SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382728.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382728.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3m4rA Structure of the n-terminal class ii aldolase domain of a conserved protein from thermoplasma acidophilum
40% identity, 31% coverage: 15:225/679 of query aligns to 4:210/213 of 3m4rA

query
sites
3m4rA
T
 
N
R
 
R
Y
 
W
A
 
A
P
 
E
E
 
T
G
 
K
V
 
F
N
 
D
R
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
D
L
 
E
R
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
G
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
H
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
C
 
V
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
E
T
 
R
D
 
D
L
 
H
L
 
A
G
 
G
E
 
R
T
 
I
V
 
I
E
 
S
V
 
V
L
 
L
C
 
R
V
 
V
K
 
K
G
 
N
S
 
S
G
 
G
W
 
S
D
 
N
M
 
L
G
 
G
D
 
T
I
 
I
E
 
D
P
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
F
P
 
T
A
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
M
A
 
D
P
 
D
L
 
A
L
 
L
K
 
A
L
 
A
R
 
A
R
 
K
L
 
I
D
 
D
S
 
K
L
 
M
S
 
T
D
 
D
E
 
E
D
 
A
M
 
M
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
K
G
 
K
N
 
S
L
 
M
M
 
V
N
 
N
S
 
P
A
 
S
S
 
E
P
 
P
N
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
|
E
T
 
T
L
 
F
L
 
L
H
 
H
G
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
K
 
K
F
 
F
I
 
V
D
 
M
H
|
H
T
 
S
H
|
H
S
 
A
T
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
I
V
 
T
D
 
N
Q
 
T
P
 
D
D
 
L
G
 
P
E
 
S
A
 
D
L
 
Q
A
 
I
R
 
A
E
 
K
V
 
I
Y
 
L
G
 
G
T
 
N
R
 
V
M
 
V
G
 
-
Y
 
V
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
M
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
V
A
 
M
E
 
N
I
 
C
Y
 
F
E
 
K
Q
 
K
D
 
-
P
 
-
T
 
G
V
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
I
I
 
V
L
 
L
V
 
R
K
 
K
H
|
H
G
 
G
I
 
L
F
 
L
T
 
T
F
 
F
A
 
G
D
 
D
N
 
T
A
 
G
R
 
K
T
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
D
L
 
R
M
 
H
I
 
I
E
 
N
M
 
I
V
 
V
T
 
S
L
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
N

6zyzA Structure of the borneol dehydrogenases of salvia rosmarinus with NAD+ (see paper)
35% identity, 36% coverage: 426:672/679 of query aligns to 1:245/259 of 6zyzA

query
sites
6zyzA
K
 
R
P
 
R
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
L
F
 
F
A
 
H
K
 
D
E
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
x
Q
A
 
D
D
 
D
A
 
L
A
 
G
A
 
Q
K
 
T
A
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
R
C
 
L
G
 
G
G
 
R
K
 
N
A
 
I
L
 
S
G
 
Y
I
 
T
A
 
H
C
|
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
D
S
 
Q
V
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
A
V
 
A
A
 
V
E
 
A
R
 
K
F
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
F
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
A
x
V
-
 
E
W
 
G
Q
x
P
G
x
N
A
x
S
V
 
I
G
 
F
E
x
D
V
 
V
D
 
D
D
 
K
S
 
D
T
 
E
L
 
L
R
 
E
A
 
R
S
 
L
F
 
M
E
 
G
L
x
I
N
 
N
F
 
L
F
 
V
G
 
G
H
 
A
Q
 
F
A
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
K
N
 
H
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
M
K
 
-
A
 
V
Q
 
P
G
 
A
T
 
K
G
 
K
G
 
G
A
 
C
L
 
I
L
 
I
F
 
F
N
x
T
A
 
A
S
 
S
K
 
A
Q
 
C
A
 
T
V
 
E
N
 
I
P
 
A
G
 
G
K
 
I
N
 
A
F
 
G
G
 
H
P
 
S
Y
|
Y
G
 
T
L
 
A
P
 
S
K
|
K
A
 
Y
A
 
G
T
 
I
L
 
V
F
 
G
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
S
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
D
 
E
H
 
L
G
 
G
K
 
S
D
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
V
N
 
S
A
 
P
D
 
F
R
 
G
I
x
V
R
 
L
S
 
T
G
 
G
L
 
I
L
 
V
T
 
P
D
 
D
D
 
D
M
 
E
I
 
-
K
 
A
S
 
S
R
 
K
S
 
L
S
 
M
A
 
F
R
 
E
G
 
G
L
 
I
S
 
M
E
 
S
Q
 
K
D
 
V
Y
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
K
G
 
G
R
 
K
E
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
V
A
 
T
F
 
V
V
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
E
A
 
A
S
 
S
K
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
G
C
 
V
T
 
N
V
 
L
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
33% identity, 37% coverage: 428:675/679 of query aligns to 5:261/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
L
 
I
A
 
S
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
V
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
V
D
x
A
R
|
R
D
x
Q
A
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
L
A
 
H
K
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
S
C
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
F
G
 
G
G
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
E
I
 
V
A
 
A
C
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
T
P
 
P
A
 
E
S
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
V
D
 
E
R
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
A
 
G
W
 
S
Q
 
N
G
 
E
A
 
T
V
 
I
G
 
M
E
 
E
V
 
A
D
 
A
D
 
D
S
 
E
T
 
K
L
 
W
R
 
Q
A
 
F
S
 
Y
F
 
W
E
 
E
L
 
L
N
 
H
F
 
V
F
 
M
G
 
A
H
 
A
Q
 
V
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
N
 
G
A
 
L
V
 
V
R
 
P
V
 
G
F
 
M
K
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
I
F
 
H
N
|
N
A
 
A
S
|
S
K
 
I
Q
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
Q
P
 
P
G
 
L
K
 
W
N
 
Y
F
 
E
G
 
P
P
 
I
Y
|
Y
G
 
N
L
 
V
P
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
M
F
 
M
L
 
F
M
 
S
K
 
K
Q
 
T
Y
 
L
A
 
A
L
 
T
D
 
E
H
 
V
G
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
N
A
x
P
D
 
G
R
 
L
I
|
I
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
T
|
T
D
 
P
D
 
D
M
x
W
I
 
I
K
 
K
S
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
E
L
 
L
S
 
T
E
 
K
Q
 
D
D
 
N
Y
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
G
N
 
D
L
 
W
L
 
K
G
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
K
R
 
R
E
 
F
V
 
A
T
 
S
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
A
 
F
F
 
F
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
C
-
 
S
-
 
E
K
 
R
A
 
A
S
 
T
K
 
Y
V
 
S
T
 
V
A
 
G
C
 
S
T
 
A
V
 
Y
T
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
I
 
L
E
 
K

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 37% coverage: 428:675/679 of query aligns to 5:261/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
L
 
I
A
 
S
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
V
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
V
D
x
A
R
|
R
D
x
Q
A
 
V
D
 
D
A
x
R
A
 
L
A
 
H
K
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
S
C
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
F
G
 
G
G
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
E
I
 
V
A
 
A
C
 
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
T
P
 
P
A
 
E
S
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
V
D
 
E
R
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
A
x
G
W
 
S
Q
 
N
G
 
E
A
 
T
V
 
I
G
 
M
E
 
E
V
 
A
D
 
A
D
 
D
S
 
E
T
 
K
L
 
W
R
 
Q
A
 
F
S
 
Y
F
 
W
E
 
E
L
 
L
N
 
L
F
 
V
F
 
M
G
 
A
H
 
A
Q
 
V
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
N
 
G
A
 
L
V
 
V
R
 
P
V
 
G
F
 
M
K
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
I
F
 
H
N
|
N
A
 
A
S
|
S
K
 
I
Q
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
Q
P
 
P
G
 
L
K
 
W
N
 
Y
F
x
E
G
 
P
P
 
I
Y
|
Y
G
 
N
L
 
V
P
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
M
F
 
M
L
 
F
M
 
S
K
 
K
Q
 
T
Y
 
L
A
 
A
L
 
T
D
 
E
H
 
V
G
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
N
A
x
P
D
x
G
R
 
L
I
|
I
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
T
|
T
D
 
P
D
 
D
M
x
W
I
 
I
K
 
K
S
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
E
L
 
L
S
 
T
E
 
K
Q
 
D
D
 
N
Y
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
G
N
 
D
L
 
W
L
 
K
G
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
K
R
 
R
E
 
F
V
 
A
T
 
S
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
A
 
F
F
 
F
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
C
-
 
S
-
 
E
K
 
R
A
 
A
S
 
T
K
 
Y
V
 
S
T
 
V
A
 
G
C
 
S
T
x
A
V
 
Y
T
x
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
I
 
L
E
 
K

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
33% identity, 37% coverage: 428:675/679 of query aligns to 5:261/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
L
 
I
A
 
S
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
V
 
I
A
 
V
V
 
L
L
 
V
D
x
A
R
|
R
D
x
Q
A
 
V
D
 
D
A
x
R
A
 
L
A
 
H
K
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
S
C
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
F
G
 
G
G
 
V
K
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
E
I
 
V
A
 
A
C
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
T
P
 
P
A
 
E
S
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
V
D
 
E
R
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
S
R
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
A
x
G
W
 
S
Q
 
N
G
 
E
A
 
T
V
 
I
G
 
M
E
 
E
V
 
A
D
 
A
D
 
D
S
 
E
T
 
K
L
 
W
R
 
Q
A
 
F
S
 
Y
F
 
W
E
 
E
L
 
L
N
 
L
F
 
V
F
 
M
G
 
A
H
 
A
Q
 
V
A
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
N
 
G
A
 
L
V
 
V
R
 
P
V
 
G
F
 
M
K
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
T
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
I
F
 
H
N
|
N
A
 
A
S
|
S
K
 
I
Q
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
Q
P
 
P
G
x
L
K
 
W
N
 
Y
F
x
E
G
 
P
P
 
I
Y
|
Y
G
 
N
L
 
V
P
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
M
F
 
M
L
 
F
M
 
S
K
 
K
Q
 
T
Y
 
L
A
 
A
L
 
T
D
 
E
H
 
V
G
 
I
K
 
K
D
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
I
N
 
N
A
x
P
D
x
G
R
 
L
I
|
I
R
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
T
|
T
D
 
P
D
 
D
M
x
W
I
 
I
K
 
K
S
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
E
L
 
L
S
 
T
E
 
K
Q
 
D
D
 
N
Y
 
-
M
 
-
G
 
G
G
 
G
N
 
D
L
 
W
L
 
K
G
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
I
-
 
K
R
 
R
E
 
F
V
 
A
T
 
S
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
N
A
 
F
F
 
F
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
C
-
 
S
-
 
E
K
 
R
A
 
A
S
 
T
K
 
Y
V
 
S
T
 
V
A
 
G
C
 
S
T
 
A
V
 
Y
T
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
I
 
L
E
 
K

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
32% identity, 36% coverage: 428:672/679 of query aligns to 3:240/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
A
 
Q
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
E
A
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
I
L
 
V
D
|
D
R
x
L
D
 
D
A
 
L
D
 
A
A
 
Q
A
 
S
A
 
Q
K
 
N
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
G
G
 
E
K
 
G
A
 
H
L
 
M
G
 
G
I
 
L
A
 
A
C
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
N
P
 
E
A
 
E
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
Q
V
 
A
A
 
L
E
 
Q
R
 
H
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
I
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
Q
Q
 
P
G
 
I
A
 
K
V
 
T
G
 
L
E
 
D
V
 
I
D
 
Q
D
 
R
S
 
S
T
 
D
L
 
Y
R
 
D
A
 
R
S
 
V
F
 
L
E
 
D
L
x
V
N
 
S
F
 
L
F
 
R
G
 
G
H
 
T
Q
 
L
A
 
I
V
 
M
A
 
S
Q
 
Q
N
 
A
A
 
V
V
 
I
R
 
P
V
 
S
F
 
M
K
 
K
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
T
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
V
F
 
C
N
 
L
A
 
S
S
|
S
K
 
V
Q
 
S
A
 
A
V
 
Q
N
 
R
P
 
G
G
 
G
K
 
G
N
 
I
F
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
P
P
 
H
Y
|
Y
G
 
S
L
 
A
P
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
T
 
V
L
 
L
F
 
G
L
 
L
M
 
A
K
 
K
Q
 
A
Y
 
M
A
 
A
L
 
R
D
 
E
H
 
F
G
 
G
K
 
G
D
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
N
 
T
A
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
P
G
 
G
L
 
L
L
x
I
T
 
Q
D
x
T
D
 
D
M
 
M
I
 
N
K
 
D
S
 
D
R
 
R
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
R
Q
 
H
D
 
D
Y
 
I
M
 
L
G
 
A
G
 
G
N
 
I
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
N
A
 
A
F
 
A
V
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
K
 
S
-
 
D
-
 
L
A
 
S
S
 
A
K
 
Y
V
 
L
T
 
T
A
 
G
C
 
V
T
 
T
V
 
L
T
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

A0A3Q8GL18 (+)-cis,trans-nepetalactol synthase NEPS1; Nepetalactol-related short-chain dehydrogenase; Nepetalactol dehydrogenase; Nepetalactol-related short-chain reductase 1; Nepetalactol-related SDR1; NmNEPS1; EC 5.5.1.34; EC 1.1.1.419 from Nepeta racemosa (Catmint) (Raceme catnip) (see paper)
29% identity, 37% coverage: 422:672/679 of query aligns to 9:261/271 of A0A3Q8GL18

query
sites
A0A3Q8GL18
K
 
Q
A
 
V
A
 
M
E
 
K
K
 
K
P
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
E
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
A
D
 
D
R
 
I
D
 
Q
A
 
S
D
 
E
A
 
V
A
 
G
A
 
K
K
 
S
A
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
S
C
 
I
G
 
G
G
 
D
K
 
P
A
 
C
L
 
C
G
 
Y
I
 
V
A
 
Q
C
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
P
 
E
A
 
E
S
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
S
A
 
M
F
 
I
D
 
E
R
 
W
V
 
T
A
 
A
E
 
S
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
M
V
 
M
V
 
F
S
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
M
W
 
S
Q
 
K
G
 
S
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
V
 
V
G
 
M
E
 
D
V
 
L
D
 
D
D
 
L
S
 
L
T
 
E
L
 
F
R
 
D
A
 
K
S
 
V
F
 
M
E
 
R
L
 
V
N
|
N
F
 
A
F
 
R
G
 
G
H
 
M
Q
 
A
A
 
A
V
 
C
A
 
L
Q
 
K
N
 
H
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
K
F
 
M
K
 
V
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
R
G
 
G
A
 
T
L
 
I
L
 
I
F
 
C
N
x
T
A
x
T
S
x
T
K
x
P
Q
x
L
A
 
S
V
 
S
N
 
R
P
 
G
G
 
G
K
 
Q
N
 
S
F
 
M
G
 
T
P
 
D
Y
|
Y
G
 
A
L
 
M
P
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
T
 
V
L
 
M
F
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
R
Q
 
S
Y
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
K
 
A
D
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
N
 
T
A
 
P
D
x
S
R
x
V
I
 
V
-
 
L
-
x
T
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
R
 
R
S
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
A
T
 
T
D
 
P
D
 
D
M
 
D
I
 
F
K
 
H
S
 
T
R
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
H
M
 
F
G
 
G
G
 
N
-
 
F
-
 
T
N
 
S
L
 
L
L
 
K
G
 
G
R
 
V
E
 
Y
V
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
V
V
 
V
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
S
-
 
D
-
 
D
A
 
A
S
 
A
K
 
F
V
 
I
T
 
T
A
 
G
C
 
H
T
 
D
V
 
L
T
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
33% identity, 37% coverage: 426:673/679 of query aligns to 2:254/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
K
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
S
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
Y
A
 
V
K
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
A
D
 
D
R
 
I
D
 
D
A
 
I
D
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
E
C
 
I
G
 
G
G
 
P
K
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
A
I
 
V
A
 
Q
C
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
R
P
 
Q
A
 
D
S
 
S
V
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
A
R
 
A
V
 
T
A
 
V
E
 
E
R
 
H
F
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
L
A
 
F
W
 
D
Q
 
L
G
 
A
A
 
P
V
 
I
G
 
V
E
 
E
V
 
I
D
 
T
D
 
R
S
 
E
T
 
S
L
 
Y
R
 
E
A
 
K
S
 
L
F
 
F
E
 
A
L
 
I
N
 
N
F
 
V
F
 
A
G
 
G
H
 
T
Q
 
L
A
 
F
V
 
T
A
 
L
Q
 
Q
N
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
Q
F
 
M
K
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
I
L
 
I
F
 
-
N
 
N
A
 
M
S
 
A
K
x
S
Q
|
Q
A
 
A
V
 
G
N
 
R
P
 
R
G
 
G
K
x
E
N
 
A
F
 
L
-
 
V
G
 
A
P
 
I
Y
|
Y
G
 
C
L
 
A
P
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
V
L
 
I
F
 
S
L
 
L
M
 
T
K
 
Q
Q
 
S
Y
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
L
G
 
I
K
 
K
D
 
H
G
 
R
I
 
I
R
 
N
S
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
N
 
-
A
 
A
D
 
P
R
 
G
I
 
V
R
 
V
S
 
D
G
 
G
L
 
E
L
x
H
T
x
W
D
 
D
-
 
G
-
 
V
D
 
D
M
 
A
I
 
L
K
x
F
S
 
A
R
 
R
S
 
Y
S
 
E
A
 
N
R
 
R
G
 
P
L
 
R
S
 
G
E
 
E
Q
 
K
D
 
K
Y
 
R
M
 
L
G
 
V
G
 
G
N
 
E
L
 
A
L
 
V
-
 
P
-
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
M
V
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
G
A
 
M
F
 
A
V
 
I
W
 
F
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
S
 
E
K
 
S
-
 
D
-
 
Y
V
 
I
T
 
V
A
 
S
C
 
Q
T
 
T
V
 
Y
T
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N

F1SWA0 Zerumbone synthase; EC 1.1.1.326 from Zingiber zerumbet (Shampoo ginger) (Amomum zerumbet) (see paper)
30% identity, 36% coverage: 428:672/679 of query aligns to 3:255/267 of F1SWA0

query
sites
F1SWA0
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
L
F
 
F
A
 
I
K
 
E
E
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
A
 
C
V
 
I
L
 
V
D
 
D
R
 
V
D
 
Q
A
 
D
D
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
Q
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
K
 
Q
A
 
R
C
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
P
K
 
H
A
 
A
L
 
C
G
 
Y
I
 
F
A
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
V
P
 
E
A
 
D
S
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
D
R
 
F
V
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
T
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
V
S
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
W
 
G
Q
 
D
G
 
K
A
 
V
V
 
I
G
 
D
-
 
I
-
 
R
E
 
D
V
 
A
D
 
D
D
 
F
S
 
N
T
 
E
L
 
F
R
 
K
A
 
K
S
 
V
F
 
F
E
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
V
F
 
N
G
 
G
H
 
V
Q
 
F
A
 
L
V
 
G
A
 
M
Q
 
K
N
 
H
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
I
F
 
M
K
 
I
A
 
P
Q
 
K
G
 
-
T
 
M
G
 
K
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
V
F
 
S
N
 
L
A
 
A
S
|
S
K
 
V
Q
x
S
A
 
S
V
 
V
N
 
I
P
 
A
G
 
G
K
 
A
N
 
-
F
 
-
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
G
 
G
L
x
Y
P
 
T
-
 
G
-
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
T
 
V
L
 
V
F
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
Q
 
S
Y
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
E
H
 
L
G
 
G
K
 
R
D
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
N
 
S
A
 
P
D
 
Y
R
 
A
I
 
V
R
 
P
S
 
T
G
 
R
L
 
L
L
 
S
T
 
M
D
 
P
D
 
Y
M
 
L
I
 
P
K
 
E
S
 
S
-
 
E
-
 
M
-
 
Q
R
 
E
S
 
D
S
 
A
A
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
F
S
 
L
E
 
T
Q
 
F
D
 
V
Y
 
R
M
 
S
G
 
N
G
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
K
G
 
G
R
 
V
E
 
D
V
 
L
T
 
M
A
 
P
E
 
N
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
V
V
 
L
W
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
T
-
 
E
K
 
E
A
 
S
S
 
K
K
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
G
C
 
L
T
 
N
V
 
L
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
29% identity, 34% coverage: 425:657/679 of query aligns to 5:244/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
E
 
Q
K
 
Q
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
N
A
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
E
A
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
S
P
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
N
A
 
D
A
 
G
F
 
V
D
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
D
R
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
W
 
I
Q
 
I
G
 
D
A
 
P
V
 
I
G
 
H
E
 
K
V
 
M
D
 
A
D
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
W
R
 
K
A
 
K
S
 
M
F
 
L
E
 
A
L
 
I
N
 
H
F
 
L
F
 
D
G
 
G
H
 
A
Q
 
F
A
 
L
V
 
T
A
 
T
Q
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
V
 
H
F
 
M
K
 
Y
A
 
K
Q
 
D
G
 
D
T
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
V
L
 
I
F
 
Y
N
x
M
A
 
G
S
|
S
K
 
V
Q
x
H
A
 
S
V
 
H
N
 
E
P
 
A
G
 
S
K
 
L
N
 
F
F
x
K
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
G
 
V
L
 
T
P
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
T
 
L
L
 
L
F
 
G
L
 
L
M
 
C
K
 
R
Q
 
V
Y
 
L
A
 
A
L
 
K
D
 
E
H
 
G
G
 
A
K
 
V
D
 
H
G
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
H
A
 
V
V
 
I
N
 
C
A
x
P
D
 
G
R
x
F
I
x
V
R
 
K
S
x
T
G
 
P
L
|
L
L
x
V
T
 
-
D
 
E
D
 
K
M
x
Q
I
 
I
K
 
P
S
 
Q
R
 
Q
S
 
A
S
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
N
D
 
D
Y
 
I
M
 
M
G
 
L
G
 
V
N
 
N
L
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
K
E
 
E
-
 
F
V
 
T
T
 
T
A
 
V
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
L
F
 
A
V
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
29% identity, 34% coverage: 425:657/679 of query aligns to 5:244/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
E
 
Q
K
 
Q
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
I
L
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
N
A
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
E
A
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
S
P
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
N
A
 
D
A
 
G
F
 
V
D
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
D
R
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
W
 
I
Q
 
I
G
 
D
A
 
P
V
 
I
G
 
H
E
 
K
V
 
M
D
 
A
D
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
W
R
 
K
A
 
K
S
 
M
F
 
L
E
 
A
L
 
I
N
 
H
F
 
L
F
 
D
G
 
G
H
 
A
Q
 
F
A
 
L
V
 
T
A
 
T
Q
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
V
 
H
F
 
M
K
 
Y
A
 
K
Q
 
D
G
 
D
T
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
T
L
 
V
L
 
I
F
 
Y
N
x
M
A
 
G
S
 
S
K
 
V
Q
x
H
A
 
S
V
 
H
N
 
E
P
 
A
G
 
S
K
 
L
N
 
F
F
x
K
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
G
 
V
L
 
T
P
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
T
 
L
L
 
L
F
 
G
L
 
L
M
 
C
K
 
R
Q
 
V
Y
 
L
A
 
A
L
 
K
D
 
E
H
 
G
G
 
A
K
 
V
D
 
H
G
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
H
A
 
V
V
 
I
N
 
C
A
x
P
D
 
G
R
x
F
I
x
V
R
 
K
S
x
T
G
 
P
L
|
L
L
x
V
T
 
-
D
 
E
D
 
K
M
x
Q
I
 
I
K
 
P
S
 
Q
R
 
Q
S
 
A
S
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
E
 
E
Q
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
N
D
 
D
Y
 
I
M
 
M
G
 
L
G
 
V
N
 
N
L
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
K
E
 
E
-
 
F
V
 
T
T
 
T
A
 
V
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
L
F
 
A
V
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A

7qujA Structure of nsneps2, a 7s-cis-trans nepetalactone synthase (see paper)
31% identity, 37% coverage: 425:672/679 of query aligns to 1:254/259 of 7qujA

query
sites
7qujA
E
 
K
K
 
K
P
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
D
E
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
A
D
|
D
R
x
I
D
x
Q
A
 
S
D
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
R
K
 
M
A
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
S
C
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
C
G
 
S
-
 
Y
I
 
V
A
 
Q
C
|
C
D
|
D
V
x
I
T
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
E
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
S
A
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
W
V
 
T
A
 
A
E
 
T
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
F
S
 
C
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
 
M
W
 
S
Q
 
H
G
 
S
A
 
D
V
 
S
G
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
-
 
M
E
 
E
V
 
L
D
 
D
D
 
M
S
 
S
T
 
K
L
 
F
R
 
D
A
 
E
S
 
V
F
 
M
E
 
R
L
 
V
N
 
N
F
 
T
F
 
R
G
 
G
H
 
T
Q
 
A
A
 
A
V
 
C
A
 
V
Q
 
K
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
K
F
 
M
K
 
V
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
-
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
I
F
 
C
N
x
T
A
x
S
S
 
S
K
 
P
Q
 
L
A
 
A
V
 
T
N
 
R
P
 
G
G
 
G
K
 
H
N
 
V
F
 
D
G
 
T
P
 
D
Y
|
Y
G
 
V
L
 
M
P
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
T
 
V
L
 
L
F
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
R
Q
 
S
Y
 
A
A
 
S
L
 
M
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
K
 
A
D
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
N
 
S
A
x
P
D
x
M
R
x
A
I
x
V
R
 
L
S
x
T
G
 
P
L
|
L
L
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
x
T
K
 
R
S
 
R
R
 
M
S
 
G
S
 
L
A
 
A
R
 
T
G
 
P
L
 
A
S
 
D
E
 
V
Q
 
E
D
 
N
Y
 
A
M
 
L
G
 
G
-
 
R
-
 
F
G
 
T
N
 
S
L
 
L
L
 
K
G
 
G
R
 
V
E
 
A
V
 
L
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
H
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
A
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
S
-
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
F
V
 
I
T
 
T
A
 
G
C
 
H
T
 
D
V
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6f9qC Binary complex of a 7s-cis-cis-nepetalactol cyclase from nepeta mussinii with NAD+ (see paper)
30% identity, 37% coverage: 425:672/679 of query aligns to 3:253/260 of 6f9qC

query
sites
6f9qC
E
 
K
K
 
K
P
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
L
F
 
F
A
 
V
K
 
K
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
A
D
|
D
R
x
I
D
x
Q
A
 
S
D
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
R
K
 
S
A
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
S
C
 
I
G
 
G
G
 
K
K
 
E
A
 
R
L
 
C
G
 
S
-
 
F
I
 
V
A
 
Q
C
|
C
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
E
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
S
A
 
M
F
 
I
D
 
E
R
 
W
V
 
T
A
 
A
E
 
T
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
F
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
V
A
 
L
W
 
N
Q
 
S
G
 
A
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
V
 
V
G
 
K
E
 
D
V
 
L
D
 
D
D
 
L
S
 
P
T
 
L
L
 
F
R
 
D
A
 
K
S
 
V
F
 
M
E
 
R
L
 
V
N
 
N
F
 
T
F
 
R
G
 
G
H
 
A
Q
 
A
A
 
V
V
 
C
A
 
V
Q
 
K
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
K
F
 
M
K
 
V
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
I
F
 
C
N
|
N
A
 
A
S
 
G
K
 
S
Q
 
S
A
 
A
V
 
V
N
 
R
P
 
G
G
 
A
K
 
H
N
 
G
F
 
V
G
 
T
P
 
D
Y
|
Y
G
 
V
L
 
M
P
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
T
 
V
L
 
I
F
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
R
Q
 
S
Y
 
A
A
 
S
L
 
M
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
K
 
A
D
 
H
G
 
S
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
N
 
S
A
x
P
D
x
M
R
 
A
I
x
V
R
 
A
S
x
T
G
x
P
L
|
L
L
x
T
T
 
R
D
 
N
D
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
S
E
 
T
Q
 
P
D
 
D
Y
 
D
M
 
V
G
 
Q
G
 
K
N
 
F
L
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
K
G
 
G
R
 
V
E
 
P
V
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
A
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
G
-
 
S
-
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
G
C
 
H
T
 
D
V
 
L
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

A0A3Q8GLE8 (+)-cis,cis-nepetalactol synthase NEPS3; Nepetalactol-related short-chain reductase 3; NmNEPS3; EC 5.5.1.35 from Nepeta racemosa (Catmint) (Raceme catnip) (see paper)
30% identity, 37% coverage: 425:672/679 of query aligns to 9:259/270 of A0A3Q8GLE8

query
sites
A0A3Q8GLE8
E
 
K
K
 
K
P
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
|
G
G
x
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
L
F
 
F
A
 
V
K
 
K
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
A
D
|
D
R
x
I
D
x
Q
A
 
S
D
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
R
K
 
S
A
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
S
C
 
I
G
 
G
G
 
K
K
 
E
A
 
R
L
 
C
G
 
S
-
 
F
I
 
V
A
 
Q
C
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
P
 
E
A
 
E
S
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
S
A
 
M
F
 
I
D
 
E
R
 
W
V
 
T
A
 
A
E
 
T
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
M
V
 
F
S
 
S
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
L
W
 
N
Q
 
S
G
 
A
A
 
A
-
 
Q
-
 
T
V
 
V
G
 
K
E
 
D
V
 
L
D
 
D
D
 
L
S
 
P
T
 
L
L
 
F
R
 
D
A
 
K
S
 
V
F
 
M
E
 
R
L
 
V
N
 
N
F
 
T
F
 
R
G
 
G
H
 
A
Q
 
A
A
 
V
V
 
C
A
 
V
Q
 
K
N
 
Q
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
K
F
 
M
K
 
V
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
I
L
 
I
F
 
C
N
|
N
A
 
A
S
 
G
K
 
S
Q
x
S
A
 
A
V
 
V
N
 
R
P
 
G
G
 
A
K
 
H
N
 
G
F
 
V
G
 
T
P
 
D
Y
|
Y
G
x
V
L
x
M
P
x
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
T
 
V
L
 
I
F
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
R
Q
 
S
Y
 
A
A
 
S
L
 
M
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
K
 
A
D
 
H
G
 
S
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
N
 
S
A
 
P
D
x
M
R
 
A
I
x
V
R
x
A
S
x
T
G
x
P
L
|
L
L
 
T
T
 
R
D
 
N
D
 
-
M
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
S
E
 
T
Q
 
P
D
 
D
Y
 
D
M
 
V
G
 
Q
G
 
K
N
 
F
L
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
F
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
K
G
 
G
R
 
V
E
 
P
V
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
A
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
G
-
 
S
-
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
K
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
G
C
 
H
T
 
D
V
 
L
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
35% identity, 36% coverage: 430:672/679 of query aligns to 4:249/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
R
 
R
Q
 
N
V
 
V
V
 
M
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
L
A
 
L
F
 
A
A
 
A
K
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
Y
E
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
L
-
 
N
-
 
Y
-
x
L
L
x
R
D
x
N
R
 
R
D
 
E
A
 
A
-
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
R
K
 
Q
A
 
R
A
 
I
K
 
E
A
 
R
C
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
C
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
P
 
E
A
 
G
S
 
D
V
 
V
R
 
E
A
 
R
A
 
L
F
 
F
D
 
A
R
 
S
V
 
I
A
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
M
-
 
L
A
 
E
W
 
A
Q
 
Q
G
 
T
A
 
R
V
 
L
G
 
E
E
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
A
S
 
A
T
 
R
L
 
L
R
 
H
A
 
R
S
 
V
F
 
F
E
 
A
L
x
T
N
 
N
F
 
V
F
 
T
G
 
G
H
 
S
Q
 
F
A
 
L
V
 
C
A
 
A
Q
 
R
N
 
E
A
 
A
V
 
V
-
 
K
R
 
R
V
 
L
F
 
S
K
 
T
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
T
 
G
G
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
S
L
 
I
F
 
V
N
 
N
A
x
V
S
 
S
K
x
S
Q
 
M
A
 
A
V
 
S
N
 
R
P
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
P
K
 
N
N
 
E
F
 
Y
G
 
I
P
 
D
Y
|
Y
G
 
A
L
 
A
P
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
T
 
I
L
 
D
F
 
S
L
 
M
M
 
T
K
 
I
Q
 
G
Y
 
L
A
 
A
L
 
R
D
 
E
H
 
V
G
 
A
K
 
A
D
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
R
 
R
S
x
P
G
|
G
L
 
L
L
x
I
T
 
-
D
 
D
D
x
T
M
 
E
I
|
I
K
x
H
S
 
A
R
 
S
S
 
G
S
 
G
A
 
E
R
 
P
G
 
G
L
 
R
S
 
I
E
 
E
Q
 
R
D
 
-
Y
 
L
M
 
K
G
 
G
G
 
G
N
 
I
L
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
G
V
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
A
 
A
F
 
I
V
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
A
-
 
S
-
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
S
K
 
Y
V
 
S
T
 
T
A
 
G
C
 
T
T
 
F
V
 
I
T
 
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
32% identity, 36% coverage: 428:674/679 of query aligns to 8:252/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
L
 
L
A
 
Q
R
 
G
Q
 
R
V
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
T
S
 
K
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
G
T
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
A
D
 
G
R
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
A
D
 
D
A
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
C
A
 
V
K
 
A
A
 
D
A
 
L
K
x
D
A
 
Q
C
 
L
G
|
G
-
 
S
G
|
G
K
 
K
A
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
Q
C
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
P
 
R
A
 
A
S
 
Q
V
 
C
R
 
D
A
 
A
A
 
L
F
 
A
D
 
G
R
 
R
V
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
C
S
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
F
W
 
P
Q
 
D
G
 
A
A
 
P
V
 
L
G
 
A
E
 
T
V
 
M
D
 
T
D
 
P
S
 
E
T
 
Q
L
 
L
R
 
N
A
 
G
S
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
V
N
 
N
F
 
V
F
 
N
G
 
G
H
 
T
Q
 
F
A
 
Y
V
 
A
A
 
V
Q
 
Q
N
 
A
A
 
C
V
 
L
R
 
D
V
 
A
F
 
L
K
 
I
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
T
 
S
G
 
G
G
 
R
A
 
V
L
 
V
L
 
L
F
 
T
N
 
S
A
x
S
S
 
I
K
 
T
Q
 
G
A
 
P
V
 
I
N
 
T
P
 
G
G
 
Y
K
 
P
N
 
G
F
x
W
G
 
S
P
 
H
Y
|
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
F
 
G
L
 
F
M
 
M
K
 
R
Q
 
T
Y
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
L
G
 
A
K
 
P
D
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
T
S
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
N
 
M
A
 
P
D
 
G
R
 
N
I
 
I
R
 
M
S
 
T
-
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
E
D
 
N
D
 
G
M
 
E
I
 
E
K
 
Y
S
 
I
R
 
A
S
 
S
S
 
M
A
 
A
R
 
R
G
 
S
L
 
I
S
 
P
E
 
A
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
G
R
 
A
E
 
L
V
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
G
D
 
H
-
 
L
-
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
L
W
 
A
L
 
T
A
 
K
K
 
E
A
 
A
S
 
G
K
 
Y
V
 
I
T
 
T
A
 
G
C
 
Q
T
 
A
V
 
I
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
Q
I
 
V

8ijgC Crystal structure of alcohol dehydrogenase m5 from burkholderia gladioli with NADP
29% identity, 37% coverage: 426:675/679 of query aligns to 2:249/250 of 8ijgC

query
sites
8ijgC
K
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
T
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
D
F
 
L
A
 
A
K