SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011031992.1 NCBI__GCF_000007065.1:WP_011031992.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q42601 Carbamoyl phosphate synthase arginine-specific large chain, chloroplastic; CPS; CPSase; Ammonium-dependent carbamoyl phosphate synthetase; Arginine-specific carbamoyl phosphate synthetase, ammonia chain; Glutamine-dependent carbamoyl phosphate synthetase; Protein VENOSA 3; EC 6.3.4.16; EC 6.3.5.5 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
51% identity, 98% coverage: 3:1051/1073 of query aligns to 94:1164/1187 of Q42601

query
sites
Q42601
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
L
K
 
K
K
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
E
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
|
P
E
 
E
M
 
T
A
 
A
D
 
N
S
 
R
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
A
P
 
P
L
 
M
D
 
T
A
 
P
R
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
I
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
L
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
L
T
 
A
S
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
S
G
 
G
V
 
A
F
 
L
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
K
V
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
I
K
 
K
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
E
 
D
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
N
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
P
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
G
H
 
T
S
 
T
L
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
C
E
 
F
E
 
D
V
 
I
V
 
A
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
E
L
 
F
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
R
 
R
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
S
I
 
I
T
 
C
E
 
K
R
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
A
S
 
S
R
 
A
I
 
T
N
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
L
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
A
 
L
N
 
A
D
 
D
T
 
N
C
 
V
I
 
V
V
 
I
I
 
I
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
D
P
 
P
M
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
D
A
 
Y
S
 
S
I
 
I
K
 
A
I
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
C
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
K
 
N
-
 
P
-
 
V
E
 
D
G
 
G
D
 
E
Y
 
V
R
 
M
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
M
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
S
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
V
 
P
N
 
N
S
 
D
V
 
I
T
 
T
K
 
R
S
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
A
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
P
T
 
G
A
 
S
D
 
Q
K
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
S
M
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
E
I
 
C
D
 
G
-
 
F
N
 
S
Q
 
G
L
 
W
G
 
G
I
 
C
K
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
D
W
 
W
D
 
D
E
 
W
P
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
Y
L
 
S
L
 
L
K
 
R
T
 
V
P
 
P
T
 
N
S
 
P
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
H
V
 
A
I
 
I
F
 
Y
H
 
A
A
 
A
L
 
M
E
 
K
R
 
K
G
 
G
M
 
M
S
 
K
I
 
I
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
T
 
S
S
 
M
I
 
V
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
T
K
 
Q
M
 
L
K
 
K
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
D
M
 
V
E
 
E
K
 
Q
C
 
Y
I
 
L
R
 
M
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
L
E
 
S
E
 
E
L
 
I
T
 
T
P
 
K
E
 
E
F
 
D
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
V
 
V
K
 
K
R
 
K
M
 
R
G
|
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
F
L
 
A
T
 
T
G
 
K
K
 
T
T
 
T
R
 
E
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
S
 
R
D
 
T
F
 
K
R
 
R
H
 
I
E
 
S
E
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
V
A
 
P
T
 
S
F
 
Y
K
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
H
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
S
Y
 
Y
E
 
D
D
 
V
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
A
S
 
P
T
 
N
D
 
N
K
 
K
K
 
K
K
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
C
H
 
H
A
 
T
V
 
S
T
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
L
N
 
N
N
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
L
T
 
T
M
 
I
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
H
E
 
Y
L
 
L
K
 
D
R
 
K
R
 
H
T
 
M
D
 
P
L
 
M
N
 
S
T
 
L
V
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
R
I
 
I
L
 
W
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
S
M
 
I
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
N
L
 
A
L
 
I
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
I
P
 
E
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
T
 
K
S
 
S
Q
 
E
Q
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
L
E
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
I
 
S
D
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
T
Y
 
Y
M
 
L
K
 
E
E
 
N
A
|
A
V
 
V
R
 
Q
V
 
V
S
 
D
P
 
P
E
 
E
H
 
R
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
K
F
 
Y
L
 
L
E
 
S
A
 
D
A
 
A
C
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
T
V
 
L
C
 
T
D
 
D
Q
 
S
I
 
Y
-
 
G
D
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
P
K
 
A
E
 
S
V
 
C
L
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
I
R
 
R
D
 
T
Y
 
W
T
 
T
R
 
T
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
K
L
 
L
R
 
N
V
 
V
K
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
C
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
A
-
 
I
E
 
T
K
 
T
G
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
H
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
Y
A
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
V
I
 
M
A
 
S
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
N
Y
 
F
T
 
E
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
K
H
 
H
V
 
V
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
 
E
V
 
A
L
 
V
L
 
F
P
 
P
F
 
F
D
 
E
K
 
K
L
 
F
P
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
P
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
|
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
S
V
 
I
D
 
S
Y
 
S
D
 
E
F
 
F
G
 
S
R
 
S
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
M
A
 
A
E
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
G
N
 
Q
L
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
K
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
S
I
 
L
R
 
N
N
 
D
A
 
M
D
 
T
K
 
K
P
 
P
E
 
H
L
 
L
V
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
A
R
 
V
K
 
S
L
 
F
Q
 
L
A
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
I
M
 
V
G
 
A
T
 
T
R
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
H
Y
 
F
L
 
L
A
 
E
Q
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
I
F
 
P
M
 
V
D
 
E
T
 
R
V
 
V
K
 
L
K
 
K
V
 
L
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
A
I
 
A
D
 
D
M
 
M
M
 
V
R
 
A
R
 
N
D
 
G
E
 
Q
V
 
I
D
 
H
L
 
L
I
 
M
I
 
L
N
 
I
T
 
T
P
 
S
T
 
S
S
 
G
-
 
D
K
 
A
M
 
L
S
 
D
R
 
Q
K
 
K
D
 
D
G
 
G
Y
 
R
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
A
 
M
A
 
A
V
 
L
D
 
A
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
P
Y
 
V
I
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
V
Q
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
E
A
 
G
I
 
I
E
 
K
T
 
S
M
 
L
K
 
K

1bxrA Structure of carbamoyl phosphate synthetase complexed with the atp analog amppnp (see paper)
50% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1073/1073 of 1bxrA

query
sites
1bxrA
M
 
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
|
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
x
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
x
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
S
 
S
V
x
L
L
x
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
 
I
H
|
H
T
|
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
x
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
A
N
 
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
x
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
x
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
|
L
G
|
G
G
|
G
R
 
R
A
 
A
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
S
V
 
V
S
|
S
P
 
N
E
 
D
H
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
D
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
|
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
|
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
|
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
 
T
R
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
 
K
V
 
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
 
Y
I
x
D
T
|
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

P00968 Carbamoyl phosphate synthase large chain; Carbamoyl phosphate synthetase ammonia chain; EC 6.3.4.16; EC 6.3.5.5 from Escherichia coli (strain K12) (see 6 papers)
50% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1073/1073 of P00968

query
sites
P00968
M
|
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
 
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
 
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
 
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
|
E
S
 
S
V
x
L
L
 
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
 
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
 
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
 
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
A
N
 
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
 
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
S
V
 
V
S
 
S
P
 
N
E
 
D
H
 
A
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
x
H
F
 
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
 
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
D
 
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
 
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
 
T
R
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
 
K
V
 
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
 
Y
I
 
D
T
 
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

1t36A Crystal structure of e. Coli carbamoyl phosphate synthetase small subunit mutant c248d complexed with uridine 5'-monophosphate (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1058/1058 of 1t36A

query
sites
1t36A
M
 
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
|
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
x
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
x
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
|
E
S
 
S
V
x
L
L
x
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
x
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
x
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
A
N
 
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
x
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
|
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
|
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
|
L
G
 
G
P
|
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
|
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
|
T
R
 
H
G
|
G
T
|
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
|
K
V
 
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
|
N
T
|
T
P
x
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
 
D
G
x
S
Y
 
R
R
 
V
I
|
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
 
Y
I
x
D
T
|
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

1c3oA Crystal structure of the carbamoyl phosphate synthetase: small subunit mutant c269s with bound glutamine (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1058/1058 of 1c3oA

query
sites
1c3oA
M
 
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
|
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
x
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
x
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
S
 
S
V
x
L
L
x
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
 
I
H
|
H
T
|
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
x
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
x
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
x
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
x
A
A
x
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
A
N
|
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
x
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
|
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
|
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
|
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
 
T
R
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
 
K
V
 
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
 
Y
I
x
D
T
|
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

1ce8A Carbamoyl phosphate synthetase from escherichis coli with complexed with the allosteric ligand imp (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1058/1058 of 1ce8A

query
sites
1ce8A
M
 
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
|
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
x
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
x
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
S
 
S
V
x
L
L
x
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
x
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
x
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
x
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
x
A
A
x
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
|
E
T
 
A
N
|
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
x
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
M
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
|
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
|
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
|
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
|
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
|
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
|
T
R
 
H
G
|
G
T
|
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
|
K
V
|
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
x
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
|
N
T
|
T
P
x
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
|
D
G
x
S
Y
 
R
R
x
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
|
Y
I
x
D
T
|
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

1a9xA Carbamoyl phosphate synthetase: caught in the act of glutamine hydrolysis (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:1069/1073 of query aligns to 1:1058/1058 of 1a9xA

query
sites
1a9xA
M
 
M
P
 
P
K
 
K
R
 
R
E
 
T
D
 
D
I
 
I
K
 
K
K
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
Y
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
T
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
D
 
H
A
 
W
R
 
E
I
 
V
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
V
I
 
L
A
 
P
G
 
T
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
E
K
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
D
N
 
K
T
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
R
L
 
R
F
 
F
K
 
D
E
 
V
T
 
A
M
 
M
L
 
K
S
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
L
K
 
E
V
 
T
P
 
A
L
 
R
S
 
S
R
 
G
A
 
I
V
 
A
H
 
H
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
A
E
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
C
I
|
I
I
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
T
 
T
L
x
M
G
|
G
G
|
G
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Y
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
C
E
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
D
R
 
L
S
 
S
R
 
P
I
 
T
N
x
K
Q
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
S
 
S
V
x
L
L
 
I
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
Y
E
 
E
Y
 
M
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
K
N
 
N
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
I
I
 
V
C
 
C
N
 
S
M
 
I
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
|
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
R
 
R
S
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
M
K
 
A
I
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
G
I
 
V
E
 
E
-
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
P
K
 
K
E
 
N
G
 
G
D
 
R
Y
 
L
R
 
I
I
 
V
V
x
I
E
|
E
V
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
S
x
D
V
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
G
-
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
F
P
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
G
A
 
A
D
 
N
K
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
A
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
F
D
 
D
N
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
S
I
 
L
K
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
D
E
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
R
L
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
D
P
 
A
T
 
G
S
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
I
F
 
W
V
 
Y
I
 
I
F
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
F
E
 
R
R
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
F
E
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
V
K
 
Q
M
 
I
K
 
E
K
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
R
M
 
L
E
 
E
K
 
E
C
 
K
I
 
V
R
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
G
T
 
I
E
 
T
E
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
D
F
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
T
 
A
G
|
G
K
 
V
T
 
R
R
 
E
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
D
E
 
Q
E
 
Y
G
 
D
I
 
L
L
 
H
A
 
P
T
 
V
F
 
Y
K
 
K
M
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
A
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
M
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
T
 
E
C
 
C
E
 
E
T
 
A
N
 
N
-
 
P
S
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
R
K
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
T
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
V
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
M
 
L
E
 
E
Y
 
D
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
R
R
 
I
E
 
E
R
x
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
P
V
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
R
P
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
A
E
 
A
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
P
I
 
V
L
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
Y
 
Q
L
 
H
L
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
I
 
L
P
 
K
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
N
G
 
A
Y
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
Q
 
I
Q
 
E
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
K
A
 
A
K
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
A
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
A
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
R
R
 
R
Y
 
Y
M
 
F
K
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
C
D
|
D
Q
 
G
I
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
V
|
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
V
 
S
I
 
L
P
 
P
P
 
A
Q
 
Y
S
 
T
L
 
L
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
Q
 
V
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
M
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
 
A
E
 
V
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
S
 
A
S
 
A
R
 
R
T
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
Y
 
V
T
 
T
D
 
K
E
 
E
P
 
V
K
 
I
P
 
P
K
 
P
H
 
Y
V
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
K
E
|
E
V
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
K
 
K
L
 
F
P
|
P
G
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
L
L
|
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
G
Y
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
Y
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
S
D
 
N
N
 
S
L
 
T
L
 
M
P
 
K
L
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
V
 
A
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
V
R
 
R
N
 
E
A
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
E
 
E
L
 
L
M
 
D
G
 
A
T
 
T
R
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
I
Y
 
V
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
N
M
 
P
D
 
R
T
 
L
V
 
V
K
 
N
K
 
K
V
 
V
H
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
N
 
H
V
 
I
I
 
Q
D
 
D
M
 
R
M
 
I
R
 
K
R
 
N
D
 
G
E
 
E
V
 
Y
D
 
T
L
 
Y
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
T
 
S
S
 
G
K
 
R
M
 
R
S
 
A
R
 
I
K
 
E
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
Q
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
P
 
H
Y
|
Y
I
x
D
T
|
T
T
 
T
I
 
L
Q
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
N
T
 
A
M
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
D
L
 
A
T
 
T
I
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
Q
E
 
E
Y
 
M
H
 
H
K
 
A
E
 
Q
M
 
I
E
 
K

P07259 Multifunctional protein URA2; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 4:1047/1073 of query aligns to 435:1485/2214 of P07259

query
sites
P07259
R
 
R
E
 
I
D
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
Q
 
Y
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
K
E
 
G
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
V
P
 
P
L
 
V
D
 
T
A
 
A
R
 
E
I
 
F
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
V
I
 
I
E
 
L
K
 
H
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
I
I
 
Y
A
 
V
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
S
I
 
V
T
 
G
S
 
-
E
 
-
L
 
I
A
 
A
E
 
M
M
 
K
G
 
D
V
 
E
F
 
F
E
 
E
K
 
A
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
I
E
 
D
A
 
T
I
 
I
K
 
I
N
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
N
T
 
A
M
 
I
L
 
D
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
C
P
 
A
L
 
K
S
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
A
H
 
N
S
 
S
L
 
V
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
A
V
 
A
V
 
V
E
 
K
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
F
P
 
P
L
 
V
I
 
I
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
N
T
 
N
K
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
D
I
 
L
T
 
C
E
 
N
R
 
V
G
 
A
L
 
F
R
 
S
R
 
S
S
 
S
R
 
P
I
 
-
N
 
-
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
 
M
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
F
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
D
H
 
Y
Q
 
N
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
T
A
 
T
S
 
A
I
 
V
K
 
N
I
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
 
N
-
 
P
-
 
V
E
 
S
G
 
K
D
 
D
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
G
I
 
L
G
 
N
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
N
E
 
E
I
 
V
V
 
K
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
K
S
 
S
T
 
T
P
 
C
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
M
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
T
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
T
T
 
E
L
 
L
T
 
S
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
I
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
T
D
 
E
I
 
Y
D
 
A
N
 
N
Q
 
-
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
N
R
 
E
W
 
T
D
 
D
-
 
L
E
 
D
P
 
I
E
 
D
I
 
I
K
 
D
T
 
Y
L
 
E
L
 
L
K
 
N
T
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
M
R
 
R
L
 
V
F
 
F
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
N
A
 
A
L
 
F
-
 
A
E
 
K
R
 
K
G
 
G
M
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
V
A
 
W
E
 
E
L
 
M
T
 
T
S
 
R
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
N
K
 
K
M
 
L
K
 
H
K
 
D
I
 
L
V
 
V
E
 
Q
M
 
F
E
 
A
K
 
E
C
 
K
I
 
I
R
 
S
T
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
P
P
 
S
E
 
L
F
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
D
D
 
D
S
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
F
T
 
L
G
 
D
K
 
S
T
 
N
R
 
E
E
 
V
Q
 
A
I
 
I
S
 
R
D
 
R
F
 
L
R
 
R
H
 
K
E
 
E
E
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
T
A
 
P
T
 
F
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
P
A
 
A
A
 
Y
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
M
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
A
T
 
D
C
 
S
E
 
H
T
 
D
N
 
L
S
 
S
T
 
F
D
 
D
K
 
D
K
 
H
K
 
G
I
 
V
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
A
E
 
N
G
 
N
I
 
I
E
 
K
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
S
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
T
L
 
I
T
 
N
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
I
E
 
E
R
 
N
P
 
S
D
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
V
Q
 
S
F
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
V
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
T
L
 
L
K
 
H
K
 
R
E
 
E
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
D
D
 
M
M
 
I
D
 
D
L
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
Y
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
M
M
 
L
Q
 
D
E
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
D
Q
 
Q
P
 
P
E
 
A
G
 
W
G
 
K
Y
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
S
Q
 
M
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
E
E
 
S
V
 
F
A
 
A
K
 
E
R
 
K
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
T
V
 
V
Y
 
Y
D
 
S
E
 
K
I
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
S
Y
 
Y
M
 
L
K
 
N
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
R
E
 
D
H
 
Y
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
T
D
 
K
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
A
 
N
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
R
Q
 
N
I
 
G
D
 
E
V
 
L
L
 
V
I
 
M
G
 
H
A
 
V
I
 
V
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
D
L
 
L
S
 
A
K
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
D
 
D
Q
 
R
V
 
I
R
 
V
D
 
V
Y
 
A
T
 
T
R
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
G
L
 
K
G
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
I
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
Y
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
M
 
F
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
N
K
 
E
V
 
I
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
V
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
I
S
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
P
 
N
L
 
L
A
 
I
K
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
A
I
 
I
A
 
M
G
 
G
H
 
L
S
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
P
L
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
P
D
 
V
E
 
E
P
 
K
K
 
L
P
 
P
-
 
D
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
T
V
 
F
D
 
G
Y
 
H
D
 
S
F
 
K
G
 
Y
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
S
E
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
K
K
 
N
V
 
I
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
Y
A
 
K
D
 
E
K
 
K
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
Q
 
Y
A
 
N
A
 
M
G
 
G
L
 
Y
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
 
T
R
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
D
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
F
 
Y
M
 
L
D
 
E
T
 
V
V
 
L
K
 
N
K
 
K
V
 
D
H
 
D
D
 
D
G
 
D
S
 
Q
P
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
Y
N
 
S
V
 
L
I
 
T
D
 
Q
M
 
H
M
 
L
R
 
A
R
 
N
D
 
N
E
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
A
K
 
N
M
 
R
S
 
F
R
 
R
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
D
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
Y
K
 
S
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
I
 
V
T
 
T
T
 
N
I
 
V
Q
 
K
A
 
C
A
 
A
V
 
K
A
 
L
A
 
L
A
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 6:1062/1073 of query aligns to 473:1529/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
D
 
D
I
 
A
K
 
K
K
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
Q
 
Y
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
K
E
 
G
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
N
A
 
A
R
 
D
I
 
F
I
 
V
E
 
R
K
 
K
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
Q
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
S
I
 
I
I
 
Y
A
 
V
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
V
T
 
G
S
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
D
M
 
E
G
 
-
V
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
Q
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
I
E
 
D
A
 
T
I
 
I
K
 
I
N
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
A
E
 
R
T
 
A
M
 
M
L
 
D
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
C
P
 
A
L
 
K
S
 
S
R
 
A
A
 
S
V
 
A
H
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
I
E
 
K
V
 
V
V
 
S
E
 
K
E
 
D
L
 
I
G
 
S
L
 
F
P
 
P
L
 
V
I
 
I
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
N
K
 
E
E
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
D
I
 
L
T
 
C
E
 
T
R
 
L
G
 
A
L
 
F
R
 
A
R
 
T
S
 
S
R
 
P
I
 
-
N
 
-
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
R
S
 
S
V
 
M
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
F
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
D
H
 
Y
Q
 
N
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
T
A
 
T
S
 
A
I
 
V
K
 
N
I
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
 
N
-
 
P
-
 
F
E
 
T
G
 
K
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
G
I
 
L
G
 
N
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
N
E
 
E
I
 
V
V
 
K
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
K
S
 
V
T
 
T
P
 
C
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
T
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
T
T
 
Q
L
 
L
T
 
S
T
 
S
A
 
A
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
I
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
I
K
 
R
S
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
Y
D
 
S
N
 
N
Q
 
T
L
 
-
G
 
G
I
 
F
K
 
N
R
 
V
W
 
K
D
 
D
E
 
A
-
 
L
P
 
M
E
 
S
I
 
I
K
 
D
T
 
T
L
 
E
L
 
L
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
T
 
S
S
 
D
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
F
 
F
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
N
A
 
A
L
 
M
E
 
A
R
 
S
G
 
G
M
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
W
E
 
E
L
 
L
T
 
T
S
 
R
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
E
K
 
K
M
 
L
K
 
M
K
 
G
I
 
L
V
 
I
E
 
R
M
 
T
E
 
S
K
 
Q
C
 
L
I
 
I
R
 
S
T
 
K
E
 
H
E
 
D
L
 
I
T
 
S
P
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
I
E
 
S
F
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
T
V
 
A
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
A
D
 
D
S
 
V
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
F
T
 
M
G
 
N
K
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
V
S
 
R
D
 
R
F
 
I
R
 
R
H
 
T
E
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
R
A
 
P
T
 
F
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
P
A
 
A
A
 
F
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
T
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
A
T
 
V
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
I
S
 
H
T
 
F
D
 
N
K
 
D
K
 
K
K
 
G
I
 
V
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
D
E
 
R
G
 
G
I
 
V
E
 
K
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
S
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
N
L
 
I
T
 
G
M
 
L
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
Q
E
 
E
R
 
S
P
 
S
D
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
I
Q
 
A
F
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
V
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
H
K
 
R
E
 
E
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
N
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
x
S
P
 
P
E
 
E
D
 
M
M
 
I
D
 
D
L
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
F
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
M
M
 
L
Q
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
D
Q
 
Q
P
 
P
E
 
K
G
 
W
G
 
K
Y
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
S
Q
 
F
Q
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
D
E
 
K
V
 
F
A
 
C
K
 
D
R
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
T
V
 
V
Y
 
Y
D
 
S
E
 
Q
I
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
R
 
S
Y
 
Y
M
 
L
K
 
Q
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
A
V
 
I
S
 
N
P
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
S
D
 
K
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
A
 
N
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
R
Q
 
E
I
 
G
D
 
K
V
 
M
L
 
V
I
 
M
G
 
H
A
 
V
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
V
I
 
L
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
D
L
 
L
S
 
A
K
 
P
E
 
T
V
 
T
L
 
I
D
 
E
Q
 
R
V
 
I
R
 
V
D
 
D
Y
 
A
T
 
A
R
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
G
L
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
N
V
 
I
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
Y
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
M
 
F
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
N
K
 
E
V
 
I
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
V
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
M
A
 
I
K
 
S
I
 
M
A
 
A
A
 
T
K
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
M
G
 
G
H
 
N
S
 
P
L
 
I
K
 
Q
D
 
P
L
 
Y
G
 
P
Y
 
D
T
 
V
D
 
D
E
 
L
P
 
P
K
 
R
P
 
-
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
S
K
 
R
L
 
L
P
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
H
D
 
N
F
 
K
G
 
F
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
I
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
K
K
 
N
V
 
I
F
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
Y
A
 
K
D
 
E
K
 
K
P
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
Y
A
 
V
R
 
K
K
 
K
L
 
L
Q
 
Y
A
 
E
A
 
N
G
 
N
L
 
Y
E
 
N
L
 
I
M
 
F
G
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
Y
L
 
F
A
 
M
Q
 
E
H
 
S
G
 
G
I
 
V
-
 
P
-
 
C
-
 
K
-
 
Y
F
 
L
M
 
A
D
 
D
T
 
L
V
 
P
K
 
A
K
 
E
V
 
E
H
 
A
D
 
N
G
 
N
S
 
E
P
 
Y
N
 
S
V
 
L
I
 
S
D
 
A
M
 
H
M
 
L
R
 
A
R
 
N
D
 
N
E
 
M
V
 
I
D
 
D
L
 
M
I
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
N
K
 
N
M
 
R
S
 
Y
R
 
R
K
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
I
-
 
S
D
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
I
 
S
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
Y
K
 
S
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
I
 
V
T
 
T
T
 
N
I
 
V
Q
 
K
A
 
C
A
 
A
V
 
K
A
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
M
I
 
I
E
 
E
T
 
A
M
 
I
K
 
C
K
 
R
G
 
N
Q
 
L
D
 
D
L
 
F
T
 
S
I
 
L
K
 
S
S
 
T
I
 
V
N
 
D

Sites not aligning to the query:

P07756 Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial; Carbamoyl-phosphate synthetase I; CPSase I; EC 6.3.4.16 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
42% identity, 99% coverage: 4:1066/1073 of query aligns to 419:1493/1500 of P07756

query
sites
P07756
R
 
R
E
 
V
D
 
E
I
 
V
K
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
I
 
F
I
 
V
E
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
F
E
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
K
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
x
S
V
 
V
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
M
N
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
D
T
 
K
M
 
L
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
E
S
 
S
L
 
M
K
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
C
R
 
P
T
 
N
K
 
K
E
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
D
I
 
L
T
 
G
E
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
M
I
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
R
S
 
S
V
 
V
L
 
T
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
D
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
D
P
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
E
 
A
E
 
E
H
 
F
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
S
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
H
-
 
P
-
 
T
E
 
S
G
 
M
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
V
V
 
V
T
 
S
K
 
G
S
 
K
T
 
T
P
 
S
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
D
K
 
R
F
 
F
T
 
H
T
 
G
A
 
T
D
 
S
K
 
S
T
 
R
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
-
 
M
-
 
C
-
 
H
-
 
P
S
 
S
L
 
V
D
 
D
-
 
G
I
 
F
D
 
T
N
 
P
Q
 
R
L
 
L
G
 
P
I
 
M
-
 
N
K
 
K
R
 
E
W
 
W
D
 
P
E
 
A
P
 
N
-
 
L
E
 
D
I
 
L
K
 
R
T
 
K
L
 
E
L
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
S
E
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
Y
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
N
G
 
N
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
S
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
L
E
 
N
M
 
M
E
 
D
K
 
K
C
 
T
I
 
L
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
S
E
 
E
E
 
S
L
 
V
T
 
T
P
 
E
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
R
 
E
M
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
C
T
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
I
 
T
S
 
R
D
 
E
F
 
L
R
 
R
H
 
L
E
 
K
E
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
H
A
 
P
T
 
W
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
A
 
V
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
Q
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
I
S
 
K
T
 
F
D
 
D
K
 
E
K
 
H
K
 
G
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
Y
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
V
I
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
H
R
 
Q
E
 
E
R
 
A
P
 
C
D
 
N
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
Y
K
 
K
E
 
N
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
L
D
 
Q
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
S
K
 
I
F
 
F
Y
 
S
L
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
V
P
 
A
Q
 
Q
P
 
A
E
 
P
G
 
W
G
 
K
Y
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
T
Q
 
L
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
N
R
 
S
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
Y
 
F
M
 
L
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
D
 
K
Q
 
E
I
 
G
D
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
S
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
S
K
 
Q
E
 
G
V
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
 
K
D
 
D
Y
 
A
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
A
V
 
I
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
M
A
 
I
G
 
G
H
 
E
S
 
S
L
 
V
-
 
D
-
 
E
K
 
K
D
 
H
L
 
L
G
 
P
Y
 
T
T
 
L
D
 
E
E
 
Q
P
 
P
-
 
I
-
 
I
K
 
P
P
 
S
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
V
 
P
L
 
M
L
 
F
P
 
S
F
 
W
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
 
R
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
R
P
 
C
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
G
F
 
I
G
 
H
R
 
T
A
 
A
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
T
 
K
G
 
G
K
 
-
V
 
I
F
 
L
L
 
I
S
 
G
I
 
I
R
 
Q
N
 
Q
A
 
S
D
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
R
L
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
H
A
 
N
A
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
|
T
R
 
E
G
 
A
T
|
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
W
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
H
 
N
G
 
N
I
 
V
F
 
P
M
 
A
D
 
T
T
 
P
V
 
V
K
 
A
K
x
W
V
 
P
H
 
S
D
 
Q
G
 
E
S
 
G
P
 
Q
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
V
 
I
I
 
R
D
 
K
M
 
L
M
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
|
N
T
 
L
P
 
P
T
x
N
S
 
N
K
 
N
M
 
T
S
 
K
R
 
F
-
 
V
K
 
H
D
 
D
G
 
N
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
S
K
 
G
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
T
 
-
M
 
-
K
 
-
K
 
K
G
 
A
Q
 
R
D
 
T
L
 
V
T
 
D
I
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
N
 
F
E
 
H
Y
 
Y
H
 
R
K
 
Q

Q8C196 Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial; Carbamoyl-phosphate synthetase I; CPSase I; EC 6.3.4.16 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
42% identity, 99% coverage: 4:1066/1073 of query aligns to 419:1493/1500 of Q8C196

query
sites
Q8C196
R
 
R
E
 
V
D
 
E
I
 
V
K
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
I
 
F
I
 
V
E
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
F
E
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
K
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
M
N
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
D
T
 
K
M
 
L
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
E
S
 
S
L
 
M
K
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
C
R
 
P
T
 
N
K
 
K
E
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
D
I
 
L
T
 
G
E
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
M
I
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
R
S
 
S
V
 
V
L
 
T
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
D
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
D
P
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
E
 
A
E
 
E
H
 
F
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
S
I
 
V
K
 
N
I
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
H
-
 
P
-
 
T
E
 
S
G
 
M
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
V
V
 
V
T
 
S
K
 
G
S
 
K
T
 
T
P
 
S
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
D
K
 
R
F
 
F
T
 
H
T
 
G
A
 
T
D
 
S
K
 
S
T
 
R
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
-
 
M
-
 
C
-
 
H
-
 
P
S
 
S
L
 
V
D
 
D
-
 
G
I
 
F
D
 
T
N
 
P
Q
 
R
L
 
L
G
 
P
I
 
M
-
 
N
K
 
K
R
 
E
W
 
W
D
 
P
E
 
A
P
 
N
-
 
L
E
 
D
I
 
L
K
 
K
T
 
K
L
 
E
L
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
S
E
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
Y
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
N
G
 
N
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
R
L
 
L
T
 
T
S
 
S
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
L
E
 
N
M
 
M
E
 
D
K
 
K
C
 
T
I
 
L
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
S
E
 
D
E
 
S
L
 
V
T
 
T
P
 
E
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
A
K
 
K
R
 
E
M
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
C
T
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
I
 
T
S
 
R
D
 
E
F
 
L
R
 
R
H
 
L
E
 
K
E
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
H
A
 
P
T
 
W
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
A
 
V
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
Q
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
I
S
 
K
T
 
F
D
 
D
K
 
E
K
 
H
K
 
G
I
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
Y
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
V
I
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
H
R
 
Q
E
 
E
R
 
A
P
 
C
D
 
N
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
Y
K
 
K
E
 
N
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
L
D
 
Q
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
S
K
 
I
F
 
F
Y
 
S
L
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
V
P
 
A
Q
 
Q
P
 
A
E
 
P
G
 
W
G
 
K
Y
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
T
Q
 
L
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
N
R
 
S
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
Y
 
F
M
 
L
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
D
 
K
F
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
D
 
K
Q
 
E
I
 
G
D
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
S
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
S
K
 
Q
E
 
G
V
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
 
K
D
 
D
Y
 
A
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
A
V
 
I
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
M
A
 
I
G
 
G
H
 
E
S
 
S
L
 
I
-
 
D
-
 
E
K
|
K
D
 
R
L
 
L
G
 
P
Y
 
T
T
 
L
D
 
E
E
 
Q
P
 
P
-
 
I
-
 
I
K
 
P
P
 
S
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
V
 
P
L
 
M
L
 
F
P
 
S
F
 
W
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
 
R
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
R
P
 
C
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
G
F
 
I
G
 
H
R
 
T
A
 
A
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
T
 
K
G
 
G
K
 
-
V
 
I
F
 
L
L
 
I
S
 
G
I
 
I
R
 
Q
N
 
Q
A
 
S
D
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
R
L
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
H
A
 
N
A
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
A
T
 
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
W
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
H
 
N
G
 
N
I
 
V
F
 
P
M
 
A
D
 
T
T
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
W
V
 
P
H
 
S
D
 
Q
G
 
E
S
 
G
P
 
Q
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
V
 
I
I
 
R
D
 
K
M
 
L
M
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
N
S
 
N
K
 
N
M
 
T
S
 
K
R
 
F
-
 
V
K
 
H
D
 
D
G
 
N
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
S
K
 
G
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
T
 
-
M
 
-
K
 
-
K
 
K
G
 
S
Q
 
R
D
 
T
L
 
V
T
 
D
I
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
N
 
F
E
 
H
Y
 
Y
H
 
R
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
43% identity, 97% coverage: 7:1051/1073 of query aligns to 404:1453/2225 of P20054

query
sites
P20054
I
 
I
K
 
N
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
G
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
N
A
 
A
R
 
S
I
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
N
E
 
E
R
 
N
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
Y
E
 
K
M
 
S
G
 
G
V
 
I
F
 
L
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
C
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
I
E
 
E
A
 
T
I
 
I
K
 
I
N
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
G
L
 
I
F
 
F
K
 
A
E
 
E
T
 
K
M
 
L
L
 
S
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
M
A
 
A
V
 
C
H
 
N
S
 
S
L
 
L
K
 
E
E
 
E
A
 
S
E
 
L
E
 
I
V
 
E
V
 
A
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
I
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
N
K
 
K
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
L
 
T
E
 
A
I
 
L
T
 
V
E
 
T
R
 
E
G
 
A
L
 
M
R
 
A
R
 
T
S
 
S
R
 
-
I
 
-
N
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
N
 
K
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
T
S
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
S
L
 
L
K
 
N
-
 
P
-
 
Y
E
 
S
G
 
E
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
S
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
Y
T
 
D
L
 
L
D
 
A
E
 
A
I
 
L
V
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
T
 
T
K
 
K
S
 
K
T
 
T
P
 
T
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
L
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
M
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
T
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
N
T
 
K
L
 
I
T
 
S
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
K
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
I
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
I
K
 
R
S
 
M
L
 
V
D
 
M
I
 
D
D
 
G
N
 
A
Q
 
V
L
 
E
G
 
G
I
 
F
K
 
Q
R
 
A
W
 
G
D
 
V
E
 
F
P
 
P
E
 
T
I
 
S
K
 
D
T
 
E
L
 
E
L
 
L
K
 
E
T
 
H
P
 
P
T
 
T
S
 
N
E
 
N
R
 
R
L
 
I
F
 
L
V
 
V
I
 
L
F
 
A
H
 
S
A
 
A
L
 
F
E
 
K
R
 
D
G
 
G
M
 
Y
S
 
S
I
 
I
K
 
D
E
 
R
I
 
V
A
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
S
 
K
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
T
K
 
K
M
 
L
K
 
K
K
 
A
I
 
I
V
 
I
E
 
D
M
 
L
E
 
E
K
 
N
C
 
H
I
 
L
R
 
S
T
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
E
-
 
P
E
 
S
E
 
Q
L
 
I
T
 
P
P
 
S
E
 
E
F
 
I
L
 
L
R
 
K
E
 
F
V
 
S
K
 
K
R
 
Q
M
 
Q
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
R
L
 
A
T
 
V
G
 
G
K
 
T
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
N
I
 
V
S
 
R
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
H
 
K
E
 
K
E
 
M
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
P
T
 
C
F
 
T
K
 
K
M
 
H
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
P
A
 
A
A
 
Q
T
 
N
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
M
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
E
C
 
T
E
 
N
T
 
D
N
 
V
S
 
N
T
 
I
D
 
N
K
 
E
K
 
K
K
 
S
I
 
Y
L
 
I
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
S
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
C
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
S
E
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
K
T
 
S
H
 
I
I
 
M
I
 
I
N
 
N
N
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
Y
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
R
E
 
G
R
 
G
P
 
P
D
 
N
-
 
S
-
 
N
-
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
S
K
 
R
E
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
C
N
 
N
T
 
V
V
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
D
D
 
M
M
 
I
D
 
D
L
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
Y
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
L
M
 
L
Q
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
D
Q
 
Q
P
 
P
E
 
L
G
 
W
G
 
K
Y
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
S
Q
 
V
Q
 
S
E
 
D
A
 
T
I
 
K
E
 
D
V
 
F
A
 
C
K
 
E
R
 
S
I
 
V
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
H
D
 
S
E
 
S
I
 
Q
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
T
Y
 
F
M
 
L
K
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
A
V
 
V
S
 
S
P
 
R
E
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
D
Q
 
N
I
 
G
D
 
R
V
 
I
L
 
V
I
 
L
G
 
F
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
I
V
 
V
I
 
C
P
 
P
P
 
A
Q
 
Q
S
 
D
L
 
L
S
 
D
K
 
D
E
 
A
V
 
T
L
 
I
D
 
L
Q
 
K
V
 
V
R
 
E
D
 
E
Y
 
T
T
 
A
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
N
V
 
V
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
M
 
F
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
I
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
C
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
N
L
 
F
A
 
I
K
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
I
G
 
K
H
 
H
S
 
Q
L
 
Y
K
 
-
D
 
D
L
 
L
G
 
P
Y
 
V
T
 
V
D
 
N
E
 
-
P
 
-
K
 
P
P
 
I
K
 
N
H
 
Y
V
 
V
S
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
I
K
 
R
L
 
L
P
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
N
D
 
T
F
 
R
G
 
E
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
V
K
 
K
A
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
A
P
 
P
L
 
-
T
 
E
G
 
K
K
 
N
V
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
F
A
 
K
D
 
E
K
 
K
P
 
H
E
 
E
L
 
F
V
 
L
E
 
P
A
 
S
A
 
A
R
 
H
K
 
K
L
 
L
Q
 
I
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
T
L
 
L
M
 
F
G
 
G
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
D
Y
 
F
L
 
Y
A
 
S
Q
 
E
H
 
N
G
 
G
I
 
V
F
 
P
M
 
V
D
 
T
T
 
Q
V
 
L
K
 
N
-
 
W
K
 
D
V
 
E
H
 
E
D
 
D
G
 
L
S
 
G
P
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
D
 
Q
-
 
K
M
 
K
M
 
M
R
 
T
R
 
E
D
 
N
E
 
T
V
 
I
D
 
H
L
 
L
I
 
F
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
S
S
 
K
K
 
N
M
 
K
S
 
Y
R
 
R
K
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
F
-
 
M
-
 
S
D
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
S
I
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
V
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
F
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
N
I
 
I
Q
 
K
A
 
C
A
 
A
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
L
E
 
S
T
 
Y
M
 
M
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P31327 Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial; Carbamoyl-phosphate synthetase I; CPSase I; EC 6.3.4.16 from Homo sapiens (Human) (see 22 papers)
41% identity, 99% coverage: 4:1064/1073 of query aligns to 419:1494/1500 of P31327

query
sites
P31327
R
 
R
E
 
V
D
 
E
I
 
V
K
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
|
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
|
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
x
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
I
 
F
I
 
V
E
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
F
E
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
x
K
K
 
E
Y
 
Y
G
|
G
V
 
V
Q
x
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
M
N
 
A
T
|
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
D
T
x
K
M
 
L
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
E
S
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
C
R
 
P
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
D
I
 
L
T
 
S
E
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
M
I
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
T
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
D
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
D
P
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
E
 
A
E
 
E
H
 
F
Q
|
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
S
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
H
-
 
P
-
 
T
E
 
S
G
 
M
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
V
V
 
V
T
 
S
K
 
G
S
x
K
T
 
T
P
 
S
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
T
K
|
K
I
 
I
P
|
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
D
K
 
R
F
 
F
T
 
H
T
 
G
A
 
T
D
 
S
K
 
S
T
 
R
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
|
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
Q
K
|
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
C
D
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
G
I
 
F
D
 
T
N
 
P
Q
 
R
L
 
L
G
 
P
I
 
M
-
 
N
K
 
K
R
 
E
W
 
W
-
 
P
D
 
S
E
 
N
P
 
L
E
 
D
I
 
L
K
 
R
T
x
K
L
 
E
L
|
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
S
E
 
T
R
|
R
L
 
I
F
 
Y
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
x
K
A
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
D
G
 
N
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
E
E
x
K
L
 
L
T
|
T
S
 
Y
I
 
I
N
 
D
P
x
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
L
E
 
N
M
 
M
E
 
E
K
|
K
C
 
T
I
 
L
R
x
K
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
S
E
 
E
E
 
S
L
 
M
T
 
T
P
 
E
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
x
K
E
 
R
V
 
A
K
|
K
R
 
E
M
 
I
G
|
G
F
 
F
P
x
S
D
|
D
S
x
K
R
 
Q
L
 
I
A
x
S
E
x
K
L
 
C
T
 
L
G
 
G
K
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
I
 
T
S
 
R
D
 
E
F
 
L
R
|
R
H
 
L
E
 
K
E
 
K
G
 
N
I
|
I
L
 
H
A
 
P
T
 
W
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
|
A
E
 
E
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
A
 
V
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
x
L
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
Y
|
Y
E
 
N
D
x
G
T
 
Q
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
V
S
 
N
T
 
F
D
 
D
K
 
D
K
 
H
K
 
G
I
 
M
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
Y
R
 
H
I
|
I
G
|
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
V
I
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
H
R
 
Q
E
 
E
R
 
A
P
 
C
D
 
G
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
Y
K
 
K
E
 
N
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
x
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
L
D
 
Q
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
S
K
 
I
F
 
F
Y
 
S
L
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
V
P
 
A
Q
 
Q
P
 
A
E
 
P
G
 
W
G
 
K
Y
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
T
Q
 
L
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
K
R
 
S
I
 
V
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
S
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
K
R
x
K
Y
 
F
M
 
L
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
D
x
K
F
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
D
x
K
Q
 
D
I
 
G
D
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
S
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
x
I
S
 
S
K
 
Q
E
 
G
V
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
x
K
D
 
D
Y
 
A
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
A
V
 
I
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
L
V
 
V
L
x
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
|
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
V
I
x
M
A
 
I
G
 
G
H
 
E
S
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
E
K
 
K
D
 
H
L
 
L
G
 
P
Y
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
H
P
 
P
-
 
I
-
 
I
K
 
P
P
 
A
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
V
 
P
L
 
M
L
 
F
P
 
S
F
 
W
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
 
R
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
R
P
 
C
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
G
F
 
I
G
 
H
R
 
T
A
 
A
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
x
K
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
T
x
K
G
 
G
K
 
-
V
 
I
F
x
L
L
x
I
S
x
G
I
|
I
R
 
Q
N
 
Q
A
 
S
D
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
R
L
 
F
V
 
L
E
x
G
A
 
V
A
|
A
R
 
E
K
 
Q
L
|
L
Q
 
H
A
 
N
A
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
A
T
 
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
W
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
H
 
N
G
 
N
I
 
V
F
 
P
M
 
A
D
x
T
T
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
W
V
x
P
H
 
S
D
 
Q
G
 
E
S
 
G
P
 
Q
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
V
 
I
I
 
R
D
 
K
M
 
L
M
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
N
S
 
N
K
 
N
M
x
T
S
 
K
R
 
F
-
 
V
K
 
H
D
 
D
G
 
N
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
R
|
R
R
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
S
K
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
T
x
K
M
 
S
K
 
R
K
 
K
G
 
V
Q
 
D
D
 
S
L
x
K
T
 
S
I
 
L
K
 
F
S
 
H
I
x
Y
N
 
R
E
 
Q
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
43% identity, 96% coverage: 8:1039/1073 of query aligns to 394:1432/2225 of P08955

query
sites
P08955
K
 
R
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
V
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
Q
E
 
G
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
H
I
 
Y
I
 
V
E
 
T
K
 
Q
I
 
V
I
 
I
E
 
R
K
 
N
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
L
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
K
M
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
A
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
I
K
 
E
N
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
R
L
 
A
F
 
F
K
 
A
E
 
A
T
 
R
M
 
M
L
 
A
S
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
H
V
 
V
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
E
A
 
A
V
 
A
H
 
N
S
 
S
L
 
L
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
S
T
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
S
E
 
A
I
 
L
T
 
V
E
 
A
R
 
P
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
H
I
 
T
N
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
Y
D
 
G
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
V
I
 
T
R
 
Q
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
N
-
 
P
K
 
E
E
 
S
G
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
L
V
 
R
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
G
S
 
G
T
 
T
P
 
-
A
 
A
S
 
A
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
L
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
T
T
 
K
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
C
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
S
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
V
D
 
D
I
 
-
D
 
E
N
 
N
Q
 
C
L
 
V
G
 
G
I
 
F
K
 
D
R
 
H
W
 
T
D
 
V
E
 
K
P
 
P
E
 
V
I
 
S
K
 
D
T
 
V
L
 
E
L
 
L
K
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
I
F
 
F
V
 
V
I
 
V
F
 
A
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
W
R
 
A
G
 
G
M
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
T
 
T
S
 
R
I
 
I
N
 
D
P
 
C
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
H
K
 
R
M
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
V
E
 
T
M
 
H
E
 
A
K
 
Q
C
 
L
I
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
H
R
 
R
T
 
G
E
 
Q
E
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
Q
E
 
D
F
 
L
L
 
L
R
 
H
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
R
 
C
M
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
L
L
 
A
T
 
V
G
 
L
K
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
V
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
Q
E
 
E
E
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
C
A
 
P
T
 
A
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
Q
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
L
T
 
T
Y
 
Y
E
 
W
D
 
G
T
 
N
C
 
T
E
 
H
T
 
D
N
 
L
S
 
D
T
 
F
D
 
R
K
 
T
K
 
P
K
 
H
I
 
V
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
C
V
 
I
T
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
M
G
 
G
I
 
Y
E
 
K
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
M
S
 
C
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
D
P
 
E
L
 
I
T
 
S
M
 
F
E
 
E
Y
 
V
V
 
V
M
 
M
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
L
E
 
E
R
 
N
P
 
P
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
F
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
R
E
 
Q
L
 
Q
K
 
C
R
 
R
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
F
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
L
M
 
L
Q
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
G
 
W
G
 
R
Y
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
D
Q
 
L
Q
 
E
E
 
S
A
 
A
I
 
R
E
 
Q
V
 
F
A
 
C
K
 
Q
R
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
T
E
 
D
I
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
M
 
L
K
 
S
E
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
A
V
 
V
S
 
S
P
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
-
 
A
C
 
C
D
 
D
Q
 
G
I
 
V
D
 
V
V
 
S
L
 
A
I
 
I
G
 
-
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
V
I
 
T
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
T
K
 
P
E
 
K
V
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
D
 
A
Y
 
I
T
 
V
R
 
H
K
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
Q
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
L
Q
 
Q
M
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
V
R
 
R
S
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
L
A
 
V
K
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
K
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
M
G
 
G
H
 
E
S
 
K
L
 
V
K
 
E
D
 
P
L
 
I
G
 
G
Y
 
L
T
 
M
D
 
T
E
 
-
P
 
-
K
 
G
P
 
S
K
 
G
H
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
S
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
S
F
 
R
G
 
C
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
K
K
 
N
V
 
I
F
 
L
L
 
L
S
 
T
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
Y
A
 
K
D
 
N
K
 
K
P
 
S
E
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
T
A
 
V
R
 
R
K
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
S
L
 
L
M
 
Y
G
 
A
T
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
D
Y
 
F
L
 
Y
A
 
T
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
F
 
K
M
 
V
D
 
T
T
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
W
-
 
H
-
 
F
K
 
E
K
 
E
V
 
A
H
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
C
-
 
P
-
 
P
S
 
Q
P
 
R
N
 
S
V
 
I
I
 
L
D
 
D
M
 
Q
M
 
L
R
 
A
R
 
E
D
 
N
E
 
H
V
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
S
T
 
M
S
 
R
K
 
G
M
 
A
S
 
G
R
 
G
K
 
R
-
 
R
-
 
L
-
x
S
-
 
S
-
 
F
-
 
V
-
 
T
D
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
K
 
S
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
T
 
I
T
 
D
I
 
I
Q
 
K
A
 
C

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
42% identity, 96% coverage: 8:1039/1073 of query aligns to 394:1432/2225 of P27708

query
sites
P27708
K
 
R
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
V
 
L
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
Q
E
 
G
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
x
T
A
 
P
R
 
H
I
 
Y
I
 
V
E
 
T
K
 
Q
I
 
V
I
 
I
E
 
R
K
 
N
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
L
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
K
M
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
A
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
I
K
 
E
N
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
R
L
 
A
F
 
F
K
 
A
E
 
A
T
 
R
M
 
M
L
 
A
S
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
H
V
 
V
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
E
A
 
A
V
 
A
H
 
N
S
 
S
L
 
L
K
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
V
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
S
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
S
E
 
A
I
 
L
T
 
V
E
 
A
R
 
P
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
H
I
 
T
N
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
D
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
Y
D
 
G
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
L
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
N
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
T
S
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
V
I
 
T
R
 
Q
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
N
-
 
P
K
 
E
E
 
S
G
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
L
V
 
R
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
G
S
 
G
T
 
T
P
 
-
A
 
A
S
 
A
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
 
D
Y
|
Y
V
 
C
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
L
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
T
T
 
K
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
C
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
S
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
V
D
 
D
I
 
-
D
 
E
N
 
N
Q
 
C
L
 
V
G
 
G
I
 
F
K
 
D
R
 
H
W
 
T
D
 
V
E
 
K
P
 
P
E
 
V
I
 
S
K
 
D
T
 
M
L
 
E
L
 
L
K
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
I
F
 
F
V
 
V
I
 
V
F
 
A
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
W
R
 
A
G
 
G
M
 
Y
S
 
S
I
 
V
K
 
D
E
 
R
I
 
L
A
 
Y
E
 
E
L
 
L
T
 
T
S
 
R
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
H
K
 
R
M
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
V
 
I
E
 
A
M
 
H
E
 
A
K
 
Q
C
 
L
I
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
H
R
 
R
T
 
G
E
 
Q
E
 
P
L
 
L
T
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
R
 
C
M
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
L
L
 
A
T
 
V
G
 
L
K
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
V
S
 
R
D
 
K
F
 
L
R
 
R
H
 
Q
E
 
E
E
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
C
A
 
P
T
 
A
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
Q
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
L
T
 
T
Y
 
Y
E
 
W
D
 
G
T
 
T
C
 
T
E
 
H
T
 
D
N
 
L
S
 
T
T
 
F
D
 
R
K
 
T
K
 
P
K
 
H
I
 
V
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
C
V
 
I
T
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
M
G
 
G
I
 
Y
E
 
K
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
V
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
M
S
 
C
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
D
P
 
E
L
 
I
T
 
S
M
 
F
E
 
E
Y
 
V
V
 
V
M
 
M
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
L
E
 
E
R
 
N
P
 
P
D
 
E
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
F
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
R
E
 
Q
L
 
Q
K
 
C
R
 
R
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
A
M
 
I
D
 
D
L
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
F
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
L
M
 
L
Q
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
G
 
W
G
 
R
Y
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
D
Q
 
L
Q
 
E
E
 
S
A
 
A
I
 
R
E
 
Q
V
 
F
A
 
C
K
 
Q
R
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
T
E
 
D
I
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
M
 
L
K
 
S
E
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
A
V
 
V
S
 
S
P
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
S
Q
 
D
I
 
G
D
 
V
V
 
V
L
 
A
I
 
A
G
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
V
I
 
T
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
T
K
 
A
E
 
K
V
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
D
 
A
Y
 
I
T
 
V
R
 
H
K
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
Q
G
 
E
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
L
Q
 
Q
M
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
D
G
 
D
K
 
Q
V
 
L
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
V
R
 
R
S
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
L
A
 
V
K
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
M
G
 
G
H
 
E
S
 
E
L
 
V
K
 
E
D
 
P
L
 
V
G
 
G
Y
 
L
T
 
M
D
 
T
E
 
-
P
 
-
K
 
G
P
 
S
K
 
G
H
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
S
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
T
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
S
F
 
R
G
 
C
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
K
K
 
N
V
 
I
F
 
L
L
 
L
S
 
T
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
Y
A
 
K
D
 
N
K
 
K
P
 
S
E
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
T
A
 
V
R
 
R
K
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
S
L
 
L
M
 
Y
G
 
A
T
 
S
R
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
D
Y
 
F
L
 
Y
A
 
T
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
F
 
K
M
 
V
D
 
T
T
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
W
-
 
H
-
 
F
K
 
E
K
 
E
V
 
A
H
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
C
-
 
P
-
 
P
S
 
Q
P
 
R
N
 
S
V
 
I
I
 
L
D
 
E
M
 
Q
M
 
L
R
 
A
R
 
E
D
 
K
E
 
N
V
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
S
T
 
M
S
 
R
K
 
G
M
 
A
S
 
G
R
 
G
K
 
R
-
 
R
-
 
L
-
x
S
-
 
S
-
 
F
-
 
V
-
 
T
D
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
K
 
S
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
T
 
I
T
 
D
I
 
I
Q
 
K
A
 
C

Sites not aligning to the query:

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
42% identity, 96% coverage: 8:1039/1073 of query aligns to 404:1447/2224 of P05990

query
sites
P05990
K
 
R
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
 
R
E
 
E
E
 
S
G
 
N
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
K
E
 
G
M
 
M
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
C
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
T
A
 
P
R
 
H
I
 
Y
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
S
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
N
G
 
G
I
 
V
I
 
L
A
 
L
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
Q
L
 
L
A
 
E
E
 
R
M
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
S
K
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
V
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
I
E
 
Q
A
 
S
I
 
I
K
 
I
N
 
E
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
A
E
 
E
T
 
R
M
 
V
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
Q
V
 
V
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
Y
S
 
S
L
 
V
K
 
A
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
E
 
D
V
 
A
V
 
A
E
 
S
E
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
M
I
 
A
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
N
T
 
N
K
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
Q
E
 
S
I
 
L
T
 
A
E
 
Q
R
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
H
S
 
S
R
 
-
I
 
-
N
 
S
Q
 
Q
V
 
L
L
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
Y
D
 
N
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
T
S
 
A
I
 
L
K
 
K
I
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
C
-
 
P
K
 
H
E
 
S
G
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
D
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
G
S
 
N
T
 
T
P
 
T
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
A
K
 
K
F
 
F
T
 
V
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
K
T
 
H
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
N
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
D
N
 
-
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
D
I
 
V
K
 
V
R
 
P
W
 
L
D
 
N
E
 
K
P
 
E
E
 
Q
I
 
L
K
 
A
T
 
E
L
 
Q
L
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
R
R
 
R
L
 
P
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
A
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
R
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
R
E
 
E
I
 
L
A
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
S
 
N
I
 
I
N
 
D
P
 
Y
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
E
K
 
K
M
 
L
K
 
E
K
 
R
I
 
I
V
 
I
E
 
L
M
 
L
E
 
Q
K
 
S
C
 
L
I
 
L
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
S
R
 
R
T
 
T
E
 
D
E
 
A
L
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
A
F
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
K
V
 
A
K
 
K
R
 
R
M
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
Y
T
 
I
G
 
K
K
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
L
Q
 
A
I
 
V
S
 
R
D
 
H
F
 
Q
R
 
R
H
 
Q
E
 
E
E
 
F
G
 
G
I
 
I
L
 
R
A
 
P
T
 
H
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
S
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
H
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
S
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
V
S
 
D
T
 
F
D
 
P
K
 
G
K
 
G
K
 
H
I
 
T
L
 
I
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
C
V
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
L
G
 
Q
I
 
R
E
 
P
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
I
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
M
S
 
C
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
I
T
 
S
M
 
F
E
 
E
Y
 
V
V
 
V
M
 
M
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
M
E
 
E
R
 
N
P
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
F
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
D
L
 
L
K
 
H
K
 
R
E
 
Q
L
 
Q
K
 
A
R
 
K
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
D
 
S
M
 
I
D
 
D
L
 
C
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
F
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
M
M
 
L
Q
 
D
E
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
R
G
 
W
G
 
K
Y
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
N
Q
 
L
Q
 
Q
E
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
E
V
 
F
A
 
C
K
 
E
R
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
A
Y
 
Y
D
 
S
E
 
N
I
 
Q
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
T
Y
 
Y
M
 
L
K
 
N
E
 
A
A
 
A
V
 
S
R
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
R
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
S
Q
 
D
I
 
G
D
 
R
V
 
I
L
 
L
I
 
C
G
 
M
A
 
A
I
 
V
M
 
S
E
|
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
V
I
 
T
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
D
L
 
L
S
 
N
K
 
A
E
 
E
V
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
I
R
 
K
D
 
R
Y
 
I
T
 
T
R
 
C
K
 
D
I
 
L
A
 
A
L
 
S
G
 
V
L
 
L
R
 
D
V
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
M
Q
 
Q
M
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
L
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
V
R
 
R
S
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
D
I
 
H
P
 
D
L
 
F
A
 
V
K
 
A
I
 
T
A
 
A
A
 
T
K
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
V
G
 
G
H
 
L
S
 
D
L
 
V
K
 
E
D
 
P
L
 
L
G
 
D
Y
 
V
T
 
L
D
 
H
E
 
-
P
 
-
K
 
G
P
 
V
K
 
G
H
 
K
V
 
V
S
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
S
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
V
V
 
Q
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
D
D
 
N
F
 
R
G
 
Y
R
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
M
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
N
K
 
A
V
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
I
R
 
G
N
 
S
-
 
F
A
 
K
D
 
H
K
 
K
P
 
M
E
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
S
A
 
I
R
 
R
K
 
D
L
 
L
Q
 
A
A
 
K
A
 
M
G
 
G
L
 
Y
E
 
K
L
 
L
M
 
Y
G
 
A
T
 
S
R
 
M
G
 
G
T
 
T
V
 
G
N
 
D
Y
 
F
L
 
Y
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
F
 
N
M
 
V
D
 
E
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
W
V
 
T
H
 
F
D
 
D
G
 
K
S
 
T
P
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
R
N
 
H
V
 
L
I
 
A
D
 
E
M
 
F
M
 
L
R
 
A
R
 
N
D
 
K
E
 
Q
V
 
F
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
M
S
 
S
K
 
G
M
 
G
S
 
G
R
 
A
K
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
F
-
 
M
-
 
T
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
Y
K
 
S
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
V
T
 
T
T
 
D
I
 
V
Q
 
K
A
 
C

Sites not aligning to the query:

5douD Crystal structure of human carbamoyl phosphate synthetase i (cps1), ligand-bound form (see paper)
40% identity, 97% coverage: 4:1048/1073 of query aligns to 377:1419/1430 of 5douD

query
sites
5douD
R
 
R
E
 
V
D
 
E
I
 
V
K
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
I
 
F
I
 
V
E
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
F
E
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
K
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
M
N
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
|
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
D
T
 
K
M
 
L
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
E
S
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
x
M
I
 
I
R
|
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
C
R
 
P
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
D
I
 
L
T
 
S
E
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
M
I
 
T
N
|
N
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
|
E
E
 
K
S
|
S
V
|
V
L
x
T
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
|
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
D
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
|
V
H
|
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
E
 
A
E
 
E
H
 
F
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
S
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
|
N
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
H
-
 
P
-
 
T
E
 
S
G
 
M
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
x
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
A
R
|
R
V
 
L
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
V
V
 
V
T
 
S
K
 
G
S
 
K
T
 
T
P
 
S
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
D
K
 
R
F
 
F
T
 
H
T
 
G
A
 
T
D
 
S
K
 
S
T
 
R
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
S
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
C
D
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
G
I
 
F
D
 
T
N
 
P
Q
 
R
L
 
L
G
 
P
I
 
M
-
 
N
K
 
K
R
 
E
W
 
W
-
 
P
D
 
S
E
 
N
P
 
L
E
 
D
I
 
L
K
 
R
T
 
K
L
 
E
L
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
S
E
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
Y
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
D
G
 
N
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
Y
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
L
E
 
N
M
 
M
E
 
E
K
 
K
C
 
T
I
 
L
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
S
E
 
E
E
 
S
L
 
M
T
 
T
P
 
E
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
R
V
 
A
K
 
K
R
 
E
M
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
C
T
 
L
G
|
G
K
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
I
 
T
S
 
R
D
 
E
F
 
L
R
 
R
H
 
L
E
 
K
E
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
H
A
 
P
T
 
W
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
A
 
V
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
Q
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
V
S
 
N
T
 
F
D
 
D
K
 
D
K
 
H
K
 
G
I
 
M
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
Y
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
V
I
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
H
R
 
Q
E
 
E
R
x
A
P
 
C
D
 
G
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
Y
K
 
K
E
 
N
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
L
D
 
Q
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
S
K
 
I
F
 
F
Y
 
S
L
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
V
P
 
A
Q
 
Q
P
 
A
E
 
P
G
 
W
G
 
K
Y
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
T
Q
 
L
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
K
R
 
S
I
 
V
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
|
L
V
 
L
R
|
R
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
K
Y
 
F
M
 
L
K
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
D
 
K
F
|
F
L
x
V
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
R
E
|
E
I
 
V
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
D
x
K
Q
 
D
I
 
G
D
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
S
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
|
A
G
 
G
V
|
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
S
K
 
Q
E
 
G
V
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
 
K
D
 
D
Y
 
A
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
A
V
 
I
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
M
 
F
A
x
L
E
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
L
V
 
V
L
x
I
E
|
E
A
 
C
N
|
N
P
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
|
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
M
A
 
I
G
 
G
H
 
E
S
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
E
K
 
K
D
 
H
L
 
L
G
 
P
Y
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
H
P
 
P
-
 
I
-
 
I
K
 
P
P
 
A
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
V
 
P
L
 
M
L
 
F
P
 
S
F
 
W
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
x
R
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
R
P
 
C
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
G
F
 
I
G
 
H
R
 
T
A
 
A
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
T
 
K
G
 
G
K
 
-
V
 
I
F
 
L
L
 
I
S
 
G
I
|
I
R
x
Q
N
 
Q
A
 
S
D
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
R
L
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
H
A
 
N
A
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
|
T
R
 
E
G
x
A
T
|
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
W
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
H
 
N
G
 
N
I
 
V
F
 
P
M
 
A
D
 
T
T
 
P
V
 
V
K
 
A
K
x
W
V
 
P
H
 
S
D
 
Q
G
 
E
S
 
G
P
 
Q
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
V
 
I
I
 
R
D
 
K
M
 
L
M
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
x
L
P
 
P
T
 
N
S
 
N
K
 
N
M
x
T
S
x
K
R
x
F
-
 
V
K
 
H
D
 
D
G
x
N
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
S
K
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q18990 Multifunctional protein pyr-1; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Caenorhabditis elegans (see 3 papers)
41% identity, 97% coverage: 8:1052/1073 of query aligns to 391:1457/2198 of Q18990

query
sites
Q18990
K
 
R
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
V
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
L
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
Q
 
R
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
K
E
 
G
M
 
F
A
 
A
D
 
D
S
 
F
V
 
T
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
K
R
 
E
I
 
Y
I
 
V
E
 
T
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
K
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
T
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
C
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
A
S
 
I
E
 
D
L
 
L
A
 
Y
E
 
K
M
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
E
 
E
K
 
Q
Y
 
Y
G
 
D
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
Q
V
 
I
E
 
N
A
 
T
I
 
I
K
 
M
N
 
K
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
N
E
 
Q
T
 
E
M
 
I
L
 
S
S
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
A
H
 
T
S
 
T
L
 
M
K
 
E
E
 
G
A
 
A
E
 
I
E
 
E
V
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
A
I
 
I
T
 
A
E
 
Q
R
 
Q
G
 
A
L
 
L
R
 
A
R
 
H
S
 
S
R
 
-
I
 
-
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
D
E
 
K
S
 
S
V
 
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
Y
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
H
 
Y
Q
 
N
M
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
T
A
 
C
S
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
I
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
P
G
 
Y
D
 
S
-
 
L
-
 
T
Y
 
Y
R
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
Q
T
 
H
L
 
L
D
 
P
E
 
V
I
 
I
V
 
R
N
 
N
S
 
S
V
 
V
T
 
T
K
 
G
S
 
T
T
 
T
P
 
T
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
T
 
V
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
R
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
G
K
 
K
F
 
F
T
 
A
T
 
R
A
 
V
D
 
S
K
 
T
T
 
Q
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
C
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
L
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
M
L
 
V
-
 
S
D
 
D
I
 
H
D
 
A
N
 
D
Q
 
G
L
 
F
G
 
S
I
 
P
K
 
Y
R
 
T
W
 
F
D
 
S
E
 
R
P
 
P
E
 
T
I
 
T
K
 
A
T
 
D
L
 
D
L
 
L
K
 
S
T
 
K
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
M
F
 
F
V
 
-
I
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
F
S
 
D
I
 
V
K
 
E
E
 
K
I
 
A
A
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
S
 
R
I
 
I
N
 
D
P
 
R
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
F
K
 
R
M
 
M
K
 
Q
K
 
N
I
 
I
V
 
V
E
 
D
M
 
I
E
 
Y
K
 
H
C
 
R
I
 
L
R
 
E
T
 
K
E
 
T
E
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
T
L
 
V
T
 
S
P
 
A
E
 
E
F
 
L
L
 
L
R
 
L
E
 
E
V
 
A
K
 
K
R
 
Q
M
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
R
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
K
T
 
I
G
 
G
K
 
S
T
 
N
R
 
E
E
 
Y
Q
 
T
I
 
V
S
 
R
D
 
E
F
 
A
R
 
R
H
 
F
E
 
V
E
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
T
A
 
P
T
 
C
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
Q
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
T
T
 
T
Y
 
F
E
 
N
D
 
G
T
 
I
C
 
E
E
 
N
T
 
D
N
 
V
S
 
S
T
 
F
D
 
N
-
 
M
K
 
K
K
 
N
K
 
A
I
 
V
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
S
C
 
S
T
 
C
V
 
V
H
 
G
A
 
C
V
 
I
T
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
A
E
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
S
T
 
T
H
 
I
I
 
T
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
T
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
I
T
 
S
M
 
F
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
I
 
Y
E
 
H
R
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
L
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
S
L
 
L
K
 
S
K
 
R
E
 
A
L
 
Q
K
 
V
R
 
K
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
I
L
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
N
D
 
D
M
 
I
D
 
D
L
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
F
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
R
L
 
K
M
 
L
Q
 
E
E
 
S
L
 
L
G
 
K
I
 
I
P
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
G
 
W
G
 
K
Y
 
K
A
 
S
T
 
E
S
 
N
Q
 
M
Q
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
K
E
 
N
V
 
F
A
 
C
K
 
A
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
A
Y
 
H
D
 
N
E
 
A
I
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
V
Y
 
F
M
 
L
K
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
N
A
 
E
A
 
A
C
 
K
E
 
E
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
L
Q
 
D
I
 
G
D
 
K
V
 
L
L
 
V
I
 
V
G
 
M
A
 
A
I
 
V
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
V
I
 
T
P
 
P
P
 
A
Q
 
Q
S
 
D
L
 
M
S
 
N
K
 
K
E
 
L
V
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
D
 
D
Y
 
I
T
 
T
R
 
F
K
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
A
L
 
F
R
 
N
V
 
V
K
 
N
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
M
Q
 
Q
M
 
L
A
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
N
G
 
N
K
 
E
V
 
L
F
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
D
I
 
Y
P
 
D
L
 
F
A
 
V
K
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
T
K
 
R
V
 
A
I
 
M
A
 
M
G
 
A
H
 
S
S
 
D
L
 
S
K
 
P
D
 
A
L
 
I
G
 
R
Y
 
A
T
 
T
D
 
I
E
 
K
P
 
P
K
 
T
P
 
A
K
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
G
H
 
R
V
 
V
S
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
S
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
V
V
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
T
D
 
S
F
 
R
G
 
C
R
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
-
T
 
K
G
 
Q
K
 
N
V
 
I
F
 
F
L
 
I
S
 
S
I
 
I
R
 
G
N
 
G
A
 
Y
D
 
H
-
 
A
K
 
K
P
 
A
E
 
E
L
 
M
V
 
L
E
 
K
A
 
S
A
 
V
R
 
E
K
 
A
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
L
 
L
M
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
A
N
 
D
Y
 
Y
L
 
F
A
 
Q
Q
 
S
H
 
N
G
 
K
I
 
I
F
 
N
M
 
V
D
 
K
T
 
P
V
 
V
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
D
K
 
E
K
 
K
V
 
T
H
 
A
D
 
S
G
 
G
S
 
T
P
 
R
N
 
S
V
 
V
I
 
V
D
 
E
M
 
F
M
 
L
R
 
E
R
 
N
D
 
K
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
I
S
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
V
K
 
S
M
 
A
S
 
F
R
 
R
K
 
T
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
I
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
M
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
N
K
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
D
I
 
I
Q
 
K
A
 
C
A
 
A
V
 
K
A
 
T
A
 
F
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
E
 
E
T
 
M
M
 
V
K
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6w2jA Cps1 bound to allosteric inhibitor h3b-374 (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:1052/1073 of query aligns to 368:1412/1422 of 6w2jA

query
sites
6w2jA
M
 
L
P
 
P
K
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
S
R
 
R
E
 
V
D
 
E
I
 
V
K
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
R
 
K
S
 
A
L
 
M
K
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
V
M
 
Q
T
 
T
D
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
L
E
 
K
M
 
Q
A
 
A
D
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
I
 
F
E
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
T
A
 
P
R
 
Q
I
 
F
I
 
V
E
 
T
K
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
K
 
A
E
 
E
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
F
E
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
K
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
S
I
 
I
K
 
M
N
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
E
 
D
T
 
K
M
 
L
L
 
N
S
 
E
I
 
I
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
I
P
 
A
L
 
P
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
E
S
 
S
L
 
I
K
 
E
E
 
D
A
 
A
E
 
L
E
 
K
V
 
A
V
 
A
E
 
D
E
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
C
R
 
P
T
 
N
K
 
R
E
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
D
I
 
L
T
 
S
E
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
-
R
 
-
S
 
A
R
 
M
I
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
T
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
A
N
 
D
D
 
D
T
 
N
C
 
C
I
 
V
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
V
D
|
D
P
 
A
M
|
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
x
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
N
E
 
A
E
 
E
H
 
F
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
R
A
 
T
S
 
S
I
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
I
E
 
V
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
L
K
 
H
-
 
P
-
 
T
E
 
S
G
 
M
D
 
E
Y
 
Y
R
 
C
I
 
I
V
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
F
V
 
I
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
K
N
 
N
S
 
V
V
 
V
T
 
S
K
 
G
S
 
K
T
 
T
P
 
S
A
 
A
S
 
C
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
T
K
 
K
I
 
I
P
|
P
R
|
R
W
|
W
P
 
D
F
 
L
D
|
D
K
 
R
F
|
F
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
H
T
 
G
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
E
E
 
E
S
 
S
L
x
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
x
L
K
 
R
S
 
M
L
x
C
D
x
H
-
 
P
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
G
I
 
F
D
 
T
N
 
P
Q
 
R
L
 
L
G
 
P
I
 
M
-
 
N
K
 
K
R
 
E
W
 
W
-
 
P
D
 
S
E
 
N
P
 
L
E
 
D
I
 
L
K
 
R
T
 
K
L
 
E
L
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
P
T
 
S
S
|
S
E
 
T
R
|
R
L
x
I
F
 
Y
V
 
A
I
 
I
F
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
D
G
 
N
M
 
M
S
 
S
I
 
L
K
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
Y
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
I
V
 
L
E
 
N
M
 
M
E
 
E
K
 
K
C
 
T
I
 
L
R
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
S
E
 
E
E
 
S
L
 
M
T
 
T
P
 
E
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
R
V
 
A
K
 
K
R
 
E
M
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
C
T
 
L
G
|
G
K
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
Q
 
Q
I
 
T
S
 
R
D
 
E
F
 
L
R
 
R
H
 
L
E
 
K
E
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
H
A
 
P
T
 
W
F
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
A
 
V
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
G
T
 
Q
C
 
E
E
 
H
T
 
D
N
 
V
S
 
N
T
 
F
D
 
D
K
 
D
K
 
H
K
 
G
I
 
M
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
Y
R
 
H
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
S
A
 
S
V
 
I
T
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
V
I
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
L
E
 
E
Y
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
H
R
 
Q
E
 
E
R
x
A
P
 
C
D
 
G
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
S
 
P
V
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
Y
K
 
K
E
 
N
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
G
T
 
V
V
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
L
D
 
Q
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
S
K
 
I
F
 
F
Y
 
S
L
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
K
I
 
V
P
 
A
Q
 
Q
P
 
A
E
 
P
G
 
W
G
 
K
Y
 
A
A
 
V
T
 
N
S
 
T
Q
 
L
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
K
R
 
S
I
 
V
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
V
 
C
L
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
M
E
 
N
I
 
V
V
 
V
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
D
D
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
K
Y
 
F
M
 
L
K
 
E
E
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
D
 
K
F
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
V
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
D
x
K
Q
 
D
I
 
G
D
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
S
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
A
A
 
T
C
 
L
V
 
M
I
 
L
P
 
P
P
 
T
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
S
K
 
Q
E
 
G
V
 
A
L
 
I
D
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
 
K
D
 
D
Y
 
A
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
F
R
 
A
V
 
I
K
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
L
E
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
L
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
F
A
 
I
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
M
A
 
I
G
 
G
H
 
E
S
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
E
K
 
K
D
 
H
L
 
L
G
 
P
Y
 
T
T
 
L
D
 
D
E
 
H
P
 
P
-
 
I
-
 
I
K
 
P
P
 
A
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
A
V
 
P
L
 
M
L
 
F
P
 
S
F
 
W
D
 
P
K
 
R
L
 
L
P
x
R
G
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
R
P
 
C
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
C
V
 
F
D
 
G
Y
 
E
D
 
G
F
 
I
G
 
H
R
 
T
A
 
A
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
S
A
 
T
D
 
G
N
 
F
L
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
T
 
K
G
 
G
K
 
-
V
 
I
F
 
L
L
 
I
S
 
G
I
 
I
R
 
Q
N
 
Q
A
 
S
D
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
R
L
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
Q
 
H
A
 
N
A
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
A
T
 
T
V
 
S
N
 
D
Y
 
W
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
H
 
N
G
 
N
I
 
V
F
 
P
M
 
A
D
 
T
T
 
P
V
 
V
K
 
A
K
 
W
V
 
P
H
 
S
D
 
Q
G
 
E
S
 
G
P
 
Q
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
V
 
I
I
 
R
D
 
K
M
 
L
M
 
I
R
 
R
R
 
D
D
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
L
P
 
P
T
 
N
S
 
N
K
 
N
M
 
T
S
 
K
R
 
F
-
 
V
K
 
H
D
 
D
G
 
N
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
S
K
 
G
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
T
 
T
T
 
N
I
 
F
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
K
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
T
 
K
M
 
S
K
 
S
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P03965 Carbamoyl phosphate synthase arginine-specific large chain; CPS; CPSase; CPSase-arg; Ammonium-dependent carbamoyl phosphate synthetase; Arginine-specific carbamoyl phosphate synthetase, ammonia chain; Carbamoyl phosphate synthase A; CPS-A; Glutamine-dependent carbamoyl phosphate synthetase; EC 6.3.4.16; EC 6.3.5.5 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 5:1048/1073 of query aligns to 26:1085/1118 of P03965

query
sites
P03965
E
 
E
D
 
G
I
 
V
K
 
N
K
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
C
 
I
R
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
E
 
D
G
 
N
V
 
K
Q
 
F
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
P
N
 
N
P
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
N
M
 
Q
T
 
T
D
 
S
P
 
H
E
 
S
M
 
L
A
 
A
D
 
D
S
 
K
V
 
I
Y
 
Y
I
 
Y
E
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
T
A
 
P
R
 
E
I
 
Y
I
 
I
E
 
T
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
K
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
G
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
L
G
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
N
I
 
C
T
 
G
S
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
E
M
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
L
E
 
A
K
 
K
Y
 
Y
G
 
N
V
 
V
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
I
E
 
K
A
 
T
I
 
L
K
 
I
N
 
T
T
 
S
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
L
F
 
F
K
 
A
E
 
S
T
 
A
M
 
L
L
 
K
S
 
D
I
 
I
G
 
N
E
 
I
K
 
P
V
 
I
P
 
A
L
 
E
S
 
S
R
 
F
A
 
A
V
 
C
H
 
E
S
 
T
L
 
V
K
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
L
E
 
E
V
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
V
G
 
K
L
 
Y
P
 
P
L
 
V
I
 
I
I
 
V
R
 
R
P
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
F
A
 
A
R
 
N
T
 
N
K
 
A
E
 
S
E
 
E
L
 
M
L
 
K
E
 
E
I
 
L
T
 
A
E
 
A
R
 
Q
G
 
S
L
 
L
R
 
-
R
 
-
S
 
S
R
 
L
I
 
A
N
 
P
Q
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
V
x
L
L
 
K
G
 
G
W
 
W
A
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
R
N
 
V
D
 
G
T
 
N
C
 
C
I
 
I
V
 
T
I
 
V
C
 
C
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
N
I
 
F
D
 
D
P
 
P
M
 
L
G
 
G
V
 
V
H
|
H
T
 
T
G
 
G
E
x
D
S
 
S
A
 
M
V
 
V
V
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
E
H
 
F
Q
 
H
M
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
L
K
 
G
I
 
V
E
 
I
G
 
G
G
 
E
C
 
C
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
E
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
L
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
V
x
I
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
A
 
A
R
 
Y
V
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
G
I
 
L
G
 
G
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
E
I
 
L
V
 
P
N
 
N
S
 
P
V
 
I
T
 
T
K
 
K
S
 
T
T
 
T
P
 
V
A
 
A
S
 
N
F
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
I
 
V
T
 
A
K
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
K
W
 
W
P
 
D
F
 
L
D
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
Q
T
 
Y
A
 
V
D
 
D
K
 
R
T
 
S
L
 
I
T
 
G
T
 
S
A
 
S
M
 
M
K
 
K
S
 
S
T
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
N
I
 
Y
E
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
F
L
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
L
K
 
R
S
 
Q
L
 
V
D
 
D
I
 
-
D
 
P
N
 
S
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
F
K
 
Q
R
 
G
W
 
S
D
 
T
E
 
E
-
 
F
-
 
G
P
 
D
E
 
Q
I
 
L
K
 
D
T
 
E
L
 
A
L
 
L
K
 
R
T
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
D
E
 
R
R
 
R
L
 
V
F
 
L
V
 
A
I
 
I
F
 
G
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
-
 
I
E
 
H
R
 
E
G
 
N
M
 
Y
S
 
T
I
 
V
K
 
E
E
 
R
I
 
V
A
 
N
E
 
E
L
 
L
T
 
S
S
 
K
I
 
I
N
 
D
P
 
K
F
 
W
F
 
F
I
 
L
S
 
Y
K
 
K
M
 
C
K
 
M
K
 
N
I
 
I
V
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
E
 
E
M
 
L
E
 
E
K
 
S
C
 
V
I
 
K
R
 
S
T
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
L
T
 
S
P
 
K
E
 
D
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
E
 
R
V
 
A
K
 
K
R
 
K
M
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
D
 
D
S
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
T
T
 
I
G
 
N
K
 
K
T
 
H
R
 
A
E
 
S
-
 
T
-
 
N
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
L
Q
 
E
I
 
I
S
 
R
D
 
S
F
 
L
R
 
R
H
 
K
E
 
T
E
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
P
T
 
F
F
 
V
K
 
K
M
 
R
V
 
I
D
 
D
T
 
T
C
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
P
A
 
A
A
 
Q
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
T
T
 
T
Y
 
Y
E
 
N
D
 
A
T
 
T
C
 
K
E
 
N
T
 
D
N
 
V
S
 
E
T
 
F
D
 
N
K
 
E
K
 
N
K
 
G
I
 
M
L
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
P
 
V
I
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
I
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
W
C
 
C
T
 
A
V
 
V
H
 
N
A
 
T
V
 
A
T
 
K
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
D
E
 
Q
G
 
G
I
 
K
E
 
K
T
 
T
H
 
I
I
 
M
I
 
I
N
 
N
N
 
Y
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
V
D
 
D
K
 
R
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
E
L
 
L
T
 
S
M
 
Y
E
 
E
Y
 
R
V
 
V
M
 
M
N
 
D
V
 
I
I
 
Y
E
 
E
R
 
L
E
 
E
R
 
Q
P
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
C
L
 
I
V
 
I
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
S
 
P
V
 
Q
N
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
K
L
 
L
K
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
Y
D
 
D
L
 
N
N
 
G
T
 
C
V
 
N
I
 
I
L
 
M
G
 
G
T
 
T
D
 
N
P
 
P
E
 
N
D
 
D
M
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
N
R
 
R
E
 
H
K
 
K
F
 
F
Y
 
S
L
 
S
L
 
I
M
 
L
Q
 
D
E
 
S
L
 
I
G
 
D
I
 
V
P
 
D
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
G
 
W
G
 
S
Y
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
S
Q
 
V
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
K
E
 
L
V
 
F
A
 
A
K
 
S
R
 
K
I
 
V
G
 
N
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
I
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
S
I
 
V
V
 
V
Y
 
N
D
 
N
E
 
E
I
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
K
R
 
A
Y
 
K
M
 
L
K
 
T
E
 
L
A
 
A
V
 
S
R
 
D
V
 
V
S
 
S
P
 
P
E
 
D
H
 
H
P
 
P
I
 
V
L
 
V
I
 
M
D
 
S
D
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
G
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
Y
Q
 
N
I
 
G
D
 
N
V
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
H
A
 
A
I
 
I
M
 
S
E
 
E
H
 
H
I
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
A
A
 
S
C
 
L
V
 
V
I
 
L
P
 
P
P
 
P
Q
 
Q
S
 
H
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
K
D
 
I
Q
 
A
V
 
L
R
 
K
D
 
D
Y
 
I
T
 
A
R
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
K
G
 
A
L
 
W
R
 
K
V
 
I
K
 
T
G
 
G
L
 
P
I
 
F
N
 
N
I
 
M
Q
 
Q
M
 
I
A
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
G
 
E
K
 
H
V
 
T
F
 
L
-
 
K
V
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
C
N
 
N
P
 
I
R
 
R
S
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
S
I
 
F
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
N
L
 
F
A
 
I
K
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
V
K
 
K
V
 
A
I
 
F
A
 
L
G
 
G
H
 
G
S
 
D
L
 
I
-
 
V
-
 
P
K
 
K
D
 
P
L
 
V
G
 
D
Y
 
L
T
 
M
D
 
L
E
 
N
P
 
K
K
 
K
P
 
Y
K
 
D
H
 
Y
V
 
V
S
 
A
I
 
T
K
 
K
E
 
V
V
 
P
L
 
Q
L
 
F
P
 
S
F
 
F
D
 
T
K
 
R
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
V
E
 
E
M
 
M
K
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
A
G
 
S
V
 
F
D
 
G
Y
 
R
D
 
D
F
 
L
G
 
I
R
 
E
A
 
S
Y
 
Y
Y
 
W
K
 
T
A
 
A
E
 
I
L
 
Q
A
 
S
A
 
T
D
 
M
N
 
N
L
 
F
-
 
H
-
 
V
-
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
P
T
 
S
G
 
G
K
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
G
S
 
G
I
 
-
R
 
-
N
 
D
A
 
T
D
 
S
K
 
R
P
 
E
E
 
Y
L
 
L
V
 
G
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
I
L
 
V
Q
 
A
A
 
T
A
 
I
G
 
G
L
 
Y
E
 
R
L
 
I
M
 
Y
G
 
T
T
 
T
R
 
N
G
 
E
T
 
T
V
 
T
-
 
K
N
 
T
Y
 
Y
L
 
L
A
 
Q
Q
 
E
H
 
H
-
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
K
G
 
N
I
 
A
F
 
K
M
 
V
D
 
S
T
 
L
V
 
I
K
 
K
K
 
F
V
 
P
H
 
K
D
 
N
G
 
D
S
 
K
P
 
R
N
 
K
V
 
L
I
 
R
D
 
E
M
 
L
M
 
F
R
 
Q
R
 
E
D
 
Y
E
 
D
V
 
I
D
 
K
L
 
A
I
 
V
I
 
F
N
 
N
T
 
L
P
 
A
T
 
S
S
 
K
K
 
R
M
 
A
S
 
E
R
 
S
K
 
T
D
 
D
-
 
D
-
 
V
G
 
D
Y
 
Y
R
 
I
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
F
K
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
I
 
F
T
 
N
T
 
E
I
 
P
Q
 
Q
A
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
L
A
 
F
A
 
A
D
 
K
A
 
C
I
 
L
E
 
K

Query Sequence

>WP_011031992.1 NCBI__GCF_000007065.1:WP_011031992.1
MPKREDIKKVLLIGSGPITIGQAAEFDFSGSQACRSLKEEGVQVVLVNSNPATIMTDPEM
ADSVYIEPLDARIIEKIIEKERPDGIIAGIGGQTGLNITSELAEMGVFEKYGVQILGTPV
EAIKNTEDRELFKETMLSIGEKVPLSRAVHSLKEAEEVVEELGLPLIIRPAYTLGGAGGG
IARTKEELLEITERGLRRSRINQVLIEESVLGWAEVEYEVMRDANDTCIVICNMENIDPM
GVHTGESAVVAPSQTLSDEEHQMLRSASIKIIRALKIEGGCNIQYALKEGDYRIVEVNPR
VSRSSALASKATGYPIARVTAKIAIGMTLDEIVNSVTKSTPASFEPALDYVITKIPRWPF
DKFTTADKTLTTAMKSTGEIMAIGRTIEESLLKAFKSLDIDNQLGIKRWDEPEIKTLLKT
PTSERLFVIFHALERGMSIKEIAELTSINPFFISKMKKIVEMEKCIRTEELTPEFLREVK
RMGFPDSRLAELTGKTREQISDFRHEEGILATFKMVDTCAAEFEAATPYYYSTYEDTCET
NSTDKKKILILGAGPIRIGQGIEFDYCTVHAVTALREEGIETHIINNNPETVSTDFDTSD
KLFFEPLTMEYVMNVIERERPDGVLVQFGGQTSVNLALPLKKELKRRTDLNTVILGTDPE
DMDLAEDREKFYLLMQELGIPQPEGGYATSQQEAIEVAKRIGFPVLVRPSYVLGGRAMEI
VYDEIDLERYMKEAVRVSPEHPILIDDFLEAACEIDVDAVCDQIDVLIGAIMEHIEEAGV
HSGDSACVIPPQSLSKEVLDQVRDYTRKIALGLRVKGLINIQMAEKGGKVFVLEANPRSS
RTIPFVSKAVGIPLAKIAAKVIAGHSLKDLGYTDEPKPKHVSIKEVLLPFDKLPGADPVL
GPEMKSTGEVMGVDYDFGRAYYKAELAADNLLPLTGKVFLSIRNADKPELVEAARKLQAA
GLELMGTRGTVNYLAQHGIFMDTVKKVHDGSPNVIDMMRRDEVDLIINTPTSKMSRKDGY
RIRRAAVDFKVPYITTIQAAVAAADAIETMKKGQDLTIKSINEYHKEMEQKEE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory