SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011605797.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_011605797.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ey5B Lbcats
59% identity, 98% coverage: 8:383/385 of query aligns to 1:383/383 of 5ey5B

query
sites
5ey5B
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
M
S
 
P
A
 
A
C
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
E
D
 
R
A
 
A
R
 
K
S
 
N
D
 
D
P
 
P
S
 
E
F
 
F
T
 
Q
Q
 
A
Q
 
E
L
 
L
D
 
E
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
R
V
 
D
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
F
A
 
A
N
 
E
R
 
N
L
 
L
S
 
T
E
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E
V
 
C
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
R
P
 
P
V
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
T
Q
 
N
V
 
V
D
 
E
E
 
D
A
 
T
H
 
F
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
M
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
Q
 
Q
C
 
I
A
 
-
G
 
-
L
 
L
L
 
E
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
-
 
R
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
P
F
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
D
P
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
L
T
 
S
D
 
A
G
 
G
L
 
R
P
 
P
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
A
Y
 
M
S
 
T
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
I
E
 
E
A
 
A
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
D
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
E
A
 
A
V
 
F
V
 
Q
R
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
P
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
S
Y
 
K
G
 
D
S
 
Q
T
 
I
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
N
Q
 
T
L
 
V
R
 
A
R
 
R

5t6mB Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/386 of 5t6mB

query
sites
5t6mB
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

1v8zA X-ray crystal structure of the tryptophan synthase b2 subunit from hyperthermophile, pyrococcus furiosus (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/386 of 1v8zA

query
sites
1v8zA
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

5dw0A Trpb from pyrococcus furiosus with l-serine bound as the external aldimine (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/388 of 5dw0A

query
sites
5dw0A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

6am8B Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9 with trp bound as e(aex2) (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/385 of 6am8B

query
sites
6am8B
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
|
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
|
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
x
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
x
S
H
|
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

5dw3A Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with product l-tryptophan non-covalently bound in the active site (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:376/383 of 5dw3A

query
sites
5dw3A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
-
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

6cuzA Engineered trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3r)- ethylserine bound as the amino-acrylate (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/383 of 6cuzA

query
sites
6cuzA
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
E
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

7rnpA Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9_h275e with 4-cl-trp non-covalently bound (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/384 of 7rnpA

query
sites
7rnpA
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
x
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
S
H
 
E
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

6cutA Engineered holo trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3s)- isopropylserine bound as the external aldimine (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:377/385 of 6cutA

query
sites
6cutA
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
A
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
E
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

6uapB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - open form with brd6309 bound
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 8:394/405 of 6uapB

query
sites
6uapB
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
 
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
x
I
S
x
N
E
 
E
A
 
A
L
x
F
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
I
x
F
G
 
G
S
 
T
T
 
A
M
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
A
 
G
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
|
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

5ocwB Structure of mycobacterium tuberculosis tryptophan synthase in space group f222 (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 4:390/399 of 5ocwB

query
sites
5ocwB
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
I
 
F
G
 
G
S
x
T
T
 
A
M
 
A
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
-
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

5t6mA Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:375/383 of 5t6mA

query
sites
5t6mA
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

5tciH Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - brd4592-bound form (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 9:395/406 of 5tciH

query
sites
5tciH
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
|
P
E
 
E
A
 
A
L
|
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
 
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
I
x
F
G
 
G
S
 
T
T
 
A
M
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
A
 
G
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
|
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

6u6cB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk2-bound form (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 9:395/405 of 6u6cB

query
sites
6u6cB
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
|
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
x
F
R
 
R
Q
 
D
W
|
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
T
 
A
M
 
A
G
|
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
A
 
G
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
|
H
G
|
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

6usaB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk1-bound form (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 8:394/404 of 6usaB

query
sites
6usaB
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
x
F
R
 
R
Q
 
D
W
|
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
T
 
A
M
 
A
G
|
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
A
 
G
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
|
H
G
|
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

6dweB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and brd0059-bound form
57% identity, 98% coverage: 3:379/385 of query aligns to 8:394/404 of 6dweB

query
sites
6dweB
D
 
D
P
 
P
G
 
D
V
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
F
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
M
S
 
A
A
 
V
C
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
V
D
 
S
P
 
Q
S
 
D
F
 
F
T
 
L
Q
 
D
Q
 
D
L
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
S
 
A
V
 
N
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
E
A
 
A
N
 
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
E
 
H
L
 
A
G
 
G
-
 
S
V
 
A
H
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
C
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
G
A
 
I
D
 
D
I
 
T
Q
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
A
R
 
R
M
 
M
E
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
V
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
T
 
Q
S
 
T
G
 
G
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
x
F
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
N
V
 
A
D
 
D
E
 
N
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
I
x
F
G
 
G
S
x
T
T
 
A
M
 
A
G
 
G
P
|
P
H
 
H
P
 
P
Y
x
F
P
 
P
W
 
T
M
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
M
E
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
Q
C
 
I
A
 
Q
G
 
G
L
 
Q
L
 
A
R
 
G
Q
 
R
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
H
G
 
A
F
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
P
A
 
G
-
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
F
T
 
T
D
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
A
L
 
F
H
|
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
F
S
 
S
N
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
R
 
I
E
 
E
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
W
L
 
L
G
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
R
T
 
P
A
 
I
N
 
T
D
 
D
E
 
S
E
 
E
V
 
A
V
 
M
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
V
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
L
P
 
G
Y
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E

5ixjD Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with l- threonine non-covalently bound in the active site (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:375/394 of 5ixjD

query
sites
5ixjD
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
I
S
 
E
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
F
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
F
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
T
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
 
G
L
 
L
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

5vm5D Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9, with ser bound (see paper)
56% identity, 96% coverage: 10:377/385 of query aligns to 3:375/383 of 5vm5D

query
sites
5vm5D
F
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
P
C
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
K
D
 
R
A
 
F
R
 
K
S
 
D
D
 
D
P
 
E
S
 
E
F
 
F
T
 
N
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
S
 
K
V
 
T
Y
 
W
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
Y
A
 
A
N
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
T
E
 
E
E
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
G
V
 
A
H
 
K
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
T
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
M
I
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
D
 
K
V
 
V
V
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
M
N
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
T
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
A
Q
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
Y
A
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
L
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
T
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
A
 
L
G
 
E
L
 
A
L
 
E
R
 
G
Q
 
Q
G
 
-
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
M
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
V
-
 
N
D
 
D
T
 
K
P
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
S
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
N
D
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
M
Y
 
L
S
 
S
N
 
Y
I
 
F
L
 
L
Q
 
Q
D
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
I
S
 
A
A
 
P
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
L
G
 
K
T
 
K
S
 
I
G
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
F
V
 
H
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
A
W
 
Y
I
 
A
I
 
M
R
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
I
 
M
P
 
S
Y
 
R
G
 
D
S
 
E
T
 
I
V
 
I
L
 
I
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D

8vhhA Engineered holo tryptophan synthase (tm9d8 ) Derived from t. Maritima trpb (see paper)
54% identity, 97% coverage: 7:381/385 of query aligns to 1:377/389 of 8vhhA

query
sites
8vhhA
S
 
K
G
 
G
R
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
I
L
 
L
V
 
M
S
 
G
A
 
A
C
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
E
D
 
G
A
 
I
R
 
M
S
 
K
D
 
D
P
 
E
S
 
S
F
 
F
T
 
W
Q
 
K
Q
 
E
L
 
F
D
 
N
H
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
R
V
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
F
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
H
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
M
D
 
E
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
T
Q
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
E
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
K
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
I
S
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
Q
 
N
V
 
L
D
 
Q
E
 
T
A
 
T
H
 
Y
Y
 
Y
C
 
V
I
 
F
G
 
G
S
|
S
T
 
V
M
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
I
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
N
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
E
E
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
K
Q
 
Q
C
 
I
A
 
P
G
 
E
L
 
-
L
 
-
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
-
 
R
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
S
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
G
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
P
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
K
S
 
T
N
 
F
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
E
 
V
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
P
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
W
G
 
R
T
 
E
S
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
Y
 
Y
V
 
D
T
 
A
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
L
I
 
K
R
 
K
A
 
I
A
 
N
E
 
I
S
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
L
E
 
E
Q
 
S
L
 
V

8eh0A Engineered tyrosine synthase (tmtyrs1) derived from t. Maritima trpb with ser bound as the amino-acrylate intermediate and complexed with quinoline n-oxide (see paper)
54% identity, 97% coverage: 8:381/385 of query aligns to 1:376/385 of 8eh0A

query
sites
8eh0A
G
 
G
R
 
N
F
 
F
G
 
G
E
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
Y
 
N
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
I
L
 
L
V
 
M
S
 
G
A
 
A
C
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
E
D
 
G
A
 
I
R
 
M
S
 
K
D
 
D
P
 
E
S
 
S
F
 
F
T
 
W
Q
 
K
Q
 
E
L
 
Y
D
 
N
H
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
R
V
 
D
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
T
 
T
P
 
P
V
 
L
T
 
Y
P
 
F
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
A
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
K
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
T
A
 
A
E
 
G
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
H
|
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
T
I
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
M
D
 
E
V
 
C
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
T
Q
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
E
R
 
R
M
 
M
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
K
S
 
S
G
 
G
T
 
S
R
 
R
T
 
T
L
|
L
K
 
K
D
 
D
A
 
A
C
x
I
S
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
Q
 
N
V
 
L
D
 
Q
E
 
T
A
 
T
H
 
Y
Y
|
Y
C
 
V
I
x
P
G
|
G
S
|
S
T
 
V
M
x
V
G
 
G
P
 
P
H
 
H
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
I
M
 
I
V
 
V
R
 
R
E
 
N
F
 
F
Q
 
Q
R
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
E
E
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
K
Q
 
Q
C
 
I
A
 
P
G
 
E
L
 
-
L
 
-
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
-
 
R
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
T
 
V
A
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
S
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
F
 
F
A
 
Y
G
 
P
F
 
F
V
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
G
A
 
V
R
 
K
L
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
H
G
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
L
T
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
P
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
S
Y
 
K
S
 
T
N
 
F
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
E
 
D
D
 
W
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
Q
E
 
A
A
 
S
H
 
H
S
 
S
I
 
V
S
 
S
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
A
 
A
G
 
Y
L
 
W
G
 
R
T
 
E
S
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
V
E
 
L
Y
 
Y
V
 
D
T
 
A
A
 
V
N
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
A
V
 
L
S
 
D
A
 
A
V
 
F
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
S
 
S
A
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
Y
I
 
L
I
 
K
R
 
K
A
 
I
A
 
N
E
 
I
S
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
V
M
 
V
T
 
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
K
 
K
D
 
D
A
 
L
E
 
E
Q
 
S
L
 
V

Query Sequence

>WP_011605797.1 NCBI__GCF_000058485.1:WP_011605797.1
MSDPGVSGRFGEFGGRYVPEALVSACEDLEAAYRDARSDPSFTQQLDHLLSVYAGRPTPV
TPANRLSEELGVHLLLKREDLAHTGSHKINNVLGQGLLAQRMGKKRLLAETGAGQHGVAT
ATIGALLGLDVVVYMGEADIQRQALNVFRMELLGATVVPVTSGTRTLKDACSEALRQWVT
QVDEAHYCIGSTMGPHPYPWMVREFQRVIGTEARAQCAGLLRQGVPDVVTACVGGGSNAA
GTFAGFVDTPARLVGVEAAGGAAMTDGLPGILHGFYSNILQDEDGQVREAHSISAGLDYP
GIGPEHAGLGTSGRAEYVTANDEEVVSAVVRLARAEGILPALESAHALAWIIRAAESGEI
PYGSTVLMTLSGRGDKDAEQLRRLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory