q
E
 
M
A
 
V
K
 
A
S
 
E
R
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
T
I
 
L
T
 
T
H
 
H
I
 
V
L
 
F
E
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
x
H
V
 
I
S
 
T
G
 
A
H
 
S
M
 
G
D
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
E
L
 
R
T
 
T
G
 
Q
A
 
A
P
 
T
I
 
V
Y
 
V
-
 
G
A
 
S
P
 
V
E
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
S
C
 
C
E
 
A
F
 
-
E
 
-
H
 
N
V
 
V
G
 
Q
L
 
V
V
 
R
E
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
E
F
 
V
E
 
R
I
 
V
E
 
G
D
 
Q
M
 
L
T
 
V
V
 
F
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
E
 
D
H
 
S
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
V
 
L
S
 
G
D
 
D
T
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
R
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
V
 
V
G
 
R
D
 
G
V
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
N
G
 
G
K
 
N
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
S
 
S
T
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
H
 
T
K
 
R
K
 
V
L
 
L
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
E
C
 
T
E
 
L
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
L
 
Y
C
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
T
M
 
V
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
T
T
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
 
E
E
 
E
R
 
K
K
 
R
Y
 
H
N
 
N
Y
 
P
A
 
R
L
 
V
Q
 
A
I
 
G
P
 
K
D
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
E
F
 
F
I
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
M
E
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
N
T
 
L
D
 
P
M
 
R
P
 
P

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
27% identity, 70% coverage: 15:350/481 of query aligns to 18:343/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
S
 
T
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
D
K
 
S
-
 
T
-
 
T
K
x
R
S
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
Q
 
R
R
 
R
D
 
D
V
 
A
E
 
A
I
 
L
Y
 
I
I
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
E
S
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
I
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
T
L
 
I
E
 
D
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
x
H
V
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
A
M
 
W
D
 
M
L
 
L
A
 
N
E
 
R
L
 
R
T
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
R
I
 
I
Y
 
A
A
 
I
P
 
S
E
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
G
E
 
A
H
 
D
V
 
R
G
 
Y
L
 
L
V
 
S
E
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
V
E
 
E
I
 
F
E
 
G
D
 
T
M
 
R
T
 
Y
V
 
L
K
 
T
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
E
 
G
H
 
C
I
 
I
S
 
T
Y
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
D
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
N
P
 
E
T
 
T
A
 
M
V
 
A
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
C
L
 
L
F
 
L
V
 
I
G
 
R
D
 
G
V
 
T
G
|
G
R
|
R
P
 
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
R
G
 
G
K
 
D
A
 
A
R
 
H
E
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
M
Y
 
F
D
 
R
S
 
A
L
 
V
H
 
H
K
 
G
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
T
S
 
A
C
 
C
E
 
L
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
|
H
G
 
D
E
x
Y
G
 
R
S
 
G
L
 
L
C
 
T
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
V
S
 
T
T
 
S
I
 
V
G
 
G
Y
 
E
E
 
E
R
 
R
K
 
R
Y
 
F
N
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
G
Y
 
G
A
 
E
L
 
L
Q
 
C
I
 
E
P
 
E
D
 
D
R
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
Y
I
 
M
E
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
H
 
H
F
x
L
S
 
P
R
 
H
C
x
P
S
x
K
E
 
Q
I
 
I
N
 
D
R
 
V
K
 
A
G
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
N
L
 
L
R
 
K
-
 
C
E
 
G
I
 
L
P
 
A
P
 
E
P
 
P
K
 
D
E
 
W
L
 
A
P
 
P
P
 
L
G
 
T
E
 
C
F
 
S
F
 
F
R
 
A
F
 
G
A
 
I
G
 
W
R
 
E
D
 
I
N
 
N
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
A
T
 
V
E
 
E
V
 
I
L
 
V
D
 
D
S
 
V
R
 
R
H
 
E
Y
 
P
D
 
E
N
 
E
F
 
F
G
 
N
G
 
G
E
 
P
-
 
L
-
 
G
H
 
R
V
 
I
P
 
P
G
 
A
A
 
A
W
 
R
C
 
L
I
 
I
D
 
S
L
 
L
R
 
G
S
 
E
N
 
L
F
 
A
A
 
G
T
 
R
Y
 
T
A
 
A
G
 
E
W
 
-
L
 
-
L
 
L
P
 
T
P
 
K
E
 
D
R
 
R
Q
 
P
I
 
I
L
 
V
L
 
T
V
 
V
S
 
S
D
 
R
S
 
A
E
 
G
K
 
G
D
 
R
A
 
S
R
 
A
E
 
Q
S
 
A
A
 
T
V
 
V
W
 
M
L
 
L
H
 
R
R
 
Q
V
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
N
F
 
-
L
 
L
S
 
P
G
 
G
E
 
G
M
 
M
F
 
L
A
 
R
W
 
W
A
 
R
T
 
A
A
 
E
G
 
G

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
31% identity, 39% coverage: 22:209/481 of query aligns to 24:209/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
K
 
R
S
 
L
C
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
R
 
G
D
 
D
V
 
A
E
 
E
I
 
K
Y
 
I
I
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
V
K
 
D
S
 
A
R
 
S
G
 
G
L
 
V
K
 
T
I
 
L
T
 
M
H
 
Q
I
 
I
L
 
L
E
 
L
T
 
T
H
 
H
L
 
G
H
 
H
A
 
L
D
|
D
F
x
H
V
 
V
S
 
G
G
 
A
H
 
A
M
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
H
T
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
P
I
 
V
Y
 
I
A
 
G
P
 
P
E
 
E
A
 
K
A
 
E
K
 
D
C
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
W
H
 
L
V
 
Q
G
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
C
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
R
-
 
W
L
 
L
V
 
N
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
R
F
 
V
E
 
S
I
 
V
E
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
T
V
 
L
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
H
T
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
G
H
 
H
I
 
V
S
 
V
Y
 
F
V
 
F
V
 
D
S
 
E
D
 
Q
T
 
S
S
 
Q
R
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
L
V
 
L
F
 
I
C
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
I
F
 
F
V
 
K
G
 
G
D
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
S
D
 
D
L
 
-
F
 
F
P
 
P
G
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
R
E
 
G
L
 
D
A
 
H
S
 
T
T
 
Q
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
S
 
A
L
 
I
H
 
K
K
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
P
L
 
L
P
 
G
D
 
D
S
 
D
C
 
V
E
 
T
V
 
F
Y
 
I
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
G
E
 
P
G
 
-
S
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
L
S
 
S
T
 
T
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
L
Y
 
H
N
 
N
Y
 
P
A
 
F
L
 
L
Q
 
Q

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 44% coverage: 15:225/481 of query aligns to 66:271/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
S
 
T
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
H
-
 
P
K
 
D
K
 
K
S
 
P
C
 
A
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
Q
 
D
R
 
K
D
 
T
V
 
V
E
 
D
I
 
R
Y
 
D
I
 
L
R
 
K
E
 
L
A
 
I
K
 
D
S
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
H
V
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
T
M
 
G
D
 
L
L
 
L
-
 
K
A
 
T
E
 
K
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
I
 
S
Y
 
V
A
 
I
P
 
S
E
 
K
A
 
A
A
 
S
K
 
G
C
 
S
E
 
K
F
 
A
E
 
D
H
 
-
V
 
L
G
 
F
L
 
L
V
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
V
E
 
S
I
 
I
E
 
G
D
 
D
M
 
I
T
 
Y
V
 
L
K
 
E
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
E
 
G
H
 
C
I
 
V
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
S
 
G
D
 
E
T
 
G
S
 
A
R
 
D
G
 
Q
P
 
P
D
 
Q
P
 
P
T
 
R
A
 
M
V
 
A
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
V
 
I
G
 
R
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
S
 
S
L
 
V
H
 
H
K
 
S
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
S
 
D
C
 
T
E
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
 
H
G
 
D
E
 
Y
G
 
K
S
 
G
L
 
F
C
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
E
S
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
V
G
 
G
Y
 
E
E
 
E
R
 
M
K
 
Q
Y
 
H
N
 
N
Y
 
P
A
 
R
L
 
L
Q
 
-
I
 
T
P
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
E
G
 
T
F
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
I
I
 
M
E
 
S
N
 
N
L
 
L
T
 
N
T
 
L
D
 
S
M
 
Y
P
 
P

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
30% identity, 44% coverage: 15:225/481 of query aligns to 17:222/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
S
 
T
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
H
-
 
P
K
 
D
K
 
K
S
 
P
C
 
A
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
-
 
V
Q
 
D
R
 
K
D
 
T
V
 
V
E
 
D
I
 
R
Y
 
D
I
 
L
R
 
K
E
 
L
A
 
I
K
 
D
S
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
L
T
 
I
H
 
Y
I
 
A
L
 
M
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
V
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
x
H
V
 
V
S
 
T
G
 
G
H
 
T
M
 
G
D
 
L
L
 
L
-
 
K
A
 
T
E
 
K
L
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
V
P
 
K
I
 
S
Y
 
V
A
 
I
P
 
S
E
 
K
A
 
A
A
 
S
K
 
G
C
 
S
E
 
K
F
 
A
E
 
D
H
 
-
V
 
L
G
 
F
L
 
L
V
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
V
E
 
S
I
 
I
E
 
G
D
 
D
M
 
I
T
 
Y
V
 
L
K
 
E
V
 
V
L
 
R
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
E
 
G
H
 
C
I
 
V
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
S
 
G
D
 
E
T
 
G
S
 
A
R
 
D
G
 
Q
P
 
P
D
 
Q
P
 
P
T
 
R
A
 
M
V
 
A
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
V
 
I
G
 
R
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
E
G
 
G
K
 
S
A
 
S
R
 
D
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
S
 
S
L
 
V
H
 
H
K
 
S
K
 
Q
L
 
I
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
S
 
D
C
 
T
E
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
|
H
G
 
D
E
 
Y
G
 
K
S
 
G
L
 
F
C
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
E
S
 
V
S
 
S
T
 
T
I
 
V
G
 
G
Y
 
E
E
 
E
R
 
M
K
 
Q
Y
 
H
N
 
N
Y
 
P
A
 
R
L
 
L
Q
 
-
I
 
T
P
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
E
G
 
T
F
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
I
I
 
M
E
 
S
N
 
N
L
 
L
T
 
N
T
 
L
D
 
S
M
 
Y
P
 
P

Q16775 Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 33% coverage: 22:180/481 of query aligns to 71:221/308 of Q16775

query
sites
Q16775
K
 
K
S
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
Q
D
 
P
V
 
Q
E
 
K
I
 
V
Y
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
W
D
|
D
F
x
H
V
 
A
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
K
L
 
L
-
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
L
P
 
K
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
P
 
G
E
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
I
C
 
G
E
 
A
F
 
L
E
 
T
H
 
H
V
 
-
G
 
K
L
 
I
V
 
T
E
 
H
G
 
L
D
 
S
T
 
T
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
E
 
G
D
 
S
M
 
L
T
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
V
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
P
S
 
G
R
 
-
G
 
G
P
 
S
D
 
E
P
 
P
T
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
A
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
x
K
P
 
-
D
 
-
L
x
F
F
x
Y
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
M
A
 
C
S
 
K
T
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
E
S
 
V
L
 
L
H
 
G
K
 
R
K
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
P
S
 
D
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

Sites not aligning to the query:

1qh5B Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
34% identity, 33% coverage: 22:180/481 of query aligns to 23:173/260 of 1qh5B

query
sites
1qh5B
K
 
K
S
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
Q
D
 
P
V
 
Q
E
 
K
I
 
V
Y
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
W
D
|
D
F
x
H
V
 
A
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
K
L
 
L
-
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
L
P
 
K
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
P
 
G
E
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
I
C
 
G
E
 
A
F
 
L
E
 
T
H
 
H
V
 
-
G
 
K
L
 
I
V
 
T
E
 
H
G
 
L
D
 
S
T
 
T
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
E
 
G
D
 
S
M
 
L
T
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
V
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
P
S
 
G
R
 
-
G
 
G
P
 
S
D
 
E
P
 
P
T
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
A
D
 
G
V
x
C
G
 
G
R
x
K
P
 
-
D
 
-
L
 
F
F
x
Y
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
M
A
 
C
S
 
K
T
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
E
S
 
V
L
 
L
H
 
G
K
 
R
K
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
P
S
 
D
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

Sites not aligning to the query:

1qh5A Human glyoxalase ii with s-(n-hydroxy-n-bromophenylcarbamoyl) glutathione (see paper)
34% identity, 33% coverage: 22:180/481 of query aligns to 23:173/260 of 1qh5A

query
sites
1qh5A
K
 
K
S
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
Q
D
 
P
V
 
Q
E
 
K
I
 
V
Y
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
W
D
|
D
F
x
H
V
 
A
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
K
L
 
L
-
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
L
P
 
K
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
P
 
G
E
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
I
C
 
G
E
 
A
F
 
L
E
 
T
H
 
H
V
 
-
G
 
K
L
 
I
V
 
T
E
 
H
G
 
L
D
 
S
T
 
T
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
E
 
G
D
 
S
M
 
L
T
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
V
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
P
S
 
G
R
 
-
G
 
G
P
 
S
D
 
E
P
 
P
T
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
A
D
 
G
V
x
C
G
 
G
R
x
K
P
 
-
D
 
-
L
 
F
F
 
Y
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
M
A
 
C
S
 
K
T
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
E
S
 
V
L
 
L
H
 
G
K
 
R
K
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
P
S
 
D
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

Sites not aligning to the query:

1qh3A Human glyoxalase ii with cacodylate and acetate ions present in the active site (see paper)
34% identity, 33% coverage: 22:180/481 of query aligns to 23:173/260 of 1qh3A

query
sites
1qh3A
K
 
K
S
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
Q
D
 
P
V
 
Q
E
 
K
I
 
V
Y
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
R
S
 
K
R
 
H
G
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
L
T
 
T
H
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
W
D
|
D
F
x
H
V
 
A
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
K
L
 
L
-
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
L
P
 
K
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
P
 
G
E
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
I
C
 
G
E
 
A
F
 
L
E
 
T
H
 
H
V
 
-
G
 
K
L
 
I
V
 
T
E
 
H
G
 
L
D
 
S
T
 
T
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
E
 
G
D
 
S
M
 
L
T
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
C
L
 
L
E
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
|
H
T
 
T
P
 
S
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
V
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
T
 
P
S
 
G
R
 
-
G
 
G
P
 
S
D
 
E
P
 
P
T
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
A
D
 
G
V
x
C
G
 
G
R
 
K
P
 
-
D
 
-
L
 
F
F
x
Y
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
M
A
 
C
S
 
K
T
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
E
S
 
V
L
 
L
H
 
G
K
 
R
K
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
P
S
 
D
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

Sites not aligning to the query:

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
31% identity, 35% coverage: 15:180/481 of query aligns to 37:195/254 of O95571

query
sites
O95571
S
 
T
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
D
K
 
R
K
 
E
S
 
S
-
 
R
-
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
-
D
 
-
V
x
L
E
 
E
I
 
T
Y
 
A
I
 
P
R
 
R
E
 
D
A
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
K
 
K
S
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
H
V
 
I
S
 
T
G
 
G
H
 
S
M
 
G
D
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
C
G
 
Q
A
 
S
P
 
V
I
 
I
Y
 
S
A
 
R
P
 
L
E
 
S
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
C
 
A
E
 
D
F
 
L
E
 
H
H
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
I
V
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
S
F
 
I
E
 
R
I
 
F
E
 
G
D
 
R
M
 
F
T
 
A
V
 
L
K
 
E
V
 
T
L
 
R
E
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
E
 
G
H
 
C
I
 
V
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
V
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
H
S
 
S
R
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
M
V
 
A
F
 
F
C
x
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
V
 
I
G
 
R
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
 
R
P
x
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
Q
G
 
G
K
 
C
A
 
A
R
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
H
S
 
S
L
 
V
H
 
H
K
 
E
K
 
K
L
 
I
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
S
 
D
C
 
C
E
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
31% identity, 35% coverage: 15:180/481 of query aligns to 21:179/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
S
 
T
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
G
G
 
D
K
 
R
K
 
E
S
 
S
-
 
R
-
 
E
C
 
A
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
R
 
-
D
 
-
V
 
L
E
 
E
I
 
T
Y
 
A
I
 
P
R
 
R
E
 
D
A
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
K
 
K
S
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
L
T
 
L
H
 
Y
I
 
A
L
 
V
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
C
H
|
H
A
 
A
D
|
D
F
x
H
V
 
I
S
 
T
G
 
G
H
 
S
M
 
G
D
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
S
L
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
T
 
C
G
 
Q
A
 
S
P
 
V
I
 
I
Y
 
S
A
 
R
P
 
L
E
 
S
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
C
 
A
E
 
D
F
 
L
E
 
H
H
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
I
V
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
S
F
 
I
E
 
R
I
 
F
E
 
G
D
 
R
M
 
F
T
 
A
V
 
L
K
 
E
V
 
T
L
 
R
E
 
A
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
E
 
G
H
 
C
I
 
V
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
V
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
H
S
 
S
R
 
M
G
 
A
P
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
V
 
I
G
 
R
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
F
F
 
Q
P
 
Q
G
 
G
K
 
C
A
 
A
R
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
H
S
 
S
L
 
V
H
 
H
K
 
E
K
 
K
L
 
I
L
 
F
S
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
S
 
D
C
 
C
E
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
H
|
H

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
31% identity, 35% coverage: 15:180/481 of query aligns to 14:169/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
A
 
H
G
 
D
K
 
E
K
 
D
S
 
T
-
 
G
-
 
T
C
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
R
 
-
D
 
E
V
 
A
E
 
E
I
 
P
Y
 
I
I
 
I
R
 
D
E
 
S
A
 
L
K
 
K
S
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
N
I
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
Y
D
|
D
F
x
H
V
 
T
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
D
L
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
I
 
V
Y
 
I
A
 
G
P
 
S
E
 
A
A
 
M
A
 
D
K
 
K
C
 
D
E
 
R
F
 
I
E
 
P
H
 
G
V
 
I
-
 
D
-
 
M
G
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
W
E
 
M
I
 
F
E
 
A
D
 
G
M
 
H
T
 
E
V
 
V
K
 
H
V
 
V
L
 
M
E
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
S
Y
 
L
V
 
Y
V
 
F
S
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
G
P
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
I
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
V
 
S
G
 
L
D
 
S
V
 
C
G
 
G
R
 
K
P
 
-
D
 
-
L
 
L
F
 
F
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
P
R
 
K
E
 
Q
L
 
M
A
 
L
S
 
A
T
 
S
L
 
L
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
T
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
D
C
 
T
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
31% identity, 35% coverage: 15:180/481 of query aligns to 84:239/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
A
 
H
G
 
D
K
 
E
K
 
D
S
 
T
-
 
G
-
 
T
C
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
R
 
-
D
 
E
V
 
A
E
 
E
I
 
P
Y
 
I
I
 
I
R
 
D
E
 
S
A
 
L
K
 
K
S
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
N
I
 
L
T
 
T
H
 
Y
I
 
I
L
 
L
E
 
N
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
Y
D
|
D
F
x
H
V
 
T
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
D
L
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
P
 
K
I
 
V
Y
 
I
A
 
G
P
 
S
E
 
A
A
 
M
A
 
D
K
 
K
C
 
D
E
 
R
F
 
I
E
 
P
H
 
G
V
 
I
-
 
D
-
 
M
G
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
W
E
 
M
I
 
F
E
 
A
D
 
G
M
 
H
T
 
E
V
 
V
K
 
H
V
 
V
L
 
M
E
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
S
Y
 
L
V
 
Y
V
 
F
S
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
G
P
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
I
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
V
 
S
G
 
L
D
 
S
V
 
C
G
 
G
R
 
K
P
 
-
D
 
-
L
 
L
F
 
F
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
P
R
 
K
E
 
Q
L
 
M
A
 
L
S
 
A
T
 
S
L
 
L
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
Q
K
 
K
L
 
I
L
 
T
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
D
C
 
T
E
 
S
V
 
I
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
|
H

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
30% identity, 38% coverage: 1:181/481 of query aligns to 2:186/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
I
 
S
P
 
S
F
 
L
F
 
T
V
 
L
R
 
G
G
 
L
I
 
V
A
 
D
H
 
T
S
 
N
S
 
T
Y
 
Y
I
 
F
L
 
I
A
 
E
G
 
N
K
 
D
K
 
K
S
 
A
C
 
V
A
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
R
 
G
D
 
E
V
 
S
E
 
E
I
 
K
Y
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
K
A
 
L
K
 
N
S
 
Q
R
 
I
G
 
N
L
 
K
K
 
P
I
 
L
T
 
K
H
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
F
x
H
V
 
I
S
 
G
G
 
A
H
 
V
M
 
D
D
 
D
L
 
I
A
 
V
E
 
D
L
 
R
T
 
F
G
 
D
A
 
V
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
A
 
M
P
 
H
E
 
E
A
 
A
A
 
-
K
 
-
C
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
D
H
 
F
V
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
N
E
 
E
G
 
G
D
 
S
T
 
T
F
 
-
E
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
G
M
 
F
T
 
K
V
 
F
K
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
E
 
G
H
 
S
I
 
L
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
V
 
F
S
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
P
 
E
T
 
F
A
 
A
V
 
V
F
 
-
C
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
N
G
 
N
D
 
G
V
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
P
 
K
G
 
G
K
 
D
A
 
Y
R
 
E
E
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
L
Y
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
I
H
 
Q
K
 
D
K
 
K
L
 
I
L
 
F
S
 
E
L
 
L
P
 
E
D
 
G
S
 
D
C
 
L
E
 
P
V
 
L
Y
 
F
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
G

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
29% identity, 39% coverage: 1:187/481 of query aligns to 1:191/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
M
 
M
Q
 
R
I
 
V
I
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
T
V
 
L
R
 
G
G
 
P
I
 
L
A
 
Q
H
 
E
S
 
N
S
 
A
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
A
 
E
G
 
T
K
 
G
K
 
E
S
 
G
C
 
P
A
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
R
 
D
D
 
E
V
 
P
E
 
E
I
 
K
Y
 
L
I
 
L
R
 
A
E
 
L
A
 
F
K
 
Q
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
I
I
 
P
T
 
L
H
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
L
T
 
T
H
|
H
L
 
A
H
|
H
A
 
F
D
|
D
F
x
H
V
 
V
S
 
G
G
 
A
H
 
V
M
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
A
 
L
P
 
H
E
 
P
A
 
L
A
 
D
K
 
L
C
 
P
E
 
L
F
 
Y
E
 
E
H
 
G
V
 
A
G
 
D
L
 
L
V
 
A
E
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
W
G
 
G
D
 
L
T
 
A
F
 
I
E
 
P
I
 
K
E
 
P
D
 
P
M
 
L
T
 
P
V
 
V
K
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
E
 
G
H
 
H
I
 
V
S
 
A
Y
 
F
V
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
Y
G
 
D
P
 
P
D
 
E
P
 
G
T
 
A
A
 
Q
V
 
V
F
 
F
C
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
V
 
R
G
 
G
D
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
Y
D
 
D
L
 
L
F
 
P
P
 
G
G
 
A
K
 
D
A
 
P
R
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
A
T
 
S
L
 
L
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
K
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
S
 
E
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
H
P
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
G
E
 
P
G
 
G
S
 
T
L
 
T
C
 
L
G
 
G

O24496 Hydroxyacylglutathione hydrolase cytoplasmic; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 35% coverage: 15:180/481 of query aligns to 14:174/258 of O24496

query
sites
O24496
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
I
A
 
I
G
 
D
K
 
E
K
 
S
S
 
T
-
 
G
-
 
D
C
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
-
R
 
V
D
 
D
V
 
P
E
 
E
I
 
K
Y
 
V
I
 
I
R
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
E
S
 
K
R
 
H
G
 
Q
L
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
K
H
 
F
I
 
V
L
 
L
E
 
T
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
 
H
A
 
W
D
|
D
F
 
H
V
 
A
S
 
G
G
 
G
H
 
N
M
 
E
D
 
K
L
 
I
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
T
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
I
P
 
K
I
 
V
Y
 
Y
A
 
G
P
 
G
E
 
S
A
 
L
A
 
D
K
 
K
C
 
V
E
 
K
F
 
G
E
 
C
H
 
T
V
 
D
G
 
A
L
 
V
V
 
D
E
 
N
G
 
G
D
 
D
T
 
K
F
 
L
E
 
T
I
 
L
-
 
G
E
 
Q
D
 
D
M
 
I
T
 
N
V
 
I
K
 
L
V
 
A
L
 
L
E
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
 
H
T
 
T
P
 
K
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
V
 
V
S
 
-
D
 
N
T
 
G
S
 
K
R
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
N
P
 
P
T
 
-
A
 
A
V
 
V
F
 
F
C
 
T
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
A
D
 
G
V
x
C
G
 
G
R
x
K
P
 
-
D
 
-
L
 
F
F
 
F
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
M
Y
 
Y
D
 
Q
S
 
S
L
 
L
H
 
C
K
 
V
K
 
T
L
 
L
L
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
K
S
 
P
C
 
T
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8ewoA Crystal structure of putative glyoxylase ii from pseudomonas aeruginosa
32% identity, 34% coverage: 19:180/481 of query aligns to 22:171/259 of 8ewoA

query
sites
8ewoA
A
 
A
G
 
T
K
 
S
K
 
R
S
 
R
C
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
-
 
G
-
 
D
Q
 
A
R
 
K
D
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
A
Y
 
W
I
 
L
R
 
-
E
 
-
A
 
A
K
 
A
S
 
H
R
 
P
G
 
D
L
 
W
K
 
R
I
 
L
T
 
S
H
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
V
T
 
T
H
|
H
L
 
H
H
|
H
A
 
H
D
|
D
F
x
H
V
 
V
S
 
G
G
 
G
H
 
V
M
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
R
I
 
V
Y
 
L
A
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
K
C
 
I
E
 
P
F
 
A
E
 
R
H
 
D
V
 
L
G
 
A
L
 
L
V
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
E
T
 
R
F
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
L
D
 
G
M
 
L
T
 
V
V
 
F
K
 
E
V
 
I
L
 
F
E
 
H
T
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
L
E
 
G
H
 
H
I
 
I
S
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
V
 
-
S
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
H
G
 
P
P
 
A
D
 
E
P
 
T
T
 
P
A
 
L
V
 
L
F
 
F
C
 
C
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
A
G
 
A
D
 
G
V
 
C
G
 
G
R
 
R
P
 
-
D
 
-
L
 
L
F
 
F
P
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
P
R
 
A
E
 
Q
L
 
M
A
 
H
S
 
H
T
 
S
L
 
L
Y
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
A
S
 
N
C
 
T
E
 
R
V
 
V
Y
 
Y
P
 
C
A
 
T
H
|
H

Query Sequence

>WP_011021797.1 NCBI__GCF_000007345.1:WP_011021797.1
MQIIPFFVRGIAHSSYILAGKKSCAIIDPQRDVEIYIREAKSRGLKITHILETHLHADFV
SGHMDLAELTGAPIYAPEAAKCEFEHVGLVEGDTFEIEDMTVKVLETPGHTPEHISYVVS
DTSRGPDPTAVFCGDTLFVGDVGRPDLFPGKARELASTLYDSLHKKLLSLPDSCEVYPAH
GEGSLCGRAMGAKRSSTIGYERKYNYALQIPDREGFIENLTTDMPPAPYHFSRCSEINRK
GPTKLREIPPPKELPPGEFFRFAGRDNTEVLDSRHYDNFGGEHVPGAWCIDLRSNFATYA
GWLLPPERQILLVSDSEKDARESAVWLHRVGLDRIAGFLSGEMFAWATAGLRASHVSQVS
IPELYEWVRSKNPPLILDVRASSEYESFHIENALNIQVQDLRKRYRELDPEAEYAVICST
GQRSGIGCSILKKHGFSRVNNAAGGMTGYNAAGFGPECPMCALSWAGKAGKKEVVPIQKG
K

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory