SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011735476.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011735476.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2q5oA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp and phenylpyruvate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:524/545 of query aligns to 4:513/529 of 2q5oA

query
sites
2q5oA
I
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
D
L
 
R
R
 
G
V
 
A
Q
 
Q
H
 
A
A
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
A
L
 
L
G
 
P
F
 
F
Y
 
F
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
I
 
I
K
 
L
I
 
P
I
 
L
N
 
H
T
 
T
C
 
L
D
 
S
-
 
H
E
|
E
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
R
|
R
V
 
Y
R
 
S
G
 
S
-
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
V
x
A
G
 
G
G
 
A
L
 
F
K
 
N
V
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
A
T
 
V
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
T
E
 
E
Q
 
G
A
 
N
G
 
A
N
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
Q
V
x
G
K
x
R
E
x
T
F
x
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
Q
 
K
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
R
L
 
L
D
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
K
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
Y
 
Q
R
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
|
R
D
 
N
M
 
M
V
 
V
T
 
N
V
 
A
K
 
E
I
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
Q
 
G
E
 
D
E
 
D
P
 
P
L
 
A
Q
 
W
P
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
D
P
 
A
F
 
L
R
 
A
E
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
A
M
 
A
I
 
M
N
 
R
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
C
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
x
R
R
|
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
K
 
R
T
 
L
N
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
x
M
G
 
G
K
 
R
S
x
G
A
 
L
M
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
H
 
P
P
 
T
G
 
P
Y
 
P
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
I
G
 
G
G
x
V
L
 
A
S
 
G
R
 
D
E
 
A
D
 
E
I
 
I
R
 
T
Q
 
R
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
S
D
 
D
C
 
G
I
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
x
T
D
x
N
L
 
F
G
 
A
I
 
V
F
 
S
T
 
Q
A
 
R
H
 
K
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
T
 
F
S
 
D
E
 
R
K
 
A
T
 
V
S
 
T
I
 
L
R
 
G
H
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
P
 
A
G
 
D
V
 
I
Y
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
R
T
 
L
C
 
P
E
 
P
T
 
S
P
 
P
H
 
H
A
 
A
P
 
-
A
 
Y
P
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
E
P
 
P
F
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
M
P
 
D
D
 
I
T
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
V
V
 
N
E
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
R
Q
 
A
R
 
G
L
 
Q
E
 
E
T
 
P
F
 
L
F
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
L
V
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
D
T
x
M
G
 
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
F
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
M
D
 
D
I
 
M
S
 
I
I
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
A
E
 
G
F
x
L
M
|
M
S
x
A
S
 
P
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
S
 
G
L
x
M
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
L
 
S
P
 
G
T
 
G
L
 
K
R
 
R
P
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
M
 
W
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
Y
 
L
H
 
G
L
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
F
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
x
S
Y
x
W
G
x
E
T
x
M
E
x
L
R
 
R
P
 
T
M
x
F
L
 
Q
-
 
P
D
 
E
G
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
V
 
L
Y
 
D
P
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
M
P
 
A
E
 
A
L
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
-
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
V
D
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
F
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
R
F
 
F
C
 
Q
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
A
R
 
M
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2q5qA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp and 5-phenyl-2-oxo-valeric acid (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:524/545 of query aligns to 5:518/533 of 2q5qA

query
sites
2q5qA
I
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
D
L
 
R
R
 
G
V
 
A
Q
 
Q
H
 
A
A
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
A
L
 
L
G
 
P
F
 
F
Y
 
F
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
I
 
I
K
 
L
I
 
P
I
 
L
N
 
H
T
 
T
C
 
L
D
 
S
-
 
H
E
|
E
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
R
|
R
V
 
Y
R
 
S
G
 
S
-
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
V
x
A
G
 
G
G
 
A
L
 
F
K
 
N
V
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
A
T
 
V
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
T
E
 
E
Q
 
G
A
 
N
G
 
A
N
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
Q
V
x
G
K
x
R
E
x
T
F
x
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
Q
 
K
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
R
L
 
L
D
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
K
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
Y
 
Q
R
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
|
R
D
 
N
M
 
M
V
 
V
T
 
N
V
 
A
K
 
E
I
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
Q
 
G
E
 
D
E
 
D
P
 
P
L
 
A
Q
 
W
P
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
D
P
 
A
F
 
L
R
 
A
E
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
A
M
 
A
I
 
M
N
 
R
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
C
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
x
R
R
|
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
K
 
R
T
 
L
N
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
x
M
G
 
G
K
x
R
S
 
G
A
 
L
M
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
H
 
P
P
 
T
G
 
P
Y
 
P
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
I
G
 
G
G
x
V
L
 
A
S
 
G
R
 
D
E
 
A
D
 
E
I
 
I
R
 
T
Q
 
R
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
S
D
 
D
C
 
G
I
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
S
D
|
D
L
x
T
D
x
N
L
 
F
G
 
A
I
 
V
F
 
S
T
 
Q
A
 
R
H
 
K
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
T
 
F
S
 
D
E
 
R
K
 
A
T
 
V
S
 
T
I
 
L
R
 
G
H
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
P
 
A
G
 
D
V
 
I
Y
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
P
A
 
S
D
 
D
I
 
G
R
 
K
R
 
E
R
 
P
E
 
H
T
 
A
C
 
Y
E
 
P
T
 
T
P
 
G
H
 
L
A
 
Q
P
 
A
A
 
D
P
 
G
T
 
E
P
 
P
F
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
M
P
 
D
D
 
I
T
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
V
V
 
N
E
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
R
Q
 
A
R
 
G
L
 
Q
E
 
E
T
 
P
F
 
L
F
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
x
L
V
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
D
T
x
M
G
 
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
F
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
M
D
 
D
I
 
M
S
 
I
I
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
A
E
 
G
F
x
L
M
|
M
S
x
A
S
 
P
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
S
 
G
L
x
M
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
L
 
S
P
 
G
T
 
G
L
 
K
R
 
R
P
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
M
 
W
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
Y
 
L
H
 
G
L
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
F
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
x
S
Y
x
W
G
x
E
T
x
M
E
x
L
R
 
R
P
 
T
M
x
F
L
 
Q
-
 
P
D
 
E
G
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
V
 
L
Y
 
D
P
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
M
P
 
A
E
 
A
L
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
-
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
V
D
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
F
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
R
F
 
F
C
 
Q
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
A
R
 
M
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2q5lA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 2-(1- hydroxyethyl)-3-deaza-thdp (see paper)
37% identity, 98% coverage: 8:543/545 of query aligns to 9:538/538 of 2q5lA

query
sites
2q5lA
I
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
D
L
 
R
R
 
G
V
 
A
Q
 
Q
H
 
A
A
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
A
L
 
L
G
 
P
F
 
F
Y
 
F
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
I
 
I
K
 
L
I
 
P
I
 
L
N
 
H
T
 
T
C
 
L
D
 
S
-
 
H
E
|
E
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
Y
R
 
S
G
 
S
-
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
F
K
 
N
V
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
A
T
 
V
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
T
E
 
E
Q
 
G
A
 
N
G
 
A
N
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
E
x
T
F
x
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
Q
 
K
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
R
L
 
L
D
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
K
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
Y
 
Q
R
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
|
R
D
 
N
M
 
M
V
 
V
T
 
N
V
 
A
K
 
E
I
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
Q
 
G
E
 
D
E
 
D
P
 
P
L
 
A
Q
 
W
P
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
D
P
 
A
F
 
L
R
 
A
E
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
A
M
 
A
I
 
M
N
 
R
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
C
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
K
 
R
T
 
L
N
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
G
 
G
K
 
R
S
 
G
A
 
L
M
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
H
 
P
P
 
T
G
 
P
Y
 
P
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
I
G
 
G
G
x
V
L
 
A
S
 
G
R
 
D
E
 
A
D
 
E
I
 
I
R
 
T
Q
 
R
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
S
D
 
D
C
 
G
I
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
T
D
x
N
L
 
F
G
 
A
I
 
V
F
 
S
T
 
Q
A
 
R
H
 
K
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
T
 
F
S
 
D
E
 
R
K
 
A
T
 
V
S
 
T
I
 
L
R
 
G
H
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
P
 
A
G
 
D
V
 
I
Y
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
-
 
R
-
 
L
A
 
P
D
 
P
I
 
S
R
 
D
R
 
R
R
 
T
E
 
T
T
 
R
C
 
G
E
 
K
T
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
P
 
-
A
 
Y
P
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
E
P
 
P
F
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
M
P
 
D
D
 
I
T
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
V
V
 
N
E
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
R
Q
 
A
R
 
G
L
 
Q
E
 
E
T
 
P
F
 
L
F
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
L
V
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
D
T
x
M
G
 
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
F
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
M
D
 
D
I
 
M
S
 
I
I
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
A
E
 
G
F
 
L
M
 
M
S
 
A
S
 
P
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
S
 
G
L
x
M
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
L
 
S
P
 
G
T
 
G
L
 
K
R
 
R
P
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
M
 
W
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
Y
 
L
H
 
G
L
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
F
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
x
S
Y
x
W
G
x
E
T
x
M
E
x
L
R
 
R
P
 
T
M
x
F
L
 
Q
-
 
P
D
 
E
G
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
V
 
L
Y
 
D
P
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
M
P
 
A
E
 
A
L
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
-
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
V
D
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
F
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
R
F
 
F
C
 
Q
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
A
R
 
M
L
 
I
D
 
P
P
x
R
Y
 
G
D
 
V
F
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
T
 
-
S
 
-
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
Q
K
 
K

2nxwA Crystal structure of phenylpyruvate decarboxylase of azospirillum brasilense (see paper)
37% identity, 98% coverage: 8:543/545 of query aligns to 10:535/537 of 2nxwA

query
sites
2nxwA
I
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
D
L
 
R
R
 
G
V
 
A
Q
 
Q
H
 
A
A
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
A
L
 
L
G
 
P
F
 
F
Y
 
F
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
I
 
I
K
 
L
I
 
P
I
 
L
N
 
H
T
 
T
C
 
L
D
 
S
-
 
H
E
|
E
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
Y
R
 
S
G
 
S
-
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
F
K
 
N
V
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
A
T
 
V
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
T
E
 
E
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
F
 
-
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
Q
 
K
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
R
L
 
L
D
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
K
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
Y
 
Q
R
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
|
R
D
 
N
M
 
M
V
 
V
T
 
N
V
 
A
K
 
E
I
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
Q
 
G
E
 
D
E
 
D
P
 
P
L
 
A
Q
 
W
P
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
D
P
 
A
F
 
L
R
 
A
E
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
A
M
 
A
I
 
M
N
 
R
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
C
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
K
 
R
T
 
L
N
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
G
 
G
K
 
R
S
 
G
A
 
L
M
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
H
 
P
P
 
T
G
 
P
Y
 
P
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
I
G
 
G
G
x
V
L
 
A
S
 
G
R
 
D
E
 
A
D
 
E
I
 
I
R
 
T
Q
 
R
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
S
D
 
D
C
 
G
I
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
T
D
x
N
L
 
F
G
 
A
I
 
V
F
 
S
T
 
Q
A
 
R
H
 
K
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
T
 
F
S
 
D
E
 
R
K
 
A
T
 
V
S
 
T
I
 
L
R
 
G
H
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
P
 
A
G
 
D
V
 
I
Y
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
-
 
R
-
 
L
A
 
P
D
 
P
I
 
S
R
 
D
R
 
R
R
 
T
E
 
T
T
 
R
C
 
G
E
 
K
T
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
P
 
-
A
 
Y
P
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
E
P
 
P
F
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
M
P
 
D
D
 
I
T
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
V
V
 
N
E
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
R
Q
 
A
R
 
G
L
 
Q
E
 
E
T
 
P
F
 
L
F
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
L
V
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
D
T
x
M
G
 
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
F
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
M
D
 
D
I
 
M
S
 
I
I
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
A
E
 
G
F
 
L
M
 
M
S
 
A
S
 
P
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
S
 
G
L
x
M
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
L
 
S
P
 
G
T
 
G
L
 
K
R
 
R
P
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
M
 
W
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
Y
 
L
H
 
G
L
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
F
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
x
S
Y
x
W
G
x
E
T
x
M
E
x
L
R
 
R
P
 
T
M
x
F
L
 
Q
-
 
P
D
 
E
G
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
V
 
L
Y
 
D
P
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
M
P
 
A
E
 
A
L
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
-
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
V
D
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
F
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
R
F
 
F
C
 
Q
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
A
R
 
M
L
 
I
D
 
P
P
x
R
Y
 
G
D
 
V
F
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
T
 
-
S
 
-
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
Q
K
 
K

2q5jA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp (see paper)
36% identity, 98% coverage: 8:543/545 of query aligns to 3:522/523 of 2q5jA

query
sites
2q5jA
I
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
I
 
L
H
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
K
Q
 
D
L
 
R
R
 
G
V
 
A
Q
 
Q
H
 
A
A
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
A
L
 
L
G
 
P
F
 
F
Y
 
F
K
 
K
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
T
R
 
Q
I
 
I
K
 
L
I
 
P
I
 
L
N
 
H
T
 
T
C
 
L
D
 
S
-
 
H
E
|
E
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
A
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
Y
R
 
S
G
 
S
-
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
F
K
 
N
V
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
A
T
 
V
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
T
E
 
E
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
H
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
K
 
Q
V
 
V
F
 
F
Q
 
K
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
R
L
 
L
D
 
D
N
 
D
P
 
P
A
 
A
T
 
K
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
Y
 
Q
R
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
|
R
D
 
N
M
 
M
V
 
V
T
 
N
V
 
A
K
 
E
I
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
Q
 
G
E
 
D
E
 
D
P
 
P
L
 
A
Q
 
W
P
 
P
P
 
-
D
 
-
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
D
P
 
A
F
 
L
R
 
A
E
 
A
A
 
C
S
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
A
M
 
A
I
 
M
N
 
R
A
 
S
A
 
A
T
 
T
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
C
V
 
V
E
 
E
L
 
V
L
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
A
H
 
K
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
Q
K
 
R
T
 
L
N
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
T
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
G
 
G
K
 
R
S
 
G
A
 
L
M
 
L
G
 
A
E
 
D
R
 
A
H
 
P
P
 
T
G
 
P
Y
 
P
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
I
G
 
G
G
x
V
L
 
A
S
 
G
R
 
D
E
 
A
D
 
E
I
 
I
R
 
T
Q
 
R
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
S
D
 
D
C
 
G
I
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
T
D
x
N
L
 
F
G
 
A
I
 
V
F
 
S
T
 
Q
A
 
R
H
 
K
L
 
I
D
 
D
Q
 
L
G
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
T
 
F
S
 
D
E
 
R
K
 
A
T
 
V
S
 
T
I
 
L
R
 
G
H
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
P
 
A
G
 
D
V
 
I
Y
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
V
L
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
-
 
R
-
 
L
A
 
P
D
 
P
I
 
S
R
 
D
R
 
R
R
 
T
E
 
T
T
 
R
C
 
G
E
 
K
T
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
P
 
-
A
 
Y
P
 
P
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
E
P
 
P
F
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
M
P
 
D
D
 
I
T
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
V
V
 
N
E
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
R
Q
 
A
R
 
G
L
 
Q
E
 
E
T
 
P
F
 
L
F
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
T
 
-
F
 
L
V
 
I
I
 
A
A
 
A
D
 
D
T
x
M
G
|
G
D
|
D
A
 
C
L
 
L
F
 
F
A
 
T
A
 
A
A
 
M
D
 
D
I
 
M
S
 
I
I
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
D
A
 
A
E
 
G
F
 
L
M
 
M
S
 
A
S
 
P
A
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
S
x
G
L
x
M
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
L
 
S
P
 
G
T
 
G
L
 
K
R
 
R
P
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
M
 
W
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
N
A
 
C
A
 
R
R
 
R
Y
 
L
H
 
G
L
 
I
N
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
V
I
 
I
V
 
L
L
 
F
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
x
S
Y
x
W
G
x
E
T
x
M
E
x
L
R
 
R
P
 
T
M
x
F
L
 
Q
-
 
P
D
 
E
G
 
S
S
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
V
 
L
Y
 
D
P
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
D
L
 
M
P
 
A
E
 
A
L
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
-
G
 
G
R
 
D
G
 
G
F
 
V
D
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
K
A
 
A
R
 
F
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
R
F
 
F
C
 
Q
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
A
R
 
M
L
 
I
D
 
P
P
x
R
Y
 
G
D
 
V
F
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
T
 
-
S
 
-
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
Q
K
 
K

6vgsBBB Alpha-keto acid decarboxylase (see paper)
30% identity, 99% coverage: 7:545/545 of query aligns to 3:542/543 of 6vgsBBB

query
sites
6vgsBBB
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
Q
 
E
L
 
L
R
 
G
V
 
I
Q
 
E
H
 
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
I
x
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
V
x
N
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
Y
 
L
K
 
D
Q
 
H
L
 
I
D
 
I
E
 
S
S
 
R
R
 
K
-
 
D
I
 
M
K
 
K
I
 
W
I
 
V
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
T
R
 
K
G
 
K
L
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
F
C
 
L
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
V
N
 
N
T
 
G
T
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
E
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
G
 
T
V
 
S
R
 
K
E
 
V
Q
 
Q
A
 
N
G
 
E
N
 
G
P
 
K
L
 
F
L
 
V
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
A
E
 
D
F
 
G
D
 
D
T
 
F
Q
 
K
-
 
H
-
 
F
L
 
M
K
 
K
V
 
M
F
 
H
Q
 
E
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
-
N
 
T
P
 
A
A
 
E
T
 
N
A
 
A
C
 
T
R
 
V
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
L
L
 
L
C
 
K
Y
 
E
R
 
R
R
 
K
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
L
 
L
P
 
P
R
x
V
D
 
D
M
 
V
V
 
A
T
 
A
V
 
A
K
 
K
I
 
A
V
 
E
P
 
K
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
T
P
 
S
P
 
N
D
 
T
V
 
S
D
 
D
R
 
Q
E
 
E
P
 
I
F
 
L
R
 
N
E
 
K
A
 
I
S
 
Q
R
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
E
M
 
S
I
 
L
N
 
K
A
 
N
A
 
A
T
 
K
Q
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
V
V
 
I
A
 
T
G
 
G
V
 
H
E
 
E
L
 
I
L
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
K
H
 
T
L
 
V
Q
 
S
E
 
Q
L
 
F
V
 
I
E
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
K
I
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
T
T
 
L
L
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
M
 
V
G
 
D
E
 
E
R
 
A
H
 
L
P
 
P
G
 
S
Y
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
G
 
G
G
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
E
E
 
P
D
 
N
I
 
L
R
 
K
Q
 
E
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
F
I
 
I
V
 
L
L
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
S
D
x
S
L
 
T
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
H
H
 
H
L
 
L
D
 
N
Q
 
E
G
 
N
K
 
K
S
 
M
I
 
I
H
 
S
A
 
L
T
 
N
S
 
I
E
 
D
K
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
F
-
 
N
T
 
E
S
 
S
I
 
I
R
 
Q
H
 
N
H
 
F
T
 
D
Y
 
F
P
 
E
G
 
S
V
 
L
Y
 
I
L
 
S
N
 
S
G
 
L
F
 
L
L
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
Y
D
 
K
I
 
G
R
 
K
R
 
Y
R
 
I
E
 
D
T
 
K
C
 
K
E
 
Q
T
 
E
P
 
D
H
 
F
A
 
V
P
 
P
A
 
S
P
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
N
T
 
A
R
 
L
I
 
L
T
 
S
V
 
Q
E
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
W
Q
 
Q
R
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
N
F
 
L
F
 
T
D
 
Q
D
 
S
S
 
N
T
 
E
F
 
T
V
 
I
I
 
V
A
 
A
D
 
E
T
x
Q
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
F
F
 
F
A
 
G
A
 
A
A
 
S
D
 
P
I
 
I
S
 
F
I
 
L
P
 
K
R
 
P
A
 
K
A
 
S
E
 
H
F
 
F
M
 
I
S
 
G
S
 
Q
A
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
 
S
L
x
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
T
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
D
P
 
K
T
 
E
L
 
S
R
 
R
P
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
R
Y
 
E
H
 
K
L
 
I
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
C
I
 
F
V
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
V
E
|
E
R
 
R
P
 
E
M
 
I
L
 
H
-
 
G
-
 
P
D
 
N
G
 
Q
S
 
S
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
P
P
 
M
W
 
W
R
 
N
Y
 
Y
A
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
V
G
 
S
F
 
K
D
 
I
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
E
E
 
N
Q
 
E
L
 
F
E
 
V
V
 
S
A
 
V
L
 
M
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
A
Y
 
D
R
 
P
D
 
N
G
 
R
F
 
M
C
 
Y
I
 
W
L
 
I
D
 
E
V
 
L
R
 
I
L
 
L
D
 
A
P
 
K
Y
 
E
D
 
D
F
 
A
S
 
P
P
 
K
A
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
M
T
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
A
K
 
E
K
 
Q
V
 
N
K
 
K

2vbgA The complex structure of the branched-chain keto acid decarboxylase (kdca) from lactococcus lactis with 2r-1-hydroxyethyl-deazathdp (see paper)
31% identity, 99% coverage: 7:545/545 of query aligns to 8:546/546 of 2vbgA

query
sites
2vbgA
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
Q
 
E
L
 
L
R
 
G
V
 
I
Q
 
E
H
 
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
I
x
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
V
x
N
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
Y
 
L
K
 
D
Q
 
Q
L
 
I
-
 
I
D
 
S
E
 
R
S
 
E
R
 
D
I
 
M
K
 
K
I
 
W
I
 
I
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
x
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
T
R
 
K
G
 
K
L
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
F
C
 
L
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
I
N
 
N
T
 
G
T
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
E
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
G
 
T
V
 
S
R
 
K
E
 
V
Q
 
Q
A
 
N
G
 
D
N
 
G
P
 
K
L
x
F
L
x
V
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
A
E
 
D
F
 
G
D
 
D
T
 
F
Q
 
K
-
 
H
-
 
F
L
 
M
K
 
K
V
 
M
F
 
H
Q
 
E
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
-
N
 
T
P
 
A
A
 
E
T
 
N
A
 
A
C
 
T
R
 
Y
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
C
 
K
Y
 
E
R
 
R
R
 
K
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
L
 
L
P
 
P
R
x
V
D
 
D
M
 
V
V
 
A
T
 
A
V
 
A
K
 
K
I
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
A
E
 
E
E
 
K
P
 
P
L
 
A
Q
 
L
P
 
S
P
 
L
D
 
E
V
 
N
D
 
T
R
 
T
E
 
E
P
 
Q
F
 
V
R
 
I
E
 
L
A
 
S
S
 
K
R
 
I
E
 
E
A
 
-
V
 
-
D
 
E
M
 
S
I
 
L
N
 
K
A
 
N
A
 
A
T
 
Q
Q
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
H
E
 
E
L
 
V
L
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
K
H
 
T
L
 
V
Q
 
T
E
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
S
K
 
E
T
 
T
N
 
K
I
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
T
T
 
L
L
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
M
 
V
G
 
D
E
 
E
R
 
S
H
 
L
P
 
P
G
 
S
Y
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
G
 
G
G
x
K
L
 
L
S
 
S
R
 
E
E
 
I
D
 
S
I
 
L
R
 
K
Q
 
N
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
F
I
 
I
V
 
L
L
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
S
D
x
S
L
 
T
G
 
G
I
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
H
H
 
H
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
K
 
K
S
 
M
I
 
I
H
 
S
A
 
L
T
 
N
S
 
I
E
 
D
K
 
E
T
 
G
S
 
I
I
 
I
R
 
F
H
 
N
H
 
K
T
 
V
Y
 
V
P
 
E
G
 
D
V
 
F
Y
 
D
L
 
F
N
 
R
G
 
A
F
 
V
L
 
V
L
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
A
 
S
D
 
E
I
 
L
R
 
K
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
Y
C
 
E
E
 
G
T
 
Q
P
 
Y
H
 
I
A
 
D
P
 
K
A
 
Q
P
 
Y
T
 
E
P
 
E
F
 
F
H
 
I
P
 
P
A
 
S
P
 
S
D
 
-
T
 
A
R
 
P
I
 
L
T
 
S
V
 
Q
E
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
W
Q
 
Q
R
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
F
 
L
F
 
T
D
 
Q
D
 
S
S
 
N
T
 
E
F
 
T
V
 
I
I
 
V
A
 
A
D
x
E
T
x
Q
G
|
G
D
x
T
A
 
S
L
 
F
F
 
F
A
 
G
A
 
A
A
 
S
D
 
T
I
 
I
S
 
F
I
 
L
P
 
K
R
 
S
A
 
N
A
 
S
E
 
R
F
 
F
M
 
I
S
 
G
S
 
Q
A
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
T
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
D
P
 
K
T
 
E
L
 
S
R
 
R
P
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
L
A
 
S
A
 
I
R
 
R
Y
 
E
H
 
K
L
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
C
I
 
F
V
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
V
E
|
E
R
 
R
P
 
E
M
 
I
L
 
H
-
 
G
-
 
P
D
 
T
G
 
Q
S
 
S
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
P
P
 
M
W
 
W
R
 
N
Y
 
Y
A
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
V
G
 
S
F
 
K
D
 
I
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
E
E
 
N
Q
 
E
L
 
F
E
 
V
V
 
S
A
 
V
L
 
M
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
A
Y
 
D
R
 
V
D
 
N
G
 
R
F
 
M
C
 
Y
I
 
W
L
 
I
D
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
E
P
x
K
Y
 
E
D
 
D
F
 
A
S
 
P
P
 
K
A
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
M
T
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
A
K
 
E
K
 
Q
V
 
N
K
 
K

2vbfB The holostructure of the branched-chain keto acid decarboxylase (kdca) from lactococcus lactis (see paper)
31% identity, 99% coverage: 7:545/545 of query aligns to 8:546/546 of 2vbfB

query
sites
2vbfB
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
Q
 
E
L
 
L
R
 
G
V
 
I
Q
 
E
H
 
E
A
 
I
F
 
F
G
 
G
I
x
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
V
x
N
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
Y
 
L
K
 
D
Q
 
Q
L
 
I
-
 
I
D
 
S
E
 
R
S
 
E
R
 
D
I
 
M
K
 
K
I
 
W
I
 
I
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
x
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
M
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
T
R
 
K
G
 
K
L
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
F
C
 
L
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
I
N
 
N
T
 
G
T
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
E
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
G
 
T
V
 
S
R
 
K
E
 
V
Q
 
Q
A
 
N
G
 
D
N
 
G
P
 
K
L
x
F
L
x
V
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
A
E
 
D
F
 
G
D
 
D
T
 
F
Q
 
K
-
 
H
-
 
F
L
 
M
K
 
K
V
 
M
F
 
H
Q
 
E
Q
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
-
N
 
T
P
 
A
A
 
E
T
 
N
A
 
A
C
 
T
R
 
Y
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
C
 
K
Y
 
E
R
 
R
R
 
K
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
E
 
N
L
 
L
P
 
P
R
x
V
D
 
D
M
 
V
V
 
A
T
 
A
V
 
A
K
 
K
I
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
A
E
 
E
E
 
K
P
 
P
L
 
A
Q
 
L
P
 
S
P
 
L
D
 
E
V
 
N
D
 
T
R
 
T
E
 
E
P
 
Q
F
 
V
R
 
I
E
 
L
A
 
S
S
 
K
R
 
I
E
 
E
A
 
-
V
 
-
D
 
E
M
 
S
I
 
L
N
 
K
A
 
N
A
 
A
T
 
Q
Q
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
H
E
 
E
L
 
V
L
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
M
 
L
H
 
E
H
 
K
H
 
T
L
 
V
Q
 
T
E
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
S
K
 
E
T
 
T
N
 
K
I
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
T
T
 
L
L
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
M
 
V
G
 
D
E
 
E
R
 
S
H
 
L
P
 
P
G
 
S
Y
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
E
 
N
G
 
G
G
x
K
L
 
L
S
 
S
R
 
E
E
 
I
D
 
S
I
 
L
R
 
K
Q
 
N
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
F
I
 
I
V
 
L
L
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
D
L
 
S
D
x
S
L
 
T
G
 
G
I
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
H
H
 
H
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
K
 
K
S
 
M
I
 
I
H
 
S
A
 
L
T
 
N
S
 
I
E
 
D
K
 
E
T
 
G
S
 
I
I
 
I
R
 
F
H
 
N
H
 
K
T
 
V
Y
 
V
P
 
E
G
 
D
V
 
F
Y
 
D
L
 
F
N
 
R
G
 
A
F
 
V
L
 
V
L
 
S
G
 
S
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
A
 
S
D
 
E
I
 
L
R
 
K
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
Y
C
 
E
E
 
G
T
 
Q
P
 
Y
H
 
I
A
 
D
P
 
K
A
 
Q
P
 
Y
T
 
E
P
 
E
F
 
F
H
 
I
P
 
P
A
 
S
P
 
S
D
 
-
T
 
A
R
 
P
I
 
L
T
 
S
V
 
Q
E
 
D
R
 
R
L
 
L
F
 
W
Q
 
Q
R
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
S
F
 
L
F
 
T
D
 
Q
D
 
S
S
 
N
T
 
E
F
 
T
V
 
I
I
 
V
A
 
A
D
x
E
T
x
Q
G
|
G
D
x
T
A
 
S
L
 
F
F
 
F
A
 
G
A
 
A
A
 
S
D
 
T
I
 
I
S
 
F
I
 
L
P
 
K
R
 
S
A
 
N
A
 
S
E
 
R
F
 
F
M
 
I
S
 
G
S
 
Q
A
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
T
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
D
P
 
K
T
 
E
L
 
S
R
 
R
P
 
H
L
 
L
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
L
A
 
S
A
 
I
R
 
R
Y
 
E
H
 
K
L
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
C
I
 
F
V
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
V
E
|
E
R
 
R
P
 
E
M
 
I
L
 
H
-
 
G
-
 
P
D
 
T
G
 
Q
S
 
S
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
P
P
 
M
W
 
W
R
 
N
Y
 
Y
A
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
T
R
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
V
G
 
S
F
 
K
D
 
I
V
 
V
Q
 
R
T
 
T
E
 
E
E
 
N
Q
 
E
L
 
F
E
 
V
V
 
S
A
 
V
L
 
M
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
G
 
A
Y
 
D
R
 
V
D
 
N
G
 
R
F
 
M
C
 
Y
I
 
W
L
 
I
D
 
E
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
E
P
x
K
Y
 
E
D
 
D
F
 
A
S
 
P
P
 
K
A
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
M
 
M
T
 
G
S
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
A
K
 
E
K
 
Q
V
 
N
K
 
K

5npuA Inferred ancestral pyruvate decarboxylase (see paper)
30% identity, 99% coverage: 7:544/545 of query aligns to 3:536/547 of 5npuA

query
sites
5npuA
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
H
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
H
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
A
Q
 
Q
L
 
I
R
 
G
V
 
L
Q
 
K
H
 
H
A
 
H
F
 
F
G
 
A
I
 
V
P
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
N
L
 
L
G
 
V
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
Q
L
 
L
D
 
L
E
 
K
S
 
N
R
 
K
-
 
D
I
 
L
K
 
E
I
 
Q
I
 
V
N
 
Y
T
 
C
C
 
C
D
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
T
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
A
R
 
N
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
A
C
 
V
V
 
V
T
 
T
Y
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
F
N
 
N
T
 
A
T
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
N
V
 
T
R
 
N
E
 
D
Q
 
H
A
 
G
G
 
S
N
 
G
P
 
H
L
 
I
L
 
L
H
 
H
H
 
H
K
 
T
V
 
I
-
 
G
-
 
T
K
 
T
E
 
D
F
 
Y
D
 
G
T
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
K
 
E
V
 
M
F
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
L
 
I
T
 
T
V
 
C
A
 
A
Q
 
A
T
 
V
V
 
S
L
 
I
D
 
T
N
 
H
P
 
A
A
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
L
I
 
I
N
 
D
R
 
H
V
 
A
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
R
Y
 
E
R
 
K
R
 
K
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
P
 
A
R
 
C
D
 
N
M
 
V
V
 
A
T
 
A
V
 
Q
K
 
P
I
 
C
V
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
G
P
 
P
Q
 
V
E
 
S
E
 
A
P
 
L
L
 
L
Q
 
N
P
 
E
P
 
P
D
 
T
V
 
S
D
 
D
R
 
E
E
 
E
P
 
T
F
 
L
R
 
K
E
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
M
 
F
I
 
I
N
 
E
A
 
K
A
 
R
T
 
E
Q
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
G
E
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
A
Y
 
A
G
 
G
M
 
A
H
 
E
H
 
E
H
 
A
L
 
V
Q
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
D
K
 
A
T
 
L
N
 
G
I
 
C
P
 
A
V
 
V
T
 
A
S
 
T
T
 
M
L
 
A
L
 
A
G
 
A
K
 
K
S
 
S
A
 
F
M
 
F
G
 
P
E
 
E
R
 
D
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
W
G
 
G
G
 
E
L
 
V
S
 
S
R
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
V
R
 
E
Q
 
E
Y
 
I
V
 
V
E
 
D
S
 
W
S
 
A
D
 
D
C
 
G
I
 
I
V
 
I
L
 
C
L
 
L
G
 
G
V
 
P
L
 
V
L
 
F
T
 
N
D
 
D
L
 
Y
D
 
S
L
 
T
G
 
V
I
 
G
F
 
W
T
 
T
A
 
A
H
 
W
L
 
P
D
 
K
Q
 
G
G
 
E
K
 
N
S
 
V
I
 
V
H
 
L
A
 
V
T
 
D
S
 
P
E
 
H
K
 
H
T
 
I
S
 
T
I
 
V
R
 
G
H
 
G
H
 
E
T
 
E
Y
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
H
L
 
L
N
 
K
G
 
D
F
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
A
L
 
L
L
 
T
Q
 
E
A
 
R
D
 
V
I
 
P
R
 
K
R
 
K
R
 
D
E
 
A
T
 
T
C
 
L
E
 
D
T
 
A
P
 
A
H
 
D
A
 
P
P
 
N
A
 
A
P
 
P
T
 
-
P
 
-
F
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
L
T
 
T
V
 
R
E
 
A
R
 
E
L
 
L
F
 
C
Q
 
R
R
 
Q
L
 
I
E
 
Q
T
 
G
F
 
L
F
 
L
D
 
N
D
 
P
S
 
N
T
 
T
F
 
T
V
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
S
L
 
W
F
 
F
A
 
N
A
 
A
A
 
M
D
 
R
I
 
M
S
 
K
I
 
L
P
 
P
R
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
F
 
V
M
 
E
S
 
L
S
 
E
A
 
M
Y
 
Q
Y
 
W
A
x
G
S
x
H
L
x
I
G
 
G
F
 
W
A
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
F
G
 
G
V
 
Y
Q
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
E
P
 
P
T
 
E
L
 
R
R
 
R
P
 
N
L
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
 
G
A
x
S
F
 
F
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
A
M
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
A
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
R
H
 
K
L
 
L
N
 
P
P
 
I
I
 
I
I
 
I
I
 
F
V
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
S
 
R
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
|
E
R
 
V
P
 
K
M
 
I
L
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
P
F
 
Y
N
 
N
D
 
N
V
 
I
Y
 
K
P
 
N
W
 
W
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
G
L
 
L
P
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
D
G
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
L
G
 
G
F
 
L
D
 
K
V
 
A
Q
 
T
T
 
T
E
 
G
E
 
G
Q
 
E
L
 
L
E
 
A
V
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
L
G
 
A
Y
 
H
R
 
R
D
 
E
G
 
G
F
 
P
C
 
T
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
C
R
 
V
L
 
I
D
 
D
P
 
R
Y
 
D
D
 
D
F
 
C
S
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
S
 
V
V
 
T
L
 
W
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V

P23234 Indole-3-pyruvate decarboxylase; Indolepyruvate decarboxylase; EC 4.1.1.74 from Enterobacter cloacae (see paper)
31% identity, 98% coverage: 8:540/545 of query aligns to 7:546/552 of P23234

query
sites
P23234
I
 
V
G
 
A
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
T
Q
 
D
L
 
C
R
 
G
V
 
A
Q
 
D
H
 
H
A
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
N
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
Y
 
L
K
 
D
Q
 
H
-
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
S
S
 
P
R
 
D
I
 
I
K
 
C
I
 
W
I
 
V
N
 
G
T
 
C
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
C
R
 
K
G
 
G
L
 
F
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
L
V
 
T
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
M
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
R
N
 
G
P
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
K
 
T
V
 
L
K
 
G
-
 
D
-
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
R
T
 
H
Q
 
F
L
 
Y
K
 
H
V
 
M
F
 
S
Q
 
E
Q
 
P
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
-
N
 
T
P
 
E
A
 
Q
T
 
N
A
 
A
C
 
C
R
 
Y
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
T
A
 
T
A
 
M
L
 
L
C
 
R
Y
 
E
R
 
R
R
 
R
P
 
P
V
 
G
Y
 
Y
I
 
L
E
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
A
D
 
D
M
 
V
V
 
A
T
 
K
V
 
K
K
 
A
I
 
A
V
 
T
P
 
P
Q
 
P
E
 
V
E
 
N
P
 
A
L
 
L
Q
 
T
P
 
H
P
 
K
D
 
Q
V
 
A
D
 
H
R
 
A
E
 
D
P
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
N
A
 
K
V
 
L
D
 
A
M
 
M
I
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
S
T
 
K
Q
 
R
P
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
F
E
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
M
 
L
H
 
K
H
 
H
H
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
L
 
W
V
 
V
E
 
K
K
 
E
T
 
V
N
 
P
I
 
M
P
 
A
V
 
H
T
 
A
S
 
T
T
 
M
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
I
M
 
F
G
 
D
E
 
E
R
 
R
H
 
Q
P
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
Y
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
S
G
 
G
G
 
S
L
 
A
S
 
S
R
 
T
E
 
G
D
 
A
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
G
S
 
A
D
 
D
C
 
T
I
 
V
V
 
L
L
 
C
L
 
V
G
 
G
V
 
T
L
 
R
L
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
T
D
 
L
L
 
T
G
 
A
I
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
H
H
 
Q
L
 
L
D
 
T
Q
 
P
G
 
A
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
H
 
E
A
 
V
T
 
Q
S
 
P
E
 
H
K
 
A
T
 
A
S
 
R
I
 
V
R
 
G
H
 
D
H
 
V
T
 
W
Y
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
L
 
M
N
 
N
G
 
Q
F
 
A
L
 
I
L
 
E
G
 
T
L
 
L
L
 
V
Q
 
E
A
 
L
D
 
C
I
 
K
R
 
Q
R
 
H
R
 
V
E
 
H
T
 
A
C
 
G
E
 
L
T
 
M
P
 
S
H
 
S
A
 
S
P
 
S
A
 
G
P
 
A
T
 
I
P
 
P
F
 
F
H
 
-
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
D
 
D
T
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
T
V
 
Q
E
 
E
R
 
N
L
 
F
F
 
W
Q
 
R
R
 
T
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
F
 
F
F
 
I
D
 
R
D
 
P
S
 
G
T
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
D
 
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
D
I
 
L
S
 
R
I
 
L
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
V
E
 
N
F
 
F
M
 
I
S
 
V
S
 
Q
A
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
 
G
S
 
S
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
P
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
L
 
C
P
 
P
T
 
N
L
 
R
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
T
G
 
G
D
|
D
G
 
G
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
I
M
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
S
A
 
M
A
 
L
R
 
R
Y
 
D
H
 
K
L
 
Q
N
 
H
P
 
P
I
 
I
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
G
 
T
T
 
V
E
 
E
R
 
R
P
 
A
M
 
I
-
 
H
-
 
G
L
 
A
D
 
E
G
 
Q
S
 
R
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
A
P
 
L
W
 
W
R
 
N
Y
 
W
A
 
T
R
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
G
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
G
 
C
F
 
W
D
 
R
V
 
V
Q
 
S
T
 
E
E
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
A
V
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
V
R
 
-
G
 
A
Y
 
H
R
 
H
D
 
E
G
 
R
F
 
L
C
 
S
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
V
R
 
M
L
 
L
D
 
P
P
 
K
Y
 
A
D
 
D
F
 
I
S
 
P
P
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
G
R
 
A
M
 
L
T
 
T
S
 
K
V
 
A
L
 
L

1ovmA Crystal structure of indolepyruvate decarboxylase from enterobacter cloacae (see paper)
31% identity, 98% coverage: 8:540/545 of query aligns to 5:530/535 of 1ovmA

query
sites
1ovmA
I
 
V
G
 
A
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
H
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
T
Q
 
D
L
 
C
R
 
G
V
 
A
Q
 
D
H
 
H
A
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
V
x
N
L
 
L
G
 
Q
F
 
F
Y
 
L
K
 
D
Q
 
H
-
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
S
S
 
P
R
 
D
I
 
I
K
 
C
I
 
W
I
 
V
N
 
G
T
 
C
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
C
R
 
K
G
 
G
L
 
F
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
L
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
M
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
R
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
R
N
 
G
P
 
E
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
-
 
D
-
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
R
T
 
H
Q
 
F
L
 
Y
K
 
H
V
 
M
F
 
S
Q
 
E
Q
 
P
L
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
-
N
 
T
P
 
E
A
 
Q
T
 
N
A
 
A
C
 
C
R
 
Y
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
T
A
 
T
A
 
M
L
 
L
C
 
R
Y
 
E
R
 
R
R
 
R
P
 
P
V
 
G
Y
 
Y
I
 
L
E
 
M
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
D
M
 
V
V
 
A
T
 
K
V
 
K
K
 
A
I
 
A
V
 
T
P
 
P
Q
 
P
E
 
V
E
 
N
P
 
A
L
 
L
Q
 
T
P
 
H
P
 
K
D
 
Q
V
 
A
D
 
H
R
 
A
E
 
D
P
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
D
A
 
A
S
 
A
R
 
E
E
 
N
A
 
K
V
 
L
D
 
A
M
 
M
I
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
S
T
 
K
Q
 
R
P
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
F
E
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
M
 
L
H
 
K
H
 
H
H
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
L
 
W
V
 
V
E
 
K
K
 
E
T
 
V
N
 
P
I
 
M
P
 
A
V
 
H
T
 
A
S
 
T
T
 
M
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
I
M
 
F
G
 
D
E
 
E
R
 
R
H
 
Q
P
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
Y
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
E
 
S
G
 
G
G
x
S
L
 
A
S
 
S
R
 
T
E
 
G
D
 
A
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
I
E
 
E
S
 
G
S
 
A
D
 
D
C
 
T
I
 
V
V
 
L
L
 
C
L
 
V
G
 
G
V
 
T
L
 
R
L
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
T
D
x
L
L
 
T
G
 
A
I
 
G
F
 
F
T
 
T
A
 
H
H
 
Q
L
 
L
D
 
T
Q
 
P
G
 
A
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
H
 
E
A
 
V
T
 
Q
S
 
P
E
 
H
K
 
A
T
 
A
S
 
R
I
 
V
R
 
G
H
 
D
H
 
V
T
 
W
Y
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
L
 
M
N
 
N
G
 
Q
F
 
A
L
 
I
L
 
E
G
 
T
L
 
L
L
 
V
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
T
 
L
C
 
C
E
 
K
T
 
Q
P
 
H
H
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
V
H
 
H
P
 
-
A
 
A
P
 
P
D
 
D
T
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
T
V
 
Q
E
 
E
R
 
N
L
 
F
F
 
W
Q
 
R
R
 
T
L
 
L
E
 
Q
T
 
T
F
 
F
F
 
I
D
 
R
D
 
P
S
 
G
T
 
D
F
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
A
D
 
D
T
x
Q
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A
A
 
I
D
 
D
I
 
L
S
 
R
I
 
L
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
V
E
 
N
F
 
F
M
 
I
S
 
V
S
 
Q
A
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
T
V
 
L
P
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
L
 
C
P
 
P
T
 
N
L
 
R
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
I
M
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
G
T
 
S
A
 
M
A
 
L
R
 
R
Y
 
D
H
 
K
L
 
Q
N
 
H
P
 
P
I
 
I
I
 
I
I
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
E
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
V
E
|
E
R
 
R
P
 
A
M
x
I
-
 
H
-
 
G
L
 
A
D
 
E
G
 
Q
S
 
R
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
A
P
 
L
W
 
W
R
 
N
Y
 
W
A
 
T
R
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
G
 
S
-
 
L
-
 
D
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
G
 
C
F
 
W
D
 
R
V
 
V
Q
 
S
T
 
E
E
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
A
V
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
V
R
 
-
G
 
A
Y
 
H
R
 
H
D
 
E
G
 
R
F
 
L
C
 
S
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
V
R
 
M
L
 
L
D
 
P
P
x
K
Y
 
A
D
 
D
F
 
I
S
 
P
P
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
G
R
 
A
M
 
L
T
 
T
S
 
K
V
 
A
L
 
L

1qpbA Pyruvate decarboyxlase from yeast (form b) complexed with pyruvamide (see paper)
32% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 1:503/555 of 1qpbA

query
sites
1qpbA
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
V
 
V
Q
 
N
H
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
G
I
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
S
 
V
R
 
E
-
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
I
R
 
S
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
A
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
x
Y
C
 
V
Y
 
T
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
N
I
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
P
 
L
L
 
Q
Q
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
D
V
 
M
D
 
S
R
 
L
E
 
K
P
 
P
F
 
N
R
 
D
-
 
A
E
 
E
A
 
S
S
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
D
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
V
M
 
L
I
 
I
N
 
K
A
 
D
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
 
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
x
H
G
x
D
M
 
V
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
x
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
I
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
F
D
x
N
L
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
Y
H
 
S
L
 
Y
D
 
K
Q
 
T
G
 
K
K
 
N
S
 
I
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
 
H
S
 
S
E
 
D
K
 
H
T
 
M
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
N
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
F
F
 
V
L
 
L
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
D
 
I
I
 
A
R
 
D
R
 
A
R
 
A
E
 
K
T
 
G
C
 
Y
E
 
K
T
 
P
P
 
V
H
 
A
A
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
R
T
 
T
P
 
P
F
 
A
H
 
N
P
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
P
P
 
A
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
M
F
 
W
Q
 
N
R
 
Q
L
 
L
E
 
G
T
 
N
F
 
F
F
 
L
D
 
Q
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
|
T
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
 
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
|
E
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
x
I
D
 
H
G
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
E
V
 
I
Y
 
Q
P
 
G
W
 
W
R
 
D
Y
 
H
A
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P06169 Pyruvate decarboxylase isozyme 1; Thiamine pyrophosphate-dependent 2-oxo-acid decarboxylase; 2ODC; EC 4.1.1.-; EC 4.1.1.43; EC 4.1.1.72; EC 4.1.1.74 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 5 papers)
32% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 2:504/563 of P06169

query
sites
P06169
A
x
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
V
 
V
Q
 
N
H
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
V
 
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
S
 
V
R
 
E
-
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
I
R
 
S
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
K
 
T
V
 
L
K
 
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
A
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
 
Y
C
 
V
Y
 
T
R
 
Q
R
|
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
N
I
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
P
 
L
L
 
Q
Q
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
D
V
 
M
D
 
S
R
 
L
E
 
K
P
 
P
F
 
N
R
 
D
-
 
A
E
 
E
A
 
S
S
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
L
A
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
D
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
 
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
 
H
G
 
D
M
 
V
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
I
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
|
D
L
 
F
D
 
N
L
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
Y
H
 
S
L
 
Y
D
 
K
Q
 
T
G
 
K
K
 
N
S
 
I
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
 
H
S
 
S
E
 
D
K
 
H
T
 
M
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
N
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
F
F
 
V
L
 
L
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
T
D
 
I
I
 
A
R
 
D
R
 
A
R
 
A
E
 
K
T
 
G
C
 
Y
E
 
K
T
 
P
P
 
V
H
 
A
A
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
R
T
 
T
P
 
P
F
 
A
H
 
N
P
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
P
P
 
A
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
M
F
 
W
Q
 
N
R
 
Q
L
 
L
E
 
G
T
 
N
F
 
F
F
 
L
D
 
Q
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
x
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
 
E
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
 
I
D
 
H
G
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
E
V
 
I
Y
 
Q
P
 
G
W
 
W
R
 
D
Y
 
H
A
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q92345 Probable pyruvate decarboxylase C1F8.07c; EC 4.1.1.1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
29% identity, 97% coverage: 7:533/545 of query aligns to 10:550/569 of Q92345

query
sites
Q92345
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
T
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
H
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
V
Q
 
E
L
 
I
R
 
G
V
 
I
Q
 
K
H
 
N
A
 
H
F
 
F
G
 
V
I
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
D
V
 
F
L
 
L
G
 
E
F
 
Y
Y
 
Y
K
 
P
Q
 
G
L
 
L
D
 
S
E
 
E
S
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
I
N
 
G
T
 
C
C
 
C
D
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
C
G
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
S
R
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
A
A
 
C
V
 
A
C
 
V
V
 
V
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
L
K
 
T
V
 
A
V
 
F
N
 
D
T
 
G
T
 
I
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
L
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
S
P
 
P
G
 
N
V
 
T
R
 
N
E
 
D
Q
 
L
A
 
S
G
 
S
N
 
G
P
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
K
 
T
V
 
L
-
 
G
-
 
T
K
 
H
E
 
D
F
 
F
D
 
E
T
 
Y
Q
 
Q
L
 
M
K
 
E
V
 
I
F
 
A
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
V
 
C
A
 
A
Q
 
A
T
 
V
V
 
A
L
 
I
D
 
K
N
 
R
P
 
A
A
 
E
T
 
D
A
 
A
C
 
P
R
 
V
E
 
M
I
 
I
N
 
D
R
 
H
V
 
A
L
 
I
G
 
R
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
C
 
L
Y
 
Q
R
 
H
R
 
K
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
T
D
 
N
M
 
M
V
 
A
T
 
N
V
 
Q
K
 
P
I
 
C
V
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
G
P
 
P
Q
 
I
E
 
S
E
 
A
P
 
V
L
 
I
Q
 
S
P
 
P
P
 
E
D
 
I
V
 
S
D
 
D
R
 
K
E
 
E
P
 
S
F
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
S
 
T
R
 
D
E
 
I
A
 
A
V
 
A
D
 
E
M
 
L
I
 
I
N
 
S
A
 
K
A
 
K
T
 
E
Q
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
P
E
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
A
Y
 
A
G
 
G
M
 
A
H
 
E
H
x
S
H
 
A
L
 
F
Q
 
V
E
 
K
L
 
L
V
 
A
E
 
E
K
 
A
T
 
L
N
 
N
I
 
C
P
 
A
V
 
A
T
 
F
S
 
I
T
 
M
L
 
P
L
 
A
G
 
A
K
 
K
S
 
G
A
 
F
M
 
Y
G
 
S
E
 
E
R
 
E
H
 
H
P
 
K
G
 
N
Y
 
Y
I
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
W
G
 
G
G
 
E
L
 
V
S
 
S
R
 
S
E
 
S
D
 
E
I
 
T
R
 
T
Q
 
K
Y
 
A
V
 
V
-
 
Y
E
 
E
S
 
S
S
 
S
D
 
D
C
 
L
I
 
V
V
 
I
L
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
F
T
 
N
D
 
D
L
 
Y
D
 
S
L
 
T
G
 
V
I
 
G
F
 
W
T
 
R
A
 
A
H
 
A
L
 
P
D
 
N
Q
 
P
G
 
N
K
 
I
S
 
L
I
 
L
H
 
N
A
 
S
T
 
D
S
 
Y
E
 
T
K
 
S
T
 
V
S
 
S
I
 
I
R
 
P
H
 
G
H
 
Y
T
 
V
Y
 
F
P
 
S
G
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
N
 
A
G
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
E
G
 
L
L
 
L
L
 
A
Q
 
K
A
 
K
D
 
V
I
 
S
R
 
K
R
 
K
R
 
P
E
 
A
T
 
T
C
 
L
E
 
E
T
 
A
P
 
Y
H
 
N
A
 
K
P
 
A
A
 
R
P
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
T
 
V
P
 
P
F
 
K
H
 
A
P
 
A
A
 
E
P
 
P
D
 
K
T
 
A
R
 
A
I
 
L
T
 
N
V
 
R
E
 
V
R
 
E
L
 
V
F
 
M
Q
 
R
R
 
Q
L
 
I
E
 
Q
T
 
G
F
 
L
F
 
V
D
 
D
D
 
S
S
 
N
T
 
T
F
 
T
V
 
L
I
 
Y
A
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
S
L
 
W
F
 
F
A
 
N
A
 
G
A
 
L
D
 
Q
I
 
M
S
 
K
I
 
L
P
 
P
R
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
K
F
 
F
M
 
E
S
 
V
S
 
E
A
 
M
Y
 
Q
Y
 
W
A
 
G
S
 
H
L
 
I
G
 
G
F
 
W
A
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
S
S
 
A
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
Q
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
A
P
 
P
T
 
E
L
 
R
R
 
R
P
 
T
L
 
I
V
 
V
L
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
F
 
F
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
Q
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
H
H
 
K
L
 
L
N
 
P
P
 
V
I
 
L
I
 
I
I
 
F
V
 
L
L
 
L
N
 
N
N
 
N
S
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
T
T
 
I
E
 
E
R
 
I
P
 
Q
M
 
I
L
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
P
F
 
Y
N
 
N
D
 
R
V
 
I
Y
 
Q
P
 
N
W
 
W
R
 
D
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
L
 
F
P
 
C
E
 
E
L
 
S
L
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
L
D
 
H
V
 
A
Q
 
K
T
 
T
E
 
G
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
E
x
T
V
x
S
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
L
G
 
Q
Y
 
N
R
 
K
D
 
E
G
 
G
F
 
P
C
 
T
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
C
R
 
A
L
 
I
D
 
D
P
 
T
Y
 
D
D
 
D
F
 
C
S
 
T
P
 
Q
A
 
E
L
 
L

2vk1A Crystal structure of the saccharomyces cerevisiae pyruvate decarboxylase variant d28a in complex with its substrate (see paper)
32% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 1:503/562 of 2vk1A

query
sites
2vk1A
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
V
 
V
Q
 
N
H
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
G
I
x
L
P
|
P
G
|
G
D
x
A
Y
x
F
V
x
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
S
 
V
R
 
E
-
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
I
R
 
S
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
A
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
 
Y
C
 
V
Y
 
T
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
N
I
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
P
 
L
L
 
Q
Q
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
D
V
 
M
D
 
S
R
 
L
E
 
K
P
 
P
F
 
N
R
 
D
-
 
A
E
 
E
A
 
S
S
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
D
M
 
T
I
 
I
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
D
N
 
K
A
 
D
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
x
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
 
H
G
 
D
M
 
V
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
x
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
I
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
|
G
V
x
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
F
D
x
N
L
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
Y
H
 
S
L
 
Y
D
 
K
Q
 
T
G
 
K
K
 
N
S
 
I
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
x
H
S
|
S
E
 
D
K
 
H
T
 
M
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
N
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
F
F
 
V
L
 
L
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
D
 
I
I
 
A
R
 
D
R
 
A
R
 
A
E
 
K
T
 
G
C
 
Y
E
 
K
T
 
P
P
 
V
H
 
A
A
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
R
T
 
T
P
 
P
F
 
A
H
 
N
P
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
P
P
 
A
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
M
F
 
W
Q
 
N
R
 
Q
L
 
L
E
 
G
T
 
N
F
 
F
F
 
L
D
 
Q
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
|
T
G
|
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
 
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
|
E
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
x
I
D
 
H
G
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
E
V
 
I
Y
 
Q
P
 
G
W
 
W
R
 
D
Y
 
H
A
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2vbiA Holostructure of pyruvate decarboxylase from acetobacter pasteurianus
28% identity, 99% coverage: 7:543/545 of query aligns to 3:553/554 of 2vbiA

query
sites
2vbiA
T
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
M
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
L
 
I
R
 
G
V
 
L
Q
 
K
H
 
H
A
 
H
F
 
F
G
 
A
I
 
V
P
x
A
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
V
x
N
L
 
L
G
 
V
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
Q
L
 
L
D
 
L
E
 
L
S
 
N
R
 
K
-
 
D
I
 
M
K
 
K
I
 
Q
I
 
I
N
 
Y
T
 
C
C
 
C
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
T
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
S
R
 
N
G
 
G
L
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
A
C
 
V
V
 
V
T
|
T
Y
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
G
 
A
L
 
I
K
 
S
V
 
A
V
 
M
N
 
N
T
 
A
T
 
L
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
N
T
 
L
A
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
N
V
 
S
R
 
N
E
 
D
Q
 
Q
A
 
G
G
 
T
N
 
G
P
 
H
L
 
I
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
I
-
x
G
-
 
K
K
 
T
E
 
D
F
 
Y
D
 
S
T
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
K
 
E
V
 
M
F
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
V
T
 
T
V
 
C
A
 
A
Q
 
A
T
 
E
V
 
S
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
A
A
 
H
T
 
S
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
K
I
 
I
N
 
D
R
 
H
V
 
V
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
L
C
 
R
Y
 
E
R
 
R
R
 
K
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
I
 
L
E
 
D
L
 
I
P
 
A
R
x
C
D
 
N
M
 
I
V
 
A
T
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
C
V
 
V
K
 
R
I
 
P
V
 
G
P
 
P
Q
 
V
E
 
S
E
 
S
P
 
L
L
 
L
Q
 
S
P
 
E
P
 
P
D
 
E
V
 
I
D
 
D
R
 
H
E
 
T
P
 
S
F
 
L
R
 
K
E
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
D
E
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
A
M
 
L
I
 
L
N
 
E
A
 
K
A
 
S
T
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
M
V
 
L
A
 
L
G
 
G
V
 
S
E
 
K
L
 
L
L
 
R
R
 
A
Y
 
A
G
 
N
M
 
A
H
 
L
H
 
A
H
 
A
L
 
T
Q
 
E
E
 
T
L
 
L
V
 
A
E
 
D
K
 
K
T
 
L
N
 
Q
I
 
C
P
 
A
V
 
V
T
 
T
S
 
I
T
 
M
L
 
A
L
 
A
G
 
A
K
 
K
S
 
G
A
 
F
M
 
F
G
 
P
E
 
E
R
 
D
H
 
H
P
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
E
 
W
G
 
G
G
 
E
L
 
V
S
 
S
R
 
N
E
 
P
D
 
G
I
 
V
R
 
Q
Q
 
E
Y
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
T
S
 
S
D
 
D
C
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
C
L
 
I
G
 
A
V
 
P
L
 
V
L
 
F
T
 
N
D
 
D
L
 
Y
D
x
S
L
 
T
G
 
V
I
 
G
F
 
W
T
 
S
A
 
A
H
 
W
L
 
P
D
 
K
Q
 
G
G
 
P
K
 
N
S
 
V
I
 
I
H
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
P
E
 
D
K
 
R
T
 
V
S
 
T
I
 
V
R
 
D
H
 
G
H
 
R
T
 
A
Y
 
Y
P
 
D
G
 
G
V
 
F
Y
 
T
L
 
L
N
 
R
G
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
A
 
K
D
 
A
I
 
P
R
 
A
R
 
R
R
 
P
E
 
A
T
 
S
C
 
A
E
 
Q
T
 
K
P
 
S
H
 
S
A
 
V
P
 
P
A
 
T
P
 
C
T
 
S
P
 
L
F
 
T
H
 
A
P
 
T
A
 
S
P
 
D
D
 
E
T
 
A
R
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
N
E
 
D
R
 
E
L
 
I
F
 
V
Q
 
R
R
 
H
L
 
I
E
 
N
T
 
A
F
 
L
F
 
L
D
 
T
D
 
S
S
 
N
T
 
T
F
 
T
V
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
E
T
|
T
G
 
G
D
|
D
A
 
S
L
 
W
F
 
F
A
 
N
A
 
A
A
 
M
D
 
R
I
 
M
S
 
T
I
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
G
A
 
A
E
 
R
F
 
V
M
 
E
S
 
L
S
 
E
A
 
M
Y
 
Q
Y
 
W
A
x
G
S
x
H
L
x
I
G
 
G
F
 
W
A
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
S
S
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
N
Q
 
A
L
 
M
A
 
G
L
 
S
P
 
Q
T
 
D
L
 
R
R
 
Q
P
 
H
L
 
V
V
 
V
L
 
M
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
F
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
A
M
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
A
 
M
A
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
E
L
 
L
N
 
P
P
 
V
I
 
I
I
 
I
I
 
F
V
 
L
L
 
I
N
 
N
N
|
N
S
 
R
G
|
G
Y
|
Y
G
x
V
T
x
I
E
|
E
R
 
I
P
 
A
M
 
I
L
 
H
D
 
D
G
 
G
S
 
P
F
 
Y
N
 
N
D
 
Y
V
 
I
Y
 
K
P
 
N
W
 
W
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
R
 
G
L
 
L
P
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
F
G
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
L
G
 
G
F
 
L
D
 
K
V
 
A
Q
 
T
T
 
T
E
 
P
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
E
 
T
V
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
A
A
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
A
Y
 
N
R
 
T
D
 
R
G
 
G
F
 
P
C
 
T
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
C
R
 
Q
L
 
I
D
 
D
P
x
R
Y
 
T
D
 
D
F
 
C
S
 
T
P
 
D
A
 
M
L
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
W
-
 
G
R
 
R
R
 
K
M
 
V
T
 
A
S
 
S
V
 
T
L
 
N
G
 
A
K
 
R
K
 
K

8hp4A Ctpdc complex
30% identity, 90% coverage: 4:493/545 of query aligns to 1:486/540 of 8hp4A

query
sites
8hp4A
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
R
Y
 
F
L
 
F
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
Q
 
Q
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
Q
 
D
H
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
L
P
|
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
V
 
N
L
 
L
G
 
A
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
-
 
V
S
 
D
R
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
R
 
N
-
 
P
-
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
V
V
 
S
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
L
V
 
T
N
 
N
T
 
A
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
N
I
 
L
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
S
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
H
H
 
H
K
 
T
V
 
L
K
 
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
F
Q
 
T
L
 
V
-
 
F
-
 
H
K
 
R
V
 
M
F
 
F
Q
 
K
Q
 
N
L
 
I
T
 
S
V
 
Q
A
 
T
Q
 
S
T
 
A
V
 
F
L
 
I
D
 
S
N
 
D
P
 
P
A
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
A
R
 
S
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
Y
C
 
V
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
S
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
V
K
 
K
I
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
K
E
 
S
E
 
L
P
 
L
L
 
D
Q
 
K
P
 
K
P
 
I
D
 
D
V
 
L
D
 
S
R
 
L
E
 
H
P
 
P
F
 
N
R
 
E
-
 
P
E
 
E
A
 
S
S
 
Q
R
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
D
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
K
M
 
F
I
 
I
N
 
S
A
 
E
A
 
A
T
 
S
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
V
G
 
D
V
 
A
E
 
C
L
 
A
L
 
I
R
 
R
Y
 
H
G
 
N
M
 
C
H
 
L
H
 
K
H
 
E
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
I
E
 
A
K
 
E
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
V
T
 
F
S
 
T
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
M
 
V
G
 
D
E
 
E
R
 
S
H
 
N
P
 
P
G
 
R
Y
 
F
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
S
E
 
P
D
 
D
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
V
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
M
L
 
L
T
 
T
D
 
R
L
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
K
 
N
S
 
V
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
 
H
S
 
S
E
 
D
K
 
Y
T
 
T
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
Q
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
E
F
 
A
L
 
L
L
 
Q
G
 
V
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
V
R
 
K
E
 
K
T
 
S
C
 
V
E
 
N
T
 
P
P
 
K
H
 
Y
A
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
T
 
V
P
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
F
 
I
H
 
T
P
 
P
A
 
G
P
 
N
D
 
N
T
 
D
R
 
P
I
 
V
T
 
S
V
 
Q
E
 
E
R
 
Y
L
 
L
F
 
W
Q
 
R
R
 
K
L
 
V
E
 
S
T
 
D
F
 
W
F
 
F
D
 
Q
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
E
T
 
T
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
V
D
 
Q
I
 
S
S
 
K
I
 
F
P
 
P
R
 
K
A
 
N
A
 
A
E
 
I
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
 
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
C
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
C
R
 
K
Y
 
W
H
 
D
L
 
C
-
 
Y
N
 
N
P
 
T
I
 
Y
I
 
L
I
 
Y
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
 
E
R
 
R
P
 
-
M
 
L
L
 
I
D
 
H
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
V
 
I
Y
 
Q
P
 
P
W
 
W
R
 
N
Y
 
N
A
 
L
R
 
Q
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
F
G
 
N
A
 
A
G
 
K
R
 
K

6efhA Pyruvate decarboxylase from kluyveromyces lactis soaked with pyruvamide
31% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 1:503/557 of 6efhA

query
sites
6efhA
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
E
V
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
I
F
 
F
G
 
G
I
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
N
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
-
 
V
S
 
P
R
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
x
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
V
R
 
S
E
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
S
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
 
Y
C
 
V
Y
 
S
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
T
I
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
D
V
 
T
P
 
P
Q
 
I
E
 
D
E
 
L
P
 
S
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
P
 
N
D
 
D
V
 
P
D
 
E
R
 
A
E
 
E
P
 
-
F
 
-
R
 
E
E
 
E
A
 
V
S
 
I
R
 
E
E
 
N
A
 
V
V
 
L
D
 
Q
M
 
L
I
 
I
N
 
K
A
 
E
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
x
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
x
H
G
 
D
M
 
A
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
F
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
x
T
L
 
L
S
 
S
R
 
S
E
 
P
D
 
A
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
V
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
|
G
V
x
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
 
F
D
x
N
L
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
Y
H
 
S
L
 
Y
D
 
K
Q
 
T
G
 
K
K
 
N
S
 
I
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
x
H
S
|
S
E
 
D
K
 
Y
T
 
T
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
S
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
F
F
 
A
L
 
L
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
V
E
 
A
T
 
D
C
 
A
E
 
A
T
 
K
P
 
G
H
 
Y
A
 
K
P
 
P
A
 
V
P
 
P
T
 
V
P
 
P
F
 
S
H
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
D
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
V
F
 
W
Q
 
T
R
 
Q
L
 
V
E
 
G
T
 
E
F
 
F
F
 
L
D
 
R
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
D
 
E
T
|
T
G
|
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
H
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
 
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
|
E
R
 
R
P
 
-
M
 
L
L
x
I
D
 
H
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
C
V
 
I
Y
 
Q
P
 
N
W
 
W
R
 
Q
Y
 
H
A
 
L
R
 
E
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2vjyA Pyruvate decarboxylase from kluyveromyces lactis in complex with the substrate analogue methyl acetylphosphonate (see paper)
31% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 1:503/562 of 2vjyA

query
sites
2vjyA
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
x
E
V
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
I
F
 
F
G
 
G
I
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
N
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
-
 
V
S
 
P
R
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
L
R
x
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
x
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
V
R
 
S
E
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
S
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
N
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
x
Y
C
 
V
Y
 
S
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
T
I
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
D
V
 
T
P
 
P
Q
 
I
E
 
D
E
 
L
P
 
S
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
P
 
N
D
 
D
V
 
P
D
 
E
R
 
A
E
 
E
P
 
-
F
 
-
R
 
E
E
 
E
A
 
V
S
 
I
R
 
E
E
 
N
A
 
V
V
 
L
D
 
Q
M
 
L
I
 
I
N
 
K
A
 
E
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
x
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
x
H
G
 
D
M
 
A
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
K
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
F
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
x
T
L
 
L
S
 
S
R
 
S
E
 
P
D
 
A
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
V
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
|
G
V
x
A
L
 
L
L
 
L
T
 
S
D
 
D
L
x
F
D
x
N
L
 
T
G
 
G
I
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
Y
H
 
S
L
 
Y
D
 
K
Q
 
T
G
 
K
K
 
N
S
 
I
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
x
H
S
|
S
E
 
D
K
 
Y
T
 
T
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
S
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
F
F
 
A
L
 
L
L
 
Q
G
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
V
E
 
A
T
 
D
C
 
A
E
 
A
T
 
K
P
 
G
H
 
Y
A
 
K
P
 
P
A
 
V
P
 
P
T
 
V
P
 
P
F
 
S
H
 
E
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
D
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
V
F
 
W
Q
 
T
R
 
Q
L
 
V
E
 
G
T
 
E
F
 
F
F
 
L
D
 
R
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
T
D
 
E
T
|
T
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
H
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
|
E
R
 
R
P
 
-
M
 
L
L
x
I
D
 
H
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
C
V
 
I
Y
 
Q
P
 
N
W
 
W
R
 
Q
Y
 
H
A
 
L
R
 
E
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2w93A Crystal structure of the saccharomyces cerevisiae pyruvate decarboxylase variant e477q in complex with the surrogate pyruvamide
31% identity, 90% coverage: 4:491/545 of query aligns to 1:489/544 of 2w93A

query
sites
2w93A
A
 
S
E
 
E
T
 
I
T
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
H
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
K
Q
 
Q
L
 
V
R
 
N
V
 
V
Q
 
N
H
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
G
I
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
V
x
N
L
 
L
G
 
S
F
 
L
Y
 
L
K
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
Y
E
 
E
S
 
V
R
 
E
-
 
G
I
 
M
K
 
R
I
 
W
I
 
A
N
 
G
T
 
N
C
 
A
D
 
N
E
|
E
Q
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
D
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
M
G
 
S
A
 
C
V
 
I
C
 
I
V
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
G
 
E
L
 
L
K
 
S
V
 
A
V
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
I
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
H
T
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
V
S
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
G
 
S
V
 
I
R
 
S
E
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
N
 
Q
P
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
T
V
x
L
K
x
G
E
 
N
F
 
G
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
L
 
F
K
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
Q
 
R
L
 
M
T
 
S
-
 
A
-
 
N
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
T
 
T
-
 
T
-
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
T
N
 
D
P
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
A
C
 
P
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
T
L
 
Y
C
 
V
Y
 
T
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
E
 
G
L
 
L
P
 
P
R
x
A
D
 
N
M
 
L
V
 
V
T
 
D
V
 
L
K
 
N
I
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
P
 
L
L
 
Q
Q
 
T
P
 
P
P
 
I
D
 
D
V
 
M
D
 
S
R
 
L
E
 
K
P
 
P
F
 
N
R
 
D
-
 
A
E
 
E
A
 
S
S
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
L
A
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
D
A
 
A
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
D
V
 
A
E
x
C
L
 
C
L
 
S
R
 
R
Y
x
H
G
 
D
M
 
V
H
 
K
H
 
A
H
 
E
L
 
T
Q
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
K
 
L
T
 
T
N
 
Q
I
 
F
P
 
P
V
 
A
T
 
F
S
 
V
T
 
T
L
 
P
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
D
E
 
E
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
G
 
R
Y
 
Y
I
 
G
G
 
G
L
 
V
Y
 
Y
E
 
V
G
 
G
G
x
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
K
Q
 
E
Y
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
S
 
A
D
 
D
C
 
L
I
 
I
V
 
L
L
 
S
L
 
V
G
|
G
V
x
A
L
 
L
L
 
T
T
 
K
D
 
N
L
 
I
D
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
V
H
 
E
A
 
F
T
x
H
S
|
S
E
 
D
K
 
H
T
 
M
S
 
K
I
 
I
R
 
R
H
 
N
H
 
A
T
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
Q
L
 
M
N
 
K
G
 
-
F
 
F
L
 
V
L
 
L
G
 
Q
L
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
T
D
 
N
I
 
I
R
 
A
R
 
D
R
 
A
E
 
A
T
 
K
C
 
G
E
 
Y
T
 
K
P
 
P
H
 
V
A
 
A
-
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
R
T
 
T
P
 
P
F
 
A
H
 
N
P
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
P
P
 
A
D
 
S
T
 
T
R
 
P
I
 
L
T
 
K
V
 
Q
E
 
E
R
 
W
L
 
M
F
 
W
Q
 
N
R
 
Q
L
 
L
E
 
G
T
 
N
F
 
F
F
 
L
D
 
Q
D
 
E
S
 
G
T
 
D
F
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
 
E
T
|
T
G
 
G
D
x
T
A
 
S
L
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
I
A
 
N
D
 
Q
I
 
T
S
 
T
I
 
F
P
 
P
R
 
N
A
 
N
A
 
T
E
 
Y
F
 
G
M
 
I
S
 
S
S
 
Q
A
 
V
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
S
|
S
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
T
P
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
K
L
 
K
R
 
R
P
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
F
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
V
M
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
G
L
 
L
N
 
K
P
 
P
I
 
Y
I
 
L
I
 
F
V
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
S
 
D
G
|
G
Y
|
Y
G
x
T
T
x
I
E
x
Q
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
x
I
D
 
H
G
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
A
S
 
Q
F
 
Y
N
 
N
D
 
E
V
 
I
Y
 
Q
P
 
G
W
 
W
R
 
D
Y
 
H
A
 
L
R
 
S
L
 
L
P
 
L
E
 
P
L
 
T
L
 
F
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011735476.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011735476.1
MEPAETTIGEYLIHRLYQLRVQHAFGIPGDYVLGFYKQLDESRIKIINTCDEQGAGFAAT
AYARVRGLGAVCVTYGVGGLKVVNTTAQAYAEETAVVVISGAPGVREQAGNPLLHHKVKE
FDTQLKVFQQLTVAQTVLDNPATACREINRVLGAALCYRRPVYIELPRDMVTVKIVPQEE
PLQPPDVDREPFREASREAVDMINAATQPVIVAGVELLRYGMHHHLQELVEKTNIPVTST
LLGKSAMGERHPGYIGLYEGGLSREDIRQYVESSDCIVLLGVLLTDLDLGIFTAHLDQGK
SIHATSEKTSIRHHTYPGVYLNGFLLGLLQADIRRRETCETPHAPAPTPFHPAPDTRITV
ERLFQRLETFFDDSTFVIADTGDALFAAADISIPRAAEFMSSAYYASLGFAVPASLGVQL
ALPTLRPLVLVGDGAFQMTGMEVATAARYHLNPIIIVLNNSGYGTERPMLDGSFNDVYPW
RYARLPELLGAGRGFDVQTEEQLEVALEAARGYRDGFCILDVRLDPYDFSPALRRMTSVL
GKKVK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory