SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011736993.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011736993.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2e9fB Crystal structure of t.Th.Hb8 argininosuccinate lyase complexed with l-arginine
50% identity, 96% coverage: 16:456/458 of query aligns to 3:445/450 of 2e9fB

query
sites
2e9fB
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
A
E
 
A
E
 
R
F
 
F
T
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
L
Q
 
A
F
 
F
D
 
D
K
 
R
R
 
A
L
 
L
Y
 
W
H
 
R
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
R
 
W
G
 
Q
S
 
N
I
 
R
A
 
V
H
 
H
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
G
 
H
K
 
A
Q
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
L
P
 
S
Q
 
A
A
 
E
D
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
Q
 
R
I
 
I
L
 
E
L
 
E
Q
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
A
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
P
F
 
W
S
 
R
I
 
E
S
 
E
L
 
L
E
|
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
M
N
 
N
I
 
L
E
 
E
S
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
T
A
 
E
R
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
P
G
 
G
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
A
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
G
E
 
A
I
 
I
V
 
D
E
 
E
I
 
L
T
 
L
S
 
A
Y
 
L
I
 
L
D
 
L
L
 
A
L
 
L
I
 
R
D
 
R
A
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
R
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
K
N
 
H
V
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
L
V
 
Y
V
 
V
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
W
M
 
F
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
Y
E
 
E
M
 
M
F
 
L
K
 
K
R
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
A
L
 
K
K
 
E
R
 
R
V
 
L
N
 
N
V
 
E
L
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
H
Y
 
F
V
 
T
A
 
A
E
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
K
A
 
A
I
 
P
T
 
M
R
 
R
N
 
N
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
A
V
 
V
S
 
A
D
 
S
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
V
I
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
N
I
 
I
L
 
G
M
 
M
M
 
L
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
S
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
I
L
 
L
W
 
Y
S
 
S
T
 
T
S
 
E
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
P
D
 
D
G
 
A
F
 
F
C
 
A
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
A
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
G
 
G
N
 
A
L
 
F
M
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
S
T
 
A
V
 
V
M
 
V
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
T
 
A
I
 
L
D
 
A
T
 
T
V
 
Y
K
 
R
G
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
R
V
 
L
F
 
L
S
 
A
D
 
A
M
 
L
I
 
L
R
 
P
E
 
G
M
 
L
S
 
K
I
 
W
Y
 
R
P
 
R
E
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
W
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
E
Q
 
G
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
R
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
H
A
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
R
Y
 
R
C
 
L
V
 
V
E
 
E
N
 
E
E
 
G
M
 
R
E
 
A
L
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
E
W
 
L
E
 
Q
L
 
A
F
 
H
S
 
H
P
 
P
R
 
L
F
 
F
E
 
A
Q
 
E
D
 
D
I
 
A
F
 
L
E
 
P
A
 
L
I
 
L
T
 
R
V
 
L
D
 
E
A
 
T
C
 
A
I
 
I
D
 
H
A
 
R
R
 
R
N
 
R
V
 
S
P
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
P
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
E
R
 
E
C
 
A
R
 
K
K
 
K

P24058 Argininosuccinate lyase; ASAL; Arginosuccinase; Delta crystallin II; Delta-2 crystallin; EC 4.3.2.1 from Anas platyrhynchos (Mallard) (Anas boschas) (see 4 papers)
45% identity, 99% coverage: 4:456/458 of query aligns to 8:459/468 of P24058

query
sites
P24058
D
 
D
K
 
K
L
 
L
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
F
T
 
S
Q
 
G
P
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
P
F
 
I
V
 
M
E
 
E
E
 
K
F
 
L
T
 
N
A
 
S
S
|
S
I
 
I
Q
 
A
F
 
Y
D
|
D
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
H
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
K
A
 
T
D
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
Q
 
K
I
 
I
L
 
S
L
 
E
Q
 
E
I
 
W
E
 
S
E
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
D
 
V
F
 
V
S
 
K
I
 
Q
S
 
S
L
 
D
E
 
E
D
|
D
I
 
I
H
 
H
M
 
T
N
 
A
I
 
N
E
 
E
S
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
I
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
|
N
D
|
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
F
L
 
M
R
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
V
 
S
E
 
I
I
 
I
T
 
S
S
 
T
Y
 
H
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
R
F
 
W
A
 
S
H
 
Q
H
 
F
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
E
 
V
M
 
A
F
 
L
K
 
T
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
E
R
 
R
M
 
L
E
 
G
D
 
E
C
 
V
L
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
M
V
 
L
A
 
R
E
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
P
 
A
A
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
|
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
S
A
 
F
S
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
M
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
S
 
S
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
F
C
 
S
T
|
T
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
P
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
L
M
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
S
A
 
T
Y
|
Y
N
 
N
K
|
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
|
D
K
|
K
E
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
F
 
A
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
L
S
 
Q
I
 
I
Y
 
S
P
 
K
E
 
E
A
 
N
M
 
M
G
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
T
Q
 
P
G
 
E
F
 
M
S
 
-
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
A
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Y
 
L
C
 
A
V
 
E
E
 
T
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
T
L
 
I
T
 
N
D
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
L
T
 
E
E
 
D
W
 
L
E
 
K
L
 
S
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
Q
F
 
F
E
 
S
Q
 
S
D
 
D
I
 
V
F
 
S
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
T
 
N
V
 
F
D
 
V
A
 
N
C
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
R
 
Y
N
 
T
V
 
A
P
 
L
G
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
S
Q
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
Q
C
 
L
R
 
R
K
 
E

1tj7B Structure determination and refinement at 2.44 a resolution of argininosuccinate lyase from e. Coli (see paper)
47% identity, 97% coverage: 10:452/458 of query aligns to 1:444/451 of 1tj7B

query
sites
1tj7B
R
 
R
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
P
 
A
T
 
A
D
 
D
A
 
Q
F
 
R
V
 
F
E
 
K
E
 
Q
F
 
F
T
 
N
A
 
D
S
 
S
I
 
L
Q
 
R
F
 
F
D
 
D
K
 
Y
R
 
R
L
 
L
Y
 
A
H
 
E
Q
 
Q
D
 
D
I
 
I
R
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
V
A
 
A
H
 
W
A
 
S
R
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
V
K
 
T
Q
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
L
P
 
T
Q
 
A
A
 
E
D
 
E
V
 
Q
E
 
A
A
 
Q
I
 
L
V
 
E
E
 
E
G
 
A
L
 
L
Q
 
N
Q
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
E
Q
 
D
I
 
V
E
 
R
E
 
A
G
 
R
S
 
P
F
 
Q
D
 
Q
F
 
I
S
 
L
I
 
E
S
 
S
-
 
D
L
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
H
 
H
M
 
S
N
 
W
I
 
V
E
 
E
S
 
G
R
 
K
L
 
L
S
 
I
A
 
D
R
 
K
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
W
L
 
C
R
 
K
D
 
D
E
 
T
I
 
V
V
 
S
E
 
E
I
 
L
T
 
L
S
 
T
Y
 
A
I
 
N
D
 
R
L
 
Q
L
 
L
I
 
Q
D
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
E
Q
 
T
A
 
A
E
 
Q
E
 
N
N
 
N
V
 
Q
D
 
D
V
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
L
 
T
F
 
F
A
 
A
H
 
H
H
 
W
M
 
C
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
M
 
M
F
 
L
K
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
E
G
 
S
R
 
R
M
 
L
E
 
Q
D
 
D
C
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
V
 
L
N
 
D
V
 
V
L
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
A
F
 
Y
P
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
G
Q
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
A
A
 
S
I
 
A
T
 
T
R
 
R
N
 
N
S
 
S
L
 
L
D
 
D
S
 
S
V
 
V
S
 
S
D
 
D
R
 
R
D
 
D
F
 
H
A
 
V
L
 
L
E
 
E
F
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
A
S
 
A
S
 
A
I
 
I
L
 
G
M
 
M
M
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
F
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
F
W
 
F
S
 
N
T
 
T
S
 
G
Q
 
E
F
 
A
K
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
R
F
 
V
C
 
T
T
 
S
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
L
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
A
P
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
C
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Q
G
 
G
N
 
A
L
 
L
M
 
T
A
 
G
L
 
M
L
 
M
T
 
M
V
 
T
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
M
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
P
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
T
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
W
K
 
L
G
 
D
S
 
C
L
 
L
K
 
H
V
 
M
F
 
A
S
 
A
D
 
L
M
 
V
I
 
L
R
 
D
E
 
G
M
 
I
S
 
Q
I
 
V
Y
 
K
P
 
R
E
 
P
A
 
R
M
 
C
G
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
S
 
A
T
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
E
V
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
H
A
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
Y
 
E
C
 
A
V
 
I
E
 
R
N
 
Q
E
 
G
M
 
K
E
 
P
L
 
L
T
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
P
L
 
L
T
 
S
E
 
E
W
 
L
E
 
Q
L
 
K
F
 
F
S
 
S
P
 
Q
R
 
V
F
 
I
E
 
D
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
F
 
Y
E
 
P
A
 
I
I
 
L
T
 
S
V
 
L
D
 
Q
A
 
S
C
 
C
I
 
L
D
 
D
A
 
K
R
 
R
N
 
A
V
 
A
P
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
V
A
 
S
R
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
K
 
A
G
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A

P04424 Argininosuccinate lyase; ASAL; Arginosuccinase; EC 4.3.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 12 papers)
44% identity, 98% coverage: 5:455/458 of query aligns to 7:456/464 of P04424

query
sites
P04424
K
 
K
L
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
|
R
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
P
 
A
T
 
V
D
 
D
A
 
P
F
 
I
V
 
M
E
 
E
E
 
K
F
 
F
T
 
N
A
 
A
S
 
S
I
 
I
Q
 
A
F
 
Y
D
|
D
K
 
R
R
 
H
L
 
L
Y
 
W
H
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
K
A
 
A
H
 
Y
A
 
S
R
 
R
M
 
G
L
 
L
G
 
E
K
|
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
P
 
T
Q
 
K
A
 
A
D
 
E
V
 
M
E
 
D
A
 
Q
I
 
I
V
 
L
E
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
Q
x
K
I
 
V
L
 
A
L
 
E
Q
x
E
I
 
W
E
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
T
F
 
F
D
 
K
F
 
L
S
 
N
I
 
S
S
 
N
L
 
D
E
 
E
D
|
D
I
 
I
H
|
H
M
 
T
N
 
A
I
 
N
E
 
E
S
x
R
R
|
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
A
A
 
T
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
L
 
T
D
|
D
I
 
L
R
 
R
L
 
L
Y
 
W
L
 
M
R
 
R
D
 
Q
E
 
T
I
 
C
V
 
S
E
 
T
I
 
L
T
 
S
S
 
G
Y
 
L
I
 
L
D
 
W
L
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
R
A
 
T
L
 
M
L
 
V
T
 
D
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
E
 
A
N
 
E
V
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
L
M
 
F
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
R
F
 
W
A
 
S
H
 
H
H
 
W
M
 
I
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
E
x
V
M
 
A
F
 
L
K
x
T
R
|
R
D
 
D
S
 
S
G
 
E
R
|
R
M
 
L
E
 
L
D
 
E
C
 
V
L
 
R
K
 
K
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
|
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
G
I
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
L
V
 
L
A
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
N
F
 
F
P
 
G
A
 
A
I
 
I
T
 
T
R
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
S
D
 
E
R
|
R
D
|
D
F
 
F
A
 
V
L
 
A
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
F
A
 
W
S
 
A
S
 
S
I
 
L
L
 
C
M
 
M
M
 
T
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
W
 
Y
S
 
C
T
 
T
S
 
K
Q
 
E
F
 
F
K
 
S
F
 
F
I
 
V
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
Y
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
|
Q
K
 
K
K
|
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
I
R
|
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
x
R
L
 
C
M
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
M
V
 
T
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
S
A
 
T
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
E
T
x
V
I
 
S
D
 
D
T
 
T
V
 
M
K
 
S
G
 
A
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
F
 
A
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
L
S
 
Q
I
 
I
Y
 
H
P
 
Q
E
 
E
A
 
N
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
A
 
L
G
 
S
Q
 
P
G
 
D
F
 
M
S
 
-
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
x
M
A
 
P
F
 
F
R
|
R
D
 
Q
A
 
A
H
|
H
E
 
E
A
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
F
Y
 
M
C
x
A
V
 
E
E
 
T
N
 
K
E
 
G
M
 
V
E
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
Q
L
 
L
T
 
S
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
W
 
L
E
 
Q
L
 
T
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
L
F
 
F
E
 
S
Q
 
G
D
 
D
I
 
V
F
 
I
E
 
C
A
 
V
I
 
W
T
 
D
V
 
Y
D
 
G
A
 
H
C
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
R
 
Y
N
 
G
V
 
A
P
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
S
Q
 
S
V
 
V
K
 
D
G
 
W
E
 
Q
I
 
I
A
 
R
R
 
Q
C
 
V
R
|
R

1k7wD Crystal structure of s283a duck delta 2 crystallin mutant (see paper)
44% identity, 97% coverage: 15:456/458 of query aligns to 2:442/450 of 1k7wD

query
sites
1k7wD
T
 
T
D
 
D
A
 
P
F
 
I
V
 
M
E
 
E
E
 
K
F
 
L
T
 
N
A
 
S
S
 
S
I
 
I
Q
 
A
F
 
Y
D
 
D
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
H
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
K
A
 
T
D
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
Q
 
K
I
 
I
L
 
S
L
 
E
Q
 
E
I
 
W
E
 
S
E
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
D
 
V
F
 
V
S
 
K
I
 
Q
S
 
S
L
 
D
E
|
E
D
 
D
I
 
I
H
 
H
M
 
T
N
 
A
I
 
N
E
 
E
S
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
I
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
F
L
 
M
R
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
V
 
S
E
 
I
I
 
I
T
 
S
S
 
T
Y
 
H
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
R
F
 
W
A
 
S
H
 
Q
H
 
F
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
E
 
V
M
 
A
F
 
L
K
 
T
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
E
R
 
R
M
 
L
E
 
G
D
 
E
C
 
V
L
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
M
V
 
L
A
 
R
E
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
P
 
A
A
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
S
A
 
F
S
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
M
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
S
 
S
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
F
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
x
A
S
|
S
I
 
L
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
L
M
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
S
A
 
T
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
F
 
A
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
L
S
 
Q
I
 
I
Y
 
S
P
 
K
E
 
E
A
 
N
M
 
M
G
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
T
Q
 
P
G
 
E
F
 
M
S
 
-
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
A
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Y
 
L
C
 
A
V
 
E
E
 
T
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
T
L
 
I
T
 
N
D
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
L
T
 
E
E
 
D
W
 
L
E
 
K
L
 
S
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
Q
F
 
F
E
 
S
Q
 
S
D
 
D
I
 
V
F
 
S
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
T
 
N
V
 
F
D
 
V
A
 
N
C
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
R
 
Y
N
 
T
V
 
A
P
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
S
Q
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
Q
C
 
L
R
 
R
K
 
E

1hy0A Crystal structure of wild type duck delta 1 crystallin (eye lens protein) (see paper)
42% identity, 96% coverage: 16:456/458 of query aligns to 1:440/447 of 1hy0A

query
sites
1hy0A
D
 
D
A
 
P
F
 
I
V
 
M
E
 
Q
E
 
M
F
 
L
T
 
S
A
 
T
S
 
S
I
 
I
Q
 
S
F
 
T
D
 
E
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
S
H
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
G
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
K
A
 
T
D
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
Q
 
K
I
 
I
L
 
S
L
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
S
E
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
I
D
 
V
F
 
V
S
 
T
I
 
Q
S
 
S
L
 
D
E
|
E
D
 
D
I
 
I
H
 
Q
M
 
T
N
 
A
I
 
N
E
 
E
S
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
I
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
F
L
 
M
R
 
K
D
 
N
E
 
S
I
 
L
V
 
S
E
 
I
I
 
I
T
 
S
S
 
T
Y
 
H
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
I
M
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
R
F
 
W
A
 
S
H
 
Q
H
 
F
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
E
 
V
M
 
A
F
 
L
K
 
T
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
E
R
 
R
M
 
L
E
 
G
D
 
E
C
 
V
L
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
M
V
 
L
A
 
R
E
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
E
F
 
F
P
 
A
A
 
S
I
 
I
T
 
S
R
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
M
D
 
D
S
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
S
A
 
V
S
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
L
M
 
L
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
M
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
Y
S
 
S
T
 
T
S
 
S
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
F
I
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
F
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
L
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
L
M
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
M
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
S
A
 
T
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
I
D
 
D
T
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
F
 
A
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
L
S
 
Q
I
 
I
Y
 
S
P
 
K
E
 
E
A
 
N
M
 
M
G
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
T
Q
 
P
G
 
E
F
 
M
S
 
-
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
M
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
H
 
H
E
 
T
A
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Y
 
L
C
 
A
V
 
E
E
 
T
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
A
L
 
I
T
 
N
D
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
D
W
 
L
E
 
K
L
 
S
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
L
F
 
F
E
 
S
Q
 
S
D
 
D
I
 
V
F
 
S
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
T
 
N
V
 
F
D
 
V
A
 
N
C
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
R
 
Y
N
 
T
V
 
A
P
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
S
Q
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
Q
C
 
L
R
 
R
K
 
E

P02521 Delta-1 crystallin; Delta crystallin I from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 4:456/458 of query aligns to 6:457/466 of P02521

query
sites
P02521
D
 
D
K
 
K
L
 
L
W
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
P
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
P
F
 
I
V
 
M
E
 
E
E
 
I
F
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
S
I
 
I
Q
 
S
F
 
T
D
 
E
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
T
H
 
E
Q
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
G
 
A
S
 
S
I
 
M
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
Q
 
A
G
 
S
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
K
A
 
T
D
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
Q
 
K
I
 
I
L
 
S
L
 
E
Q
 
E
I
 
S
E
 
S
E
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
D
 
V
F
 
M
S
 
T
I
 
Q
S
 
S
L
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
I
H
 
Q
M
 
T
N
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
R
R
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
I
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
Q
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
S
E
 
S
I
 
I
V
 
S
E
 
V
I
 
I
T
 
S
S
 
T
Y
 
H
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
I
N
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
H
 
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
R
F
 
W
A
 
S
H
 
Q
H
 
F
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
V
 
A
E
 
V
M
 
A
F
 
L
K
 
T
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
E
R
 
R
M
 
L
E
 
G
D
 
E
C
 
V
L
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
I
N
 
T
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
N
T
 
P
F
 
L
P
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
D
 
E
Y
 
L
V
 
L
A
 
R
E
 
S
Q
 
E
L
 
L
G
 
D
F
 
M
P
 
T
A
 
S
I
 
I
T
 
T
R
 
L
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
D
S
 
A
V
 
I
S
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
F
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
V
S
 
A
S
 
T
I
 
L
L
 
L
M
 
M
M
 
I
H
 
H
L
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
I
W
 
F
S
 
S
T
 
T
S
 
T
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
F
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
A
F
 
Y
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
L
M
 
L
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
R
G
 
S
K
 
K
T
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
R
L
 
L
M
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
M
V
 
V
M
 
L
K
 
K
S
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
S
A
 
T
Y
 
F
N
 
S
K
 
K
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
E
D
 
D
K
 
K
E
 
E
P
 
A
L
 
V
F
 
L
D
 
D
T
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
T
G
 
A
S
 
V
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
F
 
A
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
I
R
 
S
E
 
T
M
 
L
S
 
Q
I
 
V
Y
 
N
P
 
K
E
 
E
A
 
N
M
 
M
G
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
T
Q
 
P
G
 
E
F
 
L
S
 
-
T
 
L
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
L
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
M
A
 
P
F
 
I
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
H
 
Q
E
 
T
A
 
A
V
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Y
 
L
C
 
A
V
 
E
E
 
T
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
T
L
 
I
T
 
N
D
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
D
W
 
L
E
 
K
L
 
S
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
L
F
 
F
E
 
A
Q
 
S
D
 
D
I
 
V
F
 
S
E
 
Q
A
 
V
I
 
F
T
 
S
V
 
V
D
 
V
A
 
N
C
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
R
 
Y
N
 
T
V
 
A
P
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
S
Q
 
S
V
 
V
K
 
T
G
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
R
 
Q
C
 
L
R
 
R
K
 
E

Sites not aligning to the query:

6ienB Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 96% coverage: 14:451/458 of query aligns to 1:438/454 of 6ienB

query
sites
6ienB
P
 
P
T
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
A
E
 
A
E
 
-
F
 
L
T
 
S
A
 
K
S
 
S
I
 
T
Q
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
R
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
R
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
P
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
Q
V
 
R
E
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
Q
 
S
I
 
L
L
 
A
L
 
Q
Q
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
G
F
 
P
S
 
L
I
 
V
S
 
T
L
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
R
R
 
G
L
 
L
S
 
I
A
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
G
-
 
P
E
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
G
R
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
G
 
G
R
 
R
S
|
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
L
 
M
Y
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
R
I
 
V
T
 
A
S
 
T
Y
 
G
I
 
V
D
 
L
L
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
E
 
A
N
 
H
V
 
P
D
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
K
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
E
 
H
M
 
P
F
 
L
K
 
L
R
 
R
D
 
D
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
I
E
 
V
D
 
D
C
 
F
L
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
A
N
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
I
 
L
D
 
D
R
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
E
F
 
A
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
I
 
M
L
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
S
S
 
T
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
H
D
 
D
G
 
S
F
 
W
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
L
M
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
T
M
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
P
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
S
 
L
L
 
L
K
 
P
V
 
A
F
 
M
S
 
A
D
 
G
M
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
S
M
 
L
S
 
T
I
 
F
Y
 
N
P
 
V
E
 
Q
A
 
R
M
 
M
G
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
P
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
R
Y
 
A
C
 
A
V
 
E
E
 
Q
N
 
R
E
 
G
M
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
Q
D
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
D
T
 
D
E
 
E
W
 
L
E
 
A
L
 
A
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
E
F
 
L
E
 
T
Q
 
P
D
 
Q
I
 
V
F
 
R
E
 
E
A
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
G
C
 
S
I
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
D
V
 
C
P
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
P
E
 
G
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
G
 
E
E
 
Q
I
 
L

6ienA Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 96% coverage: 14:451/458 of query aligns to 1:436/452 of 6ienA

query
sites
6ienA
P
 
P
T
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
A
E
 
A
E
 
-
F
 
L
T
 
S
A
 
K
S
 
S
I
 
T
Q
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
R
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
R
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
P
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
Q
V
 
R
E
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
Q
 
S
I
 
L
L
 
A
L
 
Q
Q
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
G
F
 
P
S
 
L
I
 
V
S
 
T
L
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
R
R
 
G
L
 
L
S
 
I
A
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
G
-
 
P
E
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
G
R
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
L
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
L
 
M
Y
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
R
I
 
V
T
 
A
S
 
T
Y
 
G
I
 
V
D
 
L
L
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
E
 
A
N
 
H
V
 
P
D
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
K
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
E
 
H
M
 
P
F
 
L
K
 
L
R
 
R
D
 
D
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
I
E
 
V
D
 
D
C
 
F
L
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
A
N
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
I
 
L
D
 
D
R
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
E
F
 
A
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
I
 
M
L
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
S
S
 
T
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
H
D
 
D
G
 
S
F
 
W
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
-
M
 
-
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
L
M
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
T
M
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
P
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
S
 
L
L
 
L
K
 
P
V
 
A
F
 
M
S
 
A
D
 
G
M
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
S
M
 
L
S
 
T
I
 
F
Y
 
N
P
 
V
E
 
Q
A
 
R
M
 
M
G
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
P
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
R
Y
 
A
C
 
A
V
 
E
E
 
Q
N
 
R
E
 
G
M
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
Q
D
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
D
T
 
D
E
 
E
W
 
L
E
 
A
L
 
A
F
 
I
S
 
S
P
 
P
R
 
E
F
 
L
E
 
T
Q
 
P
D
 
Q
I
 
V
F
 
R
E
 
E
A
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
I
D
 
E
A
 
G
C
 
S
I
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
R
N
 
D
V
 
C
P
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
R
 
P
E
 
G
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
G
 
E
E
 
Q
I
 
L

6ienC Substrate/product bound argininosuccinate lyase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
42% identity, 82% coverage: 14:390/458 of query aligns to 1:377/418 of 6ienC

query
sites
6ienC
P
 
P
T
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
A
E
 
A
E
 
-
F
 
L
T
 
S
A
 
K
S
 
S
I
 
T
Q
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
W
R
 
V
L
 
L
Y
 
A
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
L
R
 
T
G
 
A
S
 
S
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
T
R
 
M
M
 
V
L
 
L
G
 
F
K
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
P
 
T
Q
 
E
A
 
E
D
 
Q
V
 
R
E
 
D
A
 
G
I
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
Q
 
S
I
 
L
L
 
A
L
 
Q
Q
 
D
I
 
V
E
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
G
F
 
P
S
 
L
I
 
V
S
 
T
L
 
D
E
 
E
D
 
D
I
 
V
H
 
H
M
 
A
N
 
A
I
 
L
E
 
E
S
 
R
R
 
G
L
 
L
S
 
I
A
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
G
-
 
P
E
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
G
R
 
R
L
 
L
H
 
R
T
 
A
G
 
G
R
 
R
S
|
S
R
|
R
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
V
|
V
A
 
A
L
 
A
D
 
L
I
 
F
R
 
R
L
 
M
Y
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
A
I
 
V
V
 
R
E
 
R
I
 
V
T
 
A
S
 
T
Y
 
G
I
 
V
D
 
L
L
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
E
 
A
N
 
H
V
 
P
D
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
K
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
H
V
 
A
E
 
H
M
 
P
F
 
L
K
 
L
R
 
R
D
 
D
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
I
E
 
V
D
 
D
C
 
F
L
 
D
K
 
K
R
 
R
V
 
A
N
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
S
T
 
S
F
 
L
P
 
G
I
 
L
D
 
D
R
 
P
D
 
D
Y
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
S
A
 
A
I
 
A
T
 
A
R
 
D
N
 
N
S
 
S
L
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
L
 
A
E
 
E
F
 
A
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
F
S
 
A
I
 
M
L
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
I
I
 
I
L
 
V
W
 
W
S
 
S
T
 
S
S
 
T
Q
 
E
F
 
F
K
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
H
D
 
D
G
 
S
F
 
W
C
 
S
T
 
T
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
 
N
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
L
M
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
T
M
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
E
D
 
D
K
|
K
E
 
E
P
 
P
L
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
S
I
 
V
D
 
A
T
 
Q
V
 
L
K
 
E
G
 
L
S
 
L
L
 
L
K
 
P
V
 
A
F
 
M
S
 
A
D
 
G
M
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
S
M
 
L
S
 
T
I
 
F
Y
 
N
P
 
V
E
 
Q
A
 
R
M
 
M
G
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
P
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
S
 
T
T
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
P
F
 
F
R
 
R
D
 
S
A
 
A
H
 
H
E
 
R
A
 
E
V
 
V

6g3iA Crystal structure of edds lyase in complex with n-(2-aminoethyl) aspartic acid (aeaa) (see paper)
31% identity, 87% coverage: 10:409/458 of query aligns to 6:404/496 of 6g3iA

query
sites
6g3iA
R
 
R
F
 
I
T
 
G
Q
 
R
P
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
A
F
 
K
V
 
A
E
 
P
E
 
E
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
x
Y
-
 
D
-
 
F
-
 
D
T
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
L
Q
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
R
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
R
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
S
E
 
A
A
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
-
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
A
I
 
A
E
 
T
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
D
 
R
F
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
I
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
K
A
 
R
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
L
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
I
S
 
E
Y
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
Y
I
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
K
A
 
A
E
 
A
E
 
D
N
 
H
V
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
H
 
Q
L
 
R
Q
 
K
T
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
T
F
 
L
A
 
G
H
 
H
H
 
Y
M
 
L
L
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
E
 
E
M
 
N
F
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
Y
E
 
R
D
 
E
C
 
L
L
 
Y
K
 
A
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
I
 
L
D
 
N
R
 
R
D
 
D
Y
 
R
V
 
T
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
D
A
 
G
I
 
L
T
 
V
R
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
S
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
L
 
A
E
 
E
F
 
H
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
S
 
S
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
F
 
Y
K
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
D
D
 
A
G
 
S
F
 
F
C
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
x
R
V
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
N
 
P
L
 
L
M
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
K
 
N
S
 
A
L
 
I
P
 
E
L
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
D
 
-
K
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
-
F
 
-
D
 
R
T
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
L
K
 
I
G
 
A
S
 
A
L
 
T
K
 
H
V
 
A
F
 
M
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
T
M
 
L
S
 
H
I
 
P
Y
 
N
P
 
K
E
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
R
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
I
Y
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
K
L
 
A
T
 
N
D
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L

6g3hA Crystal structure of edds lyase in complex with ss-edds (see paper)
31% identity, 87% coverage: 10:409/458 of query aligns to 6:404/497 of 6g3hA

query
sites
6g3hA
R
 
R
F
 
I
T
 
G
Q
 
R
P
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
A
F
 
K
V
 
A
E
 
P
E
 
E
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
x
Y
-
 
D
-
 
F
-
 
D
T
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
L
Q
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
R
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
R
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
S
E
 
A
A
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
-
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
A
I
 
A
E
 
T
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
D
 
R
F
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
I
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
K
A
 
R
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
L
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
I
S
 
E
Y
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
Y
I
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
K
A
 
A
E
 
A
E
 
D
N
 
H
V
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
H
 
Q
L
 
R
Q
 
K
T
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
T
F
 
L
A
 
G
H
 
H
H
 
Y
M
 
L
L
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
E
 
E
M
 
N
F
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
Y
E
 
R
D
 
E
C
 
L
L
 
Y
K
 
A
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
I
 
L
D
 
N
R
 
R
D
 
D
Y
 
R
V
 
T
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
D
A
 
G
I
 
L
T
 
V
R
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
S
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
L
 
A
E
 
E
F
 
H
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
S
 
S
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
F
 
Y
K
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
D
D
 
A
G
 
S
F
 
F
C
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
|
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
x
R
V
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
N
 
P
L
 
L
M
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
K
 
N
S
 
A
L
 
I
P
 
E
L
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
D
 
-
K
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
-
F
 
-
D
 
R
T
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
L
K
 
I
G
 
A
S
 
A
L
 
T
K
 
H
V
 
A
F
 
M
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
T
M
 
L
S
 
H
I
 
P
Y
 
N
P
 
K
E
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
R
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
I
Y
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
K
L
 
A
T
 
N
D
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L

6g3gA Crystal structure of edds lyase in complex with succinate (see paper)
31% identity, 87% coverage: 10:409/458 of query aligns to 6:404/497 of 6g3gA

query
sites
6g3gA
R
 
R
F
 
I
T
 
G
Q
 
R
P
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
A
F
 
K
V
 
A
E
 
P
E
 
E
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
F
-
 
D
T
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
L
Q
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
R
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
R
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
S
E
 
A
A
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
-
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
A
I
 
A
E
 
T
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
D
 
R
F
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
I
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
K
A
 
R
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
L
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
I
S
 
E
Y
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
Y
I
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
K
A
 
A
E
 
A
E
 
D
N
 
H
V
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
H
 
Q
L
 
R
Q
 
K
T
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
T
F
 
L
A
 
G
H
 
H
H
 
Y
M
 
L
L
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
E
 
E
M
 
N
F
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
Y
E
 
R
D
 
E
C
 
L
L
 
Y
K
 
A
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
I
 
L
D
 
N
R
 
R
D
 
D
Y
 
R
V
 
T
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
D
A
 
G
I
 
L
T
 
V
R
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
S
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
L
 
A
E
 
E
F
 
H
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
S
 
S
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
F
 
Y
K
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
D
D
 
A
G
 
S
F
 
F
C
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
 
R
V
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
N
 
P
L
 
L
M
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
K
 
N
S
 
A
L
 
I
P
 
E
L
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
D
 
-
K
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
-
F
 
-
D
 
R
T
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
L
K
 
I
G
 
A
S
 
A
L
 
T
K
 
H
V
 
A
F
 
M
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
T
M
 
L
S
 
H
I
 
P
Y
 
N
P
 
K
E
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
R
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
I
Y
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
K
L
 
A
T
 
N
D
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L

6g3fA Crystal structure of edds lyase in complex with fumarate (see paper)
31% identity, 87% coverage: 10:409/458 of query aligns to 6:404/497 of 6g3fA

query
sites
6g3fA
R
 
R
F
 
I
T
 
G
Q
 
R
P
 
A
T
 
T
D
 
G
A
 
A
F
 
K
V
 
A
E
 
P
E
 
E
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
F
-
 
D
T
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
L
Q
 
T
F
 
L
D
 
T
K
 
S
R
 
A
L
 
V
Y
 
F
H
 
P
Q
 
Y
D
 
D
I
 
S
R
 
Q
G
 
I
S
 
H
I
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
V
R
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
T
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
L
P
 
T
Q
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
S
E
 
A
A
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
-
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
A
I
 
A
E
 
T
E
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
L
D
 
R
F
 
-
S
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
T
H
 
Y
M
 
L
N
 
P
I
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
A
L
 
L
S
 
K
A
 
R
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
S
A
 
V
G
 
A
K
 
G
R
 
K
L
 
M
H
 
H
T
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
R
 
R
N
 
N
D
 
D
Q
 
L
V
 
A
A
 
N
L
 
A
D
 
G
I
 
K
R
 
R
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
D
E
 
Q
I
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
I
S
 
E
Y
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
Y
I
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
K
A
 
A
E
 
A
E
 
D
N
 
H
V
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
V
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
H
 
Q
L
 
R
Q
 
K
T
 
E
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
T
F
 
L
A
 
G
H
 
H
H
 
Y
M
 
L
L
 
M
A
 
A
Y
 
I
V
 
S
E
 
E
M
 
N
F
 
L
K
 
A
R
 
K
D
 
N
S
 
L
G
 
D
R
 
R
M
 
Y
E
 
R
D
 
E
C
 
L
L
 
Y
K
 
A
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
C
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
W
P
 
P
I
 
L
D
 
N
R
 
R
D
 
D
Y
 
R
V
 
T
A
 
S
E
 
A
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
F
P
 
D
A
 
G
I
 
L
T
 
V
R
 
V
N
 
N
S
 
S
L
 
I
D
 
E
S
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
G
R
 
W
D
 
D
F
 
H
A
 
V
L
 
A
E
 
E
F
 
H
I
 
A
S
 
F
A
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
V
L
 
F
M
 
L
M
 
S
H
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
E
L
 
I
I
 
Q
L
 
L
W
 
W
S
 
S
T
 
T
S
 
D
Q
 
E
F
 
Y
K
 
Q
F
 
V
I
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
D
D
 
A
G
 
S
F
 
F
C
 
A
T
 
G
G
 
T
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
|
M
P
 
P
Q
 
Q
K
|
K
K
 
K
N
|
N
P
 
P
D
 
D
V
 
S
P
 
L
E
 
E
L
 
R
V
 
S
R
 
R
G
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
F
R
 
A
V
 
A
Y
 
M
G
 
G
N
 
P
L
 
L
M
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
S
M
 
L
K
 
N
S
 
A
L
 
I
P
 
E
L
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
S
K
 
A
D
 
A
M
 
R
Q
 
V
E
 
E
D
 
-
K
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
-
F
 
-
D
 
R
T
 
S
I
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
L
K
 
I
G
 
A
S
 
A
L
 
T
K
 
H
V
 
A
F
 
M
S
 
T
D
 
G
M
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
T
M
 
L
S
 
H
I
 
P
Y
 
N
P
 
K
E
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
R
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
N
F
 
Y
S
 
S
T
 
T
A
 
M
T
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
T
D
 
D
Y
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
R
-
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
D
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
H
A
 
V
V
 
V
A
 
I
Y
 
T
C
 
A
V
 
I
E
 
E
N
 
K
E
 
G
M
 
I
E
 
K
L
 
A
T
 
N
D
 
K
L
 
I
T
 
G
L
 
L

P12047 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; Glutamyl--tRNA ligase regulatory factor; EC 4.3.2.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
23% identity, 88% coverage: 24:425/458 of query aligns to 11:413/431 of P12047

query
sites
P12047
A
 
S
S
 
A
I
 
I
Q
 
W
F
 
T
D
 
D
K
 
E
R
 
N
L
 
R
Y
 
F
H
 
Q
Q
 
A
D
 
W
I
 
L
R
 
E
G
 
V
S
 
E
I
 
I
A
 
L
H
 
A
A
 
C
R
 
E
M
 
A
L
 
W
G
 
A
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
Q
 
K
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
K
A
 
V
I
 
M
V
 
R
E
 
E
G
 
N
L
 
-
Q
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
A
S
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
I
S
 
N
I
 
R
S
 
I
L
 
L
E
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
K
D
 
D
I
 
T
H
 
R
M
 
H
N
 
D
I
 
V
E
 
V
S
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
R
R
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
S
I
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
E
G
 
R
K
 
K
R
 
W
L
 
V
H
|
H
T
 
Y
G
 
G
R
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
T
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
A
 
D
L
 
T
D
 
A
I
 
L
R
 
S
L
 
Y
Y
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
E
 
A
I
 
N
V
 
D
E
 
I
I
 
L
T
 
L
S
 
K
Y
 
D
I
 
L
D
 
E
L
 
R
L
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
I
L
 
K
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
K
E
 
E
N
 
H
V
 
K
D
 
Y
V
 
T
V
 
V
M
 
M
P
 
M
G
 
G
F
 
R
T
 
T
H
|
H
L
 
G
Q
 
V
T
 
H
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
T
L
 
T
F
 
F
A
 
G
H
 
L
H
 
K
M
 
L
L
 
A
A
 
L
Y
 
W
V
 
H
E
 
E
M
 
E
F
 
M
K
 
K
R
 
R
D
 
N
S
 
L
G
 
E
R
 
R
M
 
F
E
 
K
D
 
Q
C
 
A
L
 
K
K
 
A
R
 
G
V
 
I
N
 
E
V
 
V
L
 
G
P
 
K
L
 
I
-
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
G
L
 
T
A
 
Y
G
 
A
T
 
N
T
 
I
F
 
D
P
 
P
I
 
F
D
 
V
R
 
E
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
A
-
 
P
I
 
I
T
 
S
R
 
T
N
x
Q
S
 
T
L
 
L
D
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
Q
R
 
R
D
 
D
F
 
R
A
 
H
L
 
A
E
 
D
F
 
Y
I
 
M
S
 
A
A
 
T
S
 
L
S
 
A
I
 
L
L
 
I
M
 
A
M
 
T
H
 
S
L
 
I
S
 
E
R
 
K
L
 
F
S
 
A
E
 
V
E
 
E
L
 
I
I
 
R
L
 
G
W
 
L
S
 
Q
T
 
K
S
 
S
Q
 
E
F
 
T
K
 
R
F
 
E
I
 
V
E
 
E
-
 
E
-
 
F
L
 
F
S
 
A
D
 
K
G
 
G
F
 
-
C
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
H
K
 
K
K
 
R
N
|
N
P
 
P
D
 
I
V
 
G
P
 
S
E
 
E
L
 
N
V
 
M
R
 
T
G
 
G
K
 
M
T
 
A
G
 
R
R
 
V
V
 
I
Y
 
R
G
 
G
N
 
Y
L
 
M
M
 
M
A
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
A
M
 
Y
K
 
E
S
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
W
Y
 
H
N
 
E
K
x
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
S
E
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
A
D
 
E
K
 
R
E
 
I
P
 
I
L
 
L
F
 
P
D
 
D
T
 
A
I
 
T
D
 
I
T
 
A
V
 
L
K
 
N
G
 
Y
S
 
M
L
 
L
K
 
N
V
 
R
F
 
F
S
 
S
D
 
N
M
 
I
I
 
V
R
 
K
E
 
N
M
 
L
S
 
T
I
 
V
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
N
M
 
M
G
 
K
R
 
R
A
 
N
A
 
M
G
 
D
Q
 
R
-
 
T
-
 
L
G
 
G
F
 
L
S
 
I
T
 
Y
A
 
S
T
 
Q
D
 
R
V
 
V
A
 
L
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
D
K
 
T
G
 
G
V
 
L
A
 
T
F
 
R
R
 
E
D
 
E
A
 
A
H
 
Y
E
 
D
A
 
T
V
 
V
G
 
Q
K
 
P
A
 
K
V
 
A
A
 
M
Y
 
E
C
 
A
V
 
W
E
 
E
N
 
K
E
 
Q
M
 
V
E
 
P
L
 
F
T
 
R
D
 
E
L
 
L
T
 
V
L
 
E
T
 
A
E
 
E
W
 
E
E
 
K
L
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
R
F
 
L
S
 
S
P
 
P
R
 
E
F
 
K
E
 
I
Q
 
A
D
 
D
I
 
C
F
 
F
E
 
D

Q9LCC6 Aspartate ammonia-lyase; Aspartase; EC 4.3.1.1 from Bacillus sp. (see 3 papers)
30% identity, 40% coverage: 121:304/458 of query aligns to 154:343/468 of Q9LCC6

query
sites
Q9LCC6
L
 
L
Y
 
S
L
 
L
R
 
L
D
 
N
E
 
Q
I
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
T
 
T
S
 
K
Y
 
Y
I
 
M
D
 
Q
L
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
Q
A
 
E
L
 
F
L
 
M
T
 
K
Q
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
E
N
 
F
V
 
A
D
 
G
V
 
V
V
 
I
M
x
K
P
 
M
G
 
G
F
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
G
H
 
Q
H
 
E
M
 
F
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
E
 
R
M
 
V
F
 
I
K
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
I
G
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
A
D
 
N
C
 
T
L
 
R
K
 
N
R
 
N
V
 
L
N
 
Y
V
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
I
 
A
D
 
D
R
 
P
D
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
V
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
S
G
 
G
F
 
H
P
 
P
A
 
L
I
 
R
T
 
S
R
 
A
N
 
Q
S
 
H
L
 
L
-
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
L
 
T
E
 
E
F
 
V
I
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
I
 
V
L
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
I
S
 
A
E
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
S
 
A
T
 
S
S
 
G
Q
 
P
F
 
R
K
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
S
 
L
D
 
P
G
 
A
F
 
R
C
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
|
I
M
|
M
P
|
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
|
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
P
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3r6vG Crystal structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 with bound l- aspartate (see paper)
30% identity, 40% coverage: 121:304/458 of query aligns to 151:340/463 of 3r6vG

query
sites
3r6vG
L
 
L
Y
 
S
L
 
L
R
 
L
D
 
N
E
 
Q
I
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
T
 
T
S
 
K
Y
 
Y
I
 
M
D
 
Q
L
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
Q
A
 
E
L
 
F
L
 
M
T
 
K
Q
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
E
N
 
F
V
 
A
D
 
G
V
 
V
V
 
I
M
 
K
P
 
M
G
 
G
F
 
R
T
 
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
G
H
 
Q
H
 
E
M
 
F
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
E
 
R
M
 
V
F
 
I
K
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
I
G
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
A
D
 
N
C
 
T
L
 
R
K
 
N
R
 
N
V
 
L
N
 
Y
V
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
I
 
A
D
 
D
R
 
P
D
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
V
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
S
G
 
G
F
 
H
P
 
P
A
 
L
I
 
R
T
 
S
R
 
A
N
 
Q
S
 
H
L
 
L
-
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
L
 
T
E
 
E
F
 
V
I
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
I
 
V
L
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
I
S
 
A
E
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
S
 
A
T
 
S
S
 
G
Q
 
P
F
 
R
K
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
S
 
L
D
 
P
G
 
A
F
 
R
C
 
Q
T
 
P
G
|
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
P
 
P
E
|
E
L
 
V
V
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N

3r6qA A triclinic-lattice structure of aspartase from bacillus sp. Ym55-1 (see paper)
30% identity, 40% coverage: 121:304/458 of query aligns to 150:339/462 of 3r6qA

query
sites
3r6qA
L
 
L
Y
 
S
L
 
L
R
 
L
D
 
N
E
 
Q
I
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
T
 
T
S
 
K
Y
 
Y
I
 
M
D
 
Q
L
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
Q
A
 
E
L
 
F
L
 
M
T
 
K
Q
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
E
N
 
F
V
 
A
D
 
G
V
 
V
V
 
I
M
 
K
P
 
M
G
 
G
F
 
R
T
 
T
H
|
H
L
 
L
Q
 
Q
T
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
F
 
L
A
 
G
H
 
Q
H
 
E
M
 
F
L
 
E
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
E
 
R
M
 
V
F
 
I
K
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
I
G
 
E
R
 
R
M
 
I
E
 
A
D
 
N
C
 
T
L
 
R
K
 
N
R
 
N
V
 
L
N
 
Y
V
 
D
L
 
I
P
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
I
 
A
D
 
D
R
 
P
D
 
E
Y
 
Y
-
 
I
-
 
S
-
 
I
V
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
S
G
 
G
F
 
H
P
 
P
A
 
L
I
 
R
T
 
S
R
 
A
N
 
Q
S
 
H
L
 
L
-
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
T
S
 
Q
D
 
N
R
 
T
D
 
D
F
 
C
A
 
Y
L
 
T
E
 
E
F
 
V
I
 
S
S
 
S
A
 
A
S
 
L
S
 
K
I
 
V
L
 
C
M
 
M
M
 
I
H
 
N
L
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
I
S
 
A
E
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
R
L
 
L
W
 
M
S
 
A
T
 
S
S
 
G
Q
 
P
F
 
R
K
 
A
F
 
G
I
 
L
E
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
V
S
 
L
D
 
P
G
 
A
F
 
R
C
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
 
V
N
 
N
P
 
P
D
 
V
V
 
M
P
 
P
E
|
E
L
 
V
V
 
M
R
 
N
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
F
R
 
Q
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N

Sites not aligning to the query:

2x75A Staphylococcus aureus adenylosuccinate lyase (see paper)
23% identity, 92% coverage: 16:437/458 of query aligns to 2:412/427 of 2x75A

query
sites
2x75A
D
 
E
A
x
R
F
x
Y
V
 
S
E
 
R
E
 
E
F
 
E
T
 
M
A
 
S
S
 
N
I
 
I
Q
 
W
F
 
T
D
 
D
K
 
Q
R
 
N
L
 
R
Y
 
Y
H
 
E
Q
 
A
D
 
W
I
 
L
R
 
E
G
 
V
S
 
E
I
 
I
A
 
L
H
 
A
A
 
C
R
 
E
M
 
A
L
 
W
G
 
S
K
 
E
Q
 
L
G
 
G
I
 
H
I
 
I
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
Q
A
 
K
I
 
I
V
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
R
Q
 
Q
Q
 
N
I
 
A
L
 
K
L
 
V
Q
 
N
I
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
A
S
 
Q
F
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
E
I
 
I
S
 
E
L
 
Q
E
 
E
D
 
T
I
 
R
H
|
H
-
 
D
-
 
V
M
 
V
N
 
A
I
 
F
E
 
T
S
 
R
R
 
Q
L
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
T
I
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
E
G
 
R
K
 
K
R
 
W
L
 
V
H
 
H
T
 
Y
G
 
G
R
 
L
S
 
T
R
 
S
N
 
T
D
 
D
Q
 
V
V
 
V
-
 
D
-
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
S
I
 
F
R
 
V
L
 
I
Y
 
K
L
 
Q
R
 
A
D
 
N
E
 
D
I
 
I
V
 
I
E
 
E
I
 
-
T
 
-
S
 
K
Y
 
D
I
 
L
D
 
E
L
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
A
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
K
E
 
N
N
 
Y
V
 
K
D
 
Y
V
 
T
V
 
L
M
 
M
P
 
M
G
 
G
F
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
G
Q
 
V
T
 
H
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
I
 
T
L
 
T
F
 
F
A
 
G
H
 
V
H
 
K
M
 
M
-
 
A
L
 
L
A
 
W
Y
 
Y
V
 
T
E
 
E
M
 
M
F
 
-
K
 
Q
R
 
R
D
 
N
S
 
L
G
 
Q
R
 
R
M
 
F
E
 
K
D
 
Q
C
 
V
L
 
R
K
 
E
R
 
E
V
 
I
N
 
E
V
 
V
L
 
G
P
 
K
L
 
M
-
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
G
L
 
T
A
 
F
G
 
A
T
 
N
T
 
I
F
 
P
P
 
P
I
 
E
D
 
I
R
 
E
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
A
 
C
E
 
K
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
I
-
 
G
-
 
T
P
 
A
A
 
P
I
 
V
T
 
S
R
 
T
N
 
Q
S
 
T
L
 
L
D
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
Q
R
 
R
D
 
D
F
 
R
A
 
H
L
 
A
E
 
Y
F
 
Y
I
 
I
S
 
A
A
 
T
S
 
L
S
 
A
I
 
L
L
 
I
M
 
A
M
 
T
H
 
S
L
 
L
S
 
E
R
 
K
L
 
F
S
 
A
E
 
V
E
 
E
L
 
I
I
 
R
L
 
N
W
 
L
S
 
Q
T
 
K
S
 
T
Q
 
E
F
 
T
K
 
R
F
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
V
S
 
E
D
 
E
G
 
A
F
 
F
C
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
H
K
|
K
K
 
R
N
 
N
P
 
P
D
 
I
V
 
G
P
 
S
E
|
E
L
x
N
V
 
I
R
 
T
G
 
G
K
 
I
T
 
S
G
 
R
R
 
V
V
 
I
Y
 
R
G
 
G
N
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
Y
L
 
I
L
 
T
T
 
T
V
 
A
M
 
Y
K
 
E
S
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
W
Y
 
H
N
 
E
K
 
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
S
E
 
H
-
 
S
-
 
S
-
 
A
D
 
E
K
 
R
E
 
I
P
 
M
L
 
L
F
 
P
D
 
D
T
 
V
I
 
T
D
 
I
T
 
A
V
 
L
K
 
D
G
 
Y
S
 
A
L
 
L
K
 
N
V
 
R
F
 
F
S
 
T
D
 
N
M
 
I
I
 
V
R
 
D
E
 
R
M
 
L
S
 
T
I
 
V
Y
 
F
P
 
E
E
 
D
A
 
N
M
 
M
G
 
R
R
 
N
A
 
N
A
 
I
G
 
D
Q
 
K
G
 
T
F
 
F
S
 
G
T
 
L
-
 
I
-
 
F
A
 
S
T
 
Q
D
 
R
V
 
V
A
 
L
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
V
 
M
A
 
V
F
 
R
R
 
E
D
 
E
A
 
A
H
 
Y
E
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
Q
K
 
P
A
 
K
V
 
A
A
 
-
Y
 
-
C
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
M
T
 
I
E
 
S
W
 
W
E
 
E
L
 
T
F
 
K
S
 
T
P
 
P
-
 
F
-
 
R
-
 
E
R
 
L
F
 
I
E
 
E
Q
 
Q
D
 
D
I
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
S
I
 
I
T
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
E
C
 
C
I
 
F
D
 
D
A
 
P
R
 
K
N
 
H

P9WN93 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
26% identity, 48% coverage: 87:308/458 of query aligns to 109:347/474 of P9WN93

query
sites
P9WN93
H
 
N
M
 
M
N
 
N
I
 
T
E
 
N
S
 
E
R
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
S
R
 
I
I
 
A
G
 
A
E
 
K
A
 
G
G
 
G
K
 
V
R
 
T
L
 
L
H
 
H
T
 
P
G
 
N
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
M
-
 
S
R
 
Q
S
|
S
R
x
S
N
|
N
D
 
D
Q
 
T
V
 
F
A
 
P
L
 
T
D
 
A
I
 
T
R
 
H
L
 
I
Y
 
A
L
 
A
R
 
T
D
 
E
E
 
A
I
 
A
V
 
V
-
 
A
E
 
H
I
 
L
T
 
I
S
 
P
Y
 
A
I
 
L
D
 
Q
L
 
Q
L
 
L
I
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
E
 
L
E
 
D
N
 
W
V
 
H
D
 
T
V
 
V
V
 
V
M
 
K
P
 
S
G
 
G
F
 
R
T
|
T
H
 
H
L
 
L
Q
 
M
T
 
D
A
 
A
Q
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
T
F
 
L
A
 
G
H
 
Q
H
 
E
M
 
F
L
 
S
A
 
G
Y
 
Y
V
 
A
E
 
R
M
 
Q
F
 
I
K
 
E
R
 
A
D
 
G
S
 
I
G
 
E
R
 
R
M
 
V
E
 
R
D
 
A
C
 
C
L
 
L
K
 
P
R
 
R
V
 
L
N
 
G
V
 
E
L
 
L
P
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
-
G
 
G
A
 
T
L
 
A
A
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
G
F
 
L
P
 
N
I
 
A
D
 
P
R
 
D
D
 
D
Y
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
V
V
 
L
A
 
V
E
 
A
Q
 
Q
L
 
T
G
 
G
F
 
L
P
 
S
A
 
E
I
 
L
-
 
R
-
 
T
T
 
A
R
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
F
D
 
E
S
 
A
V
 
Q
S
 
A
D
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
G
A
 
L
L
 
V
E
 
E
F
 
A
I
 
S
S
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
R
I
 
T
L
 
I
M
 
A
M
 
V
H
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
K
L
 
I
S
 
A
E
 
N
E
 
D
L
 
-
I
 
I
L
 
R
W
 
W
S
 
M
T
 
G
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
T
Q
 
G
F
 
L
K
 
A
F
 
E
I
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
 
P
D
 
D
G
 
-
F
 
L
C
 
Q
T
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
Q
 
G
K
|
K
K
x
V
N
|
N
P
 
P
D
 
V
V
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
Q
K
 
V
T
 
A
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
D
M
 
A
A
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_011736993.1 NCBI__GCF_000015045.1:WP_011736993.1
MSKDKLWGGRFTQPTDAFVEEFTASIQFDKRLYHQDIRGSIAHARMLGKQGIIPQADVEA
IVEGLQQILLQIEEGSFDFSISLEDIHMNIESRLSARIGEAGKRLHTGRSRNDQVALDIR
LYLRDEIVEITSYIDLLIDALLTQAEENVDVVMPGFTHLQTAQPILFAHHMLAYVEMFKR
DSGRMEDCLKRVNVLPLGAGALAGTTFPIDRDYVAEQLGFPAITRNSLDSVSDRDFALEF
ISASSILMMHLSRLSEELILWSTSQFKFIELSDGFCTGSSIMPQKKNPDVPELVRGKTGR
VYGNLMALLTVMKSLPLAYNKDMQEDKEPLFDTIDTVKGSLKVFSDMIREMSIYPEAMGR
AAGQGFSTATDVADYLVRKGVAFRDAHEAVGKAVAYCVENEMELTDLTLTEWELFSPRFE
QDIFEAITVDACIDARNVPGGTAREQVKGEIARCRKGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory