SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011385138.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385138.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7poaA An irreversible, promiscuous and highly thermostable claisen- condensation biocatalyst drives the synthesis of substituted pyrroles
40% identity, 91% coverage: 26:383/392 of query aligns to 34:386/398 of 7poaA

query
sites
7poaA
P
 
P
V
 
Q
D
 
E
P
 
P
L
 
V
P
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
T
R
 
R
V
 
V
G
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
V
V
 
V
N
 
N
F
 
L
S
 
A
S
 
S
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
F
S
 
A
R
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
Y
V
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
W
 
Y
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
V
R
 
R
L
 
T
V
 
I
T
 
A
G
 
G
H
 
T
L
 
F
A
 
T
A
 
Y
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
C
 
F
K
 
K
Q
 
G
T
 
T
E
 
E
A
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
|
G
W
x
F
Q
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
Q
S
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
K
K
 
E
A
 
G
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
D
 
D
K
 
E
L
 
L
I
 
N
H
|
H
A
 
A
S
|
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
K
A
 
A
R
 
T
R
 
R
Y
 
L
R
 
V
Y
 
F
R
 
R
H
 
H
D
 
A
D
 
D
L
 
V
D
 
A
H
 
H
L
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
-
D
 
D
K
 
T
E
 
D
G
 
G
P
 
L
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
D
A
 
K
L
 
I
A
 
V
A
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
K
R
 
K
W
 
Y
D
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
G
T
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
E
N
 
K
G
 
G
F
 
K
G
 
G
L
 
T
S
 
V
P
 
H
G
 
H
M
 
F
G
 
G
A
 
F
E
 
H
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
D
-
 
V
L
 
V
A
 
Q
M
 
V
G
 
A
T
|
T
F
 
L
S
 
S
K
|
K
G
 
A
L
 
W
G
 
A
S
 
G
F
 
I
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
C
 
G
S
 
A
A
 
R
R
 
E
L
 
L
R
 
K
H
 
D
Y
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
R
 
K
A
 
A
S
 
R
G
 
P
L
 
F
I
 
L
Y
 
F
A
x
S
T
|
T
G
 
S
L
 
H
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
L
D
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
E
R
 
K
L
 
-
E
 
E
G
 
P
E
 
E
R
 
R
T
 
V
-
 
E
R
 
R
L
 
L
Q
 
W
M
 
E
M
 
N
G
 
T
R
 
R
R
 
Y
L
 
F
R
 
K
D
 
R
G
 
E
L
 
L
R
 
A
A
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
L
P
 
G
S
 
S
A
 
Q
S
 
T
Q
 
P
I
 
I
V
 
T
P
 
P
L
 
V
I
 
L
L
 
F
G
 
G
D
 
E
E
 
A
G
 
P
R
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
E
V
 
A
A
 
S
K
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
L
D
 
E
R
 
E
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
A
I
 
V
A
 
G
I
 
I
R
 
G
P
 
F
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
R
G
 
G
T
 
K
S
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
F
 
N
A
 
I
L
 
V
S
 
T
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
T
D
 
K
A
 
E
D
 
M
L
 
L
D
 
D
R
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
A

Q0P5L8 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial; AKB ligase; Aminoacetone synthase; Glycine acetyltransferase; EC 2.3.1.29 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
38% identity, 88% coverage: 42:386/392 of query aligns to 67:410/419 of Q0P5L8

query
sites
Q0P5L8
L
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
F
S
 
C
S
 
A
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
Q
R
 
A
S
 
G
R
 
L
R
 
R
W
 
T
L
 
L
N
 
K
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
L
G
 
S
A
 
S
S
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
I
T
 
C
G
 
G
H
 
T
L
 
Q
A
 
S
A
 
I
M
 
H
E
 
K
A
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
F
K
 
H
Q
 
Q
T
 
R
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
Y
A
 
P
S
 
S
G
 
C
W
 
F
Q
 
D
C
 
A
N
 
N
A
 
T
S
 
G
V
 
L
L
 
F
P
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
T
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
S
E
 
E
P
 
D
L
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
D
K
 
E
L
 
L
I
 
N
H
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
I
E
 
R
L
 
L
S
 
C
G
 
K
A
 
A
R
 
H
R
 
K
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
D
 
L
D
 
D
L
 
M
D
 
A
H
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
Q
A
 
-
H
 
E
A
 
A
D
 
Q
K
 
K
E
 
H
G
 
R
P
 
L
R
 
R
F
 
L
I
 
V
V
 
A
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
A
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
I
A
 
C
A
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
Q
W
 
Y
D
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
V
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
S
H
 
H
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
T
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
D
P
 
E
G
 
L
M
 
L
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
D
-
 
Q
A
 
V
E
 
T
L
 
I
A
 
I
M
 
N
G
 
S
T
 
T
F
 
L
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
-
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
S
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
T
A
 
T
C
 
G
S
 
P
A
 
G
R
 
A
L
 
L
R
 
V
H
 
S
Y
 
L
L
 
L
I
 
R
N
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
P
L
 
Y
I
 
L
Y
 
F
A
 
S
T
 
N
G
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
C
I
 
A
D
 
S
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
L
P
 
M
R
 
E
L
 
S
E
 
N
G
 
A
E
 
I
R
 
V
T
 
Q
R
 
S
L
 
M
Q
 
A
M
 
A
M
 
K
G
 
T
R
 
L
R
 
R
L
 
F
R
 
R
D
 
S
G
 
Q
L
 
M
R
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
T
T
 
I
G
 
S
P
 
G
S
 
A
A
 
N
S
 
H
Q
 
P
I
 
I
V
 
C
P
 
P
L
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
D
E
 
A
G
 
R
R
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
N
V
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
D
L
 
M
E
 
L
D
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
L
 
F
G
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
F
R
 
S
P
 
Y
P
 
P
T
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
K
G
 
G
T
 
K
S
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
F
 
V
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
D
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
F
L
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

P12998 8-amino-7-oxononanoate synthase; AONS; 7-keto-8-amino-pelargonic acid synthase; 7-KAP synthase; KAPA synthase; 8-amino-7-ketopelargonate synthase; EC 2.3.1.47 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
40% identity, 90% coverage: 32:384/392 of query aligns to 30:380/384 of P12998

query
sites
P12998
A
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
W
R
 
L
V
 
V
G
 
A
G
 
D
-
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
Y
V
 
L
N
 
N
F
 
F
S
 
S
S
 
S
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
H
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
A
S
 
W
R
 
Q
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
N
 
E
E
 
Q
Y
 
F
G
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
S
R
 
G
L
 
H
V
 
V
T
 
S
G
 
G
H
 
Y
L
 
S
A
 
V
A
 
V
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
C
 
W
K
 
L
Q
 
G
T
 
Y
E
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
I
S
 
S
G
|
G
W
x
F
Q
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
M
D
 
A
K
 
K
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
D
L
 
R
V
 
I
F
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
P
A
 
S
R
 
Q
R
 
L
Y
 
R
R
 
R
Y
 
F
R
 
A
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
T
H
 
H
L
 
L
E
 
A
S
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
H
 
P
A
 
C
D
 
-
K
 
-
E
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
E
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
S
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
T
S
 
Q
R
 
Q
W
 
H
D
 
N
A
 
G
F
 
W
L
 
L
Y
 
M
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
H
|
H
A
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
S
S
 
C
-
 
W
-
 
L
P
 
Q
G
 
K
M
 
V
G
 
K
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
L
M
 
V
G
 
V
T
|
T
F
 
F
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
F
G
 
G
S
 
V
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
S
 
S
A
 
S
R
 
T
L
 
V
R
 
A
H
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
Q
R
 
F
A
 
A
S
 
R
G
 
H
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
L
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
R
R
 
S
L
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
D
-
 
A
-
 
R
R
 
R
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
M
 
A
M
 
L
G
 
I
R
 
T
R
 
R
L
 
F
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
L
G
 
P
L
 
F
D
 
T
T
 
L
G
 
A
P
 
D
S
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
N
G
 
S
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
C
L
 
W
G
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
P
 
P
P
 
P
T
|
T
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
E
D
 
M
A
 
Q
D
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
V
I
 
L

Sites not aligning to the query:

2g6wA Suicide inhibition of a-oxamine synthase: structures of the covalent adducts of 8-amino-7-oxonanoate synthase with trifluoroalanine (see paper)
40% identity, 90% coverage: 32:384/392 of query aligns to 29:379/383 of 2g6wA

query
sites
2g6wA
A
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
W
R
 
L
V
 
V
G
 
A
G
 
D
-
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
Y
V
 
L
N
 
N
F
 
F
S
 
S
S
 
S
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
H
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
A
S
 
W
R
 
Q
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
N
 
E
E
 
Q
Y
 
F
G
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
S
R
 
G
L
 
H
V
 
V
T
 
S
G
 
G
H
 
Y
L
 
S
A
 
V
A
 
V
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
C
 
W
K
 
L
Q
 
G
T
 
Y
E
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
I
S
 
S
G
|
G
W
 
F
Q
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
M
D
 
A
K
 
K
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
D
L
 
R
V
 
I
F
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
P
A
 
S
R
 
Q
R
 
L
Y
 
R
R
 
R
Y
 
F
R
 
A
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
T
H
 
H
L
 
L
E
 
A
S
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
H
 
P
A
 
C
D
 
-
K
 
-
E
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
|
E
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
S
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
T
S
 
Q
R
 
Q
W
 
H
D
 
N
A
 
G
F
 
W
L
 
L
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
S
S
 
C
-
 
W
-
 
L
P
 
Q
G
 
K
M
 
V
G
 
K
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
L
M
 
V
G
 
V
T
 
T
F
 
F
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
F
G
 
G
S
 
V
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
S
 
S
A
 
S
R
 
T
L
 
V
R
 
A
H
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
Q
R
 
F
A
 
A
S
 
R
G
 
H
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
L
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
R
R
 
S
L
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
D
-
 
A
-
 
R
R
 
R
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
M
 
A
M
 
L
G
 
I
R
 
T
R
 
R
L
 
F
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
L
G
 
P
L
 
F
D
 
T
T
 
L
G
 
A
P
 
D
S
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
N
G
 
S
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
C
L
 
W
G
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
P
 
P
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
T
S
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
E
D
 
M
A
 
Q
D
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
V
I
 
L

1djeA Crystal structure of the plp-bound form of 8-amino-7-oxonanoate synthase (see paper)
39% identity, 94% coverage: 15:384/392 of query aligns to 10:379/383 of 1djeA

query
sites
1djeA
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
K
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
R
V
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
V
P
 
A
-
 
Q
-
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
W
R
 
L
V
 
V
G
 
A
G
 
D
-
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
Y
V
 
L
N
 
N
F
 
F
S
 
S
S
 
S
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
H
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
A
S
 
W
R
 
Q
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
N
 
E
E
 
Q
Y
 
F
G
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
S
R
 
G
L
 
H
V
 
V
T
 
S
G
 
G
H
 
Y
L
 
S
A
 
V
A
 
V
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
C
 
W
K
 
L
Q
 
G
T
 
Y
E
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
I
S
 
S
G
|
G
W
x
F
Q
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
M
D
 
A
K
 
K
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
D
L
 
R
V
 
I
F
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
P
A
 
S
R
 
Q
R
 
L
Y
 
R
R
 
R
Y
 
F
R
 
A
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
T
H
 
H
L
 
L
E
 
A
S
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
H
 
P
A
 
C
D
 
-
K
 
-
E
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
|
E
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
S
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
T
S
 
Q
R
 
Q
W
 
H
D
 
N
A
 
G
F
 
W
L
 
L
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
S
S
 
C
-
 
W
-
 
L
P
 
Q
G
 
K
M
 
V
G
 
K
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
L
M
 
V
G
 
V
T
|
T
F
 
F
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
F
G
 
G
S
 
V
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
S
 
S
A
 
S
R
 
T
L
 
V
R
 
A
H
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
Q
R
 
F
A
 
A
S
 
R
G
 
H
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
L
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
R
R
 
S
L
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
D
-
 
A
-
 
R
R
 
R
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
M
 
A
M
 
L
G
 
I
R
 
T
R
 
R
L
 
F
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
L
G
 
P
L
 
F
D
 
T
T
 
L
G
 
A
P
 
D
S
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
N
G
 
S
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
C
L
 
W
G
 
V
I
 
T
A
 
G
I
 
I
R
 
R
P
 
P
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
E
D
 
M
A
 
Q
D
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
V
I
 
L

1dj9A Crystal structure of 8-amino-7-oxonanoate synthase (or 7-keto- 8aminipelargonate or kapa synthase) complexed with plp and the product 8(s)-amino-7-oxonanonoate (or kapa). The enzyme of biotin biosynthetic pathway. (see paper)
39% identity, 94% coverage: 15:384/392 of query aligns to 10:379/383 of 1dj9A

query
sites
1dj9A
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
K
 
A
R
 
D
V
 
A
L
 
L
R
|
R
P
 
R
V
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
V
P
 
A
-
 
Q
-
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
W
R
 
L
V
 
V
G
 
A
G
 
D
-
 
D
R
 
R
E
 
Q
L
 
Y
V
 
L
N
 
N
F
 
F
S
 
S
S
 
S
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
H
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
A
S
 
W
R
 
Q
R
 
Q
W
 
G
L
 
A
N
 
E
E
 
Q
Y
 
F
G
 
G
A
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
S
R
 
G
L
 
H
V
 
V
T
 
S
G
 
G
H
 
Y
L
 
S
A
 
V
A
 
V
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
C
 
W
K
 
L
Q
 
G
T
 
Y
E
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
F
A
 
I
S
 
S
G
|
G
W
x
F
Q
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
Q
S
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
M
D
 
A
K
 
K
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
D
L
 
R
V
 
I
F
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
R
L
 
L
I
 
S
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
P
A
 
S
R
 
Q
R
 
L
Y
 
R
R
 
R
Y
 
F
R
 
A
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
T
H
 
H
L
 
L
E
 
A
S
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
A
A
 
S
H
 
P
A
 
C
D
 
-
K
 
-
E
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
|
E
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
S
T
 
A
D
 
P
M
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
Q
A
 
Q
L
 
V
A
 
T
S
 
Q
R
 
Q
W
 
H
D
 
N
A
 
G
F
 
W
L
 
L
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
N
 
Q
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
S
S
 
C
-
 
W
-
 
L
P
 
Q
G
 
K
M
 
V
G
 
K
A
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
L
M
 
V
G
 
V
T
|
T
F
 
F
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
F
G
 
G
S
 
V
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
A
V
 
V
A
 
L
C
 
C
S
 
S
A
 
S
R
 
T
L
 
V
R
 
A
H
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
Q
R
 
F
A
 
A
S
 
R
G
 
H
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
Q
L
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
R
R
 
S
L
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
D
-
 
A
-
 
R
R
 
R
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
M
 
A
M
 
L
G
 
I
R
 
T
R
 
R
L
 
F
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
A
 
L
G
 
P
L
 
F
D
 
T
T
 
L
G
 
A
P
 
D
S
 
S
A
 
C
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
N
G
 
S
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
L
 
L
E
 
R
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
C
L
 
W
G
 
V
I
 
T
A
 
G
I
|
I
R
 
R
P
 
P
P
 
P
T
|
T
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
E
D
 
M
A
 
Q
D
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
V
I
 
L

3tqxA Structure of the 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme a ligase (kbl) from coxiella burnetii (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:384/392 of query aligns to 1:386/396 of 3tqxA

query
sites
3tqxA
M
 
M
K
 
Q
G
 
E
L
 
I
D
 
L
D
 
S
S
 
Q
I
 
L
G
 
N
R
 
K
F
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
K
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
K
V
 
S
L
 
E
R
 
R
P
 
I
V
 
I
D
 
T
P
 
S
L
 
P
P
 
Q
A
 
N
G
 
A
R
 
E
V
 
I
R
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
L
N
 
N
F
 
F
S
 
C
S
 
A
N
|
N
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
A
R
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
A
V
 
L
V
 
I
E
 
K
R
 
T
S
 
A
R
 
Q
R
 
T
W
 
V
L
 
V
N
 
E
E
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
M
G
 
A
A
 
S
S
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
I
T
 
C
G
 
G
H
 
T
L
 
Q
A
 
T
A
 
I
M
 
H
E
 
K
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
D
I
 
I
A
 
S
R
 
E
C
 
F
K
 
L
Q
 
G
T
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
T
L
 
I
I
 
L
L
 
Y
A
 
S
S
|
S
G
x
C
W
x
F
Q
 
D
C
 
A
N
 
N
A
 
G
S
 
G
V
 
L
L
 
F
P
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
P
E
 
E
P
 
D
L
 
A
V
 
I
F
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
E
L
 
L
I
 
N
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
I
E
 
R
L
 
L
S
 
C
G
 
K
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
K
H
 
N
D
 
N
D
 
A
L
 
M
D
 
G
H
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
-
H
 
E
A
 
A
D
 
D
K
 
E
E
 
K
G
 
G
P
 
A
R
 
R
F
 
F
-
 
K
-
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
T
E
x
D
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
I
V
 
I
T
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
K
A
 
S
L
 
I
A
 
C
A
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
K
W
 
Y
D
 
N
A
 
A
F
 
L
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
x
S
H
|
H
A
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
R
G
 
G
L
 
T
S
 
P
P
 
E
G
 
Y
M
 
C
G
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
R
A
 
V
E
 
D
L
 
I
A
 
L
M
 
T
G
 
G
T
|
T
F
 
L
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
-
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
S
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
T
A
 
S
C
 
G
S
 
H
A
 
K
R
 
E
L
 
I
R
 
I
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
R
N
 
N
R
 
R
A
 
S
S
 
R
G
 
P
L
 
Y
I
 
L
Y
x
F
A
x
S
T
x
N
G
 
T
L
 
V
P
 
A
P
 
P
A
 
V
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
T
I
 
S
D
 
L
A
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
L
P
 
-
R
 
K
L
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
P
-
 
Q
-
 
L
R
 
R
T
 
K
R
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
M
 
E
M
 
N
G
 
S
R
 
R
R
 
Y
L
 
F
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
E
A
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
F
D
 
Q
T
 
L
G
 
V
P
 
P
S
 
G
A
 
N
S
 
H
Q
 
P
I
 
I
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
D
E
 
A
G
 
Q
R
 
L
T
 
A
L
 
T
A
 
N
V
 
M
A
 
A
K
 
D
A
 
H
L
 
L
E
 
L
D
 
Q
R
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
Y
G
 
V
I
 
V
A
 
G
I
 
F
R
 
S
P
 
Y
P
 
P
T
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
M
G
 
G
T
 
K
S
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
F
 
V
A
 
Q
L
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
T
D
 
Q
A
 
Q
D
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
A
I
 
F

2bwpA 5-aminolevulinate synthase from rhodobacter capsulatus in complex with glycine (see paper)
35% identity, 89% coverage: 38:384/392 of query aligns to 44:393/398 of 2bwpA

query
sites
2bwpA
G
 
G
G
 
K
R
 
Q
E
 
D
L
 
I
V
 
T
N
 
V
F
 
W
S
 
C
S
 
G
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
V
V
 
V
V
 
L
E
 
A
R
 
A
S
 
M
R
 
H
R
 
E
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
A
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
N
V
 
I
T
 
S
G
 
G
H
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
Y
M
 
H
E
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
G
C
 
L
K
 
H
Q
 
Q
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
F
A
 
S
S
 
S
G
x
A
W
x
Y
Q
 
N
C
 
A
N
 
N
A
 
D
S
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
V
L
 
L
W
 
F
G
 
P
A
 
G
E
 
L
P
 
-
L
 
I
V
 
I
F
 
Y
A
 
S
D
 
D
K
 
S
L
 
L
I
 
N
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
M
H
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
I
E
 
K
L
 
R
S
 
N
G
 
A
A
 
G
R
 
P
R
 
K
Y
 
R
R
 
I
Y
 
F
R
 
R
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
A
H
 
H
L
 
L
E
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
A
H
 
D
A
 
-
D
 
D
K
 
P
E
 
A
G
 
A
P
 
P
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
F
E
|
E
T
 
S
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
F
T
 
G
D
 
P
M
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
C
A
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
E
R
 
E
W
 
F
D
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
T
Y
 
Y
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
x
V
H
|
H
A
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
Y
G
 
G
A
 
P
N
 
R
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
E
G
 
R
M
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
H
-
 
R
A
 
I
E
 
D
L
 
I
A
 
F
M
 
N
G
 
G
T
|
T
F
 
L
S
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
C
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
M
R
 
V
H
 
D
Y
 
A
L
 
V
I
 
R
N
 
S
R
 
Y
A
 
A
S
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
Y
 
F
A
x
S
T
|
T
G
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
A
L
 
F
V
 
L
P
 
K
R
 
T
L
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
T
 
L
R
 
R
-
 
D
-
 
A
L
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
M
 
H
G
 
A
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
M
G
 
R
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
P
T
 
I
G
 
I
P
 
D
S
 
H
A
 
G
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
V
R
 
H
T
 
T
L
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
K
 
D
A
 
M
-
 
L
L
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
Y
G
 
V
I
 
Q
A
 
P
I
 
I
R
 
N
P
 
F
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
R
G
 
G
T
 
T
S
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
T
L
 
P
S
 
S
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
D
D
 
L
A
 
K
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
H
A
 
A
I
 
M

2bwoB 5-aminolevulinate synthase from rhodobacter capsulatus in complex with succinyl-coa (see paper)
35% identity, 89% coverage: 38:384/392 of query aligns to 44:393/399 of 2bwoB

query
sites
2bwoB
G
 
G
G
 
K
R
 
Q
E
 
D
L
 
I
V
 
T
N
 
V
F
 
W
S
 
C
S
 
G
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
V
V
 
V
V
 
L
E
 
A
R
 
A
S
 
M
R
 
H
R
 
E
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
A
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
x
T
R
 
R
L
x
N
V
 
I
T
 
S
G
 
G
H
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
Y
M
 
H
E
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
G
C
 
L
K
 
H
Q
 
Q
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
F
A
 
S
S
|
S
G
x
A
W
x
Y
Q
 
N
C
 
A
N
 
N
A
 
D
S
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
V
L
 
L
W
 
F
G
 
P
A
 
G
E
 
L
P
 
-
L
 
I
V
 
I
F
 
Y
A
x
S
D
 
D
K
x
S
L
 
L
I
 
N
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
M
H
x
I
A
 
E
G
 
G
L
 
I
E
x
K
L
 
R
S
 
N
G
 
A
A
 
G
R
 
P
R
x
K
Y
 
R
R
x
I
Y
 
F
R
 
R
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
A
H
 
H
L
 
L
E
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
A
H
 
D
A
 
-
D
 
D
K
 
P
E
 
A
G
 
A
P
 
P
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
F
E
|
E
T
 
S
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
F
T
 
G
D
 
P
M
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
C
A
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
E
R
 
E
W
 
F
D
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
T
Y
 
Y
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
x
V
H
|
H
A
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
Y
G
 
G
A
 
P
N
 
R
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
E
G
 
R
M
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
H
-
 
R
A
 
I
E
 
D
L
 
I
A
 
F
M
 
N
G
 
G
T
|
T
F
 
L
S
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
C
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
M
R
 
V
H
 
D
Y
 
A
L
 
V
I
 
R
N
 
S
R
 
Y
A
 
A
S
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
Y
x
F
A
 
S
T
 
T
G
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
A
L
 
F
V
 
L
P
 
K
R
 
T
L
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
T
 
L
R
 
R
-
 
D
-
 
A
L
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
M
 
H
G
 
A
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
M
G
 
R
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
P
T
 
I
G
 
I
P
 
D
S
 
H
A
 
G
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
V
R
 
H
T
 
T
L
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
K
 
D
A
 
M
-
 
L
L
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
Y
G
 
V
I
 
Q
A
 
P
I
 
I
R
 
N
P
x
F
P
|
P
T
|
T
V
 
V
P
 
P
P
 
R
G
 
G
T
 
T
S
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
T
L
 
P
S
 
S
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
D
D
 
L
A
 
K
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
H
A
 
A
I
 
M

Sites not aligning to the query:

P18079 5-aminolevulinate synthase; 5-aminolevulinic acid synthase; Delta-ALA synthase; Delta-aminolevulinate synthase; EC 2.3.1.37 from Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003) (see paper)
35% identity, 89% coverage: 38:384/392 of query aligns to 44:393/409 of P18079

query
sites
P18079
G
 
G
G
 
K
R
 
Q
E
 
D
L
 
I
V
 
T
N
 
V
F
 
W
S
 
C
S
 
G
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
V
V
 
V
V
 
L
E
 
A
R
 
A
S
 
M
R
 
H
R
 
E
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
A
Y
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
N
V
 
I
T
 
S
G
 
G
H
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
Y
M
 
H
E
 
R
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
D
C
 
L
K
 
H
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
F
A
 
S
S
 
S
G
 
A
W
 
Y
Q
 
I
C
 
A
N
 
N
A
 
D
S
 
A
V
 
T
L
 
L
P
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
V
L
 
L
W
 
F
G
 
P
A
 
G
E
 
L
P
 
-
L
 
I
V
 
I
F
 
Y
A
x
S
D
 
D
K
 
S
L
 
L
I
 
N
H
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
M
H
 
I
A
 
E
G
 
G
L
 
I
E
 
K
L
 
R
S
 
N
G
 
A
A
 
G
R
 
P
R
x
K
Y
 
R
R
 
I
Y
 
F
R
 
R
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
V
D
 
A
H
 
H
L
 
L
E
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
A
A
 
A
H
 
D
A
 
-
D
 
D
K
 
P
E
 
A
G
 
A
P
 
P
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
F
E
 
E
T
 
S
V
 
V
F
 
Y
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
F
T
 
G
D
 
P
M
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
C
A
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
D
R
 
E
W
 
F
D
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
T
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
V
H
|
H
A
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
M
L
 
Y
G
 
G
A
 
P
N
 
R
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
E
G
 
R
M
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
H
-
 
R
A
 
I
E
 
D
L
 
I
A
 
F
M
 
N
G
 
G
T
|
T
F
 
L
S
 
A
K
|
K
G
 
A
L
 
Y
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
A
C
 
A
S
 
S
A
 
A
R
 
K
L
 
M
R
 
V
H
 
D
Y
 
A
L
 
V
I
 
R
N
 
S
R
 
Y
A
 
A
S
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
Y
 
F
A
x
S
T
|
T
G
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
A
L
 
F
V
 
L
P
 
K
R
 
T
L
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
T
 
L
R
 
R
-
 
D
-
 
A
L
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
M
 
H
G
 
A
R
 
K
R
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
M
G
 
R
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
P
T
 
I
G
 
I
P
 
D
S
 
H
A
 
G
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
P
G
 
V
R
 
H
T
 
T
L
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
K
 
D
A
 
M
-
 
L
L
 
L
E
 
S
D
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
Y
G
 
V
I
 
Q
A
 
P
I
 
I
R
 
N
P
 
F
P
 
P
T
|
T
V
 
V
P
 
P
P
 
R
G
 
G
T
 
T
S
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
T
L
 
P
S
 
S
A
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
D
D
 
L
A
 
K
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
H
A
 
A
I
 
M

Sites not aligning to the query:

Q5W264 4-hydroxy-2,2'-bipyrrole-5-methanol synthase PigH; HBM synthase; Aminotransferase PigH; EC 2.3.2.- from Serratia sp. (strain ATCC 39006) (see paper)
34% identity, 88% coverage: 40:385/392 of query aligns to 285:628/653 of Q5W264

query
sites
Q5W264
R
 
R
E
 
E
L
 
F
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
H
R
 
A
S
 
I
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
A
N
 
S
E
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
T
S
 
N
G
 
T
A
 
G
S
 
C
R
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
A
G
 
G
H
 
S
L
 
N
A
 
V
A
 
L
M
 
H
E
 
L
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
R
K
 
K
I
 
L
A
 
A
R
 
K
C
 
L
K
 
K
Q
 
G
T
 
R
E
 
D
A
 
D
A
 
C
L
 
I
I
 
V
L
 
Y
A
 
P
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
Q
 
S
C
 
A
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
C
L
 
I
P
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
T
D
 
S
K
 
R
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
H
P
 
D
L
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
T
D
 
D
K
 
A
L
 
I
I
 
N
H
 
H
A
 
M
S
 
S
L
 
I
H
 
Q
A
 
D
G
 
G
L
 
C
E
 
K
L
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
Y
 
K
R
 
I
Y
 
Y
R
 
N
H
 
H
D
 
S
D
 
-
L
 
L
D
 
T
H
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
K
L
 
S
L
 
L
K
 
A
A
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
H
E
 
P
G
 
G
P
 
G
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
H
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
M
A
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
R
W
 
Y
D
 
G
A
 
A
F
 
R
L
 
V
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
K
N
 
T
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
S
P
 
E
G
 
H
M
 
F
G
 
N
-
 
M
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
E
M
 
L
G
 
G
T
 
T
F
 
M
S
 
S
K
 
K
G
 
A
L
 
L
G
 
S
S
 
G
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
C
 
G
S
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
V
R
 
V
H
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
R
N
 
F
R
 
Y
A
 
S
S
 
N
G
 
S
L
 
Y
I
 
V
Y
 
F
A
 
A
T
 
A
G
 
T
L
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
P
V
 
V
L
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
V
D
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
M
P
 
L
R
 
R
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
R
R
 
L
T
 
A
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
D
M
 
N
G
 
I
R
 
Y
R
 
Y
L
 
F
R
 
R
D
 
T
G
 
R
L
 
L
R
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
E
P
 
N
S
 
S
A
 
D
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
D
G
 
A
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
F
V
 
F
A
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
R
D
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
M
L
 
F
G
 
C
I
 
Q
A
 
T
I
 
V
R
 
V
P
 
F
P
 
P
T
 
G
V
 
V
P
 
S
P
 
V
G
 
G
T
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
I
A
 
S
L
 
I
S
 
T
A
 
S
V
 
E
H
 
H
S
 
T
D
 
R
A
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
I
I
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Q8GW43 8-amino-7-oxononanoate synthase; AONS; 7-keto-8-amino-pelargonic acid synthase; 7-KAP synthase; KAPA synthase; 8-amino-7-ketopelargonate synthase; Biotin synthase 4; Biotin synthase F; AtbioF; EC 2.3.1.47 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 88% coverage: 40:384/392 of query aligns to 102:455/476 of Q8GW43

query
sites
Q8GW43
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
L
N
 
L
F
 
F
S
 
S
S
 
G
N
 
N
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
T
V
 
I
V
 
S
E
 
N
R
 
A
S
 
A
R
 
A
R
 
N
W
 
A
L
 
V
N
 
K
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
M
G
 
G
S
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
S
R
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
C
G
 
G
H
 
Y
L
 
T
A
 
T
A
 
Y
M
 
H
E
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
K
 
S
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
C
 
L
K
 
K
Q
 
K
T
 
K
E
 
E
A
 
D
A
 
C
L
 
L
I
 
V
L
 
C
A
 
P
S
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
A
C
 
A
N
 
N
A
 
M
S
 
A
V
 
A
L
 
M
P
 
V
A
 
A
L
 
I
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
A
L
 
S
D
 
G
K
 
K
A
 
P
L
 
L
W
 
K
G
 
N
A
 
E
E
 
K
P
 
V
L
 
A
V
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
D
K
 
A
L
 
L
I
 
N
H
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
G
 
N
A
 
V
R
 
E
R
 
V
Y
 
F
R
 
V
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
D
 
C
D
 
D
L
 
M
D
 
Y
H
 
H
L
 
L
E
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
N
H
 
C
A
 
K
D
 
M
K
 
K
E
 
R
G
 
-
P
 
-
R
 
K
F
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
D
T
 
S
V
 
L
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
F
T
 
A
D
 
P
M
 
M
A
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
K
R
 
K
W
 
Y
D
 
G
A
 
F
F
 
L
L
 
L
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
G
T
 
T
G
 
F
V
 
V
L
 
C
G
 
G
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
A
P
 
E
G
 
E
M
 
F
G
 
N
A
 
C
E
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
L
 
L
A
 
C
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
L
S
 
S
K
 
K
G
 
A
L
 
A
G
 
G
S
 
C
F
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
I
A
 
A
C
 
C
S
 
S
A
 
K
R
 
K
L
 
W
R
 
K
H
 
Q
Y
 
L
L
 
I
I
 
Q
N
 
S
R
 
R
A
 
G
S
 
R
G
 
S
L
 
F
I
 
I
Y
 
F
A
 
S
T
 
T
G
 
A
L
 
I
P
 
P
P
 
V
A
 
P
V
 
M
L
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
A
D
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
V
D
 
V
L
 
V
V
 
A
P
 
R
R
 
K
L
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
I
T
 
W
R
 
R
L
 
R
Q
 
K
M
 
A
M
 
I
G
 
W
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
F
L
 
K
R
 
E
A
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
D
T
 
I
G
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
S
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
I
P
 
S
L
 
L
I
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
N
E
 
Q
G
 
E
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
A
A
 
S
K
 
R
A
 
Y
L
 
L
E
 
L
D
 
K
R
 
S
G
 
G
I
 
F
L
 
H
G
 
V
I
 
M
A
 
A
I
 
I
R
 
R
P
 
P
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
N
T
 
S
S
 
C
R
 
R
I
 
L
R
 
R
F
 
V
A
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
T
D
 
T
A
 
E
D
 
D
L
 
V
D
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
T
A
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3a2bA Crystal structure of serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum with substrate l-serine (see paper)
29% identity, 96% coverage: 10:385/392 of query aligns to 13:386/392 of 3a2bA

query
sites
3a2bA
R
 
K
F
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
|
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
x
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8h29A Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with l-threonine (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8h29A

query
sites
8h29A
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8h21A Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with l-alanine (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8h21A

query
sites
8h21A
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8h20A Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with glycine (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8h20A

query
sites
8h20A
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8h1yA Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with l-homoserine (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8h1yA

query
sites
8h1yA
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8h1qA Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with l-serine (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8h1qA

query
sites
8h1qA
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
 
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

8guhA Serine palmitoyltransferase from sphingobacterium multivorum complexed with tris (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:385/392 of query aligns to 5:386/394 of 8guhA

query
sites
8guhA
L
 
L
D
 
G
D
 
E
S
 
K
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
-
 
I
L
 
V
D
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
K
Q
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
Y
R
 
A
V
 
Y
L
 
F
R
 
R
P
 
P
V
 
I
D
 
Q
P
 
S
L
 
K
P
 
Q
A
 
D
G
 
T
R
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
D
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
V
V
 
L
N
 
M
F
 
F
S
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
S
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
R
 
T
H
 
D
P
 
T
E
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
K
R
 
A
S
 
A
R
 
Q
R
 
D
W
 
A
L
 
L
N
 
E
E
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
G
 
G
S
 
C
G
 
A
A
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
L
T
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
I
M
 
H
E
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
K
I
 
L
A
 
S
R
 
A
C
 
Y
K
 
V
Q
 
G
T
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
S
S
 
T
G
|
G
W
x
F
Q
 
Q
C
 
S
N
 
N
A
 
L
S
 
G
V
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
C
L
 
L
L
 
M
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
R
E
 
N
P
 
D
L
 
Y
V
 
I
F
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
E
L
 
R
I
 
D
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
S
E
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
F
A
 
S
R
 
K
R
 
V
Y
 
I
R
 
K
Y
 
Y
R
 
G
H
 
H
D
 
N
D
 
N
L
 
M
D
 
E
H
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
S
H
 
R
A
 
L
D
 
P
K
 
E
E
 
D
G
 
S
P
 
A
R
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
C
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
N
R
 
E
W
 
F
D
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
|
D
E
 
D
A
|
A
H
|
H
A
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
K
G
 
G
F
 
A
G
 
G
L
 
T
S
 
A
P
 
S
G
 
H
M
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
D
A
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
I
M
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
G
 
S
L
 
L
G
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
C
 
G
S
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
V
R
 
I
H
 
D
Y
 
F
L
 
L
I
 
K
N
 
H
R
 
N
A
 
A
S
 
R
G
 
S
L
 
V
I
 
M
Y
 
F
A
 
S
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
V
G
 
A
A
 
S
I
 
T
D
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
I
V
 
I
P
 
Q
R
 
N
L
 
E
E
 
P
G
 
E
E
 
H
R
 
I
T
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
W
M
 
K
M
 
N
G
 
T
R
 
D
R
 
Y
L
 
A
R
 
K
D
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
L
A
 
D
A
 
H
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
G
P
 
A
S
 
T
A
 
E
S
 
S
Q
 
P
I
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
F
L
 
I
G
 
R
D
 
S
E
 
N
G
 
E
R
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
W
V
 
V
A
 
T
K
 
K
A
 
M
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
F
G
 
V
I
 
N
A
 
P
I
 
V
R
 
V
P
 
S
P
 
P
T
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
E
T
 
E
S
 
S
R
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
H
S
 
T
D
 
Y
A
 
D
D
 
Q
L
 
I
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
V

P0AB77 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase; AKB ligase; Glycine acetyltransferase; EC 2.3.1.29 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 88% coverage: 39:384/392 of query aligns to 41:387/398 of P0AB77

query
sites
P0AB77
G
 
G
R
 
S
E
 
H
L
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
F
S
 
C
S
 
A
N
 
N
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
A
R
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
D
V
 
L
V
 
I
E
 
A
R
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
A
W
 
G
L
 
M
N
 
D
E
 
S
Y
 
H
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
M
G
 
A
A
 
S
S
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
I
T
 
C
G
 
G
H
 
T
L
 
Q
A
 
D
A
 
S
M
 
H
E
 
K
A
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
K
 
K
I
 
L
A
 
A
R
 
A
C
 
F
K
 
L
Q
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
L
L
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
C
W
 
F
Q
 
D
C
 
A
N
 
N
A
 
G
S
 
G
V
 
L
L
 
F
P
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
W
 
-
G
 
G
A
 
A
E
 
E
P
 
D
L
 
A
V
 
I
F
 
I
A
 
S
D
 
D
K
 
A
L
 
L
I
 
N
H
|
H
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
I
A
 
D
G
 
G
L
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
C
G
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
R
 
A
H
 
N
D
 
N
D
 
D
L
 
M
D
 
Q
H
 
E
L
 
L
E
 
E
S
 
A
L
 
R
L
 
L
K
 
K
A
 
-
H
 
E
A
 
A
D
 
R
K
 
E
E
 
A
G
 
G
P
 
A
R
 
R
-
 
H
-
 
V
F
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
T
E
 
D
T
 
G
V
 
V
F
 
F
S
|
S
M
 
M
D
 
D
G
 
G
D
 
V
V
 
I
T
 
A
D
 
N
M
 
L
A
 
K
A
 
G
L
 
V
A
 
C
A
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
K
W
 
Y
D
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
V
Y
 
M
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
S
H
 
H
A
 
A
T
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
V
G
 
G
A
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
H
-
 
E
L
 
Y
S
 
C
P
 
D
G
 
V
M
 
M
G
 
G
-
 
R
A
 
V
E
 
D
L
 
I
A
 
I
M
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
S
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
G
S
 
A
F
 
S
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
V
 
T
A
 
A
C
 
A
S
 
R
A
 
K
R
 
E
L
 
V
R
 
V
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
I
 
R
N
 
Q
R
 
R
A
 
S
S
 
R
G
 
P
L
 
Y
I
 
L
Y
 
F
A
 
S
T
 
N
G
 
S
L
 
L
P
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
A
I
 
S
D
 
I
A
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
E
L
 
M
V
 
V
P
 
E
R
 
A
L
 
G
E
 
S
G
 
E
E
 
L
R
 
R
T
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
W
M
 
A
M
 
N
G
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
F
R
 
R
D
 
E
G
 
Q
L
 
M
R
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
T
T
 
L
G
 
A
P
 
G
S
 
A
A
 
D
S
 
H
Q
 
A
I
 
I
V
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
D
E
 
A
G
 
V
R
 
V
T
 
A
L
 
Q
A
 
K
V
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
E
L
 
L
E
 
Q
D
 
K
R
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
Y
G
 
V
I
 
T
A
 
G
I
 
F
R
 
F
P
 
Y
P
 
P
T
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
K
G
 
G
T
 
Q
S
 
A
R
 
R
I
 
I
R
|
R
F
 
T
A
 
Q
L
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
A
H
 
H
S
 
T
D
 
P
A
 
E
D
 
Q
L
 
I
D
 
T
R
 
R
L
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
A
I
 
F

Query Sequence

>WP_011385138.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385138.1
MKGLDDSIGRFLDGLDQAGRKRVLRPVDPLPAGRVRVGGRELVNFSSNDYLGLSRHPEVV
ERSRRWLNEYGAGSGASRLVTGHLAAMEALEAKIARCKQTEAALILASGWQCNASVLPAL
LDKALWGAEPLVFADKLIHASLHAGLELSGARRYRYRHDDLDHLESLLKAHADKEGPRFI
VTETVFSMDGDVTDMAALAALASRWDAFLYVDEAHATGVLGANGFGLSPGMGAELAMGTF
SKGLGSFGAYVACSARLRHYLINRASGLIYATGLPPAVLGAIDAALDLVPRLEGERTRLQ
MMGRRLRDGLRAAGLDTGPSASQIVPLILGDEGRTLAVAKALEDRGILGIAIRPPTVPPG
TSRIRFALSAVHSDADLDRLLAAILDAVEATP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory