SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011425184.1 NCBI__GCF_000092045.1:WP_011425184.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6eb3C Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
43% identity, 45% coverage: 15:131/261 of query aligns to 8:117/262 of 6eb3C

query
sites
6eb3C
G
 
G
L
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
H
F
 
Y
F
 
E
D
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
Q
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
F
x
L
A
 
G
S
 
A
T
 
P
A
 
A
N
 
A
V
 
A
N
 
-
W
 
W
V
 
-
N
 
D
P
 
P
G
 
I
W
 
F
L
 
V
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
G
 
T
D
 
K
A
 
T
G
 
-
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
I
I
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
A
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
H
 
D
D
 
-
A
 
-
E
 
M
A
 
P
Y
 
Y
R
 
S
P
 
I
W
 
A
V
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
P
E
 
R
A
 
A
N
 
H
L
 
V
M
 
F
G
 
G
Y
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
I
S
 
A
V
 
Q
F
 
E
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
H
 
Q
R
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G

6eb3B Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
43% identity, 45% coverage: 15:131/261 of query aligns to 8:117/268 of 6eb3B

query
sites
6eb3B
G
 
G
L
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
H
F
 
Y
F
 
E
D
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
Q
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
F
 
L
A
 
G
S
 
A
T
 
P
A
 
A
N
 
A
V
 
A
N
 
-
W
 
W
V
 
-
N
 
D
P
 
P
G
 
I
W
 
F
L
 
V
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
G
 
T
D
 
K
A
 
T
G
 
-
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
I
I
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
A
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
H
 
D
D
 
-
A
 
-
E
 
M
A
 
P
Y
 
Y
R
 
S
P
 
I
W
x
A
V
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
P
E
 
R
A
 
A
N
 
H
L
 
V
M
 
F
G
 
G
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
I
S
 
A
V
 
Q
F
x
E
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
x
H
N
 
Y
P
 
P
H
 
Q
R
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6eb3A Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
43% identity, 45% coverage: 15:131/261 of query aligns to 8:117/265 of 6eb3A

query
sites
6eb3A
G
 
G
L
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
H
F
 
Y
F
 
E
D
 
I
E
 
E
G
|
G
D
 
Q
P
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
F
 
L
A
 
G
S
 
A
T
 
P
A
 
A
N
 
A
V
 
A
N
 
-
W
 
W
V
 
-
N
 
D
P
 
P
G
 
I
W
 
F
L
 
V
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
G
 
T
D
 
K
A
 
T
G
 
-
Y
 
H
R
x
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
I
I
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
A
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
H
 
D
D
 
-
A
 
-
E
 
M
A
 
P
Y
 
Y
R
 
S
P
 
I
W
 
A
V
 
M
M
 
F
A
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
H
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
P
E
 
R
A
 
A
N
 
H
L
 
V
M
 
F
G
 
G
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
I
S
 
A
V
 
Q
F
 
E
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
H
N
 
Y
P
 
P
H
 
Q
R
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G

5alsA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/541 of 5alsA

query
sites
5alsA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5fp0A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/543 of 5fp0A

query
sites
5fp0A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5am2A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 242:349/537 of 5am2A

query
sites
5am2A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
x
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alrA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/542 of 5alrA

query
sites
5alrA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5am5A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5am5A

query
sites
5am5A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
x
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5am4A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5am4A

query
sites
5am4A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5am1A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5am1A

query
sites
5am1A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5am0A Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5am0A

query
sites
5am0A
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alzA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alzA

query
sites
5alzA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alyA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alyA

query
sites
5alyA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alxA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alxA

query
sites
5alxA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alwA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alwA

query
sites
5alwA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5aluA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5aluA

query
sites
5aluA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5altA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5altA

query
sites
5altA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
x
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alpA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alpA

query
sites
5alpA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5aloA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5aloA

query
sites
5aloA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5alnA Ligand complex structure of soluble epoxide hydrolase (see paper)
35% identity, 43% coverage: 16:128/261 of query aligns to 247:354/546 of 5alnA

query
sites
5alnA
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
H
F
 
F
F
 
V
D
 
E
E
 
L
G
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
S
G
 
G
V
 
P
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
I
 
C
H
 
H
G
 
G
F
|
F
A
 
P
S
 
E
T
 
S
A
 
-
N
 
-
V
 
-
N
 
-
W
 
W
V
 
Y
N
 
S
P
 
W
G
 
R
W
 
Y
-
 
Q
L
 
I
R
 
P
T
 
A
L
 
L
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
M
D
 
D
N
 
M
R
 
K
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
A
 
E
S
 
S
D
 
S
K
 
A
P
 
P
H
 
P
D
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
R
 
C
P
 
M
W
 
E
V
 
V
M
 
L
A
 
C
G
 
K
D
 
E
A
 
M
I
 
V
A
 
T
L
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
S
E
 
Q
A
 
A
N
 
V
L
 
F
M
 
I
G
 
G
Y
x
H
S
x
D
M
x
W
G
 
G
A
 
G
R
 
M
I
 
L
S
 
V
V
 
W
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
F
N
 
Y
P
 
P
H
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011425184.1 NCBI__GCF_000092045.1:WP_011425184.1
MNLNTPAFSSFTHEGLRLAFFDEGDPSGVPVLLIHGFASTANVNWVNPGWLRTLGDAGYR
VIAIDNRGHGASDKPHDAEAYRPWVMAGDAIALLDHLGIPEANLMGYSMGARISVFAALA
NPHRVRSLVLGGLGIGMTDGVGDWDPIADALLAPSLDVVMHDRGRMFRAFAEQTKSDRTA
LAACIRGSRDLVARSDMAKLDMPTLIGVGTKDDIAGSPQELAALMPEAEALDIPGRDHML
AVGDKVFKQAVLAFYARVAEG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory