SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011764552.1 NCBI__GCF_000061505.1:WP_011764552.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

4g09A The crystal structure of the c366s mutant of hdh from brucella suis in complex with a substituted benzyl ketone (see paper)
51% identity, 99% coverage: 5:436/436 of query aligns to 2:424/432 of 4g09A

query
sites
4g09A
T
 
T
P
 
T
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
L
 
T
D
 
D
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
P
D
 
D
F
 
F
L
 
E
A
 
Q
T
 
K
L
 
F
D
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
F
 
G
E
 
E
S
 
D
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
V
R
 
D
A
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
R
T
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
S
A
 
A
V
 
L
M
 
L
E
 
D
Y
 
Y
T
 
S
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
H
 
R
V
 
I
E
 
D
A
 
L
K
 
E
S
 
K
M
 
-
V
 
T
E
 
G
L
 
I
E
 
A
L
 
V
P
 
T
K
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
D
S
 
A
L
 
A
T
 
P
V
 
A
E
 
S
Q
 
T
R
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
R
D
 
D
R
 
R
V
 
I
R
 
E
I
 
K
Y
 
H
H
 
H
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
R
 
L
A
 
P
E
 
K
S
 
D
W
 
D
D
 
R
Y
 
Y
V
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
L
G
 
G
S
 
V
R
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
S
K
 
R
V
 
W
T
 
T
P
 
A
L
 
I
D
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
|
A
S
 
S
Y
|
Y
P
 
P
S
|
S
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
M
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
D
E
 
R
L
 
I
I
 
V
M
 
M
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
P
 
P
R
 
D
G
 
G
E
 
N
K
 
L
N
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
L
T
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
S
R
 
E
V
 
I
F
 
Y
T
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
T
I
 
I
P
 
R
Q
 
P
V
 
V
D
 
A
K
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
I
V
 
V
F
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
I
I
 
V
S
 
A
D
 
D
G
 
K
S
 
D
G
 
N
H
 
N
A
 
P
D
 
D
W
 
W
V
 
I
A
 
A
M
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
D
E
 
T
L
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
L
 
L
L
 
M
C
 
T
T
 
N
D
 
D
A
 
E
G
 
A
F
 
F
L
 
A
D
 
H
A
 
A
V
 
V
H
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
H
T
 
T
M
 
L
P
 
A
R
 
R
R
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
A
A
 
S
R
 
A
S
 
S
L
 
W
A
 
R
N
 
D
R
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
I
H
 
L
V
 
V
G
 
K
S
x
D
L
 
F
E
 
E
Q
x
D
A
 
A
C
 
I
A
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
A
P
 
A
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
E
L
 
I
S
 
A
M
 
V
E
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
A
W
 
F
I
 
V
D
 
P
A
 
R
I
 
I
R
 
R
H
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
I
G
 
G
H
 
G
W
 
Y
A
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
V
L
 
I
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
V
A
 
G
G
 
G
P
 
S
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
F
S
 
S
S
 
S
P
 
G
L
 
L
G
 
S
V
 
V
Y
 
L
D
 
D
F
 
Y
Q
 
M
K
 
K
R
 
R
T
 
T
S
 
S
I
 
L
V
 
L
Q
 
K
I
 
L
S
 
G
E
 
S
A
 
E
G
 
Q
A
 
L
Q
 
R
H
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
P
I
 
A
A
 
A
S
 
I
V
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
R
G
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
A
 
V
E
 
A
M
 
I
R
 
R
L
 
L
K
 
N
V
 
L

1kaeA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with l- histidinol (substrate), zinc and NAD (cofactor) (see paper)
41% identity, 93% coverage: 31:435/436 of query aligns to 28:428/434 of 1kaeA

query
sites
1kaeA
A
 
A
D
 
S
E
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
T
S
 
R
A
 
T
V
 
V
T
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
A
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
L
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
 
A
R
 
K
F
|
F
D
 
D
H
 
K
V
 
T
E
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
T
M
 
V
V
 
T
E
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
P
 
S
K
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
S
D
 
E
S
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
T
Y
 
F
H
 
H
E
 
T
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
L
E
 
P
S
 
P
W
 
V
D
 
D
Y
 
V
V
 
E
E
 
T
A
 
Q
D
 
P
G
 
G
S
 
V
R
 
R
L
 
C
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
V
V
 
T
T
 
R
P
 
P
L
 
V
D
 
A
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
P
|
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
 
L
P
 
F
S
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
C
V
 
S
P
|
P
T
 
P
P
 
P
R
 
I
G
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
R
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
N
I
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
|
P
G
|
G
N
|
N
A
 
A
F
|
F
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
G
 
D
T
 
G
V
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
S
S
 
G
G
 
A
H
 
T
A
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
P
D
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
M
L
 
A
D
 
R
A
 
R
V
 
V
H
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
A
T
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
V
V
 
T
G
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
C
C
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
M
 
T
E
 
R
D
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
D
W
 
W
A
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
T
R
 
A
F
 
T
S
 
C
S
 
S
P
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
M
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
Q
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
S
I
 
T
A
 
I
S
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
A
E
 
E
G
 
R
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
N
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
V
K
 
N

P06988 Histidinol dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.23 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
41% identity, 93% coverage: 31:435/436 of query aligns to 28:428/434 of P06988

query
sites
P06988
A
 
A
D
 
S
E
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
T
S
 
R
A
 
T
V
 
V
T
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
A
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
L
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
 
A
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
T
E
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
T
M
 
V
V
 
T
E
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
P
 
S
K
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
S
D
 
E
S
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
T
Y
 
F
H
 
H
E
 
T
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
L
E
 
P
S
 
P
W
 
V
D
 
D
Y
 
V
V
 
E
E
 
T
A
 
Q
D
 
P
G
 
G
S
 
V
R
 
R
L
 
C
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
V
V
 
T
T
 
R
P
 
P
L
 
V
D
 
A
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
 
L
P
 
F
S
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
C
V
 
S
P
 
P
T
 
P
P
 
P
R
 
I
G
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
R
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
|
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
|
N
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
G
 
D
T
 
G
V
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
S
S
 
G
G
 
A
H
 
T
A
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
P
D
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
M
L
 
A
D
 
R
A
 
R
V
 
V
H
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
A
T
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
V
V
 
T
G
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
C
C
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
M
 
T
E
 
R
D
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
D
W
 
W
A
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
T
R
 
A
F
 
T
S
 
C
S
 
S
P
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
M
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
Q
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
S
I
 
T
A
 
I
S
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
A
E
 
E
G
 
R
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
N
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
V
K
 
N

Sites not aligning to the query:

P10370 Histidinol dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.23 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
41% identity, 93% coverage: 31:435/436 of query aligns to 28:428/434 of P10370

query
sites
P10370
A
 
A
D
 
S
E
 
D
R
 
S
I
 
I
D
 
T
S
 
R
A
 
T
V
 
V
T
 
S
E
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
T
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
D
A
 
A
V
 
L
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
 
A
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
-
K
 
-
S
 
-
M
 
V
V
 
T
E
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
V
P
 
T
K
 
P
A
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
G
D
 
A
S
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
T
I
 
A
A
 
A
A
 
V
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
T
Y
 
F
H
|
H
E
 
S
R
 
A
Q
 
Q
R
 
T
A
 
L
E
 
P
S
 
P
W
 
V
D
 
D
Y
 
V
V
 
E
E
 
T
A
 
Q
D
 
P
G
 
G
S
 
V
R
 
R
L
x
C
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
V
V
 
T
T
 
R
P
 
P
L
 
V
D
 
S
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
 
L
P
 
F
S
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
x
C
E
 
Q
E
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
C
V
 
S
P
 
P
T
 
P
P
 
P
R
 
I
G
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
R
 
E
V
 
I
F
 
F
T
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
S
Q
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
G
 
D
T
 
G
V
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
S
S
 
G
G
 
A
H
 
T
A
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
D
F
 
I
L
 
A
D
 
R
A
 
K
V
 
V
H
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
A
T
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
A
E
 
D
T
 
T
I
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
N
 
S
R
 
A
G
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
V
V
 
T
G
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
C
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
 
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
M
 
T
E
 
R
D
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
D
W
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
D
W
 
W
A
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
T
R
 
A
F
 
T
S
 
C
S
 
S
P
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
M
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
F
Q
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
S
I
 
T
A
 
I
S
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
A
E
 
E
G
 
R
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
N
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
V
K
 
N

Sites not aligning to the query:

1karA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with histamine (inhibitor), zinc and NAD (cofactor) (see paper)
41% identity, 93% coverage: 31:435/436 of query aligns to 25:425/431 of 1karA

query
sites
1karA
A
 
A
D
 
S
E
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
T
S
 
R
A
 
T
V
 
V
T
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
A
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
L
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
 
A
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
T
E
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
T
M
 
V
V
 
T
E
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
P
 
S
K
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
S
D
 
E
S
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
T
Y
 
F
H
 
H
E
 
T
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
L
E
 
P
S
 
P
W
 
V
D
 
D
Y
 
V
V
 
E
E
 
T
A
 
Q
D
 
P
G
 
G
S
 
V
R
 
R
L
 
C
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
V
V
 
T
T
 
R
P
 
P
L
 
V
D
 
A
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
 
L
P
 
F
S
|
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
C
V
 
S
P
 
P
T
 
P
P
 
P
R
 
I
G
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
R
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
G
 
D
T
 
G
V
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
S
S
 
G
G
 
A
H
 
T
A
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
P
D
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
M
L
 
A
D
 
R
A
 
R
V
 
V
H
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
A
T
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
V
V
 
T
G
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
C
C
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
M
 
T
E
 
R
D
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
D
W
 
W
A
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
T
R
 
A
F
 
T
S
 
C
S
 
S
P
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
M
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
Q
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
S
I
 
T
A
 
I
S
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
A
E
 
E
G
 
R
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
N
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
V
K
 
N

1kahA L-histidinol dehydrogenase (hisd) structure complexed with l-histidine (product), zn and NAD (cofactor) (see paper)
41% identity, 93% coverage: 31:435/436 of query aligns to 25:425/431 of 1kahA

query
sites
1kahA
A
 
A
D
 
S
E
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
T
S
 
R
A
 
T
V
 
V
T
 
N
E
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
A
T
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
V
 
L
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
 
A
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
T
E
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
T
M
 
V
V
 
T
E
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
P
 
S
K
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
I
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
S
D
 
E
S
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
T
Y
 
F
H
 
H
E
 
T
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
L
E
 
P
S
 
P
W
 
V
D
 
D
Y
 
V
V
 
E
E
 
T
A
 
Q
D
 
P
G
 
G
S
 
V
R
 
R
L
 
C
G
 
Q
Q
 
Q
K
 
V
V
 
T
T
 
R
P
 
P
L
 
V
D
 
A
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
x
L
P
 
F
S
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
K
L
 
V
I
 
V
M
 
L
V
 
C
V
 
S
P
 
P
T
 
P
P
 
P
R
 
I
G
 
A
E
 
D
K
 
E
N
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
L
T
 
C
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
R
 
D
V
 
V
F
 
F
T
 
N
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
V
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
R
F
 
L
G
 
D
T
 
G
V
 
A
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
S
S
 
G
G
 
A
H
 
T
A
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
P
D
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
M
L
 
A
D
 
R
A
 
R
V
 
V
H
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
Q
L
 
L
P
 
A
T
 
E
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
A
A
 
L
N
 
N
R
 
A
G
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
V
V
 
T
G
 
K
S
 
D
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
C
C
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
I
 
Y
A
 
G
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
M
 
T
E
 
R
D
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
W
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
D
W
 
W
A
 
S
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
T
R
 
A
F
 
T
S
 
C
S
 
S
P
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
Y
 
A
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
M
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
E
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
Q
 
S
H
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
S
I
 
T
A
 
I
S
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
A
E
|
E
G
 
R
L
|
L
Q
 
T
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
N
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
V
K
 
N

5vlcA Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with l-histidinol (see paper)
36% identity, 95% coverage: 20:435/436 of query aligns to 11:425/431 of 5vlcA

query
sites
5vlcA
T
 
T
L
 
Q
D
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
F
 
L
E
 
K
S
 
S
E
 
R
A
 
P
D
 
R
E
 
I
R
 
S
I
 
V
D
 
F
S
 
D
A
 
I
V
 
V
T
 
N
E
 
P
I
 
I
L
 
V
R
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
S
 
A
T
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
K
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
R
 
S
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
V
E
 
D
A
 
L
K
 
E
S
 
N
M
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
D
A
 
P
E
 
V
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
L
 
I
D
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
D
 
S
R
 
N
V
 
I
R
 
Y
I
 
A
Y
 
F
H
 
H
E
 
A
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
S
E
 
P
S
 
E
W
 
K
D
 
S
Y
 
V
V
 
E
E
 
N
A
 
M
D
 
K
G
 
G
S
 
V
R
 
Q
L
 
C
G
 
K
Q
 
R
K
 
V
V
 
A
T
 
R
P
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
V
Y
 
L
P
 
P
S
 
S
S
 
T
V
 
A
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
T
L
 
I
I
 
V
M
 
L
V
 
A
V
 
N
P
 
P
T
 
P
P
 
T
R
 
R
-
 
D
G
 
G
E
 
T
K
 
T
N
 
C
P
 
K
L
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
K
I
 
K
T
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
T
R
 
H
V
 
L
F
 
L
T
 
K
I
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
T
I
 
C
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
Q
F
 
Y
V
 
V
A
 
T
E
 
A
A
 
A
K
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
L
R
 
Q
R
 
N
V
 
S
F
 
E
G
 
A
T
 
M
V
 
V
G
 
S
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
K
S
 
H
G
 
A
H
 
I
A
 
P
D
 
S
W
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
V
C
 
I
T
 
A
D
 
G
A
 
D
G
 
G
F
 
V
-
 
D
L
 
Q
D
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Q
A
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
S
R
 
K
L
 
Q
L
 
C
P
 
Q
T
 
S
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
G
E
 
E
T
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
H
R
 
-
G
 
S
A
 
F
L
 
I
I
 
V
H
 
H
V
 
A
G
 
R
S
 
D
L
 
M
E
 
L
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
T
I
 
F
A
 
S
N
 
N
R
 
M
I
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
N
M
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
W
 
W
I
 
E
D
 
S
A
 
F
I
 
I
R
 
E
H
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
S
W
 
W
A
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
V
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
 
Y
S
 
S
P
 
G
L
 
V
G
 
S
V
 
L
Y
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
L
K
 
K
R
 
Y
T
 
I
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
S
I
 
L
S
 
T
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
H
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
P
I
 
Y
A
 
V
S
 
E
V
 
T
L
 
M
A
 
A
H
 
E
G
 
V
E
|
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
R
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
Q

6an0A Crystal structure of histidinol dehydrogenase from elizabethkingia anophelis
35% identity, 92% coverage: 33:435/436 of query aligns to 29:429/433 of 6an0A

query
sites
6an0A
E
 
E
R
 
D
I
 
L
D
 
Q
S
 
N
A
 
I
V
 
V
T
 
L
E
 
T
I
 
V
L
 
F
R
 
E
A
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
N
T
 
E
G
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
L
M
 
I
E
 
N
Y
 
Y
T
 
T
R
 
K
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
Y
M
 
L
V
 
T
E
 
D
L
 
I
E
 
R
L
 
V
P
 
S
K
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
A
S
 
L
L
 
V
T
 
S
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
R
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
I
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
S
R
 
N
V
 
I
R
 
E
I
 
K
Y
 
F
H
 
H
E
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
K
A
 
-
E
|
E
S
x
N
W
x
K
D
 
N
Y
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
T
-
 
T
D
 
E
G
 
G
S
 
V
R
 
N
L
 
C
G
 
W
Q
x
R
K
x
E
V
x
A
T
 
R
P
 
P
L
 
I
D
 
E
R
 
N
V
 
I
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
S
A
 
A
S
 
P
Y
 
L
P
 
F
S
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
Q
V
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
N
L
 
I
I
 
T
M
 
L
V
 
C
V
 
T
P
 
P
T
 
P
P
 
D
R
 
E
-
 
S
G
 
G
E
 
N
K
 
I
N
 
N
P
 
P
L
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
N
I
 
L
T
 
I
G
 
G
V
 
I
D
 
K
R
 
N
V
 
I
F
 
Y
T
 
K
I
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
T
I
 
I
P
 
E
Q
 
K
V
 
A
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
Q
F
 
Y
V
 
V
A
 
T
E
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
-
 
I
-
 
A
R
 
Q
V
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
-
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
T
S
 
T
G
 
A
H
 
N
A
 
P
D
 
E
W
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
A
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
E
G
 
N
F
 
I
L
 
L
D
 
Q
A
 
Q
V
 
T
H
 
L
A
 
M
A
 
Q
I
 
V
D
 
E
R
 
N
L
 
Q
L
 
L
P
 
T
T
 
Q
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
K
E
 
S
T
 
I
I
 
A
A
 
S
R
 
Q
S
 
A
L
 
L
-
 
L
A
 
Q
N
 
S
R
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
I
 
I
H
 
V
V
 
L
G
 
D
S
 
S
L
 
I
E
 
E
Q
 
K
A
 
C
C
 
I
A
 
A
I
 
F
A
 
S
N
 
N
R
 
L
I
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
L
S
 
A
M
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
T
E
 
E
R
 
N
W
 
Y
I
 
T
D
 
D
A
 
K
I
 
I
R
 
T
H
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
N
W
 
F
A
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
 
H
V
 
T
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
N
R
 
G
S
 
Y
A
 
A
R
 
R
F
 
N
S
 
Y
S
 
S
P
 
G
L
 
V
G
 
S
V
 
L
Y
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
I
K
 
K
R
x
K
T
 
I
S
 
T
I
 
F
V
 
Q
Q
 
K
I
 
V
S
 
T
E
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
I
Q
 
Q
H
 
N
L
 
I
G
 
G
K
 
P
I
 
G
A
 
I
S
 
E
V
 
K
L
 
M
A
 
A
H
 
E
G
 
A
E
 
E
G
 
E
L
 
L
Q
 
F
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
H
S
 
A
A
 
V
E
 
S
M
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
K

5vldF Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with l-histidine and NAD+ (see paper)
37% identity, 95% coverage: 20:435/436 of query aligns to 11:428/435 of 5vldF

query
sites
5vldF
T
 
T
L
 
Q
D
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
F
 
L
E
 
K
S
 
S
E
 
R
A
 
P
D
 
-
E
 
-
R
 
R
I
 
I
D
 
D
S
 
F
A
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
I
V
 
V
T
 
N
E
 
P
I
 
I
L
 
V
R
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
S
 
A
T
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
K
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
R
 
S
R
 
K
F
|
F
D
|
D
H
 
K
V
 
V
E
 
D
A
 
L
K
 
E
S
 
N
M
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
D
A
 
P
E
 
V
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
L
 
I
D
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
D
 
S
R
 
N
V
 
I
R
 
Y
I
 
A
Y
 
F
H
 
H
E
 
A
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
S
E
 
P
S
 
E
W
 
K
D
 
S
Y
 
V
V
 
E
E
 
N
A
 
M
D
 
K
G
 
G
S
 
V
R
 
Q
L
 
C
G
 
K
Q
 
R
K
 
V
V
 
A
T
 
R
P
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
P
|
P
G
 
G
G
|
G
R
x
T
A
 
A
S
 
V
Y
 
L
P
 
P
S
|
S
S
 
T
V
 
A
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
T
L
 
I
I
 
V
M
 
L
V
 
A
V
 
N
P
 
P
T
 
P
P
 
T
R
 
R
-
 
D
G
 
G
E
 
T
K
 
T
N
 
C
P
 
K
L
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
K
I
 
K
T
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
T
R
 
H
V
 
L
F
 
L
T
 
K
I
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
|
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
T
I
 
C
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
|
P
G
|
G
N
|
N
A
 
Q
F
x
Y
V
 
V
A
 
T
E
 
A
A
 
A
K
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
L
R
 
Q
R
 
N
V
 
S
F
 
E
G
 
A
T
 
M
V
 
V
G
 
S
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
|
A
G
|
G
P
 
P
S
|
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
K
S
 
H
G
 
A
H
 
I
A
 
P
D
 
S
W
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
V
C
 
I
T
 
A
D
 
G
A
 
D
G
 
G
F
 
V
-
 
D
L
 
Q
D
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Q
A
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
S
R
 
K
L
 
Q
L
 
C
P
 
Q
T
 
S
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
G
E
 
E
T
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
H
R
 
-
G
 
S
A
 
F
L
 
I
I
 
V
H
 
H
V
 
A
G
 
R
S
 
D
L
 
M
E
 
L
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
T
I
 
F
A
 
S
N
 
N
R
 
M
I
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
N
M
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
W
 
W
I
 
E
D
 
S
A
 
F
I
 
I
R
 
E
H
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
S
W
 
W
A
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
V
G
 
G
D
|
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
|
H
V
|
V
L
|
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
 
Y
S
 
S
P
 
G
L
 
V
G
 
S
V
 
L
Y
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
L
K
 
K
R
 
Y
T
 
I
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
S
I
 
L
S
 
T
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
H
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
P
I
 
Y
A
 
V
S
 
E
V
 
T
L
 
M
A
 
A
H
 
E
G
 
V
E
|
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
R
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
Q

5vlbA Crystal structure of medicago truncatula l-histidinol dehydrogenase in complex with imidazole (see paper)
37% identity, 95% coverage: 20:435/436 of query aligns to 10:427/434 of 5vlbA

query
sites
5vlbA
T
 
T
L
 
Q
D
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
S
F
 
L
E
 
K
S
 
S
E
 
R
A
 
P
D
 
-
E
 
-
R
 
R
I
 
I
D
 
D
S
 
F
A
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
I
V
 
V
T
 
N
E
 
P
I
 
I
L
 
V
R
 
D
A
 
D
V
 
V
R
 
H
S
 
A
T
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
K
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
R
 
S
R
 
K
F
 
F
D
 
D
H
 
K
V
 
V
E
 
D
A
 
L
K
 
E
S
 
N
M
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
D
A
 
P
E
 
V
L
 
L
Q
 
D
A
 
P
A
 
A
L
 
I
D
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
Y
D
 
S
R
 
N
V
 
I
R
 
Y
I
 
A
Y
 
F
H
 
H
E
 
A
R
 
A
Q
 
Q
R
 
K
A
 
S
E
 
P
S
 
E
W
 
K
D
 
S
Y
 
V
V
 
E
E
 
N
A
 
M
D
 
K
G
 
G
S
 
V
R
 
Q
L
 
C
G
 
K
Q
 
R
K
 
V
V
 
A
T
 
R
P
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
A
S
 
V
Y
 
L
P
 
P
S
 
S
S
 
T
V
 
A
L
 
L
M
 
M
N
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
K
E
 
T
L
 
I
I
 
V
M
 
L
V
 
A
V
 
N
P
 
P
T
 
P
P
 
T
R
 
R
-
 
D
G
 
G
E
 
T
K
 
T
N
 
C
P
 
K
L
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
K
I
 
K
T
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
T
R
 
H
V
 
L
F
 
L
T
 
K
I
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
T
I
 
C
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
E
K
 
K
I
 
I
V
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
A
 
Q
F
 
Y
V
 
V
A
 
T
E
 
A
A
 
A
K
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
L
R
 
Q
R
 
N
V
 
S
F
 
E
G
 
A
T
 
M
V
 
V
G
 
S
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
P
A
 
A
G
 
G
P
 
P
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
V
I
 
I
S
 
A
D
 
D
G
 
K
S
 
H
G
 
A
H
 
I
A
 
P
D
 
S
W
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
H
|
H
D
 
G
E
 
P
L
 
D
A
 
S
Q
 
Q
S
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
V
C
 
I
T
 
A
D
 
G
A
 
D
G
 
G
F
 
V
-
 
D
L
 
Q
D
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Q
A
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
S
R
 
K
L
 
Q
L
 
C
P
 
Q
T
 
S
M
 
L
P
 
P
R
 
R
R
 
G
E
 
E
T
 
F
I
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
H
R
 
-
G
 
S
A
 
F
L
 
I
I
 
V
H
 
H
V
 
A
G
 
R
S
 
D
L
 
M
E
 
L
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
T
I
 
F
A
 
S
N
 
N
R
 
M
I
 
Y
A
 
A
P
 
P
E
|
E
H
|
H
L
 
L
E
 
I
L
 
I
S
 
N
M
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
W
 
W
I
 
E
D
 
S
A
 
F
I
 
I
R
 
E
H
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
S
I
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
G
H
 
S
W
 
W
A
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
S
L
 
V
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
G
P
 
T
N
 
N
H
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
Y
R
 
G
S
 
Y
A
 
A
R
 
R
F
 
M
S
 
Y
S
 
S
P
 
G
L
 
V
G
 
S
V
 
L
Y
 
D
D
 
S
F
 
F
Q
 
L
K
 
K
R
 
Y
T
 
I
S
 
T
I
 
V
V
 
Q
Q
 
S
I
 
L
S
 
T
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
H
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
P
I
 
Y
A
 
V
S
 
E
V
 
T
L
 
M
A
 
A
H
 
E
G
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
H
|
H
A
 
K
R
 
R
S
 
A
A
 
V
E
 
T
M
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
Q

Query Sequence

>WP_011764552.1 NCBI__GCF_000061505.1:WP_011764552.1
MSFATPIRRLDARQPDFLATLDALLAFESEADERIDSAVTEILRAVRSTGDAAVMEYTRR
FDHVEAKSMVELELPKAELQAALDSLTVEQREALRIAADRVRIYHERQRAESWDYVEADG
SRLGQKVTPLDRVGLYVPGGRASYPSSVLMNAIPAKVAGVEELIMVVPTPRGEKNPLVLA
AAAITGVDRVFTIGGAQAVAALAYGTQTIPQVDKIVGPGNAFVAEAKRRVFGTVGIDMVA
GPSEVLIISDGSGHADWVAMDLFAQAEHDELAQSILLCTDAGFLDAVHAAIDRLLPTMPR
RETIARSLANRGALIHVGSLEQACAIANRIAPEHLELSMEDAERWIDAIRHAGAIFVGHW
AVEALGDYCAGPNHVLPTMRSARFSSPLGVYDFQKRTSIVQISEAGAQHLGKIASVLAHG
EGLQAHARSAEMRLKV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory