SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011383023.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011383023.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wd1A Acetoacetyl-coa synthetase from streptomyces lividans (see paper)
42% identity, 99% coverage: 5:650/652 of query aligns to 4:641/646 of 4wd1A

query
sites
4wd1A
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
S
 
D
K
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
I
E
 
A
A
 
Q
S
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
T
R
 
R
F
 
F
M
 
Q
R
 
A
R
 
W
A
 
A
D
 
A
A
 
E
R
 
H
F
 
H
Q
 
G
V
 
A
G
 
P
A
 
A
T
 
E
D
 
G
-
 
G
Y
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
L
W
 
H
R
 
R
W
 
W
S
 
S
V
 
V
D
 
D
R
 
E
P
 
L
D
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
K
L
 
A
V
 
V
W
 
T
D
 
E
E
 
W
V
 
F
G
 
D
I
 
V
I
 
R
G
 
F
D
 
S
R
 
T
P
 
P
D
 
Y
G
 
A
G
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
G
D
|
D
D
 
R
A
x
T
G
 
-
R
 
-
M
 
M
P
|
P
G
|
G
A
 
A
R
 
Q
W
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
H
L
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
T
R
 
R
D
 
P
D
 
D
G
 
E
G
 
-
D
 
P
A
 
A
L
 
L
V
 
L
F
 
Y
W
 
V
G
 
D
E
 
E
D
 
T
K
 
H
V
 
E
K
 
P
R
 
A
R
 
P
L
 
V
S
 
T
F
 
W
A
 
A
E
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
Q
V
 
V
S
 
A
R
 
S
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
R
A
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
R
K
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
N
 
N
M
 
I
P
 
P
E
 
Q
S
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
G
I
 
V
W
 
W
S
 
T
S
 
S
A
 
C
S
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
A
Q
 
R
G
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
R
 
R
F
 
F
G
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
A
 
E
P
 
P
K
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
F
A
 
T
A
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
F
 
R
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
E
H
 
H
D
 
D
C
 
R
L
 
R
E
 
D
K
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
R
P
 
R
G
 
E
I
 
L
P
 
P
S
 
T
L
 
L
E
 
R
R
 
A
V
 
V
V
 
I
V
 
H
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
T
 
L
R
 
G
E
 
T
A
 
E
A
 
A
D
 
P
L
 
D
S
 
G
G
 
T
V
 
L
D
 
D
K
 
W
A
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
E
F
 
T
L
 
L
A
 
T
P
 
A
F
 
A
P
 
D
A
 
A
K
 
E
A
 
P
V
 
V
E
 
-
F
 
Y
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
W
I
 
V
M
 
L
Y
 
Y
S
|
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
P
K
 
K
C
 
A
I
 
I
V
 
V
H
 
Q
S
 
S
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
S
 
I
L
 
L
I
 
V
Q
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
K
E
 
Q
H
 
L
R
 
G
L
 
L
H
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
L
R
 
G
K
 
P
D
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
F
F
 
F
Y
 
W
F
 
Y
T
 
T
T
 
S
C
 
T
G
 
G
W
 
W
M
 
M
M
 
M
W
 
W
N
 
N
W
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
L
A
 
T
E
 
G
A
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
N
 
S
P
 
P
S
 
G
H
 
F
L
 
P
G
 
A
G
 
T
N
 
D
I
 
A
L
 
Q
F
 
W
D
 
R
F
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
R
E
 
T
G
 
G
M
 
A
T
 
T
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
K
 
A
W
 
Y
I
 
V
D
 
M
A
 
A
I
 
C
A
 
R
K
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
H
P
 
P
I
 
A
K
 
R
T
 
D
H
 
L
S
 
D
L
 
L
A
 
S
T
 
A
V
 
I
R
 
Q
T
 
C
I
 
V
C
 
A
S
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
P
L
 
L
A
 
P
P
 
P
E
 
D
G
 
G
F
 
F
D
 
R
Y
 
W
V
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
Y
 
F
A
 
A
K
 
A
V
 
G
K
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
Q
 
W
L
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
|
D
I
 
V
I
 
C
S
 
S
C
 
C
F
 
F
M
 
A
L
 
G
G
 
A
N
 
V
P
 
P
L
 
T
V
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
H
R
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
C
 
A
R
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
T
K
 
D
V
 
L
E
 
Q
V
 
S
F
 
W
D
 
D
E
 
P
N
 
S
G
 
G
Q
 
D
S
 
P
L
 
L
A
 
T
G
 
D
S
 
E
K
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
C
 
V
T
 
T
R
 
N
A
 
P
F
 
M
P
 
P
S
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
G
 
R
F
 
F
W
 
W
N
 
N
D
 
D
D
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
S
K
 
R
Y
 
Y
R
 
H
A
 
D
A
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
D
K
 
T
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
W
 
W
T
 
R
H
 
H
G
 
G
D
 
D
W
 
W
V
 
I
E
 
T
L
 
L
N
 
T
P
 
-
E
 
S
T
 
R
G
 
G
G
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
I
F
 
H
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
A
 
S
T
 
T
L
 
L
N
|
N
P
 
-
G
 
-
G
 
R
V
 
V
R
|
R
I
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
A
E
 
D
I
 
I
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
A
V
 
V
E
|
E
Q
 
R
I
x
L
D
 
P
D
 
E
V
x
I
L
 
R
E
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
D
 
E
W
 
Y
Q
 
W
A
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
M
V
 
P
L
 
L
F
 
F
V
 
V
R
 
H
L
 
L
R
 
A
D
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
D
P
 
D
E
 
A
L
 
L
E
 
L
T
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
K
K
 
R
R
 
T
I
 
I
R
 
R
D
 
V
N
 
N
T
 
L
T
 
S
P
 
P
R
 
R
H
 
H
V
 
V
P
 
P
A
 
D
K
 
E
V
 
V
V
 
I
Q
 
E
V
 
V
A
 
P
D
 
G
I
 
I
P
 
P
R
 
H
T
 
T
K
 
L
S
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
R
V
 
I
E
 
E
L
 
V
A
 
P
V
 
V
R
 
K
D
 
R
V
 
L
V
 
L
H
 
Q
G
 
G
R
 
T
A
 
P
V
 
L
K
 
D
N
 
K
K
 
A
E
 
V
A
 
N
L
 
P
A
 
G
N
 
S
P
 
I
E
 
D
A
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
H
G
 
F
R
 
Y
A
 
E
E
 
E
L
 
L

P9WQD1 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
30% identity, 87% coverage: 78:642/652 of query aligns to 63:645/651 of P9WQD1

query
sites
P9WQD1
P
 
P
G
 
F
A
 
A
R
 
K
W
 
W
F
 
F
P
 
V
E
 
G
A
 
G
R
 
E
L
 
L
N
 
N
F
 
V
A
 
A
E
 
Y
N
 
N
L
 
C
L
 
V
R
 
D
R
 
R
D
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
G
D
 
H
G
 
G
G
 
D
D
 
R
A
 
V
L
 
A
V
 
I
F
 
H
W
 
W
G
 
E
E
 
G
D
 
E
K
 
P
V
 
V
-
 
G
-
 
D
K
 
R
R
 
R
R
 
T
L
 
L
S
 
T
F
 
Y
A
 
S
E
 
D
L
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
E
V
 
V
S
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
A
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
T
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
L
G
 
V
K
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
N
 
L
M
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
A
V
 
V
A
 
I
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
I
I
 
M
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
V
S
 
F
P
 
G
D
 
G
F
 
F
G
 
T
V
 
A
Q
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
Q
D
 
A
R
 
R
F
 
I
G
 
V
Q
 
D
I
 
A
A
 
Q
P
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
G
Y
 
Q
F
 
F
Y
 
R
S
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
P
H
 
S
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
A
K
 
A
L
 
A
A
 
D
A
 
E
I
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
A
I
 
I
P
 
P
-
 
D
-
 
C
S
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
H
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
R
Y
 
R
T
 
T
R
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
I
D
 
E
K
 
M
A
 
A
V
 
W
H
 
S
L
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
D
L
 
L
-
 
W
-
 
W
-
 
H
-
 
H
-
 
V
-
 
V
-
 
G
A
 
S
P
 
A
F
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
H
A
 
T
V
 
P
E
 
E
F
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
P
F
 
F
D
 
D
-
 
S
-
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
L
M
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
K
P
 
P
K
 
K
C
 
G
I
 
I
V
 
M
H
 
H
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
T
Q
 
Q
Q
 
C
L
 
C
K
 
Y
E
 
T
H
 
M
R
 
R
L
 
T
H
 
I
C
 
F
D
 
D
V
 
V
R
 
K
K
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
D
V
 
V
F
 
F
Y
 
W
F
 
C
T
 
T
T
 
A
-
 
D
C
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
V
M
 
T
W
 
G
N
 
H
W
 
T
-
 
Y
-
 
G
L
 
V
V
 
Y
A
 
G
G
 
P
L
 
L
G
 
C
A
 
N
E
 
G
A
 
V
T
 
T
L
 
E
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
N
 
T
P
 
P
S
 
D
H
 
T
L
 
P
G
 
D
G
 
R
N
 
H
I
 
R
L
 
H
F
 
F
D
 
Q
F
 
I
A
 
I
D
 
E
A
 
K
E
 
Y
G
 
G
M
 
V
T
 
T
L
 
I
F
 
Y
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
L
I
 
I
D
 
R
A
 
M
I
 
F
A
 
M
K
 
K
S
 
W
G
 
G
L
 
R
E
 
E
P
 
I
I
 
P
K
 
D
T
 
S
H
 
H
S
 
D
L
 
L
A
 
S
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
E
V
 
P
L
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
W
D
 
R
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
R
A
 
D
K
 
V
V
 
I
K
 
G
A
 
G
D
 
G
-
 
R
V
 
T
Q
 
P
L
 
L
A
 
V
S
 
D
I
 
T
S
 
W
G
 
W
G
 
Q
T
 
T
D
 
E
I
 
T
I
 
G
S
 
S
C
 
A
F
 
M
M
 
I
L
 
S
G
 
P
N
 
L
P
 
P
L
 
G
V
 
I
P
 
A
V
 
A
Y
 
A
R
 
K
-
 
P
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
M
C
 
T
R
 
P
G
 
L
L
 
P
G
 
G
M
 
I
K
 
S
V
 
A
E
 
K
V
 
I
F
 
V
D
 
D
E
 
D
N
 
H
G
 
G
Q
 
D
S
 
P
L
 
L
A
 
P
G
 
P
S
 
H
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
V
K
 
T
G
 
G
E
 
Y
L
 
L
V
 
V
C
 
L
T
 
D
R
 
Q
A
 
P
F
 
W
P
 
P
S
 
S
M
 
M
P
 
L
V
 
R
G
 
G
F
 
I
W
 
W
N
 
G
D
 
D
D
 
P
D
 
-
G
 
-
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
R
 
W
A
 
H
A
 
S
Y
 
Y
F
 
W
E
 
S
K
 
K
F
 
F
P
 
S
-
 
D
-
 
K
G
 
G
I
 
Y
W
 
Y
T
 
F
H
 
A
G
 
G
D
 
D
W
 
G
V
 
A
E
 
R
L
 
I
N
 
D
P
 
P
E
 
D
T
 
-
G
 
G
G
 
A
I
 
I
I
 
W
V
 
V
F
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
I
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
M
N
 
N
P
 
V
G
 
S
G
 
G
V
 
H
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
V
Y
 
E
R
 
S
Q
 
A
V
 
L
E
 
V
Q
 
A
I
 
H
D
 
S
D
 
G
V
 
V
L
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
V
Q
 
T
D
 
D
W
 
E
Q
 
T
A
 
T
D
 
T
V
 
Q
R
 
A
V
 
I
V
 
C
L
 
A
F
 
F
V
 
V
R
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
A
G
 
N
V
 
Y
T
 
A
L
 
P
S
 
H
P
 
D
E
 
R
L
 
T
E
 
A
T
 
E
R
 
E
I
 
L
K
 
R
K
 
T
R
 
E
I
 
V
R
 
A
D
 
R
N
 
V
T
 
I
T
 
S
P
 
P
R
 
I
H
 
A
V
 
R
P
 
P
A
 
R
K
 
D
V
 
V
V
 
H
Q
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
E
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
L
V
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
A
H
 
E
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
K
 
G
N
 
D
K
 
T
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
T
A
 
V
L
 
F
D
 
D

P78773 Probable acetyl-coenzyme A synthetase; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
27% identity, 93% coverage: 35:642/652 of query aligns to 34:648/662 of P78773

query
sites
P78773
D
 
E
Y
 
Y
A
 
K
G
 
R
L
 
M
W
 
Y
R
 
E
W
 
E
S
 
S
V
 
I
D
 
N
R
 
D
P
 
P
D
 
S
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
G
-
 
N
-
 
M
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
M
L
 
M
V
 
T
W
 
W
D
 
D
E
 
K
V
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
Q
G
 
F
G
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
Q
D
 
G
A
 
S
G
 
I
R
 
D
M
 
K
P
 
A
G
 
D
A
 
S
R
 
A
W
 
W
F
 
F
P
 
A
E
 
D
A
 
G
R
 
A
L
 
I
N
 
S
F
 
P
A
 
C
E
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
V
R
 
D
R
 
R
D
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
R
D
 
P
G
 
D
G
 
A
D
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
F
 
Y
W
 
E
G
 
A
E
 
D
D
 
E
K
 
P
V
 
N
K
 
Q
-
 
G
R
 
R
R
 
Y
L
 
I
S
 
T
F
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
S
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
L
 
C
Q
 
A
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
A
 
S
A
 
M
G
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
M
M
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
T
V
 
I
A
 
I
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
V
S
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
I
S
 
F
P
 
A
D
 
G
F
 
F
G
 
S
V
 
A
Q
 
E
G
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
D
R
 
R
F
 
V
G
 
N
Q
 
D
I
 
S
A
 
E
P
 
C
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
E
Y
 
S
F
 
H
Y
 
R
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
R
H
 
I
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
G
K
 
V
L
 
V
A
 
N
A
 
K
I
 
A
V
 
L
P
 
T
G
 
E
I
 
C
P
 
P
S
 
T
L
 
I
E
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
V
V
 
F
P
 
Q
Y
 
R
T
 
S
R
 
A
E
 
E
-
 
P
-
 
T
A
 
A
A
 
S
D
 
M
L
 
V
S
 
E
G
 
G
V
 
R
D
 
D
K
 
V
A
 
W
V
 
W
H
 
H
L
 
-
G
 
-
D
 
D
F
 
I
L
 
I
A
 
P
P
 
K
F
 
F
P
 
P
A
 
R
K
 
Y
A
 
C
V
 
P
E
 
P
F
 
A
L
 
V
R
 
V
L
 
N
P
 
P
F
 
-
D
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
L
M
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
K
P
 
P
K
 
K
C
 
G
I
 
V
V
 
V
H
 
H
S
 
C
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
L
Q
 
G
Q
 
A
L
 
A
K
 
A
E
 
T
H
 
C
R
 
K
L
 
Y
H
 
V
C
 
F
D
 
D
V
 
L
R
 
H
K
 
P
D
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
M
F
 
G
Y
 
C
F
 
A
T
 
G
T
 
D
C
 
V
G
 
G
W
 
W
M
 
I
M
 
T
-
 
G
W
 
H
N
 
T
W
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
L
 
L
G
 
M
A
 
L
E
 
G
A
 
A
T
 
A
L
 
T
L
 
L
L
 
V
Y
 
F
D
 
E
G
 
S
N
 
T
P
 
P
S
 
A
H
 
Y
L
 
P
G
 
D
G
 
Y
N
 
S
I
 
R
L
 
Y
F
 
W
D
 
S
F
 
V
A
 
V
D
 
E
A
 
R
E
 
H
G
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
Q
F
 
W
G
 
Y
T
 
I
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
L
I
 
L
A
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
L
 
N
E
 
E
P
 
F
I
 
V
K
 
K
T
 
-
H
 
H
S
 
D
L
 
R
A
 
S
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
V
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
E
V
 
P
L
 
I
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
S
F
 
F
D
 
M
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
Y
A
 
E
K
 
V
V
 
V
K
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
T
Q
 
Y
L
 
W
A
 
Q
S
 
T
I
 
E
S
 
T
G
 
G
G
 
S
T
 
H
D
 
I
I
 
V
I
 
T
S
 
S
C
 
L
F
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
P
 
P
L
 
V
V
 
T
P
 
P
V
 
M
Y
 
K
R
 
P
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
T
C
 
L
R
 
P
G
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
I
K
 
D
V
 
A
E
 
V
V
 
I
F
 
I
D
 
D
E
 
P
-
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
K
S
 
I
L
 
I
A
 
E
G
 
G
S
 
N
-
 
D
-
 
V
K
 
E
G
 
G
E
 
V
L
 
L
V
 
A
C
 
I
T
 
R
R
 
S
A
 
P
F
 
W
P
 
P
S
 
S
M
 
A
P
 
A
V
 
R
G
 
T
F
 
V
W
 
W
N
 
R
D
 
G
D
 
H
D
 
D
G
 
-
A
 
-
K
 
R
Y
 
Y
R
 
I
A
 
D
A
 
T
Y
 
Y
F
 
L
E
 
K
K
 
P
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
F
W
 
Y
T
 
F
H
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
G
V
 
A
E
 
T
L
 
R
N
 
D
P
 
K
E
 
D
T
 
-
G
 
G
G
 
Y
I
 
I
I
 
W
V
 
I
F
 
R
G
 
G
R
 
R
S
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
V
N
 
N
P
 
I
G
 
S
G
 
G
V
 
H
R
 
R
I
 
L
G
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
E
R
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
L
Q
 
S
I
 
H
D
 
D
D
 
A
V
 
V
L
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
-
 
V
Q
 
H
D
 
D
W
 
E
Q
 
L
A
 
T
D
 
G
V
 
Q
R
 
A
V
 
V
V
 
N
L
 
A
F
 
F
V
 
I
R
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
P
G
 
G
V
 
Y
T
 
E
L
 
A
S
 
T
P
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
T
 
K
R
 
E
I
 
L
K
 
I
K
 
M
R
 
A
I
 
V
R
 
R
D
 
S
N
x
T
T
 
I
T
 
G
P
 
P
R
 
F
H
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
R
K
 
K
V
 
L
V
 
I
Q
 
-
V
 
F
A
 
S
D
 
D
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
I
V
 
L
R
 
R
D
 
K
V
 
I
V
 
L
H
 
A
G
 
G
R
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
Q
V
 
I
K
 
G
N
 
D
K
 
L
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
K
A
 
V
L
 
V
D
 
E

Q89WV5 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110) (see paper)
26% identity, 94% coverage: 28:642/652 of query aligns to 15:636/648 of Q89WV5

query
sites
Q89WV5
R
 
R
F
 
A
Q
 
W
V
 
V
G
 
D
A
 
Q
T
 
A
D
 
K
Y
 
Y
A
 
K
G
 
E
L
 
M
W
 
Y
R
 
A
W
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
S
R
 
D
P
 
P
D
 
N
Q
 
G
F
 
F
W
 
W
S
 
A
L
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
Q
G
 
A
I
 
K
I
 
R
G
 
I
D
 
D
R
 
W
P
 
M
D
 
K
G
 
A
G
 
P
V
 
T
V
 
K
V
 
I
D
 
E
D
 
N
A
 
V
G
 
S
R
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
I
R
 
K
W
 
W
F
 
F
P
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
V
L
 
L
N
 
N
F
 
V
A
 
A
E
 
H
N
 
N
L
 
C
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
H
L
 
L
R
 
H
R
 
K
D
 
R
D
 
A
G
 
N
G
 
Q
D
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
 
W
W
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
D
K
 
P
V
 
S
K
 
Q
-
 
S
R
 
R
R
 
H
L
 
I
S
 
T
F
 
Y
A
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
H
A
 
D
L
 
E
V
 
V
S
 
C
R
 
R
L
 
M
Q
 
A
Q
 
N
A
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
T
A
 
R
G
 
N
V
 
V
G
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
T
G
 
I
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
N
 
M
M
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
A
V
 
A
A
 
Y
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
I
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
V
S
 
F
P
 
A
D
 
G
F
 
F
G
 
S
V
 
P
Q
 
D
G
 
S
V
 
L
L
 
A
D
 
Q
R
 
R
F
 
I
G
 
N
Q
 
D
I
 
C
A
 
Q
P
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
E
Y
 
G
F
 
L
Y
 
R
S
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
K
H
 
V
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
A
K
 
N
L
 
V
A
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
L
P
 
A
G
 
K
I
 
A
P
 
D
S
 
G
L
 
V
E
 
D
R
 
W
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
K
Y
 
R
T
 
T
R
 
G
E
 
G
A
 
K
A
 
I
D
 
D
L
 
M
S
 
N
G
 
P
V
 
T
D
 
R
K
 
D
A
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
L
A
 
W
P
 
Y
F
 
H
P
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
M
E
 
V
F
 
T
L
 
T
R
 
E
L
 
C
P
 
P
F
 
V
D
 
E
H
 
H
-
 
M
-
 
H
-
 
A
-
 
E
-
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
I
M
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
G
|
G
T
 
S
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
P
 
P
K
|
K
C
 
G
I
 
V
V
 
L
H
 
H
S
 
T
A
 
S
G
 
A
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
Q
 
A
L
 
A
K
 
M
E
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
Y
H
 
V
C
 
F
D
 
D
V
 
Y
R
 
H
K
 
D
D
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
F
 
W
Y
 
C
F
 
T
T
 
A
T
 
D
C
 
V
G
 
G
W
 
W
M
 
V
M
 
T
-
 
G
W
 
H
N
 
S
W
 
Y
L
 
I
V
 
L
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
L
 
L
G
 
A
A
 
N
E
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
N
 
V
P
 
P
S
 
N
H
 
Y
L
 
P
G
 
D
G
 
N
N
 
S
I
 
R
L
 
F
F
 
W
D
 
N
F
 
V
A
 
I
D
 
D
A
 
K
E
 
H
G
 
K
M
 
V
T
 
N
L
 
T
F
 
F
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
K
 
Q
S
 
G
G
 
G
L
 
D
E
 
E
P
 
P
I
 
V
K
 
K
T
 
K
H
 
T
S
 
S
L
 
R
A
 
A
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
L
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
E
V
 
P
L
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
W
D
 
E
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
H
A
 
R
K
 
V
V
 
V
K
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
C
-
 
P
-
 
I
A
 
V
D
 
D
V
 
T
Q
 
W
L
 
W
A
 
Q
S
 
T
I
x
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
I
D
 
-
I
 
L
I
 
I
S
 
T
C
 
P
F
 
L
M
 
P
L
 
G
G
 
A
N
 
T
P
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
P
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
T
C
 
Q
R
 
P
G
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
V
V
 
P
E
 
E
V
 
I
F
 
V
D
 
D
E
 
A
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
G
-
 
E
S
 
T
K
 
T
G
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
C
C
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
F
 
W
P
 
P
S
 
G
M
 
M
P
 
M
V
 
R
G
 
T
F
 
V
W
 
Y
N
 
G
D
 
D
D
 
H
D
 
-
G
 
-
A
 
A
K
 
R
Y
 
F
R
 
E
A
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
S
K
 
T
F
 
Y
P
 
K
G
 
G
I
 
K
W
 
Y
T
 
F
H
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
G
V
 
C
E
 
R
L
 
R
N
 
D
P
 
A
E
 
D
T
 
-
G
 
G
G
 
Y
I
 
Y
I
 
W
V
 
I
F
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
I
N
 
N
P
 
V
G
 
S
G
 
G
V
 
H
R
 
R
I
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
V
Y
 
E
R
 
S
Q
 
A
V
 
L
E
 
V
Q
 
A
I
 
H
D
 
E
D
 
K
V
 
V
L
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
-
D
 
-
W
 
F
Q
 
P
A
 
H
D
 
D
V
 
I
R
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
V
 
I
V
 
Y
L
 
A
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
M
D
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
L
 
P
S
 
T
P
 
E
E
 
D
L
 
L
E
 
R
T
 
K
R
 
E
I
 
L
K
 
V
K
 
T
R
 
W
I
 
V
R
 
R
D
 
K
N
 
E
T
 
I
T
 
G
P
 
P
R
 
I
H
 
A
V
 
S
P
 
P
A
 
D
K
 
Q
V
 
I
V
 
Q
Q
 
F
V
 
A
A
 
P
D
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
I
V
 
L
R
 
R
D
 
K
V
 
I
V
 
A
H
 
E
G
 
D
R
 
E
-
 
P
-
 
G
A
 
S
V
 
L
K
 
G
N
 
D
K
 
T
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
V
L
 
V
D
 
D

2p20A Acetyl-coa synthetase, r584a mutation (see paper)
26% identity, 94% coverage: 28:638/652 of query aligns to 12:629/641 of 2p20A

query
sites
2p20A
R
 
R
F
 
C
Q
 
L
V
 
I
G
 
N
A
 
P
T
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
G
 
T
L
 
K
W
 
Y
R
 
K
W
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
N
R
 
D
P
 
P
D
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
G
L
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
Q
G
 
G
I
 
K
I
 
I
G
 
L
D
 
D
R
 
W
P
 
I
D
 
T
G
 
P
G
 
Y
V
 
Q
V
 
K
V
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
T
G
 
S
R
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
I
R
 
K
W
 
W
F
 
Y
P
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
T
L
 
L
N
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
N
L
 
C
L
 
L
R
 
D
R
 
R
-
 
H
-
 
L
D
 
Q
D
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
 
W
W
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
D
K
 
T
V
 
S
K
 
Q
-
 
S
R
 
K
R
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
H
A
 
R
L
 
D
V
 
V
S
 
C
R
 
R
L
 
F
Q
 
A
Q
 
N
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
M
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
I
S
 
F
P
 
G
D
 
G
F
 
F
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
A
D
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
I
Q
 
D
I
 
S
A
 
S
P
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
E
Y
 
G
F
 
V
Y
 
R
S
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
S
H
 
I
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
K
K
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
V
P
 
T
S
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
H
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
L
P
 
K
Y
 
R
T
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
W
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
A
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
W
G
 
W
V
 
R
D
 
D
K
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
K
L
 
A
G
 
S
D
 
P
F
 
E
L
 
H
A
 
Q
P
 
P
F
 
E
P
 
A
A
 
M
K
 
N
A
 
A
V
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
H
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
I
M
 
L
Y
 
Y
S
x
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
K
P
 
P
K
 
K
C
 
G
I
 
V
V
 
L
H
 
H
S
 
T
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
Q
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
T
H
 
F
R
 
K
L
 
Y
H
 
V
C
 
F
D
 
D
V
 
Y
R
 
H
K
 
P
D
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
F
 
W
Y
 
C
F
 
T
T
 
A
T
 
D
C
 
V
G
 
G
W
 
W
M
x
V
M
x
T
-
 
G
W
 
H
N
 
S
W
 
Y
L
 
L
V
 
L
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
L
 
L
G
 
A
A
 
C
E
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
N
 
V
P
 
P
S
 
N
H
 
W
L
 
P
G
 
T
G
 
P
N
 
A
I
 
R
L
 
M
F
 
C
D
 
Q
F
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
H
G
 
Q
M
 
V
T
 
N
L
 
I
F
 
L
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
K
 
A
S
 
E
G
 
G
L
 
D
E
 
K
P
 
A
I
 
I
K
 
E
T
 
G
H
 
T
S
 
D
L
 
R
A
 
S
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
I
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
|
G
S
x
E
V
x
P
L
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
W
D
 
E
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
-
 
P
-
 
V
A
 
V
D
|
D
V
x
T
Q
x
W
L
x
W
A
x
Q
S
x
T
I
x
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
F
 
F
M
 
M
L
 
I
G
 
-
N
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
V
 
I
P
 
E
V
 
L
Y
 
K
R
 
A
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
T
C
 
R
R
 
P
G
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
Q
V
 
P
E
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
D
E
 
N
N
 
E
G
 
G
Q
 
H
S
 
P
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
-
 
A
S
 
T
K
 
E
G
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
V
C
 
I
T
 
T
R
 
D
A
 
S
F
 
W
P
 
P
S
 
G
M
 
Q
P
 
A
V
 
R
G
 
T
F
 
L
W
 
F
N
 
G
D
 
D
D
 
H
D
 
E
G
 
-
A
 
-
K
 
R
Y
 
F
R
 
E
A
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
S
K
 
T
F
 
F
P
 
K
G
 
N
I
 
M
W
 
Y
T
 
F
H
 
S
G
 
G
D
|
D
W
 
G
V
 
A
E
 
R
L
 
R
N
 
D
P
 
-
E
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
Y
I
 
Y
I
 
W
V
x
I
F
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
L
N
|
N
P
 
V
G
 
S
G
 
G
V
 
H
R
|
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
E
R
 
S
Q
 
A
V
 
L
E
 
V
Q
 
A
I
 
H
D
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
 
P
W
 
H
Q
 
A
A
 
I
D
 
K
V
 
G
R
 
Q
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
A
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
N
D
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
L
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
T
 
A
R
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
N
R
 
W
I
 
V
R
 
A
D
 
K
N
 
E
T
 
I
T
 
G
P
 
P
R
 
L
H
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
D
K
 
V
V
 
L
V
 
H
Q
 
W
V
 
T
A
 
D
D
 
S
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
I
V
 
L
R
 
R
D
 
K
V
 
I
V
 
A
H
 
A
G
 
G
R
 
D
A
 
T
V
 
S
K
 
N
N
 
D
K
 
T
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
P
 
P

P27550 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 94% coverage: 28:638/652 of query aligns to 16:635/652 of P27550

query
sites
P27550
R
 
R
F
 
C
Q
 
L
V
 
I
G
 
N
A
 
P
T
 
Q
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
G
 
A
L
 
M
W
 
Y
R
 
Q
W
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
N
R
 
V
P
 
P
D
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
G
L
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
Q
G
 
G
I
 
K
I
 
I
G
 
L
D
 
D
R
 
W
P
 
I
D
 
K
G
 
P
G
 
Y
V
 
Q
V
 
K
V
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
T
G
 
S
R
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
I
R
 
K
W
 
W
F
 
Y
P
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
T
L
 
L
N
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
N
L
 
C
L
 
L
R
 
D
R
 
R
-
 
H
-
 
L
D
 
Q
D
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
 
W
W
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
D
K
 
A
V
 
S
K
 
Q
-
 
S
R
 
K
R
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
H
A
 
R
L
 
D
V
 
V
S
 
C
R
 
R
L
 
F
Q
 
A
Q
 
N
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
M
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
I
S
 
F
P
 
G
D
 
G
F
 
F
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
A
D
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
I
Q
 
D
I
 
S
A
 
N
P
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
S
E
 
D
G
 
E
Y
 
G
F
 
V
Y
 
R
S
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
S
H
 
I
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
K
K
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
V
P
 
T
S
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
L
P
 
K
Y
 
R
T
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
W
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
A
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
W
G
 
W
V
 
H
D
 
D
K
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
Q
L
 
A
G
 
S
D
 
D
F
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
Q
V
 
H
E
 
Q
F
 
A
L
 
E
R
 
E
L
 
M
P
 
N
F
 
A
D
 
E
H
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
I
M
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
K
P
 
P
K
 
K
C
 
G
I
 
V
V
 
L
H
 
H
S
 
T
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
Q
 
A
L
 
A
K
 
L
E
 
T
H
 
F
R
 
K
L
 
Y
H
 
V
C
 
F
D
 
D
V
 
Y
R
 
H
K
 
P
D
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
F
 
W
Y
 
C
F
 
T
T
 
A
T
 
D
C
 
V
G
 
G
W
 
W
M
 
V
M
 
T
-
 
G
W
 
H
N
 
S
W
 
Y
L
 
L
V
 
L
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
L
 
L
G
 
A
A
 
C
E
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
N
 
V
P
 
P
S
 
N
H
 
W
L
 
P
G
 
T
G
 
P
N
 
A
I
 
R
L
 
M
F
 
A
D
 
Q
F
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
H
G
 
Q
M
 
V
T
 
N
L
 
I
F
 
L
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
K
 
A
S
 
E
G
 
G
L
 
D
E
 
K
P
 
A
I
 
I
K
 
E
T
 
G
H
 
T
S
 
D
L
 
R
A
 
S
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
I
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
G
S
 
E
V
 
P
L
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
W
D
 
E
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
C
-
 
P
-
 
V
A
 
V
D
 
D
V
 
T
Q
 
W
L
 
W
A
 
Q
S
 
T
I
 
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
F
 
F
M
 
M
L
 
I
G
 
-
N
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
V
 
T
P
 
E
V
 
L
Y
 
K
R
 
A
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
T
C
 
R
R
 
P
G
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
Q
V
 
P
E
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
D
E
 
N
N
 
E
G
 
G
Q
 
N
S
 
P
L
 
L
A
 
E
G
 
G
-
 
A
S
 
T
K
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
L
V
 
V
C
 
I
T
 
T
R
 
D
A
 
S
F
 
W
P
 
P
S
 
G
M
 
Q
P
 
A
V
 
R
G
 
T
F
 
L
W
 
F
N
 
G
D
 
D
D
 
H
D
 
E
G
 
-
A
 
-
K
 
R
Y
 
F
R
 
E
A
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
S
K
 
T
F
 
F
P
 
K
G
 
N
I
 
M
W
 
Y
T
 
F
H
 
S
G
 
G
D
 
D
W
 
G
V
 
A
E
 
R
L
 
R
N
 
D
P
 
-
E
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
Y
I
 
Y
I
 
W
V
 
I
F
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
V
G
 
S
G
 
G
V
 
H
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
E
R
 
S
Q
 
A
V
 
L
E
 
V
Q
 
A
I
 
H
D
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
 
P
W
 
H
Q
 
N
A
 
I
D
 
K
V
 
G
R
 
Q
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
A
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
N
D
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
L
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
T
 
A
R
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
N
R
 
W
I
 
V
R
 
R
D
 
K
N
 
E
T
 
I
T
 
G
P
 
P
R
 
L
H
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
D
K
 
V
V
 
L
V
 
H
Q
 
W
V
 
T
A
 
D
D
 
S
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
I
V
 
L
R
 
R
D
 
K
V
 
I
V
 
A
H
 
A
G
 
G
R
 
D
A
 
T
-
 
S
-
 
N
V
 
L
K
 
G
N
 
D
K
 
T
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
P
 
P

5jrhA Crystal structure of salmonella enterica acetyl-coa synthetase (acs) in complex with camp and coenzyme a (see paper)
26% identity, 94% coverage: 28:638/652 of query aligns to 12:628/640 of 5jrhA

query
sites
5jrhA
R
 
R
F
 
C
Q
 
L
V
 
I
G
 
N
A
 
P
T
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
G
 
T
L
 
K
W
 
Y
R
 
K
W
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
N
R
 
D
P
 
P
D
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
G
L
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
Q
G
 
G
I
 
K
I
 
I
G
 
L
D
 
D
R
 
W
P
 
I
D
 
T
G
 
P
G
 
Y
V
 
Q
V
 
K
V
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
T
G
 
S
R
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
I
R
 
K
W
 
W
F
 
Y
P
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
T
L
 
L
N
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
N
L
 
C
L
 
L
R
 
D
R
 
R
-
 
H
-
 
L
D
 
Q
D
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
x
W
W
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
D
K
 
T
V
 
S
K
 
Q
-
 
S
R
x
K
R
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
H
A
 
R
L
 
D
V
 
V
S
 
C
R
 
R
L
 
F
Q
 
A
Q
 
N
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
M
M
x
V
P
 
P
E
|
E
S
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
I
S
x
F
P
x
G
D
x
G
F
 
F
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
A
D
x
G
R
|
R
F
 
I
G
 
I
Q
 
D
I
 
S
A
 
S
P
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
E
Y
 
G
F
 
V
Y
x
R
S
 
A
G
 
G
K
 
R
A
 
S
H
x
I
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
K
K
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
V
P
 
T
S
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
H
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
x
L
P
 
K
Y
x
R
T
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
W
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
A
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
W
G
 
W
V
 
R
D
 
D
K
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
K
L
 
A
G
 
S
D
 
P
F
 
E
L
 
H
A
 
Q
P
 
P
F
 
E
P
 
A
A
 
M
K
 
N
A
 
A
V
 
-
E
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
H
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
I
 
I
M
 
L
Y
|
Y
S
x
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
A
x
K
P
|
P
K
 
K
C
 
G
I
 
V
V
 
L
H
 
H
S
 
T
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
V
Q
 
Y
Q
 
A
L
 
A
K
 
T
E
 
T
H
 
F
R
 
K
L
 
Y
H
 
V
C
 
F
D
 
D
V
 
Y
R
 
H
K
 
P
D
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
Y
F
 
W
Y
 
C
F
 
T
T
 
A
T
x
D
C
 
V
G
 
G
W
 
W
M
 
V
M
 
T
-
 
G
W
 
H
N
 
S
W
 
Y
L
 
L
V
 
L
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
L
 
L
G
 
A
A
 
C
E
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
D
 
E
G
 
G
N
 
V
P
 
P
S
 
N
H
 
W
L
 
P
G
 
T
G
 
P
N
 
A
I
 
R
L
 
M
F
 
C
D
 
Q
F
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
H
G
 
Q
M
 
V
T
 
N
L
 
I
F
 
L
G
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
P
K
 
T
W
 
A
I
 
I
D
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
M
K
 
A
S
 
E
G
 
G
L
 
D
E
 
K
P
 
A
I
 
I
K
 
E
T
 
G
H
 
T
S
 
D
L
 
R
A
 
S
T
 
S
V
 
L
R
 
R
T
 
I
I
 
L
C
 
G
S
 
S
T
 
V
G
|
G
S
x
E
V
x
P
L
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
E
G
 
A
F
 
W
D
 
E
Y
 
W
V
 
Y
Y
 
W
A
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
-
 
P
-
 
V
A
 
V
D
|
D
V
x
T
Q
x
W
L
x
W
A
x
Q
S
x
T
I
x
E
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
F
 
F
M
 
M
L
 
I
G
 
-
N
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
A
V
 
I
P
 
E
V
 
L
Y
 
K
R
 
A
G
 
G
E
 
S
I
 
A
Q
 
T
C
 
R
R
 
P
G
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
Q
V
 
P
E
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
D
E
 
N
N
 
E
G
 
G
Q
 
H
S
 
P
L
 
Q
A
 
E
G
 
G
-
 
A
S
 
T
K
 
E
G
 
G
E
 
N
L
 
L
V
 
V
C
 
I
T
 
T
R
 
D
A
 
S
F
 
W
P
 
P
S
 
G
M
 
Q
P
 
A
V
 
R
G
 
T
F
 
L
W
 
F
N
 
G
D
 
D
D
 
H
D
 
E
G
 
-
A
 
-
K
 
R
Y
 
F
R
 
E
A
 
Q
A
 
T
Y
 
Y
F
 
F
E
 
S
K
 
T
F
 
F
P
 
K
G
 
N
I
 
M
W
 
Y
T
 
F
H
 
S
G
 
G
D
|
D
W
 
G
V
 
A
E
 
R
L
 
R
N
 
D
P
 
-
E
 
E
T
 
D
G
 
G
G
 
Y
I
 
Y
I
 
W
V
x
I
F
 
T
G
 
G
R
|
R
S
 
V
D
 
D
A
 
D
T
 
V
L
 
L
N
|
N
P
 
V
G
x
S
G
 
G
V
x
H
R
|
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
E
R
 
S
Q
 
A
V
 
L
E
x
V
Q
 
A
I
x
H
D
 
P
D
 
K
V
x
I
L
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
I
D
 
P
W
 
H
Q
 
A
A
 
I
D
 
K
V
 
G
R
 
Q
V
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
A
F
 
Y
V
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
N
D
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
L
 
P
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
T
 
A
R
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
N
R
 
W
I
 
V
R
|
R
D
 
K
N
 
E
T
 
I
T
 
G
P
|
P
R
 
L
H
 
A
V
 
T
P
 
P
A
 
D
K
 
V
V
 
L
V
 
H
Q
 
W
V
 
T
A
 
D
D
 
S
I
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
T
K
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
V
 
M
E
 
R
L
 
R
A
 
I
V
 
L
R
 
R
D
 
K
V
 
I
V
 
A
H
 
A
G
 
G
R
 
D
A
 
-
V
 
L
K
 
G
N
 
D
K
 
T
E
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
N
 
D
P
 
P

Q8ZKF6 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
26% identity, 94% coverage: 28:638/652 of query aligns to 16:635/652 of Q8ZKF6

query
sites
Q8ZKF6
R
 
R
F
 
C
Q
 
L
V
 
I
G
 
N
A
 
P
T
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
G
 
T
L
 
K
W
 
Y
R
 
K
W
 
Q
S
 
S
V
 
I
D
 
N
R
 
D
P
 
P
D
 
D
Q
 
T
F
 
F
W
 
W
S
 
G
L
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
Q
G
 
G
I
 
K
I
 
I
G
 
L
D
 
D
R
 
W
P
 
I
D
 
T
G
 
P
G
 
Y
V
 
Q
V
 
K
V
 
V
D
 
K
D
 
N
A
 
T
G
 
S
R
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
I
R
 
K
W
 
W
F
 
Y
P
 
E
E
 
D
A
 
G
R
 
T
L
 
L
N
 
N
F
 
L
A
 
A
E
 
A
N
 
N
L
 
C
L
 
L
R
 
D
R
 
R
-
 
H
-
 
L
D
 
Q
D
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
D
-
 
R
-
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
I
F
 
W
W
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
D
K
 
T
V
 
S
K
 
Q
-
 
S
R
 
K
R
 
H
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
H
A
 
R
L
 
D
V
 
V
S
 
C
R
 
R
L
 
F
Q
 
A
Q
 
N
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
M
M
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
W
 
H
S
 
S
S
 
V
A
 
I
S
 
F
P
 
G
D
 
G
F
 
F
G
 
S
V
 
P
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
A
D
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
I
Q
 
D
I
 
S
A
 
S
P
 
S
K
 
R
V
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
A
E
 
D
G
 
E
Y
 
G
F
 
V
Y
 
R
S
 
A
G
 
G
K
x
R
A
 
S
H
 
I
D
 
P
C
 
L
L
 
K
E
 
K
K
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
K
V
 
N
P
 
P
G
 
N
I
 
V
P
 
T
S
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
H
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
L
P
 
K
Y
 
R
T
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
W
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
A
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
W
G
 
W
V
 
R
D
 
D
K
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
K
L
 
A
G
 
S
D
 
P
F
 
E