SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011648824.1 NCBI__GCF_000009265.1:WP_011648824.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ag6A Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with sulfofructose (sf), adp-mg (see paper)
32% identity, 94% coverage: 5:298/313 of query aligns to 2:295/302 of 7ag6A

query
sites
7ag6A
F
 
I
Q
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
C
F
 
V
G
 
G
A
x
I
L
 
T
A
x
V
I
 
M
D
|
D
D
 
R
I
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
P
A
 
T
G
 
E
K
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
Y
T
 
V
K
 
A
R
 
R
A
 
N
T
 
Y
D
 
T
H
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
G
|
G
N
x
P
V
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
G
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
D
T
 
D
T
 
T
A
 
G
D
 
N
V
 
S
A
 
L
G
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
S
D
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
S
 
R
L
 
Y
A
 
T
P
 
K
R
 
R
H
 
Y
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
Q
S
|
S
V
 
A
I
 
I
T
 
M
V
 
V
A
 
D
P
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
R
F
 
I
I
 
I
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
I
L
x
N
H
 
Y
G
 
P
T
 
S
S
 
P
D
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
W
D
 
D
V
 
V
L
 
V
M
 
L
R
 
-
A
 
A
P
 
D
V
 
V
L
x
R
L
 
W
I
 
H
D
 
D
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
A
E
 
K
S
 
K
V
 
A
V
 
F
A
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
M
V
 
T
I
 
V
A
 
L
D
 
D
I
 
G
E
 
D
W
 
I
T
 
T
V
 
P
G
 
Q
A
 
D
A
 
I
T
 
S
D
 
E
R
 
-
I
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
A
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
E
A
 
P
F
 
G
G
 
L
K
 
A
E
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
V
G
 
K
D
 
E
P
 
M
T
 
A
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
Q
L
 
A
W
 
Q
S
 
T
K
 
L
D
 
T
R
 
N
S
 
G
A
 
H
V
 
V
V
 
Y
L
 
V
T
|
T
D
 
Q
G
|
G
E
 
S
R
 
A
G
|
G
A
 
C
Y
 
D
L
 
W
R
 
L
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
G
V
 
-
T
 
-
R
 
R
W
 
Q
H
 
H
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
K
V
 
V
Q
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
F
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
G
 
S
K
 
G
S
 
D
P
 
L
L
 
A
D
 
E
C
 
S
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
x
S
A
 
G
A
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
S
 
K
V
x
C
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
D
 
D
H
 
C
Q
 
D
T
 
Q
C
 
T
L
 
R
T
 
S
W
 
F
M
 
L
A
 
S

7agkA Crystal structure of e. Coli sf kinase (yihv) in complex with product sulfofructose phosphate (sfp) (see paper)
32% identity, 94% coverage: 5:298/313 of query aligns to 2:295/298 of 7agkA

query
sites
7agkA
F
 
I
Q
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
C
F
 
V
G
 
G
A
 
I
L
 
T
A
x
V
I
 
M
D
|
D
D
 
R
I
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
P
A
 
T
G
 
E
K
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
Y
T
 
V
K
 
A
R
 
R
A
 
N
T
 
Y
D
 
T
H
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
G
|
G
N
x
P
V
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
G
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
D
T
 
D
T
 
T
A
 
G
D
 
N
V
 
S
A
 
L
G
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
S
D
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
S
 
R
L
 
Y
A
 
T
P
 
K
R
 
R
H
 
Y
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
Q
S
|
S
V
 
A
I
 
I
T
 
M
V
 
V
A
 
D
P
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
R
F
 
I
I
 
I
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
I
L
x
N
H
 
Y
G
 
P
T
 
S
S
 
P
D
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
W
D
 
D
V
 
V
L
 
V
M
 
L
R
 
-
A
 
A
P
 
D
V
 
V
L
x
R
L
 
W
I
 
H
D
 
D
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
A
E
 
K
S
 
K
V
 
A
V
 
F
A
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
M
V
 
T
I
 
V
A
 
L
D
 
D
I
 
G
E
 
D
W
 
I
T
 
T
V
 
P
G
 
Q
A
 
D
A
 
I
T
 
S
D
 
E
R
 
-
I
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
A
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
E
A
 
P
F
 
G
G
 
L
K
 
A
E
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
V
G
 
K
D
 
E
P
 
M
T
 
A
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
Q
L
 
A
W
 
Q
S
 
T
K
 
L
D
 
T
R
 
N
S
 
G
A
 
H
V
 
V
V
 
Y
L
 
V
T
 
T
D
 
Q
G
 
G
E
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
C
Y
 
D
L
 
W
R
 
L
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
G
V
 
-
T
 
-
R
 
R
W
 
Q
H
 
H
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
K
V
 
V
Q
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
V
F
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
G
 
S
K
 
G
S
 
D
P
 
L
L
 
A
D
 
E
C
 
S
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
K
V
 
C
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
D
 
D
H
 
C
Q
 
D
T
 
Q
C
 
T
L
 
R
T
 
S
W
 
F
M
 
L
A
 
S

P32143 Sulfofructose kinase; SF kinase; EC 2.7.1.184 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 94% coverage: 5:298/313 of query aligns to 2:295/298 of P32143

query
sites
P32143
F
 
I
Q
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
C
F
 
V
G
 
G
A
 
I
L
 
T
A
 
V
I
 
M
D
|
D
D
 
R
I
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
P
A
 
T
G
 
E
K
 
S
G
 
G
K
|
K
V
 
Y
T
 
V
K
 
A
R
 
R
A
 
N
T
 
Y
D
 
T
H
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
G
|
G
N
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
G
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
D
T
 
D
T
 
T
A
 
G
D
 
N
V
 
S
A
 
L
G
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
S
D
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
S
 
R
L
 
Y
A
 
T
P
 
K
R
 
R
H
 
Y
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
Q
S
|
S
V
 
A
I
 
I
T
 
M
V
 
V
A
 
D
P
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
R
F
 
I
I
 
I
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
I
L
 
N
H
 
Y
G
 
P
T
 
S
S
 
P
D
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
W
D
 
D
V
 
V
L
 
V
M
 
L
R
 
-
A
 
A
P
 
D
V
 
V
L
x
R
L
 
W
I
 
H
D
 
D
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
A
E
 
K
S
 
K
V
 
A
V
 
F
A
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
M
V
 
T
I
 
V
A
 
L
D
 
D
I
 
G
E
 
D
W
 
I
T
 
T
V
 
P
G
 
Q
A
 
D
A
 
I
T
 
S
D
 
E
R
 
-
I
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
A
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
E
A
 
P
F
 
G
G
 
L
K
 
A
E
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
V
G
 
K
D
 
E
P
 
M
T
 
A
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
Q
L
 
A
W
 
Q
S
 
T
K
 
L
D
 
T
R
 
N
S
 
G
A
 
H
V
 
V
V
 
Y
L
 
V
T
 
T
D
 
Q
G
 
G
E
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
C
Y
 
D
L
 
W
R
 
L
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
G
V
 
-
T
 
-
R
 
R
W
 
Q
H
 
H
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
K
V
 
V
Q
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
V
F
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
G
 
S
K
 
G
S
 
D
P
 
L
L
 
A
D
 
E
C
 
S
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
K
V
 
C
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
D
 
D
H
 
C
Q
 
D
T
 
Q
C
 
T
L
 
R
T
 
S
W
 
F
M
 
L
A
 
S

7aghA Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with amppnp-mg (see paper)
32% identity, 94% coverage: 5:298/313 of query aligns to 2:293/295 of 7aghA

query
sites
7aghA
F
 
I
Q
 
R
V
 
V
L
 
A
G
 
C
F
 
V
G
 
G
A
 
I
L
 
T
A
 
V
I
 
M
D
 
D
D
 
R
I
 
I
I
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
D
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
P
A
 
T
G
 
E
K
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
Y
T
 
V
K
 
A
R
 
R
A
 
N
T
 
Y
D
 
T
H
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
P
V
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
G
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
D
E
 
D
T
 
D
T
 
T
A
 
G
D
 
N
V
 
S
A
 
L
G
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
S
D
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
S
 
R
L
 
Y
A
 
T
P
 
K
R
 
R
H
 
Y
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
Q
S
 
S
V
 
A
I
 
I
T
 
M
V
 
V
A
 
D
P
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
|
R
F
 
I
I
 
I
A
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
I
L
 
N
H
 
Y
G
 
P
T
 
S
S
 
P
D
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
Q
-
 
W
D
 
D
V
 
V
L
 
V
M
 
L
R
 
-
A
 
A
P
 
D
V
 
V
L
 
R
L
 
W
I
 
H
D
 
D
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
S
 
A
E
 
K
S
 
K
V
 
A
V
 
F
A
 
T
R
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
M
V
 
T
I
 
V
A
 
L
D
 
D
I
 
G
E
 
D
W
 
I
T
 
T
V
 
P
G
 
Q
A
 
D
A
 
I
T
 
S
D
 
E
R
 
-
I
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
A
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
E
A
 
P
F
 
G
G
 
L
K
 
A
E
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
V
G
 
K
D
 
E
P
 
M
T
 
A
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
K
K
 
Q
L
 
A
W
 
Q
S
 
T
K
 
L
D
 
T
R
 
N
S
 
G
A
 
H
V
 
V
V
 
Y
L
 
V
T
|
T
D
 
Q
G
|
G
E
 
S
R
 
A
G
|
G
A
 
C
-
 
D
Y
 
W
L
 
L
R
 
E
Q
 
G
R
 
R
A
 
Q
D
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
H
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
K
V
 
V
Q
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
V
F
 
F
H
 
H
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
G
 
S
K
 
G
S
 
D
P
 
L
L
 
A
D
 
E
C
 
S
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
x
S
A
 
G
A
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
S
 
K
V
 
C
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
D
 
D
H
 
C
Q
 
D
T
 
Q
C
 
T
L
 
R
T
 
S
W
 
F
M
 
L
A
 
S

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
30% identity, 90% coverage: 7:288/313 of query aligns to 2:289/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
V
 
I
L
 
L
G
 
V
F
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
L
A
 
N
I
 
M
D
 
D
D
 
L
I
 
V
I
 
L
Y
 
R
V
 
V
D
 
K
R
 
R
G
 
L
L
 
P
T
 
R
A
 
P
G
 
G
K
 
E
G
 
T
K
 
V
V
 
L
T
 
G
K
 
E
R
 
D
A
 
Y
T
 
Q
D
 
T
H
 
H
-
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
G
 
R
F
 
M
I
 
L
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
D
T
 
P
T
 
F
A
 
G
D
 
Q
V
 
A
A
 
L
G
 
K
S
 
S
E
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
A
L
 
W
A
 
V
P
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
L
I
 
E
T
 
T
V
 
P
A
 
G
P
 
P
D
 
S
G
 
G
D
 
T
R
 
G
F
 
F
I
 
I
A
 
L
Y
 
V
D
 
D
D
 
P
D
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
V
 
V
L
 
A
H
 
P
G
 
G
T
 
A
S
 
N
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
P
D
 
E
A
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
T
V
 
A
L
 
F
M
 
Q
R
 
G
A
 
V
P
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
Q
G
 
-
Y
 
L
A
 
E
T
 
I
H
 
P
S
 
L
E
 
E
S
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
-
R
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
K
V
 
A
I
 
G
A
 
A
D
 
R
I
 
I
E
 
L
W
 
L
T
 
N
V
 
A
G
 
A
A
 
P
A
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
L
T
 
P
D
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
A
 
V
D
 
D
H
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
V
P
x
N
L
 
E
A
 
V
F
 
E
G
 
A
K
 
A
E
 
Q
Y
 
L
T
 
T
G
 
-
E
 
E
G
 
A
D
 
S
P
 
P
T
 
P
M
 
R
I
 
T
L
 
P
D
 
E
K
 
E
L
 
A
W
 
L
S
 
A
K
 
L
D
 
A
R
 
R
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
S
 
A
A
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
Y
 
V
L
 
W
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
S
D
 
G
V
 
T
T
 
E
R
 
E
W
 
S
H
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
P
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
|
F
H
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
K
 
Q
S
 
N
P
 
M
L
 
R
D
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
x
N
A
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
I
 
L
S
x
A
V
x
T
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
R
 
P
G
x
S
L
 
L
P
 
P

6znxC Ribokinase from thermus species
30% identity, 81% coverage: 37:288/313 of query aligns to 20:254/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
T
 
T
D
 
H
H
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
G
 
R
F
 
M
I
 
L
G
 
G
W
 
R
L
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
D
T
 
P
T
 
F
A
 
G
D
 
Q
V
 
A
A
 
L
G
 
K
S
 
S
E
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
A
L
 
W
A
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
T
P
 
P
R
 
G
H
 
P
A
 
S
D
 
G
A
 
T
A
 
A
P
 
F
I
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
G
R
 
Q
S
 
N
V
 
Q
I
 
I
T
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
G
G
 
A
D
 
N
R
 
A
F
 
R
I
 
L
A
 
V
Y
 
P
D
 
E
D
 
D
D
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
T
V
 
A
L
 
F
M
 
Q
R
 
G
A
 
V
P
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
Q
G
 
-
Y
 
L
A
 
E
T
 
I
H
 
P
S
 
L
E
 
E
S
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
-
R
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
K
V
 
A
I
 
G
A
 
A
D
 
R
I
 
I
E
 
L
W
 
L
T
 
N
V
 
A
G
 
A
A
 
P
A
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
L
T
 
P
D
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
A
 
V
D
 
D
H
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
V
P
 
-
L
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
D
x
N
P
 
E
T
 
V
M
 
E
I
 
A
L
 
A
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
W
 
A
S
 
R
K
 
Q
D
 
L
R
 
R
S
 
G
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
L
 
V
T
 
L
D
x
L
G
|
G
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
L
 
W
R
 
S
Q
 
G
R
 
E
A
 
E
D
 
S
V
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
Q
 
P
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
|
F
H
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
K
 
Q
S
 
N
P
 
M
L
 
R
D
 
A
C
 
A
V
 
L
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
x
N
A
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
I
 
L
S
 
A
V
x
T
T
 
T
A
 
R
R
 
P
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
R
 
P
G
 
S
L
 
L
P
 
P

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
26% identity, 82% coverage: 36:291/313 of query aligns to 35:302/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
A
 
A
T
 
M
D
 
T
H
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
D
V
 
A
A
 
I
T
 
N
A
 
E
L
 
A
V
 
T
A
 
I
V
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
T
G
 
A
F
 
L
I
 
M
G
 
S
W
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
A
T
 
A
A
 
G
D
 
Q
V
 
F
A
 
I
G
 
L
S
 
D
E
 
H
L
 
C
E
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
S
 
Q
L
 
S
A
 
L
P
 
K
R
 
Q
H
 
D
A
 
V
D
 
S
A
 
I
A
 
D
P
 
T
I
 
S
R
 
I
S
 
N
V
 
V
I
 
G
T
 
L
V
 
V
A
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
F
 
T
I
 
F
A
 
V
Y
 
T
D
 
N
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
I
D
 
D
D
 
D
V
 
V
-
 
D
-
 
F
-
 
A
L
 
R
H
 
F
G
 
S
T
 
Q
S
 
A
D
 
K
A
 
L
L
 
L
P
 
S
D
 
L
D
 
A
V
 
S
L
 
I
M
 
F
R
 
N
A
 
S
P
 
P
V
 
-
L
 
-
L
 
L
I
 
L
D
 
D
G
 
G
Y
 
K
A
 
A
T
 
L
H
 
T
S
 
E
E
 
-
S
 
-
V
 
I
V
 
F
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
R
G
 
Q
L
 
M
A
 
I
V
 
I
I
 
C
A
 
A
D
 
D
-
 
M
I
 
I
E
 
K
W
 
P
T
 
R
V
 
L
G
 
N
A
 
E
A
 
T
T
 
L
D
 
D
R
 
D
I
 
I
-
 
C
-
 
E
-
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
Y
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
L
 
L
V
 
F
L
 
P
P
x
N
L
 
F
A
 
A
F
 
E
G
 
A
K
 
K
E
 
L
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
K
G
 
E
D
 
T
P
 
L
T
 
D
M
 
E
I
 
I
L
 
A
D
 
D
K
 
C
L
 
F
W
 
L
S
 
A
K
 
C
D
 
G
R
 
V
S
 
K
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
I
T
x
K
D
 
T
G
|
G
E
 
K
R
 
D
G
|
G
A
 
C
Y
 
F
L
 
I
R
 
K
Q
 
-
R
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
M
T
 
T
R
 
-
W
 
M
H
 
K
V
 
V
P
 
P
A
|
A
Y
 
V
Q
 
A
-
 
G
V
 
I
Q
 
T
A
 
A
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
N
F
 
F
H
 
A
G
 
S
A
 
G
Y
 
F
A
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
N
P
 
L
L
 
R
D
 
E
C
 
C
V
 
A
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
x
N
A
 
A
A
 
T
A
|
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
L
A
 
S
R
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
K
D
 
N
H
 
R
Q
 
K

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
25% identity, 90% coverage: 7:288/313 of query aligns to 16:317/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
V
 
I
L
 
L
G
 
V
F
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
C
A
 
F
I
 
L
D
|
D
D
 
Y
I
 
V
I
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
R
 
H
G
 
-
L
 
-
T
 
M
A
 
P
G
 
Q
K
 
V
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
M
K
 
H
R
x
S
A
 
V
T
x
S
D
 
F
H
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
F
G
|
G
G
|
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
x
N
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
A
 
V
G
 
A
F
 
M
I
 
V
G
 
S
W
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
T
E
 
D
T
 
G
T
 
D
A
 
G
D
 
S
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
A
-
 
Y
-
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
M
R
 
I
H
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
N
S
 
N
V
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
P
D
 
N
G
 
A
D
 
T
R
 
N
F
 
H
I
 
F
A
 
T
Y
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
D
 
E
D
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
T
T
 
G
S
 
L
D
 
K
A
 
Y
L
 
L
P
 
I
D
 
C
D
 
Q
V
 
N
L
 
E
M
 
I
R
 
P
A
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
T
L
 
L
I
 
D
D
 
T
G
 
I
Y
 
K
A
 
E
T
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
R
S
 
G
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
R
 
V
A
 
F
R
 
N
A
 
S
L
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
P
V
 
K
I
 
P
A
 
A
D
 
E
I
 
V
E
 
E
W
 
Q
T
 
I
V
 
K
G
 
P
A
 
F
A
 
L
T
 
P
D
 
Y
R
 
V
I
 
S
L
 
L
A
 
F
V
 
C
A
 
P
D
 
N
H
 
E
L
 
V
V
 
E
L
 
A
P
 
T
L
 
L
A
 
I
F
 
T
G
 
G
K
 
V
E
 
K
Y
 
V
T
 
T
G
 
D
E
 
T
G
 
E
D
 
S
P
 
A
T
 
F
M
 
S
I
 
A
L
 
I
D
 
K
K
 
A
L
 
L
W
 
Q
S
 
Q
K
 
L
D
 
G
R
 
V
S
 
R
A
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
A
G
 
G
A
 
F
Y
 
V
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
-
V
 
A
T
 
E
R
 
P
W
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
T
A
 
G
Y
 
K
Q
 
H
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
L
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
R
S
 
N
P
 
L
L
 
L
D
 
E
C
 
A
V
 
C
A
 
K
Y
 
R
A
 
A
T
x
N
A
 
E
A
 
C
A
|
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
L
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

6a8bA Ribokinase from leishmania donovani with amppcp (see paper)
25% identity, 90% coverage: 7:288/313 of query aligns to 16:317/327 of 6a8bA

query
sites
6a8bA
V
 
I
L
 
L
G
 
V
F
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
C
A
 
F
I
 
L
D
|
D
D
 
Y
I
 
V
I
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
R
 
H
G
 
-
L
 
-
T
 
M
A
 
P
G
 
Q
K
 
V
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
M
K
 
H
R
 
S
A
 
V
T
 
S
D
 
F
H
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
F
G
|
G
G
|
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
x
N
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
A
 
V
G
 
A
F
 
M
I
 
V
G
 
S
W
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
T
E
 
D
T
 
G
T
 
D
A
 
G
D
 
S
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
A
-
 
Y
-
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
M
R
 
I
H
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
N
S
 
N
V
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
P
D
 
N
G
 
A
D
 
T
R
 
N
F
 
H
I
 
F
A
 
T
Y
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
D
 
E
D
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
T
T
 
G
S
 
L
D
 
K
A
 
Y
L
 
L
P
 
I
D
 
C
D
 
Q
V
x
N
L
 
E
M
x
I
R
 
P
A
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
T
L
 
L
I
 
D
D
 
T
G
 
I
Y
 
K
A
 
E
T
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
R
S
 
G
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
R
 
V
A
 
F
R
 
N
A
 
S
L
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
P
V
 
K
I
 
P
A
 
A
D
x
E
I
 
V
E
 
E
W
 
Q
T
 
I
V
 
K
G
 
P
A
 
F
A
 
L
T
 
P
D
 
Y
R
 
V
I
 
S
L
 
L
A
 
F
V
 
C
A
 
P
D
 
N
H
 
E
L
 
V
V
 
E
L
 
A
P
 
T
L
 
L
A
 
I
F
 
T
G
 
G
K
 
V
E
 
K
Y
 
V
T
 
T
G
 
D
E
 
T
G
 
E
D
 
S
P
 
A
T
 
F
M
 
S
I
 
A
L
 
I
D
 
K
K
 
A
L
 
L
W
 
Q
S
 
Q
K
 
L
D
 
G
R
 
V
S
 
R
A
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
A
G
 
G
A
 
F
Y
 
V
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
-
V
 
A
T
 
E
R
 
P
W
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
T
A
 
G
Y
 
K
Q
 
H
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
L
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
R
S
 
N
P
 
L
L
 
L
D
 
E
C
 
A
V
 
C
A
 
K
Y
 
R
A
 
A
T
x
N
A
 
E
A
 
C
A
|
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
|
V
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
L
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

6a8aA Ribokinase from leishmania donovani with atp (see paper)
25% identity, 90% coverage: 7:288/313 of query aligns to 16:317/327 of 6a8aA

query
sites
6a8aA
V
 
I
L
 
L
G
 
V
F
 
V
G
 
G
A
 
S
L
 
C
A
 
F
I
 
L
D
|
D
D
 
Y
I
 
V
I
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
R
 
H
G
 
-
L
 
-
T
 
M
A
 
P
G
 
Q
K
 
V
G
 
G
K
 
E
V
 
T
T
 
M
K
 
H
R
 
S
A
 
V
T
 
S
D
 
F
H
 
H
-
 
K
-
 
G
-
 
F
G
|
G
G
|
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
x
N
A
 
Q
L
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
A
 
V
G
 
A
F
 
M
I
 
V
G
 
S
W
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
T
E
 
D
T
 
G
T
 
D
A
 
G
D
 
S
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
A
-
 
Y
-
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
M
R
 
I
H
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
K
P
 
S
I
 
S
R
 
N
S
 
N
V
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
P
D
 
N
G
 
A
D
 
T
R
 
N
F
 
H
I
 
F
A
 
T
Y
 
P
D
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
D
 
E
D
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
T
T
 
G
S
 
L
D
 
K
A
 
Y
L
 
L
P
 
I
D
 
C
D
 
Q
V
 
N
L
 
E
M
 
I
R
 
P
A
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
T
L
 
L
I
 
D
D
 
T
G
 
I
Y
 
K
A
 
E
T
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
R
S
 
G
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
R
 
V
A
 
F
R
 
N
A
 
S
L
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
P
V
 
K
I
 
P
A
 
A
D
 
E
I
 
V
E
 
E
W
 
Q
T
 
I
V
 
K
G
 
P
A
 
F
A
 
L
T
 
P
D
 
Y
R
 
V
I
 
S
L
 
L
A
 
F
V
 
C
A
 
P
D
x
N
H
 
E
L
 
V
V
 
E
L
 
A
P
 
T
L
 
L
A
 
I
F
 
T
G
 
G
K
 
V
E
 
K
Y
 
V
T
 
T
G
 
D
E
 
T
G
 
E
D
 
S
P
 
A
T
 
F
M
 
S
I
 
A
L
 
I
D
 
K
K
 
A
L
 
L
W
 
Q
S
 
Q
K
 
L
D
 
G
R
 
V
S
 
R
A
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
A
G
|
G
A
 
F
Y
 
V
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
-
V
 
A
T
 
E
R
 
P
W
 
V
H
 
H
V
 
V
P
 
T
A
 
G
Y
 
K
Q
 
H
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
C
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
S
Y
 
M
A
 
V
L
 
Y
A
 
F
L
 
M
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
R
S
 
N
P
 
L
L
 
L
D
 
E
C
 
A
V
 
C
A
 
K
Y
 
R
A
 
A
T
x
N
A
 
E
A
 
C
A
|
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
|
V
T
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
L
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
36% identity, 28% coverage: 210:297/313 of query aligns to 288:375/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
V
 
V
V
 
L
L
 
V
T
 
K
D
 
L
G
 
G
E
 
S
R
 
K
G
 
G
A
 
S
-
 
A
-
 
L
Y
 
F
L
 
I
R
 
Q
Q
 
G
R
 
E
A
 
K
D
 
P
V
 
I
T
 
Q
R
 
Q
W
 
S
H
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
-
A
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
T
F
 
F
H
 
T
G
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
V
R
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
H
L
 
E
D
 
E
C
 
C
V
 
L
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
L
S
 
C
V
 
V
T
 
Q
A
 
V
R
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
I
R
 
P
G
 
S
L
 
M
P
 
P
D
 
D
H
 
R
Q
 
K
T
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
K
W
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
36% identity, 28% coverage: 210:297/313 of query aligns to 222:309/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
V
 
V
V
 
L
L
 
V
T
x
K
D
 
L
G
|
G
E
 
S
R
 
K
G
 
G
A
 
S
-
 
A
-
 
L
Y
 
F
L
 
I
R
 
Q
Q
 
G
R
 
E
A
 
K
D
 
P
V
 
I
T
 
Q
R
 
Q
W
 
S
H
 
I
V
x
I
P
 
P
A
|
A
Y
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
-
A
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
T
F
|
F
H
 
T
G
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
V
R
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
H
L
 
E
D
 
E
C
 
C
V
 
L
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
|
A
A
x
S
I
 
L
S
 
C
V
 
V
T
 
Q
A
 
V
R
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
I
R
 
P
G
 
S
L
 
M
P
 
P
D
 
D
H
 
R
Q
 
K
T
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
K
W
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9H477 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Homo sapiens (Human)
25% identity, 80% coverage: 39:288/313 of query aligns to 51:312/322 of Q9H477

query
sites
Q9H477
H
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
x
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
x
L
G
|
G
E
x
A
R
x
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
x
T
Y
 
E
Q
 
K
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

5byfA Crystal structure of human ribokinase in complex with amp
25% identity, 80% coverage: 40:288/313 of query aligns to 40:300/313 of 5byfA

query
sites
5byfA
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
 
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
T
Y
 
E
Q
 
K
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
 
A
I
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

6wjzA Crystal structure of human ribokinase in complex with ampcp
25% identity, 80% coverage: 40:288/313 of query aligns to 39:299/315 of 6wjzA

query
sites
6wjzA
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
x
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
x
T
Y
 
E
Q
 
K
V
|
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
|
A
I
 
V
S
 
S
V
|
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

2fv7A Crystal structure of human ribokinase
25% identity, 80% coverage: 39:288/313 of query aligns to 37:298/308 of 2fv7A

query
sites
2fv7A
H
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
x
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
 
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
x
T
Y
 
E
Q
 
K
V
|
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
|
A
I
 
V
S
 
S
V
|
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

5c3yA Structure of human ribokinase crystallized with amppnp
25% identity, 80% coverage: 39:288/313 of query aligns to 37:298/306 of 5c3yA

query
sites
5c3yA
H
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
 
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
T
Y
 
E
Q
 
K
V
|
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
|
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
|
A
I
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

6wk0B Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp and ribose
25% identity, 80% coverage: 39:288/313 of query aligns to 38:299/311 of 6wk0B

query
sites
6wk0B
H
 
F
G
 
G
G
|
G
N
x
K
V
 
G
A
 
A
T
x
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
x
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
x
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
x
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
x
T
Y
 
E
Q
 
K
V
|
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
|
A
I
 
V
S
 
S
V
|
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5c41A Crystal structure of human ribokinase in complex with amppcp in p21 spacegroup and with 4 protomers
25% identity, 80% coverage: 39:288/313 of query aligns to 38:299/317 of 5c41A

query
sites
5c41A
H
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
K
V
 
G
A
 
A
T
 
N
A
 
Q
L
 
C
V
 
V
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
M
A
 
T
G
 
S
F
 
M
I
 
V
G
 
C
W
 
K
L
 
V
G
 
G
D
 
K
E
 
D
T
 
S
T
 
F
A
 
G
D
 
N
V
 
D
A
 
Y
G
 
I
S
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
K
R
 
Q
D
 
N
G
 
D
V
 
I
D
 
S
I
 
T
S
 
E
L
 
F
A
 
T
P
 
Y
R
 
Q
H
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
T
I
 
G
R
 
T
S
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
N
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
F
 
I
I
 
I
A
 
V
Y
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
G
D
 
A
D
 
N
V
 
L
L
 
L
H
 
L
G
 
N
T
 
T
S
 
E
D
 
D
A
 
L
-
 
R
L
 
A
P
 
A
D
 
A
D
 
N
V
 
V
L
 
I
M
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
C
D
 
Q
G
 
L
Y
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
P
S
 
A
E
 
T
S
 
S
V
 
L
V
 
E
A
 
A
-
 
L
-
 
T
R
 
M
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
T
I
 
L
A
 
F
D
 
N
I
 
P
E
 
A
W
 
P
T
 
A
V
 
I
G
 
A
A
 
D
A
 
L
T
 
D
D
 
P
R
 
Q
I
 
F
L
 
Y
A
 
T
V
 
L
A
 
S
D
 
D
H
 
V
L
 
F
V
 
C
L
 
C
P
x
N
L
 
E
A
 
S
F
 
E
G
 
A
K
 
E
E
 
I
Y
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
A
G
 
G
D
 
E
P
 
A
T
 
A
M
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
L
K
 
K
L
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
R
D
 
G
R
 
C
S
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
E
x
A
R
 
E
G
|
G
A
 
C
Y
 
V
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
R
 
Q
A
 
T
D
 
E
V
 
P
T
 
E
R
 
P
W
 
K
H
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
T
Y
 
E
Q
 
K
V
|
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
H
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
-
 
Y
-
 
P
G
 
N
K
 
L
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
D
C
 
M
V
 
L
A
 
N
Y
 
R
A
 
S
T
x
N
A
 
F
A
 
I
A
|
A
A
|
A
I
 
V
S
 
S
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
Q
R
 
S
G
 
S
L
 
Y
P
 
P

3uboA The crystal structure of adenosine kinase from sinorhizobium meliloti
23% identity, 78% coverage: 40:284/313 of query aligns to 57:314/338 of 3uboA

query
sites
3uboA
G
|
G
G
|
G
N
x
S
V
 
A
A
 
G
T
x
N
A
 
T
L
 
A
V
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
I
 
F
G
 
G
W
 
K
L
 
V
G
 
A
D
 
D
E
 
D
T
 
Q
T
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
I
A
 
F
G
 
T
S
 
H
E
 
D
L
 
I
E
 
R
R
 
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
H
I
 
F
S
 
Q
L
 
T
A
 
K
P
 
P
R
 
L
H
 
D
A
 
G
D
 
H
A
 
P
A
 
P
P
 
T
I
 
A
R
 
R
S
 
S
V
 
M
I
 
I
T
 
F
V
 
V
A
 
T
P
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
F
 
S
I
x
M
-
 
N
A
x
T
Y
 
Y
D
 
L
D
 
G
D
 
A
V
 
C
L
 
V
H
 
E
G
 
L
T
 
G
S
 
P
D
 
E
A
 
D
L
 
V
P
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
V
M
 
A
R
 
Q
A
 
S
P
 
K
V
 
V
L
 
T
L
 
Y
I
 
F
D
x
E
G
 
G
Y
|
Y
-
 
L
-
 
W
-
 
D
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
D
A
 
A
T
 
I
H
 
R
S
 
E
E
 
A
S
 
A
V
 
R
V
 
I
A
 
A
R
 
H
A
 
A
R
 
H
A
 
G
L
 
R
G
 
E
L
 
T
A
 
A
V
 
M
I
 
T
A
 
L
D
 
S
I
 
D
E
 
S
W
 
F
T
 
C
V
 
V
G
 
H
A
 
R
A
 
Y
T
 
R
D
 
S
R
 
E
I
 
F
L
 
L
A
 
E
V
 
L
A
 
M
D
 
R
H
 
S
L
 
G
V
 
T
L
 
V
P
 
D
L
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
A
K
x
N
E
 
R
Y
 
Q
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
G
 
E
E
 
D
G
 
F
D
 
D
P
 
R
T
 
A
M
 
L
I
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
E
L
 
L
W
 
L
S
 
A
K
 
R
D
 
D
R
 
C
S
 
K
A
 
L
V
 
A
V
 
A
L
 
V
T
|
T
D
 
L
G
x
S
E
|
E
R
 
E
G
|
G
A
 
S
Y
 
V
L
 
V
R
 
V
Q
 
R
R
 
G
A
 
A
D
 
E
V
 
R
T
 
V
R
 
R
W
 
V
H
 
G
V
 
A
P
 
S
A
 
V
Y
x
L
Q
 
E
V
 
-
Q
 
Q
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
C
 
L
F
 
Y
H
 
A
G
 
A
A
 
G
Y
 
F
A
 
L
L
 
F
A
 
G
L
 
Y
A
 
T
R
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
C
 
C
V
 
S
A
 
K
Y
 
L
A
 
G
T
x
N
A
 
L
A
 
A
A
|
A
A
 
G
I
 
I
S
 
V
V
x
I
T
 
G
A
 
Q
R
 
I
G
 
G
G
x
P
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011648824.1 NCBI__GCF_000009265.1:WP_011648824.1
MSRPFQVLGFGALAIDDIIYVDRGLTAGKGKVTKRATDHGGNVATALVAVARLGGQAGFI
GWLGDETTADVAGSELERDGVDISLAPRHADAAPIRSVITVAPDGDRFIAYDDDVLHGTS
DALPDDVLMRAPVLLIDGYATHSESVVARARALGLAVIADIEWTVGAATDRILAVADHLV
LPLAFGKEYTGEGDPTMILDKLWSKDRSAVVLTDGERGAYLRQRADVTRWHVPAYQVQAV
DTTGAGDCFHGAYALALARGKSPLDCVAYATAAAAISVTARGGRRGLPDHQTCLTWMAAE
NAPAPLPMPGYQK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory