SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011778289.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011778289.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
30% identity, 88% coverage: 13:293/321 of query aligns to 16:295/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
H
 
H
R
 
Q
E
 
K
R
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
L
M
 
R
P
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
Y
T
 
T
E
 
N
V
 
I
L
 
E
W
 
F
H
 
H
V
 
K
A
 
G
G
 
A
V
 
L
P
 
D
E
 
D
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
D
E
 
A
V
 
H
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
L
R
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
H
F
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
D
M
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
G
P
 
A
A
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
N
K
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
K
-
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
P
V
 
V
A
 
F
N
 
N
T
 
A
-
 
P
F
 
F
H
 
S
H
x
N
E
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
V
L
 
P
T
 
E
Q
 
A
D
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
H
D
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
A
 
N
S
 
K
S
 
L
V
 
A
Y
 
A
D
 
G
S
 
S
T
 
F
V
 
E
P
 
A
Q
 
R
P
 
G
S
 
K
T
 
K
L
 
L
A
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
G
F
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
|
G
H
|
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
H
 
Q
T
 
L
W
 
G
K
 
I
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
V
 
S
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
Y
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
V
x
Y
T
x
D
G
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
V
x
I
A
 
E
D
 
N
D
 
K
A
 
L
G
 
P
L
 
L
A
 
G
W
 
N
V
 
A
D
 
T
D
 
Q
T
 
V
G
 
Q
K
 
H
L
 
L
E
 
S
R
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
N
E
 
M
C
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
S
V
 
L
S
x
H
A
x
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
R
 
P
H
x
S
T
 
T
E
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
S
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
I
R
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
K
A
 
H
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
P
R
 
T
Y
x
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
C
 
S
A
 
D
P
 
P
S
 
F
D
 
T
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
I
 
V
L
 
L
M
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
x
G
G
 
G
V
 
S
T
 
T
T
 
Q
D
 
E

2gsdA NAD-dependent formate dehydrogenase from bacterium moraxella sp.C2 in complex with NAD and azide (see paper)
32% identity, 80% coverage: 36:291/321 of query aligns to 84:337/399 of 2gsdA

query
sites
2gsdA
E
 
E
D
 
K
E
 
H
L
 
L
R
 
H
K
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
V
F
 
I
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
x
P
F
|
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
A
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
P
N
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
N
D
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
 
S
R
 
N
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
V
V
 
L
M
 
G
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
I
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
D
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
A
Q
 
R
P
 
S
S
 
Y
T
 
D
L
 
V
A
 
E
D
 
G
A
 
M
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
x
A
F
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
R
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
-
T
 
M
A
 
H
A
 
L
A
 
H
V
 
Y
T
 
T
G
x
D
S
x
R
G
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
N
L
 
L
A
 
T
W
 
W
V
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
H
G
 
A
K
 
T
L
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
G
E
 
A
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
 
C
P
|
P
L
 
L
N
x
H
R
 
P
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
C
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
I
Y
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
x
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
N
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
H
I
 
N
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
S

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
29% identity, 88% coverage: 13:293/321 of query aligns to 16:295/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
H
 
H
R
 
Q
E
 
K
R
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
L
M
 
R
P
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
Y
T
 
T
E
 
N
V
 
I
L
 
E
W
 
F
H
 
H
V
 
K
A
 
G
G
 
A
V
 
L
P
 
D
E
 
D
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
D
E
 
A
V
 
H
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
L
R
|
R
-
x
S
-
 
R
-
 
T
-
 
H
F
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
D
M
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
G
P
 
C
A
 
F
A
x
C
A
x
I
G
|
G
T
 
T
D
x
N
K
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
K
-
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
P
V
 
V
A
 
F
N
 
N
T
 
A
-
 
P
F
|
F
H
 
S
H
x
N
E
 
T
R
 
R
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
V
L
 
P
T
 
E
Q
 
A
D
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
H
D
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
A
 
N
S
 
K
S
 
L
V
 
A
Y
 
A
D
 
G
S
 
S
T
 
F
V
 
E
P
 
A
Q
 
R
P
 
G
S
 
K
T
 
K
L
 
L
A
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
G
F
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
Y
G
|
G
H
|
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
H
 
Q
T
 
L
W
 
G
K
 
I
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
V
 
S
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
Y
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
V
x
Y
T
x
D
G
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
V
x
I
A
 
E
D
 
N
D
x
K
A
 
L
G
 
P
L
 
L
A
 
G
W
 
N
V
 
A
D
 
T
D
 
Q
T
 
V
G
 
Q
K
 
H
L
 
L
E
 
S
R
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
N
E
 
M
C
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
S
V
 
L
S
x
H
A
x
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
R
 
P
H
 
S
T
 
T
E
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
S
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
I
R
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
K
A
 
H
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
P
R
 
T
Y
x
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
C
 
S
A
 
D
P
 
P
S
 
F
D
 
T
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
I
 
V
L
 
L
M
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
x
G
G
 
G
V
 
S
T
 
T
T
 
Q
D
 
E

1psdA The allosteric ligand site in the vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
29% identity, 88% coverage: 13:293/321 of query aligns to 14:293/404 of 1psdA

query
sites
1psdA
H
 
H
R
 
Q
E
 
K
R
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
L
M
 
R
P
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
Y
T
 
T
E
 
N
V
 
I
L
 
E
W
 
F
H
 
H
V
 
K
A
 
G
G
 
A
V
 
L
P
 
D
E
 
D
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
D
E
 
A
V
 
H
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
L
R
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
H
F
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
D
M
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
G
P
 
C
A
 
F
A
 
C
A
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
N
K
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
K
-
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
P
V
 
V
A
 
F
N
 
N
T
 
A
-
 
P
F
 
F
H
 
S
H
x
N
E
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
V
L
 
P
T
 
E
Q
 
A
D
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
H
D
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
A
 
N
S
 
K
S
 
L
V
 
A
Y
 
A
D
 
G
S
 
S
T
 
F
V
 
E
P
 
A
Q
 
R
P
 
G
S
 
K
T
 
K
L
 
L
A
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
G
F
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
H
|
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
H
 
Q
T
 
L
W
 
G
K
 
I
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
V
 
S
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
Y
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
V
 
Y
T
x
D
G
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
V
x
I
A
 
E
D
 
N
D
x
K
A
 
L
G
 
P
L
 
L
A
 
G
W
 
N
V
 
A
D
 
T
D
 
Q
T
 
V
G
 
Q
K
 
H
L
 
L
E
 
S
R
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
N
E
 
M
C
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
S
V
 
L
S
x
H
A
x
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
R
 
P
H
 
S
T
 
T
E
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
S
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
I
R
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
K
A
 
H
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
P
R
 
T
Y
x
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
C
 
S
A
 
D
P
 
P
S
 
F
D
 
T
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
I
 
V
L
 
L
M
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
 
G
G
 
G
V
 
S
T
 
T
T
 
Q
D
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
29% identity, 88% coverage: 13:293/321 of query aligns to 20:299/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
H
 
H
R
 
Q
E
 
K
R
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
L
M
 
R
P
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
Y
T
 
T
E
 
N
V
 
I
L
 
E
W
 
F
H
 
H
V
 
K
A
 
G
G
 
A
V
 
L
P
 
D
E
 
D
D
 
E
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
D
E
 
A
V
 
H
F
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
L
R
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
H
F
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
D
M
 
V
A
 
I
R
 
N
L
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
L
 
L
R
 
V
L
 
A
L
 
I
H
 
G
P
 
C
A
 
F
A
 
C
A
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
N
K
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
K
-
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
P
V
 
V
A
 
F
N
 
N
T
 
A
-
 
P
F
 
F
H
 
S
H
 
N
E
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
L
V
 
L
M
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
V
L
 
P
T
 
E
Q
 
A
D
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
A
R
 
H
D
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
W
A
 
N
S
 
K
S
 
L
V
 
A
Y
 
A
D
 
G
S
 
S
T
 
F
V
 
E
P
 
A
Q
 
R
P
 
G
S
 
K
T
 
K
L
 
L
A
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
G
 
G
F
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
H
|
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
H
 
Q
T
 
L
W
 
G
K
 
I
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
V
 
S
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
Y
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
V
 
Y
T
x
D
G
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
A
 
E
D
 
N
D
 
K
A
 
L
G
 
P
L
 
L
A
 
G
W
 
N
V
 
A
D
 
T
D
 
Q
T
 
V
G
 
Q
K
 
H
L
 
L
E
 
S
R
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
N
E
 
M
C
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
S
V
 
L
S
 
H
A
 
V
P
 
P
L
 
E
N
 
N
R
 
P
H
 
S
T
 
T
E
 
K
G
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
S
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
A
G
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
E
 
I
R
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
K
A
 
H
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
P
R
 
T
Y
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
N
C
 
S
A
 
D
P
 
P
S
 
F
D
 
T
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
G
 
N
I
 
V
L
 
L
M
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
x
I
S
x
G
G
|
G
V
 
S
T
 
T
T
 
Q
D
 
E

Sites not aligning to the query:

2nadA High resolution structures of holo and apo formate dehydrogenase (see paper)
33% identity, 80% coverage: 34:291/321 of query aligns to 82:337/391 of 2nadA

query
sites
2nadA
V
 
V
P
 
F
E
 
E
D
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
V
K
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
x
P
F
|
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
N
V
 
V
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
 
S
R
 
I
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
I
V
 
L
M
 
S
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
L
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
E
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
S
Q
 
H
P
 
A
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
M
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
x
A
F
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
-
T
 
V
A
 
H
A
 
L
A
 
H
V
 
Y
T
 
T
G
x
D
S
 
R
G
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
N
L
 
L
A
 
T
W
 
W
V
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
H
G
 
A
K
 
T
L
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
P
E
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
 
C
P
|
P
L
 
L
N
 
H
R
 
P
H
x
E
T
|
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
C
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
x
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
Y
I
 
N
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P33160 Formate dehydrogenase; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Pseudomonas sp. (strain 101) (Achromobacter parvulus T1) (see 3 papers)
33% identity, 80% coverage: 34:291/321 of query aligns to 83:338/401 of P33160

query
sites
P33160
V
 
V
P
 
F
E
 
E
D
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
V
K
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
 
P
F
 
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
N
V
 
V
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
x
S
R
 
I
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
I
V
 
L
M
 
S
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
L
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
E
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
S
Q
 
H
P
 
A
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
M
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
 
A
F
 
A
G
 
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
-
T
 
V
A
 
H
A
 
L
A
 
H
V
 
Y
T
 
T
G
x
D
S
 
R
G
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
N
L
 
L
A
 
T
W
 
W
V
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
H
G
 
A
K
 
T
L
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
P
E
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
x
C
P
|
P
L
|
L
N
x
H
R
x
P
H
x
E
T
 
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
C
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
Y
I
 
N
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
x
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6jujA Crystal structure of formate dehydrogenase mutant v198i/c256i/p260s/e261p/s381n/s383f from pseudomonas sp. 101in complex with non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide (see paper)
33% identity, 80% coverage: 34:291/321 of query aligns to 82:337/381 of 6jujA

query
sites
6jujA
V
 
V
P
 
F
E
 
E
D
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
V
K
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
 
P
F
|
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
N
V
 
V
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
 
S
R
 
I
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
I
V
 
L
M
 
S
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
L
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
E
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
S
Q
 
H
P
 
A
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
A
A
 
M
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
T
V
 
I
G
 
A
F
 
A
G
|
G
H
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
-
T
 
V
A
 
H
A
 
L
A
 
H
V
 
Y
T
 
T
G
x
D
S
x
R
G
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
N
L
 
L
A
 
T
W
 
W
V
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
H
G
 
A
K
 
T
L
 
R
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
P
E
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
x
I
P
|
P
L
 
L
N
x
H
R
 
S
H
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
 
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
C
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
Y
I
 
N
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T

8oq2A Binding of NADP to a formate dehydrogenase from starkeya novella.
32% identity, 80% coverage: 34:291/321 of query aligns to 83:338/381 of 8oq2A

query
sites
8oq2A
V
 
V
P
 
F
E
 
E
D
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
V
K
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
 
P
F
 
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
 
S
R
 
I
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
I
V
 
L
M
 
G
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
I
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
D
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
E
Q
 
H
P
 
S
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
M
H
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
S
V
 
V
G
 
G
F
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
-
T
 
V
A
 
K
A
 
L
A
 
H
V
 
Y
T
 
T
G
x
Q
S
x
R
G
x
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
V
W
 
W
V
 
H
D
 
D
D
 
T
T
 
R
G
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
P
E
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
x
V
P
|
P
L
 
L
N
x
H
R
 
P
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
I
Y
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
Q
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
K
G
 
W
I
 
E
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
S

Sites not aligning to the query:

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
30% identity, 80% coverage: 64:319/321 of query aligns to 62:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
L
 
V
H
 
H
P
 
C
A
 
I
A
x
R
A
|
A
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
K
 
E
I
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
G
A
 
V
L
 
Y
-
 
E
-
 
E
S
 
A
A
 
G
D
 
T
V
 
Y
L
 
L
V
 
T
A
 
N
N
 
S
T
|
T
F
 
G
H
 
I
H
|
H
E
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
M
V
 
L
M
 
T
L
 
F
-
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
L
F
 
H
L
 
A
T
 
Y
Q
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
-
R
 
H
D
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
A
 
D
S
 
L
S
 
P
V
 
R
Y
 
Y
D
 
E
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
S
 
F
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
E
H
 
R
V
 
V
G
 
C
F
 
V
V
 
V
G
 
G
F
x
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
H
 
G
T
 
V
W
 
V
K
 
D
L
 
R
L
 
A
Q
 
A
V
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
T
x
R
G
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
V
 
P
A
 
V
D
 
D
D
 
N
A
 
V
G
 
S
L
 
T
A
 
V
W
 
Y
V
 
T
D
x
P
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
E
L
 
A
M
 
I
R
 
A
E
 
D
C
 
A
D
 
R
V
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
L
S
 
A
A
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
D
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
G
M
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
K
x
E
A
 
T
L
x
M
G
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
R
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
G
 
S
G
 
G
A
x
D
I
 
I
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
S
R
 
E
Y
 
E
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
L
P
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
W
T
 
D
L
 
F
P
 
E
G
 
D
I
 
V
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
S
|
S
G
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
S
D
 
K
T
x
Y
F
 
H
K
 
E
G
 
D
R
 
V
V
 
A
D
 
A
D
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
E
R
 
K
L
 
I
Q
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
E
L
 
L
R
 
T
N
 
N
L
 
R
V
 
V

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
30% identity, 80% coverage: 64:319/321 of query aligns to 62:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
L
 
V
H
 
H
P
 
C
A
 
I
A
x
R
A
|
A
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
K
 
E
I
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
G
A
 
V
L
 
Y
-
 
E
-
 
E
S
 
A
A
 
G
D
 
T
V
 
Y
L
 
L
V
 
T
A
 
N
N
 
S
T
|
T
F
 
G
H
 
I
H
|
H
E
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
M
V
 
L
M
 
T
L
 
F
-
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
L
F
 
H
L
 
A
T
 
Y
Q
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
-
R
 
H
D
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
A
 
D
S
 
L
S
 
P
V
 
R
Y
 
Y
D
 
E
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
S
 
F
T
|
T
L
 
L
A
|
A
D
 
G
A
 
E
H
 
R
V
 
V
G
 
C
F
 
V
V
 
V
G
 
G
F
x
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
H
 
G
T
 
V
W
 
V
K
 
D
L
 
R
L
 
A
Q
 
A
V
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
T
x
R
G
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
V
 
P
A
 
V
D
 
D
D
 
N
A
 
V
G
 
S
L
 
T
A
 
V
W
 
Y
V
 
T
D
x
P
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
E
L
 
A
M
 
I
R
 
A
E
 
D
C
 
A
D
 
R
V
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
L
S
 
A
A
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
D
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
G
M
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
 
F
K
 
E
A
 
T
L
 
M
G
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
R
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
G
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
I
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
S
R
 
E
Y
 
E
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
L
P
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
W
T
 
D
L
 
F
P
 
E
G
 
D
I
 
V
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
S
|
S
G
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
S
D
 
K
T
x
Y
F
 
H
K
 
E
G
 
D
R
 
V
V
 
A
D
 
A
D
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
E
R
 
K
L
 
I
Q
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
E
L
 
L
R
 
T
N
 
N
L
 
R
V
 
V

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
30% identity, 80% coverage: 64:319/321 of query aligns to 62:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
L
 
V
H
 
H
P
 
C
A
 
I
A
x
R
A
|
A
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
K
 
E
I
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
G
A
 
V
L
 
Y
-
 
E
-
 
E
S
 
A
A
 
G
D
 
T
V
 
Y
L
 
L
V
 
T
A
 
N
N
 
S
T
|
T
F
 
G
H
 
I
H
|
H
E
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
M
V
 
L
M
 
T
L
 
F
-
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
L
F
 
H
L
 
A
T
 
Y
Q
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
-
R
 
H
D
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
A
 
D
S
 
L
S
 
P
V
 
R
Y
 
Y
D
 
E
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
S
 
F
T
|
T
L
 
L
A
|
A
D
 
G
A
 
E
H
 
R
V
 
V
G
 
C
F
 
V
V
 
V
G
|
G
F
x
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
H
 
G
T
 
V
W
 
V
K
 
D
L
 
R
L
 
A
Q
 
A
V
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
T
x
R
G
x
R
S
|
S
G
 
G
R
 
D
V
 
P
A
 
V
D
 
D
D
 
N
A
 
V
G
 
S
L
 
T
A
 
V
W
 
Y
V
 
T
D
 
P
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
E
L
 
A
M
 
I
R
 
A
E
 
D
C
 
A
D
 
R
V
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
L
S
 
A
A
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
D
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
G
M
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
K
x
E
A
 
T
L
x
M
G
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
R
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
G
 
S
G
 
G
A
x
D
I
 
I
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
S
R
 
E
Y
 
E
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
L
P
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
W
T
 
D
L
 
F
P
 
E
G
 
D
I
 
V
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
S
|
S
G
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
S
D
 
K
T
x
Y
F
 
H
K
 
E
G
 
D
R
 
V
V
 
A
D
 
A
D
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
E
R
 
K
L
 
I
Q
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
E
L
 
L
R
 
T
N
 
N
L
 
R
V
 
V

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
30% identity, 80% coverage: 64:319/321 of query aligns to 60:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
L
 
V
H
 
H
P
 
C
A
 
I
A
x
R
A
|
A
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
K
 
E
I
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
G
A
 
V
L
 
Y
-
 
E
-
 
E
S
 
A
A
 
G
D
 
T
V
 
Y
L
 
L
V
 
T
A
 
N
N
 
S
T
|
T
F
 
G
H
 
I
H
|
H
E
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
V
A
 
G
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
M
V
 
L
M
 
T
L
 
F
-
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
L
F
 
H
L
 
A
T
 
Y
Q
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
-
R
 
H
D
 
D
G
 
H
V
 
A
W
 
W
A
 
D
S
 
L
S
 
P
V
 
R
Y
 
Y
D
 
E
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
S
 
F
T
|
T
L
 
L
A
|
A
D
 
G
A
 
E
H
 
R
V
 
V
G
 
C
F
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
|
G
H
x
T
I
x
L
G
 
G
R
 
R
H
 
G
T
 
V
W
 
V
K
 
D
L
 
R
L
 
A
Q
 
A
V
 
A
F
 
L
G
 
G
C
 
M
T
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
G
V
 
V
T
 
R
G
x
R
S
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
P
A
 
V
D
 
D
D
 
N
A
 
V
G
 
S
L
 
T
A
 
V
W
 
Y
V
 
T
D
 
P
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
E
L
 
A
M
 
I
R
 
A
E
 
D
C
 
A
D
 
R
V
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
L
S
 
A
A
 
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
D
H
 
E
T
|
T
E
 
E
G
 
G
M
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
P
E
 
E
L
x
F
K
x
E
A
 
T
L
x
M
G
 
R
P
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
P
|
P
L
 
V
V
|
V
Q
 
V
E
|
E
R
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
G
 
S
G
 
G
A
x
D
I
 
I
K
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
W
 
F
Y
x
S
R
 
E
Y
 
E
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
L
P
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
W
T
 
D
L
 
F
P
 
E
G
 
D
I
 
V
L
 
L
M
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
V
S
|
S
G
 
A
V
 
A
T
 
T
T
 
S
D
 
K
T
x
Y
F
 
H
K
 
E
G
 
D
R
 
V
V
 
A
D
 
A
D
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
E
R
 
K
L
 
I
Q
 
A
N
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
E
L
 
L
R
 
T
N
 
N
L
 
R
V
 
V

3wr5A Structural basis on the efficient co2 reduction of acidophilic formate dehydrogenase
32% identity, 80% coverage: 34:291/321 of query aligns to 87:342/401 of 3wr5A

query
sites
3wr5A
V
 
V
P
 
F
E
 
E
D
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
V
K
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
V
F
 
V
V
 
I
G
 
S
S
 
Q
R
 
P
F
 
F
-
 
W
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
L
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
Y
H
 
C
H
x
N
E
 
S
R
 
I
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
M
A
 
M
A
 
I
V
 
L
M
 
G
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
I
T
 
P
Q
 
S
D
 
H
A
 
D
R
 
W
L
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
I
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
D
T
 
C
V
 
V
P
 
E
Q
 
H
P
 
S
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
M
H
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
S
V
 
V
G
x
A
F
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
L
K
 
R
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
D
C
 
V
T
 
K
A
 
L
A
 
H
A
 
-
V
 
Y
T
 
T
G
x
D
S
x
R
G
 
H
R
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
V
W
 
W
V
 
H
D
 
D
D
 
T
T
 
R
G
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
D
L
 
M
M
 
Y
R
 
P
E
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
L
S
 
N
A
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
H
R
 
P
H
 
E
T
 
T
E
 
E
G
 
H
M
 
M
I
 
I
G
 
N
A
 
D
A
 
E
E
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
K
P
 
R
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
L
V
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
I
Y
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
Q
I
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
F
R
 
P
Y
x
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
K
G
 
W
I
 
E
L
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
S

Sites not aligning to the query:

6ttbA Crystal structure of NAD-dependent formate dehydrogenase from staphylococcus aureus in complex with NAD
29% identity, 85% coverage: 45:317/321 of query aligns to 63:323/331 of 6ttbA

query
sites
6ttbA
F
 
F
V
 
Y
G
 
P
S
 
A
R
 
Y
F
 
M
T
 
T
A
 
R
E
 
E
M
 
R
A
 
I
R
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
P
N
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
A
H
 
I
P
 
T
A
 
A
A
 
G
A
x
V
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
I
-
 
G
-
 
V
A
 
V
D
 
E
V
 
V
L
 
T
V
 
G
A
 
S
N
|
N
T
 
T
F
 
V
H
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
A
V
 
V
G
 
M
A
 
D
A
 
L
V
 
L
M
 
I
L
 
L
R
 
L
R
 
R
D
 
N
F
 
Y
L
 
E
T
 
E
Q
 
G
D
 
H
A
 
R
R
 
Q
L
 
S
R
 
V
D
 
E
G
 
G
V
 
E
W
 
W
A
 
N
S
 
L
S
 
S
V
 
Q
Y
 
V
D
 
G
S
 
N
T
 
H
V
 
A
P
 
H
Q
 
E
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
Q
D
 
H
A
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
I
V
x
F
G
 
G
F
 
F
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
H
 
L
T
 
V
W
 
A
K
 
E
L
 
R
L
 
L
Q
 
A
V
 
P
F
 
F
G
 
N
C
 
V
T
 
T
A
 
L
A
 
Q
A
 
H
V
x
Y
T
x
D
G
x
P
S
 
I
G
 
N
R
 
Q
V
 
-
A
 
Q
D
 
D
D
 
H
A
 
K
G
 
L
L
 
S
A
 
K
W
 
F
V
 
V
D
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
S
L
 
F
E
 
D
R
 
E
L
 
L
M
 
V
R
 
S
E
 
S
C
 
S
D
 
D
V
 
A
V
 
I
V
 
T
V
 
I
S
x
H
A
|
A
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
P
H
 
E
T
|
T
E
 
D
G
 
N
M
 
L
I
 
F
G
 
D
A
 
K
A
 
D
E
 
V
L
 
L
K
 
S
A
 
R
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
H
G
 
S
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
I
V
 
V
Q
 
N
E
 
R
R
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
E
A
 
H
I
 
L
K
 
Q
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
G
D
 
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
Y
R
 
P
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
A
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
G
 
R
I
 
N
L
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
V
H
|
H
T
 
Y
S
|
S
G
|
G
V
 
M
T
 
T
T
 
L
D
 
E
T
 
A
F
 
Q
K
 
K
G
 
R
R
 
I
V
 
E
D
 
D
D
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
D
N
 
I
V
 
L
G
 
E
R
 
R
L
 
F
Q
 
F
N
 
N
G
 
H
E
 
E
P
 
P
L
 
F
R
 
Q
N
 
D

3n7uA NAD-dependent formate dehydrogenase from higher-plant arabidopsis thaliana in complex with NAD and azide
30% identity, 71% coverage: 67:293/321 of query aligns to 93:312/351 of 3n7uA

query
sites
3n7uA
A
 
A
A
 
G
A
x
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
A
S
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
T
V
 
G
A
 
S
N
|
N
T
 
V
F
 
V
H
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
L
M
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
R
D
 
N
F
 
F
L
 
V
T
 
P
Q
 
G
D
 
Y
A
 
N
R
 
Q
L
 
V
R
 
V
D
 
K
G
 
G
V
 
E
W
 
W
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
S
 
R
V
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
A
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
K
H
 
L
T
 
L
W
 
L
K
 
Q
L
 
R
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
F
 
F
G
 
G
C
 
C
T
 
N
A
 
L
A
 
L
A
 
Y
-
 
H
-
x
D
-
x
R
V
 
L
T
 
Q
G
 
M
S
 
A
G
 
P
R
 
E
V
 
L
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
T
G
 
G
L
 
A
A
 
K
W
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
N
R
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
P
E
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
N
A
x
M
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
E
H
 
K
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
F
G
 
N
A
 
K
A
 
E
E
 
L
L
 
I
K
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
N
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
A
L
 
I
V
 
M
Q
 
E
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
H
I
 
I
K
 
G
A
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
D
R
 
P
Y
x
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
N
I
 
Q
L
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
T
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T
T
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3jtmA Structure of recombinant formate dehydrogenase from arabidopsis thaliana
30% identity, 71% coverage: 67:293/321 of query aligns to 93:312/351 of 3jtmA

query
sites
3jtmA
A
 
A
A
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
A
S
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
T
V
 
G
A
 
S
N
|
N
T
 
V
F
 
V
H
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
L
M
 
I
L
|
L
R
 
M
R
 
R
D
 
N
F
 
F
L
 
V
T
 
P
Q
 
G
D
 
Y
A
 
N
R
 
Q
L
 
V
R
 
V
D
 
K
G
 
G
V
 
E
W
 
W
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
S
 
R
V
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
A
G
 
G
H
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
H
 
L
T
 
L
W
 
L
K
 
Q
L
 
R
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
F
 
F
G
 
G
C
 
C
T
 
N
A
 
L
A
 
L
A
 
Y
-
 
H
-
 
D
-
 
R
V
 
L
T
 
Q
G
 
M
S
 
A
G
 
P
R
 
E
V
 
L
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
T
G
 
G
L
 
A
A
 
K
W
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
N
R
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
P
E
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
N
A
 
M
P
 
P
L
 
L
N
 
T
R
 
E
H
 
K
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
F
G
 
N
A
 
K
A
 
E
E
 
L
L
 
I
K
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
N
G
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
A
L
 
I
V
 
M
Q
 
E
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
H
I
 
I
K
x
G
A
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
D
R
 
P
Y
x
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
N
I
 
Q
L
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
T
T
 
T
T
 
I
D
 
D

Q9S7E4 Formate dehydrogenase, chloroplastic/mitochondrial; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)
30% identity, 71% coverage: 67:293/321 of query aligns to 126:345/384 of Q9S7E4

query
sites
Q9S7E4
A
 
A
A
 
G
A
 
I
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
A
S
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
T
V
 
G
A
 
S
N
 
N
T
 
V
F
 
V
H
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
M
A
 
R
A
 
I
V
 
L
M
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
R
D
 
N
F
 
F
L
 
V
T
 
P
Q
 
G
D
 
Y
A
 
N
R
 
Q
L
 
V
R
 
V
D
 
K
G
 
G
V
 
E
W
 
W
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
I
A
 
A
S
 
Y
S
 
R
V
 
A
Y
 
Y
D
 
D
S
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
A
G
 
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
K
H
 
L
T
 
L
W
 
L
K
 
Q
L
 
R
L
 
L
Q
 
K
V
 
P
F
 
F
G
 
G
C
 
C
T
 
N
A
 
L
A
 
L
A
 
Y
-
 
H
-
x
D
-
 
R
V
 
L
T
 
Q
G
 
M
S
 
A
G
 
P
R
 
E
V
 
L
A
 
E
D
 
K
D
 
E
A
 
T
G
 
G
L
 
A
A
 
K
W
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
D
T
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
L
E
 
N
R
 
E
L
 
M
M
 
L
R
 
P
E
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
N
A
 
M
P
|
P
L
|
L
N
x
T
R
x
E
H
x
K
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
F
G
 
N
A
 
K
A
 
E
E
 
L
L
 
I
K
 
G
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
N
G
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
A
L
 
I
V
 
M
Q
 
E
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
H
I
 
I
K
 
G
A
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
D
R
 
P
Y
 
Q
P
 
P
A
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
A
P
 
P
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
N
I
 
Q
L
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
|
T
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T
T
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7arzA Ternary complex of NAD-dependent formate dehydrogenase from physcomitrium patens
30% identity, 81% coverage: 36:296/321 of query aligns to 66:325/361 of 7arzA

query
sites
7arzA
E
 
D
D
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
A
K
 
D
A
 
A
E
 
H
V
 
I
F
 
L
V
 
I
G
x
T
S
 
T
R
x
P
F
|
F
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
Y
-
 
M
T
 
T
A
 
K
E
 
E
M
 
R
A
 
L
R
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
E
L
 
L
L
|
L
H
x
V
P
x
T
A
 
A
A
x
G
A
x
V
G
 
G
T
 
S
D
 
D
K
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
H
A
 
A
L
 
A
S
 
A
A
 
E
D
 
K
V
 
G
L
 
L
V
 
T
A
 
V
N
 
S
-
 
E
-
 
V
T
 
T
F
 
G
H
 
S
H
x
N
E
 
V
R
 
T
S
 
S
I
x
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
D
V
 
E
V
 
V
G
 
L
A
 
R
A
 
I
V
 
L
M
 
V
L
 
L
R
 
V
R
 
R
D
 
N
F
 
F
L
 
A
T
 
P
Q
 
G
D
 
W
A
 
K
R
 
Q
L
 
V
R
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
G
W
 
W
A
 
N
S
 
V
S
 
A
V
 
-
Y
 
-
D
 
-
S
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
H
Q
 
H
P
 
A
S
 
Y
T
 
D
L
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
R
H
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
G
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
H
 
E
T
 
L
W
 
M
K
 
K
L
 
R
L
 
L
Q
 
K
V
 
G
F
 
F
G
 
G
C
 
L
T
 
K
A
 
E
A
 
M
A
 
L
V
 
Y
T
 
Y
G
x
D
S
x
R
G
 
N
R
 
S
V
 
L
A
 
G
-
 
A
-
 
E
D
 
R
D
 
E
A
 
K
G
 
E
L
 
L
A
 
G
W
 
C
V
 
K
D
 
R
D
 
E
T
 
T
G
 
-
K
 
D
L
 
L
E
 
D
R
 
T
L
 
M
M
 
L
R
 
S
E
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
N
A
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
D
H
x
Q
T
 
T
E
 
R
G
 
G
M
 
L
I
 
F
G
 
N
A
 
K
A
 
E
E
 
R
L
 
I
K
 
A
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
G
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
x
N
G
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
D
E
 
T
R
 
E
A
 
A
L
 
V
Y
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
C
A
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
H
I
 
L
K
 
G
A
 
G
A
 
Y
A
 
G
V
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
Y
 
N
R
 
A
Y
 
Q
P
 
P
A
 
A
D
 
G
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
K
D
 
D
L
 
H
P
 
P
F
 
W
A
 
R
T
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
N
I
 
H
L
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
T
 
I
S
|
S
G
|
G
V
 
T
T
 
T
T
 
L
D
 
D
T
 
A
F
 
Q
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
29% identity, 82% coverage: 52:315/321 of query aligns to 57:306/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
A
 
A
E
 
E
M
 
L
A
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
E
 
P
N
 
K
L
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
H
 
S
P
 
S
A
 
F
A
 
S
A
x
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
K
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
I
A
 
K
L
 
C
S
 
E
A
 
E
D
 
K
-
 
G
V
 
V
L
 
R
V
 
V
A
 
T
N
 
N
T
 
T
F
 
P
H
 
D
-
 
V
H
x
L
E
 
T
R
 
D
S
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
V
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
I
V
 
L
M
 
A
L
 
V
R
 
L
R
 
R
D
 
R
F
 
I
L
 
C
T
 
E
Q
 
C
D
 
D
A
 
K
R
 
Y
L
 
V
R
 
R
D
 
R
G
 
G
V
 
A
W
 
W
A
 
K
S
 
F
S
 
G
V
 
D
Y
 
F
D
 
K
S
 
L
T
 
T
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
T
T
 
K
L
 
F
A
 
S
D
 
G
A
 
K
H
 
R
V
 
V
G
 
G
F
 
I
V
 
I
G
|
G
F
x
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
H
 
A
T
 
V
W
 
A
K
 
E
L
 
R
L
 
A
Q
 
E
V
 
A
F
 
F
G
 
D
C
 
C
T
 
P
A
 
I
A
 
S
A
 
Y
V
 
F
T
x
S
G
x
R
S
|
S
G
 
K
R
 
K
V
 
P
A
 
N
D
 
T
D
 
N
A
 
Y
G
 
T
L
 
Y
A
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
Y
G
 
G
K
 
S
L
 
V
E
 
V
R
 
E
L
 
L
M
 
A
R
 
S
E
 
N
C
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
A
A
x
C
P
|
P
L
 
L
N
 
T
R
 
P
H
 
E
T
|
T
E
 
T
G
 
H
M
 
I
I
 
I
G
 
N
A
 
R
A
 
E
E
 
V
L
 
I
K
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
H
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
R
 
P
A
 
E
L
 
L
Y
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
A
 
R
I
 
L
K
 
G
A
 
G
A
|
A
A
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
W
 
F
Y
 
E
R
 
R
Y
x
E
P
 
P
A
 
E
D
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
V
P
 
P
S
 
E
D
 
K
L
 
L
P
 
-
F
 
-
A
 
F
T
 
G
L
 
L
P
 
E
G
 
N
I
 
V
L
 
V
M
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
T
 
V
S
x
G
G
 
S
V
 
G
T
 
T
T
 
V
D
 
E
T
 
T
F
 
R
K
 
K
G
 
V
R
 
M
V
 
A
D
 
D
D
 
L
V
 
V
A
 
V
A
 
G
N
 
N
V
 
L
G
 
E
R
 
A
L
 
H
Q
 
F
N
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
L

Query Sequence

>WP_011778289.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011778289.1
MRVLVVDPNLVPHRERLEAAMPPGTEVLWHVAGVPEDELRKAEVFVGSRFTAEMARLAEN
LRLLHPAAAGTDKIDLSALSADVLVANTFHHERSIAEYVVGAAVMLRRDFLTQDARLRDG
VWASSVYDSTVPQPSTLADAHVGFVGFGHIGRHTWKLLQVFGCTAAAVTGSGRVADDAGL
AWVDDTGKLERLMRECDVVVVSAPLNRHTEGMIGAAELKALGPDGVLINVGRGPLVQERA
LYDALAGGAIKAAAVDVWYRYPADGTGCAPSDLPFATLPGILMTPHTSGVTTDTFKGRVD
DVAANVGRLQNGEPLRNLVPH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory