SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011385177.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385177.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
24% identity, 97% coverage: 3:412/422 of query aligns to 4:356/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
|
V
V
x
I
G
 
G
T
 
S
A
 
S
S
 
V
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
V
|
V
D
x
E
R
x
K
R
 
Q
E
 
S
G
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
-
E
|
E
T
x
A
S
|
S
F
 
K
A
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
I
 
L
S
 
G
P
 
V
C
 
A
H
 
Y
A
 
-
E
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
S
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
L
K
 
F
W
 
E
L
 
L
G
 
A
R
 
R
E
 
E
D
 
S
A
 
R
P
 
A
L
 
I
L
 
F
F
 
-
R
 
-
W
 
-
N
 
-
R
 
-
W
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
W
 
A
A
 
A
W
 
V
G
 
-
L
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
Y
Q
 
E
V
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
Y
H
 
R
V
 
I
Y
 
A
R
 
Q
D
 
N
G
 
E
A
 
D
E
 
E
F
 
K
E
 
E
H
 
R
A
 
I
C
 
L
R
 
H
A
 
I
A
 
M
E
 
D
V
 
W
M
 
Q
I
 
Q
R
 
K
H
 
T
G
 
G
L
 
E
R
 
D
R
 
S
L
 
Y
P
 
F
R
 
L
T
 
T
P
 
G
A
 
D
E
 
H
C
 
V
T
 
R
A
 
E
I
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
S
A
 
E
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
S
L
 
I
A
 
I
G
 
G
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
T
 
Y
P
 
P
D
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
H
G
 
V
D
 
I
A
 
A
H
 
P
K
 
E
F
 
L
T
 
T
R
 
K
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
H
L
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
I
K
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
D
F
 
I
R
 
Y
W
 
E
N
 
Q
V
 
T
P
 
E
I
x
V
Q
 
F
S
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
I
D
 
E
G
 
N
D
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
I
T
 
T
S
 
S
D
 
E
G
 
G
T
 
I
I
 
V
R
 
T
A
 
C
E
 
E
S
 
K
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
G
G
|
G
C
 
S
D
x
W
S
 
S
P
 
T
L
 
K
L
 
L
A
 
L
R
 
S
P
 
Y
L
 
F
G
 
H
L
 
R
R
 
D
L
 
W
P
 
G
I
 
T
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
V
V
 
V
T
 
A
V
 
V
P
 
R
V
 
S
D
 
R
N
 
K
H
 
Q
A
 
L
-
 
L
G
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
F
S
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
Q
E
 
E
H
 
R
K
 
F
M
 
Y
V
 
I
Y
 
T
S
 
P
R
 
K
L
 
R
G
 
G
D
 
G
R
 
R
L
 
Y
R
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
M
 
P
A
 
H
G
 
T
Y
 
F
D
 
N
R
 
K
M
 
T
P
 
V
N
 
Q
P
 
P
V
 
E
R
 
S
N
 
I
R
 
T
L
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
R
A
 
A
R
 
Y
R
 
T
L
 
I
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
K
D
 
E
F
 
A
D
 
E
R
 
W
A
 
E
E
 
S
P
 
T
W
 
W
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
|
P
V
 
Q
T
 
S
P
 
N
D
 
H
S
 
E
V
 
A
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
G
 
G
A
 
E
-
 
H
T
 
E
P
 
E
L
 
I
R
 
K
N
 
G
L
 
L
W
 
Y
L
 
A
N
 
C
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
M
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
Y
V
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
Q
S
 
E
A
 
N
I
 
H
S
 
L
M
 
L
D
 
D
G
 
S
L
 
L

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
24% identity, 67% coverage: 136:419/422 of query aligns to 105:391/405 of P40875

query
sites
P40875
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
V
 
L
Y
 
A
R
 
H
D
 
T
G
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
H
 
E
A
 
S
C
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
N
I
 
K
R
 
F
H
 
N
G
 
G
L
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
E
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
C
 
V
T
 
K
A
 
E
I
 
V
E
x
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
G
 
N
A
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
D
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
E
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
D
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
K
x
H
F
 
V
T
 
A
R
 
W
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
x
C
P
 
E
I
 
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
H
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
C
 
G
D
 
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
E
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
 
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
 
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
 
H
K
 
V
M
 
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
 
R
P
 
T
W
 
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
x
C
G
 
G
H
 
W
G
 
G
T
 
T
L
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
F
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A
G
 
N
R
 
D
P
 
E
S
 
A
A
 
H
I
 
A
S
 
L
M
 
N
D
 
A
G
 
P
L
 
F
G
 
S
I
 
L
D
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
E
S
 
T

Sites not aligning to the query:

3ad8B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with pyrrole 2-carboxylate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 136:401/422 of query aligns to 104:372/404 of 3ad8B

query
sites
3ad8B
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
V
 
L
Y
 
A
R
 
H
D
 
T
G
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
H
 
E
A
 
S
C
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
N
I
 
K
R
 
F
H
 
N
G
 
G
L
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
E
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
C
 
V
T
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
G
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
E
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
D
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
K
 
H
F
 
V
T
 
A
R
 
W
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
C
P
 
E
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
C
 
G
D
x
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
E
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
x
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
x
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
 
H
K
 
V
M
x
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3ad7B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with methylthio acetate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 136:401/422 of query aligns to 104:372/404 of 3ad7B

query
sites
3ad7B
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
V
 
L
Y
 
A
R
 
H
D
 
T
G
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
H
 
E
A
 
S
C
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
N
I
 
K
R
 
F
H
 
N
G
 
G
L
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
E
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
C
 
V
T
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
G
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
E
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
D
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
K
 
H
F
 
V
T
 
A
R
 
W
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
C
P
 
E
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
C
 
G
D
x
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
E
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
x
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
x
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
 
H
K
 
V
M
x
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Q50LF2 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain U-96) (see 4 papers)
25% identity, 63% coverage: 136:401/422 of query aligns to 105:373/405 of Q50LF2

query
sites
Q50LF2
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
V
 
L
Y
 
A
R
 
H
D
 
T
G
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
H
 
E
A
 
S
C
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
N
I
 
K
R
 
F
H
 
N
G
 
G
L
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
E
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
C
 
V
T
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
G
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
E
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
D
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
x
K
A
x
H
H
 
D
K
 
H
F
 
V
T
 
A
R
 
W
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
C
P
 
E
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
A
C
 
G
D
 
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
E
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
 
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
 
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
|
H
K
 
V
M
x
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
 
R
P
 
T
W
 
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
 
T
L
 
G
G
|
G
W
 
F
T
x
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

1vrqB Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with folinic acid (see paper)
25% identity, 63% coverage: 136:401/422 of query aligns to 104:372/402 of 1vrqB

query
sites
1vrqB
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
V
 
L
Y
 
A
R
 
H
D
 
T
G
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
E
 
R
H
 
E
A
 
S
C
 
I
R
 
R
A
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
N
I
 
K
R
 
F
H
 
N
G
 
G
L
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
E
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
C
 
V
T
 
K
A
 
E
I
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
G
 
N
A
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
V
 
I
Q
 
R
G
 
Y
E
 
P
L
 
V
A
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
P
 
P
D
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
H
 
D
K
 
H
F
 
V
T
 
A
R
 
W
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
C
P
 
E
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
L
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
|
A
A
x
G
G
 
A
C
 
G
D
x
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
E
P
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
x
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
x
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
 
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
 
H
K
 
V
M
 
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
A
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
Y
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
29% identity, 75% coverage: 100:416/422 of query aligns to 52:369/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
S
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
F
N
 
S
T
 
T
E
 
S
R
 
S
T
 
P
L
 
L
R
 
V
-
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
A
 
A
C
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
G
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
Q
 
V
V
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
V
 
L
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
H
 
D
A
 
L
C
 
Y
R
 
R
A
 
H
A
 
Y
E
 
T
V
 
F
M
 
W
I
 
R
R
 
G
H
 
I
G
 
G
L
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
Q
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
K
A
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
G
 
A
A
 
A
V
 
E
Q
 
A
G
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
H
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
R
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
W
 
E
N
 
Y
V
 
T
P
 
E
I
x
V
Q
 
F
S
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
S
D
 
S
R
 
G
V
 
H
A
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
D
T
 
T
S
 
T
D
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
W
S
 
A
P
 
A
L
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
P
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
S
I
 
V
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
H
 
R
A
 
A
G
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
L
S
 
Q
I
 
T
T
 
T
D
 
V
D
 
F
E
 
A
H
 
K
K
 
N
M
 
G
V
 
C
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
A
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
M
 
P
A
 
G
G
 
T
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
R
P
 
V
N
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
N
 
V
R
 
M
L
 
N
I
 
L
L
 
L
D
 
H
N
 
R
A
 
A
R
 
A
R
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
I
G
 
E
D
 
Q
F
 
A
D
 
E
R
 
W
A
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
A
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
S
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
P
 
P
-
 
E
L
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
M
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
F
S
 
D
M
 
L
D
 
A
G
 
P
L
 
F
G
 
S
I
 
L
D
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
29% identity, 75% coverage: 100:416/422 of query aligns to 51:367/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
S
 
A
R
x
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
F
N
 
S
T
 
T
E
 
S
R
 
S
T
 
P
L
 
L
R
 
V
-
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
A
 
A
C
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
G
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
Q
 
V
V
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
V
 
L
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
H
 
D
A
 
L
C
 
Y
R
 
R
A
 
H
A
 
Y
E
 
T
V
 
F
M
 
W
I
 
R
R
 
G
H
 
I
G
 
G
L
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
Q
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
K
A
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
G
 
A
A
 
E
V
 
A
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
H
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
R
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
W
 
E
N
 
Y
V
 
T
P
 
E
I
x
V
Q
 
F
S
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
S
D
 
S
R
 
G
V
 
H
A
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
D
T
 
T
S
 
T
D
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
C
 
A
D
x
W
S
 
A
P
 
A
L
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
P
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
S
I
 
V
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
H
 
R
A
 
A
G
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
L
S
 
Q
I
 
T
T
 
T
D
 
V
D
 
F
E
 
A
H
 
K
K
 
N
M
x
G
V
 
C
Y
|
Y
-
 
I
-
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
A
x
I
A
 
G
G
x
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
M
 
P
A
 
G
G
 
T
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
R
P
 
V
N
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
N
 
V
R
 
M
L
 
N
I
x
L
L
 
L
D
 
H
N
 
R
A
 
A
R
 
A
R
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
I
G
 
E
D
 
Q
F
 
A
D
 
E
R
 
W
A
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
S
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
P
 
P
-
 
E
L
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
M
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
F
S
 
D
M
 
L
D
 
A
G
 
P
L
 
F
G
 
S
I
 
L
D
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
29% identity, 75% coverage: 100:416/422 of query aligns to 51:367/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
S
 
A
R
x
Q
A
 
S
E
 
E
I
 
F
N
 
S
T
 
T
E
 
S
R
 
S
T
 
P
L
 
L
R
 
V
-
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Q
S
 
S
R
 
R
A
 
A
C
 
L
L
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
G
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
D
Y
 
I
D
 
G
Q
 
L
Q
 
V
V
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
V
 
L
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
E
 
D
H
 
D
A
 
L
C
 
Y
R
 
R
A
 
H
A
 
Y
E
 
T
V
 
F
M
 
W
I
 
R
R
 
G
H
 
I
G
 
G
L
 
E
R
 
P
R
 
V
L
 
Q
P
 
W
R
 
L
T
 
T
P
 
K
A
 
G
E
 
E
C
 
A
T
 
L
A
 
E
I
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
G
 
A
A
 
E
V
 
A
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
M
Y
 
Y
T
 
I
P
 
P
D
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
H
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
R
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
W
 
E
N
 
Y
V
 
T
P
 
E
I
x
V
Q
 
F
S
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
S
D
 
D
G
 
S
D
 
S
R
 
G
V
 
H
A
 
V
G
 
-
L
 
L
A
 
D
T
 
T
S
 
T
D
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
F
R
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
|
G
C
 
A
D
x
W
S
 
A
P
 
A
L
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
A
P
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
S
I
 
V
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
H
 
R
A
 
A
G
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
L
S
 
Q
I
 
T
T
 
T
D
 
V
D
 
F
E
 
A
H
 
K
K
 
N
M
 
G
V
 
C
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
L
A
x
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
M
 
P
A
 
G
G
 
T
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
R
P
 
V
N
 
S
P
 
A
V
 
G
R
 
G
N
 
V
R
 
M
L
 
N
I
x
L
L
 
L
D
 
H
N
 
R
A
 
A
R
 
A
R
 
H
L
 
L
F
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
I
G
 
E
D
 
Q
F
 
A
D
 
E
R
 
W
A
 
V
E
 
A
P
 
S
W
 
W
A
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
P
 
E
D
 
D
S
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
H
P
 
P
-
 
E
L
 
R
R
 
R
N
 
G
L
 
L
W
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
M
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
S
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
F
S
 
D
M
 
L
D
 
A
G
 
P
L
 
F
G
 
S
I
 
L
D
 
T
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2gagB Heteroteterameric sarcosine: structure of a diflavin metaloenzyme at 1.85 a resolution (see paper)
27% identity, 50% coverage: 208:419/422 of query aligns to 178:389/403 of 2gagB

query
sites
2gagB
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
W
 
Q
N
 
N
V
 
C
P
 
E
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
F
L
 
I
A
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
K
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
T
D
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
H
A
 
A
E
 
G
S
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
x
G
G
x
A
C
 
G
D
x
H
S
 
S
P
 
S
L
 
V
L
|
L
A
 
A
R
 
E
P
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
P
I
x
L
P
 
Q
A
 
A
K
 
L
G
x
V
Y
 
S
S
 
E
V
 
L
T
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
T
V
 
V
S
 
V
I
x
M
T
 
S
D
 
N
D
 
H
E
 
I
H
 
H
K
 
V
M
x
Y
V
 
V
-
 
S
Y
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
L
 
V
R
 
M
A
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
M
 
Y
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
G
R
 
Q
M
 
R
P
 
G
N
 
A
P
 
F
V
 
H
R
 
V
N
 
I
R
 
Q
L
 
E
I
 
Q
L
 
M
D
 
A
N
 
A
A
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
I
G
 
F
G
 
A
D
 
R
F
 
A
D
 
H
R
 
V
A
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
A
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
V
 
T
T
 
T
P
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
S
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
Q
N
 
N
L
 
L
W
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
M
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
F
I
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
T
V
 
I
S
 
A
G
 
N
R
 
D
P
 
E
S
 
P
A
 
H
I
 
E
S
 
L
M
 
N
D
 
K
G
 
P
L
 
F
G
 
S
I
 
L
D
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
E
S
 
T

Sites not aligning to the query:

1y56B Crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.Horikoshii (see paper)
23% identity, 75% coverage: 101:417/422 of query aligns to 51:368/374 of 1y56B

query
sites
1y56B
R
 
R
A
 
Q
E
 
Q
I
 
F
N
 
N
T
 
D
E
 
E
R
 
A
T
 
N
L
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
M
L
 
K
Y
 
R
S
 
S
R
 
V
A
 
E
C
 
L
L
 
W
G
 
K
E
 
K
L
 
Y
R
 
S
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
F
A
 
S
Y
 
F
D
 
K
Q
 
Q
Q
 
T
V
 
-
R
 
-
G
 
G
I
 
Y
L
 
L
H
 
F
V
 
L
Y
 
L
R
 
Y
D
 
D
G
 
D
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
K
H
 
T
A
 
F
C
 
K
R
 
R
A
 
N
A
 
I
E
 
E
V
 
I
M
 
Q
I
 
N
R
 
K
H
 
F
G
 
G
L
 
V
R
 
P
R
 
T
L
 
K
P
 
L
R
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
E
C
 
A
T
 
K
A
 
E
I
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
L
G
 
D
A
 
I
V
 
-
Q
 
-
G
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
I
G
 
A
G
 
A
I
 
S
Y
 
W
T
 
N
P
 
P
D
 
T
D
 
D
E
 
G
S
 
K
G
 
A
D
 
D
A
 
P
H
 
F
K
 
E
F
 
A
T
 
T
R
 
T
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
V
L
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
E
K
 
Y
G
 
G
V
 
A
E
 
K
F
 
L
R
 
L
W
 
E
N
 
Y
V
 
T
P
x
E
I
x
V
Q
 
K
S
 
G
L
 
F
L
 
L
A
 
I
D
 
E
G
 
N
D
 
N
R
 
E
V
 
I
A
 
K
G
 
G
L
 
V
A
 
K
T
 
T
S
 
N
D
 
K
G
 
G
T
 
I
I
 
I
R
 
K
A
 
T
E
 
G
S
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
N
A
 
A
A
x
T
G
x
N
C
 
A
D
x
W
S
 
A
P
 
N
L
 
L
L
 
I
A
 
N
R
 
A
P
 
M
L
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
K
-
 
T
-
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
E
P
 
P
A
 
Y
K
 
K
G
x
H
Y
 
Q
S
 
A
V
 
V
-
 
I
T
 
T
V
 
Q
P
 
P
V
 
I
D
 
K
N
 
R
H
 
G
A
 
T
G
 
I
A
 
N
P
|
P
L
 
M
V
 
V
S
 
I
I
 
S
T
 
F
D
 
K
D
 
Y
E
 
G
H
 
H
K
 
A
M
 
Y
V
 
L
Y
 
T
S
 
Q
R
 
T
L
 
F
G
 
H
D
 
G
R
 
G
L
 
I
R
x
I
A
 
G
A
 
G
G
 
I
T
 
G
A
 
Y
E
 
E
M
 
I
A
 
G
-
 
P
G
 
T
Y
 
Y
D
 
D
R
 
L
M
 
T
P
 
P
N
 
T
P
 
Y
V
 
E
R
 
F
N
 
L
R
 
R
L
 
E
I
 
V
L
 
S
D
 
Y
N
 
Y
A
 
F
R
 
T
R
 
K
L
 
I
F
 
I
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
K
D
 
N
F
 
L
D
 
L
R
 
I
A
 
L
E
x
R
P
 
T
W
|
W
A
 
A
G
|
G
L
x
Y
R
x
Y
P
 
A
V
 
K
T
 
T
P
 
P
D
 
D
S
 
S
V
 
N
P
 
P
L
 
A
L
 
I
G
 
G
-
 
R
A
 
I
T
 
E
P
 
E
L
 
L
R
 
N
N
 
D
L
 
Y
W
 
Y
L
 
I
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
 
F
G
 
S
T
x
G
L
x
H
G
|
G
W
x
F
T
x
M
M
 
M
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
V
G
 
G
R
 
E
I
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
K
R
 
G
P
 
K
S
 
T
A
 
K
I
 
L
S
 
P
M
 
V
D
 
E
G
 
W
L
 
Y
G
 
D
I
 
P
D
 
Y
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
28% identity, 74% coverage: 105:417/422 of query aligns to 54:368/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
N
 
S
T
 
Q
E
 
E
R
 
D
T
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
A
 
S
C
 
F
L
 
V
G
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
A
 
A
E
 
V
T
 
S
G
 
G
I
 
T
A
 
S
Y
 
A
D
 
G
Q
 
Y
Q
 
R
V
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
D
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
A
F
 
F
E
 
D
H
 
D
A
 
E
C
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
D
M
 
G
I
 
L
R
 
R
H
 
N
G
 
F
L
 
L
R
 
A
R
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
R
 
L
T
 
N
P
 
A
A
 
R
E
 
R
C
 
C
T
 
R
A
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
G
 
A
A
 
E
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
G
S
 
A
G
 
V
D
 
N
A
 
P
H
 
R
K
 
E
F
 
L
T
 
T
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
-
G
 
-
V
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
R
W
 
G
N
 
G
V
 
T
P
 
L
I
 
I
Q
 
R
-
 
R
-
 
R
-
x
A
-
 
T
S
 
E
L
 
F
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
-
D
 
E
R
 
R
V
 
T
A
 
P
G
 
G
L
 
V
A
 
L
T
 
L
S
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
T
 
A
I
 
V
R
 
H
A
 
G
E
 
D
S
 
R
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
C
 
C
D
x
W
S
 
T
P
 
H
L
 
R
L
 
L
A
 
A
-
 
G
R
 
L
P
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
A
R
 
V
L
 
P
P
 
E
I
 
I
I
 
A
P
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
Q
S
x
I
V
 
L
T
 
R
V
 
L
P
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
H
 
R
A
 
S
G
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
x
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
D
 
G
E
 
S
H
 
G
K
 
V
M
x
Y
V
 
L
Y
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
T
G
 
D
D
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
x
Y
E
 
E
M
 
E
A
 
R
G
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
T
M
 
T
P
 
V
N
 
T
P
 
A
V
 
G
R
 
G
N
 
V
R
 
A
L
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
G
N
 
K
A
 
V
R
 
L
R
 
A
L
 
V
F
 
L
P
 
P
D
 
G
G
 
A
G
 
A
D
 
E
F
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
T
W
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
W
T
 
T
P
 
A
L
 
V
R
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
T
x
R
L
x
I
G
|
G
W
x
V
T
x
Q
M
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
G
 
A
R
 
D
I
 
V
V
 
M
A
 
G
D
 
E
-
 
M
L
 
L
V
 
V
S
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
T
S
 
P
A
 
E
I
 
V
S
 
A
M
 
-
D
 
K
G
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
28% identity, 74% coverage: 105:417/422 of query aligns to 54:368/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
N
 
S
T
 
Q
E
 
E
R
 
D
T
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
R
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
A
 
S
C
 
F
L
 
V
G
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
A
 
A
E
 
V
T
 
S
G
 
G
I
 
T
A
 
S
Y
 
A
D
 
G
Q
 
Y
Q
 
R
V
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
D
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
A
F
 
F
E
 
D
H
 
D
A
 
E
C
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
D
M
 
G
I
 
L
R
 
R
H
 
N
G
 
F
L
 
L
R
 
A
R
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
R
 
L
T
 
N
P
 
A
A
 
R
E
 
R
C
 
C
T
 
R
A
 
E
I
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
M
L
 
L
G
 
A
A
 
E
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
S
L
 
V
A
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
D
E
 
G
S
 
A
G
 
V
D
 
N
A
 
P
H
 
R
K
 
E
F
 
L
T
 
T
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
-
G
 
-
V
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
R
W
 
G
N
 
G
V
 
T
P
 
L
I
 
I
Q
 
R
-
 
R
-
 
R
-
x
A
-
 
T
S
 
E
L
 
F
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
-
D
 
E
R
 
R
V
 
T
A
 
P
G
 
G
L
 
V
A
 
L
T
 
L
S
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
C
T
 
A
I
 
V
R
 
H
A
 
G
E
 
D
S
 
R
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
|
A
G
 
G
C
 
C
D
x
W
S
 
T
P
 
H
L
 
R
L
 
L
A
 
A
-
 
G
R
 
L
P
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
A
R
 
V
L
 
P
P
 
E
I
 
I
I
 
A
P
 
P
A
 
A
K
 
K
G
|
G
Y
 
Q
S
 
I
V
 
L
T
 
R
V
 
L
P
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
-
H
 
R
A
 
S
G
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
R
S
 
A
I
 
V
T
 
T
D
 
R
D
 
G
E
 
S
H
 
G
K
 
V
M
 
Y
V
 
L
Y
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
T
G
 
D
D
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
Y
E
 
E
M
 
E
A
 
R
G
 
D
Y
 
Y
D
 
D
R
 
T
M
 
T
P
 
V
N
 
T
P
 
A
V
 
G
R
 
G
N
 
V
R
 
A
L
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
G
N
 
K
A
 
V
R
 
L
R
 
A
L
 
V
F
 
L
P
 
P
D
 
G
G
 
A
G
 
A
D
 
E
F
 
L
D
 
E
R
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
T
W
 
A
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
W
T
 
T
P
 
A
L
 
V
R
 
P
N
 
N
L
 
L
W
 
L
L
 
V
N
 
A
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
S
T
x
R
L
x
I
G
|
G
W
x
V
T
x
Q
M
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
I
S
 
T
G
 
A
R
 
D
I
 
V
V
 
M
A
 
G
D
 
E
-
 
M
L
 
L
V
 
V
S
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
T
S
 
P
A
 
E
I
 
V
S
 
A
M
 
-
D
 
K
G
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
24% identity, 52% coverage: 185:403/422 of query aligns to 134:349/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
G
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
D
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
Y
K
 
F
F
 
V
T
 
C
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
A
 
V
A
 
K
L
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
M
K
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
I
R
 
F
W
 
E
N
 
H
V
 
T
P
 
P
I
x
V
Q
 
L
S
 
H
L
 
V
L
 
E
A
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
A
V
 
L
A
 
F
G
 
-
L
 
I
A
 
K
T
 
T
S
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
R
 
W
A
 
A
E
 
N
S
 
H
Y
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
S
G
|
G
C
 
V
D
x
W
S
 
S
P
 
G
L
 
M
L
x
F
A
 
F
R
 
K
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
N
P
 
A
I
 
F
I
 
L
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
W
V
 
N
D
 
D
N
 
D
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
K
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
D
 
H
E
 
D
H
 
H
K
 
C
M
x
Y
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
K
G
 
S
D
 
G
R
|
R
L
 
L
R
 
V
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
M
 
P
A
 
G
G
 
D
Y
 
W
D
 
S
R
 
E
M
 
T
P
 
P
N
 
D
P
 
L
V
 
G
R
 
G
N
 
L
R
 
E
L
 
S
I
 
V
L
 
M
D
 
K
N
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
M
F
 
L
P
 
P
D
 
P
G
 
I
G
 
Q
D
 
N
F
 
M
D
 
K
R
 
V
A
 
D
E
 
R
P
 
F
W
 
W
A
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
T
P
 
K
D
 
D
S
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
L
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
P
 
P
L
 
E
R
 
D
N
 
S
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
M
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
L
V
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
I
S
 
M
G
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
24% identity, 52% coverage: 185:403/422 of query aligns to 134:349/369 of O31616

query
sites
O31616
G
 
G
E
 
D
L
 
I
A
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
S
Y
 
F
T
 
I
P
 
Q
D
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
Y
K
 
F
F
 
V
T
 
C
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
A
 
V
A
 
K
L
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
M
K
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
I
R
 
F
W
 
E
N
 
H
V
 
T
P
 
P
I
x
V
Q
 
L
S
 
H
L
 
V
L
 
E
A
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
A
V
 
L
A
 
F
G
 
-
L
 
I
A
 
K
T
 
T
S
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
R
 
W
A
 
A
E
 
N
S
 
H
Y
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
S
G
 
G
C
 
V
D
 
W
S
 
S
P
 
G
L
 
M
L
 
F
A
 
F
R
 
K
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
N
P
 
A
I
 
F
I
 
L
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
W
V
 
N
D
 
D
N
 
D
H
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
K
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
D
 
H
E
 
D
H
|
H
K
 
C
M
 
Y
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
K
G
 
S
D
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
M
 
P
A
 
G
G
 
D
Y
 
W
D
 
S
R
 
E
M
 
T
P
 
P
N
 
D
P
 
L
V
 
G
R
 
G
N
 
L
R
 
E
L
 
S
I
 
V
L
 
M
D
 
K
N
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
T
L
 
M
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
I
G
 
Q
D
 
N
F
 
M
D
 
K
R
 
V
A
 
D
E
 
R
P
 
F
W
 
W
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
G
T
 
T
P
 
K
D
 
D
S
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
Y
L
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
P
 
P
L
 
E
R
 
D
N
 
S
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
M
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
L
V
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
I
S
 
M
G
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Q9AGP8 Dimethylglycine oxidase; DMGO; EC 1.5.3.10 from Arthrobacter globiformis (see 2 papers)
25% identity, 78% coverage: 90:417/422 of query aligns to 51:393/830 of Q9AGP8

query
sites
Q9AGP8
G
 
G
L
|
L
R
 
V
F
 
F
L
 
Q
A
 
T
N
 
N
C
 
P
S
 
S
R
 
K
S
 
T
R
 
M
A
 
A
E
 
S
I
 
F
N
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
K
Y
 
Y
S
 
T
R
 
V
A
 
E
C
 
K
L
 
L
G
 
L
E
 
S
L
 
L
R
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
C
D
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
-
L
 
L
H
 
E
V
 
V
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
E
 
A
H
 
D
A
 
L
C
 
K
R
 
R
A
 
K
A
 
L
E
 
G
V
 
Y
M
 
A
I
 
A
R
 
A
H
 
W
G
 
G
L
 
I
R
 
E
R
 
G
L
 
R
P
 
L
R
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
C
T
 
Q
A
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
A
H
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
V
R
 
Q
E
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
E
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
R
 
R
W
 
G
N
 
S
V
 
T
P
 
T
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
I
L
 
E
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
T
 
T
S
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
V
I
 
I
R
 
P
A
 
A
E
 
D
S
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
S
A
 
C
A
 
A
G
 
G
C
 
F
D
 
W
S
 
G
P
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
G
R
 
A
P
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
M
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
I
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
V
 
K
T
 
T
V
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
D
 
D
N
 
Q
H
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
P
S
 
I
I
 
L
T
 
R
D
 
H
D
 
Q
E
 
D
H
 
Q
K
 
D
M
 
L
V
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
R
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
S
T
 
Y
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
E
 
E
M
 
T
A
 
V
G
 
S
Y
 
E
D
 
H
R
 
H
M
 
M
P
 
P
N
 
S
P
 
-
V
 
-
R
 
R
N
 
L
R
 
D
L
 
F
I
 
T
L
 
L
D
 
E
N
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
E
E
 
D
P
 
G
W
 
F
A
 
N
G
 
G
L
 
I
R
 
F
P
 
S
V
 
F
T
 
T
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
P
 
K
-
 
E
L
 
L
R
 
D
N
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
A
T
 
E
G
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
-
L
x
V
G
x
W
W
x
V
T
|
T
M
 
H
S
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
G
 
A
R
 
K
I
 
A
V
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
T
R
 
G
P
 
R
S
 
S
A
 
E
I
 
T
S
 
D
M
 
L
D
 
G
G
 
E
L
 
C
G
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1pj6A Crystal structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folic acid (see paper)
25% identity, 78% coverage: 90:417/422 of query aligns to 49:391/828 of 1pj6A

query
sites
1pj6A
G
 
G
L
|
L
R
 
V
F
 
F
L
 
Q
A
 
T
N
 
N
C
 
P
S
 
S
R
 
K
S
 
T
R
 
M
A
 
A
E
 
S
I
 
F
N
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
K
Y
 
Y
S
 
T
R
 
V
A
 
E
C
 
K
L
 
L
G
 
L
E
 
S
L
 
L
R
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
C
D
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
-
L
 
L
H
 
E
V
 
V
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
E
 
A
H
 
D
A
 
L
C
 
K
R
 
R
A
 
K
A
 
L
E
 
G
V
 
Y
M
 
A
I
 
A
R
 
A
H
 
W
G
 
G
L
 
I
R
 
E
R
 
G
L
 
R
P
 
L
R
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
C
T
 
Q
A
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
A
H
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
V
R
 
Q
E
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
E
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
R
 
R
W
 
G
N
 
S
V
 
T
P
 
T
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
I
L
 
E
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
T
 
T
S
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
V
I
 
I
R
 
P
A
 
A
E
 
D
S
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
C
 
F
D
x
W
S
 
G
P
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
G
R
 
A
P
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
M
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
I
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
V
 
K
T
 
T
V
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
D
 
D
N
 
Q
H
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
P
S
 
I
I
 
L
T
 
R
D
 
H
D
 
Q
E
 
D
H
 
Q
K
 
D
M
 
L
V
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
R
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
S
T
 
Y
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
E
 
E
M
 
T
A
 
V
G
 
S
Y
 
E
D
 
H
R
 
H
M
 
M
P
 
P
N
 
S
P
 
-
V
 
-
R
 
R
N
 
L
R
 
D
L
 
F
I
 
T
L
 
L
D
 
E
N
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
E
E
 
D
P
 
G
W
 
F
A
 
N
G
|
G
L
x
I
R
 
F
P
 
S
V
 
F
T
 
T
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
P
 
K
-
 
E
L
 
L
R
 
D
N
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
A
T
 
E
G
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
-
L
x
V
G
x
W
W
x
V
T
|
T
M
 
H
S
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
G
 
A
R
 
K
I
 
A
V
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
T
R
 
G
P
 
R
S
 
S
A
 
E
I
 
T
S
 
D
M
 
L
D
 
G
G
 
E
L
 
C
G
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3gsiA Crystal structure of d552a dimethylglycine oxidase mutant of arthrobacter globiformis in complex with tetrahydrofolate (see paper)
25% identity, 78% coverage: 90:417/422 of query aligns to 48:390/827 of 3gsiA

query
sites
3gsiA
G
 
G
L
|
L
R
 
V
F
 
F
L
 
Q
A
 
T
N
 
N
C
 
P
S
 
S
R
 
K
S
 
T
R
 
M
A
 
A
E
 
S
I
 
F
N
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
K
Y
 
Y
S
 
T
R
 
V
A
 
E
C
 
K
L
 
L
G
 
L
E
 
S
L
 
L
R
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
C
D
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
-
L
 
L
H
 
E
V
 
V
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
E
 
A
H
 
D
A
 
L
C
 
K
R
 
R
A
 
K
A
 
L
E
 
G
V
 
Y
M
 
A
I
 
A
R
 
A
H
 
W
G
 
G
L
 
I
R
 
E
R
 
G
L
 
R
P
 
L
R
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
C
T
 
Q
A
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
A
H
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
V
R
 
Q
E
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
E
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
R
 
R
W
 
G
N
 
S
V
 
T
P
x
T
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
I
L
 
E
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
T
 
T
S
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
V
I
 
I
R
 
P
A
 
A
E
 
D
S
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
C
 
F
D
x
W
S
 
G
P
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
G
R
 
A
P
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
M
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
I
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
V
 
K
T
 
T
V
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
D
 
D
N
 
Q
H
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
P
S
 
I
I
 
L
T
 
R
D
 
H
D
 
Q
E
 
D
H
 
Q
K
x
D
M
 
L
V
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
R
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
S
T
 
Y
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
E
 
E
M
 
T
A
 
V
G
 
S
Y
 
E
D
 
H
R
 
H
M
 
M
P
 
P
N
 
S
P
 
-
V
 
-
R
 
R
N
 
L
R
 
D
L
 
F
I
 
T
L
 
L
D
 
E
N
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
E
E
 
D
P
 
G
W
 
F
A
 
N
G
|
G
L
x
I
R
x
F
P
 
S
V
 
F
T
 
T
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
P
 
K
-
 
E
L
 
L
R
 
D
N
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
A
T
 
E
G
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
-
L
x
V
G
x
W
W
x
V
T
|
T
M
 
H
S
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
G
 
A
R
 
K
I
 
A
V
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
T
R
 
G
P
 
R
S
 
S
A
 
E
I
 
T
S
 
D
M
 
L
D
 
G
G
 
E
L
 
C
G
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1pj7A Structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folinic acid (see paper)
25% identity, 78% coverage: 90:417/422 of query aligns to 48:390/827 of 1pj7A

query
sites
1pj7A
G
 
G
L
|
L
R
 
V
F
 
F
L
 
Q
A
 
T
N
 
N
C
 
P
S
 
S
R
 
K
S
 
T
R
 
M
A
 
A
E
 
S
I
 
F
N
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
K
Y
 
Y
S
 
T
R
 
V
A
 
E
C
 
K
L
 
L
G
 
L
E
 
S
L
 
L
R
 
-
A
 
T
E
 
E
T
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Y
 
C
D
 
F
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
V
R
 
G
G
 
G
I
 
-
L
 
L
H
 
E
V
 
V
Y
 
A
R
 
T
D
 
T
G
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
E
 
A
H
 
D
A
 
L
C
 
K
R
 
R
A
 
K
A
 
L
E
 
G
V
 
Y
M
 
A
I
 
A
R
 
A
H
 
W
G
 
G
L
 
I
R
 
E
R
 
G
L
 
R
P
 
L
R
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
C
 
C
T
 
Q
A
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
G
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
N
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
L
Y
 
H
T
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
A
H
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
V
R
 
Q
E
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
K
L
 
R
A
 
T
A
 
E
A
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
R
 
R
W
 
G
N
 
S
V
 
T
P
x
T
I
x
V
Q
 
T
S
 
G
L
 
I
L
 
E
A
 
Q
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
T
 
T
S
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
V
I
 
I
R
 
P
A
 
A
E
 
D
S
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
S
A
 
C
A
|
A
G
|
G
C
 
F
D
x
W
S
 
G
P
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
G
R
 
A
P
 
M
L
 
I
G
 
G
L
 
M
R
 
A
L
 
V
P
 
P
I
 
L
I
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
V
 
K
T
 
T
V
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
D
 
D
N
 
Q
H
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
A
P
 
R
L
 
L
V
 
P
S
 
I
I
 
L
T
 
R
D
 
H
D
 
Q
E
 
D
H
 
Q
K
 
D
M
 
L
V
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
Y
R
 
G
A
 
I
A
 
G
G
 
S
T
 
Y
A
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
E
 
E
M
 
T
A
 
V
G
 
S
Y
 
E
D
 
H
R
 
H
M
 
M
P
 
P
N
 
S
P
 
-
V
 
-
R
 
R
N
 
L
R
 
D
L
 
F
I
 
T
L
 
L
D
 
E
N
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
A
 
T
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
L
P
 
P
D
 
A
G
 
L
G
 
A
D
 
D
F
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
E
E
 
D
P
 
G
W
 
F
A
 
N
G
 
G
L
x
I
R
 
F
P
 
S
V
 
F
T
 
T
P
 
P
D
 
D
S
 
G
V
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
E
T
 
S
P
 
K
-
 
E
L
 
L
R
 
D
N
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
A
T
 
E
G
 
A
H
 
-
G
 
-
T
 
-
L
x
V
G
x
W
W
x
V
T
|
T
M
 
H
S
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
G
 
A
R
 
K
I
 
A
V
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
T
R
 
G
P
 
R
S
 
S
A
 
E
I
 
T
S
 
D
M
 
L
D
 
G
G
 
E
L
 
C
G
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
26% identity, 67% coverage: 121:404/422 of query aligns to 78:350/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
G
 
G
E
 
E
L
 
L
R
x
K
A
 
D
E
 
I
T
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
D
Y
 
I
D
 
R
Q
 
R
Q
 
H
V
 
D
R
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
H
 
K
V
 
L
Y
 
A
R
 
F
D
 
S
G
 
E
A
 
S
E
 
D
F
 
R
E
 
E
H
 
H
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
L
M
 
M
I
 
Q
R
 
M
H
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
S
L
 
V
P
 
E
R
 
W
T
 
L
P
 
E
A
 
A
-
 
D
E
 
E
C
 
V
T
 
Y
A
 
K
I
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
N
L
 
A
G
 
G
A
 
-
V
 
-
Q
 
K
G
 
G
E
 
I
L
 
L
A
 
-
G
 
G
G
 
A
I
 
N
Y
 
F
T
 
I
P
 
R
D
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
H
 
A
K
 
A
F
 
V
T
 
C
R
 
R
E
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
L
 
G
A
 
A
A
 
R
A
 
M
K
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
D
F
 
V
R
 
F
W
 
E
N
 
Y
V
 
T
P
 
P
I
 
V
Q
 
L
S
 
S
L
 
I
L
 
E
A
 
S
D
 
E
G
 
A
D
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
R
G
 
-
L
 
V
A
 
T
T
 
S
S
 
A
D
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
H
Y
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
x
S
G
 
G
C
 
V
D
 
W
S
 
S
P
 
G
L
 
A
L
 
L
A
 
F
R
 
K
P
 
Q
L
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
D
L
 
K
P
 
R
I
 
F
I
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
V
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
W
V
 
N
D
 
D
N
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
I
P
 
S
L
 
L
V
 
T
S
 
R
I
 
T
T
 
L
D
 
Y
D
 
H
E
 
D
H
 
H
K
 
C
M
 
Y
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
R
L
 
H
G
 
S
D
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
A
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
M
 
P
A
 
G
G
 
D
Y
 
W
D
 
N
R
 
E
M
 
Q
P
 
P
N
 
E
P
 
L
V
 
G
R
 
G
N
 
I
R
 
E
L
 
E
I
 
L
L
 
I
D
 
R
N
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
L
 
M
F
 
L
P
 
P
D
 
G
G
 
I
G
 
E
D
 
S
F
 
M
D
 
K
R
 
I
A
 
D
E
 
Q
P
 
C
W
 
W
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
E
T
 
T
P
 
G
D
 
D
S
 
G
V
 
N
P
 
P
L
 
Y
L
 
I
G
 
G
A
 
R
T
 
H
P
 
P
L
 
E
R
 
N
N
 
D
-
 
R
L
 
I
W
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
F
T
 
R
L
 
N
G
 
G
W
x
I
T
 
L
M
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
M
V
x
M
A
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
I
S
 
L
G
 
G
R
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011385177.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011385177.1
MKVVVIGAGVVGTASAWYLAKAGHEVTVVDRREGAGLETSFANGGQISPCHAEPWANPSV
LPKVLKWLGREDAPLLFRWNRWDPALWAWGLRFLANCSRSRAEINTERTLRVALYSRACL
GELRAETGIAYDQQVRGILHVYRDGAEFEHACRAAEVMIRHGLRRLPRTPAECTAIEPAL
GAVQGELAGGIYTPDDESGDAHKFTRELAALAAAKGVEFRWNVPIQSLLADGDRVAGLAT
SDGTIRAESYVLAAGCDSPLLARPLGLRLPIIPAKGYSVTVPVDNHAGAPLVSITDDEHK
MVYSRLGDRLRAAGTAEMAGYDRMPNPVRNRLILDNARRLFPDGGDFDRAEPWAGLRPVT
PDSVPLLGATPLRNLWLNTGHGTLGWTMSCGSGRIVADLVSGRPSAISMDGLGIDRFTSY
LW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory