SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011501998.1 NCBI__GCF_900110435.1:WP_011501998.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 94% coverage: 12:246/249 of query aligns to 12:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
I
 
E
T
x
F
K
 
K
V
 
A
I
 
L
Q
 
D
N
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
I
 
V
A
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
V
H
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Y
 
F
M
 
L
R
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
L
 
Y
L
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
E
P
 
P
F
 
A
Q
 
E
I
 
L
N
 
Y
R
 
H
R
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
T
 
P
N
 
Q
V
 
P
F
 
L
T
 
K
N
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
W
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
C
 
I
A
 
G
V
 
E
L
 
I
W
 
C
A
 
P
-
 
G
-
 
E
T
 
S
G
 
P
H
 
L
R
 
N
Y
 
S
A
 
L
F
 
F
W
 
Y
K
 
K
N
 
K
-
 
W
V
 
I
D
 
P
K
 
K
L
 
E
P
 
E
E
 
E
V
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
K
T
 
A
A
 
F
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
E
D
 
F
I
 
L
H
 
K
L
 
L
T
 
S
S
 
H
R
 
L
R
 
Y
D
 
D
M
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
M
G
 
T
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
A
H
 
P
A
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
I
V
 
F
A
 
N
L
 
H
I
 
V
R
 
L
R
 
E
L
 
L
-
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
I
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
L
 
M
V
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
R
 
L
G
 
S
N
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 94% coverage: 12:245/249 of query aligns to 12:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
I
 
E
T
x
F
K
 
K
V
 
A
I
 
L
Q
 
D
N
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
I
 
V
A
 
C
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
V
H
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Y
 
F
M
 
L
R
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
L
 
Y
L
 
F
R
 
E
G
 
N
E
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
E
P
 
P
F
 
A
Q
 
E
I
 
L
N
 
Y
R
 
H
R
 
Y
G
 
G
L
 
I
S
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
V
 
T
T
 
P
N
 
Q
V
 
P
F
 
L
T
 
K
N
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
W
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
L
C
 
I
A
 
G
V
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
P
W
 
G
A
 
E
T
 
S
G
 
P
H
 
L
R
 
N
Y
 
S
A
 
L
F
 
F
W
 
Y
K
 
K
N
 
K
-
 
W
V
 
I
D
 
P
K
 
K
L
 
E
P
 
E
E
 
E
V
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
K
T
 
A
A
 
F
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
E
D
 
F
I
 
L
H
 
K
L
 
L
T
 
S
S
 
H
R
 
L
R
 
Y
D
 
D
M
 
R
P
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
E
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
M
G
 
T
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
A
H
 
P
A
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
R
 
D
A
 
I
V
 
F
A
 
N
L
 
H
I
 
V
R
 
L
R
 
E
L
 
L
-
 
K
T
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
I
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
L
 
M
V
 
F
Y
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
R
 
L
G
 
S
N
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
31% identity, 95% coverage: 12:247/249 of query aligns to 10:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
K
 
K
S
 
S
F
 
Y
G
 
K
I
 
K
T
 
R
K
 
K
V
 
V
I
 
V
Q
 
S
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
Q
I
 
V
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
Y
 
L
M
 
V
R
 
A
P
 
R
T
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
T
I
 
I
L
 
T
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
N
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
I
L
 
L
R
 
P
P
 
M
F
 
H
Q
 
S
I
 
R
N
 
S
R
 
R
R
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
R
N
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
-
T
 
T
G
 
R
H
 
E
R
 
E
Y
 
L
A
 
T
F
 
H
W
x
E
K
 
E
N
 
R
V
 
Q
D
|
D
K
 
K
L
 
L
P
 
E
E
 
D
V
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
Q
 
-
I
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
Q
S
 
H
R
 
I
R
 
R
D
 
K
M
 
S
P
 
A
A
 
G
G
 
M
L
 
A
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
Q
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
S
T
 
V
E
 
I
R
 
D
A
 
I
V
 
K
A
 
K
L
 
I
I
 
I
R
 
E
R
 
H
L
 
L
T
 
R
E
 
D
-
 
R
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
V
R
 
L
G
 
N
N
 
N
P
 
E
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
Q

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 6:237/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
 
Y
G
 
K
I
 
G
T
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
x
R
N
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
x
M
A
x
G
G
x
Q
L
 
S
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
D
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
D

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:247/249 of query aligns to 6:237/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
x
R
K
 
R
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
R
N
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
x
S
L
 
L
T
x
S
Y
 
G
A
 
G
E
|
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
D
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
D

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
32% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 1:238/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
S
 
S
N
 
A
A
 
T
I
 
L
E
 
T
L
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
x
R
K
 
R
V
|
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
R
N
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
 
S
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
S
 
S
H
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
E
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
I
A
 
E
L
 
H
I
 
L
R
 
R
R
 
-
L
 
-
T
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
D

Q8R420 Phospholipid-transporting ATPase ABCA3; ATP-binding cassette sub-family A member 3; Xenobiotic-transporting ATPase ABCA3; EC 7.6.2.1; EC 7.6.2.2 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
34% identity, 84% coverage: 20:229/249 of query aligns to 549:746/1704 of Q8R420

query
sites
Q8R420
I
 
I
Q
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
T
L
 
L
S
 
N
I
 
L
A
 
Y
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
H
 
T
A
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
T
F
 
M
N
 
S
L
 
L
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Y
 
L
M
 
F
R
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
H
I
 
A
L
 
Y
L
 
I
R
 
H
G
 
G
E
 
Y
E
 
E
I
 
I
S
 
S
G
 
-
L
 
-
R
 
Q
P
 
D
F
 
M
Q
 
A
I
 
Q
N
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
S
L
 
L
S
 
G
R
 
L
S
 
C
F
 
P
Q
 
Q
V
 
H
T
 
D
N
 
V
V
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
A
E
 
E
N
 
H
L
 
L
R
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
Y
R
 
F
Y
 
Y
A
 
A
F
 
Q
W
 
L
K
 
K
N
 
G
V
 
L
D
 
S
K
 
-
L
 
L
P
 
Q
E
 
K
V
 
C
R
 
P
E
 
E
R
 
E
T
 
V
A
 
K
Q
 
Q
I
 
M
L
 
L
E
 
H
D
 
I
I
 
L
H
 
S
L
 
L
T
 
E
S
 
D
R
 
K
R
 
R
D
 
D
M
 
L
P
 
R
A
 
S
G
 
K
L
 
F
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
M
Q
 
K
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
I
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
M
 
M
S
 
D
H
 
-
A
 
A
E
 
V
T
 
S
E
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
I
-
 
W
A
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
Q
R
 
Q
L
 
Q
T
 
K
E
 
S
G
 
D
R
 
R
T
 
T
L
 
V
L
 
L
I
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
F
M
 
M
S
 
D
V
 
E
V
 
A
F
 
D
G
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
A
Y
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
I
 
Q
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S

Sites not aligning to the query:

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:245/249 of query aligns to 6:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
 
R
K
 
R
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
R
N
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
x
S
L
 
L
T
x
S
Y
x
G
A
x
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
|
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
S
 
S
H
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
I
E
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
I
A
 
E
L
 
H
I
 
L
R
 
R
R
 
-
L
 
-
T
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:244/249 of query aligns to 6:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
x
R
K
 
R
V
|
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
x
L
F
x
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
x
P
Q
|
Q
V
 
E
T
x
A
N
x
S
V
 
I
F
|
F
T
x
R
N
x
R
M
x
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
|
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
x
Q
L
 
S
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
x
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
D
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:244/249 of query aligns to 6:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
x
R
K
 
R
V
|
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
 
F
T
 
R
N
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
 
S
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
D
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
33% identity, 88% coverage: 15:233/249 of query aligns to 16:227/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
G
 
G
I
 
G
T
x
V
K
 
K
V
x
A
I
 
L
Q
 
D
N
 
D
I
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
V
A
 
P
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
S
H
 
L
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
L
N
 
L
L
 
H
I
 
L
S
 
N
G
 
G
Y
 
T
M
 
L
R
 
R
P
 
P
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
R
E
 
K
E
 
D
I
 
L
S
 
T
G
 
G
L
 
W
R
 
R
P
 
-
F
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
R
R
 
R
R
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
V
R
 
L
S
x
Q
F
 
D
Q
 
A
V
 
D
T
 
D
N
 
Q
V
 
L
F
 
F
T
 
A
N
 
T
M
 
-
T
 
T
V
 
V
W
 
F
E
 
E
N
 
D
L
 
V
R
 
S
C
 
F
A
 
G
V
 
P
L
 
L
W
 
-
A
 
N
T
 
L
G
 
G
H
 
L
R
 
S
Y
 
E
A
 
A
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
E
V
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
R
T
 
V
A
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
A
I
 
L
H
 
S
L
 
I
T
 
S
S
 
D
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
R
P
 
P
A
 
T
G
x
H
L
x
M
L
|
L
T
x
S
Y
 
G
A
x
G
E
x
Q
Q
 
K
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
G
T
 
A
I
 
V
A
 
A
G
 
M
G
 
R
A
 
P
N
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
S
 
D
H
 
L
A
 
A
E
 
G
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
R
 
G
L
 
L
-
 
R
T
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
L
L
 
V
I
 
F
V
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
S
 
E
V
 
L
V
 
A
F
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
S
 
A
V
 
L
L
 
F
V
 
R
Y
 
T
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
A
P
 
A
E
 
E
E
 
A
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
31% identity, 94% coverage: 5:238/249 of query aligns to 3:228/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
E
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
N
V
 
L
E
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
I
 
P
T
 
L
K
 
H
V
|
V
I
 
L
Q
 
K
N
 
G
I
 
I
S
 
H
L
 
L
S
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
K
H
 
L
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
T
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
Y
 
L
M
 
E
R
 
D
P
 
F
T
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
D
G
 
G
E
 
L
E
 
S
I
 
V
S
 
K
G
 
D
L
 
D
R
 
R
P
 
A
F
 
L
Q
 
R
I
 
E
N
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
E
L
 
V
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
F
N
 
N
V
 
L
F
 
F
T
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
W
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
T
C
 
L
A
 
A
V
 
P
L
 
M
W
 
R
A
 
V
T
 
-
G
 
-
H
 
R
R
 
R
Y
 
W
A
 
P
F
 
R
W
 
E
K
 
K
N
 
A
V
 
E
D
 
K
K
 
K
L
 
A
P
 
L
E
 
E
V
 
L
R
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
V
A
 
G
Q
 
I
I
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
L
T
 
D
S
 
Q
R
 
A
R
 
R
D
 
K
M
 
Y
P
 
P
A
 
A
G
 
Q
L
 
-
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
M
G
 
E
A
 
P
N
 
K
V
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
S
 
D
H
 
P
A
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
R
 
E
A
 
V
V
 
L
A
 
D
L
 
V
I
 
M
R
 
R
R
 
D
L
 
L
T
 
A
E
 
Q
-
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
S
 
V
V
 
F
L
 
M
V
 
D
Y
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
I
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
F
G
 
T
N
 
R
P
 
P
K
 
K

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:243/249 of query aligns to 6:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
R
 
K
G
 
N
V
 
L
E
 
A
K
 
K
S
 
A
F
x
Y
G
 
K
I
 
G
T
x
R
K
 
R
V
|
V
I
 
V
Q
 
E
N
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
R
 
P
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
G
 
D
E
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
F
 
H
Q
 
A
I
 
R
N
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
V
 
E
T
 
A
N
 
S
V
 
I
F
|
F
T
x
R
N
x
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
W
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
-
C
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
W
 
Q
A
 
I
T
 
R
G
 
D
H
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
D
K
 
L
L
 
S
P
 
A
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
-
 
D
R
 
R
T
 
A
A
 
N
Q
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
D
 
E
I
 
F
H
 
H
L
 
I
T
 
E
S
 
H
R
 
L
R
 
R
D
 
D
M
 
S
P
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
 
S
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
N
A
 
P
N
 
K
V
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
I
E
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
D
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
G
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
S
 
Y
V
 
I
L
 
V
V
 
S
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
R
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
28% identity, 97% coverage: 5:245/249 of query aligns to 7:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
I
 
L
E
 
E
L
 
V
R
 
Q
G
 
S
V
 
L
E
 
H
K
 
V
S
 
Y
F
x
Y
G
 
G
I
 
A
T
 
I
K
 
H
V
 
A
I
 
I
Q
 
K
N
 
G
I
 
I
S
 
D
L
 
L
S
 
K
I
 
V
A
 
P
Q
 
R
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
H
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
L
N
 
S
L
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
Y
 
L
M
 
V
R
 
R
P
 
A
T
 
Q
S
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
L
 
I
L
 
F
R
 
N
G
 
G
E
 
Q
E
 
D
I
 
I
S
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
P
P
 
A
F
 
H
Q
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
M
G
 
G
L
 
I
S
 
A
R
 
L
S
 
V
F
 
P
Q
x
E
V
 
G
T
 
R
N
 
R
V
 
I
F
 
F
T
 
P
N
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
M
C
 
M
A
 
G
V
 
A
L
 
-
W
 
Y
A
 
N
T
 
R
G
 
K
H
 
D
R
 
K
Y
 
E
A
 
G
F
 
I
W
 
K
K
 
R
N
 
D
V
 
L
D
 
E
-
 
W
-
 
I
-
 
F
-
 
S
K
 
L
L
 
F
P
 
P
E
 
R
V
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
T
 
L
A
 
K
Q
 
Q
I
 
L
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
G
G
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
M
G
 
S
G
 
R
A
 
P
N
 
K
V
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
A
H
 
P
A
 
I
E
 
L
T
 
V
E
 
S
R
 
E
A
 
V
V
 
F
A
 
E
L
 
V
I
 
I
R
 
Q
R
 
K
L
 
I
T
 
N
-
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
S
 
L
V
 
G
V
 
A
F
 
L
G
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
H
R
 
Y
I
 
G
S
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
E
Y
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
I
 
V
A
 
L
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
L
G
 
D
N
 
N
P
 
E
K
 
M
V
 
V
K
 
R
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

8ee6A Cryo-em structure of human abca7 in pe/ch nanodiscs (see paper)
30% identity, 94% coverage: 1:234/249 of query aligns to 620:843/1808 of 8ee6A

query
sites
8ee6A
M
 
L
S
 
S
N
 
P
A
 
G
I
 
V
E
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
S
V
 
L
E
 
E
K
 
K
S
 
R
F
|
F
-
 
P
-
 
G
G
 
S
I
 
P
T
 
Q
K
 
P
V
x
A
I
 
L
Q
 
R
N
 
G
I
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
D
I
 
F
A
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
E
 
H
R
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
T
F
 
L
N
 
S
L
 
I
I
 
L
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
M
 
F
R
 
P
P
 
P
T
 
S
S
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
A
L
 
F
L
 
I
R
 
L
G
 
G
E
 
H
E
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
S
-
 
M
S
 
A
G
 
A
L
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
H
R
 
L
G
 
G
L
 
V
S
 
C
R
 
P
S
 
Q
F
 
Y
Q
 
N
V
 
V
T
 
-
N
 
-
V
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
M
M
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
D
E
 
E
N
 
H
L
 
V
R
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
W
 
W
A
 
F
T
 
Y
G
 
G
H
 
R
R
 
L
Y
 
K
A
 
G
F
 
L
W
 
S
K
 
A
N
 
A
V
 
V
D
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
V
R
 
G
E
 
P
R
 
E
T
 
Q
A
 
D
Q
 
R
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
D
I
 
V
H
 
G
L
 
L
T
 
V
S
 
S
R
 
K
R
 
Q
D
 
S
M
 
V
P
 
Q
A
 
T
G
 
R
L
 
H
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
M
Q
 
Q
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
S
I
 
V
G
 
A
I
 
I
T
 
A
I
 
F
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
A
E
 
S
T
 
R
E
 
R
R
 
G
A
 
I
V
 
W
A
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
L
R
 
K
L
 
Y
T
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
I
I
 
L
V
 
S
E
 
T
H
 
H
D
 
H
M
 
L
S
 
D
V
 
E
V
 
A
F
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
S
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
A
Y
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
I
 
C
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
L
E
 
F
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 91% coverage: 1:226/249 of query aligns to 1:221/501 of P04983

query
sites
P04983
M
 
M
S
 
E
N
 
A
A
 
L
I
 
L
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
D
K
 
K
S
 
A
F
 
F
G
 
P
I
 
G
T
 
V
K
 
K
V
 
A
I
 
L
Q
 
S
N
 
G
I
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
N
I
 
V
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
E
 
R
R
 
V
H
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
T
 
M
F
 
M
N
 
K
L
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Y
 
I
M
 
Y
R
 
T
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
S
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
K
E
 
E
I
 
T
S
 
T
G
 
F
L
 
T
R
 
G
P
 
P
F
 
K
Q
 
S
I
 
S
N
 
Q
R
 
E
R
 
A
G
 
G
L
 
I
S
 
G
R
 
I
S
 
I
F
 
H
Q
 
Q
V
 
E
T
 
L
N
 
N
V
 
L
F
 
I
T
 
P
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
V
 
I
W
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
F
C
 
L
A
 
G
V
 
R
L
 
E
W
 
F
A
 
V
T
 
N
G
 
R
H
 
F
R
 
G
Y
 
K
A
 
I
F
 
D
W
 
W
K
 
K
N
 
T
V
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
M
R
 
Y
E
 
A
R
 
E
T
 
A
A
 
D
Q
 
K
I
 
L
L
 
L
E
 
A
D
 
K
I
 
L
H
 
N
L
 
L
T
 
R
S
 
F
R
 
K
R
 
S
D
 
D
M
 
K
P
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
D
L
 
L
T
 
S
Y
 
I
A
 
G
E
 
D
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
I
 
K
T
 
V
I
 
L
A
 
S
G
 
F
G
 
E
A
 
S
N
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
S
 
T
H
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
R
 
S
A
 
L
V
 
F
A
 
R
L
 
V
I
 
I
R
 
R
R
 
E
L
 
L
-
 
K
T
 
S
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
T
 
G
L
 
I
L
 
V
I
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
S
 
K
V
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
D
I
 
V
S
 
T
V
 
V
L
 
F
V
 
R
Y
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
F
I
 
I
A
 
A

E9Q876 Glucosylceramide transporter ABCA12; ATP-binding cassette sub-family A member 12; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
28% identity, 92% coverage: 5:234/249 of query aligns to 1346:1565/2595 of E9Q876

query
sites
E9Q876
I
 
V
E
 
A
L
 
L
R
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
I
F
 
Y
G
 
G
I
 
S
T
 
K
K
 
T
V
 
A
I
 
V
Q
 
E
N
 
N
I
 
L
S
 
N
L
 
L
S
 
N
I
 
F
A
 
Y
Q
 
E
G
 
G
E
 
H
R
 
I
H
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
T
 
T
F
x
I
N
x
S
L
x
M
I
x
L
S
x
T
G
|
G
Y
x
L
M
x
F
R
x
G
P
x
A
T
|
T
S
x
A
G
|
G
S
x
T
I
|
I
L
x
F
L
x
V
R
x
Y
G
|
G
E
x
K
E
x
D
I
|
I
S
x
K
G
 
-
L
 
-
R
x
T
P
x
D
F
x
L
Q
x
N
I
x
T
N
x
V
R
|
R
R
x
K
G
x
N
L
x
M
S
x
G
R
x
V
S
x
C
F
x
M
Q
|
Q
V
x
H
T
x
D
N
x
V
V
x
L
F
|
F
T
x
S
N
x
Y
M
x
L
T
|
T
V
x
T
W
x
K
E
|
E
N
x
H
L
|
L
R
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
L
|
L
W
x
L
A
x
Y
T
x
G
G
x
S
H
x
I
R
x
K
Y
x
V
A
x
P
F
x
H
W
|
W
K
x
T
N
x
K
V
x
T
D
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
E
x
Q
V
x
L
R
x
H
E
|
E
R
x
E
T
x
V
A
x
K
Q
x
R
I
 
T
L
 
L
E
 
K
D
 
D
I
 
T
H
 
G
L
 
L
T
 
Y
S
 
S
R
 
H
R
 
R
D
 
H
M
 
K
P
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
S
Y
 
G
A
 
G
E
 
M
Q
 
K
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
S
I
 
I
G
 
S
I
 
I
T
 
A
I
 
L
A
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
S
N
 
R
V
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
A
 
T
G
 
G
M
 
V
S
 
D
H
 
P
A
 
C
E
 
S
T
 
R
E
 
R
R
 
S
A
 
I
V
 
W
A
 
D
L
 
V
I
 
I
R
 
S
R
 
K
L
 
N
T
 
K
E
 
T
G
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
L
V
 
S
E
 
T
H
 
H
D
 
H
M
 
L
S
 
D
V
 
E
V
 
A
F
 
E
G
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
E
Y
 
Q
G
 
G
Q
 
G
V
 
L
I
 
R
A
 
C
S
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
F
E
 
Y
I
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 94% coverage: 5:237/249 of query aligns to 4:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
I
E
 
I
L
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
V
E
 
S
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
K
I
 
K
T
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
-
 
A
-
 
L
Q
 
D
N
 
N
I
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
H
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
Y
 
L
M
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
L
 
Y
L
 
F
R
 
D
G
 
D
E
 
R
E
 
L
I
 
V
S
 
A
-
 
S
-
 
N
G
 
G
L
 
K
R
 
L
P
 
I
F
 
V
Q
 
P
I
 
P
N
 
E
R
 
D
R
 
R
G
 
K
L
 
I
S
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
V
 
T
T
 
W
N
 
A
V
 
L
F
 
Y
T
 
P
N
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
A
W
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
R
 
A
C
 
F
A
 
P
V
 
L
L
 
T
W
 
N
A
 
M
T
 
K
G
 
M
H
 
S
R
 
K
Y
 
E
A
 
E
F
 
I
W
 
R
K
 
K
N
 
R
V
 
V
D
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
E
T
 
V
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
D
D
 
I
I
 
H
H
 
H
L
 
V
T
 
L
S
 
N
R
 
H
-
 
F
-
 
P
R
 
R
D
 
E
M
 
L
P
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
-
L
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
A
I
 
L
A
 
V
G
 
K
G
 
D
A
 
P
N
 
S
V
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
S
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
M
T
 
R
E
 
D
R
 
S
A
 
A
V
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
V
T
 
Q
E
 
S
-
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
S
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
Y
 
K
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
L
R
 
Y
G
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 94% coverage: 5:237/249 of query aligns to 4:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
I
E
 
I
L
 
V
R
 
K
G
 
N
V
 
V
E
 
S
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
K
I
 
K
T
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
-
 
A
-
 
L
Q
 
D
N
 
N
I
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
R
H
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
T
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
Y
 
L
M
 
D
R
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
L
 
Y
L
 
F
R
 
D
G
 
D
E
 
R
E
 
L
I
 
V
S
 
A
-
 
S
-
 
N
G
 
G
L
 
K
R
 
L
P
 
I
F
 
V
Q
 
P
I
 
P
N
 
E
R
 
D
R
 
R
G
 
K