SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382757.1 AMB_RS01570 protein meaA to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6oxdA Structure of mycobacterium tuberculosis methylmalonyl-coa mutase with adenosyl cobalamin (see paper)
38% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 93:713/736 of 6oxdA

query
sites
6oxdA
K
x
Q
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
D
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
Q
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
L
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
Q
L
 
L
F
 
F
E
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
D
L
 
L
E
 
S
K
 
T
M
 
V
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
A
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
K
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
L
P
 
N
A
 
A
A
 
G
-
 
L
D
 
D
F
 
I
E
 
D
Q
 
S
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
G
T
 
R
E
 
L
L
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
A
R
 
Q
Y
 
F
G
 
A
V
 
P
K
 
K
D
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
S
R
 
L
R
 
S
F
 
L
R
|
R
Y
x
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
F
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
A
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
L
G
x
A
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
V
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
P
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
W
K
 
L
V
 
T
E
 
H
A
 
R
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
A
E
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
V
D
 
A
A
 
E
M
 
H
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
S
S
 
D
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
L
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
Q
E
 
V
T
 
P
E
 
E
P
 
D
S
 
H
P
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
G
 
I
S
 
E
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
-
 
E
D
 
N
P
 
S
K
 
R
A
 
V
E
 
R
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
R
D
 
D
A
 
E
K
 
P
A
 
A
V
 
V
D
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
-
 
T
R
 
R
S
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
E
E
 
L
G
 
G
R
 
N
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
A
P
 
L
S
 
A
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
A
G
 
Q
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
I
A
 
S
Q
 
E
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
Y
G
 
G
E
 
R
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
P
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
T
-
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
Y
R
 
R
A
 
-
A
 
-
A
 
D
E
 
E
V
 
V
-
 
G
K
 
K
G
 
A
E
 
P
K
 
N
M
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
T
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
K
V
 
F
S
 
A
A
 
E
K
 
A
L
 
D
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
I
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
 
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
I
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
S
I
 
L
R
 
F
L
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
D
E
 
N
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
x
A
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
D
R
 
A
M
 
L
K
 
A
A
 
Q
A
 
V
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
M
V
 
I
V
 
V
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
G
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
T
R
 
A
I
 
I
Y
x
F
T
x
P
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2xiqA Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adenosylcobalamin and malonyl-coa (see paper)
35% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 68:689/714 of 2xiqA

query
sites
2xiqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
L
 
F
Y
 
Y
R
 
K
T
 
D
N
 
N
L
 
I
T
 
K
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
T
L
 
V
G
 
E
D
 
D
M
 
T
M
 
K
T
 
I
L
 
L
F
 
F
E
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
I
W
 
P
L
 
V
L
 
L
S
 
A
L
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
A
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
P
R
 
K
S
 
E
V
 
K
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Q
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
K
L
 
I
T
 
I
G
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
F
A
 
E
F
 
Y
T
 
T
Y
 
A
R
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
|
K
W
 
F
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
P
 
A
E
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
E
T
 
Y
V
 
S
R
 
R
P
 
T
T
 
G
V
 
L
P
 
Q
A
 
A
A
 
G
-
 
L
D
 
T
F
 
I
E
 
D
Q
 
E
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
Y
T
 
M
E
 
E
L
 
I
C
 
A
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
G
T
 
R
E
 
R
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
H
I
 
L
C
 
I
V
 
E
G
 
K
R
 
M
Y
 
F
G
 
Q
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
S
K
 
K
A
 
S
R
 
L
R
 
L
F
 
L
R
|
R
Y
x
A
G
x
H
V
 
C
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
A
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
F
S
 
G
K
 
G
N
 
T
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
F
N
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
L
G
|
G
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
V
W
 
K
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
I
I
 
I
M
 
I
A
 
Q
Y
 
E
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
I
L
 
P
E
 
K
F
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
M
I
 
M
T
 
E
R
 
C
K
 
L
V
 
T
E
 
N
A
 
D
L
 
V
K
 
Y
E
 
D
G
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
K
E
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
S
 
E
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
L
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
S
Q
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
Q
E
 
L
T
 
E
E
 
K
P
 
E
S
 
D
P
 
T
L
 
V
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
E
I
 
V
M
 
L
T
 
A
V
 
I
D
 
D
P
 
N
K
 
T
A
 
S
-
 
V
E
 
R
A
 
N
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
K
F
 
I
R
 
K
A
 
S
A
 
S
R
 
R
D
 
D
A
 
Q
K
 
A
A
 
L
V
 
A
D
 
E
K
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
L
R
 
T
S
 
E
A
 
C
A
 
A
N
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
D
-
 
G
N
 
N
V
 
I
M
 
L
E
 
A
P
 
L
S
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
S
H
 
R
A
 
A
G
 
R
V
 
C
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
I
A
 
T
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
K
A
 
A
P
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
M
-
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
A
A
 
Y
R
 
R
A
 
Q
A
 
E
A
 
F
E
 
G
V
 
E
K
 
S
G
 
K
E
 
E
K
 
I
M
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
H
A
 
K
V
 
F
S
 
M
A
 
E
K
 
R
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
G
A
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
I
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
N
 
Q
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
A
V
 
V
G
|
G
L
 
V
S
|
S
I
 
T
L
|
L
S
 
A
G
x
A
S
 
G
H
 
H
V
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
N
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
V
V
 
M
A
 
C
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
E
 
Y
K
 
E
V
 
F
L
 
L
L
 
F
A
 
E
A
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
S
R
 
N
I
 
V
Y
x
F
T
x
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P22033 Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial; MCM; Methylmalonyl-CoA isomerase; EC 5.4.99.2 from Homo sapiens (Human) (see 28 papers)
35% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 103:724/750 of P22033

query
sites
P22033
K
x
R
P
|
P
W
|
W
L
x
T
F
x
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
S
x
A
G
|
G
H
x
F
S
|
S
S
x
T
A
x
V
A
x
E
E
|
E
S
|
S
N
|
N
K
|
K
L
x
F
Y
|
Y
R
x
K
T
x
D
N
|
N
L
x
I
T
x
K
K
x
A
G
|
G
Q
|
Q
T
x
Q
G
|
G
L
|
L
S
|
S
I
x
V
A
|
A
F
|
F
D
|
D
L
|
L
P
x
A
T
|
T
Q
x
H
T
x
R
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
S
|
S
D
|
D
H
x
N
V
x
P
L
x
R
A
x
V
K
x
R
G
|
G
E
x
D
V
|
V
G
|
G
K
x
M
V
x
A
G
|
G
V
|
V
P
x
A
V
x
I
C
x
D
H
x
T
L
x
V
G
x
E
D
|
D
M
x
T
M
x
K
T
x
I
L
|
L
F
|
F
E
x
D
G
|
G
I
|
I
P
|
P
L
|
L
E
|
E
K
|
K
M
|
M
N
x
S
T
x
V
S
|
S
M
|
M
T
|
T
I
x
M
N
|
N
A
x
G
P
x
A
A
x
V
A
x
I
W
x
P
L
x
V
L
|
L
S
x
A
L
x
N
Y
x
F
I
|
I
A
x
V
A
x
T
A
x
G
E
|
E
R
x
E
Q
|
Q
G
|
G
A
x
V
N
x
P
R
x
K
S
x
E
V
x
K
L
|
L
N
x
T
G
|
G
T
|
T
T
x
I
Q
|
Q
N
|
N
D
|
D
V
x
I
I
x
L
K
|
K
E
|
E
Y
x
F
L
x
M
S
x
V
R
|
R
G
x
N
T
|
T
Y
|
Y
I
|
I
F
|
F
A
x
P
P
|
P
Q
x
E
P
|
P
S
|
S
L
x
M
K
|
K
L
x
I
T
x
I
G
x
A
D
|
D
V
x
I
I
x
F
A
x
E
F
x
Y
T
|
T
Y
x
A
R
x
K
E
x
H
V
x
M
P
|
P
K
|
K
W
x
F
N
|
N
P
x
S
M
x
I
N
x
S
V
x
I
C
x
S
S
x
G
Y
|
Y
H
|
H
L
x
M
Q
|
Q
E
|
E
A
|
A
G
|
G
A
|
A
T
x
D
P
x
A
E
x
I
Q
x
L
E
|
E
L
|
L
A
|
A
Y
|
Y
A
x
T
L
|
L
A
|
A
T
x
D
A
x
G
V
 
-
A
 
-
V
 
-
L
|
L
D
x
E
T
x
Y
V
x
S
R
|
R
P
x
T
T
x
G
V
x
L
P
x
Q
A
|
A
A
x
G
-
x
L
D
x
T
F
x
I
E
x
D
Q
x
E
V
x
F
V
x
A
S
x
P
R
|
R
I
x
L
S
|
S
F
|
F
F
|
F
V
x
W
N
x
G
A
x
I
G
|
G
I
x
M
R
x
N
F
|
F
V
x
Y
T
x
M
E
|
E
L
x
I
C
x
A
K
|
K
M
|
M
R
|
R
A
|
A
F
x
G
T
x
R
E
x
R
L
|
L
W
|
W
D
x
A
E
x
H
I
x
L
C
x
I
V
x
E
G
x
K
R
x
M
Y
x
F
G
x
Q
V
x
P
K
|
K
D
x
N
E
x
S
K
|
K
A
x
S
R
x
L
R
x
L
F
x
L
R
|
R
Y
x
A
G
x
H
V
x
C
Q
|
Q
V
x
T
N
x
S
S
x
G
L
x
W
G
x
S
L
|
L
T
|
T
E
|
E
Q
|
Q
Q
x
D
P
|
P
E
x
Y
N
|
N
N
|
N
V
x
I
Y
x
V
R
|
R
I
x
T
V
x
A
M
x
I
E
|
E
M
x
A
L
x
M
A
|
A
V
x
A
V
|
V
L
x
F
S
x
G
K
x
G
N
x
T
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
x
Q
A
x
S
V
x
L
Q
x
H
L
x
T
P
x
N
A
x
S
W
x
F
N
x
D
E
|
E
A
|
A
L
|
L
G
|
G
L
|
L
P
|
P
R
x
T
P
x
V
W
x
K
D
x
S
Q
x
A
Q
x
R
W
x
I
S
x
A
L
x
R
R
x
N
L
x
T
Q
|
Q
Q
x
I
I
|
I
M
x
I
A
x
Q
Y
x
E
E
|
E
T
x
S
D
x
G
L
x
I
L
x
P
E
x
K
F
x
V
G
x
A
D
|
D
I
x
P
F
x
W
D
x
G
G
|
G
S
|
S
H
x
Y
E
x
M
I
x
M
T
x
E
R
x
C
K
x
L
V
x
T
E
x
N
A
x
D
L
x
V
K
x
Y
E
x
D
G
x
A
A
|
A
R
x
L
E
x
K
E
x
L
L
x
I
A
x
N
R
x
E
I
|
I
D
x
E
A
x
E
M
|
M
G
|
G
G
|
G
A
x
M
V
x
A
S
x
K
A
|
A
V
|
V
E
x
A
S
x
E
S
x
G
Y
x
I
M
x
P
K
|
K
Q
x
L
K
x
R
L
x
I
V
x
E
E
|
E
S
x
C
N
x
A
A
|
A
R
|
R
R
|
R
I
x
Q
G
x
A
A
x
R
I
|
I
E
x
D
T
x
S
G
|
G
E
x
S
Q
x
E
I
x
V
V
x
I
V
|
V
G
|
G
V
|
V
N
|
N
K
|
K
W
x
Y
T
x
Q
E
x
L
T
x
E
E
x
K
P
x
E
S
x
D
P
x
A
L
x
V
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
x
E
I
x
V
M
x
L
T
x
A
V
x
I
D
|
D
P
x
N
K
x
T
A
x
S
-
x
V
E
x
R
A
x
N
E
x
R
Q
|
Q
I
|
I
E
|
E
R
x
K
L
|
L
K
|
K
A
x
K
F
x
I
R
x
K
A
x
S
A
x
S
R
|
R
D
|
D
A
x
Q
K
x
A
A
x
L
V
x
A
D
x
E
K
x
R
A
x
C
L
|
L
A
|
A
E
x
A
L
|
L
R
x
T
S
x
E
A
x
C
A
|
A
N
x
A
E
x
S
G
|
G
R
x
D
-
x
G
N
|
N
V
x
I
M
x
L
E
x
A
P
x
L
S
x
A
I
x
V
A
x
D
A
|
A
A
x
S
H
x
R
A
|
A
G
x
R
V
x
C
T
|
T
T
x
V
G
|
G
E
|
E
W
x
I
A
x
T
Q
x
D
C
x
A
L
|
L
R
x
K
D
x
K
V
|
V
F
|
F
G
|
G
E
|
E
Y
x
H
R
x
K
A
|
A
P
x
N
-
x
D
-
x
R
-
x
M
-
x
V
T
x
S
G
|
G
V
x
A
A
x
Y
R
|
R
A
x
Q
A
x
E
A
x
F
E
x
G
V
x
E
K
x
S
G
x
K
E
|
E
K
x
I
M
x
T
G
x
S
A
|
A
V
x
I
R
x
K
A
 
-
K
x
R
V
|
V
E
x
H
A
x
K
V
x
F
S
x
M
A
x
E
K
x
R
L
x
E
G
|
G
R
|
R
R
|
R
V
x
P
K
x
R
I
x
L
L
|
L
V
|
V
G
x
A
K
|
K
P
x
M
G
|
G
L
x
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
|
A
E
x
K
Q
x
V
I
|
I
A
|
A
V
x
T
R
x
G
A
x
F
R
x
A
D
|
D
A
x
L
G
|
G
M
x
F
E
x
D
V
|
V
V
x
D
Y
x
I
E
x
G
G
x
P
I
x
L
R
x
F
L
x
Q
T
|
T
P
|
P
A
x
R
Q
x
E
I
x
V
V
x
A
N
x
Q
A
x
Q
A
|
A
L
x
V
E
x
D
E
x
A
G
x
D
V
|
V
H
|
H
V
x
A
V
|
V
G
|
G
L
x
I
S
|
S
I
x
T
L
|
L
S
x
A
G
x
A
S
x
G
H
|
H
V
x
K
P
x
T
L
|
L
V
|
V
T
x
P
E
|
E
V
x
L
L
x
I
E
x
K
R
x
E
M
x
L
K
x
N
A
x
S
A
x
L
G
|
G
L
x
R
S
x
P
D
|
D
I
|
I
P
x
L
V
|
V
V
x
M
A
x
C
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
|
I
P
|
P
P
|
P
E
x
Q
D
|
D
E
x
Y
K
x
E
V
x
F
L
|
L
L
x
F
A
x
E
A
x
V
G
|
G
C
x
V
A
x
S
R
x
N
I
x
V
Y
x
F
T
x
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

8dyjB Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase in complex with adp and cob(ii)alamin (see paper)
35% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 67:688/708 of 8dyjB

query
sites
8dyjB
K
 
R
P
 
P
W
 
W
L
 
T
F
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
L
 
F
Y
 
Y
R
 
K
T
 
D
N
 
N
L
 
I
T
 
K
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
|
L
P
 
A
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
T
L
 
V
G
 
E
D
 
D
M
 
T
M
 
K
T
 
I
L
 
L
F
 
F
E
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
I
W
 
P
L
 
V
L
 
L
S
 
A
L
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
A
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
P
R
 
K
S
 
E
V
 
K
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Q
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
K
L
 
I
T
 
I
G
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
F
A
 
E
F
 
Y
T
 
T
Y
 
A
R
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
P
 
A
E
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
E
T
 
Y
V
 
S
R
 
R
P
 
T
T
 
G
V
 
L
P
 
Q
A
 
A
A
 
G
-
 
L
D
 
T
F
 
I
E
 
D
Q
 
E
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
R
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
Y
T
 
M
E
 
E
L
 
I
C
 
A
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
G
T
 
R
E
 
R
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
H
I
 
L
C
 
I
V
 
E
G
 
K
R
 
M
Y
 
F
G
 
Q
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
S
K
 
K
A
 
S
R
 
L
R
 
L
F
 
L
R
 
R
Y
 
A
G
 
H
V
 
C
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
A
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
F
S
 
G
K
 
G
N
 
T
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
x
N
A
 
S
W
 
F
N
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
L
G
|
G
L
|
L
P
|
P
R
 
T
P
 
V
W
 
K
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
I
I
 
I
M
 
I
A
 
Q
Y
 
E
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
I
L
 
P
E
 
K
F
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
M
I
 
M
T
 
E
R
 
C
K
 
L
V
 
T
E
 
N
A
 
D
L
 
V
K
 
Y
E
 
D
G
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
K
E
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
S
 
E
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
L
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
S
Q
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
Q
E
 
L
T
 
E
E
 
K
P
 
E
S
 
D
P
 
T
L
 
V
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
E
I
 
V
M
 
L
T
 
A
V
 
I
D
 
D
P
 
N
K
 
T
A
 
S
-
 
V
E
 
R
A
 
N
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
K
F
 
I
R
 
K
A
 
S
A
 
S
R
 
R
D
 
D
A
 
Q
K
 
A
A
 
L
V
 
A
D
 
E
K
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
L
R
 
T
S
 
E
A
 
C
A
 
A
N
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
D
-
 
G
N
 
N
V
 
I
M
 
L
E
 
A
P
 
L
S
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
S
H
 
R
A
 
A
G
 
R
V
 
C
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
I
A
 
T
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
K
A
 
A
P
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
M
-
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
A
A
 
Y
R
 
R
A
 
Q
A
 
E
A
 
F
E
 
G
V
 
E
K
 
S
G
 
K
E
 
E
K
 
I
M
 
T
G
 
S
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
H
A
 
K
V
 
F
S
 
M
A
 
E
K
 
R
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
G
A
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
I
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
N
 
Q
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
T
L
|
L
S
 
A
G
x
A
S
 
G
H
 
H
V
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
N
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
V
V
 
M
A
 
C
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
E
 
Y
K
 
E
V
 
F
L
 
L
L
 
F
A
 
E
A
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
S
R
 
N
I
 
V
Y
x
F
T
x
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4reqA Methylmalonyl-coa mutase substrate complex (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 80:705/726 of 4reqA

query
sites
4reqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
|
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
|
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
x
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6reqA Methylmalonyl-coa mutase, 3-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 81:706/727 of 6reqA

query
sites
6reqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
I
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
|
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
x
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
|
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P11653 Methylmalonyl-CoA mutase large subunit; MCM-alpha; EC 5.4.99.2 from Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (see 4 papers)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 82:707/728 of P11653

query
sites
P11653
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
I
 
V
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
 
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
 
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
 
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
 
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
 
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
 
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7reqA Methylmalonyl-coa mutase, 2-carboxypropyl-coa inhibitor complex (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 79:704/725 of 7reqA

query
sites
7reqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3reqA Methylmalonyl-coa mutase, substrate-free state (poor quality structure) (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 79:704/725 of 3reqA

query
sites
3reqA
K
 
R
P
 
P
W
 
W
L
 
T
F
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
R
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
 
E
A
|
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
|
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
|
P

Sites not aligning to the query:

2reqA Methylmalonyl-coa mutase, non-productive coa complex, in open conformation representing substrate-free state (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 79:704/725 of 2reqA

query
sites
2reqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
 
T
F
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
R
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
|
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
 
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
 
E
A
|
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
|
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
x
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5reqA Methylmalonyl-coa mutase, y89f mutant, substrate complex (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 79:704/725 of 5reqA

query
sites
5reqA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
|
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
x
T
G
x
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
x
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
 
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1e1cA Methylmalonyl-coa mutase h244a mutant (see paper)
36% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 81:706/727 of 1e1cA

query
sites
1e1cA
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
A
L
 
F
Y
 
Y
R
 
R
T
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
L
S
|
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
|
L
P
 
P
T
 
T
Q
x
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
S
L
 
I
G
 
Y
D
 
D
M
 
M
M
 
R
T
 
E
L
 
L
F
 
F
E
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
L
W
 
P
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
A
 
V
A
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
K
R
 
P
S
 
E
V
 
Q
L
 
L
N
 
A
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
x
V
R
|
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
R
L
 
I
T
 
I
G
 
S
D
 
E
V
 
I
I
 
F
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
Y
 
S
R
 
A
E
 
N
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
W
N
 
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
x
A
L
 
M
Q
 
Q
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
R
 
R
P
 
A
T
 
G
V
 
E
P
 
S
A
 
V
A
 
G
-
 
L
D
 
N
F
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
F
T
 
M
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
R
E
 
M
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
K
I
 
L
C
 
-
V
 
V
G
 
H
R
 
Q
Y
 
F
G
 
G
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
P
K
 
K
A
 
S
R
 
M
R
 
S
F
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
x
H
V
 
S
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
V
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
C
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
A
K
 
T
N
 
Q
A
 
G
R
 
H
A
 
T
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
L
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
A
L
|
L
P
 
P
R
 
T
P
 
D
W
 
F
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
F
M
 
L
A
 
Q
Y
 
Q
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
T
L
 
T
E
 
R
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
A
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
W
A
 
D
L
 
L
K
 
A
E
 
R
G
 
K
A
 
A
R
 
W
E
 
G
E
 
H
L
 
I
A
 
Q
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
K
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
M
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
T
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
I
 
P
V
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
R
E
 
L
T
 
E
E
 
H
P
 
E
S
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
D
I
 
V
M
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
D
-
 
N
P
 
S
K
 
T
A
 
V
E
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
K
E
 
A
R
 
K
L
 
L
K
 
V
A
 
K
F
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
P
K
 
E
A
 
K
V
 
V
D
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
T
S
 
W
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
K
N
 
D
E
 
P
G
 
D
R
 
R
N
 
N
V
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
S
 
C
I
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
G
H
 
R
A
 
A
G
 
M
V
 
A
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
M
A
 
S
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
R
 
R
A
 
T
P
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
Y
A
 
S
A
 
K
E
 
E
V
 
V
K
 
K
G
 
N
E
 
T
-
 
P
K
 
E
M
 
V
G
 
E
A
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
E
K
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
F
S
 
E
A
 
Q
K
 
A
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
A
K
|
K
P
 
M
G
 
G
L
 
Q
D
|
D
G
|
G
H
|
H
S
x
D
N
x
R
G
|
G
A
 
Q
E
 
K
Q
 
V
I
|
I
A
 
A
V
 
T
R
 
A
A
x
Y
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
V
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
E
I
 
T
V
 
A
N
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
|
S
I
 
S
L
|
L
S
 
A
G
 
G
S
 
G
H
 
H
V
 
L
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
A
V
 
L
L
 
R
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
D
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
I
V
 
T
A
 
V
G
|
G
G
|
G
I
x
V
I
 
I
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
D
 
D
E
 
F
K
 
D
V
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
G
C
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
T
|
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8gjuJ Crystal structure of human methylmalonyl-coa mutase (mmut) in complex with methylmalonic acidemia type a protein (mmaa), coenzyme a, and gdp (see paper)
34% identity, 94% coverage: 16:642/665 of query aligns to 68:666/689 of 8gjuJ

query
sites
8gjuJ
K
x
R
P
 
P
W
 
W
L
x
T
F
 
I
R
|
R
T
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
S
S
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
E
S
 
S
N
 
N
K
 
K
L
 
F
Y
 
Y
R
 
K
T
 
D
N
 
N
L
 
I
T
 
K
K
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
A
T
 
T
Q
 
H
T
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
N
V
 
P
L
 
R
A
 
V
K
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
M
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
T
L
 
V
G
 
E
D
 
D
M
 
T
M
 
K
T
 
I
L
 
L
F
 
F
E
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
M
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
M
T
|
T
I
 
M
N
 
N
A
 
G
P
 
A
A
 
V
A
 
I
W
 
P
L
 
V
L
 
L
S
 
A
L
 
N
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
A
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
P
R
 
K
S
 
E
V
 
K
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
|
T
T
 
I
Q
|
Q
N
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
L
 
M
S
 
V
R
 
R
G
 
N
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Q
 
E
P
 
P
S
 
S
L
 
M
K
 
K
L
 
I
T
 
I
G
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
F
A
 
E
F
 
Y
T
 
T
Y
 
A
R
 
K
E
 
H
V
 
M
P
 
P
K
 
K
W
 
F
N
|
N
P
 
S
M
 
I
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
 
Y
H
 
H
L
 
M
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
D
P
 
A
E
 
I
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
D
A
 
G
V
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
E
T
 
Y
V
 
S
R
 
R
P
 
T
T
 
G
V
 
L
P
 
Q
A
 
A
A
 
G
-
 
L
D
 
T
F
 
I
E
 
D
Q
 
E
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
V
 
W
N
 
G
A
 
I
G
 
G
I
 
M
R
 
N
F
 
F
V
 
Y
T
 
M
E
 
E
L
 
I
C
 
A
K
 
K
M
 
M
R
 
R
A
 
A
F
 
G
T
 
R
E
 
R
L
 
L
W
 
W
D
 
A
E
 
H
I
 
L
C
 
I
V
 
E
G
 
K
R
 
M
Y
 
F
G
 
Q
V
 
P
K
 
K
D
 
N
E
 
S
K
 
K
A
 
S
R
 
L
R
 
L
F
 
L
R
|
R
Y
x
A
G
x
H
V
 
C
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
 
G
L
 
W
G
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
A
M
 
I
E
 
E
M
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
F
S
 
G
K
 
G
N
 
T
A
 
-
R
 
-
A
 
-
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
S
W
 
F
N
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
V
W
 
K
D
 
S
Q
 
A
Q
 
R
W
 
I
S
 
A
L
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
I
I
 
I
M
 
I
A
 
Q
Y
 
E
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
I
L
 
P
E
 
K
F
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
P
F
 
W
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
M
I
 
M
T
 
E
R
 
C
K
 
L
V
 
T
E
 
N
A
 
D
L
 
V
K
 
Y
E
 
D
G
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
K
E
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
M
V
 
A
S
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
S
 
E
S
 
G
Y
 
I
M
 
P
K
 
K
Q
 
L
K
 
R
L
 
I
V
 
E
E
 
E
S
 
C
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
I
 
Q
G
 
A
A
 
R
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
E
 
S
Q
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
K
W
 
Y
T
 
Q
E
 
L
T
 
E
E
 
K
P
 
E
S
 
D
P
 
T
L
 
V
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
E
I
 
V
M
 
L
T
 
A
V
 
I
D
 
D
P
 
N
K
 
T
A
 
S
-
 
V
E
 
R
A
 
N
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
K
F
 
I
R
 
K
A
 
S
A
 
S
R
 
R
D
 
D
A
 
Q
K
 
A
A
 
L
V
 
A
D
 
E
K
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
L
R
 
T
S
 
E
A
 
C
A
 
A
N
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
D
-
 
G
N
 
N
V
 
I
M
 
L
E
 
A
P
 
L
S
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
S
H
 
R
A
 
A
G
 
R
V
 
C
T
 
T
T
 
V
G
 
G
E
 
E
W
 
I
A
 
T
Q
 
D
C
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Y
 
H
R
 
K
A
 
E
P
 
I
T
 
T
G
 
S
V
 
A
A
 
I
R
 
K
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
R
V
 
V
E
 
H
A
 
K
V
 
F
S
 
M
A
 
E
K
 
R
L
 
E
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
P
K
 
R
I
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
K
P
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
M
S
 
D
N
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
T
R
 
G
A
 
F
R
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
M
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
D
Y
 
I
E
 
G
G
 
P
I
 
L
R
 
F
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
N
 
Q
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
E
 
D
E
 
A
G
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
S
I
 
T
L
 
L
S
 
A
G
 
A
S
 
G
H
 
H
V
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
T
 
P
E
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
E
M
 
L
K
 
N
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
R
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
L
V
 
V
V
 
M
A
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
E
 
Y
K
 
E
V
 
F
L
 
L
L
 
F
A
 
E
A
 
V
G
 
G
C
 
V
A
 
S
R
 
N
I
 
V
Y
 
F
T
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4r3uA Crystal structure of 2-hydroxyisobutyryl-coa mutase (see paper)
31% identity, 73% coverage: 14:498/665 of query aligns to 80:556/557 of 4r3uA

query
sites
4r3uA
R
 
R
E
 
S
K
x
R
P
 
T
W
 
W
L
x
T
F
 
M
R
|
R
T
 
Q
Y
x
I
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
G
S
 
T
A
 
G
A
 
E
E
 
D
S
 
T
N
 
N
K
 
K
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
Y
N
 
L
L
 
I
T
 
A
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
I
S
 
S
I
 
T
A
x
D
F
 
F
D
 
D
L
x
M
P
 
P
T
 
T
Q
 
L
T
 
M
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
P
L
 
M
A
 
S
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
R
V
x
E
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
D
M
 
M
M
 
E
T
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
A
G
 
D
I
 
I
P
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
N
 
S
T
 
V
S
|
S
M
 
F
T
|
T
I
 
I
N
 
N
A
 
-
P
 
P
A
 
S
A
 
A
W
 
W
-
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
R
G
 
G
A
 
Y
N
 
D
R
 
L
S
 
N
V
 
K
L
 
L
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
L
 
M
S
 
A
R
x
Q
G
 
K
T
x
E
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
I
Q
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
V
K
 
R
L
 
I
T
 
V
G
 
R
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
Y
T
 
S
Y
 
A
R
 
K
E
 
N
V
 
L
P
 
K
K
x
R
W
 
Y
N
|
N
P
 
P
M
 
I
N
|
N
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
S
E
|
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
T
 
S
P
 
P
E
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
L
V
 
I
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
N
T
 
E
V
 
V
R
 
T
P
 
K
T
 
T
V
 
G
P
 
M
A
 
H
A
 
V
D
 
D
F
 
-
E
 
-
Q
 
E
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
 
A
F
 
F
F
|
F
V
 
F
N
 
V
A
 
S
G
 
Q
I
 
G
R
 
D
F
 
F
V
 
F
T
 
E
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
A
 
A
F
 
L
T
 
R
E
 
R
L
 
C
W
 
Y
D
 
A
E
 
K
I
 
I
C
 
M
V
 
K
G
 
E
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
K
 
R
D
 
N
E
 
P
K
 
E
A
 
S
R
 
M
R
 
R
F
 
L
R
|
R
Y
x
F
G
x
H
V
 
C
Q
|
Q
V
 
T
N
 
A
S
x
A
L
 
A
G
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
K
Q
 
P
Q
 
Q
P
 
Y
E
 
M
N
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
S
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
G
K
 
G
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
R
x
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
G
W
 
Y
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
F
G
x
A
L
 
I
P
 
P
R
 
T
P
 
E
W
 
D
D
 
A
Q
 
M
Q
 
K
W
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
A
 
A
Y
 
E
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
D
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
L
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
A
K
 
L
V
 
T
E
 
T
A
 
E
L
 
Y
K
 
E
E
 
K
G
 
K
A
 
I
R
 
F
E
 
E
E
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
T
V
 
I
S
 
K
A
 
L
V
 
I
E
 
E
S
 
Q
S
 
G
Y
 
W
M
 
F
K
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
L
 
I
V
 
A
E
 
D
S
 
F
N
 
A
A
 
Y
R
 
E
R
 
T
I
 
A
G
 
L
A
 
R
I
 
K
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
I
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
R
W
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
N
E
 
E
P
 
E
S
 
D
P
 
V
L
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
I
S
 
E
I
 
I
M
 
H
T
 
P
V
 
Y
D
 
D
P
 
N
K
 
T
A
 
T
E
 
A
A
 
E
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
T
K
 
R
A
 
R
F
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
E
K
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
Q
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
R
 
V
S
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
K
N
 
D
E
 
E
G
 
S
R
 
Q
N
 
N
V
 
L
M
 
M
E
 
P
P
 
L
S
 
T
I
 
I
A
 
E
A
 
L
A
 
V
H
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
T
T
 
M
G
 
G
E
 
D
W
 
I
A
 
V
Q
 
E
C
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
G
V
 
I
F
 
W
G
 
G
E
 
T
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

I3VE77 2-hydroxyisobutanoyl-CoA mutase large subunit; 2-hydroxyisobutyryl-CoA mutase large subunit; HCM large subunit; EC 5.4.99.64 from Aquincola tertiaricarbonis (see 2 papers)
31% identity, 73% coverage: 14:498/665 of query aligns to 81:557/562 of I3VE77

query
sites
I3VE77
R
 
R
E
 
S
K
 
R
P
 
T
W
 
W
L
x
T
F
x
M
R
|
R
T
 
Q
Y
x
I
S
 
A
G
 
G
H
 
F
S
 
G
S
 
T
A
 
G
A
 
E
E
 
D
S
 
T
N
 
N
K
 
K
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
Y
N
 
L
L
 
I
T
 
A
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
I
S
 
S
I
 
T
A
x
D
F
 
F
D
 
D
L
 
M
P
 
P
T
 
T
Q
 
L
T
 
M
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
P
L
 
M
A
 
S
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
R
V
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
A
V
 
I
C
 
D
H
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
D
M
 
M
M
 
E
T
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
A
G
 
D
I
 
I
P
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
N
 
S
T
 
V
S
 
S
M
 
F
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
-
P
 
P
A
 
S
A
 
A
W
 
W
-
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
R
G
 
G
A
 
Y
N
 
D
R
 
L
S
 
N
V
 
K
L
 
L
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
x
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
L
 
M
S
 
A
R
 
Q
G
 
K
T
 
E
Y
 
Y
I
 
I
F
 
Y
A
 
P
P
 
I
Q
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
V
K
 
R
L
 
I
T
 
V
G
 
R
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
Y
T
 
S
Y
 
A
R
 
K
E
 
N
V
 
L
P
 
K
K
x
R
W
 
Y
N
 
N
P
 
P
M
 
I
N
|
N
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
 
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
T
 
S
P
 
P
E
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
L
V
 
I
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
N
T
 
E
V
 
V
R
 
T
P
 
K
T
 
T
V
 
G
P
 
M
A
 
H
A
 
V
D
 
D
F
 
-
E
 
-
Q
 
E
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
|
R
I
 
L
S
 
A
F
 
F
F
 
F
V
 
F
N
 
V
A
 
S
G
 
Q
I
 
G
R
 
D
F
 
F
V
 
F
T
 
E
E
 
E
L
 
V
C
 
A
K
 
K
M
 
F
R
 
R
A
 
A
F
 
L
T
 
R
E
 
R
L
 
C
W
 
Y
D
 
A
E
 
K
I
 
I
C
 
M
V
 
K
G
 
E
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
V
 
A
K
 
R
D
 
N
E
 
P
K
 
E
A
 
S
R
 
M
R
 
R
F
 
L
R
 
R
Y
 
F
G
 
H
V
 
C
Q
 
Q
V
 
T
N
 
A
S
 
A
L
 
A
G
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
K
Q
 
P
Q
 
Q
P
 
Y
E
 
M
N
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
V
R
 
R
I
 
T
V
 
S
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
G
K
 
G
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
Q
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
G
W
 
Y
N
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
A
L
 
I
P
 
P
R
 
T
P
 
E
W
 
D
D
 
A
Q
 
M
Q
 
K
W
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
M
 
I
A
 
A
Y
 
E
E
 
E
T
 
S
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
D
F
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
P
F
 
L
D
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Y
E
 
Y
I
 
V
T
 
E
R
 
A
K
 
L
V
 
T
E
 
T
A
 
E
L
 
Y
K
 
E
E
 
K
G
 
K
A
 
I
R
 
F
E
 
E
E
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
K
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
T
V
 
I
S
 
K
A
 
L
V
 
I
E
 
E
S
 
Q
S
 
G
Y
 
W
M
 
F
K
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
L
 
I
V
 
A
E
 
D
S
 
F
N
 
A
A
 
Y
R
 
E
R
 
T
I
 
A
G
 
L
A
 
R
I
 
K
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
I
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
R
W
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
N
E
 
E
P
 
E
S
 
D
P
 
V
L
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
I
S
 
E
I
 
I
M
 
H
T
 
P
V
 
Y
D
 
D
P
 
N
K
 
T
A
 
T
E
 
A
A
 
E
E
 
R
Q
 
Q
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
T
K
 
R
A
 
R
F
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
E
K
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
Q
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
R
 
V
S
 
A
A
 
V
A
 
A
-
 
K
N
 
D
E
 
E
G
 
S
R
 
Q
N
 
N
V
 
L
M
 
M
E
 
P
P
 
L
S
 
T
I
 
I
A
 
E
A
 
L
A
 
V
H
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
A
T
 
T
T
 
M
G
 
G
E
 
D
W
 
I
A
 
V
Q
 
E
C
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
G
V
 
I
F
 
W
G
 
G
E
 
T
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q1LRY0 Fused isobutyryl-CoA mutase; EC 5.4.99.13; EC 3.6.5.- from Cupriavidus metallidurans (strain ATCC 43123 / DSM 2839 / NBRC 102507 / CH34) (Ralstonia metallidurans) (see 2 papers)
26% identity, 72% coverage: 21:498/665 of query aligns to 596:1090/1093 of Q1LRY0

query
sites
Q1LRY0
R
 
R
T
 
M
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
F
E
 
R
S
 
T
N
 
N
K
 
R
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
-
L
 
V
T
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
G
 
A
-
 
K
-
x
R
L
 
L
S
 
S
I
 
T
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
S
P
 
V
T
 
T
Q
 
L
T
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
-
 
P
S
 
H
D
 
E
H
 
R
V
 
P
L
 
D
A
 
I
K
 
Y
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
V
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
S
V
 
I
C
 
A
H
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
D
M
 
M
M
 
K
T
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
F
P
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
N
M
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
P
W
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
F
I
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
D
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
I
N
 
D
R
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
V
-
 
L
S
 
Q
V
 
N
L
 
V
N
x
R
G
 
G
T
 
T
T
 
V
Q
 
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
D
L
 
Q
S
 
G
R
 
Q
G
 
N
T
 
T
Y
 
C
I
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
T
Q
 
E
P
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
Q
A
 
E
-
 
Y
F
 
F
T
 
V
Y
 
H
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
P
 
R
K
 
N
W
 
F
N
x
Y
P
 
S
M
 
V
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
 
Y
H
 
H
L
 
I
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
P
 
P
E
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
G
V
 
F
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
Y
R
 
-
P
 
-
T
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
M
D
 
H
F
 
I
E
 
D
Q
 
D
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
N
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
 
F
V
 
F
N
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
D
F
 
P
V
 
E
T
 
Y
E
 
S
L
 
V
C
 
L
K
 
G
M
 
-
R
 
R
A
 
V
F
 
A
T
 
R
E
 
R
L
 
I
W
 
W
D
 
A
E
 
V
I
 
T
C
 
M
V
 
R
G
 
D
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
K
 
N
D
 
D
E
 
-
K
x
R
A
 
S
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
R
x
K
Y
 
Y
G
 
H
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
 
G
L
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
I
E
 
D
N
 
F
N
 
N
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
I
 
T
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
D
K
 
N
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
C
R
 
N
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
Y
N
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
T
L
 
T
P
 
P
R
 
T
P
 
A
W
 
E
D
 
S
Q
 
V
Q
 
R
W
 
R
S
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
I
M
 
I
A
 
N
Y
 
R
E
 
E
T
 
W
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
K
F
 
C
G
 
E
D
 
N
I
 
P
F
 
N
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
F
E
 
L
I
 
I
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
D
A
 
L
L
 
V
K
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
L
 
F
A
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
A
A
 
E
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
L
S
 
G
A
 
A
V
 
M
E
|
E
S
 
T
S
 
G
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
R
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
V
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
A
 
L
R
 
Y
R
 
Y
I
 
E
G
 
Q
A
 
L
I
 
K
E
 
H
T
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
N
T
 
P
-
 
N
-
 
G
E
 
D
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
T
 
L
G
 
-
E
 
E
G
 
L
S
 
A
I
 
R
M
 
S
T
 
S
V
 
E
D
 
D
P
 
E
K
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
E
F
 
F
R
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
H
D
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
-
D
 
E
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
N
 
I
E
 
D
G
 
N
R
 
R
N
 
N
V
 
V
M
 
F
E
 
A
P
 
V
S
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
A
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
-
V
 
C
T
 
S
T
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
I
A
 
T
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
R
 
F
D
 
E
V
 
V
F
 
G
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5cjtA Isobutyryl-coa mutase fused with bound adenosylcobalamin, gdp, mg (holo-icmf/gdp), and substrate isobutyryl-coenzyme a (see paper)
26% identity, 72% coverage: 21:498/665 of query aligns to 567:1059/1062 of 5cjtA

query
sites
5cjtA
R
|
R
T
 
M
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
F
E
 
R
S
 
T
N
 
N
K
 
R
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
-
L
 
V
T
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
G
 
A
-
 
K
-
x
R
L
 
L
S
 
S
I
 
T
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
 
S
P
 
V
T
 
T
Q
x
L
T
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
-
 
P
S
 
H
D
 
E
H
 
R
V
 
P
L
 
D
A
 
I
K
 
Y
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
V
x
S
G
 
G
V
 
V
P
 
S
V
 
I
C
 
A
H
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
D
M
 
M
M
 
K
T
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
F
P
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
N
M
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
S
-
 
V
-
x
S
M
 
M
T
|
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
P
W
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
F
I
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
D
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
I
N
 
D
R
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
V
-
 
L
S
 
Q
V
 
N
L
 
V
N
x
R
G
 
G
T
|
T
T
 
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
D
L
 
Q
S
 
G
R
x
Q
G
 
N
T
 
T
Y
 
C
I
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
T
Q
 
E
P
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
Q
A
 
E
-
 
Y
F
 
F
T
 
V
Y
 
H
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
P
 
R
K
 
N
W
 
F
N
x
Y
P
 
S
M
 
V
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
A
E
|
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
P
 
P
E
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
G
V
 
F
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
Y
R
 
-
P
 
-
T
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
M
D
 
H
F
 
I
E
 
D
Q
 
D
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
N
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
F
N
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
D
F
 
P
V
 
E
T
 
Y
E
 
S
L
 
V
C
 
L
K
 
G
M
 
-
R
 
R
A
 
V
F
 
A
T
 
R
E
 
R
L
 
I
W
 
W
D
 
A
E
 
V
I
 
T
C
 
M
V
 
R
G
 
D
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
K
 
N
D
 
D
E
 
-
K
x
R
A
 
S
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
R
x
K
Y
 
Y
G
x
H
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
R
G
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
I
E
 
D
N
 
F
N
 
N
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
I
 
T
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
D
K
 
N
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
C
R
 
N
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
Y
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
T
L
 
T
P
 
P
R
 
T
P
 
A
W
 
E
D
 
S
Q
 
V
Q
 
R
W
 
R
S
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
I
M
 
I
A
 
N
Y
 
R
E
 
E
T
 
W
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
K
F
 
C
G
 
E
D
 
N
I
 
P
F
 
N
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
F
E
 
L
I
 
I
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
D
A
 
L
L
 
V
K
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
L
 
F
A
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
A
A
 
E
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
L
S
 
G
A
 
A
V
 
M
E
|
E
S
 
T
S
 
G
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
R
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
V
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
A
 
L
R
 
Y
R
 
Y
I
 
E
G
 
Q
A
 
L
I
 
K
E
x
H
T
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
N
T
 
P
E
 
N
P
 
G
S
 
D
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
T
 
L
G
 
-
E
 
E
G
 
L
S
 
A
I
 
R
M
 
S
T
 
S
V
 
E
D
 
D
P
 
E
K
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
E
F
 
F
R
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
H
D
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
-
D
 
E
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
N
 
I
E
 
D
G
 
N
R
 
R
N
 
N
V
 
V
M
 
F
E
 
A
P
 
V
S
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
A
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
-
V
 
C
T
 
S
T
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
I
A
 
T
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
R
 
F
D
 
E
V
 
V
F
 
G
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4xc6A Isobutyryl-coa mutase fused with bound adenosylcobalamin, gdp, and mg (holo-icmf/gdp) (see paper)
26% identity, 72% coverage: 21:498/665 of query aligns to 570:1064/1067 of 4xc6A

query
sites
4xc6A
R
 
R
T
 
M
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
F
E
 
R
S
 
T
N
 
N
K
 
R
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
-
L
 
V
T
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
G
 
A
-
 
K
-
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
T
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
 
S
P
 
V
T
 
T
Q
x
L
T
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
-
 
P
S
 
H
D
 
E
H
 
R
V
 
P
L
 
D
A
 
I
K
 
Y
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
V
x
S
G
 
G
V
 
V
P
 
S
V
 
I
C
 
A
H
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
D
M
 
M
M
 
K
T
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
F
P
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
N
M
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
S
-
 
V
-
 
S
M
 
M
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
P
W
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
F
I
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
D
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
I
N
 
D
R
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
V
-
 
L
S
 
Q
V
 
N
L
 
V
N
 
R
G
 
G
T
 
T
T
 
V
Q
 
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
D
L
 
Q
S
 
G
R
x
Q
G
 
N
T
 
T
Y
 
C
I
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
T
Q
 
E
P
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
Q
A
 
E
-
 
Y
F
 
F
T
 
V
Y
 
H
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
P
 
R
K
 
N
W
 
F
N
 
Y
P
 
S
M
 
V
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
A
E
|
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
P
 
P
E
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
G
V
 
F
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
Y
R
 
-
P
 
-
T
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
M
D
 
H
F
 
I
E
 
D
Q
 
D
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
F
 
F
V
 
F
N
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
D
F
 
P
V
 
E
T
 
Y
E
 
S
L
 
V
C
 
L
K
 
G
M
 
-
R
 
R
A
 
V
F
 
A
T
 
R
E
 
R
L
 
I
W
 
W
D
 
A
E
 
V
I
 
T
C
 
M
V
 
R
G
 
D
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
K
 
N
D
 
D
E
 
-
K
 
R
A
 
S
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
R
 
K
Y
 
Y
G
 
H
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
R
G
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
I
E
 
D
N
 
F
N
 
N
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
I
 
T
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
D
K
 
N
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
C
R
 
N
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
Y
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
T
L
 
T
P
 
P
R
 
T
P
 
A
W
 
E
D
 
S
Q
 
V
Q
 
R
W
 
R
S
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
I
M
 
I
A
 
N
Y
 
R
E
 
E
T
 
W
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
K
F
 
C
G
 
E
D
 
N
I
 
P
F
 
N
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
F
E
 
L
I
 
I
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
D
A
 
L
L
 
V
K
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
L
 
F
A
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
A
A
 
E
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
L
S
 
G
A
 
A
V
 
M
E
|
E
S
 
T
S
 
G
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
R
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
V
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
A
 
L
R
 
Y
R
 
Y
I
 
E
G
 
Q
A
 
L
I
 
K
E
x
H
T
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
N
T
 
P
-
 
N
-
 
G
E
 
D
P
 
P
S
 
T
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
T
 
L
G
 
-
E
 
E
G
 
L
S
 
A
I
 
R
M
 
S
T
 
S
V
 
E
D
 
D
P
 
E
K
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
E
F
 
F
R
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
H
D
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
-
D
 
E
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
N
 
I
E
 
D
G
 
N
R
 
R
N
 
N
V
 
V
M
 
F
E
 
A
P
 
V
S
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
A
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
-
V
 
C
T
 
S
T
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
I
A
 
T
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
R
 
F
D
 
E
V
 
V
F
 
G
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5cjvA Isobutyryl-coa mutase fused with bound adenosylcobalamin, gdp, mg (holo-icmf/gdp), and substrate isovaleryl-coenzyme a (see paper)
26% identity, 72% coverage: 21:498/665 of query aligns to 567:1058/1061 of 5cjvA

query
sites
5cjvA
R
|
R
T
 
M
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
F
E
 
R
S
 
T
N
 
N
K
 
R
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
-
L
 
V
T
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
G
 
A
-
 
K
-
x
R
L
 
L
S
 
S
I
 
T
A
 
A
F
|
F
D
 
D
L
 
S
P
 
V
T
 
T
Q
x
L
T
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
-
 
P
S
 
H
D
 
E
H
 
R
V
 
P
L
 
D
A
 
I
K
 
Y
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
V
x
S
G
 
G
V
 
V
P
 
S
V
 
I
C
 
A
H
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
D
M
 
M
M
 
K
T
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
F
P
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
N
M
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
S
-
 
V
-
x
S
M
 
M
T
|
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
P
W
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
F
I
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
D
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
I
N
 
D
R
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
V
-
 
L
S
 
Q
V
 
N
L
 
V
N
x
R
G
 
G
T
|
T
T
 
V
Q
|
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
D
L
 
Q
S
 
G
R
x
Q
G
 
N
T
 
T
Y
 
C
I
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
T
Q
 
E
P
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
Q
A
 
E
-
 
Y
F
 
F
T
 
V
Y
 
H
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
P
 
R
K
 
N
W
 
F
N
x
Y
P
 
S
M
 
V
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
A
E
|
E
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
P
 
P
E
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
G
V
 
F
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
Y
R
 
-
P
 
-
T
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
M
D
 
H
F
 
I
E
 
D
Q
 
D
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
N
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
F
N
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
D
F
 
P
V
 
E
T
 
Y
E
 
S
L
 
V
C
 
L
K
 
G
M
 
-
R
 
R
A
 
V
F
 
A
T
 
R
E
 
R
L
 
I
W
 
W
D
 
A
E
 
V
I
 
T
C
 
M
V
 
R
G
 
D
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
K
 
N
D
 
D
E
 
-
K
 
R
A
 
S
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
R
x
K
Y
 
Y
G
x
H
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
x
G
L
x
R
G
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
I
E
 
D
N
 
F
N
 
N
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
I
 
T
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
D
K
 
N
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
C
R
 
N
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
Y
N
 
D
E
|
E
A
|
A
L
 
I
G
x
T
L
 
T
P
 
P
R
 
T
P
 
A
W
 
E
D
 
S
Q
 
V
Q
 
R
W
 
R
S
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
I
M
 
I
A
 
N
Y
 
R
E
 
E
T
 
W
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
K
F
 
C
G
 
E
D
 
N
I
 
P
F
 
N
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
F
E
 
L
I
 
I
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
D
A
 
L
L
 
V
K
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
L
 
F
A
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
A
A
 
E
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
L
S
 
G
A
 
A
V
 
M
E
|
E
S
 
T
S
 
G
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
R
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
V
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
A
 
L
R
 
Y
R
 
Y
I
 
E
G
 
Q
A
 
L
I
 
K
E
x
H
T
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
T
W
 
F
T
 
-
E
 
-
T
 
R
E
 
N
P
 
P
S
 
N
P
 
G
L
 
D
T
 
Q
T
 
T
G
 
L
E
 
E
G
 
L
S
 
A
I
 
R
M
 
S
T
 
S
V
 
E
D
 
D
P
 
E
K
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
E
F
 
F
R
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
H
D
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
-
D
 
E
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
N
 
I
E
 
D
G
 
N
R
 
R
N
 
N
V
 
V
M
 
F
E
 
A
P
 
V
S
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
A
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
-
V
 
C
T
 
S
T
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
I
A
 
T
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
R
 
F
D
 
E
V
 
V
F
 
G
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4xc7A Isobutyryl-coa mutase fused with bound butyryl-coa and without cobalamin or gdp (apo-icmf) (see paper)
25% identity, 72% coverage: 21:498/665 of query aligns to 564:1050/1053 of 4xc7A

query
sites
4xc7A
R
|
R
T
 
M
Y
x
F
S
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
G
S
 
D
A
 
A
A
 
F
E
 
R
S
 
T
N
 
N
K
 
R
L
 
R
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
N
 
-
L
 
V
T
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
G
 
A
-
 
K
-
x
R
L
 
L
S
 
S
I
 
T
A
 
A
F
 
F
D
 
D
L
 
S
P
 
V
T
 
T
Q
 
L
T
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
-
 
P
S
 
H
D
 
E
H
 
R
V
 
P
L
 
D
A
 
I
K
 
Y
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
V
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
S
V
 
I
C
 
A
H
 
T
L
 
L
G
 
E
D
 
D
M
 
M
M
 
K
T
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
F
P
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
N
M
 
P
N
 
S
T
 
T
S
 
S
-
 
V
-
x
S
M
 
M
T
|
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
P
W
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
M
Y
 
F
I
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
D
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
I
N
 
D
R
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
V
-
 
L
S
 
Q
V
 
N
L
 
V
N
x
R
G
 
G
T
|
T
T
 
V
Q
 
Q
N
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
D
L
 
Q
S
 
G
R
 
Q
G
 
N
T
 
T
Y
 
C
I
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
T
Q
 
E
P
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
V
T
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
Q
A
 
E
-
 
Y
F
 
F
T
 
V
Y
 
H
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
P
 
R
K
 
N
W
 
F
N
x
Y
P
 
S
M
 
V
N
 
S
V
 
I
C
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
L
 
I
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
N
P
 
P
E
 
I
Q
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
N
A
 
G
V
 
F
A
 
T
V
 
Y
L
 
V
D
 
E
T
 
A
V
 
Y
R
 
-
P
 
-
T
 
L
V
 
A
P
 
R
A
 
G
A
 
M
D
 
H
F
 
I
E
 
D
Q
 
D
V
 
F
V
 
A
S
 
P
R
 
N
I
 
L
S
|
S
F
 
F
F
|
F
V
 
F
N
 
S
A
 
N
G
 
G
I
 
M
R
 
D
F
 
P
V
 
E
T
 
Y
E
 
S
L
 
V
C
 
L
K
 
G
M
 
-
R
 
R
A
 
V
F
 
A
T
 
R
E
 
R
L
 
I
W
 
W
D
 
A
E
 
V
I
 
T
C
 
M
V
 
R
G
 
D
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
K
 
N
D
 
D
E
 
-
K
x
R
A
 
S
R
 
Q
R
 
K
F
 
L
R
x
K
Y
 
Y
G
x
H
V
 
I
Q
 
Q
V
 
T
N
 
S
S
 
G
L
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
H
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
P
 
I
E
 
D
N
 
F
N
 
N
V
 
D
Y
 
I
R
 
R
I
 
T
V
 
T
M
 
L
E
 
Q
M
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
S
 
D
K
 
N
N
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
C
R
 
N
A
 
S
V
 
L
Q
 
H
L
 
T
P
 
N
A
 
A
W
 
Y
N
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
I
G
 
T
L
 
T
P
 
P
R
 
T
P
 
A
W
 
E
D
 
S
Q
 
V
Q
 
R
W
 
R
S
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
I
M
 
I
A
 
N
Y
 
R
E
 
E
T
 
W
D
 
G
L
 
V
L
 
A
E
 
K
F
 
C
G
 
E
D
 
N
I
 
P
F
 
N
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
H
 
F
E
 
L
I
 
I
T
 
E
R
 
E
K
 
L
V
 
T
E
 
D
A
 
L
L
 
V
K
 
E
E
 
E
G
 
A
A
 
V
R
 
L
E
 
Q
E
 
E
L
 
F
A
 
E
R
 
R
I
 
I
D
 
A
A
 
E
M
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
L
S
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
E
S
 
T
S
 
G
Y
 
Y
M
 
Q
K
 
R
Q
 
G
K
 
K
L
 
I
V
 
Q
E
 
E
S
 
E
N
 
S
A
 
L
R
 
Y
R
 
Y
I
 
E
G
 
Q
A
 
L
I
 
K
E
 
H
T
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
I
G
 
G
V
 
V
N
 
N
K
 
T
W
 
F
T
 
R
E
 
N
T
 
P
E
 
N
P
 
G
S
 
D
P
 
P
L
 
R
T
 
S
T
 
S
G
 
E
E
 
D
G
 
-
S
 
-
I
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
E
E
 
K
A
 
Q
E
 
S
Q
 
Q
I
 
L
E
 
H
R
 
R
L
 
L
K
 
T
A
 
E
F
 
F
R
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
H
D
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
-
D
 
E
K
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
N
 
I
E
 
D
G
 
N
R
 
R
N
 
N
V
 
V
M
 
F
E
 
A
P
 
V
S
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
A
 
V
H
 
R
A
 
V
G
 
-
V
 
C
T
 
S
T
 
L
G
 
G
E
 
Q
W
 
I
A
 
T
Q
 
H
C
 
A
L
 
L
R
 
F
D
 
E
V
 
V
F
 
G
G
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011382757.1 AMB_RS01570 protein meaA
MTDKTAREAAAPSREKPWLFRTYSGHSSAAESNKLYRTNLTKGQTGLSIAFDLPTQTGYD
SDHVLAKGEVGKVGVPVCHLGDMMTLFEGIPLEKMNTSMTINAPAAWLLSLYIAAAERQG
ANRSVLNGTTQNDVIKEYLSRGTYIFAPQPSLKLTGDVIAFTYREVPKWNPMNVCSYHLQ
EAGATPEQELAYALATAVAVLDTVRPTVPAADFEQVVSRISFFVNAGIRFVTELCKMRAF
TELWDEICVGRYGVKDEKARRFRYGVQVNSLGLTEQQPENNVYRIVMEMLAVVLSKNARA
RAVQLPAWNEALGLPRPWDQQWSLRLQQIMAYETDLLEFGDIFDGSHEITRKVEALKEGA
REELARIDAMGGAVSAVESSYMKQKLVESNARRIGAIETGEQIVVGVNKWTETEPSPLTT
GEGSIMTVDPKAEAEQIERLKAFRAARDAKAVDKALAELRSAANEGRNVMEPSIAAAHAG
VTTGEWAQCLRDVFGEYRAPTGVARAAAEVKGEKMGAVRAKVEAVSAKLGRRVKILVGKP
GLDGHSNGAEQIAVRARDAGMEVVYEGIRLTPAQIVNAALEEGVHVVGLSILSGSHVPLV
TEVLERMKAAGLSDIPVVAGGIIPPEDEKVLLAAGCARIYTPKDYDITAIMGDIVALLDA
SPKAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory