SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011444561.1 NCBI__GCF_000013325.1:WP_011444561.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
46% identity, 68% coverage: 6:167/240 of query aligns to 81:241/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
I
 
V
A
 
A
Y
 
D
L
 
L
D
 
R
S
 
A
I
 
A
R
 
R
S
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
P
 
C
R
 
V
S
 
S
R
 
Y
W
 
S
E
 
H
I
 
C
L
 
L
L
 
L
-
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
L
A
 
A
V
 
C
G
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
L
L
 
L
F
 
W
E
 
R
A
 
Q
E
 
S
L
 
R
Y
 
R
F
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
A
I
 
L
N
 
H
H
 
S
F
 
R
S
 
I
R
 
A
F
 
N
L
 
V
T
 
F
A
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
G
L
 
I
F
 
L
I
 
F
E
 
D
H
 
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
C
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
G
G
 
G
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
G
D
 
D
E
 
G
A
 
V
I
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
R
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
N
K
 
P
A
 
A
R
 
R

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
42% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 81:238/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
P
 
V
R
 
D
S
 
K
R
 
Y
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
K
E
 
G
L
 
R
Y
 
R
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
V
R
 
S
F
 
V
L
 
S
T
 
F
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
R
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
T
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
H
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
42% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 84:241/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
P
 
V
R
 
D
S
 
K
R
 
Y
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
K
E
 
G
L
 
R
Y
 
R
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
V
R
 
S
F
 
V
L
 
S
T
 
F
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
R
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
|
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
N
 
G
P
 
K
T
 
T
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
G
A
 
A
R
x
K
V
x
I
G
|
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
L
D
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
H
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
x
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
42% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 85:242/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
R
D
 
D
P
|
P
A
 
A
P
 
V
R
 
D
S
 
K
R
 
Y
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
K
E
 
G
L
 
R
Y
 
R
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
V
R
 
S
F
 
V
L
 
S
T
 
F
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
R
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
 
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
|
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
T
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
|
G
S
x
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
H
A
 
T
T
|
T
M
 
A
I
x
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
44% identity, 61% coverage: 16:161/240 of query aligns to 116:268/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
D
 
D
P
 
P
A
 
A
-
 
A
P
 
P
R
 
G
S
 
L
R
 
S
W
 
L
E
 
I
I
 
I
L
 
R
L
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
W
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
I
F
 
V
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
E
A
 
C
E
 
G
L
 
E
Y
 
R
F
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
A
 
E
I
 
M
N
 
M
H
 
E
F
 
S
S
 
V
R
 
H
F
 
S
L
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
K
K
 
G
H
 
H
L
 
F
F
 
F
I
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
G
F
 
V
-
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
W
V
 
C
T
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
x
A
T
 
M
N
x
H
-
 
F
-
 
Q
P
 
E
T
 
E
N
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
I
G
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
T
K
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
V
C
 
G
D
 
D
E
 
Y
A
 
V
I
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
S
R
 
H
A
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
T
 
D
D
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
E
 
S
G
 
N
A
 
Q
T
 
T
M
 
V

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
44% identity, 61% coverage: 16:161/240 of query aligns to 114:266/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
D
 
D
P
 
P
A
 
A
-
 
A
P
 
P
R
 
G
S
 
L
R
 
S
W
 
L
E
 
I
I
 
I
L
 
R
L
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
W
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
I
F
 
V
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
A
H
 
H
W
 
V
L
 
L
F
 
Y
E
 
E
A
 
C
E
 
G
L
 
E
Y
 
R
F
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
A
 
E
I
 
M
N
 
M
H
 
E
F
 
S
S
 
V
R
 
H
F
 
S
L
 
Y
T
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
S
I
 
I
G
 
K
K
 
G
H
 
H
L
 
F
F
 
F
I
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
G
F
 
V
-
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
W
V
 
C
T
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
M
N
x
H
-
 
F
-
 
Q
P
 
E
T
 
E
N
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
I
G
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
T
K
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
V
C
 
G
D
 
D
E
 
Y
A
 
V
I
 
T
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
S
R
 
H
A
 
V
R
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
T
 
D
D
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
E
 
S
G
 
N
A
 
Q
T
 
T
M
 
V

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
39% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 85:242/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
Y
S
 
D
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
P
 
Y
R
 
S
S
 
R
R
 
F
W
 
M
E
 
D
I
 
P
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
F
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
L
A
 
A
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
Y
E
 
K
A
 
Q
E
 
G
L
 
R
Y
 
K
F
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Y
A
 
Y
I
 
L
N
 
Q
H
 
S
F
 
R
S
 
S
R
 
S
F
 
S
L
 
I
T
 
F
A
 
Q
I
 
T
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
S
H
 
G
L
 
L
F
 
F
I
 
L
E
 
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
C
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
S
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
Q
E
 
G
A
 
V
I
 
L
I
 
I
G
|
G
S
x
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
Q
R
 
C
A
 
S
R
 
K
V
 
I
G
x
A
A
|
A
N
 
G
A
x
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
K
D
 
S
V
 
V
P
 
P
E
 
H
G
 
N
A
 
V
T
|
T
M
 
V
I
x
A
G
|
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
42% identity, 59% coverage: 16:157/240 of query aligns to 114:254/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
D
|
D
P
|
P
A
 
A
P
 
A
R
 
S
S
 
S
R
 
L
W
 
A
E
 
M
I
 
I
L
 
I
L
 
R
-
 
S
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
I
W
 
H
A
 
V
V
 
M
G
 
M
F
 
I
H
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
I
L
 
L
F
 
Y
E
 
M
A
 
N
E
 
G
L
 
D
Y
 
I
F
 
E
L
 
Y
A
 
S
R
 
R
A
 
E
I
 
L
N
 
M
H
 
E
F
 
N
S
 
I
R
 
H
F
 
S
L
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
T
K
 
S
I
 
I
G
 
G
K
 
N
H
 
H
L
 
F
F
 
F
I
 
I
E
x
D
H
|
H
G
 
G
F
 
V
-
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
W
V
 
C
T
 
R
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
x
A
T
 
M
N
 
S
P
 
F
T
 
K
N
 
G
G
 
N
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
I
C
 
G
D
 
D
E
 
F
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
S
R
 
N
A
 
V
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
T
 
T
D
 
Q
D
 
N
V
 
I
P
 
D
E
 
Q

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
41% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 81:238/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
H
R
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
P
 
V
R
 
E
S
 
L
R
 
W
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
F
 
S
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
T
H
 
H
W
 
Y
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
Q
E
 
N
L
 
R
Y
 
K
F
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
Y
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
I
R
 
S
F
 
V
L
 
A
T
 
F
A
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
H
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
F
E
x
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
E
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
V
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
Y
A
 
A
T
 
T
M
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
40% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 85:242/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
P
 
V
R
 
D
S
 
K
R
 
Y
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
Q
E
 
G
L
 
R
Y
 
R
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
V
R
 
S
F
 
V
L
 
T
T
 
F
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
R
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
 
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
S
N
 
G
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
H
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
44% identity, 68% coverage: 6:167/240 of query aligns to 77:231/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
I
 
V
A
 
A
Y
 
D
L
 
L
D
 
R
S
 
A
I
 
A
R
 
R
S
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
S
P
 
Y
R
 
S
S
 
H
R
 
-
W
 
-
E
 
C
I
 
L
L
 
L
L
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
L
A
 
A
V
 
C
G
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
W
 
L
L
 
L
F
 
W
E
 
R
A
 
Q
E
 
S
L
 
R
Y
 
R
F
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
A
I
 
L
N
 
H
H
 
S
F
 
R
S
 
I
R
 
A
F
 
N
L
 
V
T
 
F
A
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
H
 
G
L
 
I
F
 
L
I
 
F
E
 
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
C
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
G
K
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
G
D
 
D
E
 
G
A
 
V
I
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
G
A
 
A
R
x
K
V
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
L
D
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
R
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
x
V
G
 
G
L
 
N
K
 
P
A
 
A
R
 
R

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
41% identity, 65% coverage: 11:167/240 of query aligns to 90:245/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
L
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
P
 
V
R
 
D
S
 
K
R
 
Y
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
A
A
 
Q
E
 
D
L
 
R
Y
 
K
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
A
 
Y
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
V
R
 
S
F
 
V
L
 
A
T
 
F
A
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
C
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
 
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
N
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
T
N
 
S
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
R
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
Q
D
 
S
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
H
A
 
T
T
 
T
M
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
38% identity, 67% coverage: 7:167/240 of query aligns to 84:243/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
A
 
A
Y
 
D
L
 
L
D
 
K
S
 
A
I
 
I
R
 
Y
S
 
E
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
-
 
C
P
 
D
R
 
E
S
 
Y
R
 
S
W
 
L
E
 
P
I
 
L
L
 
L
L
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
N
H
 
H
W
 
R
L
 
L
F
 
Y
E
 
L
A
 
D
E
 
G
L
 
R
Y
 
K
F
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
R
S
 
M
R
 
S
F
 
E
L
 
V
T
 
F
A
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
G
L
 
L
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
|
H
-
 
A
-
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
-
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
C
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
S
N
 
G
P
 
K
T
 
E
N
 
G
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
G
D
 
D
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
N
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
S
R
 
N
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
D
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
S
A
 
I
T
 
T
M
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
K

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
38% identity, 67% coverage: 7:167/240 of query aligns to 82:241/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
A
 
A
Y
 
D
L
 
L
D
 
K
S
 
A
I
 
I
R
 
Y
S
 
E
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
-
 
C
P
 
D
R
 
E
S
 
Y
R
 
S
W
 
L
E
 
P
I
 
L
L
 
L
L
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
N
H
 
H
W
 
R
L
 
L
F
 
Y
E
 
L
A
 
D
E
 
G
L
 
R
Y
 
K
F
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
A
 
F
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
R
S
 
M
R
 
S
F
 
E
L
 
V
T
 
F
A
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
G
L
 
L
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
|
H
-
 
A
-
 
T
G
 
G
F
 
F
T
 
-
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
C
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
S
N
 
G
P
 
K
T
 
E
N
 
G
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
G
D
 
D
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
N
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
S
R
 
N
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
D
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
S
A
 
I
T
 
T
M
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
K

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
40% identity, 66% coverage: 9:167/240 of query aligns to 81:231/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
L
 
I
D
 
Q
S
 
A
I
 
V
R
 
R
S
 
H
R
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
P
 
V
R
 
E
S
 
L
R
 
W
W
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
F
W
 
H
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
F
 
S
H
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
T
H
 
H
W
 
Y
L
 
L
F
 
W
E
 
N
A
 
Q
E
 
N
L
 
R
Y
 
K
F
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
Y
I
 
L
N
 
Q
H
 
N
F
 
Q
S
 
I
R
 
S
F
 
V
L
 
A
T
 
F
A
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
H
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
F
E
 
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
Q
C
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
N
 
-
P
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
R
 
-
H
 
H
P
 
P
T
 
K
L
 
V
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
x
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
|
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
Y
A
 
A
R
x
K
V
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
|
V
V
 
V
T
x
L
D
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
Y
A
 
A
T
|
T
M
 
A
I
x
A
G
 
G
L
x
V
K
x
P
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
41% identity, 64% coverage: 14:167/240 of query aligns to 86:238/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
S
 
N
R
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
P
 
V
R
 
S
S
 
M
R
 
Y
W
 
S
E
 
M
I
 
P
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
-
 
L
P
 
K
G
 
G
L
 
Y
W
 
H
A
 
A
V
 
L
G
 
Q
F
 
G
H
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
N
W
 
W
L
 
L
F
 
W
E
 
R
A
 
Q
E
 
G
L
 
R
Y
 
K
F
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
A
x
Y
I
 
F
N
 
Q
H
 
N
F
x
Q
S
 
I
R
 
S
F
 
V
L
 
A
T
 
C
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
H
 
G
L
 
I
F
 
M
I
 
L
E
x
D
H
|
H
G
 
A
F
 
T
-
 
G
T
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
C
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
 
T
N
 
G
P
 
K
T
 
E
N
 
C
G
 
G
I
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
T
 
K
L
 
I
C
 
R
D
 
E
E
 
G
A
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
E
R
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
S
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
H
A
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

G3XD01 UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-D-glucuronate N-acetyltransferase; UDP-D-GlcNAc3NA N-acetyltransferase; UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-alpha-D-glucuronic acid 3-N-acetyltransferase; EC 2.3.1.201 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
29% identity, 52% coverage: 57:180/240 of query aligns to 25:158/191 of G3XD01

query
sites
G3XD01
H
 
H
F
 
F
S
 
V
R
 
H
F
 
I
L
 
C
T
 
A
A
 
G
I
 
A
D
 
R
I
 
I
H
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
S
I
 
L
G
 
G
K
 
Q
H
 
N
L
 
V
F
 
F
I
 
V
E
 
G
H
 
N
G
 
K
F
 
-
T
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
D
T
 
R
A
 
C
E
 
K
I
 
I
G
 
Q
D
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
D
C
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
 
T
G
 
N
G
 
V
T
 
Y
N
 
N
P
 
P
T
 
R
N
 
S
G
 
L
I
 
I
P
 
E
G
 
R
K
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
R
 
R
H
 
N
P
 
T
T
 
L
L
 
V
C
 
K
D
 
K
E
 
G
A
 
A
I
 
T
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
N
A
 
C
Q
 
T
I
 
I
L
 
V
G
 
C
P
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
E
R
 
Y
A
 
A
R
 
F
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
N
D
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
S
G
 
Y
A
 
A
T
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
T
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
G
W
 
W
L
 
M
K
 
S
Q
 
E
F
 
F

4aawA S.Pneumoniae glmu in complex with an antibacterial inhibitor (see paper)
31% identity, 40% coverage: 67:163/240 of query aligns to 327:434/455 of 4aawA

query
sites
4aawA
I
 
I
H
 
R
P
 
P
G
 
N
A
 
S
K
 
S
I
 
L
G
 
G
K
 
A
H
 
Q
L
 
V
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
 
N
F
 
F
I
 
V
E
 
E
H
 
V
G
 
K
F
 
G
T
 
S
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
N
A
 
T
E
 
K
I
 
A
G
 
G
D
 
H
N
 
L
V
 
T
T
 
Y
I
 
I
Y
 
G
Q
 
N
C
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
N
V
 
V
T
 
N
L
 
F
G
 
G
G
 
A
T
 
G
N
 
T
P
 
I
T
 
T
N
x
V
G
 
N
I
x
Y
P
x
D
G
 
G
K
 
K
-
 
N
R
 
K
H
 
Y
P
 
K
T
 
T
L
 
V
C
 
I
-
 
G
D
 
D
E
 
N
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
N
A
 
S
Q
 
T
I
 
I
L
x
I
G
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
D
A
 
A
T
 
I
M
 
A
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1hm9A Crystal structure of s.Pneumoniae n-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase, glmu, bound to acetyl coenzyme a and udp-n- acetylglucosamine (see paper)
31% identity, 40% coverage: 67:163/240 of query aligns to 330:437/458 of 1hm9A

query
sites
1hm9A
I
 
I
H
 
R
P
 
P
G
 
N
A
 
S
K
 
S
I
 
L
G
 
G
K
 
A
H
 
Q
L
 
V
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
 
N
F
 
F
I
 
V
E
 
E
H
 
V
G
 
K
F
 
G
T
 
S
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
N
A
 
T
E
 
K
I
 
A
G
 
G
D
 
H
N
 
L
V
 
T
T
x
Y
I
 
I
Y
 
G
Q
 
N
C
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
N
V
 
V
T
 
N
L
 
F
G
 
G
G
 
A
T
 
G
N
 
T
P
 
I
T
 
T
N
x
V
G
x
N
I
x
Y
P
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
N
R
 
K
H
 
Y
P
 
K
T
 
T
L
 
V
C
 
I
-
 
G
D
|
D
E
 
N
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
N
A
 
S
Q
 
T
I
 
I
L
 
I
G
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
E
V
 
L
G
 
G
A
x
D
R
 
N
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
D
A
 
A
T
 
I
M
 
A
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1hm8A Crystal structure of s.Pneumoniae n-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase, glmu, bound to acetyl coenzyme a (see paper)
31% identity, 40% coverage: 67:163/240 of query aligns to 330:437/458 of 1hm8A

query
sites
1hm8A
I
 
I
H
 
R
P
 
P
G
 
N
A
 
S
K
 
S
I
 
L
G
 
G
K
 
A
H
 
Q
L
 
V
-
 
H
-
 
I
-
 
G
-
 
N
F
 
F
I
 
V
E
 
E
H
 
V
G
 
K
F
 
G
T
 
S
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
N
A
 
T
E
 
K
I
 
A
G
 
G
D
 
H
N
 
L
V
 
T
T
 
Y
I
 
I
Y
 
G
Q
 
N
C
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
N
V
 
V
T
 
N
L
 
F
G
 
G
G
 
A
T
 
G
N
 
T
P
 
I
T
 
T
N
x
V
G
 
N
I
x
Y
P
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
N
R
 
K
H
 
Y
P
 
K
T
 
T
L
 
V
C
 
I
-
 
G
D
 
D
E
 
N
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
N
A
 
S
Q
 
T
I
 
I
L
 
I
G
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
D
R
 
N
A
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
D
A
 
A
T
 
I
M
 
A
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011444561.1 NCBI__GCF_000013325.1:WP_011444561.1
MFNGLIAYLDSIRSRDPAPRSRWEILLYPGLWAVGFHRVAHWLFEAELYFLARAINHFSR
FLTAIDIHPGAKIGKHLFIEHGFTVIGETAEIGDNVTIYQCVTLGGTNPTNGIPGKRHPT
LCDEAIIGSGAQILGPITVGARARVGANAVVTDDVPEGATMIGLKARSTLVPAETWLKQF
IPYGTPCKEPCEPNGGTRVDDLEAEVAALKAQVAALMAARDGGDDLTPAPTPSRARRTRS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory