SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011372418.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011372418.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:219/223 of query aligns to 3:217/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
V
 
I
I
 
I
I
 
E
A
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
A
 
K
Y
|
Y
S
 
D
N
 
N
N
 
G
E
x
T
T
 
T
I
x
A
I
 
L
N
 
R
K
 
G
A
 
V
N
 
S
F
 
V
S
 
S
I
 
V
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
Y
G
 
R
A
 
E
L
 
V
K
 
K
L
 
I
K
 
D
H
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
S
V
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
L
S
 
V
N
 
K
V
 
I
S
 
K
R
 
K
S
 
K
K
 
D
L
 
V
N
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
K
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
L
 
Y
P
 
A
L
 
M
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
E
V
 
N
K
 
R
G
 
R
V
 
N
A
 
I
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
M
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
D
H
 
L
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
K
H
 
H
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
L
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
D
S
 
N
S
 
S
G
 
W
L
 
E
I
 
I
W
 
M
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
L
Q
 
Q
L
 
-
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
I
 
S
P
 
Q
K
 
I
T
 
V
L
 
N
N
 
T
V
 
L
N
 
R
Y
 
H
K
 
R
H
 
V
F
 
I
H
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
N
G
 
G
S
 
R
I
 
V

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:219/223 of query aligns to 3:217/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
V
 
I
I
 
I
I
 
E
A
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
A
 
K
Y
 
Y
S
 
D
N
 
N
N
 
G
E
 
T
T
 
T
I
 
A
I
 
L
N
 
R
K
 
G
A
 
V
N
 
S
F
 
V
S
 
S
I
 
V
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
Y
G
 
R
A
 
E
L
 
V
K
 
K
L
 
I
K
 
D
H
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
S
V
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
L
S
 
V
N
 
K
V
 
I
S
 
K
R
 
K
S
 
K
K
 
D
L
 
V
N
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
K
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
L
 
Y
P
 
A
L
 
M
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
E
V
 
N
K
 
R
G
 
R
V
 
N
A
 
I
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
M
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
D
H
 
L
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
K
H
 
H
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
L
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
D
S
 
N
S
 
S
G
 
W
L
 
E
I
 
I
W
 
M
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
L
Q
 
Q
L
 
-
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
I
 
S
P
 
Q
K
 
I
T
 
V
L
 
N
N
 
T
V
 
L
N
 
R
Y
 
H
K
 
R
H
 
V
F
 
I
H
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
N
G
 
G
S
 
R
I
 
V

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:219/223 of query aligns to 3:217/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
V
 
I
I
 
I
I
 
E
A
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
A
 
K
Y
|
Y
S
 
D
N
 
N
N
x
G
E
 
T
T
 
T
I
x
A
I
 
L
N
 
R
K
 
G
A
 
V
N
 
S
F
 
V
S
 
S
I
 
V
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
F
 
Y
G
 
R
A
 
E
L
 
V
K
 
K
L
 
I
K
 
D
H
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
S
V
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
F
E
 
N
L
 
L
S
 
V
N
 
K
V
 
I
S
 
K
R
 
K
S
 
K
K
 
D
L
 
V
N
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
K
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
A
L
 
Y
P
 
A
L
 
M
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
E
V
 
N
K
 
R
G
 
R
V
 
N
A
 
I
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
M
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
D
H
 
L
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
K
H
 
H
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
L
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
D
S
 
N
S
 
S
G
 
W
L
 
E
I
 
I
W
 
M
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
L
Q
 
Q
L
 
-
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
N
I
 
S
P
 
Q
K
 
I
T
 
V
L
 
N
N
 
T
V
 
L
N
 
R
Y
 
H
K
 
R
H
 
V
F
 
I
H
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
N
G
 
G
S
 
R
I
 
V

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
36% identity, 92% coverage: 14:219/223 of query aligns to 11:215/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
Y
|
Y
S
 
P
N
 
N
N
 
G
E
x
H
T
 
V
I
 
G
I
 
L
N
 
H
K
 
E
A
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
R
I
 
V
S
 
H
S
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
I
V
 
L
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
H
S
|
S
G
 
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
L
L
 
I
F
 
L
G
 
A
A
 
M
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
E
 
D
L
 
L
S
 
G
N
 
R
V
 
I
S
 
T
R
 
T
S
 
A
K
 
Q
L
 
I
N
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
Y
 
H
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
K
 
T
E
 
D
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
A
K
 
D
N
 
N
I
 
I
M
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
Q
I
 
I
N
 
L
G
 
G
Y
 
M
V
 
P
K
 
K
G
 
P
V
 
E
A
 
I
Q
 
A
N
 
K
Q
 
R
V
 
V
D
 
A
K
 
S
L
 
A
L
 
L
K
 
E
H
 
R
V
 
V
R
 
N
L
 
L
N
 
K
H
 
E
Q
 
K
T
 
G
G
 
E
K
 
A
Y
 
L
P
 
P
L
 
S
E
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
H
 
H
N
 
Q
P
 
P
I
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
R
S
 
L
S
 
A
G
 
S
L
 
E
I
 
I
W
 
M
N
 
G
L
 
V
L
 
F
E
 
E
G
 
D
A
 
I
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
I
V
 
A
T
 
S
H
 
H
N
 
D
I
 
L
P
 
A
K
 
L
T
 
I
L
 
A
N
 
R
V
 
M
N
 
R
Y
 
H
K
 
R
H
 
M
F
 
L
H
 
T
I
 
L
E
 
Q
Y
 
R
G
 
G
S
 
R
I
 
I

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
36% identity, 95% coverage: 10:220/223 of query aligns to 7:216/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
L
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Y
|
Y
S
 
L
N
 
G
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
I
 
A
I
 
L
N
 
Q
K
 
G
A
 
V
N
 
T
F
 
F
S
 
H
I
 
M
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
L
L
 
I
F
 
C
G
 
G
A
 
I
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
S
H
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
W
V
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
H
E
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
V
 
L
S
 
K
R
 
N
S
 
R
K
 
E
L
 
V
N
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
M
E
 
D
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
K
 
G
G
 
D
V
 
D
A
 
I
Q
 
R
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
S
K
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
K
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
L
H
 
D
Q
x
K
T
 
A
G
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
I
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
H
 
N
N
 
K
P
 
P
I
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
Y
 
A
S
 
L
S
 
S
G
 
E
L
 
G
I
 
I
W
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
E
A
 
F
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
V
K
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
|
H
N
 
D
I
 
I
P
 
N
K
 
L
T
 
I
L
 
S
N
 
R
V
 
R
N
 
S
Y
 
Y
K
 
R
H
 
M
F
 
L
H
 
T
I
 
L
E
 
S
Y
 
D
G
 
G
S
 
H
I
 
L
H
 
H

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:222/223 of query aligns to 2:220/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
V
 
V
I
 
I
I
 
R
A
 
F
K
 
Q
D
 
Q
L
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Y
|
Y
S
 
R
N
 
G
N
 
G
E
x
R
T
 
Q
I
x
A
I
 
L
N
 
Q
K
 
K
A
 
V
N
 
D
F
 
F
S
 
H
I
 
L
S
 
R
S
 
R
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
I
 
L
T
 
G
G
 
G
A
 
H
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
L
L
 
I
F
 
C
G
 
A
A
 
I
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
T
H
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
S
V
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
H
E
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
V
 
I
S
 
P
R
 
N
S
 
K
K
 
D
L
 
I
N
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
H
K
 
R
L
 
L
V
 
L
K
 
M
E
 
D
W
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
R
I
 
I
N
 
E
G
 
S
Y
 
I
V
 
S
K
 
E
G
 
N
V
 
E
A
 
I
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
S
K
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
K
V
 
T
R
 
G
L
 
L
N
 
L
H
 
D
Q
 
K
T
 
A
G
 
R
K
 
C
Y
 
L
P
 
P
L
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
H
 
N
N
 
R
P
 
P
I
 
T
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
E
S
 
L
S
 
S
G
 
S
L
 
R
I
 
V
W
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
E
A
 
F
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
A
K
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
I
 
I
P
 
H
K
 
L
T
 
V
-
 
N
L
 
S
N
 
R
V
 
P
N
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
H
 
H
F
 
L
H
 
E
I
 
L
E
 
N
Y
 
Q
G
 
G
S
 
F
I
 
L
H
 
S
E
 
E
V
 
V

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 95% coverage: 10:220/223 of query aligns to 7:216/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
L
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Y
 
Y
S
 
L
N
 
G
N
 
G
E
 
R
T
 
Q
I
 
A
I
 
L
N
 
Q
K
 
G
A
 
V
N
 
T
F
 
F
S
 
H
I
 
M
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
L
L
 
I
F
x
C
G
 
G
A
 
I
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
S
H
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
W
V
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
H
E
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
V
 
L
S
 
K
R
 
N
S
 
R
K
 
E
L
 
V
N
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
M
E
 
D
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
K
 
G
G
 
D
V
 
D
A
 
I
Q
 
R
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
S
K
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
K
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
L
H
 
D
Q
 
K
T
 
A
G
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
H
 
N
N
 
K
P
 
P
I
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
Y
 
A
S
 
L
S
 
S
G
 
E
L
 
G
I
 
I
W
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
E
A
 
F
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
V
K
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
I
 
I
P
 
N
K
 
L
T
 
I
L
 
S
N
 
R
V
 
R
N
 
S
Y
 
Y
K
 
R
H
 
M
F
 
L
H
 
T
I
 
L
E
 
S
Y
 
D
G
 
G
S
 
H
I
 
L
H
 
H

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
35% identity, 95% coverage: 10:220/223 of query aligns to 7:216/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
L
 
V
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Y
|
Y
S
 
L
N
 
G
N
 
G
E
x
R
T
 
Q
I
x
A
I
 
L
N
 
Q
K
 
G
A
 
V
N
 
T
F
 
F
S
 
H
I
 
M
S
 
Q
S
 
P
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
L
L
 
I
F
 
C
G
 
G
A
 
I
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
S
H
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
W
V
 
F
G
 
S
G
 
G
V
 
H
E
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
V
 
L
S
 
K
R
 
N
S
 
R
K
 
E
L
 
V
N
 
P
F
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
M
E
 
D
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
I
N
 
A
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
K
 
G
G
 
D
V
 
D
A
 
I
Q
 
R
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
S
K
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
K
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
L
H
 
D
Q
 
K
T
 
A
G
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
H
 
N
N
 
K
P
 
P
I
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
Y
 
A
S
 
L
S
 
S
G
 
E
L
 
G
I
 
I
W
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
G
 
E
A
 
F
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
V
K
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D
I
 
I
P
 
N
K
 
L
T
 
I
L
 
S
N
 
R
V
 
R
N
 
S
Y
 
Y
K
 
R
H
 
M
F
 
L
H
 
T
I
 
L
E
 
S
Y
 
D
G
 
G
S
 
H
I
 
L
H
 
H

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
37% identity, 83% coverage: 16:200/223 of query aligns to 18:203/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
N
 
N
N
 
K
E
 
Q
T
 
E
I
 
V
I
 
L
N
 
K
K
 
G
A
 
I
N
 
D
F
 
I
S
 
H
I
 
I
S
 
E
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
I
 
I
T
 
M
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
 
G
S
|
S
G
 
G
K
 
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
V
L
 
L
F
 
S
G
 
S
A
 
I
L
 
D
K
 
Q
L
 
V
K
 
S
H
 
H
G
 
G
S
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
I
G
 
N
G
 
G
V
 
N
E
 
D
L
 
M
S
 
T
N
 
A
V
 
M
S
 
K
R
 
E
S
 
K
K
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
E
F
 
F
L
 
R
R
 
K
R
 
Q
H
 
H
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
N
L
 
L
V
 
L
K
 
D
E
 
T
W
 
L
S
 
T
I
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
S
I
 
I
N
 
T
G
 
K
Y
 
L
V
 
S
K
 
K
G
 
K
V
 
E
A
 
A
Q
 
N
N
 
R
Q
 
K
V
 
F
D
 
E
K
 
E
L
 
V
L
 
A
K
 
K
H
 
E
V
 
L
R
 
G
L
 
I
N
 
Y
H
 
E
Q
 
L
T
 
R
G
 
D
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
L
 
N
E
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
M
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
I
H
 
H
N
 
D
P
 
P
I
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
S
Y
 
K
S
 
S
S
 
A
G
 
S
L
 
D
I
 
L
W
 
L
N
 
N
L
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
Q
A
 
L
N
 
N
E
 
Q
Q
 
K
L
 
R
K
 
N
T
 
A
T
 
T
V
 
I
I
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D

Sites not aligning to the query:

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
36% identity, 83% coverage: 16:200/223 of query aligns to 17:202/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
N
 
N
N
 
K
E
x
Q
T
 
E
I
x
V
I
 
L
N
 
K
K
 
G
A
 
I
N
 
D
F
 
I
S
 
H
I
 
I
S
 
E
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
I
 
I
T
 
M
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
V
L
 
L
F
 
S
G
 
S
A
 
I
L
 
D
K
 
Q
L
 
V
K
 
S
H
 
H
G
 
G
S
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
I
G
 
N
G
 
G
V
 
N
E
 
D
L
 
M
S
 
T
N
 
A
V
 
M
S
 
K
R
 
E
S
 
K
K
 
Q
L
 
L
-
 
A
N
 
E
F
 
F
L
 
R
R
 
K
R
 
Q
H
 
H
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
K
 
N
L
 
L
V
 
L
K
 
D
E
 
T
W
 
L
S
 
T
I
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
S
I
 
I
N
 
T
G
 
K
Y
 
L
V
 
S
K
 
K
G
 
K
V
 
E
A
 
A
Q
 
N
N
 
R
Q
 
K
V
 
F
D
 
E
K
 
E
L
 
V
L
 
A
K
 
K
H
 
E
V
 
L
R
 
G
L
 
I
N
 
Y
H
 
E
Q
 
L
T
 
R
G
 
D
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
L
 
N
E
|
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
M
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
I
H
 
H
N
 
D
P
 
P
I
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
S
Y
 
K
S
 
S
S
 
A
G
 
S
L
 
D
I
 
L
W
 
L
N
 
N
L
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
Q
A
 
L
N
 
N
E
 
Q
Q
 
K
L
 
R
K
 
N
T
 
A
T
 
T
V
 
I
I
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D

Sites not aligning to the query:

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 90% coverage: 1:201/223 of query aligns to 1:206/233 of P75957

query
sites
P75957
M
 
M
N
 
N
K
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
Q
K
 
C
D
 
D
-
 
N
L
 
L
S
 
C
L
 
K
A
 
R
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
S
 
S
N
 
V
N
 
Q
E
 
T
T
 
D
I
 
V
I
 
L
N
 
H
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
S
I
 
V
S
 
G
S
 
E
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
I
 
I
T
 
V
G
|
G
A
 
S
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
 
L
L
 
D
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
I
V
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
E
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
S
S
 
A
K
 
A
L
 
K
N
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
H
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
D
 
F
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
D
W
 
F
S
 
T
I
 
A
D
 
L
K
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
K
Y
 
K
V
 
K
K
 
P
G
 
A
V
 
E
A
 
I
Q
 
N
N
 
S
Q
 
R
V
 
A
D
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
H
 
A
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
D
H
 
H
Q
 
R
T
 
A
G
 
N
K
 
H
Y
 
R
P
 
P
L
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
A
Y
 
R
S
 
N
S
 
A
G
 
D
L
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
L
N
 
N
E
 
R
Q
 
L
L
 
Q
K
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
I
 
L

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
38% identity, 83% coverage: 15:200/223 of query aligns to 13:197/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
S
 
S
N
 
S
N
 
A
E
 
R
T
 
P
I
 
A
I
 
L
N
 
D
K
 
D
A
 
I
N
 
N
F
 
V
S
 
K
I
 
I
S
 
D
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
I
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
S
 
L
L
 
L
F
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
R
V
 
V
G
 
S
G
 
K
V
 
F
E
 
H
L
 
V
S
 
N
N
 
K
V
 
L
S
 
R
R
 
G
S
 
R
K
 
H
L
 
V
N
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
I
x
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
L
 
L
V
 
L
K
 
Q
E
 
Q
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
F
P
 
A
L
 
L
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
K
V
 
R
K
 
T
G
 
D
V
 
A
A
 
I
Q
 
N
N
 
R
Q
 
V
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
E
H
 
T
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
S
H
 
G
Q
 
K
T
 
A
G
 
N
K
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
N
N
 
R
P
 
P
I
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
E
S
 
T
S
 
S
G
 
R
L
 
D
I
 
I
W
 
M
N
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
T
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
38% identity, 83% coverage: 15:200/223 of query aligns to 14:198/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
S
 
S
N
 
S
N
 
A
E
 
R
T
 
P
I
 
A
I
 
L
N
 
D
K
 
D
A
 
I
N
 
N
F
 
V
S
 
K
I
 
I
S
 
D
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
I
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
S
|
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
S
 
L
L
 
L
F
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
R
V
 
V
G
 
S
G
 
K
V
 
F
E
 
H
L
 
V
S
 
N
N
 
K
V
 
L
S
 
R
R
 
G
S
 
R
K
 
H
L
 
V
N
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
L
 
L
V
 
L
K
 
Q
E
 
Q
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
F
P
 
A
L
 
L
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
K
V
 
R
K
 
T
G
 
D
V
 
A
A
 
I
Q
 
N
N
 
R
Q
 
V
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
E
H
 
T
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
S
H
 
G
Q
 
K
T
 
A
G
 
N
K
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
N
N
 
R
P
 
P
I
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
E
S
 
T
S
 
S
G
 
R
L
 
D
I
 
I
W
 
M
N
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
T
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D

Sites not aligning to the query:

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
38% identity, 83% coverage: 15:200/223 of query aligns to 14:198/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
S
 
S
N
 
S
N
 
A
E
 
R
T
 
P
I
 
A
I
 
L
N
 
D
K
 
D
A
 
I
N
 
N
F
 
V
S
 
K
I
 
I
S
 
D
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
I
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
K
 
R
S
 
L
L
 
L
F
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
R
V
 
V
G
 
S
G
 
K
V
 
F
E
 
H
L
 
V
S
 
N
N
 
K
V
 
L
S
 
R
R
 
G
S
 
R
K
 
H
L
 
V
N
 
P
F
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
Y
 
F
K
 
R
L
 
L
V
 
L
K
 
Q
E
 
Q
W
 
K
S
 
T
I
 
V
D
 
Y
K
 
D
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
F
P
 
A
L
 
L
L
 
E
I
 
V
N
 
I
G
 
G
Y
 
K
V
 
R
K
 
T
G
 
D
V
 
A
A
 
I
Q
 
N
N
 
R
Q
 
V
V
 
V
D
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
L
K
 
E
H
 
T
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
S
H
 
G
Q
 
K
T
 
A
G
 
N
K
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
H
 
N
N
 
R
P
 
P
I
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
E
S
 
T
S
 
S
G
 
R
L
 
D
I
 
I
W
 
M
N
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
R
A
 
I
N
 
N
E
 
-
Q
 
R
L
 
T
K
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
N
 
D

Sites not aligning to the query:

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
41% identity, 81% coverage: 20:200/223 of query aligns to 18:198/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
I
 
I
I
 
L
N
 
K
K
 
G
A
 
I
N
 
S
F
 
L
S
 
S
I
 
V
S
 
K
S
 
K
A
 
G
D
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
I
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
-
S
 
Y
L
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
L
K
 
D
L
 
A
K
 
P
-
 
T
H
 
E
G
 
G
S
 
K
L
 
V
V
 
F
V
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
K
E
 
E
L
 
V
S
 
D
N
 
Y
V
 
T
S
 
N
R
 
E
S
 
K
K
 
E
L
 
L
N
 
S
F
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
R
H
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
Y
 
H
K
 
Y
L
 
L
V
 
I
K
 
P
E
 
E
W
 
L
S
 
T
I
 
A
D
 
L
K
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
I
 
K
N
 
M
G
 
G
Y
 
K
V
 
P
K
 
K
G
 
K
V
 
E
A
 
A
Q
 
K
N
 
E
Q
 
R
V
 
G
D
 
E
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
K
 
S
H
 
E
V
 
L
R
 
G
L
 
L
N
 
G
H
 
D
Q
 
K
T
 
L
G
 
S
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
L
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
N
N
 
E
P
 
P
I
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
S
Y
 
A
S
 
N
S
 
T
G
 
K
L
 
R
I
 
V
W
 
M
N
 
D
L
 
I
L
 
F
E
 
L
G
 
K
A
 
I
N
 
N
E
 
E
Q
 
G
L
 
-
K
 
G
T
 
T
T
 
S
V
 
I
I
 
V
V
 
M
V
 
V
T
|
T
H
 
H
N
 
E

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
39% identity, 82% coverage: 20:201/223 of query aligns to 21:203/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
I
 
V
I
 
L
N
 
H
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
S
I
 
V
S
 
G
S
 
E
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
 
L
L
 
D
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
I
V
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
E
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
S
S
 
A
K
 
A
L
 
K
N
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
H
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
D
 
F
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
D
W
 
F
S
 
T
I
 
A
D
 
L
K
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
K
Y
 
K
V
 
K
K
 
P
G
 
A
V
 
E
A
 
I
Q
 
N
N
 
S
Q
 
R
V
 
A
D
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
H
 
A
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
D
H
 
H
Q
 
R
T
 
A
G
 
N
K
x
H
Y
 
R
P
 
P
L
 
S
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
L
D
 
D
E
 
A
Y
 
R
S
 
N
S
 
A
G
 
D
L
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
L
N
 
N
E
 
R
Q
 
L
L
 
Q
K
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
N
 
D
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
39% identity, 82% coverage: 20:201/223 of query aligns to 21:203/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
I
 
V
I
 
L
N
 
H
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
S
I
 
V
S
 
G
S
 
E
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
S
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
 
L
L
 
D
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
I
V
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
E
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
S
S
 
A
K
 
A
L
 
K
N
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
H
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
D
 
F
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
D
W
 
F
S
 
T
I
 
A
D
 
L
K
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
K
Y
 
K
V
 
K
K
 
P
G
 
A
V
 
E
A
 
I
Q
 
N
N
 
S
Q
 
R
V
 
A
D
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
H
 
A
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
D
H
 
H
Q
 
R
T
 
A
G
 
N
K
 
H
Y
 
R
P
 
P
L
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
A
Y
 
R
S
 
N
S
 
A
G
 
D
L
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
L
N
 
N
E
 
R
Q
 
L
L
 
Q
K
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
N
 
D
I
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 81% coverage: 21:201/223 of query aligns to 21:201/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
L
N
 
N
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
L
S
 
H
I
 
V
S
 
P
S
 
A
A
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
S
 
C
L
 
V
F
 
N
G
 
L
A
 
L
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
T
H
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
V
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
T
N
 
T
V
 
L
S
 
S
R
 
E
S
 
S
K
 
E
L
 
L
N
 
T
F
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
Y
 
F
K
 
N
L
 
L
V
 
L
K
 
S
E
 
S
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
F
K
 
G
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
I
 
L
N
 
D
G
 
N
Y
 
T
V
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
E
A
 
V
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
S
H
 
L
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
G
H
 
D
Q
 
K
T
 
H
G
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
A
S
 
T
S
 
T
G
 
R
L
 
S
I
 
I
W
 
L
N
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
E
 
R
Q
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
N
 
E
I
 
M

Sites not aligning to the query:

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
37% identity, 90% coverage: 2:201/223 of query aligns to 1:205/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
N
 
N
K
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
L
A
 
Q
K
 
C
D
 
D
-
 
N
L
 
L
S
 
C
L
 
K
A
 
R
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
S
 
S
N
 
V
N
 
Q
E
 
T
T
 
D
I
x
V
I
 
L
N
 
H
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
F
S
 
S
I
 
V
S
 
G
S
 
E
A
 
G
D
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
I
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
S
 
L
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
 
L
L
 
D
K
 
T
L
 
P
K
 
T
H
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
I
V
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
E
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
S
S
 
A
K
 
A
L
 
K
N
 
A
F
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
H
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
D
 
F
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
V
 
L
K
 
P
E
 
D
W
 
F
S
 
T
I
 
A
D
 
L
K
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
K
Y
 
K
V
 
K
K
 
P
G
 
A
V
 
E
A
 
I
Q
 
N
N
 
S
Q
 
R
V
 
A
D
 
L
K
 
E
L
 
M
L
 
L
K
 
K
H
 
A
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
D
H
 
H
Q
x
R
T
 
A
G
 
N
K
x
H
Y
 
R
P
 
P
L
 
S
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
H
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
R
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
A
Y
 
R
S
 
N
S
 
A
G
 
D
L
 
S
I
 
I
W
 
F
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
L
N
 
N
E
 
R
Q
 
L
L
 
Q
K
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
I
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
N
 
D
I
 
L

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
36% identity, 81% coverage: 21:201/223 of query aligns to 22:202/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
I
 
L
N
 
N
K
 
N
A
 
V
N
 
S
F
 
L
S
 
H
I
 
V
S
 
P
S
 
A
A
 
G
D
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
S
 
C
L
 
V
F
 
N
G
 
L
A
 
L
L
 
E
K
 
R
L
 
P
K
 
T
H
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
V
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
T
N
 
T
V
 
L
S
 
S
R
 
E
S
 
S
K
 
E
L
 
L
N
 
T
F
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
Y
 
F
K
 
N
L
 
L
V
 
L
K
 
S
E
 
S
W
 
R
S
 
T
I
 
V
D
 
F
K
 
G
N
 
N
I
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
I
 
L
N
 
D
G
 
N
Y
 
T
V
 
P
K
 
K
G
 
D
V
 
E
A
 
V
Q
 
K
N
 
R
Q
 
R
V
 
V
D
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
S
H
 
L
V
 
V
R
 
G
L
 
L
N
 
G
H
 
D
Q
 
K
T
 
H
G
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
K
L
 
V
I
 
L
L
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
Y
 
A
S
 
T
S
 
T
G
 
R
L
 
S
I
 
I
W
 
L
N
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
D
A
 
I
N
 
N
E
 
R
Q
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
N
 
E
I
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011372418.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011372418.1
MNKVIIAKDLSLAYSNNETIINKANFSISSADFVFITGASGSGKSTLLKSLFGALKLKHG
SLVVGGVELSNVSRSKLNFLRRHIGIVFQDYKLVKEWSIDKNIMLPLLINGYVKGVAQNQ
VDKLLKHVRLNHQTGKYPLELSGGEQQRVAMARALAHNPILILADEPTGNLDEYSSGLIW
NLLEGANEQLKTTVIVVTHNIPKTLNVNYKHFHIEYGSIHEVC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory