SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011384488.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011384488.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3e9qB Crystal structure of the short chain dehydrogenase from shigella flexneri
35% identity, 95% coverage: 5:231/239 of query aligns to 16:241/256 of 3e9qB

query
sites
3e9qB
L
 
L
E
 
N
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
R
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
x
M
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
L
I
 
L
A
 
G
R
 
R
T
 
N
Q
 
E
G
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
Q
L
 
V
D
 
A
D
 
S
Q
 
H
I
 
I
R
 
N
K
 
E
A
x
E
G
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
Q
L
 
P
V
 
Q
L
 
W
V
 
F
P
 
I
E
 
L
D
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
T
C
 
C
K
 
T
P
 
S
G
 
E
L
 
N
I
 
C
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
R
I
 
I
F
 
V
Q
 
V
R
 
N
W
 
Y
A
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
G
L
 
V
V
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
D
G
 
-
L
 
V
T
 
C
P
 
P
V
 
M
A
 
S
Q
 
E
H
 
Q
A
 
N
P
 
P
D
 
Q
D
 
V
W
 
W
E
 
Q
E
 
D
A
 
V
F
 
M
A
 
Q
V
 
I
N
 
N
V
 
V
T
 
N
A
 
A
N
 
T
W
 
F
R
 
M
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
C
 
L
D
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
L
M
 
K
A
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
S
A
 
L
V
 
V
F
 
F
T
 
T
T
 
S
A
x
S
D
 
S
A
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
P
 
A
F
 
N
W
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
T
 
G
M
 
M
V
 
M
R
 
Q
T
 
V
W
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
Y
A
 
Q
N
 
Q
V
 
-
T
 
-
S
 
R
V
 
L
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
G
V
 
T
A
 
R
T
 
T
R
 
A
L
 
M
R
 
R
S
 
A
I
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
T
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
M
G
 
P
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
D
 
W
L
 
L
C
 
M
L
 
G
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
R
R
 
R
Q
 
K

3f1kA Crystal structure of ycik from e. Coli, an oxidoreductase, complexed with NADP+ at 2.6a resolution
36% identity, 95% coverage: 5:231/239 of query aligns to 10:235/252 of 3f1kA

query
sites
3f1kA
L
 
L
E
 
N
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
R
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
M
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
L
I
 
L
A
 
G
R
|
R
T
 
N
Q
 
E
G
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
Q
L
 
V
D
 
A
D
 
S
Q
 
H
I
 
I
R
 
N
K
 
E
A
 
E
G
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
Q
L
 
P
V
 
Q
L
 
W
V
 
F
P
 
I
E
 
L
D
|
D
L
|
L
-
 
L
-
 
T
C
 
C
K
 
T
P
 
S
G
 
E
L
 
N
I
 
C
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
R
I
 
I
F
 
A
Q
 
V
R
 
N
W
 
Y
A
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
G
L
 
V
V
 
L
G
 
H
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
D
G
 
-
L
 
V
T
 
C
P
 
P
V
 
M
A
 
S
Q
 
E
H
 
Q
A
 
N
P
 
P
D
 
Q
D
 
V
W
 
W
E
 
Q
E
 
D
A
 
V
F
 
M
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
N
A
 
A
N
 
T
W
 
F
R
 
M
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
C
 
L
D
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
L
M
 
K
A
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
S
A
 
L
V
 
V
F
 
F
T
|
T
T
 
S
A
x
S
D
 
S
A
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
P
 
A
F
 
N
W
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
T
 
G
M
 
M
V
 
M
R
 
Q
T
 
V
W
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
Y
A
 
Q
N
 
Q
V
 
-
T
 
-
S
 
R
V
 
L
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
|
P
G
|
G
V
x
G
V
x
T
A
 
R
T
|
T
R
 
A
L
x
M
R
|
R
S
 
A
I
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
T
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
M
G
 
P
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
D
 
W
L
 
L
C
 
M
L
 
G
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
R
R
 
R
Q
 
K

3gz4A Crystal structure of putative short chain dehydrogenase from escherichia coli cft073 complexed with NADPH
36% identity, 95% coverage: 5:231/239 of query aligns to 7:232/242 of 3gz4A

query
sites
3gz4A
L
 
L
E
 
N
G
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
 
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
M
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
L
I
 
L
A
 
G
R
|
R
T
 
N
Q
 
E
G
 
E
A
x
K
L
 
L
E
 
R
E
 
Q
L
 
V
D
 
A
D
 
S
Q
 
H
I
 
I
R
 
N
K
 
E
A
 
E
G
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
Q
L
 
P
V
 
Q
L
 
W
V
 
F
P
 
I
E
x
L
D
|
D
L
|
L
-
 
L
-
 
T
C
 
C
K
 
T
P
 
S
G
 
E
L
 
D
I
 
C
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
R
I
 
I
F
 
A
Q
 
V
R
 
N
W
 
Y
A
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
G
L
 
V
V
 
L
G
 
H
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
D
G
 
-
L
 
V
T
 
C
P
 
P
V
 
M
A
 
S
Q
 
E
H
 
Q
A
 
D
P
 
P
D
 
Q
D
 
V
W
 
W
E
 
Q
E
 
D
A
 
V
F
 
M
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
N
A
 
A
N
 
T
W
 
F
R
 
M
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
C
 
L
D
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
L
M
 
K
A
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
S
A
 
L
V
 
V
F
 
F
T
|
T
T
 
S
A
x
S
D
 
S
A
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
P
 
A
F
 
N
W
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
T
 
G
M
 
M
V
 
M
R
 
Q
T
 
V
W
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
Y
A
 
Q
N
 
Q
V
 
-
T
 
-
S
 
R
V
 
L
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
 
P
G
|
G
V
x
G
V
x
T
A
 
R
T
|
T
R
 
A
L
x
M
R
|
R
S
 
A
I
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
T
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
M
G
 
P
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
D
 
W
L
 
L
C
 
M
L
 
G
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
R
R
 
R
Q
 
K

3iahA Crystal structure of short chain dehydrogenase (ycik) from salmonella enterica subsp. Enterica serovar typhimurium str. Lt2 in complex with NADP and acetate.
36% identity, 95% coverage: 5:231/239 of query aligns to 10:236/253 of 3iahA

query
sites
3iahA
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
R
E
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
L
I
 
L
A
 
G
R
|
R
T
 
N
Q
 
E
G
 
E
A
x
K
L
 
L
E
 
R
E
 
R
L
 
V
D
 
A
D
 
Q
Q
 
H
I
 
I
R
 
A
K
 
D
A
 
E
G
 
Q
G
 
H
K
 
V
P
 
Q
L
 
P
V
 
Q
L
 
W
V
 
F
P
 
T
E
 
L
D
|
D
L
|
L
-
 
L
-
 
T
C
 
C
K
 
T
P
 
A
G
 
E
L
 
E
I
 
C
E
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
R
I
 
I
F
 
A
Q
 
A
R
 
H
W
 
Y
A
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
G
L
 
V
V
 
L
G
 
H
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
E
G
 
-
L
 
I
T
 
G
P
 
P
V
 
M
A
 
S
Q
 
E
H
 
Q
A
 
D
P
 
P
D
 
Q
D
 
I
W
 
W
E
 
Q
E
 
D
A
 
V
F
 
M
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
N
A
 
A
N
 
T
W
 
F
R
 
M
L
 
L
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
C
 
L
D
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
L
M
 
K
A
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
S
A
 
L
V
 
V
F
 
F
T
|
T
T
 
S
A
x
S
D
 
S
A
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
P
 
A
F
 
N
W
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
T
 
G
M
 
M
V
 
M
R
 
Q
T
 
V
W
 
L
A
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
Y
A
 
Q
N
 
N
V
 
-
T
 
R
S
 
S
V
 
L
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
|
P
G
|
G
V
x
G
V
x
T
A
 
R
T
|
T
R
 
S
L
x
M
R
|
R
S
 
A
I
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
T
P
 
P
D
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
M
G
 
P
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
D
 
W
L
 
L
C
 
M
L
 
G
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
R
R
 
R
Q
 
K

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
28% identity, 97% coverage: 4:235/239 of query aligns to 7:250/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
R
 
R
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
S
x
T
R
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
S
I
 
V
V
 
V
A
 
I
I
 
G
A
x
S
R
|
R
T
x
N
Q
 
Q
G
 
K
A
x
N
L
 
V
E
 
D
E
 
E
L
 
A
D
 
I
D
 
E
Q
 
Y
I
 
L
R
 
K
K
 
N
A
 
K
G
 
G
G
 
L
K
 
T
P
 
K
L
 
V
V
 
A
L
 
G
V
 
I
P
 
A
E
 
G
D
 
H
L
x
I
C
 
A
K
 
S
P
 
T
G
 
D
L
 
D
I
 
Q
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
A
 
V
A
 
D
A
 
F
I
 
T
F
 
L
Q
 
Q
R
 
K
W
 
F
A
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
A
 
-
I
 
I
G
 
N
G
 
P
G
 
A
L
 
F
T
 
G
P
 
H
V
 
I
A
 
L
Q
 
E
H
 
V
A
 
S
P
 
D
D
 
Q
D
 
V
W
 
W
E
 
D
E
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
K
A
 
A
N
 
G
W
 
F
R
 
Q
L
 
M
I
 
T
R
 
K
A
 
L
C
 
V
D
 
H
P
 
P
L
 
H
L
 
I
R
 
A
M
 
K
A
 
E
P
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
A
A
 
I
V
 
I
F
 
F
T
x
N
T
 
A
A
x
S
D
 
Y
A
x
S
A
 
A
R
 
Y
H
 
K
A
 
S
E
 
P
P
 
P
F
 
G
W
 
I
G
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
T
A
 
T
L
 
L
E
 
V
T
 
G
M
 
L
V
 
T
R
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
G
L
 
I
D
 
A
P
 
P
G
|
G
V
|
V
V
x
I
A
 
K
T
|
T
R
 
K
L
x
M
R
x
S
S
 
Q
I
 
V
A
x
L
F
 
W
P
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
E
D
 
D
P
 
A
A
 
E
K
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
T
F
 
V
L
 
A
D
 
Y
L
 
L
C
 
A
L
 
S
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
S
R
 
Y
-
 
I
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
M
I
 
I

5ojgA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
28% identity, 97% coverage: 4:235/239 of query aligns to 7:250/260 of 5ojgA

query
sites
5ojgA
R
 
R
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
S
x
T
R
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
S
I
 
V
V
 
V
A
 
I
I
 
G
A
x
S
R
|
R
T
x
N
Q
 
Q
G
 
K
A
x
N
L
 
V
E
 
D
E
 
E
L
 
A
D
 
I
D
 
E
Q
 
Y
I
 
L
R
 
K
K
 
N
A
 
K
G
 
G
G
 
L
K
 
T
P
 
K
L
 
V
V
 
A
L
 
G
V
 
I
P
 
A
E
 
G
D
 
H
L
x
I
C
 
A
K
 
S
P
 
T
G
 
D
L
 
D
I
 
Q
E
 
K
Q
 
K
V
 
L
A
 
V
A
 
D
A
 
F
I
 
T
F
 
L
Q
 
Q
R
 
K
W
 
F
A
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
A
 
-
I
 
I
G
 
N
G
 
P
G
 
A
L
 
F
T
 
G
P
 
H
V
 
I
A
 
L
Q
 
E
H
 
V
A
 
S
P
 
D
D
 
Q
D
 
V
W
 
W
E
 
D
E
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
K
A
 
A
N
 
G
W
 
F
R
 
Q
L
 
M
I
 
T
R
 
K
A
 
L
C
 
V
D
 
H
P
 
P
L
 
H
L
 
I
R
 
A
M
 
K
A
 
E
P
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
A
A
 
I
V
 
I
F
 
F
T
x
N
T
 
A
A
x
S
D
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
Y
H
 
K
A
 
S
E
 
P
P
 
P
F
 
G
W
 
I
G
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
T
A
 
T
L
 
L
E
 
V
T
 
G
M
 
L
V
 
T
R
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
G
L
 
I
D
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
V
V
x
I
A
 
K
T
|
T
R
 
K
L
x
M
R
 
S
S
 
Q
I
 
V
A
 
L
F
 
W
P
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
E
D
 
D
P
 
A
A
 
E
K
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
T
F
 
V
L
 
A
D
 
Y
L
 
L
C
 
A
L
 
S
P
 
D
D
 
D
C
 
S
T
 
S
R
 
Y
-
 
I
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
M
I
 
I

A0R518 Putative short-chain type dehydrogenase/reductase MSMEG_6031/MSMEI_5872; EC 1.1.1.- from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
31% identity, 90% coverage: 1:214/239 of query aligns to 1:221/279 of A0R518

query
sites
A0R518
M
 
M
S
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
Q
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
H
A
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
D
R
 
V
T
 
C
Q
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
S
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
A
D
 
E
Q
 
T
I
 
V
R
 
E
K
 
L
A
 
V
G
x
K
G
 
G
K
 
L
P
 
N
L
 
R
V
 
R
L
 
I
V
 
V
P
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
V
D
 
D
L
 
V
C
 
R
K
 
D
P
 
Y
G
 
D
L
 
A
I
 
L
E
 
K
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
D
A
 
S
I
 
G
F
 
V
Q
 
E
R
 
Q
W
 
L
A
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
V
G
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
-
I
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
G
L
 
G
T
 
A
P
 
T
V
 
L
A
 
D
Q
 
K
H
 
T
A
 
S
P
 
E
D
 
A
D
 
D
W
 
W
E
 
D
E
 
D
A
 
M
F
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
S
A
 
G
N
 
V
W
 
W
R
 
K
L
 
T
I
 
V
R
 
K
A
 
A
C
 
A
D
 
V
P
 
P
-
 
H
L
 
L
L
 
I
R
 
S
M
 
G
A
 
G
P
 
N
A
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
I
V
 
I
F
 
L
T
 
T
T
 
S
A
 
S
D
 
V
A
 
G
A
 
G
R
 
L
H
 
K
A
 
A
E
 
Y
P
 
P
F
 
H
W
 
T
G
 
G
A
 
H
Y
 
Y
A
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
E
 
V
T
 
G
M
 
L
V
 
M
R
 
R
T
 
T
W
 
F
A
 
A
A
 
V
E
 
E
I
 
L
A
 
G
N
 
Q
V
 
-
T
 
H
S
 
S
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
S
L
 
V
D
 
H
P
 
P
G
 
T
V
 
N
V
 
V
A
 
N
T
 
T
R
 
P
L
 
L
R
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
F
P
 
M
G
 
N
E
 
E
D
 
G
P
 
T
A
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
F
Q
 
R
P
 
P
D
 
D

P50163 Tropinone reductase 2; Tropinone reductase II; TR-II; EC 1.1.1.236 from Datura stramonium (Jimsonweed) (Common thornapple) (see paper)
28% identity, 98% coverage: 1:235/239 of query aligns to 1:248/260 of P50163

query
sites
P50163
M
 
M
S
 
A
G
 
G
R
 
R
-
 
W
-
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
C
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
Y
A
x
G
V
x
I
A
x
V
R
x
E
R
x
E
L
|
L
A
|
A
A
x
S
E
x
L
G
|
G
A
|
A
E
x
S
I
x
V
V
x
Y
A
x
T
I
x
C
A
x
S
R
|
R
T
 
N
Q
 
Q
G
 
K
A
 
E
L
 
L
E
 
N
E
 
D
L
 
C
D
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
K
 
S
A
 
K
G
 
G
G
 
F
K
 
K
P
 
V
L
 
E
V
 
A
L
 
S
V
 
V
P
 
C
E
 
D
D
 
L
L
 
S
C
 
S
K
 
R
P
 
S
G
 
E
L
 
R
I
 
Q
E
 
E
Q
 
L
V
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
N
Q
 
H
R
 
F
W
 
H
A
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
I
 
V
G
 
-
G
 
-
G
 
I
L
 
Y
T
 
K
P
 
E
V
 
A
A
 
K
Q
 
D
H
 
Y
A
 
T
P
 
V
D
 
E
D
 
D
W
 
Y
E
 
S
E
 
L
A
 
I
F
 
M
A
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
F
T
 
E
A
 
A
N
 
A
W
 
Y
R
 
H
L
 
L
I
 
S
R
 
V
A
 
L
C
 
A
D
 
H
P
 
P
L
 
F
L
 
L
R
 
K
M
 
A
A
 
S
P
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
I
T
 
S
A
x
S
D
 
V
A
 
S
A
 
G
R
 
A
H
 
L
A
 
A
E
 
V
P
 
P
F
 
Y
W
 
E
G
 
A
A
 
V
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
M
E
 
D
T
 
Q
M
 
L
V
 
T
R
 
R
T
 
C
W
 
L
A
 
A
A
 
F
E
 
E
I
 
W
A
 
A
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
G
L
 
V
D
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
x
I
A
|
A
T
|
T
R
x
S
L
|
L
R
 
V
S
 
E
I
 
M
A
 
T
F
 
I
P
 
-
G
 
-
E
 
Q
D
 
D
P
 
P
A
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
C
-
 
A
-
 
L
-
 
R
K
 
R
L
 
M
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
M
F
 
V
L
 
A
D
 
F
L
 
L
C
 
C
L
 
F
P
 
P
D
 
A
C
 
A
T
 
S
R
 
Y
-
 
V
Q
 
T
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
I
 
I

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
30% identity, 92% coverage: 5:223/239 of query aligns to 5:232/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
L
 
L
E
 
K
G
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
L
E
 
N
G
 
D
A
 
S
E
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
x
E
R
x
L
T
 
L
Q
 
E
G
 
D
A
x
R
L
 
L
E
 
N
E
 
Q
L
 
I
D
 
V
D
 
Q
Q
 
E
I
 
L
R
 
R
K
 
G
A
 
M
G
 
-
G
 
G
K
 
K
P
 
E
L
 
V
V
 
L
L
 
G
V
 
V
P
 
K
E
x
A
D
|
D
L
x
V
C
 
S
K
 
K
P
 
K
G
 
K
L
 
D
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
V
A
 
R
A
 
R
I
 
T
F
 
F
Q
 
E
R
 
T
W
 
Y
A
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
C
G
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
-
I
|
I
G
 
M
G
 
D
G
 
G
L
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
V
A
 
S
P
 
D
D
 
E
D
 
L
W
 
W
E
 
E
E
 
R
A
 
V
F
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
Y
A
 
S
N
 
A
W
 
F
R
 
Y
L
 
S
I
 
S
R
 
R
A
 
A
C
 
V
D
 
I
P
 
P
L
 
I
L
 
-
R
 
-
M
 
M
A
 
L
P
 
K
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
V
 
V
F
 
I
-
 
V
T
 
N
T
|
T
A
 
A
D
x
S
A
 
I
A
 
A
R
 
G
H
 
I
A
 
R
E
 
G
P
 
G
F
 
F
W
 
A
G
 
G
A
 
A
-
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
I
T
 
G
M
 
L
V
 
T
R
 
R
T
 
S
W
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
H
I
 
Y
A
 
G
N
 
D
V
 
-
T
 
Q
S
 
G
V
 
I
K
 
R
A
 
A
N
 
V
L
 
A
L
 
V
D
 
L
P
|
P
G
 
G
V
 
T
V
|
V
A
 
K
T
|
T
R
x
N
-
x
I
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
x
S
-
 
E
-
 
L
-
 
G
L
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
L
A
 
T
F
 
K
P
 
L
G
 
M
E
 
S
D
 
L
P
 
S
A
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
V
F
 
I
L
 
V
D
 
F
L
 
L

3rkrA Crystal structure of a metagenomic short-chain oxidoreductase (sdr) in complex with NADP (see paper)
35% identity, 89% coverage: 5:217/239 of query aligns to 3:196/221 of 3rkrA

query
sites
3rkrA
L
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
G
A
 
S
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
R
I
 
V
V
 
V
A
 
L
I
 
T
A
|
A
R
|
R
T
x
D
Q
 
V
G
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
A
L
 
V
D
 
E
D
 
R
Q
 
E
I
 
I
R
 
V
K
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
E
P
 
A
L
 
E
V
 
S
L
 
H
V
 
A
P
x
C
E
 
-
D
|
D
L
|
L
C
 
S
K
 
H
P
 
S
G
 
D
L
 
A
I
 
I
E
 
A
Q
 
A
V
 
F
A
 
A
A
 
T
A
 
G
I
 
V
F
 
L
Q
 
A
R
 
A
W
 
H
A
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
A
x
V
-
x
G
-
 
W
I
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
P
V
 
L
A
 
H
Q
 
T
H
 
M
A
 
K
P
 
P
D
 
A
D
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
A
A
 
L
F
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
P
W
 
Y
R
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
F
D
 
A
P
 
P
L
 
A
L
 
M
R
 
I
M
 
A
A
 
A
P
 
K
A
 
R
G
 
G
R
 
H
A
 
I
V
 
I
F
 
N
T
 
I
T
 
S
A
x
S
D
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
K
H
 
N
A
 
P
E
 
V
P
 
A
F
 
D
W
 
G
G
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
W
A
 
G
L
 
L
E
 
N
T
 
G
M
 
L
V
 
M
R
 
-
T
 
T
W
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
E
A
 
L
N
 
R
V
 
Q
T
 
H
S
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
V
N
 
S
L
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
S
V
 
V
A
 
A
T
 
I
R
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
31% identity, 90% coverage: 6:219/239 of query aligns to 4:218/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
E
 
E
G
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
I
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
F
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
T
A
 
A
R
x
T
T
 
S
Q
 
E
G
 
S
A
 
G
L
 
A
E
 
Q
E
 
K
L
 
L
D
 
T
D
 
D
Q
 
S
I
 
F
R
 
G
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
A
K
 
-
P
 
G
L
 
L
V
 
A
L
|
L
V
x
D
P
x
V
E
 
R
D
 
N
L
 
L
C
 
D
K
 
E
P
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
S
A
 
H
I
 
I
F
 
E
Q
 
Q
R
 
N
W
 
Y
A
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
I
 
T
G
 
K
G
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
-
P
 
-
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
H
 
M
A
 
S
P
 
E
D
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
D
E
 
D
A
 
I
F
 
L
A
 
N
V
 
I
N
 
H
V
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
V
W
 
Y
R
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
R
C
 
V
D
 
L
P
 
K
L
 
G
L
 
M
R
 
T
M
 
K
A
 
A
P
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
I
F
 
N
T
x
I
T
 
S
A
x
S
D
 
V
A
 
V
A
 
A
R
 
H
H
 
F
A
 
A
E
 
N
P
 
P
F
 
G
W
 
Q
G
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
I
E
 
E
T
 
A
M
 
F
V
 
S
R
 
R
T
 
S
W
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
M
A
 
G
N
 
S
V
 
-
T
 
R
S
 
Q
V
 
I
K
 
T
A
 
V
N
 
N
L
 
S
L
 
V
D
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
E
L
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
S
R
 
E
S
 
D
I
 
I
A
 
R
F
 
K
P
 
K
G
 
M
E
 
S
D
 
D
P
 
Q
A
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
N
K
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
31% identity, 90% coverage: 6:219/239 of query aligns to 4:218/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
E
 
E
G
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
I
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
F
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
T
A
|
A
R
x
T
T
 
S
Q
 
E
G
 
S
A
 
G
L
 
A
E
 
Q
E
 
K
L
 
L
D
 
T
D
 
D
Q
 
S
I
 
F
R
 
G
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
A
K
 
-
P
 
G
L
 
L
V
 
A
L
|
L
V
x
D
P
x
V
E
 
R
D
 
N
L
 
L
C
 
D
K
 
E
P
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
S
A
 
H
I
 
I
F
 
E
Q
 
Q
R
 
N
W
 
Y
A
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
I
 
T
G
 
K
G
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
-
P
 
-
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
H
 
M
A
 
S
P
 
E
D
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
D
E
 
D
A
 
I
F
 
L
A
 
N
V
 
I
N
 
H
V
 
L
T
 
K
A
 
A
N
 
V
W
 
Y
R
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
R
C
 
V
D
 
L
P
 
K
L
 
G
L
 
M
R
 
T
M
 
K
A
 
A
P
 
R
A
 
F
G
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
I
F
 
N
T
x
I
T
x
S
A
x
S
D
 
V
A
 
V
A
 
A
R
 
H
H
 
F
A
 
A
E
 
N
P
 
P
F
 
G
W
 
Q
G
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
I
E
 
E
T
 
A
M
 
F
V
 
S
R
 
R
T
 
S
W
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
M
A
 
G
N
 
S
V
 
-
T
 
R
S
 
Q
V
 
I
K
 
T
A
 
V
N
 
N
L
 
S
L
 
V
D
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
A
 
A
T
 
T
R
 
E
L
x
M
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
S
R
 
E
S
 
D
I
 
I
A
 
R
F
 
K
P
 
K
G
 
M
E
 
S
D
 
D
P
 
Q
A
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
N
K
 
R
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A

3l77A X-ray structure alcohol dehydrogenase from archaeon thermococcus sibiricus complexed with 5-hydroxy-NADP
31% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 1:228/235 of 3l77A

query
sites
3l77A
E
 
E
G
 
M
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
Y
E
 
A
I
 
L
V
 
A
A
 
L
I
 
G
A
 
A
R
|
R
T
x
S
Q
 
V
G
 
D
A
 
R
L
 
L
E
 
E
E
 
K
L
 
I
D
 
A
D
 
H
Q
 
E
I
 
L
R
 
M
K
 
Q
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
K
 
V
P
 
E
L
 
V
V
 
F
L
 
Y
V
 
H
P
 
H
E
x
L
D
|
D
L
x
V
C
 
S
K
 
K
P
 
A
G
 
E
L
 
S
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
V
 
F
A
 
S
A
 
K
A
 
K
I
 
V
F
 
L
Q
 
E
R
 
R
W
 
F
A
 
G
R
 
D
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
G
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
L
I
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
Y
L
 
F
T
 
K
P
 
R
V
 
L
A
 
E
Q
 
E
H
 
L
A
 
S
P
 
E
D
 
E
D
 
E
W
 
F
E
 
H
E
 
E
A
 
M
F
 
I
A
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
L
A
 
G
N
 
V
W
 
W
R
 
R
L
 
T
I
 
L
R
 
K
A
 
A
-
 
F
C
 
L
D
 
D
P
 
S
L
 
L
L
 
K
R
 
R
M
 
-
A
 
-
P
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
V
T
|
T
T
|
T
A
x
S
D
|
D
A
 
V
A
 
S
R
 
A
H
 
R
A
 
L
E
 
I
P
 
P
F
 
Y
W
 
G
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
A
 
V
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
W
A
 
A
L
 
A
E
 
R
T
 
A
M
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
T
W
 
F
A
 
Q
A
 
I
E
 
E
I
 
N
A
 
P
N
 
D
V
 
V
T
 
R
S
 
F
V
 
F
K
 
E
A
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
L
D
 
R
P
|
P
G
|
G
V
x
A
V
|
V
A
 
D
T
|
T
R
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
I
 
-
A
x
Y
F
|
F
P
 
G
G
 
G
E
 
S
D
 
K
P
 
P
A
 
G
K
 
K
-
x
P
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
L
 
Y
A
 
L
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
F
 
V
L
 
R
D
 
C
L
 
L
C
 
L
-
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
K
C
 
D
T
 
V
R
 
R
Q
 
V
G
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
R
 
L
T
 
R
S
 
S

Q73SC8 Uncharacterized NAD-dependent oxidoreductase MAP_4146; EC 1.-.-.- from Mycolicibacterium paratuberculosis (strain ATCC BAA-968 / K-10) (Mycobacterium paratuberculosis)
32% identity, 82% coverage: 2:197/239 of query aligns to 5:210/275 of Q73SC8

query
sites
Q73SC8
S
 
A
G
 
G
R
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
R
|
R
G
|
G
I
x
Q
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
H
A
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
A
-
 
C
-
x
D
-
x
I
-
 
C
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
S
I
 
V
A
 
T
R
 
Y
T
 
A
Q
 
P
G
 
A
A
 
S
L
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
Q
 
Q
I
 
G
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
T
K
 
R
P
 
V
L
 
L
V
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
D
|
D
L
x
V
C
 
R
K
 
D
P
 
D
G
 
A
L
 
A
I
 
L
E
 
R
Q
 
E
V
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
D
I
 
G
F
 
M
Q
 
E
R
 
Q
W
 
F
A
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
G
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
L
G
 
S
G
 
W
G
 
G
L
 
R
T
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
W
Q
 
E
H
 
L
A
 
T
P
 
D
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
E
 
D
E
 
T
A
 
V
F
 
I
A
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
T
A
 
G
N
 
T
W
 
W
R
 
R
L
 
T
I
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
T
D
 
V
P
 
P
-
 
A
L
 
M
L
 
I
R
 
E
M
 
A
A
 
G
P
 
N
A
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
I
V
 
V
F
 
V
T
 
V
T
 
S
A
 
S
D
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
L
H
 
K
A
 
A
E
 
T
P
 
P
F
 
G
W
 
N
G
 
G
A
 
H
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
T
T
 
A
M
 
L
V
 
T
R
 
N
T
 
T
W
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
G
N
 
E
V
 
Y
T
 
-
S
 
G
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
S
L
 
I
D
 
H
P
 
P
G
 
Y
V
 
S
V
|
V
A
x
E
T
|
T
R
 
P
L
 
M

3ai2A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH (see paper)
28% identity, 94% coverage: 1:224/239 of query aligns to 1:241/263 of 3ai2A

query
sites
3ai2A
M
 
M
S
 
D
G
 
M
R
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
|
S
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
A
|
A
R
|
R
T
x
Q
Q
 
V
G
 
D
A
 
R
L
 
L
E
 
H
E
 
E
L
 
A
D
 
A
D
 
R
Q
 
S
I
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
K
G
 
F
G
 
G
K
 
V
P
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
E
V
 
V
P
 
A
E
x
V
D
|
D
L
x
V
C
 
A
K
 
T
P
 
P
G
 
E
L
 
G
I
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
S
I
 
V
F
 
R
Q
 
S
R
 
S
W
 
F
A
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
I
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
S
L
 
N
T
 
E
P
 
T
V
 
I
A
 
M
Q
 
E
H
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
E
D
 
K
W
 
W
E
 
Q
E
 
F
A
 
Y
F
 
W
A
 
E
V
 
L
N
 
H
V
 
V
T
 
M
A
 
A
N
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
G
C
 
L
D
 
V
P
 
P
L
 
G
L
 
M
R
 
R
M
 
A
A
 
R
P
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
A
A
 
I
V
 
I
F
 
H
T
x
N
T
 
A
A
x
S
D
 
I
A
 
C
A
 
A
R
 
-
H
 
-
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
W
 
W
G
 
Y
A
 
E
-
 
P
-
 
I
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
M
T
 
M
M
 
F
V
 
S
R
 
K
T
 
T
W
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
I
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
|
P
G
 
G
V
 
L
V
x
I
A
 
L
T
|
T
-
 
P
-
 
D
-
x
W
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
R
 
Q
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
D
P
 
E
G
 
H
E
 
A
D
 
P
P
 
I
A
 
K
K
 
R
L
 
F
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
V
D
 
F
L
 
L
C
 
C

3pgxA Crystal structure of a putative carveol dehydrogenase from mycobacterium paratuberculosis bound to nicotinamide adenine dinucleotide (see paper)
32% identity, 82% coverage: 3:197/239 of query aligns to 1:205/270 of 3pgxA

query
sites
3pgxA
G
 
G
R
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
|
R
G
|
G
I
x
Q
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
H
A
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
A
-
 
C
-
x
D
-
x
I
-
 
C
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
S
I
 
V
A
 
T
R
 
Y
T
 
A
Q
 
P
G
x
A
A
 
S
L
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
E
D
 
D
Q
 
Q
I
 
G
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
T
K
 
R
P
 
V
L
 
L
V
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
D
|
D
L
x
V
C
 
R
K
 
D
P
 
D
G
 
A
L
 
A
I
 
L
E
 
R
Q
 
E
V
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
D
I
 
G
F
 
M
Q
 
E
R
 
Q
W
 
F
A
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
G
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
V
I
 
L
G
 
S
G
 
W
G
 
G
L
 
R
T
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
W
Q
 
E
H
 
L
A
 
T
P
 
D
D
 
E
D
 
Q
W
 
W
E
 
D
E
 
T
A
 
V
F
 
I
A
 
G
V
|
V
N
 
N
V
 
L
T
 
T
A
 
G
N
 
T
W
 
W
R
 
R
L
 
T
I
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
T
D
 
V
P
 
P
-
 
A
L
 
M
L
 
I
R
 
E
M
 
A
A
 
G
P
 
N
A
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
I
V
 
V
F
 
V
T
x
V
T
 
S
A
x
S
D
 
S
A
 
A
A
 
G
R
 
L
H
 
K
A
 
A
E
 
T
P
 
P
F
 
G
W
 
N
G
 
G
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
T
T
 
A
M
 
L
V
 
T
R
 
N
T
 
T
W
 
L
A
 
A
A
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
G
N
 
E
V
 
Y
T
 
-
S
 
G
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
S
L
 
I
D
 
H
P
|
P
G
 
Y
V
 
S
V
|
V
A
 
E
T
|
T
R
 
P
L
x
M

Sites not aligning to the query:

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 3:235/239 of query aligns to 1025:1262/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
G
 
G
R
x
P
L
|
L
E
x
S
G
|
G
R
x
K
V
|
V
A
|
A
L
x
V
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
|
S
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
|
A
A
|
A
V
|
V
A
|
A
R
x
T
R
x
A
L
|
L
A
|
A
A
x
R
E
|
E
G
|
G
A
|
A
E
x
H
I
x
V
V
x
A
A
x
L
I
x
G
A
|
A
R
|
R
T
x
R
Q
x
L
G
x
D
A
|
A
L
|
L
E
|
E
E
x
S
L
|
L
D
x
K
D
x
E
Q
x
K
I
x
L
R
x
S
K
x
A
A
x
S
G
|
G
G
x
V
K
|
K
P
 
-
L
x
V
V
|
V
L
x
T
V
x
C
P
x
K
E
x
T
D
|
D
L
x
V
C
x
T
K
x
D
P
x
R
G
x
K
L
x
Q
I
x
V
E
|
E
Q
x
G
V
x
L
A
x
V
A
x
K
A
|
A
I
x
A
F
x
T
Q
x
E
R
x
E
W
x
L
A
x
G
R
x
P
L
x
V
D
|
D
I
|
I
L
|
L
V
|
V
G
x
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
A
x
V
I
x
M
G
 
-
G
 
-
G
x
Y
L
x
F
T
|
T
P
x
M
V
x
M
A
|
A
Q
x
N
H
x
T
A
x
Q
P
x
M
D
|
D
D
x
E
W
|
W
E
|
E
E
x
R
A
x
T
F
x
V
A
x
D
V
|
V
N
|
N
V
x
C
T
x
K
A
x
G
N
x
I
W
x
L
R
x
N
L
x
S
I
x
L
R
x
A
A
x
S
C
x
T
D
x
V
P
|
P
L
x
G
L
x
M
R
x
L
M
x
A
A
x
R
P
x
G
A
x
K
G
|
G
R
x
H
A
x
V
V
|
V
F
x
A
T
x
I
T
x
S
A
x
S
D
|
D
A
|
A
A
x
G
R
|
R
H
x
K
A
x
V
E
x
F
P
|
P
F
x
G
W
x
L
G
|
G
A
x
V
Y
|
Y
A
x
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
x
F
A
x
F
L
x
V
E
|
E
T
x
A
M
x
T
V
x
L
R
x
Q
T
x
A
W
x
L
A
x
R
A
x
L
E
|
E
I
x
T
A
|
A
N
x
G
V
 
-
T
x
Q
S
x
G
V
x
L
K
x
R
A
x
V
N
x
T
L
x
A
L
x
V
D
x
Q
P
|
P
G
|
G
V
x
N
V
x
T
A
|
A
T
|
T
R
x
D
L
|
L
R
x
L
S
x
G
I
x
M
A
x
S
F
x
T
P
x
D
G
x
A
E
|
E
-
x
A
-
x
I
-
x
K
-
x
K
-
x
Y
-
x
G
D
x
E
P
|
P
-
x
S
-
x
G
A
|
A
K
x
Q
L
x
I
A
x
L
Q
x
D
P
|
P
D
x
E
D
|
D
V
|
V
A
|
A
G
x
N
A
x
S
F
x
I
L
x
I
D
x
Y
-
x
A
L
|
L
C
x
R
L
x
Q
P
|
P
D
x
E
C
x
H
T
x
V
R
 
A
Q
 
M
G
 
N
E
 
E
I
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3ai3C The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
28% identity, 94% coverage: 1:224/239 of query aligns to 1:241/263 of 3ai3C

query
sites
3ai3C
M
 
M
S
 
D
G
 
M
R
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
|
S
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
A
|
A
R
|
R
T
x
Q
Q
 
V
G
 
D
A
x
R
L
 
L
E
 
H
E
 
E
L
 
A
D
 
A
D
 
R
Q
 
S
I
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
K
G
 
F
G
 
G
K
 
V
P
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
E
V
 
V
P
 
A
E
 
V
D
|
D
L
x
V
C
 
A
K
 
T
P
 
P
G
 
E
L
 
G
I
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
S
I
 
V
F
 
R
Q
 
S
R
 
S
W
 
F
A
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
I
 
-
G
 
-
G
|
G
G
 
S
L
 
N
T
 
E
P
 
T
V
 
I
A
 
M
Q
 
E
H
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
E
D
 
K
W
 
W
E
 
Q
E
 
F
A
 
Y
F
 
W
A
 
E
V
 
L
N
 
L
V
 
V
T
 
M
A
 
A
N
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
G
C
 
L
D
 
V
P
 
P
L
 
G
L
 
M
R
 
R
M
 
A
A
 
R
P
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
A
A
 
I
V
 
I
F
 
H
T
x
N
T
 
A
A
x
S
D
 
I
A
 
C
A
 
A
R
 
-
H
 
-
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
W
 
W
G
 
Y
A
x
E
-
 
P
-
 
I
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
M
T
 
M
M
 
F
V
 
S
R
 
K
T
 
T
W
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
I
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
|
P
G
|
G
V
 
L
V
x
I
A
 
L
T
|
T
-
 
P
-
 
D
-
x
W
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
R
 
Q
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
D
P
 
E
G
 
H
E
 
A
D
 
P
P
 
I
A
 
K
K
 
R
L
 
F
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
V
D
 
F
L
 
L
C
 
C

Sites not aligning to the query:

3ai3A The crystal structure of l-sorbose reductase from gluconobacter frateurii complexed with NADPH and l-sorbose (see paper)
28% identity, 94% coverage: 1:224/239 of query aligns to 1:241/263 of 3ai3A

query
sites
3ai3A
M
 
M
S
 
D
G
 
M
R
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
|
S
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
A
|
A
R
|
R
T
x
Q
Q
 
V
G
 
D
A
x
R
L
 
L
E
 
H
E
 
E
L
 
A
D
 
A
D
 
R
Q
 
S
I
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
K
G
 
F
G
 
G
K
 
V
P
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
E
V
 
V
P
 
A
E
x
V
D
|
D
L
x
V
C
 
A
K
 
T
P
 
P
G
 
E
L
 
G
I
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
S
I
 
V
F
 
R
Q
 
S
R
 
S
W
 
F
A
 
G
R
 
G
L
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
T
I
 
-
G
 
-
G
|
G
G
 
S
L
 
N
T
 
E
P
 
T
V
 
I
A
 
M
Q
 
E
H
 
A
A
 
A
P
 
D
D
 
E
D
 
K
W
 
W
E
 
Q
E
 
F
A
 
Y
F
 
W
A
 
E
V
 
L
N
 
L
V
 
V
T
 
M
A
 
A
N
 
A
W
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
G
C
 
L
D
 
V
P
 
P
L
 
G
L
 
M
R
 
R
M
 
A
A
 
R
P
 
G
A
 
G
G
 
G
R
 
A
A
 
I
V
 
I
F
 
H
T
x
N
T
 
A
A
x
S
D
 
I
A
 
C
A
 
A
R
 
-
H
 
-
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
F
x
L
W
 
W
G
 
Y
A
x
E
-
 
P
-
 
I
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
M
T
 
M
M
 
F
V
 
S
R
 
K
T
 
T
W
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
I
N
 
K
V
 
-
T
 
D
S
 
N
V
 
I
K
 
R
A
 
V
N
 
N
L
 
C
L
 
I
D
 
N
P
|
P
G
|
G
V
 
L
V
x
I
A
 
L
T
|
T
-
 
P
-
 
D
-
x
W
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
D
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
R
 
Q
S
 
S
I
 
V
A
 
A
F
 
D
P
 
E
G
 
H
E
 
A
D
 
P
P
 
I
A
 
K
K
 
R
L
 
F
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
V
D
 
F
L
 
L
C
 
C

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 81% coverage: 5:197/239 of query aligns to 3:188/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
G
I
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
S
Q
 
E
G
 
N
A
 
G
L
 
A
E
 
K
E
 
N
L
 
I
D
 
S
D
 
D
Q
 
Y
I
 
L
R
 
-
K
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
G
L
 
L
V
 
M
L
 
L
V
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
N
L
 
V
C
 
T
K
 
D
P
 
P
G
 
A
L
 
S
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
A
 
L
A
 
E
A
 
N
I
 
I
F
 
R
Q
 
A
R
 
E
W
 
F
A
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
I
 
T
G
 
R
G
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
-
P
 
-
V
 
L
A
 
M
Q
 
R
H
 
M
A
 
K
P
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
E
 
D
A
 
I
F
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
V
 
L
T
 
S
A
 
S
N
 
V
W
 
F
R
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
C
 
V
D
 
M
P
 
R
L
 
A
L
x
M
R
 
M
M
 
K
A
 
K
P
 
R
A
 
C
G
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
I
F
 
T
T
 
I
T
 
G
A
 
S
D
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
T
H
 
M
A
 
G
E
 
N
P
 
A
F
 
G
W
 
Q
G
 
A
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
I
T
 
G
M
 
F
V
 
S
R
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
S
V
 
-
T
 
R
S
 
G
V
 
I
K
 
T
A
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
V
D
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
A
 
E
T
 
T
R
 
D
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011384488.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011384488.1
MSGRLEGRVALVTGASRGIGAAVARRLAAEGAEIVAIARTQGALEELDDQIRKAGGKPLV
LVPEDLCKPGLIEQVAAAIFQRWARLDILVGNAGAIGGGLTPVAQHAPDDWEEAFAVNVT
ANWRLIRACDPLLRMAPAGRAVFTTADAARHAEPFWGAYAASKAALETMVRTWAAEIANV
TSVKANLLDPGVVATRLRSIAFPGEDPAKLAQPDDVAGAFLDLCLPDCTRQGEIIRTSP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory