SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011373231.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011373231.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8jfgA Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-octanoyl-acp from helicobacter pylori (see paper)
66% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 2:248/248 of 8jfgA

query
sites
8jfgA
M
 
M
K
 
Q
F
 
F
S
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
R
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
S
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
|
R
S
 
S
G
 
N
A
 
A
T
 
E
E
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
D
 
N
A
 
E
I
 
L
E
 
E
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
F
D
 
D
V
x
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
T
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
Q
C
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
T
 
V
N
 
R
D
|
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
H
S
 
H
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
N
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
L
K
 
K
V
 
V
M
 
M
R
 
S
K
 
K
K
 
S
K
 
R
S
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
|
A
S
|
S
I
 
I
V
x
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
G
 
G
N
 
N
A
x
M
G
|
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
A
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
V
T
 
T
P
|
P
G
|
G
F
|
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
x
N
D
 
A
V
 
N
L
 
L
S
 
K
D
 
D
E
 
E
I
 
L
K
 
K
G
 
A
S
 
D
F
x
Y
T
 
V
S
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
A
P
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
N
 
Y
M
 
M

4iinA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase from helicobacter pylori 26695 complexed with NAD+
64% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 2:236/236 of 4iinA

query
sites
4iinA
M
 
M
K
 
Q
F
 
F
S
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
R
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
S
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
|
N
Y
 
Y
R
|
R
S
 
S
G
 
N
A
 
A
T
 
E
E
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
D
 
N
A
 
E
I
 
L
E
 
E
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
F
D
 
D
V
x
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
D
F
 
F
V
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
Q
C
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
T
 
V
N
 
R
D
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
H
S
 
H
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
N
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
L
K
 
K
V
 
V
M
 
M
R
 
S
K
 
K
K
 
S
K
 
R
S
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
G
 
G
N
 
N
A
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
A
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
V
T
 
T
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
Y
T
 
V
S
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
S
P
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
N
 
Y
M
 
M

8jfhD Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-octanoyl-acp from helicobacter pylori in an inactive form that priors the acyl substrate delivery (see paper)
64% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 2:238/238 of 8jfhD

query
sites
8jfhD
M
 
M
K
 
Q
F
 
F
S
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
S
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
|
R
S
 
S
G
 
N
A
 
A
T
 
E
E
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
D
 
N
A
 
E
I
 
L
E
 
E
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
F
D
|
D
V
x
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
T
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
Q
C
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
T
 
V
N
 
R
D
|
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
H
S
 
H
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
x
N
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
L
K
 
K
V
 
V
M
 
M
R
 
S
K
 
K
K
 
S
K
 
R
S
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
G
 
G
N
 
N
A
x
M
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
A
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
-
T
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
E
I
 
T
K
 
K
G
 
A
S
 
D
F
 
Y
T
 
V
S
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
A
P
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
N
 
Y
M
 
M

8jfiC Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-hexanoyl-acp from helicobacter pylori (see paper)
64% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 2:236/236 of 8jfiC

query
sites
8jfiC
M
 
M
K
 
Q
F
 
F
S
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
S
Y
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
R
|
R
S
|
S
G
 
N
A
 
A
T
 
E
E
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
K
 
K
D
 
N
A
 
E
I
 
L
E
 
E
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
Y
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
K
F
 
F
D
|
D
V
x
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
S
A
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
T
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
Q
C
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
G
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
T
 
V
N
 
R
D
 
D
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
F
M
 
H
S
 
H
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
N
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
A
F
 
F
V
 
I
G
 
G
C
 
C
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
L
K
 
K
V
 
V
M
 
M
R
x
S
K
|
K
K
 
S
K
 
R
S
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
R
G
 
G
N
 
N
A
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
A
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
L
S
x
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
N
 
N
T
 
S
I
 
V
T
 
T
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
Y
T
 
V
S
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
N
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
A
P
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
N
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
F
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
D
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
M
A
 
A
V
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
S
 
N
E
 
P
E
 
E
A
 
S
F
 
I
V
 
E
D
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
T
 
A
I
 
I
V
 
T
D
 
D
C
 
E
D
 
F
G
 
G
E
 
G
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
E
E
 
E
D
 
E
F
 
W
M
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
I
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
L
K
 
R
V
 
G
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
Q
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
F
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
T
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
D
 
K
V
 
A
L
 
L
S
 
N
D
 
D
E
 
E
I
 
Q
K
 
R
G
 
T
S
 
A
F
 
T
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
P
H
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
46% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
K
 
K
F
 
M
S
 
T
G
 
-
K
 
K
N
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Y
 
E
G
 
G
L
 
Y
K
 
N
V
 
V
W
 
A
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
A
S
 
G
G
 
S
A
 
K
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
A
 
F
V
 
A
I
 
I
G
 
Q
F
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
D
A
 
E
F
 
V
V
 
K
D
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
T
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
S
C
 
Q
D
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
S
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
E
E
 
Q
D
 
E
F
 
W
M
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
K
S
 
G
C
 
V
F
 
F
V
 
N
G
 
C
C
 
I
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
M
 
T
K
 
P
V
 
Q
M
 
M
R
 
L
K
 
R
K
 
Q
K
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
F
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
L
K
 
K
G
 
E
S
 
Q
F
 
M
T
 
L
S
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
N
 
Q
P
 
D
S
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
K
S
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
I
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
L
A
 
M
V
x
L
I
x
N
G
x
V
F
 
T
D
 
D
V
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
N
I
 
V
K
 
R
T
 
A
I
 
E
V
 
F
D
 
-
C
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
E
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
T
T
 
L
S
 
A
K
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
T
P
 
P
S
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
47% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
K
 
N
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
N
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
L
A
 
M
V
 
L
I
x
N
G
x
V
F
 
T
D
 
D
V
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
A
I
 
E
V
 
F
D
 
-
C
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
E
D
 
E
F
 
W
M
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
K
 
N
F
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
D
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
M
A
 
A
V
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
S
 
N
E
 
P
E
 
E
A
 
S
F
 
I
V
 
E
D
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
T
 
A
I
 
I
V
 
T
D
 
D
C
 
E
D
 
F
G
 
G
E
 
G
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
E
E
 
E
D
 
E
F
 
W
M
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
N
 
E
A
 
T
N
|
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
I
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
L
K
 
R
V
 
G
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
Q
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
F
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
T
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
N
D
 
D
E
 
E
I
 
Q
K
 
R
G
 
T
S
 
A
F
 
T
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
P
H
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
N
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
L
A
 
M
V
 
L
I
x
N
G
x
V
F
 
T
D
 
D
V
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
A
I
 
E
V
 
F
D
 
-
C
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
E
D
x
E
F
 
W
M
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
|
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
47% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
x
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
N
E
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
L
A
 
M
V
x
L
I
x
N
G
x
V
F
 
T
D
 
D
V
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
A
I
 
E
V
 
F
D
 
-
C
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
E
D
 
E
F
 
W
M
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
K
 
S
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
V
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
 
T
G
 
S
A
 
E
T
 
N
E
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
N
I
 
I
K
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
G
A
 
L
A
 
M
V
 
L
I
 
N
G
 
V
F
 
T
D
 
D
V
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
N
I
 
I
K
 
R
T
 
A
I
 
E
V
 
F
D
 
-
C
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
E
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
S
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
R
V
 
A
M
|
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
C
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
I
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
G
P
 
A
S
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
x
A
S
|
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
F
 
L
S
 
T
G
 
A
K
 
Q
N
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
x
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Y
 
T
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
V
W
 
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
A
S
 
Q
G
 
S
A
 
S
T
 
T
E
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
A
A
 
E
I
 
I
E
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
A
I
 
V
G
 
Q
F
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
S
 
N
E
 
A
E
 
D
A
 
E
F
 
V
V
 
D
D
 
Q
A
 
L
I
 
I
K
 
K
T
 
T
I
 
T
V
 
L
D
 
D
C
 
K
D
 
F
G
 
S
E
 
R
L
 
I
S
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
T
L
 
L
A
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
W
M
 
Q
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
G
C
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
C
C
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
S
K
 
K
V
 
L
M
 
M
R
 
L
K
 
K
K
 
Q
K
 
K
S
 
S
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
I
 
V
V
 
A
G
 
G
E
 
M
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
T
F
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
E
V
 
N
L
 
L
S
x
N
D
 
A
E
 
E
I
 
P
K
 
I
G
 
L
S
 
Q
F
 
F
T
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
Q
P
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
T
T
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
T
D
 
D
H
 
P
-
 
A
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
F
K
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
V
M
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
45% identity, 98% coverage: 6:247/248 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
N
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Y
 
E
G
 
G
L
 
Y
K
 
N
V
 
V
W
 
A
I
 
V
N
|
N
Y
|
Y
R
x
A
S
x
G
G
x
S
A
 
K
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
I
E
 
K
S
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
A
 
F
V
 
A
I
 
I
G
 
Q
F
x
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
D
A
 
E
F
 
V
V
 
K
D
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
T
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
S
C
 
Q
D
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
S
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
E
E
 
Q
D
 
E
F
 
W
M
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
x
T
N
 
N
L
 
L
L
 
K
S
 
G
C
 
V
F
 
F
V
 
N
G
 
C
C
 
I
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
M
 
T
K
 
P
V
 
Q
M
 
M
R
 
L
K
 
R
K
 
Q
K
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
F
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
D
E
 
E
I
 
L
K
 
K
G
 
E
S
 
Q
F
 
M
T
 
L
S
 
T
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
N
 
Q
P
 
D
S
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
K
S
 
A
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
I
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
44% identity, 96% coverage: 8:245/248 of query aligns to 4:242/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
S
L
 
L
A
 
G
G
 
K
Y
 
A
G
 
G
L
 
C
K
 
K
V
 
V
W
 
L
I
 
V
N
|
N
Y
|
Y
R
x
A
S
x
R
G
x
S
A
 
A
T
 
K
E
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
V
K
 
S
D
 
K
A
 
Q
I
 
I
E
 
E
S
 
A
N
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
A
 
I
V
 
T
I
 
F
G
 
G
F
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
K
E
 
E
E
 
A
A
 
D
F
 
V
V
 
E
D
 
A
A
 
M
I
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
A
D
 
W
G
 
G
E
 
T
L
 
I
S
 
D
Y
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
T
L
 
L
A
 
L
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
K
E
 
S
D
 
Q
F
 
W
M
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
A
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
G
C
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
C
C
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
M
 
T
K
 
K
V
 
I
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
K
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
L
T
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
T
F
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
A
T
x
S
E
 
D
M
|
M
T
 
T
D
 
A
V
 
K
L
 
L
S
 
G
D
 
E
E
 
D
I
 
M
K
 
E
G
 
K
S
 
K
F
 
I
T
 
L
S
 
G
K
 
T
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
T
G
 
G
N
 
Q
P
 
P
S
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
L
T
 
V
A
 
E
F
 
F
L
 
L
-
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
P
H
 
A
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
L
 
F
K
 
T
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
43% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
I
V
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Y
 
E
G
 
G
L
 
A
K
 
N
V
 
I
W
 
F
I
 
F
N
|
N
Y
|
Y
R
x
N
S
x
G
G
x
S
A
 
P
T
 
E
E
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
T
K
 
A
D
 
K
A
 
L
I
 
V
E
 
A
S
 
E
N
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
A
 
E
V
 
A
I
 
M
G
 
K
F
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
S
 
I
E
 
A
E
 
E
A
 
D
F
 
V
V
 
D
D
 
A
A
 
F
I
 
F
K
 
K
T
 
Q
I
 
A
V
 
I
D
 
E
C
 
R
D
 
F
G
 
G
E
 
R
L
 
V
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
E
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
x
I
N
 
N
L
 
L
L
 
K
S
 
G
C
 
T
F
 
F
V
 
L
G
 
C
C
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
S
K
 
R
V
 
T
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
S
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
L
T
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
F
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
P
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
K
L
 
L
S
 
D
D
 
E
E
 
K
I
 
T
K
 
K
G
 
E
S
 
A
F
 
M
T
 
L
S
 
A
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
N
 
T
P
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
K
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
V
M
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
46% identity, 100% coverage: 1:248/248 of query aligns to 1:240/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
K
 
P
F
 
L
S
 
T
G
 
D
K
 
R
N
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
A
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
x
A
S
|
S
G
x
S
A
 
A
T
 
G
E
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
V
K
 
V
D
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
A
S
 
A
N
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
F
V
 
A
I
 
V
G
 
K
F
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
Q
E
 
E
E
 
S
A
 
E
F
 
V
V
 
E
D
 
A
A
 
L
I
 
F
K
 
A
T
 
A
I
 
V
V
 
I
D
 
E
C
 
R
D
 
W
G
 
G
E
 
R
L
 
L
S
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
T
L
 
L
A
 
L
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
R
E
 
D
D
 
D
F
 
W
M
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
L
N
 
D
A
x
L
N
 
N
L
 
L
L
 
G
S
 
G
C
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
C
C
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
M
 
A
K
 
K
V
 
I
M
 
M
R
 
L
K
 
K
K
 
Q
K
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
F
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
D
 
S
V
 
L
L
 
L
S
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
S
 
E
K
 
V
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
E
P
 
A
S
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
V
T
 
V
A
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
A
D
 
D
H
 
P
-
 
A
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
K
 
N
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
N
 
V
M
 
M
A
 
A

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
F
 
F
S
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
T
L
 
F
A
 
V
G
 
A
Y
 
R
G
 
G
L
 
A
K
 
K
V
 
V
W
 
-
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
E
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
S
D
 
G
A
 
Y
I
 
L
E
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
R
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
F
D
 
M
V
 
L
S
x
N
S
x
V
E
 
K
E
 
D
A
 
A
F
 
Q
-
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
S
I
 
V
K
 
L
T
 
A
I
 
S
V
 
I
D
 
R
C
 
A
D
 
E
-
 
F
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
M
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
E
S
 
D
V
 
I
I
 
L
N
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
T
S
 
S
C
 
V
F
 
F
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
M
K
 
C
V
 
A
M
 
M
R
 
M
K
 
K
K
 
K
K
 
R
S
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
M
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
Q
K
 
R
G
 
A
S
 
G
F
 
I
T
 
L
S
 
S
K
 
S
I
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
N
R
 
R
F
 
P
G
 
G
N
 
D
P
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
S
 
A
S
 
G
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:248/248 of query aligns to 8:254/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
M
 
M
K
 
S
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
E
L
 
L
A
 
G
G
 
R
Y
 
L
G
 
G
L
 
-
K
 
A
V
 
V
W
 
V
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
x
T
G
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
A
D
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
G
I
 
L
G
 
V
F
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
A
D
 
A
A
 
T
I
 
L
K
 
E
T
 
H
I
 
I
V
 
Q
D
 
Q
C
 
H
D
 
L
G
 
G
E
 
Q
L
 
P
S
 
L
Y
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
V
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
F
S
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
N
S
 
S
C
 
L
F
 
Y
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
L
K
 
R
V
 
G
M
 
M
R
 
T
K
 
K
K
 
A
K
 
R
S
 
W
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
A
T
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
E
A
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
G
S
 
S
S
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
|
T
D
 
R
V
 
E
L
 
L
S
 
P
D
 
E
E
 
A
I
 
Q
K
 
R
G
 
E
S
 
A
F
 
L
T
 
L
S
 
G
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
V
T
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
G
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
V
K
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M
A
 
S

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:248/248 of query aligns to 14:255/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
M
 
M
K
 
S
F
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
V
 
E
L
 
L
A
 
G
G
 
R
Y
 
L
G
 
G
L
 
-
K
 
A
V
 
V
W
 
V
I
 
I
N
 
G
Y
 
T
R
 
A
S
 
T
G
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
A
D
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
K
S
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
G
A
 
A
V
 
G
I
 
L
G
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
E
 
E
A
 
S
F
 
V
V
 
A
D
 
A
A
 
T
I
 
L
K
 
E
T
 
H
I
 
I
V
 
Q
D
 
Q
C
 
H
D
 
L
G
 
G
E
 
Q
L
 
P
S
 
L
Y
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
R
D
 
D
K
 
N
L
 
L
A
 
L
L
 
V
R
 
R
M
 
M
K
 
K
S
 
D
E
 
D
D
 
E
F
 
W
M
 
F
S
 
D
V
 
V
I
x
V
N
 
N
A
 
T
N
 
N
L
|
L
L
 
N
S
 
S
C
 
L
F
 
Y
V
 
R
G
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
M
 
L
K
 
R
V
 
G
M
 
M
R
 
T
K
 
K
K
 
A
K
 
R
S
 
W
G
 
G
S
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
-
T
 
-
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
|
G
V
 
L
I
 
E
A
x
G
M
x
F
T
 
T
K
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
A
 
V
A
 
G
S
 
S
S
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
T
Y
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
D
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
D
 
R
V
 
E
L
 
A
S
 
Q
D
 
R
E
 
E
I
 
-
K
 
-
G
 
-
S
 
A
F
 
L
T
 
L
S
 
G
K
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
Q
P
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
V
T
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
G
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
V
K
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
N
 
Y
M
 
M
A
 
S

Query Sequence

>WP_011373231.1 NCBI__GCF_000012965.1:WP_011373231.1
MKFSGKNVLVTGSSRGIGAEIAKVLAGYGLKVWINYRSGATEADAIKDAIESNGGRAAVI
GFDVSSEEAFVDAIKTIVDCDGELSYLVNNAGITNDKLALRMKSEDFMSVINANLLSCFV
GCREAMKVMRKKKSGSVVNIASIVGETGNAGQTNYSASKGGVIAMTKSFALEAASSGIRY
NTITPGFIATEMTDVLSDEIKGSFTSKIPMGRFGNPSEIAEATAFLLSDHSSYITGETLK
VNGGMNMA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory