SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011428578.1 NCBI__GCF_000092045.1:WP_011428578.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
34% identity, 95% coverage: 7:247/253 of query aligns to 16:260/265 of P07821

query
sites
P07821
N
 
N
L
 
I
T
 
S
W
 
F
K
 
R
I
 
V
G
 
P
R
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
L
L
 
L
D
 
H
G
 
P
V
 
L
S
 
S
M
 
L
E
 
T
A
 
F
P
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
K
M
 
V
L
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
T
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
M
L
 
L
A
 
G
G
 
R
L
 
H
K
 
Q
R
 
P
P
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
A
S
 
Q
D
 
P
I
 
L
G
 
E
K
 
S
I
 
W
S
 
S
R
 
S
R
 
K
S
 
A
I
 
F
A
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
Y
V
 
L
E
 
P
Q
 
Q
H
 
Q
A
 
L
T
 
P
T
 
P
N
 
A
A
 
E
N
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
R
D
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
H
 
W
R
 
H
S
 
G
M
 
A
F
 
L
S
 
G
G
 
R
W
 
F
T
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
K
V
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
R
 
L
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
K
E
 
P
K
 
L
R
 
A
D
 
H
E
 
R
R
 
L
W
 
V
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
T
 
A
H
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
S
 
D
P
 
S
Q
 
R
E
 
C
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
H
 
H
Q
 
Q
I
 
V
G
 
D
L
 
V
M
 
L
R
 
S
L
 
L
V
 
V
S
 
H
G
 
R
L
 
L
P
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
H
 
M
A
 
A
A
 
A
M
 
R
F
 
Y
C
 
C
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
I
 
V
I
 
A
M
 
L
Q
 
R
Q
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
M
V
 
I
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
M
S
 
R
E
 
G
T
 
E
L
 
T
L
 
L
R
 
E
E
 
M
V
 
I
F
 
Y
S
 
G
V
 
I
E
 
P
A
 
M
R
 
G
I
 
I
E
 
L
A
 
P
S
 
H
P
 
P
Y
 
A
H
 
G
S
 
A
R
 
A
P
 
P

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
32% identity, 87% coverage: 3:223/253 of query aligns to 2:224/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
I
K
 
F
A
 
V
D
 
N
N
 
D
L
 
V
T
 
Y
W
 
K
K
 
N
I
x
F
G
 
G
R
 
S
K
 
L
T
 
E
I
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
V
P
 
N
P
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
V
L
 
V
G
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
C
L
 
I
A
 
N
G
 
L
L
 
L
K
 
E
R
 
E
P
 
P
H
 
T
S
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
F
L
 
I
D
 
D
R
 
G
S
 
V
D
 
K
I
 
I
-
 
N
-
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
V
S
 
N
R
 
I
R
 
N
S
 
K
I
 
V
A
 
R
R
 
Q
R
 
K
I
 
V
A
 
G
F
 
M
V
 
V
E
 
F
Q
 
Q
H
 
H
A
 
F
T
 
N
T
 
L
N
 
F
A
 
P
N
 
H
L
 
L
K
 
T
V
 
A
L
 
I
D
 
E
V
 
N
V
 
I
K
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
F
 
V
P
 
K
H
 
V
R
 
K
S
 
K
M
 
M
F
 
-
S
 
-
G
 
N
W
 
K
T
 
K
K
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
E
E
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
L
A
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
L
E
 
D
K
 
K
R
 
K
D
 
D
E
 
Q
R
 
Y
W
 
P
Q
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
L
H
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
S
 
Q
P
 
P
Q
 
E
E
 
V
L
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
M
I
 
V
Q
 
K
H
 
E
Q
 
V
I
 
L
G
 
N
L
 
V
M
 
M
R
 
K
L
 
Q
V
 
L
S
 
A
G
 
N
L
 
E
P
 
G
I
 
M
T
 
T
S
 
M
I
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
A
 
R
M
 
E
F
 
V
C
 
G
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
I
 
I
I
 
F
M
 
M
Q
 
D
Q
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
38% identity, 88% coverage: 3:225/253 of query aligns to 5:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
I
 
L
K
 
A
A
 
A
D
 
E
N
 
A
L
 
L
T
 
T
W
 
Y
K
 
A
I
x
F
-
 
P
G
 
G
R
 
G
K
x
V
T
 
K
I
x
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
V
 
L
S
 
S
M
 
L
E
 
A
A
 
V
P
 
P
P
 
K
G
 
G
R
 
E
M
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
L
L
 
H
L
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
T
K
 
L
R
 
R
P
 
P
H
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
L
D
 
G
R
 
G
S
 
T
D
 
A
I
 
T
G
 
G
K
 
H
I
 
-
S
 
S
R
 
R
R
 
K
S
 
D
I
 
L
A
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
G
F
 
L
V
 
V
E
 
L
Q
|
Q
H
 
D
A
 
A
T
 
D
T
 
D
N
 
Q
A
 
L
-
 
F
N
 
A
L
 
T
K
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
V
 
D
V
 
V
K
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
F
 
-
P
 
-
H
 
-
R
 
-
S
 
P
M
 
L
F
 
N
S
 
L
G
 
G
W
 
L
T
 
S
K
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
L
G
 
S
M
 
I
A
 
S
E
 
D
K
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
R
R
 
P
W
 
T
Q
x
H
S
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
M
S
 
R
P
 
P
Q
 
E
E
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
A
H
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
L
Q
 
A
H
 
G
Q
 
T
I
 
E
G
 
Q
L
 
L
M
 
L
R
 
T
L
 
L
V
 
L
S
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
A
P
 
G
I
 
M
T
 
T
S
 
L
I
 
V
V
 
F
A
 
S
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
E
H
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
A
F
 
L
C
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
I
 
A
I
 
L
M
 
F
Q
 
R
Q
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
A
E
 
E
E
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
E
 
D

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
30% identity, 88% coverage: 1:222/253 of query aligns to 5:216/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
M
 
V
S
 
E
I
 
V
K
 
K
A
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
T
W
 
K
K
 
R
I
x
F
G
 
G
R
 
N
K
x
F
T
 
T
I
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
V
 
L
S
 
N
M
 
L
E
 
T
A
 
I
P
 
K
P
 
D
G
 
G
R
 
E
M
 
F
L
 
L
G
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
L
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
M
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
E
R
 
E
P
 
P
H
 
T
S
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
Y
L
 
F
D
 
G
R
 
D
S
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
Y
I
 
L
S
 
P
R
 
P
R
 
K
S
 
D
I
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
N
I
 
I
A
 
S
F
 
M
V
 
V
E
 
F
Q
 
Q
H
 
H
A
 
M
T
 
T
T
 
V
N
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
A
V
 
F
K
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
K
F
 
F
P
 
P
H
 
K
R
 
D
S
 
E
M
 
I
F
 
-
S
 
-
G
 
-
W
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
D
E
 
K
A
 
R
V
 
V
E
 
R
A
 
W
A
 
A
L
 
A
A
 
E
R
 
L
A
 
L
G
 
Q
M
 
I
A
 
E
E
 
E
K
 
L
R
 
L
D
 
N
E
 
R
R
 
Y
W
 
P
Q
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
V
S
 
E
P
 
P
Q
 
D
E
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
N
 
S
H
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
A
Q
 
K
H
 
L
Q
 
R
I
 
V
G
 
A
L
 
M
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
I
M
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
Q
S
 
Q
G
 
K
L
 
L
P
 
K
I
 
V
T
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
Y
A
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
N
 
V
H
 
E
A
 
A
A
 
M
M
 
T
F
 
M
C
 
G
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
A
I
 
V
M
 
M
Q
 
N
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
V
 
L
A
 
Q
S
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 88% coverage: 3:224/253 of query aligns to 3:225/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
K
 
R
A
 
I
D
 
R
N
 
N
L
 
L
T
 
H
W
 
K
K
 
W
I
x
F
G
 
G
R
 
P
K
 
L
T
 
H
I
x
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
H
M
 
L
E
 
E
A
 
V
P
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
E
M
 
K
L
 
L
G
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
T
L
 
I
A
 
N
G
 
R
L
 
L
K
 
E
R
 
D
P
 
F
H
 
Q
S
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
G
S
 
L
D
 
S
I
 
V
G
 
-
K
 
K
I
 
D
S
 
D
R
 
R
-
 
A
-
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
I
A
 
R
R
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
G
F
 
M
V
 
V
E
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
A
 
F
T
 
N
T
 
L
N
 
F
A
 
P
N
 
H
L
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
M
R
 
R
S
 
V
M
 
R
F
 
R
S
 
W
G
 
P
W
 
R
T
 
E
K
 
K
A
 
A
D
 
E
E
 
K
E
 
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
-
L
 
L
A
 
E
R
 
R
A
 
V
G
 
G
M
 
I
A
 
L
E
 
D
K
 
Q
R
 
A
D
 
R
E
 
K
R
 
Y
W
 
P
Q
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
S
 
E
P
 
P
Q
 
K
E
 
I
L
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
M
I
 
V
Q
 
G
H
 
E
Q
 
V
I
 
L
G
 
D
L
 
V
M
 
M
R
 
R
L
 
D
V
 
L
S
 
A
G
 
Q
L
 
G
P
 
G
I
 
M
T
 
T
S
 
M
I
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
H
 
F
A
 
A
A
 
R
M
 
E
F
 
V
C
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
I
 
V
I
 
F
M
 
M
Q
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
A
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
L
 
F
S
 
T

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
29% identity, 91% coverage: 3:232/253 of query aligns to 3:233/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
Q
N
 
H
L
 
L
T
 
A
W
 
K
K
 
S
I
 
Y
G
 
K
R
 
K
K
 
R
T
 
K
I
 
V
L
 
V
D
 
S
G
 
D
V
 
V
S
 
S
M
 
L
E
 
Q
A
 
V
P
 
E
P
 
S
G
 
G
R
 
Q
M
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
L
 
S
L
 
F
R
 
Y
L
 
M
L
 
I
A
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
V
R
 
A
P
 
R
H
 
D
S
 
E
G
 
G
R
 
T
V
 
I
T
 
T
L
 
I
D
 
D
R
 
D
S
 
N
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
I
I
 
L
S
 
P
R
 
M
R
 
H
S
 
S
I
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
M
-
 
G
I
 
I
A
 
G
F
 
Y
V
 
L
E
 
P
Q
 
Q
H
 
E
A
 
A
T
 
S
T
 
I
N
 
F
A
 
R
N
 
K
L
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
V
 
N
V
 
I
K
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
V
F
 
L
P
 
Q
H
 
T
R
 
R
S
 
E
M
 
E
F
 
L
S
 
T
G
 
H
W
x
E
T
 
E
K
 
R
A
 
Q
D
|
D
E
 
K
E
 
-
A
 
-
V
 
L
E
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
E
A
 
F
G
 
H
M
 
I
A
 
Q
E
 
H
K
 
I
R
 
R
D
 
K
E
 
S
R
 
A
W
 
G
Q
 
M
S
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
E
 
F
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
S
Q
 
V
I
 
I
G
 
D
L
 
I
M
 
K
R
 
K
L
 
I
V
 
I
S
 
E
G
 
H
L
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
R
P
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
H
 
E
A
 
T
A
 
L
M
 
D
F
 
V
C
 
C
D
 
E
Q
 
K
L
 
A
I
 
Y
I
 
I
M
 
V
Q
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
N
E
 
N
T
 
E
L
 
Q
L
 
V
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
F
 
Y

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
33% identity, 89% coverage: 2:226/253 of query aligns to 3:230/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
S
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
L
D
 
K
N
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
F
K
 
K
I
x
R
G
 
G
R
 
S
K
 
R
T
 
A
I
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
V
 
I
S
 
D
M
 
V
E
 
R
A
 
I
P
 
P
P
 
R
G
 
G
R
 
K
M
 
V
L
 
T
G
 
G
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
Q
K
 
L
R
 
R
P
 
P
H
 
S
S
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
W
L
 
V
D
 
N
R
 
G
S
 
Q
D
 
N
I
 
L
G
 
P
K
 
Q
I
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
G
S
 
D
I
 
L
A
 
F
-
 
D
-
 
M
-
 
R
R
 
K
R
 
Q
I
 
F
A
 
G
F
 
V
V
 
L
E
 
F
Q
 
Q
H
 
S
A
 
G
T
 
A
T
 
L
N
 
F
A
 
T
N
 
D
L
 
L
K
 
D
V
 
V
L
 
F
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P
H
 
L
R
 
R
S
 
V
M
 
H
F
 
T
S
 
Q
G
 
L
W
 
P
T
 
E
K
 
E
A
 
M
D
 
I
E
 
R
E
 
D
A
 
I
V
 
V
E
 
L
A
 
M
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
R
 
A
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
R
E
 
G
K
 
A
R
 
V
D
 
E
E
 
L
R
 
M
W
 
P
Q
 
D
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
S
 
D
P
 
P
Q
 
Q
E
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
V
H
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
A
Q
 
M
I
 
G
G
 
V
L
 
L
M
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
N
S
 
D
G
 
A
L
 
L
P
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
A
H
 
E
A
 
T
A
 
A
M
 
S
F
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
I
 
Y
I
 
I
M
 
V
Q
 
G
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
G
S
 
H
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
-
E
 
D
V
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
E
T
 
T

6tejB Structure of apo irtab devoid sid in complex with sybody syb_nl5 (see paper)
33% identity, 88% coverage: 2:224/253 of query aligns to 330:553/585 of 6tejB

query
sites
6tejB
S
 
S
I
 
I
K
 
E
A
 
F
D
 
D
N
 
D
L
 
V
T
 
R
W
 
F
K
 
S
I
x
Y
G
 
G
R
 
D
K
x
E
T
 
V
I
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
S
 
S
M
 
F
E
 
T
A
 
L
P
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
N
M
 
T
L
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
|
T
S
 
T
L
 
I
L
|
L
R
 
S
L
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
x
Q
R
 
Q
P
 
P
H
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
G
S
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
T
K
 
T
I
 
L
S
 
D
R
 
P
R
 
E
S
 
A
I
 
R
A
 
R
R
 
A
R
 
A
I
 
V
A
 
S
F
 
V
V
 
V
E
x
F
Q
 
Q
H
 
H
A
 
P
T
 
Y
T
 
L
-
 
F
N
 
D
A
 
G
N
 
T
L
 
L
K
 
R
V
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
H
 
-
R
 
D
S
 
N
M
 
V
F
 
L
S
 
V
G
 
G
W
 
D
T
 
P
K
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
P
E
 
D
A
 
D
V
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
R
R
 
L
A
 
A
G
 
R
M
 
V
A
 
D
E
 
E
K
 
L
R
 
L
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
E
 
E
R
 
G
W
 
G
Q
 
T
S
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
K
S
 
P
P
 
A
Q
 
P
E
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
N
Q
 
A
H
 
N
Q
 
E
I
 
A
G
 
A
L
 
V
M
 
V
R
 
D
L
 
A
V
 
L
S
 
T
G
 
A
-
 
D
-
 
P
L
 
R
P
 
P
I
 
R
T
 
T
S
 
R
I
 
V
V
 
I
A
 
V
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
I
N
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
-
M
 
-
F
 
-
C
 
-
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
I
 
L
I
 
F
M
 
V
Q
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
A
P
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
A

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 87% coverage: 3:222/253 of query aligns to 5:228/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
I
K
 
E
A
 
V
D
 
K
N
 
N
L
 
L
T
 
S
W
 
F
K
 
N
I
 
R
G
 
G
R
 
E
K
 
R
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
V
 
I
S
 
S
M
 
L
E
 
N
A
 
I
P
 
R
P
 
R
G
 
G
R
 
Q
M
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
S
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
K
 
L
R
 
V
P
 
P
H
 
D
S
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
G
S
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
K
 
Q
I
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
S
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
G
F
 
M
V
 
L
E
 
F
Q
 
Q
H
 
S
A
 
G
T
 
A
T
 
L
N
 
F
A
 
T
N
 
D
L
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P
H
 
I
R
 
R
S
 
A
M
 
H
F
 
T
S
 
K
G
 
L
W
 
S
T
 
E
K
 
N
A
 
L
D
 
I
E
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
R
E
 
G
K
 
T
R
 
E
D
 
Q
E
 
L
R
 
M
W
 
P
Q
 
T
S
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
M
K
 
N
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
S
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
L
L
 
I
I
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
V
Q
 
K
I
 
G
G
 
V
L
 
L
M
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
S
 
E
G
 
A
L
 
L
P
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
A
 
L
M
 
S
F
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
I
 
Y
I
 
V
M
 
V
Q
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 87% coverage: 3:222/253 of query aligns to 5:228/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
I
K
 
E
A
 
V
D
 
K
N
 
N
L
 
L
T
 
S
W
 
F
K
 
N
I
x
R
G
 
G
R
 
E
K
x
R
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
V
 
I
S
 
S
M
 
L
E
 
N
A
 
I
P
 
R
P
 
R
G
 
G
R
 
Q
M
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
S
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
K
 
L
R
 
V
P
 
P
H
 
D
S
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
G
S
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
K
 
Q
I
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
S
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
G
F
 
M
V
 
L
E
 
F
Q
 
Q
H
 
S
A
 
G
T
 
A
T
 
L
N
 
F
A
 
T
N
 
D
L
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P
H
 
I
R
 
R
S
 
A
M
 
H
F
 
T
S
 
K
G
 
L
W
 
S
T
 
E
K
 
N
A
 
L
D
 
I
E
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
R
E
 
G
K
 
T
R
 
E
D
 
Q
E
 
L
R
 
M
W
 
P
Q
 
T
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
K
 
N
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
S
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
L
L
 
I
I
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
V
Q
 
K
I
 
G
G
 
V
L
 
L
M
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
S
 
E
G
 
A
L
 
L
P
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
A
 
L
M
 
S
F
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
I
 
Y
I
 
V
M
 
V
Q
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 87% coverage: 3:222/253 of query aligns to 3:226/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
I
K
 
E
A
 
V
D
 
K
N
 
N
L
 
L
T
 
S
W
 
F
K
 
N
I
x
R
G
 
G
R
 
E
K
 
R
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
V
 
I
S
 
S
M
 
L
E
 
N
A
 
I
P
 
R
P
 
R
G
 
G
R
 
Q
M
 
I
L
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
S
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
G
L
 
Q
K
 
L
R
 
V
P
 
P
H
 
D
S
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
T
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
G
S
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
K
 
Q
I
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
S
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
A
R
 
R
I
 
M
A
 
G
F
 
M
V
 
L
E
 
F
Q
|
Q
H
 
S
A
 
G
T
 
A
T
 
L
N
 
F
A
 
T
N
 
D
L
 
M
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P
H
 
I
R
 
R
S
 
A
M
 
H
F
 
T
S
 
K
G
 
L
W
 
S
T
 
E
K
 
N
A
 
L
D
 
I
E
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
V
E
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
L
A
 
E
R
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
R
E
 
G
K
 
T
R
 
E
D
 
Q
E
 
L
R
 
M
W
 
P
Q
 
T
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
K
 
N
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
S
 
D
P
 
P
Q
 
D
E
 
L
L
 
I
I
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
Q
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
V
Q
 
K
I
 
G
G
 
V
L
 
L
M
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
S
 
E
G
 
A
L
 
L
P
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
H
 
E
A
 
T
A
 
L
M
 
S
F
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
I
 
Y
I
 
V
M
 
V
Q
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L

7n5aA Structure of atatm3 in the closed conformation (see paper)
32% identity, 84% coverage: 15:226/253 of query aligns to 365:577/589 of 7n5aA

query
sites
7n5aA
K
 
R
T
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
S
M
 
F
E
 
V
A
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
K
M
 
S
L
 
V
G
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
T
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
L
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
F
G
 
R
L
 
F
K
 
F
R
 
D
P
 
T
H
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
R
L
 
I
D
 
D
R
 
G
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
G
 
K
K
 
E
I
 
V
S
 
R
R
 
L
R
 
D
S
 
S
I
 
L
A
 
R
R
 
S
R
 
S
I
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
V
E
 
P
Q
 
Q
H
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
T
V
 
V
K
 
L
L
 
F
G
 
N
R
 
D
F
 
T
P
 
I
H
 
F
R
 
H
S
 
N
M
 
I
F
 
H
S
 
Y
G
 
G
W
 
R
T
 
L
K
 
S
A
 
A
D
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
G
 
A
M
 
I
A
 
H
E
 
E
K
 
T
R
 
I
D
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
E
 
E
R
 
R
W
 
G
Q
 
L
S
x
K
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
F
A
 
L
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
E
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
Q
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
A
G
 
E
L
 
I
M
 
L
R
 
N
L
 
A
V
 
L
S
 
K
G
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
S
-
 
N
-
 
R
T
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
F
A
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
H
 
-
A
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
Q
C
 
C
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
I
 
V
M
 
L
Q
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
P
P
 
H
E
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
K
T
 
S

Sites not aligning to the query:

7n59A Structure of atatm3 in the inward-facing conformation with gssg bound (see paper)
32% identity, 84% coverage: 15:226/253 of query aligns to 366:578/590 of 7n59A

query
sites
7n59A
K
 
R
T
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
S
M
 
F
E
 
V
A
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
K
M
 
S
L
 
V
G
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
T
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
L
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
F
G
 
R
L
 
F
K
 
F
R
 
D
P
 
T
H
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
R
L
 
I
D
 
D
R
 
G
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
G
 
K
K
 
E
I
 
V
S
 
R
R
 
L
R
 
D
S
 
S
I
 
L
A
 
R
R
 
S
R
 
S
I
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
V
E
 
P
Q
 
Q
H
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
T
V
 
V
K
 
L
L
 
F
G
 
N
R
 
D
F
 
T
P
 
I
H
 
F
R
 
H
S
 
N
M
 
I
F
 
H
S
 
Y
G
 
G
W
 
R
T
 
L
K
 
S
A
 
A
D
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
G
 
A
M
 
I
A
 
H
E
 
E
K
 
T
R
 
I
D
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
E
 
E
R
 
R
W
 
G
Q
 
L
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
F
A
 
L
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
E
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
Q
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
A
G
 
E
L
 
I
M
 
L
R
 
N
L
 
A
V
 
L
S
 
K
G
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
S
-
 
N
-
 
R
T
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
F
A
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
H
 
-
A
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
Q
C
 
C
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
I
 
V
M
 
L
Q
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
P
P
 
H
E
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
K
T
 
S

Sites not aligning to the query:

Q9LVM1 ABC transporter B family member 25, mitochondrial; ABC transporter ABCB.25; AtABCB25; ABC transporter of the mitochondrion 3; AtATM3; Iron-sulfur clusters transporter ATM3; Protein STARIK 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 84% coverage: 15:226/253 of query aligns to 492:704/728 of Q9LVM1

query
sites
Q9LVM1
K
 
R
T
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
S
M
 
F
E
 
V
A
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
K
M
 
S
L
 
V
G
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
T
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
L
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
F
G
 
R
L
 
F
K
 
F
R
 
D
P
 
T
H
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
R
L
 
I
D
 
D
R
 
G
S
 
Q
D
 
D
I
 
I
G
 
K
K
 
E
I
 
V
S
 
R
R
 
L
R
 
D
S
 
S
I
 
L
A
 
R
R
 
S
R
 
S
I
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
V
E
 
P
Q
 
Q
H
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
D
V
 
T
V
 
V
K
 
L
L
 
F
G
 
N
R
 
D
F
 
T
P
 
I
H
 
F
R
 
H
S
 
N
M
 
I
F
 
H
S
 
Y
G
 
G
W
 
R
T
 
L
K
 
S
A
 
A
D
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
Y
A
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
G
 
A
M
 
I
A
 
H
E
 
E
K
 
T
R
 
I
D
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
P
-
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
E
 
E
R
|
R
W
 
G
Q
 
L
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
F
A
 
L
Q
 
K
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
E
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
S
Q
 
T
H
 
T
Q
 
E
I
 
A
G
 
E
L
 
I
M
 
L
R
 
N
L
 
A
V
 
L
S
 
K
G
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
S
-
 
N
-
 
R
T
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
F
A
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
T
H
 
-
A
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
Q
C
 
C
D
 
D
Q
 
E
L
 
I
I
 
V
I
 
V
M
 
L
Q
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
P
P
 
H
E
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
K
T
 
S

O65934 ABC transporter ATP-binding/permease protein Rv1747; EC 7.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
32% identity, 91% coverage: 7:236/253 of query aligns to 323:557/865 of O65934

query
sites
O65934
N
 
G
L
 
V
T
 
T
W
 
W
K
 
T
I
 
I
-
 
D
G
 
G
R
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
S
M
 
L
E
 
T
A
 
A
P
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
M
M
 
L
L
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
K
 
T
R
 
H
P
 
P
H
 
T
S
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
F
D
 
E
R
 
G
S
 
H
D
 
N
I
 
V
G
 
-
K
 
H
I
 
A
S
 
E
R
 
Y
R
 
A
S
 
S
I
 
L
A
 
R
R
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
G
F
 
M
V
 
V
E
 
P
Q
 
Q
H
 
D
A
 
D
T
 
V
T
 
V
N
 
H
A
 
G
N
 
Q
L
 
L
K
 
T
V
 
V
L
 
K
D
 
H
V
 
A
V
 
L
K
 
M
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
L
R
 
R
F
 
L
P
 
P
H
 
P
R
 
D
S
 
T
M
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
W
 
-
T
 
T
K
 
K
A
 
D
D
 
D
E
 
R
E
 
T
A
 
Q
V
 
V
E
 
V
A
 
A
-
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
E
R
 
E
A
 
L
G
 
E
M
 
M
A
 
S
E
 
K
K
 
H
R
 
I
D
 
D
E
 
T
R
 
R
W
 
V
Q
 
D
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
K
R
 
R
T
 
A
H
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
L
Q
 
T
S
 
G
P
 
P
Q
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
H
 
G
L
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
A
I
 
L
Q
 
D
H
 
R
Q
 
Q
I
 
V
-
 
M
G
 
T
L
 
M
M
 
L
R
 
R
L
 
Q
V
 
L
S
 
A
G
 
D
L
 
A
P
 
G
I
 
R
T
 
V
S
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
S
L
 
L
N
 
T
H
 
Y
A
 
L
A
 
D
M
 
V
F
 
-
C
 
C
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
I
 
L
I
 
L
M
 
L
Q
 
A
Q
 
P
-
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
T
V
 
A
A
 
F
S
 
C
G
 
G
A
 
P
P
 
P
E
 
T
E
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
P
V
 
V
L
 
M
S
 
G
E
 
T
T
 
T
L
 
N
L
 
W
R
 
A
E
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
S
V
 
T
E
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 95% coverage: 3:243/253 of query aligns to 2:262/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
I
K
 
K
A
 
L
D
 
S
N
 
N
L
 
I
T
 
T
-
 
K
-
 
V
W
 
F
K
 
H
I
 
Q
G
 
G
R
 
T
K
 
R
T
 
T
I
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
N
V
 
V
S
 
S
M
 
L
E
 
H
A
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
I
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
G
 
L
L
 
L
K
 
E
R
 
R
P
 
P
H
 
T
S
 
E
G
 
G
R
 
S
V
 
V
T
 
L
L
 
V
D
 
D
R
 
G
S
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
K
 
T
I
 
L
S
 
S
R
 
E
R
 
S
S
 
E
I
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
G
F
 
M
V
 
I
E
 
F
Q
 
Q
H
 
H
A
 
F
T
 
N
T
 
L
N
 
L
A
 
S
N
 
S
L
 
R
K
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
L
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
H
 
-
R
 
-
S
 
P
M
 
L
F
 
E
S
 
L
G
 
D
W
 
N
T
 
T
K
 
P
A
 
K
D
 
D
E
 
E
-
 
V
-
 
K
E
 
R
A
 
R
V
 
V
E
 
T
A
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
L
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
K
R
 
H
D
 
D
E
 
S
R
 
Y
W
 
P
Q
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
S
 
N
P
 
P
Q
 
K
E
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
Q
 
A
H
 
T
Q
 
T
I
 
R
G
 
S
L
 
I
M
 
L
R
 
E
L
 
L
V
 
L
S
 
K
G
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
R
L
 
L
P
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
I
I
 
L
V
 
L
A
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
D
H
 
V
A
 
V
A
 
K
M
 
R
F
 
I
C
 
C
D
 
D
Q
 
C
L
 
V
I
 
A
I
 
V
M
 
I
Q
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
L
V
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
A
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
F
S
 
S
-
 
H
-
 
P
E
 
K
T
 
T
L
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
Q
V
 
K
F
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
S
 
D
V
 
Y
E
 
Q
A
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
S
 
E
P
 
P
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 83% coverage: 15:225/253 of query aligns to 30:238/378 of P69874

query
sites
P69874
K
 
K
T
 
E
I
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
V
 
L
S
 
D
M
 
L
E
 
T
A
 
I
P
 
N
P
 
N
G
 
G
R
 
E
M
x
F
L
 
L
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
E
R
 
T
P
 
V
H
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
M
L
|
L
D
 
D
R
 
N
S
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
T
K
 
H
I
 
V
S
 
P
R
 
A
R
 
E
S
 
N
I
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
Y
I
 
V
A
 
N
F
 
T
V
 
V
E
 
F
Q
 
Q
H
 
S
A
 
Y
T
 
A
T
 
L
N
 
F
A
 
P
N
 
H
L
 
M
K
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
V
 
N
V
 
V
K
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
L
F
 
R
P
 
M
H
 
Q
R
 
K
S
 
T
M
 
P
F
 
A
S
 
A
G
 
E
W
 
I
T
 
T
K
 
P
A
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
R
V
 
V
E
 
M
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
M
A
x
V
G
 
Q
M
 
L
A
 
E
E
 
T
K
 
F
R
 
A
D
 
Q
E
 
R
R
 
K
W
 
P
Q
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
T
 
V
H
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
N
S
 
K
P
 
P
Q
 
R
E
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
Y
-
 
K
-
 
L
-
 
R
-
 
K
Q
 
Q
H
 
M
Q
 
Q
I
 
N
G
 
E
L
 
L
M
 
K
R
 
A
L
 
L
V
 
Q
S
 
R
G
 
K
L
 
L
P
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
F
I
 
V
V
 
F
A
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
N
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
L
M
 
T
F
 
M
C
 
S
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
I
 
V
M
 
M
Q
 
R
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
E
A
 
Q
S
 
D
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
S
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
34% identity, 85% coverage: 8:223/253 of query aligns to 366:587/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
L
 
L
T
 
R
W
 
R
K
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
E
K
 
V
T
 
R
I
 
A
L
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
I
S
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
L
P
 
R
P
 
Q
G
 
G
R
 
R
M
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
S
 
T
L
 
T
L
 
L
R
 
H
L
 
E
L
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
L
K
 
A
R
 
A
P
 
P
H
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
S
V
 
I
T
 
E
L
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
R
 
V
S
 
A
D
 
T
I
 
L
G
 
G
K
 
T
I
 
A
S
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
S
I
 
L
A
 
R
R
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
Q
F
 
V
V
 
V
E
 
F
Q
 
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
A
 
A
T
 
S
T
 
L
N
 
D
A
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
P
V
 
V
L
 
F
D
 
D
V
 
L
V
 
I
K
 
A
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
H
 
E
R
 
P
S
 
L
M
 
Q
F
 
A
S
 
N
G
 
G
W
 
F
T
 
G
K
 
K
A
 
N
D
 
E
E
 
T
E
 
H
A
 
A
-
 
R
V
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
I
A
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
R
E
 
H
K
 
G
R
 
D
D
 
A
E
 
S
R
 
R
W
 
Y
Q
 
P
S
 
A
-
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
T
 
I
H
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
S
 
Q
P
 
P
Q
 
K
E
 
I
L
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
V
N
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
V
Q
 
S
H
 
I
Q
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
I
M
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
Q
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
I
 
L
T
 
S
S
 
Y
I
 
L
V
 
F
A
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
S
H
 
V
A
 
V
A
 
K
M
 
H
F
 
L
C
 
A
D
 
H
Q
 
Q
L
 
V
I
 
A
I
 
V
M
 
M
Q
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
D
P
 
S
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
F

Sites not aligning to the query:

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 91% coverage: 2:232/253 of query aligns to 2:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
S
 
T
I
 
L
K
 
T
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
T
 
A
W
 
K
K
 
A
I
x
Y
G
 
K
R
 
G
K
x
R
T
 
R
I
x
V
L
 
V
D
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
M
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
N
P
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
S
x
T
L
 
T
L
 
F
R
 
Y
L
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
V
R
 
P
P
 
R
H
 
D
S
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
I
L
 
I
D
 
D
R
 
D
S
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
L
I
 
L
S
 
P
R
 
L
R
 
H
S
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
G
I
 
I
A
 
G
F
 
Y
V
 
L
E
 
P
Q
 
Q
H
 
E
A
 
A
T
 
S
T
 
I
N
x
F
A
x
R
N
x
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
V
 
N
V
 
L
K
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
V
F
 
L
P
 
Q
H
 
I
R
 
R
S
 
D
M
 
D
F
 
L
S
 
S
G
 
A
W
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
-
D
 
-
E
 
E
E
 
D
A
 
R
V
 
A
E
 
N
A
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
E
R
 
E
A
 
F
G
 
H
M
 
I
A
 
E
E
 
H
K
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
S
R
 
M
W
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
T
 
V
H
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
S
 
N
P
 
P
Q
 
K
E
 
F
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
A
H
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
P
Q
 
I
H
 
S
Q
 
V
I
 
I
G
 
D
L
 
I
M
 
K
R
 
R
L
 
I
V
 
I
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
G
I
 
V
T
 
-
S
 
-
I
 
L
V
 
I
A
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
H
 
E
A
 
T
A
 
L
M
 
A
F
 
V
C
 
C
D
 
E
Q
 
R
L
 
A
I
 
Y
I
 
I
M
 
V
Q
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
T
 
E
L
 
H
L
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
V
F
 
Y

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
30% identity, 91% coverage: 2:232/253 of query aligns to 2:233/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
S
 
T
I
 
L
K
 
T
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
T
 
A
W
 
K
K
 
A
I
 
Y
G
 
K
R
 
G
K
 
R
T
 
R
I
 
V
L
 
V
D
 
E
G
 
D
V
 
V
S
 
S
M
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
N
P
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
T
L
 
T
L
 
F
R
 
Y
L
 
M
L
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
V
R
 
P
P
 
R
H
 
D
S
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
I
L
 
I
D
 
D
R
 
D
S
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
S
K
 
L
I
 
L
S
 
P
R
 
L
R
 
H
S
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
R
 
R
-
 
G
I
 
I
A
 
G
F
 
Y
V
 
L
E
 
P
Q
 
Q
H
 
E
A
 
A
T
 
S
T
 
I
N
 
F
A
x
R
N
 
R
L
 
L
K
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
V
 
N
V
 
L
K
 
-
L
 
M
G
 
A
R
 
V
F
 
L
P
 
Q
H
 
I
R
 
R
S
 
D
M
 
D
F
 
L
S
 
S
G
 
A
W
 
E
T
 
Q
K
 
R
A
 
-
D
 
-
E
 
E
E
 
D
A
 
R
V
 
A
E
 
N
A
 
E
A
 
L
L
 
M
A
 
E
R
 
E
A
 
F
G
 
H
M
 
I
A
 
E
E
 
H
K
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
S
R
x
M
W
x
G
Q
|
Q
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E