SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011605777.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_011605777.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6thqB Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea thermoproteus uzoniensis with norvaline
32% identity, 84% coverage: 25:311/342 of query aligns to 14:294/301 of 6thqB

query
sites
6thqB
Q
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
D
A
 
E
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
P
A
 
S
L
 
L
R
 
N
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
S
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
W
Q
 
N
E
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
E
G
 
N
L
 
L
R
 
Y
P
 
V
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
R
Q
 
D
H
 
H
L
 
M
D
 
E
R
|
R
L
 
L
R
 
L
N
 
R
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
I
L
 
G
L
 
L
D
 
D
-
 
V
D
 
P
T
 
Y
C
 
T
C
 
A
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
S
R
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
R
V
 
A
N
 
N
D
 
G
T
 
F
Q
 
K
V
 
E
D
 
D
S
 
L
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
-
A
 
P
V
 
V
S
 
A
A
 
Y
V
 
I
D
 
S
A
 
K
G
 
P
G
 
Q
I
 
I
G
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
V
D
 
R
G
 
G
S
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
V
T
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
I
P
 
P
S
 
F
G
 
G
R
 
K
K
 
-
R
 
-
W
 
Y
L
 
L
R
 
K
D
 
V
G
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
L
 
A
T
 
A
V
 
V
S
 
V
S
 
S
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
P
 
V
S
 
H
S
 
T
A
 
S
V
 
M
F
 
M
P
 
P
S
 
V
A
 
M
A
 
A
K
|
K
N
 
A
I
 
T
S
 
G
A
 
I
Y
|
Y
A
 
L
G
 
N
P
 
S
R
 
I
L
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
I
L
 
M
C
 
L
T
 
N
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
V
S
 
V
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
E
T
x
N
V
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
V
E
 
R
G
 
R
T
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
M
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
L
G
 
E
D
 
D
A
 
G
V
 
I
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
E
W
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
I
A
 
A
P
 
G
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
P
V
 
L
A
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
S
V
 
I
T
 
T
P
 
R
D
 
E
R
 
E
I
 
L
R
 
Y
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
F
C
 
V
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
I
R
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
D
G
 
G
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
R
W
 
V
P
 
L
Q
 
Q
R
 
R
-
 
G
P
 
P
A
 
I
T
 
T
A
 
Q
Q
 
K
L
 
I
V
 
A
A
 
E
A
 
T
Y
 
Y
F
 
R
D
 
R
Q
 
I
V
 
V
R
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
E
A
 
E
S
 
K
N
 
Y
L
 
L

4whxA X-ray crystal structure of an amino acid aminotransferase from burkholderia pseudomallei bound to the co-factor pyridoxal phosphate
31% identity, 84% coverage: 25:310/342 of query aligns to 14:299/306 of 4whxA

query
sites
4whxA
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
E
A
 
W
Q
 
R
A
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
I
P
 
H
V
 
V
G
 
L
S
 
T
I
 
H
A
 
T
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M
S
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
T
E
 
A
A
 
D
P
 
G
G
 
G
L
 
T
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
T
D
 
K
R
 
R
L
 
L
R
 
L
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
F
L
 
Q
L
 
M
D
 
D
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
P
R
 
F
I
 
D
I
 
Q
D
 
E
E
 
T
L
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
D
-
 
V
V
 
V
N
 
R
D
 
E
T
 
N
Q
 
K
V
 
L
D
 
E
S
 
S
-
 
C
Y
|
Y
A
 
L
R
 
R
-
 
P
-
 
I
I
 
I
A
 
W
V
 
I
S
 
G
A
 
S
V
 
E
D
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
V
I
 
S
G
 
A
D
 
K
G
 
G
S
 
N
E
 
T
A
 
I
A
 
H
L
 
V
T
 
A
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
W
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
A
K
 
-
R
 
-
W
 
Y
L
 
L
R
 
G
D
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
L
G
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
V
T
 
K
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
F
Q
 
T
R
 
R
P
 
H
S
 
H
S
 
V
A
 
N
V
 
V
F
 
S
P
 
M
S
 
V
A
 
R
A
 
A
K
|
K
N
 
A
I
 
S
S
 
G
A
 
W
Y
 
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
N
A
 
Q
Q
 
E
A
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
D
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
V
E
 
D
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
 
G
A
 
E
T
 
N
V
 
F
F
 
F
L
 
L
A
 
V
E
 
N
G
 
R
T
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
Y
T
 
T
P
 
P
R
 
D
L
 
L
G
 
A
D
 
-
A
 
S
V
 
C
L
|
L
P
 
D
G
 
G
I
 
I
S
 
T
R
 
R
A
 
D
W
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
T
T
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
I
S
 
E
V
 
V
A
 
I
E
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
I
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
E
I
 
V
R
 
Y
Q
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
F
C
 
T
G
 
G
T
 
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
L
E
 
D
G
 
N
Y
 
R
T
 
T
P
 
I
A
 
G
R
 
G
W
 
G
P
 
A
Q
 
R
R
 
G
P
 
P
A
 
I
T
 
T
A
 
E
Q
 
K
L
 
L
V
 
Q
A
 
S
A
 
A
Y
 
F
F
 
F
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
R
 
N
G
 
G
T
 
K
A
 
S
A
 
A
S
 
K
N
 
H

6q8eA Crystal structure of branched-chain amino acid aminotransferase from thermobaculum terrenum in pmp-form (see paper)
29% identity, 84% coverage: 20:305/342 of query aligns to 6:292/307 of 6q8eA

query
sites
6q8eA
V
 
L
Y
 
W
H
 
W
R
 
N
E
 
H
Q
 
R
L
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
W
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
T
L
 
V
P
 
H
V
 
L
G
 
T
S
 
D
I
 
Y
A
 
W
L
 
W
R
 
A
Y
 
S
G
 
V
I
 
T
S
 
A
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
G
Y
 
Y
R
 
W
Q
 
N
E
 
N
A
 
A
P
 
E
G
 
G
L
 
-
G
 
E
L
 
M
R
 
Y
P
 
I
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
H
 
H
L
 
A
D
 
R
R
|
R
L
 
L
R
 
E
N
 
Q
S
 
S
C
 
M
R
 
Q
L
 
L
M
 
I
L
 
R
L
 
M
-
 
P
D
 
K
D
 
E
T
 
F
C
 
T
C
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
I
P
 
C
R
 
Q
I
 
A
I
 
T
D
 
I
E
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
R
V
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
Y
Q
 
R
V
 
G
D
 
D
S
 
V
Y
 
Y
A
 
I
R
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
N
V
 
K
D
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
R
S
 
T
E
 
T
A
 
E
A
 
M
L
 
F
T
 
I
V
 
Y
S
 
S
V
 
R
T
 
P
P
 
A
S
 
V
G
 
S
R
 
R
K
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
E
D
 
E
G
 
D
E
 
F
G
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
A
T
 
C
V
 
Y
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
T
R
 
R
P
 
I
S
 
N
S
 
E
A
 
R
V
 
V
F
 
L
P
 
P
S
 
P
A
 
R
A
 
I
K
|
K
N
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
R
G
 
N
P
 
S
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
S
 
T
C
 
A
L
 
L
L
 
F
C
 
L
T
 
N
A
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
T
T
x
G
A
x
S
T
x
C
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
K
T
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
D
L
 
I
G
 
T
D
 
S
A
 
G
V
 
I
L
|
L
P
 
E
G
x
S
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
H
T
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
D
P
 
R
D
 
T
R
 
E
I
 
T
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
H
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
I
R
 
A
E
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
R
Y
 
H
T
 
E
P
 
M
A
 
K
R
 
H
W
 
G
P
 
A
Q
 
P
R
 
G
P
 
P
A
 
I
T
 
T
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
R
A
 
D
A
 
I
Y
 
Y
F
 
R
D
 
E
Q
 
V
V
 
V
R
 
Y
G
 
G

1iyeA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
29% identity, 82% coverage: 20:300/342 of query aligns to 5:286/304 of 1iyeA

query
sites
1iyeA
V
 
I
Y
 
W
H
 
F
R
 
N
E
 
G
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
P
 
R
A
 
W
Q
 
E
A
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
H
V
 
V
G
 
M
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
C
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
S
E
 
H
A
 
K
P
 
G
G
 
P
L
 
V
G
 
V
L
 
F
R
 
R
P
 
H
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
R
Q
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
H
N
 
D
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
Y
L
 
R
L
 
F
D
 
P
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
S
R
 
Q
I
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
I
V
 
R
N
 
K
D
 
N
T
 
N
Q
 
L
V
 
T
D
 
S
S
 
A
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
I
S
 
F
A
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
-
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Y
E
 
S
A
 
T
A
 
D
L
 
V
T
 
I
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
F
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
A
K
x
Y
R
 
L
W
 
G
L
 
A
R
 
E
D
 
A
G
 
L
E
 
E
-
 
Q
G
 
G
L
 
I
R
 
D
L
 
A
T
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
N
R
 
R
P
 
A
S
 
A
S
 
P
A
 
N
V
 
T
F
 
I
P
 
P
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
x
A
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
L
G
 
S
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
G
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
R
A
 
H
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
S
 
E
C
 
G
L
 
I
L
 
A
C
 
L
T
 
D
A
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
A
T
x
G
A
x
E
T
x
N
V
 
L
F
 
F
L
 
E
A
 
V
E
 
K
G
 
D
T
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
F
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
F
G
 
T
D
 
S
A
 
S
V
 
A
L
|
L
P
 
P
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
K
T
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
E
V
 
V
A
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
V
V
 
L
T
 
S
P
 
R
D
 
E
R
 
S
I
 
L
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
S
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
T
 
Q
P
 
V
A
 
G
R
 
E
W
 
G
P
 
R
Q
 
C
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
K
Q
 
R
L
 
I
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
Y
 
F
F
 
F

1iydA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase (see paper)
29% identity, 82% coverage: 20:300/342 of query aligns to 5:286/304 of 1iydA

query
sites
1iydA
V
 
I
Y
 
W
H
 
F
R
 
N
E
 
G
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
P
 
R
A
 
W
Q
 
E
A
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
H
V
 
V
G
 
M
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
C
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
S
E
 
H
A
 
K
P
 
G
G
 
P
L
 
V
G
 
V
L
 
F
R
 
R
P
 
H
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
R
Q
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
H
N
 
D
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
Y
L
 
R
L
 
F
D
 
P
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
S
R
 
Q
I
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
I
V
 
R
N
 
K
D
 
N
T
 
N
Q
 
L
V
 
T
D
 
S
S
 
A
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
I
S
 
F
A
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
-
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Y
E
 
S
A
 
T
A
 
D
L
 
V
T
 
I
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
F
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
A
K
x
Y
R
 
L
W
 
G
L
 
A
R
 
E
D
 
A
G
 
L
E
 
E
-
 
Q
G
 
G
L
 
I
R
 
D
L
 
A
T
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
N
R
 
R
P
 
A
S
 
A
S
 
P
A
 
N
V
 
T
F
 
I
P
 
P
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
x
A
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
L
G
 
S
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
G
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
R
A
 
H
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
S
 
E
C
 
G
L
 
I
L
 
A
C
 
L
T
 
D
A
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
A
T
x
G
A
x
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
E
A
 
V
E
 
K
G
 
D
T
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
F
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
F
G
 
T
D
 
S
A
 
S
V
 
A
L
|
L
P
 
P
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
K
T
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
E
V
 
V
A
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
V
V
 
L
T
 
S
P
 
R
D
 
E
R
 
S
I
 
L
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
S
G
 
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
T
 
Q
P
 
V
A
 
G
R
 
E
W
 
G
P
 
R
Q
 
C
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
K
Q
 
R
L
 
I
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
Y
 
F
F
 
F

1i1mA Crystal structure of escherichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
29% identity, 82% coverage: 20:300/342 of query aligns to 5:286/304 of 1i1mA

query
sites
1i1mA
V
 
I
Y
 
W
H
 
F
R
 
N
E
 
G
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
P
 
R
A
 
W
Q
 
E
A
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
H
V
 
V
G
 
M
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
C
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
S
E
 
H
A
 
K
P
 
G
G
 
P
L
 
V
G
 
V
L
 
F
R
 
R
P
 
H
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
R
Q
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
H
N
 
D
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
Y
L
 
R
L
 
F
D
 
P
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
S
R
 
Q
I
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
I
V
 
R
N
 
K
D
 
N
T
 
N
Q
 
L
V
 
T
D
 
S
S
 
A
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
I
S
 
F
A
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
-
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Y
E
 
S
A
 
T
A
 
D
L
 
V
T
 
I
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
F
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
A
K
 
Y
R
 
L
W
 
G
L
 
A
R
 
E
D
 
A
G
 
L
E
 
E
-
 
Q
G
 
G
L
 
I
R
 
D
L
 
A
T
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
N
R
 
R
P
 
A
S
 
A
S
 
P
A
 
N
V
 
T
F
 
I
P
 
P
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
 
A
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
L
G
 
S
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
G
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
R
A
 
H
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
S
 
E
C
 
G
L
 
I
L
 
A
C
 
L
T
 
D
A
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
A
T
x
G
A
x
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
E
A
 
V
E
 
K
G
 
D
T
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
F
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
F
G
 
T
D
 
S
A
 
S
V
 
A
L
|
L
P
 
P
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
K
T
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
E
V
 
V
A
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
V
V
 
L
T
 
S
P
 
R
D
 
E
R
 
S
I
 
L
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
S
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
T
 
Q
P
 
V
A
 
G
R
 
E
W
 
G
P
 
R
Q
 
C
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
K
Q
 
R
L
 
I
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
Y
 
F
F
 
F

1i1lA Crystal structure of eschelichia coli branched-chain amino acid aminotransferase. (see paper)
29% identity, 82% coverage: 20:300/342 of query aligns to 5:286/304 of 1i1lA

query
sites
1i1lA
V
 
I
Y
 
W
H
 
F
R
 
N
E
 
G
Q
 
E
L
 
M
V
 
V
P
 
R
A
 
W
Q
 
E
A
 
D
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
H
V
 
V
G
 
M
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
C
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
S
E
 
H
A
 
K
P
 
G
G
 
P
L
 
V
G
 
V
L
 
F
R
 
R
P
 
H
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
R
Q
 
E
H
 
H
L
 
M
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
H
N
 
D
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
I
M
 
Y
L
 
R
L
 
F
D
 
P
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
S
R
 
Q
I
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
R
-
 
D
V
 
V
A
 
I
V
 
R
N
 
K
D
 
N
T
 
N
Q
 
L
V
 
T
D
 
S
S
 
A
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
I
S
 
F
A
 
V
V
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
G
-
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
N
-
 
P
-
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Y
E
 
S
A
 
T
A
 
D
L
 
V
T
 
I
V
 
I
S
 
A
V
 
A
T
 
F
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
A
K
 
Y
R
 
L
W
 
G
L
 
A
R
 
E
D
 
A
G
 
L
E
 
E
-
 
Q
G
 
G
L
 
I
R
 
D
L
 
A
T
 
M
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
N
R
 
R
P
 
A
S
 
A
S
 
P
A
 
N
V
 
T
F
 
I
P
 
P
S
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
 
A
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
L
G
 
S
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
V
L
 
G
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
R
A
 
H
G
 
G
F
 
Y
D
 
Q
S
 
E
C
 
G
L
 
I
L
 
A
C
 
L
T
 
D
A
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
A
T
x
G
A
 
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
E
A
 
V
E
 
K
G
 
D
T
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
F
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
F
G
 
T
D
 
S
A
 
S
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
K
T
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
E
V
 
V
A
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
V
V
 
L
T
 
S
P
 
R
D
 
E
R
 
S
I
 
L
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
S
G
 
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
I
T
 
Q
P
 
V
A
 
G
R
 
E
W
 
G
P
 
R
Q
 
C
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
K
Q
 
R
L
 
I
V
 
Q
A
 
Q
A
 
A
Y
 
F
F
 
F

2ej3A Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with gabapentin
32% identity, 84% coverage: 19:305/342 of query aligns to 6:284/297 of 2ej3A

query
sites
2ej3A
L
 
L
V
 
I
Y
 
W
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
T
P
 
S
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
P
 
K
G
 
G
L
 
P
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
V
D
 
K
R
|
R
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
V
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
E
D
 
I
T
 
P
C
 
F
C
 
A
-
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
E
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
G
T
 
Y
Q
 
R
V
 
-
D
 
S
S
 
C
Y
 
Y
A
 
I
R
 
R
-
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
W
S
 
M
A
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
N
D
 
P
G
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
M
V
 
V
T
 
A
P
 
A
S
 
W
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
E
W
 
W
L
 
V
R
 
R
D
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
F
S
 
P
S
 
A
A
 
N
V
 
V
F
 
M
P
 
P
S
 
G
A
 
K
A
 
A
K
|
K
N
 
V
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
M
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
 
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
I
P
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
E
D
 
H
A
 
S
V
 
V
-
 
N
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
I
A
 
A
P
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
Q
E
 
V
E
 
V
A
 
R
V
 
A
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
R
 
Y
Q
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
M
V
 
I
E
 
D
G
 
W
Y
 
R
T
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
K
W
 
G
P
 
T
Q
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
E
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G

2eiyA Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with 4-methylvaleric acid
32% identity, 84% coverage: 19:305/342 of query aligns to 6:284/297 of 2eiyA

query
sites
2eiyA
L
 
L
V
 
I
Y
 
W
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
T
P
 
S
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
P
 
K
G
 
G
L
 
P
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
V
D
 
K
R
|
R
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
V
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
E
D
 
I
T
 
P
C
 
F
C
 
A
-
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
E
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
G
T
 
Y
Q
 
R
V
 
-
D
 
S
S
 
C
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
-
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
W
S
 
M
A
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
N
D
 
P
G
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
M
V
 
V
T
 
A
P
 
A
S
 
W
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
E
W
 
W
L
 
V
R
 
R
D
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
F
S
 
P
S
 
A
A
 
N
V
 
V
F
 
M
P
 
P
S
 
G
A
 
K
A
 
A
K
|
K
N
 
V
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
M
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
I
P
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
E
D
 
H
A
 
S
V
 
V
-
 
N
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
I
A
 
A
P
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
Q
E
 
V
E
 
V
A
 
R
V
 
A
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
R
 
Y
Q
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
M
V
 
I
E
 
D
G
 
W
Y
 
R
T
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
K
W
 
G
P
 
T
Q
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
E
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G

1wrvA Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase
32% identity, 84% coverage: 19:305/342 of query aligns to 6:284/297 of 1wrvA

query
sites
1wrvA
L
 
L
V
 
I
Y
 
W
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
T
P
 
S
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
P
 
K
G
 
G
L
 
P
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
V
D
 
K
R
|
R
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
V
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
E
D
 
I
T
 
P
C
 
F
C
 
A
-
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
E
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
G
T
 
Y
Q
 
R
V
 
-
D
 
S
S
 
C
Y
 
Y
A
 
I
R
 
R
-
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
W
S
 
M
A
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
N
D
 
P
G
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
M
V
 
V
T
 
A
P
 
A
S
 
W
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
E
W
 
W
L
 
V
R
 
R
D
 
-
G
 
-
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
F
S
 
P
S
 
A
A
 
N
V
 
V
F
 
M
P
 
P
S
 
G
A
 
K
A
 
A
K
|
K
N
 
V
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
M
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
 
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
I
P
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
E
D
 
H
A
 
S
V
 
V
-
 
N
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
I
A
 
A
P
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
Q
E
 
V
E
 
V
A
 
R
V
 
A
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
R
 
Y
Q
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
M
V
 
I
E
 
D
G
 
W
Y
 
R
T
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
K
W
 
G
P
 
T
Q
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
E
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G

7neaA Crystal structure of branched-chain amino acid aminotransferase from thermobaculum terrenum (m3 mutant). (see paper)
27% identity, 84% coverage: 20:305/342 of query aligns to 6:292/309 of 7neaA

query
sites
7neaA
V
 
L
Y
 
W
H
 
W
R
 
N
E
 
H
Q
 
R
L
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
W
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
T
L
 
V
P
 
H
V
 
L
G
 
T
S
 
D
I
 
Y
A
 
W
L
 
W
R
 
A
Y
 
S
G
 
V
I
 
T
S
 
A
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
 
V
V
 
I
R
 
S
L
 
G
Y
 
Y
R
 
W
Q
 
N
E
 
N
A
 
A
P
 
E
G
 
G
L
 
-
G
 
E
L
 
M
R
 
Y
P
 
I
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
H
 
H
L
 
A
D
 
R
R
|
R
L
 
L
R
 
E
N
 
Q
S
 
S
C
 
M
R
 
Q
L
 
L
M
 
I
L
 
R
L
 
M
-
 
P
D
 
K
D
 
E
T
 
F
C
 
T
C
 
V
D
 
D
D
 
E
V
 
I
P
 
C
R
 
Q
I
 
A
I
 
T
D
 
I
E
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
R
V
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
Y
Q
 
R
V
 
G
D
 
D
S
 
V
Y
 
F
A
 
I
R
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
N
V
 
K
D
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
V
I
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
R
S
 
T
E
 
T
A
 
E
A
 
M
L
 
F
T
 
I
V
 
Y
S
 
S
V
 
R
T
 
P
P
 
A
S
 
V
G
 
S
R
 
R
K
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
R
 
E
D
 
E
G
 
D
E
 
F
G
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
A
T
 
C
V
 
Y
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
T
R
 
R
P
 
I
S
 
N
S
 
E
A
 
R
V
 
V
F
 
L
P
 
P
S
 
P
A
 
R
A
 
I
K
|
K
N
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
R
G
 
N
P
 
S
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
S
 
T
C
 
A
L
 
L
L
 
F
C
 
L
T
 
N
A
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
K
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
T
T
x
G
A
x
S
T
 
C
V
 
V
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
K
T
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
D
L
 
I
G
 
T
D
 
S
A
 
G
V
 
I
L
|
L
P
 
E
G
x
S
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
H
T
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
E
-
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
V
V
 
V
T
 
D
P
 
R
D
 
T
R
 
E
I
 
T
R
 
Y
Q
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
 
H
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
I
R
 
A
E
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
R
Y
 
H
T
 
E
P
 
M
A
 
K
R
 
H
W
 
G
P
 
A
Q
 
P
R
 
G
P
 
P
A
 
I
T
 
T
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
R
A
 
D
A
 
I
Y
 
Y
F
 
R
D
 
E
Q
 
V
V
 
V
R
 
Y
G
 
G

2ej0B Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase with pyridoxamine 5'-phosphate
31% identity, 84% coverage: 19:305/342 of query aligns to 6:292/305 of 2ej0B

query
sites
2ej0B
L
 
L
V
 
I
Y
 
W
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
T
P
 
S
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
P
 
K
G
 
G
L
 
P
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
V
D
 
K
R
|
R
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
V
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
E
D
 
I
T
 
P
C
 
F
C
 
A
-
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
E
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
G
T
 
Y
Q
 
R
V
 
-
D
 
S
S
 
C
Y
 
Y
A
 
I
R
 
R
-
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
W
S
 
M
A
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
N
D
 
P
G
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
M
V
 
V
T
 
A
P
 
A
S
 
W
G
 
E
R
 
W
K
 
G
R
 
A
W
 
Y
L
 
L
R
 
G
D
 
E
G
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
R
E
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
F
S
 
P
S
 
A
A
 
N
V
 
V
F
 
M
P
 
P
S
 
G
A
 
K
A
 
A
K
|
K
N
 
V
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
M
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
I
P
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
E
D
 
H
A
 
S
V
 
V
-
 
N
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
I
A
 
A
P
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
Q
E
 
V
E
 
V
A
 
R
V
 
A
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
R
 
Y
Q
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
M
V
 
I
E
 
D
G
 
W
Y
 
R
T
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
K
W
 
G
P
 
T
Q
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
E
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G

2ej2A Crystal structure of t.Th.Hb8 branched-chain amino acid aminotransferase complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-glutamate
32% identity, 84% coverage: 19:305/342 of query aligns to 6:281/294 of 2ej2A

query
sites
2ej2A
L
 
L
V
 
I
Y
 
W
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
T
P
 
S
V
 
V
G
 
L
S
 
S
I
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
T
S
 
S
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
E
E
 
T
A
 
A
P
 
K
G
 
G
L
 
P
G
 
A
L
 
I
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
V
D
 
K
R
|
R
L
 
F
R
 
Y
N
 
N
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
V
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
E
D
 
I
T
 
P
C
 
F
C
 
A
-
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
L
P
 
E
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
G
T
 
Y
Q
 
R
V
 
-
D
 
S
S
 
C
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
-
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
W
S
 
M
A
 
G
V
 
A
D
 
K
A
 
A
G
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
N
D
 
P
G
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
M
V
 
V
T
 
A
P
 
A
S
 
W
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
E
W
 
W
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
I
V
 
T
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
A
R
 
R
P
 
F
S
 
P
S
 
A
A
 
N
V
 
V
F
 
M
P
 
P
S
 
G
A
 
K
A
 
A
K
|
K
N
 
V
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
G
 
N
P
 
S
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
M
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
L
C
 
L
T
 
D
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
E
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
I
P
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
E
D
 
H
A
 
S
V
 
V
-
 
N
L
|
L
P
 
E
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
R
T
 
I
A
 
A
P
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
Q
E
 
V
E
 
V
A
 
R
V
 
A
T
 
T
P
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
R
 
Y
Q
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
M
C
 
T
G
 
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
M
V
 
I
E
 
D
G
 
W
Y
 
R
T
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
K
W
 
G
P
 
T
Q
 
A
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
A
A
 
L
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
E
A
 
V
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
G

6h65C Crystal structure of the branched-chain-amino-acid aminotransferase from haliangium ochraceum
28% identity, 81% coverage: 25:300/342 of query aligns to 12:289/308 of 6h65C

query
sites
6h65C
Q
 
Q
L
 
C
V
 
I
P
 
P
A
 
W
Q
 
D
A
 
Q
A
 
C
T
 
S
L
 
L
P
 
H
V
 
V
G
 
S
S
 
T
I
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
F
Y
 
F
G
 
G
I
 
A
S
 
S
V
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
-
Q
 
W
E
 
N
A
 
A
P
 
E
G
 
R
L
 
E
G
 
Q
L
 
L
R
 
Y
P
 
V
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
D
 
R
R
|
R
L
 
L
R
 
E
N
 
Q
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
M
M
 
L
L
 
R
L
 
M
D
 
K
D
 
L
T
 
S
C
 
M
-
 
P
C
 
I
D
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
R
R
 
Q
I
 
G
I
 
V
D
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
L
A
 
R
V
 
A
N
 
N
D
 
E
T
 
F
Q
 
R
V
 
S
D
 
D
S
 
V
Y
 
H
A
 
L
R
 
Y
I
 
V
A
 
A
V
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
S
A
 
Y
G
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
N
D
 
H
G
 
D
S
 
P
E
 
D
A
 
P
A
 
L
L
 
F
T
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
T
-
 
G
V
 
V
S
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
G
S
 
T
G
 
A
R
 
V
K
 
S
R
 
R
W
 
L
L
 
P
R
 
L
D
 
V
G
 
H
E
 
T
G
 
G
L
 
I
R
 
S
L
 
A
T
 
C
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
P
 
I
S
 
S
S
 
D
A
 
D
V
 
S
F
 
V
P
 
P
S
 
P
A
 
R
A
 
I
K
|
K
N
 
I
I
 
G
S
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
Q
G
 
N
P
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
T
Q
 
E
A
 
A
V
 
R
A
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
D
 
H
S
 
T
C
 
S
L
 
V
L
 
L
C
 
L
T
 
N
A
 
S
E
 
R
G
 
G
L
 
K
V
 
V
S
 
S
E
|
E
A
 
T
P
 
P
T
 
G
A
|
A
T
 
C
V
 
L
F
 
L
L
 
M
A
 
V
E
 
R
G
 
D
T
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
I
T
 
S
P
 
P
R
 
P
L
 
V
G
 
T
D
 
A
A
 
D
V
 
I
L
|
L
P
 
E
G
x
S
I
x
V
S
x
T
R
 
R
A
 
K
W
 
T
V
 
L
L
 
M
A
 
S
-
 
L
T
 
S
A
 
E
P
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
D
L
 
S
S
 
P
V
 
V
A
 
I
E
 
E
E
 
R
A
 
D
V
 
M
T
 
D
P
 
R
D
 
T
R
 
E
I
 
L
R
 
Y
Q
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
I
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
T
E
 
T
V
 
I
E
 
D
G
 
R
Y
 
I
T
 
Q
P
 
V
A
 
G
R
 
D
W
 
G
P
 
E
Q
 
V
R
 
G
P
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
R
Q
 
R
L
 
L
V
 
Q
A
 
E
A
 
L
Y
 
Y
F
 
F

5mr0D Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from geoglobus acetivorans and archaeoglobus fulgidus: biochemical and structural characterisation (see paper)
28% identity, 76% coverage: 20:280/342 of query aligns to 4:258/290 of 5mr0D

query
sites
5mr0D
V
 
V
Y
 
Y
H
 
M
R
 
D
E
 
G
Q
 
E
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
E
Q
 
N
A
 
E
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
S
V
 
I
G
 
F
S
 
D
I
 
H
A
 
G
L
 
F
R
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
D
S
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
N
Q
 
G
E
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
V
W
 
F
L
 
R
L
 
L
D
 
K
Q
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
R
 
Y
N
 
D
S
 
S
C
 
A
R
 
K
L
 
A
M
 
I
L
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
I
-
 
P
T
 
I
C
 
T
C
 
K
D
 
E
D
 
E
V
 
F
P
 
M
R
 
E
I
 
I
I
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
T
V
 
L
A
 
R
V
 
K
N
 
N
D
 
N
T
 
L
Q
 
R
V
 
-
D
 
D
S
 
A
Y
 
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
I
V
 
V
S
 
T
A
 
R
V
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
-
 
L
-
x
G
-
x
L
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
K
G
 
C
S
 
Q
E
 
N
A
 
P
A
 
S
L
 
I
T
 
I
V
 
V
S
 
I
V
 
T
T
 
K
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
K
K
 
L
R
 
Y
W
 
G
L
 
D
R
 
L
D
 
Y
G
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
T
L
 
A
T
 
I
V
 
T
S
 
V
S
 
A
W
 
V
Q
 
R
R
 
R
P
 
N
S
 
S
S
 
F
A
 
D
V
 
A
F
 
L
P
 
P
S
 
P
A
 
N
A
 
I
K
|
K
N
 
S
I
 
L
S
 
N
A
 
-
Y
|
Y
A
 
L
G
 
N
P
 
N
R
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
I
Q
 
E
A
 
A
V
 
N
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
G
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
I
L
 
F
C
 
L
T
 
D
A
 
R
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
D
T
 
N
V
 
I
F
 
F
L
 
V
A
 
V
E
 
K
G
 
N
T
 
G
R
 
A
L
 
I
V
 
T
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
T
G
 
I
D
 
N
A
 
N
V
 
-
L
|
L
P
 
R
G
 
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
E
W
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
E
T
 
I
A
 
I
P
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
P
V
 
F
A
 
K
E
 
E
E
 
T
A
 
N
V
 
I
T
 
G
P
 
L
D
 
Y
R
 
D
I
 
L
R
 
Y
Q
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
V
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
A
P
 
P
V
 
I
R
 
V
E
 
V
V
 
I
E
 
D
G
 
G

5e25A Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea geoglobus acetivorans complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
25% identity, 82% coverage: 19:299/342 of query aligns to 4:278/290 of 5e25A

query
sites
5e25A
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
H
 
M
R
 
N
E
 
G
Q
 
E
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
E
Q
 
S
A
 
Q
A
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
S
V
 
V
G
 
F
S
 
D
I
 
H
A
 
G
L
 
F
R
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
D
S
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
G
|
G
V
 
I
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
R
 
N
Q
 
G
E
 
K
A
 
V
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
W
 
F
L
 
K
L
 
L
D
 
Y
Q
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
R
 
Y
N
 
D
S
 
C
C
 
A
R
 
R
L
 
V
M
 
I
L
 
D
L
 
L
D
 
K
D
 
I
T
 
P
C
 
L
C
 
S
-
 
K
D
 
E
D
 
E
V
 
F
P
 
A
R
 
E
I
 
A
I
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
T
V
 
L
A
 
R
V
 
R
N
 
N
D
 
N
T
 
L
Q
 
R
V
 
-
D
 
D
S
 
A
Y
|
Y
A
 
I
R
 
R
I
 
P
A
 
I
V
 
V
S
 
T
A
 
R
V
 
-
D
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
R
A
 
K
A
 
C
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
N
L
 
V
T
 
I
V
 
I
S
 
I
V
 
T
T
 
K
P
 
P
S
 
W
G
 
G
R
 
K
K
 
L
R
 
Y
W
 
G
L
 
D
R
 
L
D
 
Y
G
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
A
T
 
I
V
 
T
S
 
V
S
 
A
W
 
I
Q
 
R
R
 
R
P
 
N
S
 
A
S
 
I
A
 
D
V
 
S
F
 
L
P
 
P
S
 
P
A
 
N
A
 
I
K
|
K
N
 
S
I
 
L
S
 
N
A
 
-
Y
|
Y
A
 
L
G
 
N
P
 
N
R
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
I
Q
 
E
A
 
A
V
 
N
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
G
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
I
L
 
F
C
 
L
T
 
D
A
 
H
E
 
N
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
S
 
S
E
|
E
A
 
G
P
 
S
T
x
G
A
x
D
T
 
N
V
 
I
F
 
F
L
 
I
A
 
V
E
 
K
G
 
N
T
 
G
R
 
T
L
 
I
V
 
T
T
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
T
G
 
L
D
 
N
A
 
N
V
 
-
L
|
L
P
 
K
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
Q
W
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
E
T
 
L
A
 
I
P
 
N
R
 
E
L
 
L
G
 
E
L
 
I
S
 
P
V
 
F
A
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
N
V
 
I
T
 
G
P
 
L
D
 
F
R
 
D
I
 
L
R
 
Y
Q
 
S
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
F
L
 
V
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
x
A
I
 
A
E
 
E
F
 
I
G
 
A
P
 
P
V
 
V
R
 
T
E
 
Y
V
 
I
E
 
D
G
 
G
Y
 
R
T
 
T
P
 
V
A
 
G
R
 
N
W
 
G
P
 
K
Q
 
P
R
 
G
P
 
K
A
 
V
T
 
T
A
 
K
Q
 
M
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
K
Y
 
F

7z79B Crystal structure of aminotransferase-like protein from variovorax paradoxus
28% identity, 82% coverage: 19:299/342 of query aligns to 17:291/306 of 7z79B

query
sites
7z79B
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
H
 
V
R
 
N
E
 
G
Q
 
Q
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
R
Q
 
H
A
 
Q
A
 
A
T
 
V
L
 
V
P
 
S
V
 
V
G
 
F
S
 
D
I
 
A
A
 
G
L
 
Y
R
 
V
Y
 
C
G
 
G
I
 
D
S
 
G
V
 
V
F
x
W
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
V
G
 
D
L
 
G
R
 
R
P
 
I
W
 
V
L
 
S
L
 
F
D
 
D
Q
 
A
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
M
R
 
Y
N
 
E
S
 
G
C
 
A
R
 
K
L
 
S
M
 
I
L
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
-
T
 
-
C
 
-
C
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
I
I
 
G
D
 
M
E
 
T
L
 
R
V
 
A
A
 
Q
V
 
T
N
 
K
D
 
Q
T
 
V
Q
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
T
Y
 
F
A
 
L
R
 
R
I
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
N
G
 
G
I
 
M
G
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
M
V
 
V
S
 
T
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
K
V
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
N
G
 
Q
R
 
D
K
 
P
R
 
R
W
 
F
L
 
I
R
 
I
D
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
C
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
E
 
N
G
 
G
L
 
L
R
 
K
L
 
L
T
 
F
V
 
T
S
 
S
S
 
T
W
 
L
Q
 
R
R
 
C
P
 
S
S
 
G
S
 
P
A
 
D
V
 
V
F
 
F
P
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
D
I
 
L
S
 
R
A
 
L
Y
x
N
A
 
S
G
 
H
P
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
A
D
 
D
S
 
E
C
 
A
L
 
L
L
 
M
C
 
L
T
 
D
A
 
P
E
 
N
G
 
G
L
 
F
V
 
V
S
 
S
E
 
S
A
 
C
P
 
N
T
x
S
A
x
T
T
 
N
V
 
F
F
 
F
L
 
A
A
 
V
E
 
R
G
 
N
T
 
G
R
 
A
L
 
L
V
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
L
 
-
G
 
G
D
 
R
A
 
Y
V
 
C
L
x
F
P
 
N
G
|
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
A
W
 
T
V
 
V
L
 
V
A
 
R
T
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
I
S
 
P
V
 
V
A
 
H
E
 
E
E
 
G
A
 
D
V
 
F
T
 
T
P
 
L
D
 
A
R
 
E
I
 
V
R
 
Y
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
V
C
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
L
I
 
A
E
 
G
F
 
L
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
S
V
 
V
E
 
D
G
 
G
Y
 
-
T
 
-
P
 
R
A
 
A
R
 
L
W
 
V
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
P
 
P
A
 
L
T
 
T
A
 
Q
Q
 
R
L
 
L
V
 
D
A
 
A
A
 
L
Y
 
Y

A0R066 Branched-chain-amino-acid aminotransferase; BCAT; EC 2.6.1.42 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see 2 papers)
28% identity, 76% coverage: 21:281/342 of query aligns to 50:327/368 of A0R066

query
sites
A0R066
Y
 
W
H
 
H
R
 
N
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
Q
 
G
A
 
P
A
 
I
T
 
Q
L
 
L
P
 
D
V
 
P
G
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
Q
S
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
-
 
W
Q
 
A
E
 
D
A
 
G
P
 
S
G
 
I
L
 
V
G
 
S
L
 
F
R
 
R
P
 
P
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
A
H
 
N
L
 
A
D
 
A
R
|
R
L
 
L
R
 
Q
N
 
S
S
 
S
C
 
A
R
 
R
L
 
R
M
 
L
L
 
A
L
 
I
D
 
P
D
 
E
T
 
L
C
 
P
C
 
E
D
 
E
D
 
V
V
 
F
P
 
I
R
 
E
I
 
S
I
 
L
D
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
D
D
 
E
T
 
K
Q
 
W
V
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
E
D
 
S
S
 
L
Y
 
Y
A
 
L
R
 
R
I
 
P
A
 
F
V
 
V
S
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
E
A
 
P
G
 
G
-
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
D
 
P
G
 
S
S
 
N
E
 
E
A
 
Y
A
 
R
L
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
I
V
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
R
 
A
K
 
-
R
 
-
W
 
Y
L
 
F
R
 
K
D
 
G
G
 
G
-
 
I
E
 
K
G
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
V
T
 
W
V
 
L
S
 
S
S
 
H
W
 
E
Q
 
Y
R
 
V
P
 
R
S
 
A
S
 
S
A
 
P
V
 
G
F
 
G
P
 
T
S
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
F
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
G
 
A
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
D
 
D
S
 
Q
C
 
V
L
 
V
L
 
W
C
 
L
T
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
E
E
 
R
G
 
R
L
 
Y
V
 
V
S
 
E
E
 
E
A
 
M
P
 
G
T
 
G
A
 
M
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
F
G
 
G
T
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
G
A
 
S
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
S
 
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
P
 
T
R
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
I
T
 
D
P
 
V
D
 
D
R
 
E
I
 
W
R
 
Q
Q
x
K
A
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
D
 
T
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
A
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
V
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
H
V
 
V
E
 
K
G
 
H
Y
 
H

3dtgA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design
28% identity, 76% coverage: 21:281/342 of query aligns to 45:322/363 of 3dtgA

query
sites
3dtgA
Y
 
W
H
 
H
R
 
N
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
Q
 
G
A
 
P
A
 
I
T
 
Q
L
 
L
P
 
D
V
 
P
G
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
Q
S
 
E
V
 
I
F
|
F
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
-
 
W
Q
 
A
E
 
D
A
 
G
P
 
S
G
 
I
L
 
V
G
 
S
L
 
F
R
 
R
P
 
P
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
A
H
 
N
L
 
A
D
 
A
R
|
R
L
 
L
R
 
Q
N
 
S
S
 
S
C
 
A
R
 
R
L
 
R
M
 
L
L
 
A
L
 
I
D
 
P
D
 
E
T
 
L
C
 
P
C
 
E
D
 
E
D
 
V
V
 
F
P
 
I
R
 
E
I
 
S
I
 
L
D
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
D
D
 
E
T
 
K
Q
 
W
V
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
E
D
 
S
S
 
L
Y
 
Y
A
 
L
R
 
R
I
 
P
A
 
F
V
 
V
S
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
E
A
 
P
G
 
G
-
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
D
 
P
G
 
S
S
 
N
E
 
E
A
 
Y
A
 
R
L
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
I
V
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
R
 
A
K
 
-
R
 
-
W
x
Y
L
 
F
R
 
K
D
 
G
G
 
G
-
 
I
E
 
K
G
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
V
T
 
W
V
 
L
S
 
S
S
 
H
W
 
E
Q
 
Y
R
 
V
P
x
R
S
 
A
S
 
S
A
 
P
V
 
G
F
 
G
P
 
T
S
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
 
F
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
G
 
A
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
D
 
D
S
 
Q
C
 
V
L
 
V
L
 
W
C
 
L
T
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
E
E
 
R
G
 
R
L
 
Y
V
 
V
S
 
E
E
|
E
A
 
M
P
 
G
T
x
G
A
 
M
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
F
G
 
G
T
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
G
A
 
S
V
 
L
L
|
L
P
 
P
G
 
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
P
 
T
R
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
I
T
 
D
P
 
V
D
 
D
R
 
E
I
 
W
R
 
Q
Q
 
K
A
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
D
 
T
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
A
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
V
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
H
V
 
V
E
 
K
G
 
H
Y
 
H

3dtfA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design (see paper)
28% identity, 76% coverage: 21:281/342 of query aligns to 45:322/363 of 3dtfA

query
sites
3dtfA
Y
 
W
H
 
H
R
 
N
E
 
A
Q
 
Q
L
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
Q
 
G
A
 
P
A
 
I
T
 
Q
L
 
L
P
 
D
V
 
P
G
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
I
 
Q
S
 
E
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
V
 
L
R
 
K
L
 
A
Y
 
Y
R
 
R
-
 
W
Q
 
A
E
 
D
A
 
G
P
 
S
G
 
I
L
 
V
G
 
S
L
 
F
R
 
R
P
 
P
W
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
A
H
 
N
L
 
A
D
 
A
R
|
R
L
 
L
R
 
Q
N
 
S
S
 
S
C
 
A
R
 
R
L
 
R
M
 
L
L
 
A
L
 
I
D
 
P
D
 
E
T
 
L
C
 
P
C
 
E
D
 
E
D
 
V
V
 
F
P
 
I
R
 
E
I
 
S
I
 
L
D
 
R
E
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
V
N
 
D
D
 
E
T
 
K
Q
 
W
V
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
E
D
 
S
S
 
L
Y
 
Y
A
 
L
R
 
R
I
 
P
A
 
F
V
 
V
S
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
E
A
 
P
G
 
G
-
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
R
D
 
P
G
 
S
S
 
N
E
 
E
A
 
Y
A
 
R
L
 
Y
T
 
L
V
 
L
S
 
I
V
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
R
 
A
K
 
-
R
 
-
W
 
Y
L
 
F
R
 
K
D
 
G
G
 
G
-
 
I
E
 
K
G
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
V
T
 
W
V
 
L
S
 
S
S
 
H
W
 
E
Q
 
Y
R
 
V
P
 
R
S
 
A
S
 
S
A
 
P
V
 
G
F
 
G
P
 
T
S
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
N
 
F
I
 
G
S
 
G
A
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
A
P
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
D
 
D
S
 
Q
C
 
V
L
 
V
L
 
W
C
 
L
T
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
E
E
 
R
G
 
R
L
 
Y
V
 
V
S
 
E
E
 
E
A
 
M
P
 
G
T
 
G
A
 
M
T
 
N
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
V
E
 
F
G
 
G
T
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
E
L
 
L
G
 
S
D
 
G
A
 
S
V
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
|
I
S
x
T
R
 
R
A
 
D
W
 
S
V
 
L
L
 
L
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
P
 
T
R
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
I
T
 
D
P
 
V
D
 
D
R
 
E
I
 
W
R
 
Q
Q
 
K
A
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
I
D
 
T
E
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
A
C
 
C
G
 
G
T
|
T
G
 
A
I
 
A
E
 
V
F
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
V
R
 
S
E
 
H
V
 
V
E
 
K
G
 
H
Y
 
H

Query Sequence

>WP_011605777.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_011605777.1
MGSEAGPAGAGGPAPAGPLVYHREQLVPAQAATLPVGSIALRYGISVFEGVRLYRQEAPG
LGLRPWLLDQHLDRLRNSCRLMLLDDTCCDDVPRIIDELVAVNDTQVDSYARIAVSAVDA
GGIGDGSEAALTVSVTPSGRKRWLRDGEGLRLTVSSWQRPSSAVFPSAAKNISAYAGPRL
ALAQAVAAGFDSCLLCTAEGLVSEAPTATVFLAEGTRLVTPRLGDAVLPGISRAWVLATA
PRLGLSVAEEAVTPDRIRQADEVFLCGTGIEFGPVREVEGYTPARWPQRPATAQLVAAYF
DQVRGTAASNLVTWSVKDGPDGLVTGPDEQADPVGQPGYGRC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory