SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382506.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382506.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
63% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 5:285/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
x
D
G
|
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
D
V
 
V
C
 
V
Q
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
L
L
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
F
R
|
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
A
 
R
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
A
 
I
T
 
K
S
 
N
Q
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
63% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 4:284/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
D
V
 
V
C
 
V
Q
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
|
R
G
|
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
A
 
R
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
A
 
I
T
 
K
S
 
N
Q
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
63% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 4:284/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
D
V
 
V
C
 
V
Q
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
R
 
V
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
A
 
R
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
A
 
I
T
 
K
S
 
N
Q
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5ifyA Crystal structure of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from burkholderia vietnamiensis in complex with 2 -deoxyuridine-5'- monophosphate and 2'-deoxy-thymidine-b-l-rhamnose
61% identity, 97% coverage: 7:292/296 of query aligns to 3:289/293 of 5ifyA

query
sites
5ifyA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
I
T
 
T
L
 
H
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
S
L
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
M
N
 
N
L
 
I
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
T
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
R
E
 
D
F
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
N
A
 
E
R
 
P
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
I
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
x
D
L
 
L
P
 
A
P
 
K
L
 
Q
V
 
L
Q
 
E
Q
 
R
A
 
A
-
 
S
A
 
A
E
 
K
G
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
Q
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
R
S
 
E
G
 
F
K
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
A
A
 
K
P
 
P
K
 
R
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
R
D
 
Q
V
 
V
C
 
C
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
D
L
 
I
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
D
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
Q
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
M
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
R
G
 
N
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
A
 
L
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
Q
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
R
G
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
T
H
 
H

4ho9A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with udp-galactose and utp
62% identity, 96% coverage: 7:289/296 of query aligns to 2:285/294 of 4ho9A

query
sites
4ho9A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
S
R
 
E
W
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
|
Q
P
 
S
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
D
A
 
D
R
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
|
G
H
|
H
G
|
G
L
 
F
P
x
T
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
-
 
R
G
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
H
 
Y
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
R
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
G
|
G
I
 
F
S
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
G
 
S
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
S
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
L
E
 
E
E
 
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
I
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
K
S
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
M
G
 
N
L
 
L

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
61% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 5:285/292 of P26393

query
sites
P26393
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
S
V
 
V
C
 
V
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
x
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
G
P
 
P
I
 
L
A
 
S
T
 
K
S
 
N
Q
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

4ho4A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with thymidine and glucose-1-phosphate
62% identity, 96% coverage: 7:289/296 of query aligns to 2:285/289 of 4ho4A

query
sites
4ho4A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
S
R
 
E
W
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
S
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
D
A
 
D
R
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
|
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
G
L
 
F
P
 
T
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
-
 
R
G
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
H
 
Y
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
|
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
R
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
F
S
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
G
 
S
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
S
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
I
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
K
S
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
M
G
 
N
L
 
L

4ho6A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with udp-glucose and utp
62% identity, 96% coverage: 7:289/296 of query aligns to 2:285/288 of 4ho6A

query
sites
4ho6A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
S
R
 
E
W
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
|
Q
P
 
S
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
D
A
 
D
R
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
|
G
L
 
F
P
x
T
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
-
 
R
G
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
H
 
Y
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
R
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
F
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
G
 
S
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
S
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
L
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
I
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
K
S
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
M
G
 
N
L
 
L

4ho5A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with tdp-glucose
62% identity, 96% coverage: 7:289/296 of query aligns to 2:285/288 of 4ho5A

query
sites
4ho5A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
x
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
S
R
 
E
W
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
|
Q
P
 
S
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
D
A
 
D
R
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
|
G
L
x
F
P
x
T
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
-
 
R
G
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
H
 
Y
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
|
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
R
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
G
|
G
I
 
F
S
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
G
 
S
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
S
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
L
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
I
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
K
S
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
M
G
 
N
L
 
L

4ho3A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with thymidine triphosphate
62% identity, 96% coverage: 7:289/296 of query aligns to 2:285/288 of 4ho3A

query
sites
4ho3A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
K
 
K
H
x
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
S
R
 
E
W
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
|
Q
P
 
S
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
D
A
 
D
R
 
N
V
 
V
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
|
G
L
x
F
P
x
T
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
-
 
R
G
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
F
A
 
G
H
 
Y
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
E
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
R
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
|
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
K
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
L
G
 
G
G
 
E
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
F
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
G
 
S
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
L
 
R
Q
 
Q
G
 
S
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
L
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
S
R
 
R
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
I
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
M
T
 
K
S
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
M
G
 
N
L
 
L

1iinA Thymidylyltransferase complexed with udp-glucose (see paper)
60% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 5:285/289 of 1iinA

query
sites
1iinA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
|
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
Q
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
x
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
A
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
S
V
 
V
C
 
V
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
G
P
 
P
I
 
L
A
 
S
T
 
K
S
 
N
Q
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

1iimA Thymidylyltransferase complexed with ttp (see paper)
60% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 5:285/289 of 1iimA

query
sites
1iimA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
 
Q
H
x
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
|
Q
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
|
G
L
|
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
G
 
D
L
 
L
P
|
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
S
V
 
V
C
 
V
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
x
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
G
P
 
P
I
 
L
A
 
S
T
 
K
S
 
N
Q
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

3pkpA Q83s variant of s. Enterica rmla with datp (see paper)
60% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 5:285/290 of 3pkpA

query
sites
3pkpA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
|
K
H
x
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
x
S
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
|
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
S
V
 
V
C
 
V
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
G
P
 
P
I
 
L
A
 
S
T
 
K
S
 
N
Q
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

3pkpB Q83s variant of s. Enterica rmla with datp (see paper)
60% identity, 95% coverage: 7:286/296 of query aligns to 4:284/289 of 3pkpB

query
sites
3pkpB
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
V
T
 
T
L
 
M
V
 
A
T
 
V
N
 
S
K
|
K
H
x
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
V
Q
x
S
P
 
P
K
 
S
P
|
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
D
R
 
D
V
 
C
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
|
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
K
L
 
L
V
 
M
Q
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
N
E
 
K
G
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
N
D
 
S
V
 
V
C
 
V
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
I
N
 
N
S
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
|
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
E
A
 
A
G
 
S
Q
 
N
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
E
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
M
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
A
L
 
G
P
 
P
I
 
L
A
 
S
T
 
K
S
 
N
Q
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 10:297/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

4b5bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 1:288/293 of 4b5bA

query
sites
4b5bA
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
x
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

4b4gA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 1:288/293 of 4b4gA

query
sites
4b4gA
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

4b42A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 1:288/293 of 4b42A

query
sites
4b42A
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
x
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

4b3uA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 7:294/299 of 4b3uA

query
sites
4b3uA
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
x
I
A
 
A
Y
 
Y
R
|
R
M
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

4asyA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
62% identity, 97% coverage: 4:290/296 of query aligns to 1:288/293 of 4asyA

query
sites
4asyA
L
 
M
P
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
A
T
 
I
N
 
S
K
 
K
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
x
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
N
W
 
W
G
 
G
I
 
L
N
 
D
L
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
P
 
P
K
 
S
P
 
P
A
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
A
 
D
R
 
L
V
 
S
G
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
G
 
D
L
 
F
P
 
H
P
 
E
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
Q
 
S
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
-
 
R
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
Y
T
 
H
V
 
V
R
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
Q
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Q
D
 
Q
V
 
V
C
 
V
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
S
 
T
H
 
D
L
 
V
N
 
N
S
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
S
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
L
T
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
I
H
 
A
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
S
 
N
L
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
K
V
|
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
A
L
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
K
S
 
N
Q
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
L
 
L
L
 
L

Query Sequence

>WP_011382506.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382506.1
MTRLPTKGIVLAGGTGTRLHPLTLVTNKHLLPVFDKPMIYYPLTTLMLGGIRDILIISTP
DDLPRFERLLGDGRRWGINLSYAEQPKPAGLPQAFLIGEEFIGGARVGLMLGDNIFYGHG
LPPLVQQAAEGTGATVFAHTVRDPERFGVVTFDASGKAISIEEKPKAPKSNWAVTGLYFY
DADVCQVAATLKPSARGELEISHLNSLYLERGGLSVELLGRGISWLDVGTPEALATAGQF
VHTIQSLQGTGVACPEEVAYRMGFIDRQALADLILPIATSQYGRYLQGLLDHVGAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory