SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382583.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382583.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 29:285/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 27:283/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
H
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
 
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 31:287/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
 
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
|
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 30:286/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
H
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
 
P
F
 
L
D
x
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 31:287/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
C
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 30:286/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
C
x
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
|
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
I
 
P
R
 
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 30:286/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 29:285/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
|
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 35:291/533 of O43175

query
sites
O43175
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
x
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
I
 
P
R
 
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
 
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
G
x
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
37% identity, 80% coverage: 40:293/318 of query aligns to 30:286/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
K
D
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Q
G
 
D
H
 
C
D
 
E
K
 
G
-
 
L
A
 
I
V
 
V
T
 
R
A
 
S
L
 
A
E
 
T
K
 
K
L
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
 
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
38% identity, 71% coverage: 67:293/318 of query aligns to 49:277/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
V
 
V
L
 
I
S
 
N
R
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
K
G
 
G
K
 
I
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
 
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
|
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
|
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 73% coverage: 63:293/318 of query aligns to 54:286/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
L
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
x
R
Y
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
A
L
 
R
G
 
G
K
 
V
R
 
L
L
 
V
G
 
V
W
 
N
T
 
A
G
 
P
G
 
T
V
 
S
N
|
N
R
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
H
V
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
A
G
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
R
D
 
E
G
 
H
G
 
T
W
 
W
R
 
K
Q
 
R
-
 
S
-
 
S
L
 
F
M
 
S
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
I
S
 
F
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
D
 
L
L
 
V
S
 
A
R
 
Q
L
 
R
L
 
I
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
C
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
I
 
P
R
 
Y
D
 
V
F
 
S
P
 
P
E
 
A
F
 
R
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
K
 
L
M
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
D
P
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
F
 
K
D
 
T
A
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
R
 
K
S
 
P
D
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
A
V
 
D
M
 
A
L
 
I
A
 
T
T
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
E
 
T
D
 
D
R
 
S
A
 
P
L
 
L
I
 
F
E
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
F
 
V
L
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
G
x
A
S
 
S
A
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 73% coverage: 63:293/318 of query aligns to 53:285/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
L
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
A
L
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
R
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
M
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
A
S
 
T
R
 
A
L
 
R
G
 
G
K
 
V
R
 
L
L
 
V
G
 
V
W
 
N
T
 
A
G
 
P
G
 
T
V
 
S
N
|
N
R
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
H
V
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
A
G
 
A
N
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
L
R
 
R
D
 
E
G
 
H
G
 
T
W
 
W
R
 
K
Q
 
R
-
 
S
-
 
S
L
 
F
M
 
S
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
I
S
 
F
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
D
 
L
L
 
V
S
 
A
R
 
Q
L
 
R
L
 
I
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
C
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
I
 
P
R
 
Y
D
 
V
F
 
S
P
 
P
E
 
A
F
 
R
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
K
 
L
M
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
D
P
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
L
 
L
P
 
P
F
 
K
D
 
T
A
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
I
 
L
L
 
I
S
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
M
 
T
R
 
K
S
 
P
D
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
A
V
 
D
M
 
A
L
 
I
A
 
T
T
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
E
 
T
D
 
D
R
 
S
A
 
P
L
 
L
I
 
F
E
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
F
 
V
L
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 77% coverage: 54:298/318 of query aligns to 47:301/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
D
 
D
K
 
A
A
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
M
L
|
L
-
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
E
V
 
V
L
 
F
S
 
E
R
 
N
L
 
A
P
 
P
D
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
N
Y
|
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
M
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
E
A
 
E
M
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
R
G
 
G
K
 
I
R
 
Y
L
 
V
G
 
T
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
R
 
T
R
 
N
S
 
A
V
x
T
S
 
A
E
 
D
L
 
H
V
 
A
I
 
F
A
 
A
F
 
L
A
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
G
 
G
N
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
S
G
 
G
G
 
E
W
 
W
R
 
K
Q
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
L
 
F
M
 
L
G
 
G
R
 
Y
Q
 
E
L
 
L
S
 
Y
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
x
F
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
D
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
R
L
 
R
L
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
C
 
M
R
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
H
 
Y
D
x
S
I
x
R
R
 
T
D
 
R
F
 
K
P
 
S
E
 
Q
F
 
A
Y
 
E
A
 
K
A
 
E
T
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
K
 
Y
M
 
R
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
L
x
V
P
|
P
F
 
L
D
 
T
A
 
K
S
 
E
T
|
T
R
 
M
N
 
Y
I
 
M
L
 
I
S
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
K
S
 
P
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
I
V
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
E
 
Y
D
 
N
R
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
E
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
F
 
V
L
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
G
 
S
S
 
A
A
 
T
E
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
R
L
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
A

7cvpA The crystal structure of human phgdh from biortus.
37% identity, 65% coverage: 88:293/318 of query aligns to 33:240/254 of 7cvpA

query
sites
7cvpA
D
 
D
L
 
V
A
 
I
A
 
V
M
 
V
S
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
K
 
T
R
 
L
L
 
V
G
 
M
W
 
N
T
 
T
G
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
C
 
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

7va1A Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with gdd-04-35
38% identity, 59% coverage: 106:293/318 of query aligns to 1:190/193 of 7va1A

query
sites
7va1A
N
 
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
C
 
L
G
|
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
x
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
I
x
P
R
x
I
D
x
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
|
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

5ofwA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 3-chloro-4-fluorobenzamide (see paper)
38% identity, 59% coverage: 106:293/318 of query aligns to 3:192/195 of 5ofwA

query
sites
5ofwA
N
|
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
 
D
I
x
P
R
 
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
 
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
I
x
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
T
T
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
P
E
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
F
 
V
L
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A

5ofvA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 5-fluoro-2-methylbenzoic acid (see paper)
38% identity, 59% coverage: 106:293/318 of query aligns to 3:192/195 of 5ofvA

query
sites
5ofvA
N
|
N
R
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
I
 
C
A
 
G
F
 
M
A
 
I
I
 
M
A
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
G
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
S
I
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
R
 
K
Q
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
N
E
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
D
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
T
L
 
R
L
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
C
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
 
D
I
x
P
R
 
I
D
 
I
F
 
S
P
 
P
E
 
E
F
 
V
Y
 
S
A
 
A
A
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
K
 
Q
M
 
L
D
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
E
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
L
x
T
P
 
P
F
 
L
D
 
L
A
 
P
S
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
M
 
C
R
 
K
S
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
V
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
&n