SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011022931.1 NCBI__GCF_000007345.1:WP_011022931.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ey5B Lbcats
68% identity, 95% coverage: 13:396/403 of query aligns to 1:381/383 of 5ey5B

query
sites
5ey5B
G
 
G
K
 
R
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
E
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
R
Y
 
A
K
 
K
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
F
L
 
Q
A
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
E
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
E
N
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
K
K
 
D
Y
 
L
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
N
H
 
H
G
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
K
R
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
T
V
 
V
G
 
A
A
 
A
T
 
M
L
 
F
G
 
G
F
 
L
E
 
E
T
 
C
I
 
V
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
M
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
P
V
 
V
E
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
T
N
 
N
I
 
V
E
 
E
N
 
D
T
 
T
H
 
F
Y
 
Y
L
 
I
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
I
 
M
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
E
V
 
A
K
 
R
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
H
P
 
P
F
 
F
I
 
I
E
 
D
D
 
D
R
 
E
E
 
S
V
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
E
C
 
T
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
L
C
 
S
I
 
A
G
 
G
E
 
R
E
 
P
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
M
T
 
T
K
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
A
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
S
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
E
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
P
S
 
E
G
 
L
E
 
S
L
 
K
G
 
D
E
 
Q
F
 
I
V
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
V
E
 
N
T
 
T
V
 
V

8vhhA Engineered holo tryptophan synthase (tm9d8 ) Derived from t. Maritima trpb (see paper)
65% identity, 96% coverage: 12:398/403 of query aligns to 1:379/389 of 8vhhA

query
sites
8vhhA
K
 
K
G
 
G
K
 
Y
Y
 
F
G
 
G
K
 
P
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
M
 
M
P
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
A
G
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
G
Y
 
I
K
 
M
N
 
K
D
 
D
P
 
E
E
 
S
S
 
F
L
 
W
A
 
K
E
 
E
L
 
F
D
 
N
H
 
D
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
R
N
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
L
H
 
H
G
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
T
V
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
F
G
 
G
F
 
M
E
 
E
T
 
C
I
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
E
K
 
E
D
 
D
I
 
T
K
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
V
Y
 
E
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
K
V
 
V
R
 
V
A
 
P
V
 
V
E
 
K
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
N
 
N
I
 
L
E
 
Q
N
 
T
T
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
I
 
F
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
E
V
 
T
K
 
K
E
 
K
Q
 
Q
A
 
I
M
 
P
E
 
E
K
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
Y
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
I
E
 
-
D
 
D
R
 
S
E
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
T
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
L
I
 
K
G
 
G
E
 
K
E
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
L
H
 
H
G
 
G
A
 
S
R
 
K
T
 
T
K
 
F
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
D
N
 
W
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
Q
E
 
V
S
 
S
E
 
H
S
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
W
S
 
R
E
 
E
S
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
L
A
 
Y
R
 
D
Y
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
I
A
 
N
E
 
I
S
 
K
G
 
G
E
 
K
L
 
V
G
 
-
E
 
-
F
 
-
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
E
T
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
N

5t6mB Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
62% identity, 96% coverage: 15:399/403 of query aligns to 3:384/386 of 5t6mB

query
sites
5t6mB
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V

1v8zA X-ray crystal structure of the tryptophan synthase b2 subunit from hyperthermophile, pyrococcus furiosus (see paper)
62% identity, 96% coverage: 15:399/403 of query aligns to 3:384/386 of 1v8zA

query
sites
1v8zA
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V

5dw0A Trpb from pyrococcus furiosus with l-serine bound as the external aldimine (see paper)
62% identity, 97% coverage: 15:403/403 of query aligns to 3:388/388 of 5dw0A

query
sites
5dw0A
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
|
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V
R
 
S
R
 
G
G
 
N
V
 
V

6am8B Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9 with trp bound as e(aex2) (see paper)
63% identity, 95% coverage: 15:397/403 of query aligns to 3:382/385 of 6am8B

query
sites
6am8B
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
|
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
V
P
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
x
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
|
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
x
S
H
|
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
S
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L

5dw3A Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with product l-tryptophan non-covalently bound in the active site (see paper)
62% identity, 96% coverage: 15:399/403 of query aligns to 3:383/383 of 5dw3A

query
sites
5dw3A
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
-
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V

5t6mA Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
62% identity, 96% coverage: 15:399/403 of query aligns to 3:382/383 of 5t6mA

query
sites
5t6mA
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
-
N
 
-
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V

5ixjD Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with l- threonine non-covalently bound in the active site (see paper)
62% identity, 97% coverage: 15:403/403 of query aligns to 3:386/394 of 5ixjD

query
sites
5ixjD
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
I
P
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
-
N
 
-
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
T
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
|
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
K
L
 
V
R
 
S
R
 
G
G
 
N
V
 
V

7rnpA Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9_h275e with 4-cl-trp non-covalently bound (see paper)
63% identity, 95% coverage: 15:397/403 of query aligns to 3:382/384 of 7rnpA

query
sites
7rnpA
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
V
P
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
|
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
S
H
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
E
N
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
S
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L

5vm5D Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9, with ser bound (see paper)
63% identity, 95% coverage: 15:397/403 of query aligns to 3:380/383 of 5vm5D

query
sites
5vm5D
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
V
P
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
I
 
V
E
 
N
D
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
E
C
 
S
T
 
G
E
 
K
K
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
C
 
N
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
E
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
S
H
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
L
T
 
S
K
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
-
N
 
-
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
K
E
 
P
S
 
S
E
 
H
S
 
S
V
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
S
 
P
G
 
G
V
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
E
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
V
 
A
T
 
E
A
 
Y
R
 
V
Y
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
F
N
 
H
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
S
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
K
 
M
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
E
G
 
M
E
 
S
L
 
R
G
 
D
E
 
E
F
 
I
V
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
I
V
 
V
L
 
L

6cuzA Engineered trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3r)- ethylserine bound as the amino-acrylate (see paper)
62% identity, 95% coverage: 15:397/403 of query aligns to 3:382/383 of 6cuzA

query
sites
6cuzA
Y
 
F
G
 
G
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
L
M
 
V
P
 
G
A
 
P
L
 
L
E
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
V
 
K
G
 
A
Y
 
Y
E
 
K
K
 
R
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
E
E
 
E
S
 
F
L
 
N
A
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
T
F
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
K
 
E
K
 
K
Y
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
A
K
 
K
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
K
|
K
L
 
T
N
 
N
N
 
N
A
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
K
T
 
V
I
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
M
 
M
N
 
N
A
 
V
Y
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
I
A
 
P
V
 
V
E
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
T
L
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
W
V
 
E
T
 
A
N
 
T
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
M
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
E
 
E
V
 
A
K
 
K
E
 
A
Q
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
S
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A