SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011372354.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011372354.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7e1sC Crystal structure of dehydrogenase/isomerase fabx from helicobacter pylori in complex with octanoyl-acp (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:362/363 of query aligns to 9:366/366 of 7e1sC

query
sites
7e1sC
R
 
K
S
 
P
L
 
L
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
E
 
K
K
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
|
G
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
K
D
 
N
K
 
M
K
 
R
Y
 
F
A
 
V
S
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
K
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
E
V
 
A
L
 
L
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
E
 
K
G
 
A
F
 
L
D
 
N
A
 
E
I
 
I
I
 
F
K
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
K
 
K
I
 
I
C
 
C
G
 
G
D
 
N
K
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
A
N
|
N
I
 
I
L
|
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
C
 
C
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
N
I
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
L
|
L
P
 
P
T
|
T
N
|
N
M
 
M
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
A
E
 
K
G
 
D
Y
 
F
P
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
P
 
P
I
|
I
V
x
I
S
|
S
S
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
I
|
I
I
 
L
C
 
C
K
|
K
R
|
R
W
 
W
Q
 
S
K
 
D
R
|
R
Y
 
Y
N
 
K
R
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
E
|
E
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
|
S
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
K
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
C
 
C
A
 
F
M
 
K
E
 
E
E
 
E
N
 
F
Q
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
P
P
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
E
W
 
W
G
 
G
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
W
D
 
D
K
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
M
|
M
G
x
A
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
x
L
A
 
G
T
 
T
H
 
K
E
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
H
 
-
D
 
K
N
 
V
F
 
Y
K
 
A
K
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
P
D
 
T
A
 
L
K
 
K
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
N
T
 
T
N
 
G
L
 
V
T
 
I
L
 
K
L
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
G
E
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
K
I
 
I
K
 
A
C
|
C
I
 
V
S
 
S
N
|
N
C
|
C
V
|
V
A
 
A
P
 
P
C
|
C
N
 
N
R
 
R
G
|
G
E
 
E
E
 
E
A
|
A
K
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
I
|
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
|
L
S
 
G
D
 
R
A
 
S
Y
 
Y
N
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
F
|
F
S
x
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
K
K
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
E
G
 
G

7e1sA Crystal structure of dehydrogenase/isomerase fabx from helicobacter pylori in complex with octanoyl-acp (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:362/363 of query aligns to 9:366/366 of 7e1sA

query
sites
7e1sA
R
 
K
S
 
P
L
 
L
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
E
 
K
K
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
|
G
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
K
D
 
N
K
 
M
K
 
R
Y
 
F
A
 
V
S
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
K
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
E
V
 
A
L
 
L
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
E
 
K
G
 
A
F
 
L
D
 
N
A
 
E
I
 
I
I
 
F
K
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
K
 
K
I
 
I
C
 
C
G
 
G
D
 
N
K
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
A
N
|
N
I
 
I
L
|
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
C
 
C
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
N
I
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
N
 
N
M
 
M
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
A
E
 
K
G
 
D
Y
 
F
P
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
P
 
P
I
|
I
V
x
I
S
|
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
I
 
I
I
 
L
C
 
C
K
 
K
R
 
R
W
 
W
Q
 
S
K
 
D
R
 
R
Y
 
Y
N
 
K
R
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
E
|
E
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
S
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
Q
G
|
G
F
 
F
T
 
K
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
C
 
C
A
 
F
M
 
K
E
 
E
E
 
E
N
 
F
Q
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
P
P
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
E
W
 
W
G
 
G
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
W
D
 
D
K
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Q
|
Q
M
|
M
G
x
A
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
G
T
 
T
H
 
K
E
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
H
 
-
D
 
K
N
 
V
F
 
Y
K
 
A
K
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
P
D
 
T
A
 
L
K
 
K
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
N
T
 
T
N
 
G
L
 
V
T
 
I
L
 
K
L
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
G
E
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
K
I
 
I
K
 
A
C
|
C
I
 
V
S
 
S
N
|
N
C
|
C
V
|
V
A
 
A
P
 
P
C
|
C
N
 
N
R
 
R
G
|
G
E
 
E
E
 
E
A
|
A
K
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
I
|
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
|
L
S
 
G
D
 
R
A
 
S
Y
 
Y
N
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
K
K
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
E
G
 
G

7e1rA Crystal structure of dehydrogenase/isomerase fabx from helicobacter pylori in complex with holo-acp (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:362/363 of query aligns to 9:366/366 of 7e1rA

query
sites
7e1rA
R
 
K
S
 
P
L
 
L
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
E
 
K
K
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
|
G
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
K
D
 
N
K
 
M
K
 
R
Y
 
F
A
 
V
S
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
K
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
E
V
 
A
L
 
L
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
E
 
K
G
 
A
F
 
L
D
 
N
A
 
E
I
 
I
I
 
F
K
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
K
 
K
I
 
I
C
 
C
G
 
G
D
 
N
K
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
A
N
|
N
I
 
I
L
|
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
C
 
C
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
N
I
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
N
 
N
M
 
M
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
A
E
 
K
G
 
D
Y
 
F
P
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
I
 
I
I
 
L
C
 
C
K
 
K
R
 
R
W
 
W
Q
 
S
K
 
D
R
 
R
Y
 
Y
N
 
K
R
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
E
|
E
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
S
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
Q
G
|
G
F
 
F
T
 
K
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
C
 
C
A
 
F
M
 
K
E
 
E
E
 
E
N
 
F
Q
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
P
P
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
E
W
 
W
G
 
G
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
I
 
I
W
 
W
D
 
D
K
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Q
|
Q
M
|
M
G
x
A
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
G
T
 
T
H
 
K
E
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
H
 
-
D
 
K
N
 
V
F
 
Y
K
 
A
K
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
P
D
 
T
A
 
L
K
 
K
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
N
T
 
T
N
 
G
L
 
V
T
 
I
L
 
K
L
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
G
E
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
K
I
 
I
K
 
A
C
|
C
I
 
V
S
 
S
N
|
N
C
|
C
V
|
V
A
 
A
P
 
P
C
|
C
N
 
N
R
 
R
G
|
G
E
 
E
E
 
E
A
|
A
K
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
I
|
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
R
A
 
S
Y
 
Y
N
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
F
|
F
S
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
K
K
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
E
G
 
G

7e1qA Crystal structure of dehydrogenase/isomerase fabx from helicobacter pylori (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:362/363 of query aligns to 9:366/366 of 7e1qA

query
sites
7e1qA
R
 
K
S
 
P
L
 
L
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
E
 
K
K
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
|
G
V
 
V
G
 
G
V
 
I
S
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
K
D
 
N
K
 
M
K
 
R
Y
 
F
A
 
V
S
 
E
K
 
R
L
 
I
V
 
V
A
 
A
G
 
K
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
E
V
 
A
L
 
L
G
 
N
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
K
 
K
E
 
K
G
 
A
F
 
L
D
 
N
A
 
E
I
 
I
I
 
F
K
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
R
K
 
K
I
 
I
C
 
C
G
 
G
D
 
N
K
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
G
A
 
A
N
|
N
I
 
I
L
|
L
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
E
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
C
 
C
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
N
I
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
N
 
N
M
 
M
P
 
P
E
 
E
F
 
F
T
 
A
E
 
K
G
 
D
Y
 
F
P
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
I
 
I
I
 
L
C
 
C
K
 
K
R
 
R
W
 
W
Q
 
S
K
 
D
R
 
R
Y
 
Y
N
 
K
R
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
E
|
E
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
|
S
G
|
G
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
K
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
C
 
C
A
 
F
M
 
K
E
 
E
E
 
E
N
 
F
Q
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
P
P
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
E
W
 
W
G
 
G
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
W
D
 
D
K
 
R
N
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
E
 
T
M
 
M
M
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
M
|
M
G
x
A
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
G
T
 
T
H
 
K
E
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
H
 
-
D
 
K
N
 
V
F
 
Y
K
 
A
K
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
P
D
 
T
A
 
L
K
 
K
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
L
L
 
L
F
 
I
S
 
K
S
 
S
P
|
P
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
N
T
 
T
N
 
G
L
 
V
T
 
I
L
 
K
L
 
R
V
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
G
E
 
N
G
 
A
P
 
P
A
 
K
I
 
I
K
 
A
C
|
C
I
 
V
S
 
S
N
|
N
C
|
C
V
|
V
A
 
A
P
 
P
C
|
C
N
 
N
R
 
R
G
|
G
E
 
E
E
 
E
A
|
A
K
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
I
|
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
R
A
 
S
Y
 
Y
N
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
F
|
F
S
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
H
E
 
E
L
 
L
M
 
I
D
 
K
K
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
E
G
 
G

7l00C Crystal structure of c. Difficile enoyl-acyl carrier protein reductase (fabk) in complex with an inhibitor
31% identity, 96% coverage: 13:361/363 of query aligns to 16:304/315 of 7l00C

query
sites
7l00C
I
 
I
E
 
K
K
 
Y
P
 
P
I
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
x
A
V
 
-
G
 
W
V
 
V
S
 
A
W
 
T
D
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
S
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
G
F
 
N
Y
 
A
S
 
P
K
 
K
E
 
E
G
 
A
F
 
I
D
 
K
A
 
K
I
 
E
I
 
I
K
 
V
N
 
E
A
 
C
R
 
K
K
 
K
I
 
L
C
 
T
G
 
-
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
|
N
I
 
V
L
x
M
Y
 
L
A
 
M
I
 
S
N
 
P
D
 
F
Y
 
V
E
 
D
R
 
D
V
 
I
V
 
I
R
 
D
D
 
L
A
 
I
C
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
K
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
I
 
I
I
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
L
 
N
P
 
P
T
 
A
N
 
K
-
 
Y
M
 
M
P
 
D
E
 
R
F
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
K
D
 
V
V
 
I
A
 
P
L
x
V
V
 
V
P
|
P
I
 
T
V
 
I
S
 
A
S
 
L
A
 
A
K
 
Q
A
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
-
C
 
-
K
 
-
R
 
-
W
 
-
Q
 
-
K
 
-
R
 
R
Y
 
M
N
 
E
R
 
K
L
 
L
-
 
G
P
 
A
D
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
|
E
G
 
G
P
 
T
K
 
E
S
x
G
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
I
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
E
L
 
L
E
 
T
N
 
T
L
 
M
V
 
V
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
P
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
L
 
D
W
 
A
G
 
V
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
V
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
I
D
 
A
E
 
A
M
 
S
M
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
 
V
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
C
T
 
S
H
 
E
E
 
E
C
 
C
D
 
S
A
 
V
H
 
H
D
 
S
N
 
N
F
 
Y
K
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
D
E
 
R
D
 
D
I
 
A
Q
 
I
L
 
V
F
 
T
S
 
G
S
 
R
P
 
S
V
 
T
G
 
G
Y
 
H
P
 
P
A
 
V
Q
 
R
G
 
T
I
 
L
R
 
K
T
 
N
N
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
K
L
 
E
V
 
F
E
 
L
K
 
K
R
 
M
E
 
E
G
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
C
 
-
I
 
-
S
 
Q
N
 
N
C
 
G
V
 
A
A
 
T
P
 
P
C
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
E
E
 
E
A
 
L
K
 
D
E
 
K
V
 
K
G
 
G
Y
 
T
C
 
G
I
 
-
A
 
A
D
x
L
R
 
R
L
 
F
S
 
A
D
 
-
A
 
T
Y
 
V
N
 
D
G
 
G
N
 
D
L
 
I
E
 
E
T
 
K
G
 
G
L
 
S
F
 
F
F
x
M
S
 
A
G
 
G
T
 
Q
N
x
S
G
 
A
Y
 
A
R
 
M
V
 
V
D
 
K
K
 
E
I
 
I
I
 
T
S
 
P
V
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
I
M
 
I
D
 
E
K
 
A
L
 
M
V
 
V
N
 
N

2z6iB Crystal structure of s. Pneumoniae enoyl-acyl carrier protein reductase (fabk) (see paper)
31% identity, 79% coverage: 13:298/363 of query aligns to 11:249/321 of 2z6iB

query
sites
2z6iB
I
 
I
E
 
D
K
 
Y
P
 
P
I
 
I
V
 
F
Q
 
Q
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
x
A
V
 
-
G
 
W
V
 
V
S
 
A
W
 
D
D
 
G
S
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
A
G
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
G
K
 
G
Y
 
L
A
 
G
S
 
I
K
 
I
L
 
G
V
 
G
A
 
G
G
 
N
R
 
A
P
 
P
L
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
K
E
 
A
G
 
N
F
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
I
I
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
R
 
-
K
 
K
I
 
S
C
 
L
G
 
T
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
|
N
I
 
I
L
 
M
Y
 
L
A
 
L
I
 
S
N
 
P
D
 
F
Y
 
V
E
 
E
R
 
D
V
 
I
V
 
V
R
 
D
D
 
L
A
 
V
C
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
V
I
 
V
I
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
N
P
 
P
T
 
S
N
 
K
-
 
Y
M
 
M
P
 
E
E
 
R
F
 
F
T
 
H
E
 
E
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
V
 
I
A
 
I
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
S
 
P
S
 
S
A
 
V
K
 
A
A
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
L
C
 
A
K
 
K
R
 
R
W
 
M
Q
 
E
K
 
K
R
 
I
Y
 
G
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
|
E
G
 
G
P
 
M
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
I
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
N
 
T
L
 
M
V
 
T
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
Q
A
 
V
A
|
A
L
 
T
W
 
A
G
x
I
D
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
E
D
 
G
I
 
A
D
 
A
E
 
A
M
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
E
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
V
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
V
A
 
V
T
 
A
H
 
K
E
 
E
C
 
S
D
 
N
A
 
A
H
 
H
D
 
P
N
 
N
F
 
Y
K
 
K
K
 
E
V
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
K
A
 
A
K
 
R
K
 
D
E
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
T
L
 
I
F
 
S
S
 
A
S
 
Q
P
 
H
V
 
F
G
 
G
Y
 
H
P
 
A
A
 
V
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
K
T
 
N
N
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
R
L
 
D
V
 
F
E
 
E
K
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
K
P
 
D
A
 
A
I
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5gvhA Structure of fabk from thermotoga maritima (see paper)
29% identity, 96% coverage: 13:361/363 of query aligns to 12:298/311 of 5gvhA

query
sites
5gvhA
I
 
I
E
 
E
K
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
L
Q
 
M
G
|
G
G
|
G
M
|
M
G
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
S
x
A
W
 
W
-
 
A
-
 
G
-
 
T
D
 
P
S
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
E
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
I
S
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
S
G
 
G
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
G
 
M
R
 
K
P
 
P
L
 
D
D
 
D
V
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
L
D
 
R
A
 
K
I
 
A
I
 
I
K
 
S
N
 
E
A
 
L
R
 
R
K
 
Q
I
 
K
C
 
T
G
 
-
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
|
N
I
 
I
L
x
I
Y
 
L
A
 
V
I
 
S
N
 
P
D
 
W
Y
 
A
E
 
D
R
 
D
V
 
L
V
 
V
R
 
K
D
 
V
A
 
C
C
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
K
I
 
V
D
 
P
I
 
V
I
 
V
I
 
T
T
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
N
P
 
P
T
 
T
N
 
K
-
 
Y
M
 
I
P
 
R
E
 
E
F
 
L
T
 
K
E
 
E
G
 
N
Y
 
G
P
 
T
D
 
K
V
 
V
A
 
-
L
 
-
V
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
S
 
A
S
 
S
A
 
D
K
 
S
A
 
L
L
 
A
K
 
R
I
 
M
I
 
V
C
 
E
K
 
R
R
 
A
W
 
G
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
Y
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
|
E
G
 
G
P
 
M
K
 
E
S
|
S
G
|
G
G
 
G
H
 
H
Q
 
I
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
E
L
 
V
E
 
T
N
 
T
L
 
F
V
 
V
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
N
E
 
K
A
 
V
A
 
S
L
 
R
W
 
S
G
 
V
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
M
D
 
A
E
 
A
M
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
E
G
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
 
M
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
V
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
E
C
 
S
D
 
D
A
 
V
H
 
H
D
 
P
N
 
V
F
 
Y
K
 
K
K
 
E
V
 
K
L
 
I
L
 
V
D
 
K
A
 
A
K
 
S
K
 
I
E
 
R
D
 
D
I
 
T
Q
 
V
L
 
V
F
 
T
S
 
G
S
 
A
P
 
K
V
 
L
G
 
G
Y
 
H
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
V
I
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
P
L
 
F
T
 
A
L
 
R
L
 
K
V
 
I
E
 
Q
K
 
E
R
 
M
E
 
E
G
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
C
 
-
I
 
F
S
 
E
N
 
N
C
 
P
V
 
M
A
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
E
V
 
M
G
 
-
Y
 
-
C
 
L
I
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
L
L
 
R
S
 
R
D
 
A
A
 
V
Y
 
V
N
 
E
G
 
G
N
 
D
L
 
L
E
 
E
T
 
R
G
 
G
L
 
S
F
 
F
F
x
M
S
 
V
G
 
G
T
 
Q
N
x
S
G
 
A
Y
 
G
R
 
L
V
 
I
D
 
D
K
 
E
I
 
I
I
 
K
S
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
L
 
I
M
 
I
D
 
E
K
 
D
L
 
I
V
 
L
N
 
K

2z6jA Crystal structure of s. Pneumoniae enoyl-acyl carrier protein reductase (fabk) in complex with an inhibitor (see paper)
33% identity, 55% coverage: 87:286/363 of query aligns to 59:234/307 of 2z6jA

query
sites
2z6jA
K
 
K
I
 
S
C
 
L
G
 
T
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
|
N
I
 
I
L
x
M
Y
 
L
A
x
L
I
 
S
N
 
P
D
 
F
Y
 
V
E
 
E
R
 
D
V
 
I
V
 
V
R
 
D
D
 
L
A
 
V
C
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
K
I
 
V
I
 
V
I
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
L
 
N
P
 
P
T
 
S
N
 
K
-
 
Y
M
 
M
P
 
E
E
 
R
F
 
F
T
 
H
E
 
E
G
 
A
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
V
 
I
A
 
I
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
x
V
V
 
V
S
x
P
S
 
S
A
 
V
K
 
A
A
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
I
x
L
C
 
A
K
 
K
R
 
R
W
 
M
Q
 
E
K
 
K
R
 
I
Y
 
G
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
|
E
G
 
G
P
 
M
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
 
G
H
|
H
Q
 
I
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
N
 
T
L
 
M
V
 
T
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
Q
A
 
V
A
|
A
L
 
T
W
 
A
G
x
I
D
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
E
D
 
G
I
 
A
D
 
A
E
 
A
M
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
E
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
V
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
V
A
 
V
T
 
A
H
 
K
E
 
E
C
 
S
D
 
N
A
 
A
H
 
H
D
 
P
N
 
N
F
 
Y
K
 
K
K
 
E
V
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
K
A
 
A
K
 
R
K
 
D
E
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
T
L
 
I
F
 
S
S
 
A
S
 
Q
P
 
-
V
 
-
G
 
-
Y
 
H
P
 
A
A
 
V
Q
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
K
T
 
N
N
 
Q
L
 
L
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3bw2A Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from streptomyces ansochromogenes (see paper)
29% identity, 73% coverage: 16:281/363 of query aligns to 10:273/347 of 3bw2A

query
sites
3bw2A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
x
A
V
 
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
V
D
 
P
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
C
K
 
E
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
K
V
 
T
G
 
A
T
 
D
G
 
G
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
Q
D
 
E
K
 
I
K
 
K
Y
 
R
A
 
L
S
 
R
K
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
-
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
F
D
 
G
V
 
V
L
x
N
G
 
V
F
|
F
Y
 
M
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
E
K
 
V
N
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
I
 
L
C
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
N
 
W
I
 
Y
L
 
E
Y
 
T
A
 
E
I
 
L
N
 
G
D
 
D
Y
 
P
E
 
D
R
 
G
V
 
G
V
 
R
R
 
D
D
 
D
A
 
G
C
 
Y
E
 
D
S
 
A
G
 
K
I
 
L
D
 
A
I
 
V
I
 
L
I
 
L
T
 
D
G
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
P
T
 
V
N
 
P
M
 
V
P
 
V
E
 
S
F
 
F
T
x
H
E
 
F
G
 
G
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
R
A
 
E
L
 
V
V
 
I
P
 
A
I
 
R
V
 
L
S
 
R
S
 
R
A
 
A
K
 
G
A
 
T
L
 
L
K
 
T
I
 
L
I
 
V
C
 
T
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
R
R
 
A
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
x
Q
G
 
G
P
 
V
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
F
 
-
T
 
T
Y
 
H
E
 
R
Q
 
D
C
 
S
A
 
S
M
 
E
E
 
D
E
 
D
N
 
G
Q
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
S
L
 
L
V
 
L
R
 
A
P
 
Q
V
 
V
V
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
V
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
R
K
 
G
N
 
G
D
 
Q
I
 
I
D
 
A
E
 
A
M
 
V
M
 
L
A
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
M
 
L
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
D
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
H
 
P
D
 
G
N
 
P
F
 
H
K
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
P
K
 
L
K
 
F
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
R
L
 
L
F
 
T
S
 
R
S
 
A
P
 
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
R
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

4q4kA Crystal structure of nitronate monooxygenase from pseudomonas aeruginosa pao1 (see paper)
28% identity, 74% coverage: 13:281/363 of query aligns to 11:280/351 of 4q4kA

query
sites
4q4kA
I
 
I
E
 
Q
K
 
Q
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
 
-
V
x
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
T
D
 
P
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
A
Y
 
A
Y
 
E
E
 
K
D
 
G
K
 
R
K
 
A
Y
 
L
A
 
I
S
 
R
K
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
G
V
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
N
V
 
V
L
x
N
G
 
L
F
|
F
Y
 
C
S
 
H
K
 
R
E
 
P
G
 
G
F
 
Q
D
 
A
A
 
D
I
 
P
I
 
A
K
 
R
N
 
E
A
 
R
R
 
A
K
 
W
I
 
L
C
 
D
G
 
Y
D
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
Y
 
F
A
 
A
I
 
E
N
 
F
D
 
G
Y
 
A
E
 
E
R
 
P
V
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
L
A
 
K
C
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
N
I
 
I
I
 
Y
I
 
L
T
 
S
G
 
F
A
 
L
G
 
E
L
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
M
F
 
L
T
 
L
E
 
E
G
 
E
Y
 
R
P
 
P
D
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
S
-
 
F
-
x
H
-
 
F
-
 
G
V
 
A
P
 
P
I
 
P
V
 
R
S
 
D
S
 
Q
A
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
I
 
L
I
 
V
C
 
C
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
A
R
 
L
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
A
E
x
Q
G
 
G
P
 
I
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
-
 
V
F
 
F
T
 
E
Y
 
P
E
 
E
Q
 
R
C
 
G
A
 
D
M
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
G
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
N
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
A
W
 
R
G
 
G
D
 
S
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
I
D
 
R
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
V
A
 
L
T
 
C
H
 
P
E
 
E
C
 
S
D
 
S
A
 
A
H
 
N
D
 
A
N
 
A
F
 
Y
K
 
R
K
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
K
D
 
G
A
 
P
K
 
R
K
 
A
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
A
L
 
L
F
 
T
S
 
V
S
 
T
P
 
M
V
 
S
G
 
G
Y
 
R
P
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9HWH9 Nitronate monooxygenase; NMO; Propionate 3-nitronate monooxygenase; P3N monooxygenase; EC 1.13.12.- from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
28% identity, 74% coverage: 13:281/363 of query aligns to 11:280/351 of Q9HWH9

query
sites
Q9HWH9
I
 
I
E
 
Q
K
 
Q
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
 
A
G
 
P
M
 
M
G
 
-
V
x
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
T
D
 
P
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
A
Y
 
A
Y
 
E
E
 
K
D
 
G
K
 
R
K
 
A
Y
 
L
A
 
I
S
 
R
K
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
G
V
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
N
V
 
V
L
x
N
G
 
L
F
 
F
Y
 
C
S
 
H
K
 
R
E
 
P
G
 
G
F
 
Q
D
 
A
A
 
D
I
 
P
I
 
A
K
 
R
N
 
E
A
 
R
R
 
A
K
 
W
I
 
L
C
 
D
G
 
Y
D
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
Y
 
F
A
 
A
I
 
E
N
 
F
D
 
G
Y
 
A
E
 
E
R
 
P
V
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
L
A
 
K
C
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
N
I
 
I
I
 
Y
I
 
L
T
 
S
G
 
F
A
 
L
G
 
E
L
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
M
F
 
L
T
 
L
E
 
E
G
 
E
Y
 
R
P
 
P
D
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
S
-
 
F
-
 
H
-
 
F
-
 
G
V
 
A
P
 
P
I
 
P
V
 
R
S
 
D
S
 
Q
A
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
I
 
L
I
 
V
C
 
C
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
A
R
 
L
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
A
E
x
Q
G
 
G
P
 
I
K
 
E
S
 
A
G
|
G
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
-
 
V
F
 
F
T
 
E
Y
 
P
E
 
E
Q
 
R
C
 
G
A
 
D
M
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
G
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
N
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
A
W
 
R
G
 
G
D
 
S
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
I
D
 
R
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
|
M
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
V
A
 
L
T
 
C
H
 
P
E
 
E
C
 
S
D
 
S
A
 
A
H
 
N
D
 
A
N
 
A
F
 
Y
K
 
R
K
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
K
D
 
G
A
 
P
K
 
R
K
 
A
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
A
L
 
L
F
 
T
S
 
V
S
 
T
P
 
M
V
 
S
G
 
G
Y
 
R
P
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
L

3bw3A Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from streptomyces ansochromogenes (see paper)
29% identity, 73% coverage: 16:281/363 of query aligns to 10:273/346 of 3bw3A

query
sites
3bw3A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
x
A
V
x
G
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
V
D
 
P
S
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
C
K
 
E
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
K
V
 
T
G
 
A
T
 
D
G
 
G
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
Q
D
 
E
K
 
I
K
 
K
Y
 
R
A
 
L
S
 
R
K
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
-
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
F
D
 
G
V
 
V
L
x
N
G
 
V
F
|
F
Y
 
M
S
 
P
K
 
Q
E
 
P
G
 
E
F
 
L
D
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
E
K
 
V
N
 
Y
A
 
A
R
 
H
K
 
Q
I
 
L
C
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
N
 
W
I
 
Y
L
 
E
Y
 
T
A
 
E
I
 
L
N
 
G
D
 
D
Y
 
P
E
 
D
R
 
G
V
 
G
V
 
R
R
 
D
D
 
D
A
 
G
C
 
Y
E
 
D
S
 
A
G
 
K
I
 
L
D
 
A
I
 
V
I
 
L
I
 
L
T
 
D
G
 
D
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
P
T
 
V
N
 
P
M
 
V
P
 
V
E
 
S
F
 
F
T
x
H
E
 
F
G
 
G
Y
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
R
A
 
E
L
 
V
V
 
I
P
 
A
I
 
R
V
 
L
S
 
R
S
 
R
A
 
A
K
 
G
A
 
T
L
 
L
K
 
T
I
 
L
I
 
V
C
 
T
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
R
R
 
A
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
A
E
 
Q
G
 
G
P
 
V
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
 
D
Q
 
Q
G
 
G
F
 
-
T
 
T
Y
 
H
E
 
R
Q
 
D
C
 
S
A
 
S
M
 
E
E
 
D
E
 
D
N
 
G
Q
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
S
L
 
L
V
 
L
R
 
A
P
 
Q
V
 
V
V
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
V
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
R
K
 
G
N
 
G
D
 
Q
I
 
I
D
 
A
E
 
A
M
 
V
M
 
L
A
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
M
 
L
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
D
E
 
E
C
 
S
D
 
G
A
 
A
H
 
P
D
 
G
N
 
P
F
 
H
K
 
K
K
 
R
V
 
A
L
 
L
L
 
T
D
 
D
A
 
P
K
 
L
K
 
F
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
R
L
 
L
F
 
T
S
 
R
S
 
A
P
 
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
R
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

5lsmA Crystal structure of nitronate monooxygenase (so_0471) from shewanella oneidensis mr-1
27% identity, 74% coverage: 13:281/363 of query aligns to 9:270/339 of 5lsmA

query
sites
5lsmA
I
 
I
E
 
E
K
 
F
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
x
A
V
 
-
G
 
G
V
 
V
S
 
Q
W
 
G
D
 
S
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
I
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
E
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
S
I
 
L
-
 
P
-
 
C
S
 
A
A
 
M
V
 
L
G
 
S
T
 
L
G
 
E
Y
 
A
Y
 
L
E
 
E
D
 
A
K
 
E
K
 
L
Y
 
T
A
 
A
S
 
I
K
 
R
L
 
S
V
 
Q
A
 
T
G
 
A
R
 
K
P
 
P
L
 
I
D
 
N
V
 
V
L
x
N
G
 
F
F
 
F
Y
 
C
S
 
H
K
 
R
E
 
E
G
 
P
F
 
V
D
 
A
A
 
Q
I
 
A
I
 
A
K
 
K
N
 
Q
A
 
A
R
 
A
K
 
W
I
 
L
C
 
E
G
 
Q
D
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
Y
A
 
F
A
 
A
N
 
E
I
 
F
L
 
N
Y
 
L
A
 
-
I
 
-
N
 
-
D
 
D
Y
 
P
E
 
N
R
 
R
V
 
T
V
 
P
R
 
Y
D
 
S
A
 
K
C
 
A
E
 
Q
S
 
A
G
 
E
I
 
V
D
 
L
I
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
K
L
 
F
P
 
K
T
 
P
N
 
E
M
 
V
P
 
V
E
 
S
F
 
F
T
x
H
E
 
F
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
E
A
 
E
L
 
L
V
 
L
P
 
L
I
 
E
V
 
I
S
 
K
S
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
I
A
 
S
K
 
T
A
 
A
L
 
T
K
 
T
I
 
V
I
 
E
C
 
E
K
 
A
R
 
L
W
 
W
Q
 
L
K
 
E
R
 
-
Y
 
-
N
 
A
R
 
R
L
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
A
E
 
Q
G
 
G
P
 
L
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
 
G
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
F
 
H
T
 
F
Y
 
L
E
 
S
Q
 
E
C
 
D
A
 
L
M
 
T
E
 
E
E
 
Q
N
 
L
Q
 
G
L
 
T
E
 
F
N
 
S
L
 
L
V
 
L
R
 
P
P
 
Q
V
 
I
V
 
I
E
 
A
E
 
A
A
 
V
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
E
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
V
D
 
D
K
 
A
N
 
T
D
 
T
I
 
V
D
 
R
E
 
A
M
 
A
M
 
M
A
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
V
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
Y
I
 
L
A
 
L
T
 
C
H
 
P
E
 
E
C
 
C
D
 
N
A
 
T
H
 
S
D
 
A
N
 
I
F
 
H
K
 
R
K
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
D
 
S
A
 
D
K
 
A
K
 
A
E
 
Q
D
 
H
I
 
T
Q
 
A
L
 
L
F
 
T
S
 
N
S
 
L
P
 
F
V
 
S
G
 
G
Y
 
R
P
 
P
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4qitA Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
28% identity, 74% coverage: 13:281/363 of query aligns to 11:280/350 of 4qitA

query
sites
4qitA
I
 
I
E
 
Q
K
 
Q
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
 
-
V
x
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
T
D
 
P
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
A
Y
 
A
Y
 
E
E
 
K
D
 
G
K
 
R
K
 
A
Y
 
L
A
 
I
S
 
R
K
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
G
V
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
N
V
 
V
L
x
N
G
 
L
F
|
F
Y
 
C
S
 
H
K
 
R
E
 
P
G
 
G
F
 
Q
D
 
A
A
 
D
I
 
P
I
 
A
K
 
R
N
 
E
A
 
R
R
 
A
K
 
W
I
 
L
C
 
D
G
 
Y
D
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
Y
 
F
A
 
A
I
 
E
N
 
F
D
 
G
Y
 
A
E
 
E
R
 
P
V
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
L
A
 
K
C
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
N
I
 
I
I
 
Y
I
 
L
T
 
S
G
 
F
A
 
L
G
 
E
L
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
M
F
 
L
T
 
L
E
 
E
G
 
E
Y
 
R
P
 
P
D
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
S
-
 
F
-
x
H
-
 
F
-
 
G
V
 
A
P
 
P
I
 
P
V
 
R
S
 
D
S
 
Q
A
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
I
 
L
I
 
V
C
 
C
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
A
R
 
L
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
A
E
x
Q
G
 
G
P
 
I
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
x
S
Q
 
R
G
 
G
-
 
V
F
 
F
T
 
E
Y
 
P
E
 
E
Q
 
R
C
 
G
A
 
D
M
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
G
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
N
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
A
W
 
R
G
 
G
D
 
S
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
I
D
 
R
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
|
M
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
V
A
 
L
T
 
C
H
 
P
E
 
E
C
 
S
D
 
S
A
 
A
H
 
N
D
 
A
N
 
A
F
 
Y
K
 
R
K
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
K
D
 
G
A
 
P
K
 
R
K
 
A
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
A
L
 
L
F
 
T
S
 
V
S
 
T
P
 
M
V
 
S
G
 
G
Y
 
R
P
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
L

Sites not aligning to the query:

4qiuB Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
28% identity, 74% coverage: 13:281/363 of query aligns to 10:279/350 of 4qiuB

query
sites
4qiuB
I
 
I
E
 
Q
K
 
Q
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
x
A
G
x
P
M
|
M
G
 
-
V
x
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
W
 
T
D
 
P
S
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
S
G
 
A
Y
 
A
Y
 
E
E
 
K
D
 
G
K
 
R
K
 
A
Y
 
L
A
 
I
S
 
R
K
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
G
V
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
F
D
 
N
V
 
V
L
x
N
G
 
L
F
|
F
Y
 
C
S
 
H
K
 
R
E
 
P
G
 
G
F
 
Q
D
 
A
A
 
D
I
 
P
I
 
A
K
 
R
N
 
E
A
 
R
R
 
A
K
 
W
I
 
L
C
 
D
G
 
Y
D
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
Y
 
F
A
 
A
I
 
E
N
 
F
D
 
G
Y
 
A
E
 
E
R
 
P
V
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
L
A
 
K
C
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
N
I
 
I
I
 
Y
I
 
L
T
 
S
G
 
F
A
 
L
G
 
E
L
 
D
P
 
P
T
 
T
N
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
M
F
 
L
T
 
L
E
 
E
G
 
E
Y
 
R
P
 
P
D
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
S
-
 
F
-
x
H
-
 
F
-
 
G
V
 
A
P
 
P
I
 
P
V
 
R
S
 
D
S
 
Q
A
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
I
 
L
I
 
V
C
 
C
K
 
A
R
 
T
W
 
T
Q
 
P
K
 
E
R
 
E
Y
 
A
N
 
A
R
 
L
L
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
A
E
x
Q
G
 
G
P
 
I
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
 
C
Q
 
R
G
 
G
-
 
V
F
 
F
T
 
E
Y
 
P
E
 
E
Q
 
R
C
 
G
A
 
D
M
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
G
Q
 
T
L
 
L
E
 
A
N
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
V
E
 
R
E
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
A
W
 
R
G
 
G
D
 
S
I
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
M
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
I
D
 
R
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
G
|
G
T
|
T
R
 
A
F
 
F
I
 
V
A
 
L
T
 
C
H
 
P
E
 
E
C
 
S
D
 
S
A
 
A
H
 
N
D
 
A
N
 
A
F
 
Y
K
 
R
K
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
K
D
 
G
A
 
P
K
 
R
K
 
A
E
 
A
D
 
R
I
 
T
Q
 
A
L
 
L
F
 
T
S
 
V
S
 
T
P
 
M
V
 
S
G
 
G
Y
 
R
P
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
L

Sites not aligning to the query:

4iqlA Crystal structure of porphyromonas gingivalis enoyl-acp reductase ii (fabk) with cofactors NADPH and fmn (see paper)
29% identity, 67% coverage: 13:256/363 of query aligns to 10:208/313 of 4iqlA

query
sites
4iqlA
I
 
I
E
 
E
K
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
I
Q
 
S
G
 
G
G
|
G
M
|
M
G
x
V
V
x
W
G
 
C
V
 
S
S
 
G
W
|
W
D
 
K
S
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
S
N
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
N
E
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
I
 
I
S
 
G
A
 
A
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
G
F
x
S
Y
x
M
S
x
H
K
 
P
E
 
D
G
x
N
F
 
L
D
 
E
A
x
H
I
x
H
I
 
I
K
 
R
N
 
S
A
 
C
R
 
-
K
 
K
I
 
A
C
 
A
G
 
T
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
|
N
I
 
V
L
 
P
Y
 
L
A
 
L
I
x
Y
N
x
P
D
x
E
Y
 
M
E
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
M
R
 
E
D
 
I
A
 
I
C
 
M
E
 
R
S
 
E
G
 
H
I
 
V
D
 
P
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
x
S
A
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
T
 
K
N
 
V
M
 
W
P
 
T
E
 
A
F
 
K
T
 
L
E
 
K
G
 
A
Y
 
A
P
 
G
D
 
S
V
 
-
A
 
K
L
 
V
V
 
I
P
 
H
I
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
T
A
 
F
L
 
A
K
 
R
I
 
-
I
 
-
C
 
-
K
 
-
R
 
-
W
 
-
Q
 
-
K
 
K
R
 
S
Y
 
E
N
 
A
R
 
A
L
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
A
E
|
E
G
 
G
P
 
F
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
 
G
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
R
E
 
E
E
 
E
N
 
T
Q
 
T
L
 
T
E
 
L
N
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
P
P
 
E
V
 
V
V
 
V
E
 
D
E
 
A
A
 
V
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
A
D
 
S
K
 
G
N
 
R
D
 
A
I
 
V
D
 
A
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
 
V
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
A
A
 
L
T
 
S
H
 
E
E
 
E
C
 
S
D
x
S
A
 
A
H
 
H
D
 
E
N
 
D
F
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2gjnA Crystal structure of 2-nitropropane dioxygenase complexed with fmn and substrate (see paper)
25% identity, 96% coverage: 13:361/363 of query aligns to 12:309/324 of 2gjnA

query
sites
2gjnA
I
 
V
E
 
E
K
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
M
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
M
|
M
G
x
Q
V
 
-
G
 
W
V
 
V
S
 
G
W
 
R
D
 
A
S
 
E
L
 
M
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
A
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
T
I
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
L
G
 
T
F
 
Q
Y
 
P
S
 
S
K
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
A
I
 
E
I
 
I
K
 
A
N
 
R
A
 
C
R
 
R
K
 
E
I
 
L
C
 
T
G
 
-
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
 
N
I
 
L
L
x
T
Y
 
L
A
 
L
I
 
P
N
 
T
D
 
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
P
Y
 
Y
E
 
A
R
 
E
V
 
Y
V
 
R
R
 
A
D
 
A
A
 
I
C
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
I
 
V
I
 
E
T
 
T
G
 
A
A
 
G
G
 
N
L
 
D
P
 
P
-
 
G
T
 
E
N
 
H
M
 
I
P
 
A
E
 
E
F
 
F
T
 
R
E
 
R
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
H
A
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
C
 
H
K
|
K
-
 
C
-
 
T
-
 
A
-
 
V
R
 
R
W
 
H
Q
 
A
K
 
L
R
 
K
Y
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
-
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
S
L
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
F
K
 
E
S
x
C
G
x
A
G
|
G
H
|
H
Q
 
P
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
E
N
 
D
Q
 
D
L
 
I
E
 
P
N
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
L
E
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
W
 
R
G
 
L
D
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
 
G
I
 
F
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
L
D
 
V
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
I
Q
x
N
M
|
M
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
R
E
 
E
C
 
C
D
 
P
A
 
I
H
 
H
D
 
P
N
 
A
F
 
V
K
 
K
K
 
A
V
 
A
L
 
I
L
 
R
D
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
E
 
R
D
 
S
I
 
T
Q
 
D
L
 
L
F
 
I
S
 
M
S
 
R
P
 
S
V
 
L
G
 
R
Y
 
N
P
 
T
A
 
A
Q
 
R
G
 
V
I
 
A
R
 
R
T
 
N
N
 
A
L
 
I
T
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
A
R
 
R
E
 
G
G
 
G
P
 
A
A
 
G
I
 
Y
K
 
A
C
 
D
I
 
I
S
 
A
N
 
A
C
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
G
E
 
Q
E
 
R
A
 
G
K
 
R
E
 
Q
V
 
V
G
 
-
Y
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
A
x
Y
Y
 
Q
N
 
Q
G
 
G
N
 
D
L
 
T
E
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
W
F
x
S
S
 
A
G
 
G
T
 
M
N
 
V
G
 
Q
Y
 
G
R
 
L
V
 
I
D
 
D
K
 
D
I
 
E
I
 
P
S
 
A
V
 
C
K
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
D
 
R
K
 
D
L
 
I
V
 
V
N
 
E

Q9I4V0 NADH:quinone reductase; EC 1.6.5.9 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
25% identity, 96% coverage: 13:361/363 of query aligns to 14:311/328 of Q9I4V0

query
sites
Q9I4V0
I
 
V
E
 
E
K
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
M
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
M
|
M
G
x
Q
V
 
-
G
 
W
V
 
V
S
 
G
W
 
R
D
 
A
S
 
E
L
 
M
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
A
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
T
I
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
L
G
 
T
F
 
Q
Y
 
P
S
 
S
K
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
A
I
 
E
I
 
I
K
 
A
N
 
R
A
 
C
R
 
R
K
 
E
I
 
L
C
 
T
G
 
-
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
 
N
I
 
L
L
x
T
Y
 
L
A
 
L
I
 
P
N
 
T
D
 
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
P
Y
 
Y
E
 
A
R
 
E
V
 
Y
V
 
R
R
 
A
D
 
A
A
 
I
C
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
I
 
V
I
 
E
T
 
T
G
 
A
A
 
G
G
 
N
L
 
D
P
 
P
-
 
G
T
 
E
N
 
H
M
 
I
P
 
A
E
 
E
F
 
F
T
 
R
E
 
R
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
H
A
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
C
 
H
K
|
K
-
 
C
-
 
T
-
 
A
-
 
V
R
 
R
W
 
H
Q
 
A
K
 
L
R
 
K
Y
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
-
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
S
L
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
F
K
 
E
S
 
C
G
x
A
G
 
G
H
 
H
Q
 
P
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
E
N
 
D
Q
 
D
L
 
I
E
 
P
N
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
L
E
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
W
 
R
G
 
L
D
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
|
G
I
 
F
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
L
D
 
V
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
I
Q
 
N
M
 
M
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
R
E
 
E
C
 
C
D
 
P
A
 
I
H
 
H
D
 
P
N
 
A
F
 
V
K
 
K
K
 
A
V
 
A
L
 
I
L
 
R
D
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
E
 
R
D
 
S
I
 
T
Q
 
D
L
 
L
F
 
I
S
 
M
S
 
R
P
 
S
V
 
L
G
 
R
Y
 
N
P
 
T
A
 
A
Q
 
R
G
 
V
I
 
A
R
 
R
T
 
N
N
 
A
L
 
I
T
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
A
R
 
R
E
 
G
G
 
G
P
 
A
A
 
G
I
 
Y
K
 
A
C
 
D
I
 
I
S
 
A
N
 
A
C
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
G
E
 
Q
E
 
R
A
 
G
K
 
R
E
 
Q
V
 
V
G
 
-
Y
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
Y
Y
 
Q
N
 
Q
G
 
G
N
 
D
L
 
T
E
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
W
F
 
S
S
 
A
G
 
G
T
 
M
N
 
V
G
 
Q
Y
 
G
R
 
L
V
 
I
D
 
D
K
 
D
I
 
E
I
 
P
S
 
A
V
 
C
K
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
D
 
R
K
 
D
L
 
I
V
 
V
N
 
E

6e2aA Crystal structure of nadh:quinone reductase pa1024 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NAD+ (see paper)
25% identity, 96% coverage: 13:361/363 of query aligns to 13:310/326 of 6e2aA

query
sites
6e2aA
I
 
V
E
 
E
K
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
M
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
M
|
M
G
x
Q
V
 
W
G
 
-
V
 
V
S
 
G
W
 
R
D
 
A
S
 
E
L
 
M
A
 
A
G
 
A
N
 
A
V
 
V
S
 
A
K
 
N
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
A
V
 
T
I
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
L
G
 
T
F
 
Q
Y
 
P
S
 
S
K
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
A
I
 
E
I
 
I
K
 
A
N
 
R
A
 
C
R
 
R
K
 
E
I
 
L
C
 
T
G
 
-
D
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
F
A
 
G
A
 
V
N
 
N
I
 
L
L
x
T
Y
 
L
A
x
L
I
x
P
N
 
T
D
x
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
P
Y
 
Y
E
 
A
R
 
E
V
 
Y
V
 
R
R
 
A
D
 
A
A
 
I
C
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
R
I
 
V
I
 
V
I
 
E
T
 
T
G
 
A
A
 
G
G
 
N
L
 
D
P
 
P
-
 
G
T
 
E
N
 
H
M
 
I
P
 
A
E
 
E
F
 
F
T
 
R
E
 
R
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
H
A
 
G
L
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
C
 
H
K
|
K
-
 
C
-
 
T
-
 
A
-
 
V
R
 
R
W
 
H
Q
 
A
K
 
L
R
 
K
Y
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
-
 
G
P
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
S
L
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
F
K
 
E
S
x
C
G
x
A
G
|
G
H
|
H
Q
 
P
G
 
G
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
-
C
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
-
E
 
E
N
 
D
Q
 
D
L
 
I
E
 
P
N
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
-
P
 
-
V
 
L
V
 
L
E
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
W
 
R
G
 
L
D
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
G
 
G
I
 
F
W
 
A
D
 
D
K
 
G
N
 
R
D
 
G
I
 
L
D
 
V
E
 
A
M
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
G
 
A
V
 
I
Q
x
N
M
|
M
G
|
G
T
|
T
R
 
R
F
 
F
I
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
R
E
 
E
C
 
C
D
 
P
A
 
I
H
 
H
D
 
P
N
 
A
F
 
V
K
 
K
K
 
A
V
 
A
L
 
I
L
 
R
D
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
E
 
R
D
 
S
I
 
T
Q
 
D
L
 
L
F
 
I
S
 
M
S
 
R
P
 
S
V
 
L
G
 
R
Y
x
N
P
 
T
A
 
A
Q
 
R
G
 
V
I
 
A
R
 
R
T
 
N
N
 
A
L
 
I
T
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
V
L
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
A
R
 
R
E
 
G
G
 
G
P
 
A
A
 
G
I
x
Y
K
 
A
C
 
D
I
 
I
S
 
A
N
 
A
C
 
L
V
 
V
A
 
S
P
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
-
G
|
G
E
 
Q
E
 
R
A
 
G
K
 
R
E
 
Q
V
 
V
G
 
-
Y
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
Y
Y
 
Q
N
 
Q
G
 
G
N
 
D
L
 
T
E
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
I
F
 
W
F
x
S
S
 
A
G
 
G
T
 
M
N
 
V
G
 
Q
Y
 
G
R
 
L
V
 
I
D
 
D
K
 
D
I
 
E
I
 
P
S
 
A
V
 
C
K
 
A
E
 
E
L
 
L
M
 
L
D
 
R
K
 
D
L
 
I
V
 
V
N
 
E

6bkaA Crystal structure of nitronate monooxygenase from cyberlindnera saturnus (see paper)
28% identity, 39% coverage: 133:273/363 of query aligns to 146:283/374 of 6bkaA

query
sites
6bkaA
F
 
F
T
x
H
E
 
F
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
D
 
H
V
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
E
I
 
S
V
 
L
S
 
Q
S
 
-
A
 
A
K
 
S
A
 
D
L
 
I
K
 
K
I
 
I
I
 
F
C
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
N
-
 
L
K
 
Q
R
 
E
W
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
A
Y
 
Y
N
 
E
R
 
S
L
 
K
P
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
E
x
Q
G
 
G
P
 
W
K
 
E
S
x
A
G
|
G
G
|
G
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
F
 
-
T
 
N
Y
 
F
E
 
K
Q
 
A
C
 
N
A
 
D
M
 
V
E
 
E
E
 
D
N
 
G
Q
 
Q
L
 
L
E
 
K
-
 
T
-
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
S
P
 
T
V
 
I
V
 
V
E
 
D
-
 
Y
-
 
I
E
 
D
A
 
S
A
 
A
L
 
S
W
 
I
G
 
S
D
 
N
I
 
P
P
 
P
-
 
F
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
|
G
G
|
G
I
 
I
W
 
H
D
 
D
K
 
D
N
 
E
D
 
S
I
 
I
D
 
K
E
 
E
M
 
L
M
 
L
A
 
Q
L
 
F
G
 
N
A
 
I
S
 
A
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
L
G
|
G
T
|
T
R
 
V
F
 
W
I
 
L
A
 
P
T
 
S
H
 
S
E
 
Q
C
 
A
D
 
-
A
 
-
H
 
-
D
 
-
N
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
T
A
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
L
Q
 
K
L
 
M
F
 
F
S
 
Q
S
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011372354.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011372354.1
MGNRSLKIGKHIIEKPIVQGGMGVGVSWDSLAGNVSKEGGLGVISAVGTGYYEDKKYASK
LVAGRPLDVLGFYSKEGFDAIIKNARKICGDKPLAANILYAINDYERVVRDACESGIDII
ITGAGLPTNMPEFTEGYPDVALVPIVSSAKALKIICKRWQKRYNRLPDAVVLEGPKSGGH
QGFTYEQCAMEENQLENLVRPVVEEAALWGDIPVIAAGGIWDKNDIDEMMALGASGVQMG
TRFIATHECDAHDNFKKVLLDAKKEDIQLFSSPVGYPAQGIRTNLTLLVEKREGPAIKCI
SNCVAPCNRGEEAKEVGYCIADRLSDAYNGNLETGLFFSGTNGYRVDKIISVKELMDKLV
NGE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory