SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011385159.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385159.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7arcG Cryo-em structure of polytomella complex-i (peripheral arm) (see paper)
55% identity, 97% coverage: 3:673/690 of query aligns to 7:678/682 of 7arcG

query
sites
7arcG
K
 
E
L
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
E
E
 
A
I
 
V
E
 
V
V
 
V
E
 
P
A
 
K
G
 
N
T
 
F
T
 
T
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
D
L
 
A
L
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
D
I
 
V
P
 
P
R
|
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
K
 
K
M
 
A
P
 
P
K
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
M
 
F
P
 
P
V
 
A
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
V
V
 
I
R
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
I
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
A
 
I
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
R
N
 
S
R
 
R
C
 
F
K
 
I
E
 
E
G
 
Y
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
A
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
M
 
S
M
 
M
T
 
N
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
T
 
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
T
S
 
H
E
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
P
 
S
V
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
R
H
 
D
L
 
S
E
 
E
I
 
V
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
I
G
 
E
A
 
K
A
 
L
V
 
H
S
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
T
 
L
N
 
S
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
T
Y
 
A
R
 
R
S
 
S
W
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
G
T
 
T
E
 
E
S
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
S
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
K
V
 
V
D
 
D
T
 
C
R
 
R
G
 
G
N
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
T
P
 
P
R
 
R
V
 
L
A
 
N
E
 
D
D
 
A
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
K
S
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
C
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
|
K
R
 
R
Q
|
Q
R
|
R
L
 
L
D
x
N
K
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
G
D
 
A
G
 
K
K
 
G
L
 
L
V
 
E
P
 
N
A
 
A
T
 
T
W
 
W
N
 
S
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
T
K
 
A
V
 
I
K
 
A
A
 
G
A
 
A
-
 
K
G
 
G
T
 
N
K
 
E
I
 
L
A
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
K
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
S
M
 
M
V
 
I
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
N
A
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
A
 
N
I
 
L
D
 
I
C
 
H
R
 
E
Q
 
D
D
 
G
G
 
S
A
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
S
A
 
A
S
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
A
N
 
N
S
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
F
E
 
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
F
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
R
 
V
W
 
F
Q
 
L
K
 
D
G
 
G
G
 
A
F
 
-
K
 
K
V
 
V
A
 
G
R
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
E
K
 
K
G
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
K
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
A
D
 
D
A
 
V
S
 
A
I
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
S
I
 
L
A
 
A
E
 
S
G
 
G
S
 
K
H
 
G
P
 
A
F
 
F
F
 
F
E
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
N
 
G
A
 
A
K
 
K
K
 
N
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
A
 
V
L
 
L
S
 
R
R
 
R
A
 
D
D
 
D
G
 
R
A
 
E
V
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
K
L
 
T
A
 
V
R
 
N
K
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
F
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
D
A
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
G
 
S
Q
 
A
G
 
S
W
 
A
R
 
R
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
T
H
 
N
K
 
P
G
 
V
D
 
P
V
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
D
V
 
F
-
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
E
A
 
I
L
 
P
G
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
H
 
H
G
|
G
D
 
D
A
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
S
T
 
L
F
 
F
V
 
A
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
Q
 
T
T
 
T
R
 
R
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
P
P
 
V
P
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
G
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
Q
K
 
P
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
V
S
 
A
P
 
P
V
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
E
I
 
I
G
 
G
S
 
K
V
 
A
T
 
E
P
 
S
A
 
A
A
 
L
W
 
W
-
 
L
-
 
N
G
 
G
A
 
Q
A
 
Y
F
 
F
G
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
K
G
 
A
S
 
A
L
 
R
G
 
S
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
L
V
 
A
S
 
T
N
 
N
I
 
I
D
 
S
N
 
N
F
 
Y
Y
 
Y
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
A
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
R
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
C
T
 
T
A
 
A

7qsoG Bovine complex i in lipid nanodisc, state 3 (slack) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 6:678/690 of query aligns to 9:690/700 of 7qsoG

query
sites
7qsoG
I
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
E
 
S
I
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
E
L
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
E
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
|
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
K
 
K
M
 
A
P
 
P
K
 
K
P
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
M
E
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
K
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
A
 
K
V
 
T
R
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
|
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
M
A
 
M
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
R
N
 
S
R
 
R
C
 
F
K
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
M
 
M
T
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
T
|
T
R
|
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
F
 
F
I
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
T
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
M
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
I
G
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
F
S
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
|
G
A
|
A
L
 
L
T
 
T
N
 
S
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
T
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
T
K
 
R
K
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
V
V
 
V
D
 
S
T
 
T
R
 
R
G
 
T
N
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
M
A
 
H
E
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
I
S
 
S
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
K
 
E
P
 
P
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
K
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
L
V
 
T
P
 
H
A
 
T
T
 
T
W
 
W
N
 
E
E
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
A
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
M
V
 
L
K
 
Q
A
 
S
-
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
G
Q
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
A
M
 
L
V
 
I
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
D
S
 
S
Q
 
D
A
 
T
I
 
L
D
 
-
C
 
C
R
 
T
Q
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
T
-
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
G
L
 
T
D
 
D
A
 
-
S
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
S
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
N
 
N
S
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
F
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
S
W
 
W
Q
 
L
K
 
H
G
 
N
G
 
D
F
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
S
K
 
P
G
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
E
 
D
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
S
A
 
P
S
 
K
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
S
G
 
G
S
 
S
H
 
H
P
 
P
F
 
F
F
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
N
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
M
L
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
A
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
G
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
L
 
I
A
 
R
D
 
T
A
 
S
A
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
T
K
 
G
D
 
D
G
 
-
W
 
W
N
 
K
G
 
V
F
 
M
N
 
N
V
 
I
L
 
L
H
 
H
T
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
V
D
 
E
G
 
A
A
 
I
H
 
Q
K
 
K
G
 
N
D
 
P
V
 
P
Q
 
K
V
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
 
I
-
 
T
E
 
R
V
 
Q
D
 
D
M
 
L
K
 
P
A
 
K
L
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
C
F
 
F
V
 
I
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
H
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
P
R
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
T
R
 
K
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
M
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
L
 
L
K
 
D
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
E
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
E
K
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
N
F
 
L
A
 
V
A
 
R
I
 
Y
G
 
D
S
 
D
V
 
V
T
 
E
P
 
G
A
 
A
A
 
N
W
 
Y
G
 
F
A
 
Q
A
 
Q
F
 
A
G
 
S
A
 
E
E
 
L
G
 
S
S
 
K
L
 
L
G
 
V
D
 
N
G
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
T
I
 
I
D
 
K
N
 
D
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
S
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
C
T
 
V
A
 
K
A
 
A
F
 
V
G
 
T
G
 
E
G
 
G

7v2cM Active state complex i from q10 dataset (see paper)
53% identity, 98% coverage: 6:678/690 of query aligns to 8:689/690 of 7v2cM

query
sites
7v2cM
I
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
E
 
S
I
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
E
L
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
E
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
K
 
K
M
 
A
P
 
P
K
 
K
P
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
M
E
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
K
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
A
 
K
V
 
S
R
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
M
A
 
M
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
R
N
 
S
R
 
R
C
 
F
K
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
M
 
M
T
 
T
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
 
Q
C
|
C
T
|
T
R
|
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
F
 
F
I
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
T
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
M
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
I
G
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
F
S
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
I
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
T
 
T
N
 
S
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
T
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
T
K
 
R
K
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
V
V
 
V
D
 
S
T
 
T
R
 
R
G
 
T
N
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
M
A
 
H
E
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
I
S
 
S
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
K
 
Q
P
 
P
Y
 
M
V
 
I
R
 
R
K
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
L
V
 
T
P
 
Y
A
 
T
T
 
T
W
 
W
N
 
E
E
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
A
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
M
V
 
L
K
 
Q
A
 
S
-
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
G
Q
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
D
S
 
S
Q
 
D
A
 
S
I
 
L
D
 
-
C
 
C
R
 
T
Q
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
T
-
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
G
L
 
T
D
 
D
A
 
-
S
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
S
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
N
 
N
S
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
F
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
S
W
 
W
Q
 
L
K
 
H
G
 
N
G
 
D
F
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
S
K
 
P
G
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
E
 
D
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
S
A
 
P
S
 
K
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
S
G
 
G
S
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
F
F
 
S
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
M
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
A
I
 
I
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
G
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
N
L
 
I
A
 
R
D
 
L
A
 
S
A
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
T
K
 
G
D
 
D
G
 
-
W
 
W
N
 
K
G
 
V
F
 
M
N
 
N
V
 
I
L
 
L
H
 
H
T
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
V
D
 
E
G
 
A
A
 
I
H
 
R
K
 
K
G
 
N
D
 
P
V
 
P
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
 
I
-
 
T
E
 
R
V
 
Q
D
 
D
M
 
L
K
 
P
A
 
K
L
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
C
F
 
F
V
 
I
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
H
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
P
R
 
M
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
T
R
 
K
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
M
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
L
 
L
K
 
D
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
E
K
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
N
F
 
L
A
 
V
A
 
R
I
 
Y
G
 
D
S
 
D
V
 
V
T
 
E
P
 
G
A
 
A
A
 
N
W
 
Y
G
 
F
A
 
Q
A
 
Q
F
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
L
G
 
S
S
 
K
L
 
L
G
 
V
D
 
N
G
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
T
I
 
I
D
 
K
N
 
D
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
S
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
C
T
 
V
A
 
K
A
 
A
F
 
V
G
 
T
G
 
E
G
 
G

5gupG structure of mammalian respiratory supercomplex I1III2IV1 (see paper)
53% identity, 97% coverage: 6:674/690 of query aligns to 7:670/673 of 5gupG

query
sites
5gupG
I
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
E
 
S
I
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
E
L
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
E
 
Q
I
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
C
|
C
R
 
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
E
K
 
K
M
 
A
P
 
P
K
 
K
P
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
M
E
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
K
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
A
 
K
V
 
S
R
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
M
A
 
M
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
R
N
 
S
R
 
R
C
 
F
K
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
M
 
M
T
 
T
R
|
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
Q
C
|
C
T
|
T
R
 
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
F
 
F
I
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
T
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
M
E
 
Q
I
x
V
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
I
G
 
E
A
 
K
A
 
M
V
 
F
S
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
I
C
|
C
P
|
P
V
 
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
T
 
T
N
 
S
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
T
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
T
K
 
R
K
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
V
V
 
V
D
 
S
T
 
T
R
 
R
G
 
T
N
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
M
A
 
H
E
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
I
S
 
S
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
Y
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
|
K
R
|
R
Q
|
Q
R
|
R
L
 
L
D
 
T
K
 
Q
P
 
P
Y
 
M
V
 
I
R
|
R
K
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
K
x
L
L
|
L
V
 
T
P
x
Y
A
 
T
T
 
T
W
 
W
N
 
E
E
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
A
 
R
I
 
V
A
 
A
A
 
G
K
 
M
V
 
L
K
 
Q
A
 
S
-
 
F
A
 
Q
G
 
G
T
 
N
K
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
G
Q
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
E
T
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
D
S
 
S
Q
 
D
A
 
S
I
 
L
D
 
-
C
 
C
R
 
T
Q
 
E
D
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
T
-
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
G
L
 
T
D
 
D
A
 
-
S
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
S
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
N
 
N
S
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
F
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
S
W
 
W
Q
 
L
K
 
H
G
 
N
G
 
D
F
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
S
K
 
P
G
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
K
 
R
Y
 
Y
E
 
D
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
S
A
 
P
S
 
K
I
 
I
L
 
L
K
 
Q
A
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
S
G
 
G
S
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
F
F
 
S
E
 
Q
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
M
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
G
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
A
A
 
V
R
 
S
K
 
N
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
F
 
-
N
 
N
V
 
I
-
 
R
L
 
L
H
 
S
T
 
S
A
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
V
D
 
E
G
 
A
A
 
I
H
 
R
K
 
K
G
 
N
D
 
P
V
 
P
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
C
-
 
I
-
 
T
E
 
R
V
 
Q
D
 
D
M
 
L
K
 
P
A
 
K
L
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
C
F
 
F
V
 
I
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
H
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
P
R
 
M
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
T
R
 
K
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
M
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
T
L
 
L
K
 
D
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
E
K
 
E
A
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
N
F
 
L
A
 
V
A
 
R
I
 
Y
G
 
D
S
 
D
V
 
V
T
 
E
P
 
G
A
 
A
A
 
N
W
 
Y
G
 
F
A
 
Q
A
 
Q
F
 
A
G
 
N
A
 
E
E
 
L
G
 
S
S
 
K
L
 
L
G
 
V
D
 
N
G
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
T
I
 
I
D
 
K
N
 
D
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
S
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
C
T
 
V
A
 
K
A
 
A

8eszS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 (see paper)
55% identity, 97% coverage: 3:674/690 of query aligns to 5:671/683 of 8eszS1

query
sites
8eszS1
K
 
E
L
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
D
R
 
I
E
 
P
I
 
V
E
 
Q
V
 
V
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
V
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
D
 
A
L
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
V
A
|
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
K
 
K
M
 
S
P
 
P
K
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
M
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
M
E
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
R
V
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
D
A
 
L
V
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
M
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
R
N
 
S
R
 
R
C
 
F
K
 
T
E
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
T
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
D
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
M
 
M
T
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
x
H
C
|
C
T
|
T
R
|
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
D
V
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
T
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
M
E
 
Q
I
|
I
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
V
G
 
E
A
 
K
A
 
L
V
 
F
S
 
L
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
S
Y
 
F
T
 
V
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
I
K
 
R
K
 
K
T
 
V
E
 
S
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
V
V
 
V
D
 
S
T
 
T
R
 
R
G
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
I
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
E
A
 
N
E
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
S
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
V
K
 
A
P
 
P
Y
 
M
V
 
V
R
 
R
-
 
M
K
 
P
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
L
V
 
Q
P
 
A
A
 
V
T
 
E
W
 
W
N
 
E
E
 
G
A
 
A
F
 
L
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
G
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
E
 
E
T
 
A
M
 
Q
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
Q
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
A
C
 
T
R
 
E
Q
 
Q
D
 
G
G
 
F
A
 
I
K
 
A
L
 
G
D
 
G
A
 
T
S
 
D
V
 
N
R
 
R
A
 
A
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
L
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
Y
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
V
N
 
N
A
 
T
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
R
 
A
W
 
Y
Q
 
V
K
 
H
G
 
N
G
 
E
F
 
L
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
R
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
P
K
 
K
G
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
S
Y
 
Y
K
 
D
Y
 
H
E
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
G
D
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
A
I
 
L
L
 
V
K
 
K
A
 
D
I
 
V
A
 
C
E
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
H
P
 
A
F
 
F
F
 
S
E
 
K
V
 
V
L
 
L
K
 
E
N
 
G
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
I
G
 
G
Q
 
A
G
 
D
A
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
 
H
G
 
A
L
 
T
A
 
V
R
 
A
K
 
E
L
 
Y
A
 
C
D
 
K
A
 
K
A
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
K
K
 
K
D
 
P
G
 
N
W
 
W
N
 
N
G
 
P
F
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
L
H
 
Q
T
 
T
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
V
G
 
G
F
 
Y
V
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
A
D
 
Q
G
 
T
A
 
A
H
 
V
K
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
P
Q
 
K
V
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
N
A
 
A
D
 
D
-
 
A
-
 
G
E
 
K
V
 
V
D
 
T
M
 
R
K
 
E
A
 
Q
L
 
L
-
 
P
G
 
K
E
 
D
A
 
C
F
 
F
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
S
R
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
A
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
Q
A
 
G
T
 
I
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
T
 
T
R
 
L
L
 
P
A
 
G
V
 
V
F
 
S
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
S
 
N
L
 
L
K
 
D
A
 
E
V
 
L
R
 
R
E
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
E
K
 
D
A
 
V
S
 
A
P
 
P
V
 
H
F
 
L
A
 
T
A
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
Q
V
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
A
A
 
G
W
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
D
A
 
A
E
 
G
G
 
K
S
 
S
L
 
I
G
 
G
D
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
I
-
 
D
-
 
I
-
 
K
V
 
L
S
 
K
N
 
E
I
 
L
D
 
R
N
 
D
F
 
Y
Y
 
F
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
A
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
A
S
 
S
K
 
P
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
C
T
 
I
A
 
S
A
 
A

7b0nG 3.7-angstrom structure of Yarrowia lipolytica complex I with an R121M mutation in NUCM. (see paper)
51% identity, 99% coverage: 3:686/690 of query aligns to 4:690/694 of 7b0nG

query
sites
7b0nG
K
 
E
L
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
H
E
 
K
I
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
A
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
E
L
 
K
L
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
F
 
Y
C
|
C
Y
 
Y
H
 
H
E
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
R
M
 
A
P
 
P
K
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
V
 
V
G
 
A
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
K
 
R
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
K
K
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
N
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
M
L
 
M
L
 
L
L
 
Q
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
V
C
|
C
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
M
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
R
D
 
D
K
 
R
N
 
G
R
 
R
C
 
F
K
 
T
E
 
E
-
 
I
-
 
T
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
S
V
 
T
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
M
 
S
M
 
M
T
 
N
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
x
H
C
|
C
T
|
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
A
S
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
A
P
 
P
V
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
M
E
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
L
G
 
E
A
 
K
A
 
N
V
 
L
S
 
N
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
R
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
K
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
I
D
 
D
T
 
S
R
 
K
G
 
G
N
 
V
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
H
E
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
I
S
 
N
D
 
D
R
 
K
S
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
K
 
T
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
R
 
R
K
 
V
D
 
G
G
 
D
K
 
K
L
 
F
V
 
V
P
 
N
A
 
A
T
 
T
W
 
W
N
 
D
E
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
A
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
A
V
 
Y
K
 
Q
-
 
Q
-
 
K
-
 
A
A
 
P
A
 
K
G
 
G
T
 
D
K
 
E
I
 
F
A
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
A
Q
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
V
E
 
E
T
 
S
M
 
M
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
Q
 
E
A
 
N
I
 
T
D
 
T
C
 
T
-
 
D
R
 
T
Q
 
P
D
 
N
G
 
G
A
 
N
K
 
S
L
 
A
D
 
P
A
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
I
S
 
T
V
 
F
R
 
R
A
 
S
S
 
N
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
N
 
N
S
 
S
T
 
S
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
T
N
 
N
P
 
P
R
 
R
K
 
R
E
 
E
N
 
A
P
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
A
W
 
W
Q
 
L
K
 
R
G
 
Q
G
 
E
F
 
L
K
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
P
K
 
T
G
 
L
D
 
D
L
 
A
T
 
T
Y
 
F
K
 
D
Y
 
V
E
 
A
H
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
T
A
 
H
S
 
A
I
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
K
I
 
A
A
 
L
E
 
S
G
 
G
S
 
E
H
 
-
P
 
-
F
 
F
F
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
A
K
 
K
K
 
N
P
 
P
A
 
L
L
 
I
I
 
I
L
 
V
G
 
G
Q
 
S
G
 
G
A
 
I
L
 
T
S
 
D
R
 
R
A
 
E
D
 
D
-
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
F
I
 
F
L
 
N
G
 
T
L
 
I
A
 
G
R
 
K
K
 
F
L
 
V
A
 
E
D
 
S
A
 
T
A
 
P
G
 
S
L
 
V
V
 
L
K
 
N
D
 
E
G
 
N
W
 
W
N
 
N
G
 
G
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
S
A
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
T
P
 
P
G
 
S
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
E
A
 
A
H
 
S
K
 
K
G
 
T
D
 
T
V
 
P
Q
 
K
V
 
M
V
 
V
F
 
W
L
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
A
M
 
A
K
 
S
A
 
D
L
 
I
-
 
P
G
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
H
 
N
G
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
R
 
F
A
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
G
T
 
T
F
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
S
Q
 
Q
Q
 
I
T
 
S
R
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
T
F
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
G
A
 
A
K
 
R
E
 
E
D
 
D
W
 
W
R
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
D
 
E
S
 
D
L
 
A
K
 
Y
A
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
S
F
 
L
A
 
V
A
 
R
I
 
Y
G
 
D
S
 
L
V
 
V
T
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
V
W
 
F
G
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
A
 
S
A
 
L
F
 
V
G
 
G
A
 
P
E
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
V
-
 
T
-
 
P
G
 
S
D
 
S
G
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
E
N
 
T
I
 
I
D
 
E
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
S
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
S
S
 
S
K
 
P
T
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
K
C
 
S
T
 
S
A
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
-
G
 
-
G
 
-
C
 
-
N
 
N
H
 
K
K
 
D
H
 
N
K
 
K
K
 
K
T
 
N

7zm7A Cryoem structure of mitochondrial complex i from chaetomium thermophilum (inhibited by ddm) (see paper)
53% identity, 97% coverage: 3:674/690 of query aligns to 4:683/711 of 7zm7A

query
sites
7zm7A
K
 
E
L
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
K
E
 
K
I
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
A
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
D
 
E
L
 
K
L
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
V
I
 
V
P
 
P
R
|
R
F
 
Y
C
|
C
Y
|
Y
H
 
H
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
N
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
E
K
 
R
M
 
S
P
 
P
K
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
M
 
W
P
 
P
V
 
V
G
 
Q
E
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
P
A
 
L
V
 
T
R
 
H
K
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
M
 
M
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
Q
|
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
D
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
M
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
A
D
 
D
K
 
R
N
 
G
R
 
R
C
 
F
K
 
H
E
 
E
-
 
I
-
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
E
D
 
D
K
 
K
D
 
N
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
K
T
 
T
M
 
S
M
 
M
T
 
N
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
T
|
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
M
S
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
A
P
 
P
V
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
N
H
 
D
L
 
L
E
 
Q
I
|
I
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
V
 
L
G
 
E
A
 
K
A
 
N
V
 
L
S
 
D
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
|
L
T
 
T
N
 
S
K
 
K
P
 
P
A
 
Y
S
 
A
Y
 
F
T
 
R
Y
 
A
R
 
R
S
 
P
W
 
W
E
 
E
L
 
L
K
 
K
K
 
R
T
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
D
A
 
V
M
 
L
D
 
D
A
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
N
 
L
E
 
E
V
 
V
I
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
L
A
 
N
E
 
D
D
 
D
V
 
V
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
W
L
 
I
S
 
N
D
 
D
R
 
K
S
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
A
C
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
T
K
 
M
P
 
P
Y
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
F
V
 
E
P
 
P
A
 
A
T
 
T
W
 
W
N
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
L
V
 
T
A
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
H
K
 
A
V
 
Y
K
 
Q
A
 
T
A
 
L
G
 
A
T
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
E
I
 
F
A
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
Q
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
V
E
 
E
T
 
S
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
M
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
A
A
 
N
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
Q
 
E
-
 
N