SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011022656.1 NCBI__GCF_000007345.1:WP_011022656.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

7d54A Crstal structure msgatase with gln (see paper)
28% identity, 79% coverage: 40:227/238 of query aligns to 53:234/242 of 7d54A

query
sites
7d54A
P
 
P
S
 
D
L
 
P
D
 
T
S
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
V
I
 
P
M
 
L
G
 
G
G
x
A
P
 
R
M
 
W
G
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
E
Y
 
Q
A
 
S
-
 
L
E
 
V
N
 
G
P
 
T
W
 
W
L
 
V
R
 
T
D
 
A
E
 
E
K
 
M
S
 
D
F
 
M
I
 
M
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
V
P
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
|
C
L
 
F
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
S
I
 
V
Y
 
A
E
 
R
N
 
A
G
 
E
H
 
T
R
 
A
E
 
E
M
 
V
G
 
G
W
 
W
F
 
F
P
 
E
V
 
L
K
 
D
A
 
T
V
 
D
R
 
D
K
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
I
E
 
A
E
 
P
I
 
G
T
 
P
V
 
W
F
 
F
H
 
Q
W
|
W
H
 
H
S
 
F
R
 
D
T
 
R
F
 
W
D
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
T
H
 
E
L
 
I
F
 
A
R
 
R
S
 
T
E
 
S
G
 
R
C
 
-
K
 
S
N
 
S
Q
 
Q
G
 
A
F
 
F
I
 
V
Y
 
L
G
 
-
G
 
G
R
 
R
V
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
H
 
D
E
 
V
E
 
D
R
 
L
V
 
L
E
 
E
S
 
G
M
x
W
I
 
L
R
 
A
R
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
E
-
 
G
F
 
I
G
 
S
G
 
G
E
 
K
S
 
L
G
 
G
-
 
Y
-
 
N
N
 
H
G
 
D
P
 
D
F
 
L
T
 
R
Q
 
L
R
 
R
K
 
T
E
 
K
E
 
E
M
 
L
V
 
V
G
 
-
Q
 
-
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
L
 
A
V
 
V
E
 
R
T
 
V
K
 
R
K
 
E
F
 
L
M
 
V
F
 
R
A
 
A
V
 
F
L
 
L
D
 
D
K
 
K

P49915 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]; GMP synthetase; Glutamine amidotransferase; EC 6.3.5.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
28% identity, 86% coverage: 18:221/238 of query aligns to 47:240/693 of P49915

query
sites
P49915
E
 
E
E
 
L
Y
 
F
A
 
V
K
 
Q
T
 
S
R
 
E
S
 
I
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
E
 
E
S
 
T
T
 
P
R
 
A
F
 
F
Y
 
A
E
 
I
T
 
K
K
 
E
N
 
Q
P
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
I
M
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
P
M
 
N
G
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
-
Y
 
A
A
 
E
E
 
D
N
 
A
P
 
P
W
 
W
L
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
F
 
F
I
 
D
K
 
P
Q
 
A
A
 
I
I
 
F
D
 
T
A
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
L
 
Y
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
L
 
M
L
 
M
A
 
N
N
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
H
E
 
K
N
 
K
G
 
S
H
 
V
R
 
R
E
 
E
M
 
D
G
 
G
W
 
V
F
 
F
P
 
N
V
 
I
K
 
S
A
 
V
V
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
D
N
 
N
K
 
T
P
 
C
E
 
S
F
 
L
L
 
F
K
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
E
 
K
E
 
E
I
 
E
T
 
V
V
 
V
F
 
L
H
 
L
W
 
T
H
 
H
S
 
G
R
 
D
T
 
S
F
 
V
D
 
D
-
 
K
L
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
V
 
K
H
 
V
L
 
V
F
 
A
R
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
V
E
 
A
G
 
G
C
 
I
K
 
A
N
 
N
Q
 
E
G
 
S
-
 
K
F
 
K
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
H
 
G
-
 
L
E
 
T
E
 
E
R
 
N
V
 
G
E
 
K
S
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
G
 
A
G
 
G
E
 
C
S
 
S
G
 
G
N
 
T
G
 
F
P
 
T
F
 
V
T
 
Q
Q
 
N
R
 
R
K
 
E
E
 
L
E
 
E
M
 
C
V
 
I
G
 
R
Q
 
E
E
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
G
T
 
T
K
 
S
K
 
K
F
 
V
M
 
L

Sites not aligning to the query:

2vxoB Human gmp synthetase in complex with xmp (see paper)
27% identity, 86% coverage: 18:221/238 of query aligns to 25:215/658 of 2vxoB

query
sites
2vxoB
E
 
E
E
 
L
Y
 
F
A
 
V
K
 
Q
T
 
S
R
 
E
S
 
I
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
E
 
E
S
 
T
T
 
P
R
 
A
F
 
F
Y
 
A
E
 
I
T
 
K
K
 
E
N
 
Q
P
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
A
L
 
I
I
 
I
I
 
I
M
 
S
G
 
G
G
|
G
P
 
P
M
 
N
G
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
-
Y
 
A
A
 
E
E
 
D
N
 
A
P
 
P
W
 
W
L
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
F
 
F
I
 
D
K
 
P
Q
 
A
A
 
I
I
 
F
D
 
T
A
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
L
 
M
L
 
M
A
 
N
N
 
K
I
 
V
L
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
H
E
 
K
N
 
K
G
 
S
H
 
D
R
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
G
W
 
V
F
 
F
P
 
N
V
 
I
K
 
S
A
 
V
V
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
D
N
 
N
K
 
T
P
 
C
E
 
S
F
 
L
L
 
F
K
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
E
 
K
E
 
E
I
 
E
T
 
V
V
 
V
F
 
L
H
 
L
W
 
T
H
 
H
S
 
G
R
 
D
T
 
S
F
 
V
D
 
D
-
 
K
L
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
V
 
K
H
 
V
L
 
V
F
 
A
R
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
V
E
 
A
G
 
G
C
 
I
K
 
A
N
 
N
Q
 
E
G
 
S
-
 
K
F
 
K
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
H
 
G
-
 
L
E
 
T
E
 
E
R
 
N
V
 
G
E
 
K
S
 
V
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
G
 
A
G
 
G
E
 
C
S
 
S
G
 
G
N
 
T
G
 
F
P
 
T
F
 
V
T
 
Q
Q
 
N
R
 
R
K
 
E
E
 
L
E
 
E
M
 
C
V
 
I
G
 
R
Q
 
E
E
 
I
K
 
K
Y
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
G
T
 
T
K
 
S
K
 
K
F
 
V
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5tw7F Crystal structure of a gmp synthase (glutamine-hydrolyzing) from neisseria gonorrhoeae
29% identity, 61% coverage: 48:191/238 of query aligns to 50:187/490 of 5tw7F

query
sites
5tw7F
L
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
S
G
 
G
G
|
G
P
 
P
M
 
N
G
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
E
N
 
S
P
 
D
W
 
Y
L
 
Q
R
 
A
D
 
D
E
 
T
K
 
G
S
 
I
F
 
F
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
L
 
F
L
 
M
A
 
A
N
 
H
I
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
I
 
V
Y
 
Q
E
 
P
N
 
G
G
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
E
M
 
F
G
 
G
W
 
Y
F
 
A
P
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
T
V
 
I
R
 
D
K
 
S
E
 
G
E
 
L
N
 
T
K
 
R
P
 
-
E
 
G
F
 
I
L
 
Q
K
 
D
G
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
N
E
 
T
I
 
L
T
 
D
V
 
V
F
 
W
H
 
M
W
 
S
H
 
H
-
 
G
S
 
D
R
 
K
T
 
V
F
 
S
D
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
F
V
 
A
H
 
V
L
 
I
F
 
G
R
 
D
S
 
T
E
 
P
G
 
S
C
 
C
-
 
P
-
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
M
-
 
E
K
 
N
N
 
T
Q
 
E
G
 
K
F
 
Q
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
-
 
T
H
 
H
E
 
T
E
 
K
R
 
Q
V
 
G
E
 
R
S
 
A
M
 
L
I
 
L
R
 
N
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2ywcA Crystal structure of gmp synthetase from thermus thermophilus in complex with xmp
34% identity, 55% coverage: 48:179/238 of query aligns to 46:167/475 of 2ywcA

query
sites
2ywcA
L
 
L
I
 
I
I
 
L
M
 
S
G
 
G
G
|
G
P
 
P
M
x
R
G
 
S
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
-
 
P
Y
 
D
A
 
A
E
 
P
N
 
R
P
 
P
W
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
D
E
 
P
K
 
R
S
 
L
F
 
F
I
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
S
A
 
S
G
 
G
K
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
I
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
R
I
 
V
Y
 
E
E
 
R
N
 
A
G
 
G
H
 
R
R
 
A
E
 
E
M
 
Y
G
 
G
W
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
K
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
L
K
 
T
E
 
R
E
 
H
N
 
E
K
 
G
P
 
P
E
 
L
F
 
F
L
 
-
K
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
E
E
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
Q
V
 
V
F
 
W
H
 
M
W
 
S
H
 
H
S
 
Q
R
 
D
T
 
A
F
 
V
D
 
T
L
 
A
P
 
P
E
 
P
G
 
P
A
 
G
V
 
W
H
 
R
L
 
V
F
 
V
R
 
A
S
 
E
E
 
T
G
 
E
C
 
E
K
 
N
N
 
P
Q
 
V
G
 
A
F
 
A
I
 
I
Y
 
A
G
 
S
-
 
P
-
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
A
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7yc6A Crystal structure of d110p mutant of gatase subunit of methanocaldococcus jannaschii gmp synthetase
30% identity, 56% coverage: 64:196/238 of query aligns to 53:179/183 of 7yc6A

query
sites
7yc6A
P
 
P
W
 
D
L
 
I
R
 
E
D
 
K
E
 
A
K
 
K
S
 
N
F
 
C
I
 
I
K
 
D
Q
 
I
A
 
A
I
 
L
D
 
N
A
 
A
G
 
K
K
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
L
 
L
G
 
G
A
 
H
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
L
I
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
R
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
V
G
 
G
W
 
R
F
 
A
P
 
A
V
 
L
K
 
T
A
 
K
V
 
V
R
 
Y
K
 
V
E
x
D
E
 
K
N
 
E
K
 
N
P
 
P
E
 
L
F
 
F
L
 
-
K
 
K
G
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
F
T
 
N
V
 
A
F
 
W
H
 
A
W
 
S
H
 
H
-
 
K
S
 
D
R
x
E
T
 
V
F
 
K
D
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
E
H
 
I
L
 
L
F
 
A
R
x
H
S
 
S
E
 
D
G
 
I
C
|
C
K
 
Q
N
 
V
Q
 
E
G
 
A
F
 
M
I
 
K
Y
 
H
G
 
K
G
 
T
R
 
K
-
 
P
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
-
 
A
H
 
H
E
 
T
E
 
E
R
 
Y
V
 
G
E
 
N
S
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
G
 
C
G
 
K
E
 
V
S
 
C
G
 
G

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
29% identity, 58% coverage: 43:180/238 of query aligns to 230:357/2224 of P05990

query
sites
P05990
D
 
E
S
 
Q
F
 
F
D
 
D
L
 
A
L
 
L
I
 
F
I
 
L
M
 
S
G
 
N
G
 
G
P
 
P
M
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
G
N
 
N
P
 
P
W
 
E
L
 
S
R
 
C
D
 
D
E
 
Q
-
 
I
K
 
V
S
 
Q
F
 
Q
I
 
V
K
 
R
Q
 
K
A
 
V
I
 
I
D
 
E
A
 
E
G
 
G
-
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
F
G
 
G
I
 
I
C
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
H
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
K
I
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
C
R
 
S
I
 
T
Y
 
Y
E
 
K
N
 
M
G
 
K
H
 
Y
R
 
G
E
 
N
M
 
R
G
 
G
W
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
H
N
 
N
K
 
L
P
 
P
E
 
C
F
 
L
L
 
H
K
 
R
G
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
R
E
 
C
I
 
L
T
 
M
V
 
T
F
 
S
H
 
Q
W
 
N
H
 
H
S
 
G
R
 
Y
T
 
A
F
 
V
D
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
W
V
 
S
H
 
E
L
 
L
F
 
F
-
 
V
R
 
N
S
 
A
E
 
N
G
 
D
C
 
G
K
 
T
N
 
N
Q
 
E
G
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
H
G
 
A
G
 
S
R
 
K
-
 
P
V
 
Y
V
 
F
A
 
S
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
H
H
 
H

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
33% identity, 41% coverage: 81:178/238 of query aligns to 246:338/2225 of P08955

query
sites
P08955
K
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
F
G
 
G
I
 
I
C
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
H
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
L
I
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
T
Y
 
Y
E
 
K
N
 
M
G
 
R
H
 
Y
R
 
G
E
 
N
M
 
R
G
 
G
W
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
H
N
 
N
K
 
Q
P
 
P
E
 
C
F
 
L
L
 
L
K
 
V
G
 
G
L
 
T
P
 
G
E
 
R
E
 
C
I
 
F
T
 
L
V
 
T
F
 
S
H
 
Q
W
 
N
H
 
H
S
 
G
R
 
F
T
 
A
F
 
V
D
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
A
 
W
V
 
T
H
 
P
L
 
L
F
 
F
-
 
T
R
 
N
S
 
A
E
 
N
G
 
D
C
 
C
K
 
S
N
 
N
Q
 
E
G
 
G
F
 
I
I
 
V
Y
 
H
G
 
D
G
 
S
-
 
L
R
 
P
V
 
F
V
 
F
A
 
S
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1gpmA Escherichia coli gmp synthetase complexed with amp and pyrophosphate (see paper)
28% identity, 48% coverage: 78:191/238 of query aligns to 75:195/501 of 1gpmA

query
sites
1gpmA
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
F
G
 
G
I
 
V
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
A
 
M
Q
 
Q
L
 
T
L
 
M
A
 
A
N
 
M
I
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
H
I
 
V
Y
 
E
E
 
A
N
 
S
G
 
N
H
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
F
G
 
G
W
 
Y
F
 
A
P
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
N
K
 
D
P
 
S
E
 
A
F
 
L
L
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
I
P
 
E
E
 
D
E
 
A
I
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
D
V
 
V
F
 
W
H
 
M
W
 
S
H
 
H
-
 
G
S
 
D
R
 
K
T
 
V
F
 
T
D
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
A
 
F
V
 
I
H
 
T
L
 
V
F
 
A
R
 
S
S
 
T
E
 
E
G
 
S
C
 
C
-
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
M
-
 
A
K
 
N
N
 
E
Q
 
E
G
 
K
F
 
R
I
 
F
Y
 
Y
G
 
G
G
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
V
 
V
-
 
T
H
 
H
E
 
T
E
 
R
R
 
Q
V
 
G
E
 
M
S
 
R
M
 
M
I
 
L
R
 
E
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8hx8A Crystal structure of 4-amino-4-deoxychorismate synthase from streptomyces venezuelae co-crystallized with chorismate (see paper)
29% identity, 58% coverage: 42:178/238 of query aligns to 45:173/673 of 8hx8A

query
sites
8hx8A
L
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
D
 
D
L
 
A
L
 
I
I
 
V
I
 
V
M
 
S
G
 
P
G
 
G
P
 
P
M
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
-
D
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
G
N
 
S
P
 
P
W
 
D
L
 
R
R
 
E
D
 
R
E
 
D
K
 
F
S
 
G
F
 
I
I
 
S
K
 
R
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
-
 
T
D
 
D
A
 
S
G
 
G
K
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
C
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
H
Q
 
Q
L
 
G
L
 
I
A
 
A
N
 
Q
I
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
G
R
 
T
I
 
V
Y
 
G
E
 
L
N
 
A
G
 
P
H
 
E
R
 
P
E
 
M
M
 
H
G
 
G
W
 
R
F
 
-
P
 
-
V
 
V
K
 
S
A
 
E
V
 
V
R
 
R
K
 
-
E
 
-
E
 
H
N
 
T
K
 
G
P
 
E
E
 
D
F
 
V
L
 
F
K
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
S
E
 
P
I
 
F
T
 
T
V
 
A
F
 
V
H
 
R
W
 
Y
H
 
H
S
 
S
-
 
L
R
 
A
T
 
A
F
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
E
A
 
L
V
 
E
H
 
P
L
 
L
F
 
A
R
 
W
S
 
S
E
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
N
 
D
Q
 
D
G
 
G
F
 
V
I
 
V
Y
 
M
G
 
G
G
 
L
R
 
R
-
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
P
V
 
L
V
 
W
A
 
G
L
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011022656.1 NCBI__GCF_000007345.1:WP_011022656.1
MKLQVLQHSALNTLGTIEEYAKTRSYPLESTRFYETKNPPSLDSFDLLIIMGGPMGIYDY
AENPWLRDEKSFIKQAIDAGKPVLGICLGAQLLANILGARIYENGHREMGWFPVKAVRKE
ENKPEFLKGLPEEITVFHWHSRTFDLPEGAVHLFRSEGCKNQGFIYGGRVVALQFHPEVH
EERVESMIRRFGGESGNGPFTQRKEEMVGQEKYLVETKKFMFAVLDKFEKIAGKGRLE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory