SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011736668.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011736668.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
I
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
I
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
D
 
S
S
 
G
F
 
V
R
 
L
A
 
S
D
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
M
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
 
H
Q
 
S
E
 
N
Q
 
P
R
 
A
R
 
R
K
 
R
S
 
T
L
 
A
S
 
F
S
 
E
T
 
S
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
V
S
 
L
D
 
S
S
 
S
G
 
N
S
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
S
D
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
M
 
L
A
 
L
A
 
K
G
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
L
D
 
K
L
 
L
E
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
K
T
 
M
T
 
K
Y
 
D
I
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
G
G
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
Q
 
G
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
N
T
 
L
A
 
I
T
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
S
 
G
R
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
W
T
 
K
T
 
A
T
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
S
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
A
N
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
V
 
A
D
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
K
G
 
A
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
V
S
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
K
K
 
R
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
I
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
I
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
D
 
S
S
 
G
F
 
V
R
 
L
A
 
S
D
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
M
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
x
H
Q
x
S
E
x
N
Q
 
P
R
 
A
R
 
R
K
 
R
S
 
T
L
 
A
S
 
F
S
 
E
T
 
S
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
V
S
 
L
D
 
S
S
 
S
G
x
N
S
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
S
D
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
M
x
L
A
 
L
A
 
K
G
 
D
V
|
V
L
 
V
S
 
L
D
 
K
L
 
L
E
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
P
 
K
T
 
M
T
 
K
Y
 
D
I
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
G
G
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
Q
 
G
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
N
T
 
L
A
 
I
T
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
S
 
G
R
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
W
T
 
K
T
 
A
T
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
S
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
A
N
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
V
 
A
D
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
K
G
 
A
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
V
S
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
K
K
 
R
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
I
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
I
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
D
 
S
S
 
G
F
 
V
R
 
L
A
 
S
D
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
M
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
x
H
Q
 
S
E
 
N
Q
 
P
R
 
A
R
 
R
K
 
R
S
 
T
L
 
A
S
 
F
S
 
E
T
 
S
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
V
S
 
L
D
 
S
S
 
S
G
x
N
S
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
S
D
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
M
x
L
A
 
L
A
 
K
G
 
D
V
|
V
L
 
V
S
 
L
D
 
K
L
 
L
E
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
M
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
P
 
K
T
 
M
T
 
K
Y
 
D
I
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
G
G
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
Q
 
G
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
N
T
 
L
A
 
I
T
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
S
 
G
R
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
W
T
 
K
T
 
A
T
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
S
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
A
N
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
V
 
A
D
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
K
G
 
A
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
V
S
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
K
K
 
R
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
I
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
I
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
D
 
S
S
 
G
F
 
V
R
 
L
A
 
S
D
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
M
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
 
H
Q
 
S
E
 
N
Q
 
P
R
 
A
R
 
R
K
 
R
S
 
T
L
 
A
S
 
F
S
 
E
T
 
S
Y
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
T
T
 
V
S
 
L
D
 
S
S
 
S
G
 
N
S
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
S
D
 
N
I
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
M
 
L
A
 
L
A
 
K
G
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
L
D
 
K
L
 
L
E
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
L
P
 
T
A
 
K
D
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
K
T
 
M
T
 
K
Y
 
D
I
 
L
E
 
Q
E
 
E
S
 
-
L
 
W
A
 
A
S
 
G
G
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
Q
 
G
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
K
 
A
A
 
A
D
 
T
D
 
E
S
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
N
T
 
L
A
 
I
T
 
S
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
S
 
G
R
 
S
V
 
I
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
W
T
 
K
T
 
A
T
 
D
E
 
D
K
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
S
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
A
N
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
V
 
A
D
 
T
E
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
T
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
K
G
 
A
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
V
S
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
K
K
 
R
S
 
S
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

2rcyA Crystal structure of plasmodium falciparum pyrroline carboxylate reductase (mal13p1.284) with NADP bound
36% identity, 98% coverage: 4:267/270 of query aligns to 4:260/262 of 2rcyA

query
sites
2rcyA
N
 
N
K
 
I
K
 
K
I
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
M
G
 
G
G
 
L
G
|
G
N
x
Q
M
|
M
A
 
G
E
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
H
G
 
G
L
 
I
L
 
A
-
 
N
A
 
A
D
 
N
S
 
I
F
 
I
R
 
K
A
 
K
D
 
E
A
 
N
I
 
L
M
 
F
V
 
Y
A
 
Y
E
 
G
P
|
P
Q
 
S
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
K
K
 
K
S
 
N
L
 
T
S
 
T
S
 
L
T
 
N
Y
 
Y
G
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
M
D
 
S
S
 
S
G
x
N
S
 
E
A
 
E
V
 
L
A
 
A
G
 
R
Q
 
H
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
V
L
 
C
A
 
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
D
M
x
I
A
 
A
A
 
G
G
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
N
D
 
N
L
 
I
E
 
K
P
 
P
A
 
Y
I
 
L
P
 
-
A
 
S
D
 
S
K
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
S
I
|
I
M
x
C
A
x
G
G
 
G
I
 
L
P
 
N
T
 
I
T
 
G
Y
 
K
I
 
L
E
 
E
E
 
E
S
 
M
L
 
V
A
 
G
S
 
S
G
 
E
V
 
N
R
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
W
V
 
V
M
|
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
C
L
 
L
I
 
V
Q
 
G
A
 
E
A
 
G
A
 
S
S
 
F
A
 
I
I
 
Y
C
 
C
P
 
S
G
 
N
R
 
K
K
 
N
A
 
V
D
 
N
D
 
S
S
 
T
D
 
D
L
 
K
A
 
K
T
 
Y
A
 
V
T
 
N
E
 
D
I
 
I
F
 
F
S
 
N
R
 
S
V
 
C
G
 
G
A
 
I
V
 
I
V
 
H
T
 
E
T
 
I
T
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
D
M
 
M
D
 
D
A
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
Y
S
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
S
R
 
R
D
 
E
V
 
L
S
 
S
L
 
K
K
 
N
L
 
L
A
 
V
V
 
L
Q
 
Q
T
 
T
V
 
I
L
 
K
G
 
G
A
 
S
A
 
V
R
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
K
E
 
K
T
 
S
G
 
D
D
 
Q
H
 
P
P
 
V
A
 
Q
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
x
I
T
 
V
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
T
 
S
L
 
L
E
 
E
N
 
K
G
 
N
R
 
S
F
 
F
H
 
K
G
 
Y
L
 
T
V
 
V
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
E
K
 
K
S
 
S
R
 
K
E
 
A
L
 
M

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 3:268/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
F
 
I
R
 
L
A
 
S
D
 
A
A
 
H
I
 
K
M
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
S
P
 
S
Q
 
P
E
 
E
Q
 
M
R
 
N
R
 
L
K
 
P
S
 
T
L
 
V
S
 
S
S
 
A
-
 
L
-
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
N
T
 
L
S
 
T
D
 
R
S
 
S
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
K
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
V
P
 
Q
A
 
A
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
M
S
 
A
-
 
F
-
 
Q
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
K
V
 
V
V
 
I
R
|
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
L
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
Q
T
 
L
A
 
L
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
M
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
M
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
I
K
 
Q
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
D
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
C
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
x
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 9:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 7:272/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
-
x
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
x
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
x
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 9:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
|
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
x
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
M
x
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
x
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 9:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
x
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
M
x
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
x
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
x
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
x
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 6:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8tddA Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(furan-2-yl)acetic acid
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 6:271/278 of 8tddA

query
sites
8tddA
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
x
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
x
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

8td7A Structure of pycr1 complexed with 2s-hydroxy-3-methylbutyric acid
37% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/282 of 8td7A

query
sites
8td7A
I
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
E
 
F
A
 
A
I
 
L
I
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
D
 
A
S
 
G
-
 
V
F
 
L
R
 
A
A
 
A
D
 
H
A
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
-
 
D
Q
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
A
R
 
T
K
 
V
S
 
S
L
 
A
S
 
L
S
 
R
T
 
K
Y
 
M
G
 
G
I
 
V
G
 
K
T
 
L
S
 
T
D
 
P
S
 
H
G
 
N
S
 
K
A
 
E
V
 
T
A
 
V
G
 
Q
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
A
 
I
A
 
P
G
 
F
V
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
E
L
 
I
E
 
G
P
 
A
A
 
D
I
 
I
P
 
E
A
 
D
D
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
T
T
 
I
T
 
S
Y
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
K
S
 
K
L
 
L
A
 
S
S
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
G
 
A
V
 
P
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
A
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
Q
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
A
S
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
K
 
H
A
 
A
D
 
Q
D
 
V
S
 
E
D
 
D
L
 
G
A
 
R
T
 
L
A
 
M
T
 
E
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
S
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
F
V
 
C
V
 
T
T
 
E
T
 
V
T
 
E
E
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
N
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
P
R
 
R
D
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
A
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
V
 
L
D
 
L
E
 
H
T
 
S
G
 
E
D
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
L
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
S
G
 
G
R
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
E
S
 
A
A
 
S
C
 
C
A
 
I
K
 
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L

Query Sequence

>WP_011736668.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011736668.1
MLINKKIGFIGGGNMAEAIIKGLLADSFRADAIMVAEPQEQRRKSLSSTYGIGTSDSGSA
VAGQADIVILAIKPQMAAGVLSDLEPAIPADKLVISIMAGIPTTYIEESLASGVRVVRVM
PNTAALIQAAASAICPGRKADDSDLATATEIFSRVGAVVTTTEKLMDAVTGLSGSGPAYV
FSFIEALSDAGVKNGLARDVSLKLAVQTVLGAARMVDETGDHPALLREKVTSPGGTTIAG
LHTLENGRFHGLVMDAVDSACAKSRELAGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory