SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382621.1 AMB_RS00885 2,3-epoxybenzoyl-CoA dihydrolase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6yswA E. Coli anaerobic trifunctional enzyme subunit-alpha in complex with coenzyme a
32% identity, 39% coverage: 22:236/550 of query aligns to 13:206/707 of 6yswA

query
sites
6yswA
V
 
I
A
 
A
T
 
V
L
 
I
T
 
T
M
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
G
Y
x
E
E
 
-
L
 
-
K
 
K
M
|
M
N
 
N
S
 
T
Y
 
L
D
 
K
L
 
A
G
 
E
V
 
F
D
 
A
I
 
S
E
 
Q
L
 
V
Y
 
R
D
 
A
A
 
I
V
 
I
Q
 
K
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
F
 
-
E
 
E
H
 
N
P
 
K
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
F
A
 
V
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
P
K
 
D
I
 
N
F
 
F
C
 
I
A
 
A
G
 
G
A
|
A
N
x
D
I
|
I
K
 
N
M
 
M
L
x
I
G
 
G
V
 
-
S
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
N
 
-
F
 
N
C
 
C
K
 
K
F
 
T
T
 
A
N
 
Q
E
 
E
T
 
A
R
 
E
N
 
A
S
 
L
I
x
A
E
 
R
D
 
Q
A
 
G
S
x
Q
E
 
Q
N
 
L
S
 
M
R
 
A
Q
 
E
T
 
I
Y
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
L
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
H
G
 
G
T
 
A
A
 
C
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
G
I
 
R
M
 
V
M
 
C
V
 
T
D
 
D
D
 
D
G
 
P
N
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
Q
L
 
-
L
|
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
|
G
T
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
Q
R
 
R
V
 
L
V
 
P
D
 
R
K
 
L
R
 
I
K
 
G
V
 
V
R
 
S
R
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
M
I
 
I
F
 
L
C
 
T
S
 
G
I
 
K
E
 
Q
E
 
-
G
 
-
V
 
L
K
 
R
G
 
A
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
K
W
 
L
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
D
V
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
H
S
 
S
A
 
I
F
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
-
A
 
A
R
 
K
S
 
K
D
 
E
R
 
R
P
 
P
T
 
S
A
 
S

Sites not aligning to the query:

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
31% identity, 35% coverage: 42:231/550 of query aligns to 24:202/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
K
|
K
M
x
L
N
 
N
S
 
A
Y
 
L
D
 
N
L
 
A
G
 
K
V
 
L
D
 
L
I
 
E
E
 
E
L
 
L
Y
 
D
D
 
R
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
R
 
Q
L
 
A
R
 
E
F
 
-
E
 
S
H
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
-
V
 
V
V
 
I
M
 
I
A
 
I
S
 
T
A
 
G
N
 
K
P
 
G
K
 
K
I
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
N
x
D
I
|
I
K
 
T
M
 
Q
L
x
F
G
 
N
V
 
Q
S
 
L
S
 
T
H
 
P
G
 
A
H
 
E
K
 
A
V
 
W
N
 
K
F
 
F
C
x
S
K
 
K
F
 
K
T
 
G
N
x
R
E
 
E
T
 
I
R
 
M
N
 
D
S
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
L
S
 
S
E
 
K
N
 
P
S
 
T
R
 
-
Q
 
-
T
 
-
Y
 
-
L
 
I
C
 
A
A
 
M
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
D
Y
 
I
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
E
D
 
E
G
 
A
N
 
Q
T
 
-
A
 
-
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
I
P
 
N
L
 
-
L
 
L
A
 
G
V
x
I
L
 
Y
P
|
P
G
|
G
T
 
Y
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
I
D
 
G
K
 
K
R
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
G
R
 
R
D
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
M
I
 
M
F
 
M
C
 
T
S
 
G
I
 
-
E
 
-
E
 
D
G
x
R
V
 
I
K
 
P
G
 
G
K
 
K
R
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
K
W
 
Y
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
N
E
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
L
S
 
A
A
 
N
F
 
L
K
 
E
A
 
Q
A
 
E
V
 
T
A
 
R
K
 
K
K
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
K
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P40939 Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial; 78 kDa gastrin-binding protein; Monolysocardiolipin acyltransferase; TP-alpha; EC 2.3.1.-; EC 4.2.1.17; EC 1.1.1.211 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
30% identity, 26% coverage: 67:211/550 of query aligns to 84:222/763 of P40939

query
sites
P40939
E
 
Q
V
 
I
R
 
R
A
 
S
V
 
A
V
 
V
M
 
L
A
 
I
S
 
S
A
 
S
N
 
K
P
 
P
K
 
G
I
 
C
F
 
F
C
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
I
K
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
A
V
 
A
S
 
C
S
 
K
H
 
T
G
 
L
H
 
Q
K
 
E
V
 
V
N
 
T
F
 
-
C
 
-
K
 
Q
F
 
L
T
 
S
N
 
Q
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
N
 
R
S
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
L
S
 
-
E
 
E
N
 
K
S
 
S
R
 
T
Q
 
K
T
 
P
Y
 
I
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
C
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
S
T
 
C
D
 
Q
Y
 
Y
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
T
D
 
K
D
 
D
G
 
R
N
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
S
 
G
L
 
T
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
G
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
Q
R
 
R
V
 
L
V
 
P
D
 
K
K
 
M
R
 
V
K
 
G
V
 
V
R
 
P
R
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
M
I
 
M
F
 
L
C
 
T
S
 
G
I
 
-
E
 
-
E
 
R
G
 
S
V
 
I
K
 
R
G
 
A
K
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
K
E
 
K
W
 
M
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
31% identity, 30% coverage: 13:175/550 of query aligns to 6:150/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
H
 
E
W
 
F
K
 
K
L
 
V
A
 
D
F
 
A
D
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
T
 
I
L
 
W
T
 
T
M
 
I
D
 
D
V
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Y
 
G
E
 
E
L
x
S
K
x
R
M
x
R
N
 
N
S
x
A
Y
 
I
D
 
S
L
 
R
G
 
A
V
 
M
D
 
L
I
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
G
D
 
E
A
 
L
V
 
V
Q
 
T
R
 
R
L
 
V
R
 
S
F
 
S
E
 
S
H
 
R
P
 
-
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
M
 
I
A
 
T
S
 
G
A
 
A
N
 
G
P
 
D
K
 
K
I
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
N
x
D
I
x
L
K
|
K
M
 
E
L
x
R
G
 
A
V
 
T
S
 
M
S
 
A
H
 
E
G
 
D
H
 
E
K
 
V
V
 
R
N
 
A
F
 
F
C
x
L
K
 
D
F
 
G
T
 
L
N
x
R
E
 
R
T
 
T
R
 
F
N
 
R
S
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
N
 
K
S
 
S
R
 
D
Q
 
C
T
 
V
Y
 
F
L
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
x
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
Y
 
T
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
D
Y
 
-
I
 
-
M
 
L
M
 
R
V
 
V
D
 
A
D
 
A
G
 
P
N
 
A
T
 
A
A
 
E
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
x
T
E
|
E
V
 
V
P
 
K
L
 
-
L
|
L
A
 
G
V
x
I
L
 
I
P
|
P
G
|
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
Q
R
 
R
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8oqsB Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-83
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 17:206/735 of 8oqsB

query
sites
8oqsB
P
|
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
x
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
x
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
x
G
N
x
D
I
 
V
K
 
K
M
x
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
x
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
x
D
V
 
A
N
 
G
F
x
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
|
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
|
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqrA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-80
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/728 of 8oqrA

query
sites
8oqrA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
x
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
x
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
x
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
x
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
|
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
x
L
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4b3iA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fatty acid beta-oxidation complex with coenzymea bound at the hydratase active sites (see paper)
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 13:202/731 of 4b3iA

query
sites
4b3iA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
x
T
A
 
N
P
x
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
|
A
G
 
G
A
x
G
N
x
D
I
x
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
|
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
x
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
|
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8pf8A Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-72
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/729 of 8pf8A

query
sites
8pf8A
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
x
M
Y
x
N
E
|
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
x
G
N
x
D
I
 
V
K
 
K
M
x
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
x
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
x
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
x
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
x
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
x
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
x
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
x
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oquA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-92
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 12:201/730 of 8oquA

query
sites
8oquA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
x
M
Y
x
N
E
|
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
x
G
N
x
D
I
x
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
x
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
x
L
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

8oqtA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-91
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/729 of 8oqtA

query
sites
8oqtA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
|
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
x
G
N
x
D
I
x
V
K
 
K
M
 
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
x
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
|
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqnA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-53
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/729 of 8oqnA

query
sites
8oqnA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
x
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
x
Q
R
 
N
D
 
A
L
x
F
A
x
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
x
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8opvA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with resveratrol (fragment-b-h11)
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/729 of 8opvA

query
sites
8opvA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
x
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
|
A
G
|
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
x
T
L
|
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
x
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8opuA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with sulfamethoxazole (fragment-b-e1)
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 11:200/729 of 8opuA

query
sites
8opuA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqlA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 10:199/728 of 8oqlA

query
sites
8oqlA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
x
V
G
 
M
Y
x
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
 
G
N
x
D
I
x
V
K
|
K
M
 
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
|
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
|
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
x
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqoA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 10:199/727 of 8oqoA

query
sites
8oqoA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
x
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqvA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-109
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 9:198/726 of 8oqvA

query
sites
8oqvA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
|
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
|
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
x
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
x
V
K
 
F
F
 
N
T
|
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
|
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
x
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqqA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-79
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 5:194/723 of 8oqqA

query
sites
8oqqA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
x
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

8oqpA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-76
30% identity, 37% coverage: 8:211/550 of query aligns to 5:194/723 of 8oqpA

query
sites
8oqpA
P
 
P
E
 
D
S
 
N
Y
 
T
R
 
I
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
x
G
T
x
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
|
A
N
x
K
P
 
-
K
|
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
P
 
T
L
|
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

6iunB Crystal structure of enoyl-coa hydratase (ech) from ralstonia eutropha h16 in complex with NAD
30% identity, 36% coverage: 22:220/550 of query aligns to 10:182/692 of 6iunB

query
sites
6iunB
V
 
V
A
 
A
T
 
V
L
 
I
T
 
T
M
 
L
D
 
D
V
 
N
D
 
P
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
G
L
 
L
A
 
-
P
 
-
G
 
G
Y
 
H
E
 
S
L
 
T
K
 
R
M
 
L
N
 
G
S
 
I
Y
 
V
D
 
E
L
 
-
G
 
G
V
 
M
D
 
T
I
 
R
E
 
A
L
 
L
Y
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
A
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
F
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
I
A
 
T
S
 
G
A
 
A
N
 
G
P
 
-
K
 
K
I
 
A
F
 
F
C
 
S
A
 
G
G
 
G
A
|
A
N
 
D
I
 
I
K
 
R
M
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
K
 
E
V
x
F
N
 
N
F
 
T
C
 
P
K
 
K
F
 
A
T
 
M
N
 
Q
E
|
E
-
 
P
T
 
T
R
 
L
N
x
H
S
 
S
I
 
V
E
 
I
D
 
R
A
 
V
S
 
L
E
 
E
N
 
G
S
 
S
R
 
S
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
H
G
 
S
T
 
V
A
 
A
A
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
Y
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
T
 
C
D
 
N
Y
 
Y
I
 
-
M
 
-
M
 
R
V
 
V
D
 
A
D
 
S
G
 
K
N
 
G
T
 
A
A
 
Q
V
 
I
S
 
A
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
P
 
K
L
 
-
L
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
|
G
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
Q
R
 
R
V
 
L
V
 
-
D
 
-
K
 
P
R
 
R
K
 
V
V
 
I
R
 
G
R
 
L
D
 
E
L
 
A
A
 
A
D
 
A
I
 
N
F
 
M
C
 
I
S
 
V
I
 
S
E
 
G
E
 
T
G
 
P
V
 
V
K
 
L
G
 
S
K
 
E
R
 
K
A
 
F
V
 
A
E
 
G
W
 
T
R
 
K
L
 
L
V
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
V
P
 
D
S
 
G
S
 
D
A
 
V
F
 
L
K
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7o4uA Structure of the alpha subunit of mycobacterium tuberculosis beta- oxidation trifunctional enzyme in complex with oxidized nicotinamide adenine dinucleotide (see paper)
30% identity, 36% coverage: 13:211/550 of query aligns to 5:189/711 of 7o4uA

query
sites
7o4uA
H
 
Q
W
 
W
K
 
D
L
 
K
A
 
D
F
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
-
V
 
I
A
 
V
T
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
D
V
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
S
S
 
G
T
 
S
L
 
T
A
 
N
P
 
V
G
 
M
Y
 
N
E
 
E
L
 
A
K
 
Y
M
 
I
N
 
E
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
M
Y
 
G
D
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
V
F
 
A
E
 
E
H
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
I
R
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
N
 
K
P
 
-
K
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
G
N
 
D
I
 
V
K
 
K
M
 
T
L
 
M
G
 
-
V
 
I
S
 
Q
S
 
A
H
 
R
G
 
P
H
 
E
K
 
D
V
 
A
N
 
G
F
 
D
C
 
V
K
 
F
F
 
N
T
 
T
N
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
I
N
 
K
S
 
R
I
 
Q
E
 
L
D
 
R
A
 
T
S
 
L
E
 
E
N
 
T
S
 
L
R
 
G
Q
 
K
T
 
P
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
C
D
 
H
Y
 
H
I
 
R
M
 
I
M
 
A
V
 
A
D
 
D
D
 
V
G
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
Q
V
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
 
T
L
 
L
L
 
G
A
 
L
V
 
L
L
 
P
P
 
-
G
 
G
T
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
T
R
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
R
K
 
M
R
 
F
K
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
N
D
 
A
L
 
F
A
 
V
D
 
S
I
 
V
F
 
L
C
 
A
S
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
K
 
R
G
 
F
K
 
K
-
 
P
-
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
K
E
 
E
W
 
I
R
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011382621.1 AMB_RS00885 2,3-epoxybenzoyl-CoA dihydrolase
MINFQTSPESYRHWKLAFDGPVATLTMDVDPASTLAPGYELKMNSYDLGVDIELYDAVQR
LRFEHPEVRAVVMASANPKIFCAGANIKMLGVSSHGHKVNFCKFTNETRNSIEDASENSR
QTYLCAVTGTAAGGGYELALATDYIMMVDDGNTAVSLPEVPLLAVLPGTGGLTRVVDKRK
VRRDLADIFCSIEEGVKGKRAVEWRLVDEVIPSSAFKAAVAKKAAELAARSDRPTAEKGV
VLSQVSRVIGTDSVTYPHIDIAFDRATRAANITIKGPKAACPADLAGIKAQGVDFYPLAL
ARELDDAILHLRANETTIATWVFRTQGDADLVMGYDAALQTFGASDWLVREILLYWKRTM
KRLDVTSRTLFALVEPGSCFAGFVAEILFAVDRSFMLDGTFEDNPAPAAAIRLSALNFDG
LPMGNGISRLATRFLGEPDSVGKARDTIGKDLDAAACAKLGLVTGTPDDIDWEDEIRLMI
EERASFSPDSLTGMEANLRFAGPETMETKIFGRLTAWQNWIFQRPNAVGDQGALKLYGTG
KRAAYNQERV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory