SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011385160.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385160.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7aqrF Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (peripheral arm) (see paper)
74% identity, 96% coverage: 2:409/427 of query aligns to 8:415/434 of 7aqrF

query
sites
7aqrF
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
H
 
H
D
 
D
W
 
P
R
 
F
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
M
A
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
H
G
 
R
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
T
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
M
 
M
K
 
K
N
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
T
 
V
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
 
E
G
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
G
F
 
V
A
 
G
I
 
M
G
 
R
A
 
A
H
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
Y
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
R
E
 
L
H
 
N
L
 
L
N
 
E
I
 
K
A
 
A
I
 
R
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
H
 
H
R
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
|
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
N
V
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
x
T
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
P
A
 
E
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
K
N
 
N
N
 
N
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
C
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
K
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
R
H
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
N
Q
 
I
C
 
C
E
 
E
E
 
D
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
K
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
V
V
 
V
R
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
G
W
 
W
M
 
L
S
 
W
R
 
M
M
 
I
M
 
M
G
 
E
R
 
R
M
 
M
V
 
K
T
 
V
G
 
G
D
 
N
A
 
A
E
 
K
L
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
S
 
T
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F

7arcF Cryo-em structure of polytomella complex-i (peripheral arm) (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 9:424/430 of 7arcF

query
sites
7arcF
L
 
L
R
 
R
D
 
D
S
 
Q
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
P
R
 
Y
L
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
M
T
 
T
K
 
K
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
G
K
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
I
E
 
D
E
 
Q
M
 
I
K
 
K
N
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
A
T
 
S
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
T
 
V
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
G
D
|
D
E
|
E
G
x
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
H
D
 
E
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
G
F
 
T
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
R
 
N
E
 
E
A
 
R
E
 
K
H
 
A
L
 
V
N
 
E
I
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
V
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
L
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
M
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
x
T
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
P
A
 
E
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
K
N
 
N
N
 
N
T
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
R
P
 
P
C
 
V
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
R
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
M
 
L
L
 
L
T
 
P
K
 
K
Q
 
K
Q
 
M
C
 
C
E
 
D
E
 
D
V
 
V
T
 
I
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
T
M
 
A
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
N
K
 
K
S
 
D
T
 
T
D
 
D
L
 
V
V
 
I
R
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
G
W
 
W
M
 
L
S
 
Y
R
 
D
M
 
I
M
 
M
G
 
S
R
 
R
M
 
M
V
 
R
T
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
T
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
S
E
 
E
M
 
M
E
 
E
R
 
D
R
 
R
I
 
I

Q91YT0 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; NDUFV1; Complex I-51kD; CI-51kD; NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit; EC 7.1.1.2 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 35:450/464 of Q91YT0

query
sites
Q91YT0
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
R
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
M
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
D
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
A
N
 
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
H
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
D
R
 
R
I
 
M

Sites not aligning to the query:

8b9zF Drosophila melanogaster complex i in the active state (dm1) (see paper)
71% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 17:432/441 of 8b9zF

query
sites
8b9zF
L
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
A
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
M
 
I
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
V
 
M
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
G
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
M
N
 
Q
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
M
H
 
H
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
 
E
E
|
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
T
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
V
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
T
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
R
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
R
H
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
N
Q
 
V
C
 
C
E
 
D
E
 
D
V
 
V
T
 
I
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
I
A
 
A
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
S
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
K
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
S
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
I
M
 
M
G
 
T
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
|
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
I
E
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
M

5lnk1 Entire ovine respiratory complex i (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 9:424/432 of 5lnk1

query
sites
5lnk1
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
V
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
|
E
G
|
G
E
 
E
P
|
P
G
|
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
I
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
|
V
N
x
A
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
x
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
A
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
I
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
 
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
|
I
C
|
C
A
 
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
M

6zk91 Peripheral domain of open complex i during turnover (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 7:422/430 of 6zk91

query
sites
6zk91
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
V
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
|
G
A
|
A
G
 
G
F
|
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
|
E
G
 
G
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
I
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
|
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
|
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
|
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
x
A
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
A
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
I
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
|
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
M

8eswV1 NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A (see paper)
71% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 15:430/439 of 8eswV1

query
sites
8eswV1
L
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
L
A
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
A
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
M
 
I
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
V
 
M
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
G
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
|
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
x
Y
R
x
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
M
N
x
Q
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
x
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
M
H
 
H
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
|
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
T
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
V
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
T
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
R
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
R
H
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
N
Q
 
V
C
 
C
E
 
D
E
 
D
V
 
V
T
 
I
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
I
A
 
A
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
S
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
K
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
S
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
I
M
 
M
G
 
T
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
M
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
|
I
C
|
C
A
|
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
I
E
 
E
R
 
K
R
 
R
I
 
M

P25708 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; NDUFV1; Complex I-51kD; CI-51kD; NADH dehydrogenase flavoprotein 1; NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit; EC 7.1.1.2 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 35:450/464 of P25708

query
sites
P25708
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
V
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
I
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
A
N
 
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
A
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
I
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
M

7dgq8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 4:419/427 of 7dgq8

query
sites
7dgq8
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
V
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
|
D
E
|
E
G
|
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
I
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
x
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
x
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
x
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
x
R
E
 
E
A
 
A
R
x
Y
A
x
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
x
F
V
 
V
H
 
V
R
|
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
|
C
G
|
G
E
 
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
x
A
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
A
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
I
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
|
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
M

P49821 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; NDUFV1; Complex I-51kD; CI-51kD; NADH dehydrogenase flavoprotein 1; NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit; EC 7.1.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
71% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 35:450/464 of P49821

query
sites
P49821
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
S
M
 
L
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
I
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
N
A
 
A
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
L
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
A
N
 
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
T
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
G
L
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
E
N
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
L
F
 
F
C
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
H
 
H
V
 
V
N
 
N
T
 
H
P
 
P
C
 
C
N
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
E
K
 
K
H
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
W
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
S
 
S
V
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
I
T
 
P
K
 
K
Q
 
S
Q
 
V
C
 
C
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
L
M
 
M
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
Q
M
 
A
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
K
 
R
S
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
I
 
I
H
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
I
R
 
E
F
 
F
Y
 
Y
W
 
K
H
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
S
 
N
R
 
K
M
 
V
M
 
M
G
 
A
R
 
R
M
 
F
V
 
V
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
R
L
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
L
E
 
W
E
 
E
I
 
I
S
 
S
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
H
F
 
F
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
E
 
E
R
 
E
R
 
R
I
 
M

7v2cA Active state complex i from q10 dataset (see paper)
72% identity, 97% coverage: 2:417/427 of query aligns to 10:425/433 of 7v2cA

query
sites
7v2cA
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
R
H
 
H
D
 
D
W
 
W
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
A
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
D
W
 
W
N
 
Y
G
 
K
T
 
T
K
 
K
D
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
P
D
 
D
W
 
W
I
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
M
 
V
K
 
K
N
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
N
K
 
K
T
 
P
E
 
S
G
 
D
P
 
G
R
 
R
P
 
P
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
V
N
|
N
A
 
A
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
I
M
 
I
R
 
R
F
 
H
D
 
D
P
 
P
H
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
G
S
 
G
F
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
E
 
E
A
 
A
E
 
S
H
 
N
L
 
L
N
 
Q
I
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
K
N
 
N
A
 
A
C
 
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
Y
D
 
D
C
 
F
E
 
D
V
 
V
Y
 
F
V
 
V
H
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
V
N
 
A
N
|
N
V
 
V
E
 
E
S
 
T
I
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
G
A
 
A
W
 
W
F
 
F
S
 
A
G
 
S
L
 
F