SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011320233.1 NCBI__GCF_000204075.1:WP_011320233.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

2i3gA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (rv1652) from mycobacterium tuberculosis in complex with NADP+. (see paper)
38% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 7:347/347 of 2i3gA

query
sites
2i3gA
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
G
|
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Y
|
Y
G
x
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
G
H
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
R
V
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
G
Y
 
A
L
 
L
G
 
T
G
x
A
E
x
A
S
x
T
S
|
S
V
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
H
Y
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
T
H
 
P
A
 
L
V
 
A
K
 
H
L
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
P
V
x
T
D
 
E
P
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
G
R
 
G
R
 
H
C
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
x
A
M
x
L
P
|
P
N
 
H
G
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
V
 
S
P
 
P
T
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
-
K
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
V
 
I
L
 
I
D
 
D
L
x
C
S
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
A
T
 
A
T
 
V
Y
 
W
T
 
E
T
 
R
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
E
 
S
R
 
H
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
S
 
R
E
 
G
A
 
T
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
G
 
A
C
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
F
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
-
A
 
A
K
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
E
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
T
Y
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
I
N
 
G
S
 
S
L
 
A
A
 
R
P
 
A
Y
 
Y
S
 
N
V
 
I
V
 
A
R
 
G
-
 
V
H
 
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
I
 
G
C
 
L
S
 
R
D
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
D
H
 
R
E
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
V
Q
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
A
V
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
C
Y
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
T
R
 
R
D
 
S
P
 
P
G
 
L
L
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
S
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
T
 
E
A
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
H
N
 
A
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
Y
V
 
L
C
 
M
E
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
Q
Y
 
L
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
K
 
G
W
 
A
A
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
H
I
 
I
G
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
E
R
 
D
T
 
A
G
 
Q
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
x
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
C
 
S
L
 
M
N
 
N
I
 
L
M
 
A
M
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
S
K
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
V
Y
 
A
P
 
P

7npjB Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 6-phenoxy-3-pyridinamine
38% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 4:344/344 of 7npjB

query
sites
7npjB
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Y
|
Y
G
 
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
G
H
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
R
V
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
G
Y
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
S
 
T
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
H
Y
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
T
H
 
P
A
 
L
V
 
A
K
 
H
L
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
P
V
 
T
D
 
E
P
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
G
R
 
G
R
 
H
C
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
V
 
S
P
 
P
T
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
-
K
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
V
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
A
T
 
A
T
 
V
Y
 
W
T
 
E
T
 
R
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
E
 
S
R
 
H
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
S
 
R
E
 
G
A
 
T
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
G
 
A
C
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
F
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
-
A
 
A
K
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
E
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
T
Y
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
I
N
 
G
S
 
S
L
 
A
A
 
R
P
 
A
Y
 
Y
S
 
N
V
 
I
V
 
A
R
 
G
-
 
V
H
 
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
I
 
G
C
 
L
S
 
R
D
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
D
H
 
R
E
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
V
Q
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
A
V
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
C
Y
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
T
R
 
R
D
 
S
P
 
P
G
 
L
L
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
S
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
T
 
E
A
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
H
N
 
A
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
Y
V
 
L
C
 
M
E
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
Q
Y
 
L
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
K
 
G
W
 
A
A
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
H
I
 
I
G
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
E
R
 
D
T
 
A
G
 
Q
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
x
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
C
 
S
L
 
M
N
 
N
I
 
L
M
 
A
M
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
S
K
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
V
Y
 
A
P
 
P

7nphC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 5-methoxy-1,3-benzoxazole-2-carboxylic acid
38% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 4:344/344 of 7nphC

query
sites
7nphC
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Y
|
Y
G
 
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
G
H
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
R
V
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
G
Y
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
S
 
T
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
H
Y
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
T
H
 
P
A
 
L
V
 
A
K
 
H
L
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
P
V
 
T
D
 
E
P
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
G
R
 
G
R
 
H
C
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
M
x
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
V
 
S
P
 
P
T
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
-
K
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
V
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
A
T
 
A
T
 
V
Y
 
W
T
 
E
T
 
R
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
E
 
S
R
 
H
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
S
 
R
E
 
G
A
 
T
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
G
 
A
C
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
F
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
-
A
 
A
K
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
E
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
T
Y
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
I
N
 
G
S
 
S
L
 
A
A
 
R
P
 
A
Y
 
Y
S
 
N
V
 
I
V
 
A
R
 
G
-
 
V
H
 
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
I
 
G
C
 
L
S
 
R
D
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
D
H
 
R
E
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
V
Q
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
A
V
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
C
Y
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
T
R
 
R
D
 
S
P
 
P
G
 
L
L
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
S
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
T
 
E
A
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
H
N
 
A
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
Y
V
 
L
C
 
M
E
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
Q
Y
 
L
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
K
 
G
W
 
A
A
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
H
I
 
I
G
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
E
R
 
D
T
 
A
G
 
Q
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
C
 
S
L
 
M
N
 
N
I
 
L
M
 
A
M
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
S
K
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
V
Y
 
A
P
 
P

7notA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+) and 5-methoxy-3- indoleacetic acid
38% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 4:344/344 of 7notA

query
sites
7notA
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
G
H
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
R
V
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
G
Y
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
S
 
T
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
H
Y
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
T
H
 
P
A
 
L
V
 
A
K
 
H
L
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
P
V
 
T
D
 
E
P
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
G
R
 
G
R
 
H
C
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
V
 
S
P
 
P
T
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
-
K
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
V
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
A
T
 
A
T
 
V
Y
 
W
T
 
E
T
 
R
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
E
 
S
R
 
H
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
S
 
R
E
 
G
A
 
T
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
G
 
A
C
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
F
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
-
A
 
A
K
 
V
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
E
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
T
Y
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
I
N
 
G
S
 
S
L
 
A
A
 
R
P
 
A
Y
|
Y
S
 
N
V
 
I
V
 
A
R
 
G
-
 
V
H
|
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
I
 
G
C
 
L
S
 
R
D
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
D
H
 
R
E
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
V
Q
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
V
L
|
L
I
 
I
P
 
P
I
 
A
V
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
C
Y
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
T
R
 
R
D
 
S
P
 
P
G
 
L
L
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
S
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
T
 
E
A
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
H
N
 
A
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
Y
V
 
L
C
 
M
E
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
Q
Y
 
L
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
K
 
G
W
 
A
A
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
H
I
 
I
G
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
E
R
 
D
T
 
A
G
 
Q
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
C
 
S
L
 
M
N
 
N
I
 
L
M
 
A
M
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
S
K
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
V
Y
 
A
P
 
P

7nnrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with xanthene-9-carboxylic acid
38% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 4:344/344 of 7nnrA

query
sites
7nnrA
V
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
L
D
 
G
H
 
H
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
G
E
 
R
V
 
L
E
 
R
L
 
I
V
 
G
Y
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
A
E
 
A
S
 
T
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
H
Y
 
H
P
 
P
H
 
H
L
 
L
A
 
T
H
 
P
A
 
L
V
 
A
K
 
H
L
 
R
S
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
P
V
 
T
D
 
E
P
 
A
E
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
G
R
 
G
R
 
H
C
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
x
H
G
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
V
 
S
P
 
P
T
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
-
K
 
-
G
 
-
C
 
-
K
 
-
V
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
T
N
 
D
L
 
A
T
 
A
T
 
V
Y
 
W
T
 
E
T
 
R
W
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
S
E
 
S
R
 
H
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
S
 
R
E
 
G
A
 
T
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
G
 
A
C
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
F
P
 
P
L
 
A
L
 
L
K
 
A
Q
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
-
A
 
A
K
 
V
S
|
S
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
E
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
T
Y
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
V
D
 
I
N
 
G
S
 
S
L
 
A
A
 
R
P
 
A
Y
|
Y
S
 
N
V
 
I
V
 
A
R
 
G
-
 
V
H
|
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
I
 
G
C
 
L
S
 
R
D
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
D
H
 
R
E
 
D
V
 
V
T
 
S
V
 
V
Q
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
V
L
|
L
I
 
I
P
 
P
I
 
A
V
 
S
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
C
Y
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
T
R
 
R
D
 
S
P
 
P
G
 
L
L
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
S
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
T
 
A
I
 
A
Y
 
Y
T
 
E
A
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
H
N
 
A
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
Y
V
 
L
C
 
M
E
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
Q
Y
 
L
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
K
 
G
W
 
A
A
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
L
 
A
C
 
A
Y
 
H
I
 
I
G
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
E
R
 
D
T
 
A
G
 
Q
R
 
T
V
 
F
I
 
V
V
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
C
 
S
L
 
M
N
 
N
I
 
L
M
 
A
M
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
S
K
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
V
Y
 
A
P
 
P

2ozpA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (ttha1904) from thermus thermophilus
34% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 4:342/342 of 2ozpA

query
sites
2ozpA
V
 
L
G
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
x
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
F
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
A
M
 
L
D
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
K
Y
 
Q
L
 
V
G
 
T
G
 
S
E
 
R
S
 
R
S
 
F
V
 
A
G
 
G
K
 
E
S
 
P
F
 
V
A
x
H
S
 
F
L
 
V
Y
 
H
P
 
P
H
 
N
L
 
L
A
x
R
H
 
G
A
 
R
V
 
T
K
 
N
L
 
L
S
 
K
I
 
F
E
 
-
E
 
-
V
 
V
D
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
K
I
 
L
A
 
-
R
 
E
R
 
P
C
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
L
F
 
V
L
 
L
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
F
C
 
A
Q
 
R
I
 
E
V
 
F
P
 
D
T
 
R
L
 
Y
L
 
S
E
 
A
K
 
L
G
 
A
C
 
P
K
 
V
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
K
N
 
D
L
 
P
T
 
E
T
 
L
Y
 
Y
T
 
R
T
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
E
R
 
H
P
 
P
T
 
R
A
 
P
D
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
G
T
 
R
A
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
R
 
A
I
 
L
S
 
K
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
L
 
W
V
 
I
G
 
A
C
 
G
P
 
A
G
 
G
S
 
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
Y
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
V
 
K
P
 
P
E
 
T
T
 
P
A
 
I
I
 
F
V
 
V
D
 
T
A
 
L
K
 
L
S
 
I
G
 
S
T
 
T
S
 
S
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
x
A
E
 
E
A
 
A
K
 
S
T
 
P
Y
 
A
L
 
S
L
 
H
L
 
H
A
 
P
E
 
E
A
 
R
D
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
I
A
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
 
K
V
 
P
V
 
T
R
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
C
 
V
S
 
E
D
 
N
L
 
L
A
 
P
G
 
G
H
 
R
E
 
P
V
 
-
T
 
E
V
 
V
Q
 
H
F
 
L
T
 
T
P
 
A
H
 
I
L
 
A
I
 
T
P
 
D
I
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
M
T
 
T
V
 
A
Y
 
Q
A
 
C
T
 
F
L
 
V
R
 
Q
D
 
D
P
 
-
G
 
G
L
 
W
V
 
S
G
 
E
D
 
R
D
 
D
L
 
V
T
 
W
T
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
T
 
R
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
A
N
 
G
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
R
V
 
L
C
 
V
E
 
K
-
 
Q
-
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
H
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
D
T
 
P
K
 
R
W
 
F
A
 
V
A
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
L
 
Y
C
 
A
Y
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
E
 
E
V
 
L
D
 
E
P
 
E
R
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
V
 
V
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
V
M
 
R
M
 
M
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
D
K
 
F
M
 
P
G
 
G
F
 
L
Y
 
H
P
 
P

O50146 [LysW]-L-2-aminoadipate 6-phosphate reductase; EC 1.2.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 6:344/344 of O50146

query
sites
O50146
V
 
L
G
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Y
|
Y
G
x
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
F
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
A
M
 
L
D
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
K
Y
 
Q
L
 
V
G
 
T
G
x
S
E
x
R
S
x
R
S
 
F
V
 
A
G
 
G
K
 
E
S
 
P
F
 
V
A
 
H
S
 
F
L
 
V
Y
 
H
P
 
P
H
 
N
L
 
L
A
 
R
H
 
G
A
 
R
V
 
T
K
 
N
L
 
L
S
 
K
I
 
F
E
 
-
E
 
-
V
 
I
D
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
K
I
 
L
A
 
-
R
 
E
R
 
P
C
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
L
F
 
V
L
 
L
S
 
A
M
x
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
F
C
 
A
Q
 
R
I
 
E
V
 
F
P
 
D
T
 
R
L
 
Y
L
 
S
E
 
A
K
 
L
G
 
A
C
 
P
K
 
I
V
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
|
R
F
 
L
R
 
K
N
 
D
L
 
P
T
 
E
T
 
L
Y
 
Y
T
 
R
T
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
E
R
 
H
P
 
P
T
 
R
A
 
P
D
 
D
T
 
L
A
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
R
 
A
I
 
L
S
 
K
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
L
 
W
V
 
I
G
 
A
C
 
G
P
 
A
G
 
G
S
x
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
Y
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
V
 
K
P
 
P
E
 
T
T
 
P
A
 
I
I
 
F
V
 
V
D
 
T
A
 
L
K
 
L
S
 
I
G
 
S
T
 
T
S
|
S
G
 
A
G
 
A
G
 
G
R
x
A
E
 
E
A
 
A
K
 
S
T
 
P
Y
 
A
L
 
S
L
 
H
L
 
H
A
 
P
E
 
E
A
x
R
D
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
I
A
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
 
K
V
 
P
V
 
T
R
 
G
H
 
H
R
 
R
H
|
H
T
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
C
 
V
S
 
E
D
 
N
L
 
L
A
 
P
G
 
G
H
 
R
E
 
P
V
 
-
T
 
E
V
 
V
Q
 
H
F
 
L
T
 
T
P
 
A
H
 
I
L
 
A
I
 
T
P
 
D
I
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
M
T
 
T
V
 
A
Y
 
Q
A
 
C
T
 
F
L
 
V
R
 
Q
D
 
D
P
 
-
G
 
G
L
 
W
V
 
S
G
 
E
D
 
R
D
 
D
L
 
V
T
 
W
T
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
T
x
R
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
A
N
 
G
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
R
V
 
L
C
 
V
E
x
K
-
 
Q
-
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
H
-
x
R
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
D
T
 
P
K
 
R
W
 
F
A
 
V
A
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
L
 
Y
C
 
A
Y
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
E
 
E
V
 
L
D
 
E
P
 
E
R
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
V
 
V
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
|
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
V
M
 
R
M
 
M
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
D
K
 
F
M
 
P
G
 
G
F
 
L
Y
 
H
P
 
P

5einA Crystal structure of c148a mutant of lysy from thermus thermophilus in complex with NADP+ and lysw-gamma-aminoadipic acid (see paper)
34% identity, 98% coverage: 9:352/352 of query aligns to 6:344/344 of 5einA

query
sites
5einA
V
 
L
G
 
S
I
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Y
|
Y
G
x
A
G
 
G
V
 
G
Q
 
E
L
 
F
V
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
A
M
 
L
D
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
K
Y
 
Q
L
 
V
G
 
T
G
x
S
E
x
R
S
x
R
S
 
F
V
 
A
G
 
G
K
 
E
S
 
P
F
 
V
A
 
H
S
 
F
L
 
V
Y
 
H
P
 
P
H
 
N
L
 
L
A
 
R
H
 
G
A
 
R
V
 
T
K
 
N
L
 
L
S
 
K
I
 
F
E
 
-
E
 
-
V
 
I
D
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
K
I
 
L
A
 
-
R
 
E
R
 
P
C
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
L
F
 
V
L
 
L
S
x
A
M
x
L
P
|
P
N
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
F
C
 
A
Q
 
R
I
 
E
V
 
F
P
 
D
T
 
R
L
 
Y
L
 
S
E
 
A
K
 
L
G
 
A
C
 
P
K
 
I
V
 
L
L
 
I
D
 
D
L
|
L
S
|
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
R
 
R
F
 
L
R
 
K
N
 
D
L
 
P
T
 
E
T
 
L
Y
 
Y
T
 
R
T
 
R
W
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
E
R
 
H
P
 
P
T
 
R
A
 
P
D
 
D
T
 
L
A
 
L
-
 
G
-
 
C
-
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
R
 
A
I
 
L
S
 
K
E
 
G
A
 
A
Q
 
D
L
 
W
V
 
I
G
 
A
C
 
G
P
 
A
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
Y
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
L
V
 
K
P
 
P
E
 
T
T
 
P
A
 
I
I
 
F
V
 
V
D
 
T
A
 
L
K
 
L
S
 
I
G
 
S
T
 
T
S
 
S
G
x
A
G
 
A
G
|
G
R
x
A
E
 
E
A
 
A
K
 
S
T
 
P
Y
 
A
L
 
S
L
 
H
L
 
H
A
 
P
E
 
E
A
 
R
D
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
I
A
 
R
P
 
V
Y
 
Y
S
 
K
V
 
P
V
 
T
R
 
G
H
 
H
R
 
R
H
 
H
T
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
C
 
V
S
 
E
D
 
N
L
 
L
A
 
P
G
 
G
H
 
R
E
 
P
V
 
-
T
 
E
V
 
V
Q
 
H
F
 
L
T
 
T
P
 
A
H
 
I
L
 
A
I
 
T
P
 
D
I
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
G
T
 
I
L
 
L
A
 
M
T
 
T
V
 
A
Y
 
Q
A
 
C
T
 
F
L
 
V
R
 
Q
D
 
D
P
 
-
G
 
G
L
 
W
V
 
S
G
 
E
D
 
R
D
 
D
L
 
V
T
 
W
T
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
T
 
R
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
A
N
 
G
S
 
E
P
 
P
W
 
F
I
 
I
K
 
R
V
 
L
C
 
V
E
 
K
-
 
Q
-
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
H
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
D
T
 
P
K
 
R
W
 
F
A
 
V
A
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
L
 
Y
C
 
A
Y
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
E
 
E
V
 
L
D
 
E
P
 
E
R
 
D
T
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
V
 
V
M
 
M
S
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
I
 
V
K
 
K
G
 
G
Q
x
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
V
M
 
R
M
 
M
G
 
G
W
 
W
D
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
D
K
 
F
M
 
P
G
 
G
F
 
L
Y
 
H
P
 
P

4dpmA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota in complex with coa (see paper)
29% identity, 28% coverage: 10:109/352 of query aligns to 6:110/354 of 4dpmA

query
sites
4dpmA
G
 
A
I
 
I
V
 
L
G
|
G
A
 
A
S
x
T
G
|
G
Y
x
L
G
 
V
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
L
 
M
L
 
L
M
 
S
D
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
I
E
 
K
L
 
P
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
|
G
E
x
K
S
x
G
S
|
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
P
F
 
Y
A
 
G
S
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
R
Y
 
W
P
 
Q
H
 
T
L
 
V
A
 
G
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
D
L
 
M
S
 
E
I
 
I
E
 
K
E
 
P
V
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
L
I
 
M
A
 
D
R
 
-
R
 
D
C
 
V
E
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
F
L
 
S
S
 
P
M
x
L
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
L
 
A
A
 
A
C
 
G
Q
 
P
I
 
V
V
 
E
P
 
E
T
 
Q
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
E
G
 
G
C
 
F
K
 
P
V
 
V
L
 
I
D
 
S
L
x
N
S
 
S
A
 
P
D
 
D
Y
 
H
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4dplA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota in complex with NADP (see paper)
29% identity, 28% coverage: 10:109/352 of query aligns to 6:110/354 of 4dplA

query
sites
4dplA
G
 
A
I
 
I
V
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
T
G
|
G
Y
x
L
G
x
V
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
L
 
M
L
 
L
M
 
S
D
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
I
E
 
K
L
 
P
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
G
E
x
K
S
x
G
S
|
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
P
F
 
Y
A
 
G
S
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
R
Y
 
W
P
 
Q
H
 
T
L
 
V
A
 
G
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
D
L
 
M
S
 
E
I
 
I
E
 
K
E
 
P
V
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
L
I
 
M
A
 
D
R
 
-
R
 
D
C
 
V
E
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
F
L
 
S
S
x
P
M
x
L
P
|
P
N
 
Q
G
 
G
L
 
A
A
 
A
C
 
G
Q
 
P
I
 
V
V
 
E
P
 
E
T
 
Q
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
E
G
 
G
C
 
F
K
 
P
V
 
V
L
 
I
D
 
S
L
x
N
S
 
S
A
 
P
D
 
D
Y
 
H
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4dpkA Structure of malonyl-coenzyme a reductase from crenarchaeota (see paper)
29% identity, 28% coverage: 10:109/352 of query aligns to 6:110/354 of 4dpkA

query
sites
4dpkA
G
 
A
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
T
G
|
G
Y
x
L
G
 
V
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
L
 
M
L
 
L
M
 
S
D
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
I
E
 
K
L
 
P
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
|
G
E
x
K
S
x
G
S
|
S
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
P
F
 
Y
A
 
G
S
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
R
Y
 
W
P
 
Q
H
 
T
L
 
V
A
 
G
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
D
L
 
M
S
 
E
I
 
I
E
 
K
E
 
P
V
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
L
I
 
M
A
 
D
R
 
-
R
 
D
C
 
V
E
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
F
L
 
S
S
 
P
M
 
L
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
L
 
A
A
 
A
C
 
G
Q
 
P
I
 
V
V
 
E
P
 
E
T
 
Q
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
E
G
 
G
C
 
F
K
 
P
V
 
V
L
 
I
D
 
S
L
 
N
S
 
S
A
 
P
D
 
D
Y
 
H
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q57658 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
24% identity, 54% coverage: 2:190/352 of query aligns to 4:190/354 of Q57658

query
sites
Q57658
G
 
G
N
 
E
F
 
K
G
 
M
R
 
K
V
 
I
P
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
x
T
G
|
G
Y
x
S
G
x
V
G
 
G
V
 
Q
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
A
D
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
M
V
 
F
E
 
E
L
 
L
V
 
T
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
G
 
A
-
x
S
E
|
E
S
x
R
S
|
S
V
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
K
F
 
Y
A
 
K
-
 
D
S
 
A
L
 
C
Y
 
Y
P
 
W
H
 
F
L
 
Q
A
 
D
H
 
R
A
 
D
V
 
I
K
 
P
L
 
E
S
 
N
I
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
M
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
H
I
 
E
A
 
E
-
 
F
R
 
E
R
 
D
C
 
V
E
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
S
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
D
L
 
L
A
 
A
C
 
K
Q
 
K
I
 
F
V
 
E
P
 
P
T
 
E
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
E
G
 
G
C
 
K
K
 
L
V
 
I
L
 
F
D
 
S
L
 
N
S
 
A
A
 
S
D
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
M
R
 
E
N
 
E
L
 
D
T
 
V
T
 
P
Y
 
L
T
 
V
T
 
I
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
T
 
E
A
 
V
D
 
N
T
 
A
A
 
D
V
 
H
Y
 
L
G
 
E
L
 
L
P
 
I
E
 
E
L
 
I
Y
 
Q
R
 
R
D
 
E
R
 
K
I
 
R
S
 
G
-
 
W
E
 
D
A
 
G
Q
 
A
L
 
I
V
 
I
G
 
T
C
 
N
P
 
P
G
 
N
S
 
C
Y
 
S
P
 
T
T
 
I
A
 
C
S
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
T
L
 
L
S
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
M
-
 
D
K
 
K
Q
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
A
A
 
V
I
 
F
V
 
I
D
 
A
A
 
T
K
 
M
S
 
Q
G
 
A
T
 
V
S
|
S
G
|
G
G
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1ys4A Structure of aspartate-semialdehyde dehydrogenase from methanococcus jannaschii (see paper)
24% identity, 53% coverage: 6:190/352 of query aligns to 2:184/348 of 1ys4A

query
sites
1ys4A
R
 
K
V
 
I
P
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
S
x
T
G
|
G
Y
x
S
G
x
V
G
 
G
V
 
Q
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
A
D
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
M
V
 
F
E
 
E
L
 
L
V
 
T
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
G
x
A
-
x
S
E
 
E
S
 
R
S
|
S
V
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
K
F
 
Y
A
 
K
-
 
D
S
 
A
L
 
C
Y
 
Y
P
 
W
H
 
F
L
 
Q
A
 
D
H
 
R
A
 
D
V
 
I
K
 
P
L
 
E
S
 
N
I
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
M
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
H
I
 
E
A
 
E
-
 
F
R
 
E
R
 
D
C
 
V
E
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
S
S
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
D
L
|
L
A
 
A
C
 
K
Q
 
K
I
 
F
V
 
E
P
 
P
T
 
E
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
E
G
 
G
C
 
K
K
 
L
V
 
I
L
 
F
D
 
S
L
x
N
S
 
A
A
 
S
D
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
M
R
 
E
N
 
E
L
 
D
T
 
V
T
 
P
Y
 
L
T
 
V
T
 
I
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
P
T
 
E
A
 
V
D
 
N
T
 
A
A
 
D
V
 
H
Y
 
L
G
 
E
L
 
L
P
 
I
E
 
E
L
 
I
Y
 
Q
R
 
R
D
 
E
R
 
K
I
 
R
S
 
G
-
 
W
E
 
D
A
 
G
Q
 
A
L
 
I
V
 
I
G
 
T
C
 
N
P
 
P
G
 
N
S
 
C
Y
 
S
P
 
T
T
 
I
A
 
C
S
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
T
L
 
L
S
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
M
-
 
D
K
 
K
Q
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
A
A
 
V
I
 
F
V
 
I
D
 
A
A
 
T
K
 
M
S
 
Q
G
 
A
T
 
V
S
|
S
G
|
G
G
x
A
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P78780 Probable aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
27% identity, 28% coverage: 9:108/352 of query aligns to 6:111/357 of P78780

query
sites
P78780
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
G
 
G
Y
 
T
G
 
V
G
 
G
V
 
Q
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
S
D
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
F
E
 
K
L
 
I
V
 
A
Y
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
A
E
 
S
S
 
A
-
 
R
S
 
S
V
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
P
F
 
Y
A
 
A
S
 
-
L
 
V
Y
 
A
P
 
T
H
 
K
L
 
W
A
 
K
H
 
Q
A
 
S
V
 
I
-
 
A
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
S
K
 
Q
L
 
M
S
 
S
I
 
V
E
 
K
E
 
A
V
 
C
D
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
E
I
 
F
A
 
S
R
 
-
R
 
E
C
 
C
E
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
S
S
 
G
M
 
L
P
 
D
N
 
A
G
 
D
L
 
F
A
 
A
C
 
G
Q
 
E
I
 
I
V
 
E
P
 
K
T
 
S
L
 
F
L
 
R
E
 
D
K
 
A
G
 
N
C
 
L
K
 
V
V
 
I
L
 
V
D
 
S
L
 
N
S
 
A
A
 
K
D
 
N
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3hskA Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase with NADP from candida albicans (see paper)
30% identity, 28% coverage: 10:108/352 of query aligns to 6:111/358 of 3hskA

query
sites
3hskA
G
 
G
I
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
S
x
T
G
|
G
Y
 
S
G
 
V
G
 
G
V
 
Q
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
S
D
 
K
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
F
E
 
E
L
 
I
V
 
H
Y
 
A
L
 
L
G
 
G
G
x
A
E
x
S
S
 
S
-
 
R
S
|
S
V
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
K
F
 
Y
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
W
-
 
K
-
 
Q
A
 
T
S
 
E
L
 
T
Y
 
L
P
 
P
H
 
E
L
 
T
A
 
E
H
 
Q
A
 
-
V
 
-
K
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
E
 
Q
E
 
E
V
 
C
D
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
G
I
 
N
A
 
F
R
 
L
R
 
E
C
 
C
E
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
S
S
 
G
M
 
L
P
x
D
N
 
A
G
 
D
L
x
V
A
 
A
C
 
G
Q
 
D
I
 
I
V
 
E
P
 
K
T
 
S
L
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
A
G
 
G
C
 
L
K
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
S
L
 
N
S
 
A
A
 
K
D
 
N
Y
 
Y
R
 
R

Query Sequence

>WP_011320233.1 NCBI__GCF_000204075.1:WP_011320233.1
MGNFGRVPVGIVGASGYGGVQLVRLLMDHPEVELVYLGGESSVGKSFASLYPHLAHAVKL
SIEEVDPEVIARRCEVVFLSMPNGLACQIVPTLLEKGCKVLDLSADYRFRNLTTYTTWYG
VERSDRPTADTAVYGLPELYRDRISEAQLVGCPGSYPTASLLALSPLLKQGLIVPETAIV
DAKSGTSGGGREAKTYLLLAEADNSLAPYSVVRHRHTPEIEQICSDLAGHEVTVQFTPHL
IPIVRGTLATVYATLRDPGLVGDDLTTIYTAFYRNSPWIKVCESGIYPQTKWAAGSNLCY
IGVEVDPRTGRVIVMSAIDNLIKGQAGQAIQCLNIMMGWDETLGLPKMGFYP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory