SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011384971.1 AMB_RS13035 NAD(P)-dependent oxidoreductase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 99% coverage: 2:246/248 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
F
 
L
E
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
C
 
E
T
 
A
V
 
A
K
 
R
S
 
V
M
 
F
A
 
M
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
V
 
-
E
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
G
K
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
A
T
 
N
A
 
P
K
 
G
G
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
V
E
 
V
F
 
F
V
 
I
R
 
R
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
H
R
 
R
V
 
L
K
 
V
E
 
E
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
E
T
 
R
R
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
I
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
G
 
T
H
 
R
I
x
D
Q
 
S
P
 
M
F
 
L
V
 
S
D
x
K
N
 
M
D
 
T
D
 
V
A
 
D
F
 
Q
I
 
F
A
 
Q
K
 
Q
V
 
V
M
 
I
S
 
N
L
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
I
 
F
E
 
H
L
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
K
 
Q
K
 
G
T
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
Y
G
 
G
S
x
N
L
x
V
G
 
G
E
x
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
V
K
 
A
S
 
E
E
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
V
L
 
I
E
 
E
A
x
K
F
 
M
L
 
K
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
A
I
 
Y
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
H
R
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
M
M
 
M

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
36% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:256/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
M
 
I
K
 
N
F
 
M
E
 
R
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
M
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Y
 
N
C
 
G
T
 
C
V
 
A
K
 
R
S
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
Y
I
 
L
A
 
I
D
|
D
-
x
R
I
 
S
N
 
N
V
 
L
E
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
-
K
 
-
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
L
 
M
T
 
R
A
 
E
K
 
A
G
 
G
F
 
L
K
 
N
A
 
A
E
 
N
F
 
H
V
 
V
R
 
Q
L
 
V
D
|
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
K
 
Q
A
 
E
N
 
S
I
 
L
A
 
T
R
 
S
V
 
A
K
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
I
V
 
A
A
 
A
T
 
E
R
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
A
A
|
A
G
 
G
W
 
V
G
 
G
H
 
D
I
 
S
Q
 
R
P
 
M
F
 
F
V
 
L
D
 
D
N
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
A
F
 
H
I
 
Y
A
 
K
K
 
K
V
 
V
M
 
I
S
 
D
L
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
P
 
T
I
 
W
E
 
N
L
 
S
I
 
C
R
 
R
A
 
A
F
 
A
F
 
V
P
 
P
L
 
H
M
 
M
I
 
L
E
 
S
K
 
N
K
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
G
S
|
S
D
 
I
A
 
S
G
 
G
R
 
P
-
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
D
L
 
P
G
 
G
E
 
W
S
 
T
V
 
V
Y
|
Y
S
 
A
A
 
L
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
I
 
F
A
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
E
G
 
F
A
 
A
R
 
G
F
 
Q
N
 
N
I
 
I
N
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
L
P
|
P
G
|
G
P
 
S
T
x
M
D
 
D
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
 
M
K
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
P
S
 
A
E
 
D
P
 
P
E
 
Q
K
 
S
F
 
V
L
 
I
E
 
D
A
 
E
F
 
I
L
 
A
K
 
A
V
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
L
R
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
I
Q
 
D
E
 
D
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
 
L
I
 
A
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
I
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
I
S
 
V
V
 
L
N
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
F
T
 
T
M
 
L

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:245/248 of query aligns to 5:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
F
 
L
E
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
C
 
E
T
 
I
V
 
A
K
 
K
S
 
K
M
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
C
E
 
Q
K
 
E
A
 
T
A
 
A
A
 
N
E
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
E
 
L
F
 
S
V
 
A
R
 
P
L
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
D
N
 
A
I
 
Y
A
 
K
R
 
Q
V
 
A
K
 
I
E
 
E
H
 
L
V
 
T
V
 
Q
A
 
K
T
 
T
R
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
I
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
G
x
Q
H
 
H
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
D
 
E
N
 
F
D
 
P
D
 
T
A
 
A
F
 
V
I
 
F
A
 
Q
K
 
K
V
 
L
M
 
V
S
 
Q
L
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
A
I
 
F
E
 
I
L
 
G
I
 
I
R
 
K
A
 
H
F
 
V
F
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
I
 
K
E
 
A
K
 
Q
K
 
K
T
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
x
N
G
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
L
 
A
G
 
G
E
x
K
S
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
G
 
C
A
 
A
R
 
R
F
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
 
V
K
 
R
S
 
G
E
x
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
E
 
S
K
 
A
F
 
L
L
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
M
I
 
V
P
 
P
M
 
Q
R
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
G
Y
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
M
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:245/248 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
F
 
L
E
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
C
 
E
T
 
I
V
 
A
K
 
K
S
 
K
M
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
V
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
C
E
 
Q
K
 
E
A
 
T
A
 
A
A
 
N
E
 
S
L
 
L
T
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
E
 
L
F
 
S
V
 
A
R
 
P
L
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
D
N
 
A
I
 
Y
A
 
K
R
 
Q
V
 
A
K
 
I
E
 
E
H
 
L
V
 
T
V
 
Q
A
 
K
T
 
T
R
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
I
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
|
G
W
 
F
G
x
Q
H
 
H
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
E
D
 
E
N
 
F
D
 
P
D
 
T
A
 
A
F
 
V
I
 
F
A
 
Q
K
 
K
V
 
L
M
 
V
S
 
Q
L
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
A
I
 
F
E
 
I
L
 
G
I
 
I
R
 
K
A
 
H
F
 
V
F
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
I
 
K
E
 
A
K
 
Q
K
 
K
T
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
D
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
L
 
A
G
 
G
E
x
K
S
 
A
V
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
E
G
 
C
A
 
A
R
 
R
F
 
D
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
Y
T
x
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
L
 
V
K
 
R
S
 
G
E
x
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
P
 
D
E
 
S
K
 
A
F
 
L
L
 
E
E
 
D
A
 
V
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
M
I
 
V
P
 
P
M
 
Q
R
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
L
Q
 
S
P
 
V
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
Y
I
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
G
Y
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
M
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:244/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
F
 
F
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
T
M
 
L
A
 
V
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
 
A
N
x
T
V
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
A
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
L
R
 
M
L
|
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
S
V
 
V
K
 
L
E
 
E
H
 
N
V
 
V
V
 
R
A
 
A
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
D
F
 
E
I
 
W
A
 
N
K
 
D
V
 
I
M
 
I
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
P
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
A
E
 
L
P
 
T
E
 
D
K
 
E
F
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
T
L
 
L
K
 
A
V
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
V

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
37% identity, 97% coverage: 6:246/248 of query aligns to 2:251/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
T
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
F
A
 
A
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
A
 
Y
D
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
A
A
 
W
D
|
D
I
x
L
N
 
A
V
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
A
K
 
A
A
 
L
A
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
I
T
 
A
A
 
D
K
 
A
G
 
G
F
 
G
K
 
S
A
 
A
E
 
D
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
A
K
 
A
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
E
R
 
A
V
 
A
K
 
V
E
 
A
H
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
A
T
 
E
R
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
|
G
W
 
I
G
 
L
H
 
H
I
 
D
Q
 
G
P
 
Q
F
 
L
V
 
V
D
 
K
N
 
V
D
 
K
D
 
G
A
 
G
F
 
E
I
 
V
A
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
M
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
A
V
 
V
M
 
I
S
 
S
L
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
V
I
 
F
E
 
L
L
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
V
F
 
A
P
 
P
L
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
K
 
A
K
 
K
T
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
V
 
A
A
 
S
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
Y
G
 
G
S
 
N
L
 
F
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
Y
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
E
L
 
M
L
 
V
K
 
Q
S
 
Q
E
 
M
P
 
P
E
 
E
K
 
R
F
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
M
L
 
V
K
 
A
V
 
R
I
 
T
P
 
P
M
 
V
R
 
G
R
 
R
F
 
I
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
Q
 
V
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
R
S
 
A
I
 
Y
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
E
R
 
E
A
 
S
D
 
G
Y
 
F
I
 
I
T
 
S
G
 
G
Q
 
T
V
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
V
M
 
V

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
F
 
L
E
 
D
D
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
C
 
A
T
 
V
V
 
A
K
 
H
S
 
S
M
 
Y
A
 
A
E
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
V
 
E
E
 
D
A
 
H
G
 
G
E
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
E
E
 
D
L
 
I
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
G
 
G
F
 
G
K
 
E
A
 
A
E
 
S
F
 
F
V
 
V
R
 
K
L
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
K
 
P
A
 
E
N
 
E
I
 
V
A
 
E
R
 
A
V
 
L
K
 
V
E
 
K
H
 
R
V
 
T
V
 
V
A
 
E
T
 
I
R
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
C
 
C
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
G
 
G
H
 
G
I
 
E
Q
 
Q
P
 
A
F
 
L
V
 
A
D
 
G
N
 
D
D
 
Y
-
 
G
-
 
L
D
 
D
A
 
S
F
 
W
I
 
-
A
 
R
K
 
K
V
 
V
M
 
L
S
 
S
L
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
G
P
 
V
I
 
F
E
 
Y
L
 
G
I
 
C
R
 
K
A
 
Y
F
 
E
F
 
L
P
 
E
L
 
Q
M
 
M
I
 
E
E
 
K
K
 
N
K
 
G
T
 
G
G
 
G
K
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
D
 
I
A
 
H
G
 
G
R
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
A
L
 
P
G
 
L
E
 
S
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
A
L
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
N
L
 
I
A
 
G
R
 
A
E
 
E
G
 
Y
A
 
G
R
 
Q
F
 
K
N
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
P
x
Y
T
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
L
 
L
K
 
E
S
 
S
E
 
L
P
 
T
E
 
K
K
 
E
F
 
M
L
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
I
K
 
S
V
 
K
I
 
H
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
S
 
L
I
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
S
S
 
S
N
 
E
R
 
K
A
 
S
D
 
S
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
L
 
Y
S
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
M
 
A
V
 
V

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:244/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
K
 
N
F
 
F
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
 
A
N
x
T
V
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
A
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
S
V
 
V
K
 
L
E
 
E
H
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
E
I
 
W
A
 
N
K
 
D
V
 
I
M
 
I
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
P
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
A
E
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
V

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:244/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
K
 
S
F
 
F
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
T
M
 
L
A
 
V
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
 
A
N
 
T
V
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
A
K
 
K
A
 
N
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
A
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
L
D
 
N
V
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
S
V
 
V
K
 
L
E
 
E
H
 
N
V
 
I
V
 
R
A
 
A
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
D
F
 
E
I
 
W
A
 
N
K
 
D
V
 
I
M
 
I
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
P
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
M
P
 
R
L
 
A
M
|
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
C
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
 
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
A
E
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
|
A
S
|
S
N
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
V

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 1:243/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
K
 
N
F
 
F
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
 
A
N
x
T
V
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
A
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
S
V
 
V
K
 
L
E
 
E
H
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
E
F
x
E
I
 
W
A
 
N
K
 
D
V
 
I
M
 
I
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
P
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
G
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
A
E
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
V
x
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
V

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
37% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 1:243/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
K
 
N
F
 
F
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
x
A
N
x
T
V
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
A
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
L
R
 
M
L
|
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
S
V
 
V
K
 
L
E
 
E
H
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
|
G
W
x
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
E
I
 
W
A
 
N
K
 
D
V
 
I
M
 
I
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
P
 
V
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
M
P
 
R
L
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
G
G
 
G
E
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
A
E
 
L
P
 
S
E
 
D
K
 
D
F
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
I
L
 
L
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
V

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 8:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
M
 
M
K
 
S
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
T
 
K
A
 
A
K
 
N
G
 
G
F
 
V
K
 
E
A
 
G
E
 
A
F
 
G
V
 
L
R
 
V
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
S
K
 
D
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
T
K
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
R
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
 
G
W
 
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
V
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
D
A
 
D
F
 
E
I
 
W
A
 
F
K
 
D
V
 
V
M
 
V
S
 
N
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
S
P
 
L
I
 
Y
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
T
E
 
K
K
 
A
K
 
R
T
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
A
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
F
 
R
N
 
A
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
x
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
P
 
D
L
x
M
L
x
T
K
 
R
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
A
F
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
G
V
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
S
 
V
I
 
V
V
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:245/248 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
K
 
N
F
 
L
E
 
T
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
T
 
A
V
 
V
K
 
Q
S
 
A
M
 
F
A
 
L
E
 
G
L
 
Q
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
V
 
E
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
K
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
M
E
 
V
L
 
R
T
 
K
A
 
E
K
 
N
G
 
N
F
 
D
K
 
R
A
 
L
E
 
H
F
 
F
V
 
V
R
 
Q
L
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
N
 
A
I
 
C
A
 
Q
R
 
H
V
 
A
K
 
V
E
 
E
H
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
H
T
 
T
R
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
C
 
I
N
 
N
V
x
N
A
 
A
G
|
G
W
 
I
G
 
E
H
 
I
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
F
 
I
V
 
H
D
 
E
N
 
M
D
 
E
D
 
L
A
 
S
F
 
D
I
 
W
A
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
L
S
 
Q
L
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
M
I
 
F
E
 
L
L
 
M
I
 
S
R
 
K
A
 
H
F
 
A
F
 
L
P
 
K
L
 
H
M
 
M
I
 
L
E
 
A
K
 
A
K
 
G
T
 
K
G
 
G
K
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
C
S
|
S
D
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
W
L
 
P
G
 
D
E
 
I
S
 
P
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
I
 
L
A
 
Q
F
 
L
S
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
V
E
 
D
G
 
Y
A
 
A
R
 
K
F
 
H
N
 
Q
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
I
T
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
-
K
 
-
S
 
-
E
 
N
P
 
E
E
 
K
K
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
K
A
 
E
F
 
K
L
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
N
P
 
P
M
 
L
R
 
L
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
V
I
 
M
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
L
A
 
S
D
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
L
 
I
S
 
T
V
 
A
N
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 1:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
K
 
G
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
Y
 
K
C
 
Q
T
 
T
V
 
A
K
 
L
S
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
N
D
|
D
I
 
I
N
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
V
E
 
R
K
 
A
A
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
T
 
S
A
 
A
K
 
R
G
 
G
F
 
H
K
 
R
A
 
V
E
 
L
F
 
G
V
 
A
R
 
V
L
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
N
 
A
I
 
V
A
 
D
R
 
G
V
 
M
K
 
V
E
 
K
H
 
Q
V
 
T
V
 
I
A
 
D
T
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
 
A
G
 
G
W
 
M
G
 
E
H
 
R
I
 
A
Q
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
D
 
K
N
 
L
D
 
S
D
 
E
A
 
A
F
 
D
I
 
W
A
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
S
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
T
I
 
F
E
 
L
L
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
V
F
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
N
K
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
G
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
A
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
 
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
L
 
W
K
 
D
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
D
L
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
L
 
L
K
 
S
V
 
R
I
 
Q
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
Q
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
D
N
 
D
R
 
D
A
 
S
D
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
R
T
 
S
M
 
L

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
M
 
M
K
 
S
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
T
 
K
A
 
A
K
 
N
G
 
G
F
 
V
K
 
E
A
 
G
E
 
A
F
 
G
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
K
 
D
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
T
K
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
R
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
G
W
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
F
 
R
V
 
M
D
 
K
N
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
W
F
|
F
I
 
-
A
 
-
K
 
D
V
 
V
M
x
V
S
 
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
P
 
L
I
 
Y
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
T
E
 
K
K
 
A
K
 
R
T
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
A
 
G
F
|
F
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
F
 
R
N
 
A
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
A
F
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
G
V
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
S
 
V
I
 
V
V
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 4:247/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
F
 
L
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
K
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
L
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
T
I
 
A
N
x
T
V
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
T
 
L
A
 
-
K
 
-
G
 
G
F
 
D
K
 
N
A
 
G
E
 
K
F
 
G
V
 
M
R
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
K
 
P
A
 
E
N
 
S
I
 
I
A
 
E
R
 
A
V
 
V
K
 
L
E
 
K
H
 
A
V
 
I
V
 
T
A
 
D
T
 
E
R
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
|
A
G
 
G
W
x
I
G
 
T
H
 
R
I
 
D
Q
 
N
P
 
L
F
 
L
V
 
M
D
 
R
N
 
M
D
 
K
D
 
E
A
 
E
F
 
E
I
 
W
A
 
S
K
 
D
V
 
I
M
 
M
S
 
E
L
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
P
 
I
I
 
F
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
K
 
K
K
 
R
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
S
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
V
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
T
x
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
L
x
M
L
 
T
K
 
K
S
 
A
E
 
L
P
 
N
E
 
D
K
 
E
F
 
Q
L
 
R
E
 
T
A
 
A
F
 
T
L
 
L
K
 
A
V
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
Q
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
S
 
A
I
 
V
V
 
A
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
P
R
 
E
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M
V
 
I

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
Y
 
K
C
 
Q
T
 
T
V
 
A
K
 
L
S
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
N
D
|
D
I
|
I
N
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
V
E
 
R
K
 
A
A
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
F
T
 
S
A
 
A
K
 
R
G
 
G
F
 
H
K
 
R
A
 
V
E
 
L
F
 
G
V
 
A
R
 
V
L
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
N
 
A
I
 
V
A
 
D
R
 
G
V
 
M
K
 
V
E
 
K
H
 
Q
V
 
T
V
 
I
A
 
D
T
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
x
N
A
 
A
G
|
G
W
 
M
G
 
E
H
 
R
I
 
A
Q
 
G
P
 
A
F
 
L
V
 
R
D
 
K
N
 
L
D
 
S
D
 
E
A
 
A
F
 
D
I
 
W
A
 
D
K
 
V
V
 
T
M
 
I
S
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
T
I
 
F
E
 
L
L
 
C
I
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
V
F
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
N
K
 
K
T
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
D
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
V
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
G
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
A
N
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
T
x
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
L
 
W
K
 
D
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
K
F
 
D
L
 
Q
E
 
Q
A
 
F
F
 
L
L
 
L
K
 
S
V
 
R
I
 
Q
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
Q
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
S
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
D
N
 
D
R
 
D
A
 
S
D
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
R
T
 
S
M
 
L

4bnyA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 4-(2-phenylthieno(3,2-d) pyrimidin-4-yl)morpholine at 1.8a resolution (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 2:238/239 of 4bnyA

query
sites
4bnyA
M
 
M
K
 
S
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
T
 
K
A
 
A
K
 
N
G
 
G
F
 
V
K
 
E
A
 
G
E
 
A
F
 
G
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
K
 
D
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
T
K
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
R
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
-
W
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
F
 
R
V
 
M
D
 
K
N
 
D
D
 
D
D
 
E
A
x
W
F
 
F
I
 
-
A
 
-
K
 
D
V
 
V
M
 
V
S
 
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
P
 
L
I
 
Y
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
T
E
 
K
K
 
A
K
 
R
T
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
A
x
G
F
|
F
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
F
 
R
N
 
A
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
A
F
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
G
V
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
S
 
V
I
 
V
V
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M

4bo7A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2,3-dihydro-1h-inden- 5-yl)tetrazolo(1,5-b)pyridazin-6-amine at 2.6a resolution (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:237/238 of 4bo7A

query
sites
4bo7A
M
 
M
K
 
S
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
T
 
K
A
 
A
K
 
N
G
 
G
F
 
V
K
 
E
A
 
G
E
 
A
F
 
G
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
K
 
D
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
T
K
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
R
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
-
W
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
K
N
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
W
F
|
F
I
 
-
A
 
-
K
 
D
V
 
V
M
x
V
S
 
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
P
 
L
I
 
Y
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
T
E
 
K
K
 
A
K
 
R
T
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
A
 
G
F
|
F
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
F
 
R
N
 
A
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
A
F
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
G
V
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
S
 
V
I
 
V
V
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M

4bnxA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 6-(4-(2-chloroanilino)- 1h-quinazolin-2-ylidene)cyclohexa-2, 4-dien-1-one at 2.3a resolution (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:239/239 of 4bnxA

query
sites
4bnxA
M
 
M
K
 
S
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Q
C
 
A
T
 
I
V
 
A
K
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
V
 
A
E
 
S
A
 
G
G
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
T
 
K
A
 
A
K
 
N
G
 
G
F
 
V
K
 
E
A
 
G
E
 
A
F
 
G
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
K
 
D
A
 
E
N
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
A
V
 
T
K
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
T
 
H
R
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
-
W
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
F
 
R
V
 
M
D
 
K
N
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
W
F
 
F
I
 
-
A
 
-
K
 
D
V
 
V
M
x
V
S
x
N
L
 
T
N
 
N
L
|
L
T
 
N
G
 
S
P
 
L
I
 
Y
E
 
R
L
 
L
I
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
F
 
L
P
 
R
L
 
G
M
 
M
I
 
T
E
 
K
K
 
A
K
 
R
T
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
D
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
S
 
N
L
 
A
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
A
x
G
F
|
F
S
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
V
A
 
G
R
 
S
F
 
R
N
 
A
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
T
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
K
 
R
S
 
E
E
 
L
P
 
P
E
 
E
K
 
A
F
 
Q
L
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
G
V
 
Q
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
S
 
V
I
 
V
V
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
R
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
L
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>WP_011384971.1 AMB_RS13035 NAD(P)-dependent oxidoreductase
MKFEDKVALITGGASGIGYCTVKSMAELGADVLIADINVEAGEKAAAELTAKGFKAEFVR
LDVTDKANIARVKEHVVATRGRLDILCNVAGWGHIQPFVDNDDAFIAKVMSLNLTGPIEL
IRAFFPLMIEKKTGKIVNVASDAGRVGSLGESVYSAAKGGLIAFSKALAREGARFNINVN
AICPGPTDTPLLKSEPEKFLEAFLKVIPMRRFGQPQEVADSIVFMASNRADYITGQVLSV
NGGITMVG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory