SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011651407.1 NCBI__GCF_000009265.1:WP_011651407.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:253/256 of query aligns to 5:244/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
N
 
S
F
 
F
S
 
D
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
C
A
x
D
S
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
A
 
A
S
 
I
A
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
G
 
G
A
 
C
-
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
N
D
x
I
I
 
V
N
 
E
E
 
P
T
 
K
V
 
D
A
 
T
K
 
I
S
 
E
K
 
K
A
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
N
 
R
G
 
R
A
 
F
K
 
L
S
 
S
F
 
L
V
 
T
C
 
A
D
|
D
V
x
M
S
 
S
N
 
N
P
 
V
Q
 
S
S
 
G
V
 
H
E
 
A
A
 
E
V
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
K
A
 
A
Q
 
V
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
A
 
I
M
 
R
L
 
R
A
 
E
P
 
D
A
 
A
E
 
I
D
 
E
L
 
F
T
 
S
L
 
E
E
 
K
A
 
N
W
 
W
D
 
D
R
 
D
T
 
V
I
 
M
D
 
N
I
x
L
N
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
F
V
 
M
S
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
G
 
A
R
 
R
V
 
Q
M
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
L
G
 
S
T
 
F
V
 
Q
A
 
G
I
 
G
D
 
I
Q
 
R
H
 
V
V
 
P
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
S
G
 
A
V
 
V
I
 
M
G
 
G
L
 
V
S
 
T
K
 
R
T
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
x
G
V
 
Y
V
x
M
L
 
A
T
|
T
E
 
N
L
x
N
G
 
T
R
 
Q
K
 
E
A
 
-
W
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
R
G
 
S
E
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
L
K
 
D
R
 
R
I
 
I
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
G
Y
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
L
A
 
M
A
 
G
A
 
P
A
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
A
A
 
S
E
 
D
M
 
Y
I
 
I
N
 
N
G
 
G
A
 
Y
D
 
T
L
 
I
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:256/256 of query aligns to 4:247/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
F
 
M
S
 
N
L
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
M
V
 
A
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
I
Q
 
T
A
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
E
A
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
T
 
I
I
 
M
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
R
 
R
V
 
G
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
F
V
x
I
L
 
E
T
|
T
E
 
D
L
x
M
G
 
T
R
 
K
K
 
A
A
 
L
W
 
N
D
 
D
N
 
E
P
 
Q
R
 
R
G
 
T
E
 
A
E
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
I

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:256/256 of query aligns to 1:244/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
F
 
M
S
 
S
L
 
F
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
L
V
 
M
C
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
A
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
T
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
F
V
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
T
D
 
D
N
 
E
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
A
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
S
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
V

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
43% identity, 96% coverage: 7:252/256 of query aligns to 2:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
I
 
M
D
 
D
L
 
L
N
 
T
F
 
Q
S
 
R
L
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
S
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
R
A
 
A
K
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
G
D
|
D
I
|
I
N
 
D
E
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
G
K
 
K
S
 
A
K
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
G
 
E
N
 
G
G
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
L
F
 
F
V
 
V
-
 
P
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
E
P
 
Q
Q
 
E
S
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
N
V
 
L
I
 
F
A
 
D
A
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
S
A
 
T
F
 
F
A
 
G
H
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
F
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
S
M
 
-
L
 
-
A
 
P
P
 
P
A
 
E
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
D
L
 
L
E
 
P
A
 
A
W
 
W
D
 
Q
R
 
R
T
 
V
I
 
Q
D
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
S
T
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
S
S
 
C
Q
 
R
A
 
A
V
 
A
G
 
L
R
 
R
V
 
H
M
 
M
L
 
V
K
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
S
R
 
-
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
F
A
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
M
-
 
G
A
 
S
I
 
A
D
 
T
Q
 
S
H
x
Q
V
 
I
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
A
L
 
M
S
 
S
K
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
V
E
 
Q
W
 
Y
G
 
A
K
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
L
S
 
C
P
|
P
T
 
G
V
x
P
V
|
V
L
 
N
T
 
T
E
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
Q
K
 
E
-
 
L
-
 
F
A
 
A
W
 
K
D
 
D
N
 
P
P
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
A
E
 
R
L
 
R
K
 
L
K
 
V
R
 
H
I
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
D
A
 
A
E
 
S
M
 
F
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
T
L
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
40% identity, 97% coverage: 9:256/256 of query aligns to 1:244/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
M
N
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
N
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
L
V
 
M
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
E
A
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
T
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
G
Q
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
F
V
x
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
S
D
 
D
N
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
I
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
V

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:256/256 of query aligns to 1:243/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
N
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
N
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
L
V
 
M
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
E
A
x
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
T
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
G
Q
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
F
V
x
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
S
D
 
D
N
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
I
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
x
E
D
x
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
V

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:256/256 of query aligns to 4:243/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
F
 
M
S
 
N
L
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
M
V
 
A
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
I
Q
 
T
A
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
E
A
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
T
 
I
I
 
M
D
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
R
 
R
V
 
G
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
F
V
 
I
L
 
E
T
|
T
E
 
D
L
 
M
G
 
N
R
 
-
K
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
D
N
 
E
P
 
Q
R
 
R
G
 
T
E
 
A
E
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
I

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:256/256 of query aligns to 1:244/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
F
 
M
S
 
S
L
 
F
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
E
 
E
T
 
N
V
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
N
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
L
V
 
M
C
 
L
D
 
N
V
 
V
S
 
T
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
A
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
T
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
R
V
 
A
M
|
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
F
V
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
S
D
 
D
N
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
I
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
S
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
V

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
39% identity, 95% coverage: 11:254/256 of query aligns to 2:250/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
S
 
D
L
 
L
G
 
R
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
D
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
Q
A
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
C
V
 
S
V
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
A
D
x
S
I
x
R
N
 
N
E
 
L
T
 
E
V
 
E
A
 
A
K
 
S
S
 
E
K
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
G
N
 
V
G
 
E
A
 
T
K
 
M
S
 
A
F
 
F
V
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
N
 
N
P
 
Y
Q
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
K
V
 
L
I
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
K
F
 
F
A
 
G
H
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
T
V
 
V
V
 
V
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
N
M
 
R
L
 
R
A
 
H
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
F
T
 
P
L
 
L
E
 
D
A
 
E
W
 
F
D
 
R
R
 
Q
T
 
V
I
 
I
D
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
F
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
L
 
Y
V
 
V
S
 
C
Q
 
R
A
 
E
V
 
A
G
 
F
R
 
S
V
 
-
M
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
S
K
 
D
G
 
N
G
 
P
R
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
-
 
L
Q
 
T
A
 
V
G
 
E
T
 
E
V
 
V
A
 
T
I
 
M
D
 
P
Q
 
N
H
x
I
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
A
G
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
E
W
 
W
G
 
G
K
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
I
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
W
V
x
Y
L
 
R
T
|
T
E
 
K
L
x
M
G
x
T
R
 
E
K
 
A
A
 
V
W
 
F
D
 
S
N
 
D
P
 
P
-
 
E
R
 
K
G
 
L
E
 
D
E
 
Y
L
 
M
K
 
L
K
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
T
A
 
G
Y
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
K
A
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
E
G
 
E
A
 
A
E
 
K
M
 
Y
I
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
I
L
 
I
L
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:256/256 of query aligns to 1:243/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
N
 
N
F
 
F
S
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
x
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
N
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
L
V
 
M
C
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
E
A
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
T
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
G
Q
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
x
F
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
F
V
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
S
D
 
D
N
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
I
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
V

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 95% coverage: 11:254/256 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
F
 
M
S
 
N
L
 
L
G
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
G
K
 
Q
G
 
Q
A
 
A
V
 
N
V
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
E
 
E
T
 
A
V
 
Q
A
 
G
K
 
E
S
 
A
K
 
M
A
 
V
D
 
R
A
 
K
L
 
E
G
 
N
N
 
N
G
 
D
A
 
R
K
 
L
S
 
H
F
 
F
V
 
V
-
 
Q
C
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
N
 
D
P
 
E
Q
 
A
S
 
A
V
 
C
E
 
Q
A
 
H
V
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
S
A
 
A
Q
 
V
A
 
H
A
 
T
F
 
F
A
 
G
H
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
A
 
E
M
 
I
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
T
 
V
I
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
S
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
G
 
L
R
 
K
V
 
H
M
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
-
G
 
G
R
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
T
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
W
D
 
P
Q
 
D
H
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
D
W
 
Y
G
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
C
I
 
V
S
 
C
P
|
P
T
x
G
V
x
I
V
x
I
L
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
G
 
N
R
 
E
K
 
K
A
 
S
W
 
F
-
 
L
D
 
E
N
 
N
P
 
N
R
 
E
G
 
G
-
 
T
-
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
K
 
K
K
 
K
R
 
E
I
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
N
P
 
P
T
 
L
G
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
L
A
 
S
E
 
S
M
 
Y
I
 
M
N
 
T
G
 
G
A
 
S
D
 
A
L
 
I
L
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
43% identity, 94% coverage: 13:252/256 of query aligns to 4:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
I
V
 
V
I
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
E
 
A
T
 
E
V
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
A
K
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
A
F
 
I
V
 
A
C
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
S
N
 
D
P
 
P
Q
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
F
 
T
A
 
G
H
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
x
S
V
 
I
A
 
V
M
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
A
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
H
W
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
S
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
G
 
T
R
 
D
V
 
Q
M
 
M
L
 
R
K
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
I
|
I
A
 
A
S
|
S
Q
x
N
A
x
T
G
 
F
T
 
F
V
 
A
A
 
G
I
 
T
D
 
P
Q
 
N
H
x
M
V
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
T
 
A
I
 
V
S
 
T
P
|
P
T
 
G
V
x
L
V
x
I
L
 
E
T
x
S
E
 
D
L
 
-
G
|
G
R
x
V
K
 
K
A
 
A
W
 
-
D
 
-
N
 
S
P
 
P
R
x
H
G
 
N
E
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
V
E
 
E
L
 
M
K
 
L
K
 
Q
R
 
A
I
 
M
P
 
K
T
 
-
G
 
G
R
 
K
F
 
-
A
 
G
Y
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
D
A
 
A
E
 
R
M
 
W
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
T
L
 
L
L
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
43% identity, 94% coverage: 13:252/256 of query aligns to 4:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
I
V
 
V
I
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
E
 
A
T
 
E
V
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
A
K
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
K
G
 
K
A
 
A
K
 
R
S
 
A
F
 
I
V
 
A
C
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
S
N
 
D
P
 
P
Q
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
L
F
 
T
A
 
G
H
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
x
S
V
 
I
A
 
V
M
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
A
 
W
E
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
H
W
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
I
I
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
S
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
G
G
 
T
R
 
D
V
 
Q
M
 
M
L
 
R
K
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
I
|
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
N
A
 
T
G
 
F
T
 
F
V
 
A
A
 
G
I
 
T
D
 
P
Q
 
N
H
 
M
V
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
T
 
A
I
 
V
S
 
T
P
|
P
T
 
G
V
x
L
V
x
I
L
 
E
T
x
S
E
 
D
L
 
-
G
|
G
R
x
V
K
 
K
A
 
A
W
 
-
D
 
-
N
 
S
P
 
P
R
 
H
G
 
N
E
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
V
E
 
E
L
 
M
K
 
L
K
 
Q
R
 
A
I
 
M
P
 
K
T
 
-
G
 
G
R
 
K
F
 
-
A
 
G
Y
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
D
A
 
A
E
 
R
M
 
W
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
T
L
 
L
L
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
40% identity, 95% coverage: 11:253/256 of query aligns to 3:246/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
S
 
S
L
 
L
G
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
H
A
 
G
F
 
Y
A
 
A
A
 
R
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
H
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
W
G
 
G
V
x
R
I
 
T
D
 
D
I
 
G
N
 
V
E
 
K
T
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
D
S
 
E
K
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
-
G
 
G
N
 
G
G
 
S
A
 
A
K
 
E
S
 
A
F
 
V
V
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
A
N
 
D
P
 
L
Q
 
E
S
 
G
V
 
A
E
 
-
A
 
A
V
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
T
A
 
R
H
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
A
 
I
M
 
A
L
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
G
A
 
R
W
 
W
D
 
R
R
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
T
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
A
T
 
A
F
 
W
L
 
V
V
 
L
S
 
S
Q
 
R
A
 
S
V
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
H
G
 
G
K
 
S
G
 
G
G
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
I
|
I
A
|
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
L
G
 
S
T
 
F
V
 
Q
A
 
G
I
 
G
D
 
R
Q
 
N
H
x
V
V
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
G
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
L
S
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
Y
V
|
V
L
 
V
T
|
T
-
 
A
-
x
N
E
x
T
L
 
A
G
 
A
R
 
L
K
 
R
A
 
A
W
 
-
D
 
D
N
 
D
P
 
E
R
 
R
G
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
T
K
 
A
R
 
R
I
 
I
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
M
A
 
V
A
 
G
A
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
A
A
 
A
E
 
S
M
 
Y
I
 
V
N
 
H
G
 
G
A
 
Q
D
 
V
L
 
L
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
39% identity, 94% coverage: 13:252/256 of query aligns to 4:253/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
L
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
F
A
 
A
S
 
E
A
 
A
F
 
Y
A
 
V
A
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
I
I
 
A
D
 
D
I
 
I
N
 
D
E
 
I
T
 
E
V
 
R
A
 
A
K
 
R
S
 
Q
K
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
E
L
 
I
G
 
G
N
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
Y
S
 
A
F
 
V
V
 
Q
C
 
M
D
 
D
V
 
V
S
 
T
N
 
R
P
 
Q
Q
 
D
S
 
S
V
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
T
Q
 
V
A
 
E
A
 
H
F
 
A
A
 
G
H
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
V
 
L
A
 
F
M
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
I
E
 
V
D
 
E
L
 
I
T
 
T
L
 
R
E
 
E
A
 
S
W
 
Y
D
 
E
R
 
K
T
 
L
I
 
F
D
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
L
L
 
F
V
 
T
S
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
G
 
A
R
 
R
V
 
Q
M
 
M
L
 
I
K
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
R
A
 
G
I
x
E
D
 
A
Q
 
L
H
 
V
V
 
A
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
Q
T
 
S
L
 
A
A
 
G
A
 
L
E
 
D
W
 
L
G
 
I
K
 
K
H
 
H
G
 
R
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
D
T
 
G
E
 
E
-
x
H
-
x
W
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
A
L
 
L
G
x
F
R
 
A
K
 
R
A
 
Y
W
 
E
D
 
N
N
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
-
L
 
-
K
 
K
K
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
A
I
 
V
P
 
P
T
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
M
A
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
M
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
G
 
E
A
 
S
E
 
D
M
 
Y
I
 
I
N
 
V
G
 
S
A
 
Q
D
 
T
L
 
Y
L
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
39% identity, 96% coverage: 12:256/256 of query aligns to 1:243/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
S
 
S
L
 
F
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
G
A
 
A
K
 
E
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
G
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
F
V
 
M
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
K
N
 
D
P
 
A
Q
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
D
A
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
E
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
D
E
 
D
A
 
E
W
 
W
D
 
E
R
 
D
T
 
I
I
 
L
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
T
 
V
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
M
R
 
C
V
 
A
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
Y
V
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
R
K
 
A
A
 
L
W
 
T
D
 
D
N
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
A
E
 
G
E
 
I
L
 
L
K
 
S
K
 
S
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
N
R
 
R
F
 
P
A
 
G
Y
 
D
P
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
E
A
 
A
E
 
G
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
Y
I
 
M
V
 
I

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
39% identity, 95% coverage: 13:256/256 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
G
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
S
 
H
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
V
I
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
E
 
E
T
 
D
V
 
H
A
 
G
K
 
N
S
 
K
K
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
D
L
 
I
G
 
K
-
 
A
-
 
Q
N
 
G
G
 
G
A
 
E
K
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
-
 
K
C
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
E
V
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
R
A
 
T
Q
 
V
A
 
E
A
 
I
F
 
Y
A
 
G
H
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
V
 
C
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
G
-
 
G
M
 
E
L
 
Q
A
 
A
P
 
L
A
 
A
E
 
G
D
 
D
L
 
Y
T
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
S
W
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
V
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
Y
V
 
G
S
 
C
Q
 
K
A
 
Y
V
 
E
G
 
L
R
 
E
V
 
Q
M
 
M
L
 
E
K
 
K
A
 
N
G
 
G
K
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
P
Q
 
L
H
 
S
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
F
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
K
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
T
 
A
I
 
V
S
 
G
P
|
P
T
x
A
V
x
Y
V
x
I
L
 
E
T
 
T
E
 
P
L
|
L
G
 
-
R
 
L
K
 
E
A
 
S
W
 
L
D
 
T
N
 
K
P
 
E
R
 
M
G
 
K
E
 
E
E
 
A
L
 
L
K
 
I
K
 
S
R
 
K
I
 
H
P
 
P
T
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
S
 
E
G
 
K
A
 
S
E
 
S
M
 
F
I
 
M
N
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
Y
L
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
A
V
 
V

3tzcA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg)(y155f) from vibrio cholerae (see paper)
40% identity, 95% coverage: 11:252/256 of query aligns to 4:222/224 of 3tzcA

query
sites
3tzcA
F
 
M
S
 
N
L
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
I
V
 
G
I
 
T
D
x
A
I
x
T
N
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
G
A
 
A
K
 
Q
S
 
A
K
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
D
G
 
N
A
 
G
K
 
K
S
 
G
F
 
M
V
 
A
C
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
I
Q
 
T
A
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
G
H
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
M
A
 
R
P
 
M
A
 
K
E
 
E
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
T
 
I
I
 
M
D
 
E
I
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
L
R
 
R
V
 
G
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
-
K
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
G
S
 
S
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
Y
 
V
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
F
V
 
I
L
 
E
T
 
T
E
 
D
L
 
M
G
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
D
N
 
E
P
 
Q
R
 
R
G
 
T
E
 
A
E
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
R
 
-
I
 
V
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
Y
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
G
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3o03A Quaternary complex structure of gluconate 5-dehydrogenase from streptococcus suis type 2 (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:252/256 of query aligns to 6:245/254 of 3o03A

query
sites
3o03A
N
 
Q
F
 
F
S
 
S
L
 
L
G
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
S
S
x
Y
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
I
G
 
V
V
 
F
I
 
N
D
|
D
I
|
I
N
 
N
-
 
Q
E
 
E
T
x
L
V
 
V
A
 
D
K
 
R
S
 
G
K
 
M
A
 
A
-
 
A
-
 
Y
D
 
K
A
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
I
G
 
N
A
 
A
K
 
H
S
 
G
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
N
 
D
P
 
E
Q
 
D
S
 
G
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
I
 
V
A
 
A
A
 
Q
A
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
E
F
 
V
A
 
G
H
 
I
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
A
x
I
M
 
R
L
x
R
A
 
V
P
 
P
A
 
M
E
 
I
D
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
A
E
 
A
A
 
Q
W
 
F
D
 
R
R
 
Q
T
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
I
N
 
D
L
 
L
K
 
N
G
 
A
T
 
P
F
 
F
L
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
I
R
 
P
V
 
S
M
 
M
L
 
I
K
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
H
G
 
-
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
C
S
|
S
Q
x
M
A
x
M
G
 
S
T
 
E
V
 
L
A
 
G
I
x
R
D
 
E
Q
 
T
H
x
V
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
F
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
K
G
 
M
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
S
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
K
 
E
H
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
C
N
 
N
T
 
G
I
 
I
S
 
G
P
|
P
T
 
G
V
 
Y
V
 
I
L
 
A
T
 
T
E
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
W
 
Q
D
 
T
N
 
H
P
 
P
R
 
F
G
 
D
E
 
Q
E
 
F
L
 
I
K
 
I
K
 
A
R
 
K
I
 
T
P
 
P
T
 
A
G
 
A
R
 
R
F
 
W
A
 
G
Y
 
E
P
 
A
E
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
M
A
 
G
A
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
A
A
 
S
E
 
N
M
 
F
I
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
H
D
 
I
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 96% coverage: 11:255/256 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
M
S
 
T
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
D
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
G
|
G
V
x
S
I
 
P
D
 
E
I
 
A
N
 
A
E
 
E
T
 
E
V
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
L
K
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
H
L
 
-
G
 
G
N
 
V
G
 
E
A
 
V
K
 
E
S
 
A
F
 
M
V
 
K
C
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
N
 
I
P
 
A
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
F
I
 
F
A
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
I
A
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
G
H
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
A
 
T
M
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
T
 
K
L
 
E
E
 
D
A
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
T
 
V
I
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
V
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
R
V
 
T
M
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
Q
G
 
-
K
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
T
 
L
V
 
I
A
 
G
I
 
N
D
 
A
Q
 
G
H
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
F
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
K
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
T
 
G
V
 
F
V
x
I
L
 
T
T
|
T
E
 
D
L
 
M
G
 
T
R
 
D
K
 
K
A
 
-
W
 
L
D
 
D
N
 
E
P
 
K
R
 
T
G
 
K
E
 
E
E
 
A
L
 
M
K
 
L
K
 
A
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
A
 
G
Y
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
G
 
A
A
 
S
E
 
K
M
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
A
 
Q
D
 
T
L
 
L
L
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
T
 
V
I
 
M

Query Sequence

>WP_011651407.1 NCBI__GCF_000009265.1:WP_011651407.1
MTDSKQIDLNFSLGGKVALVTGGASGIGDAIASAFAAKGAVVGVIDINETVAKSKADALG
NGAKSFVCDVSNPQSVEAVIAAAQAAFAHIDIVVNSAGVAMLAPAEDLTLEAWDRTIDIN
LKGTFLVSQAVGRVMLKAGKGGRIINIASQAGTVAIDQHVAYCASKFGVIGLSKTLAAEW
GKHGITVNTISPTVVLTELGRKAWDNPRGEELKKRIPTGRFAYPEEIAAAAVFLASSGAE
MINGADLLVDGGYTIV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory