SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011779880.1 NCBI__GCF_000015305.1:WP_011779880.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1bxrA Structure of carbamoyl phosphate synthetase complexed with the atp analog amppnp (see paper)
52% identity, 100% coverage: 1:1110/1112 of query aligns to 1:1072/1073 of 1bxrA

query
sites
1bxrA
M
 
M
P
 
P
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
K
H
 
S
V
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
Y
 
M
A
 
A
D
 
D
H
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
P
 
P
I
 
I
T
 
H
A
 
W
E
 
E
F
 
V
V
 
V
E
 
R
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
Q
 
E
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
R
I
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
C
A
 
A
V
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
E
E
 
R
N
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
T
F
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
Q
 
R
K
 
R
F
 
F
K
 
D
D
 
V
I
 
A
V
 
M
T
 
K
K
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
G
V
 
I
C
 
A
F
 
H
T
 
T
M
 
M
D
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
L
D
 
A
T
 
V
V
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
V
 
C
V
x
I
V
 
I
R
|
R
P
 
P
S
 
S
F
 
F
T
 
T
M
|
M
G
|
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
A
 
R
E
 
E
D
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
E
M
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
x
K
N
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
S
 
S
I
x
L
Y
x
I
G
 
G
W
 
W
K
 
K
E
|
E
Y
 
Y
E
 
E
L
 
M
E
 
E
L
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
K
H
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
C
V
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
C
S
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
 
I
H
|
H
T
|
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
K
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
I
M
 
M
R
 
R
T
 
N
L
 
A
G
 
S
I
 
M
E
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
K
D
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
D
|
D
I
 
I
T
 
T
-
 
G
K
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
C
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
N
F
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
F
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
T
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
T
F
 
Q
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
K
 
K
V
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
F
W
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
G
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
-
 
D
-
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
E
L
 
L
H
 
K
T
 
D
A
 
A
T
 
G
D
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
I
Y
 
W
D
 
Y
I
 
I
E
 
A
Y
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
F
V
 
N
A
 
L
S
 
T
G
 
N
V
 
I
D
 
D
P
 
R
W
 
W
F
 
F
V
 
L
E
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
E
A
 
E
E
 
K
L
 
V
I
 
A
D
 
E
A
 
V
P
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
L
 
L
G
 
N
E
 
A
E
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
H
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
R
 
A
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
L
 
L
A
 
A
G
|
G
-
 
V
-
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
R
 
Q
L
 
Y
G
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
K
 
K
T
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
R
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
H
 
M
Y
 
Y
S
 
S
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
L
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
E
E
 
E
T
 
C
E
 
E
V
 
A
A
 
N
P
 
P
Q
 
S
A
 
T
E
 
D
R
 
R
P
 
E
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
C
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
S
T
 
L
T
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
D
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
V
 
I
M
 
M
I
 
V
N
 
N
C
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
F
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
Q
x
K
A
 
P
S
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
G
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
Q
E
 
H
V
 
A
L
 
V
R
 
E
R
 
R
A
 
L
G
 
K
L
 
L
P
 
K
A
 
Q
P
 
P
R
 
A
F
 
N
G
 
A
M
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
F
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
A
R
 
V
R
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
x
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
|
L
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
A
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
E
 
A
T
 
D
L
 
L
E
 
R
G
 
R
Y
 
Y
I
 
F
T
 
Q
R
 
T
A
 
A
T
 
V
E
 
S
L
 
V
S
|
S
P
 
N
E
 
D
H
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
L
D
|
D
R
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
C
 
C
D
|
D
G
 
G
T
 
E
E
 
M
V
 
V
Y
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
I
x
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
V
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
Q
S
 
E
D
 
I
I
 
Q
E
 
D
A
 
V
V
 
M
R
 
R
R
 
Q
A
 
Q
T
 
V
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
E
I
 
L
G
 
Q
V
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
M
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
N
D
 
N
V
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
A
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
V
M
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
T
 
T
A
 
K
R
 
E
N
 
V
A
 
I
P
 
P
-
 
P
-
 
Y
V
 
Y
A
 
S
V
 
V
K
 
K
E
|
E
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
H
 
N
R
 
K
F
 
F
R
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
x
P
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
|
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
G
A
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
A
Q
 
Q
T
 
L
A
 
G
A
 
S
Y
 
N
G
 
S
S
 
T
L
 
M
P
 
K
A
 
K
Q
 
H
G
 
G
T
 
R
V
 
A
F
 
L
V
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
R
N
 
E
R
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
E
S
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
D
P
 
L
V
 
A
K
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
L
D
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
E
V
 
L
L
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
I
M
 
V
L
 
L
R
 
G
R
 
E
N
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
N
C
 
P
E
 
R
E
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
K
H
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
F
 
V
S
 
H
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
S
 
Q
A
 
-
V
 
-
D
 
D
A
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
E
V
 
Y
D
 
T
M
 
Y
V
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
Y
 
S
G
 
G
N
 
R
S
 
R
G
 
A
P
 
I
R
 
E
I
 
-
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
Q
M
 
Y
N
 
K
I
 
V
P
 
H
C
 
Y
V
x
D
T
|
T
T
 
T
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
S
 
F
A
 
A
A
 
T
V
 
A
Q
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
-
R
 
-
G
 
A
D
 
T
I
 
E
G
 
K
V
 
V
R
 
I
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
M
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
L
 
I

P00968 Carbamoyl phosphate synthase large chain; Carbamoyl phosphate synthetase ammonia chain; EC 6.3.4.16; EC 6.3.5.5 from Escherichia coli (strain K12) (see 6 papers)
52% identity, 100% coverage: 1:1110/1112 of query aligns to 1:1072/1073 of P00968

query
sites
P00968
M
|
M
P
 
P
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
K
H
 
S
V
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
Y
 
M
A
 
A
D
 
D
H
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
P
 
P
I
 
I
T
 
H
A
 
W
E
 
E
F
 
V
V
 
V
E
 
R
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
Q
 
E
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
R
I
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
C
A
 
A
V
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
E
E
 
R
N
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
T
F
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
Q
 
R
K
 
R
F
 
F
K
 
D
D
 
V
I
 
A
V
 
M
T
 
K
K
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
G
V
 
I
C
 
A
F
 
H
T
 
T
M
 
M
D
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
L
D
 
A
T
 
V
V
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
V
 
C
V
 
I
V
 
I
R
|
R
P
 
P
S
 
S
F
 
F
T
 
T
M
 
M
G
|
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
A
 
R
E
 
E
D
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
E
M
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
 
K
N
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
|
E
S
 
S
I
x
L
Y
 
I
G
 
G
W
 
W
K
 
K
E
|
E
Y
 
Y
E
 
E
L
 
M
E
 
E
L
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
K
H
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
C
V
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
C
S
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
A
M
 
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
K
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
I
M
 
M
R
 
R
T
 
N
L
 
A
G
 
S
I
 
M
E
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
 
N
I
 
V
Q
|
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
K
D
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
D
 
D
I
 
I
T
 
T
-
 
G
K
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
C
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
N
F
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
F
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
 
T
T
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
T
F
 
Q
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
K
 
K
V
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
F
W
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
G
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
-
 
D
-
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
E
L
 
L
H
 
K
T
 
D
A
 
A
T
 
G
D
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
I
Y
 
W
D
 
Y
I
 
I
E
 
A
Y
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
F
V
 
N
A
 
L
S
 
T
G
 
N
V
 
I
D
 
D
P
 
R
W
 
W
F
 
F
V
 
L
E
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
E
A
 
E
E
 
K
L
 
V
I
 
A
D
 
E
A
 
V
P
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
L
 
L
G
 
N
E
 
A
E
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
H
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
R
 
A
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
R
 
Q
L
 
Y
G
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
K
 
K
T
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
R
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
H
 
M
Y
 
Y
S
 
S
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
L
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
E
E
 
E
T
 
C
E
 
E
V
 
A
A
 
N
P
 
P
Q
 
S
A
 
T
E
 
D
R
 
R
P
 
E
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
C
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
S
T
 
L
T
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
D
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
V
 
I
M
 
M
I
 
V
N
 
N
C
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
F
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
Q
 
K
A
 
P
S
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
Q
E
 
H
V
 
A
L
 
V
R
 
E
R
 
R
A
 
L
G
 
K
L
 
L
P
 
K
A
 
Q
P
 
P
R
 
A
F
 
N
G
 
A
M
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
F
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
A
R
 
V
R
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
E
 
A
T
 
D
L
 
L
E
 
R
G
 
R
Y
 
Y
I
 
F
T
 
Q
R
 
T
A
 
A
T
 
V
E
 
S
L
 
V
S
 
S
P
 
N
E
 
D
H
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
L
D
 
D
R
x
H
F
 
F
L
|
L
E
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
C
 
C
D
 
D
G
 
G
T
 
E
E
 
M
V
 
V
Y
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
|
G
I
x
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
D
 
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
V
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
Q
S
 
E
D
 
I
I
 
Q
E
 
D
A
 
V
V
 
M
R
 
R
R
 
Q
A
 
Q
T
 
V
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
E
I
 
L
G
 
Q
V
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
M
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
N
D
 
N
V
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
A
 
A
S
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
V
M
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
T
 
T
A
 
K
R
 
E
N
 
V
A
 
I
P
 
P
-
 
P
-
 
Y
V
 
Y
A
 
S
V
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
H
 
N
R
 
K
F
 
F
R
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
P
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
G
A
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
A
Q
 
Q
T
 
L
A
 
G
A
 
S
Y
 
N
G
 
S
S
 
T
L
 
M
P
 
K
A
 
K
Q
 
H
G
 
G
T
 
R
V
 
A
F
 
L
V
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
R
N
 
E
R
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
E
S
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
D
P
 
L
V
 
A
K
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
L
D
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
E
V
 
L
L
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
I
M
 
V
L
 
L
R
 
G
R
 
E
N
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
N
C
 
P
E
 
R
E
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
K
H
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
F
 
V
S
 
H
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
S
 
Q
A
 
-
V
 
-
D
 
D
A
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
E
V
 
Y
D
 
T
M
 
Y
V
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
T
Y
 
S
G
 
G
N
 
R
S
 
R
G
 
A
P
 
I
R
 
E
I
 
-
D
 
D
G
 
S
Y
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
Q
M
 
Y
N
 
K
I
 
V
P
 
H
C
 
Y
V
 
D
T
 
T
T
 
T
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
S
 
F
A
 
A
A
 
T
V
 
A
Q
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
-
R
 
-
G
 
A
D
 
T
I
 
E
G
 
K
V
 
V
R
 
I
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
M
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
L
 
I

Q42601 Carbamoyl phosphate synthase arginine-specific large chain, chloroplastic; CPS; CPSase; Ammonium-dependent carbamoyl phosphate synthetase; Arginine-specific carbamoyl phosphate synthetase, ammonia chain; Glutamine-dependent carbamoyl phosphate synthetase; Protein VENOSA 3; EC 6.3.4.16; EC 6.3.5.5 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
52% identity, 99% coverage: 3:1106/1112 of query aligns to 94:1176/1187 of Q42601

query
sites
Q42601
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
K
H
 
K
V
 
I
L
 
M
V
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
Q
 
E
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
|
P
E
 
E
Y
 
T
A
 
A
D
 
N
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
E
 
A
P
 
P
I
 
M
T
 
T
A
 
P
E
 
E
F
 
L
V
 
V
E
 
E
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
Q
 
E
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
R
I
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
K
F
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
K
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
E
K
 
L
F
 
F
K
 
K
D
 
D
I
 
A
V
 
M
T
 
K
K
 
N
V
 
I
G
 
G
G
 
L
E
 
K
S
 
T
A
 
P
R
 
P
S
 
S
R
 
G
V
 
I
C
 
G
F
 
T
T
 
T
M
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
C
R
 
F
D
 
D
T
 
I
V
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
E
L
 
F
P
 
P
V
 
L
V
 
I
V
 
I
R
 
R
P
 
P
S
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
G
 
G
S
 
G
G
 
G
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
A
 
K
E
 
E
D
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
S
M
 
I
A
 
C
G
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
A
S
 
T
A
 
S
N
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
K
S
 
S
I
 
L
Y
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
L
H
 
A
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
I
C
 
C
S
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
I
D
 
D
P
 
P
M
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
R
M
 
L
R
 
R
T
 
D
L
 
Y
G
 
S
I
 
I
E
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
C
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
 
N
I
 
V
Q
 
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
E
L
 
V
I
 
M
V
 
I
I
 
I
E
 
E
M
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
V
 
P
N
 
N
D
 
D
I
 
I
T
 
T
K
 
R
E
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
A
C
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
S
D
 
Q
G
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
T
T
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
S
M
 
M
S
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
N
 
T
F
 
F
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
F
G
 
Q
K
 
K
V
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
T
 
C
G
 
G
R
 
F
A
 
S
G
 
G
F
 
W
W
 
G
T
 
C
G
 
A
P
 
K
D
 
I
P
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
D
G
 
W
S
 
D
V
 
W
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
L
 
K
T
 
Y
R
 
S
L
 
L
H
 
R
T
 
V
A
 
P
T
 
N
D
 
P
G
 
D
R
 
R
L
 
I
Y
 
H
D
 
A
I
 
I
E
 
Y
Y
 
A
A
 
A
L
 
M
R
 
K
L
 
K
G
 
G
A
 
M
T
 
K
V
 
I
E
 
D
Q
 
E
V
 
I
A
 
Y
V
 
E
A
 
L
S
 
S
G
 
M
V
 
V
D
 
D
P
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
L
E
 
T
Q
 
Q
I
 
L
G
 
K
R
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
V
R
 
E
A
 
Q
E
 
Y
L
 
L
I
 
M
D
 
S
A
 
G
P
 
T
V
 
L
-
 
S
-
 
E
L
 
I
G
 
T
E
 
K
E
 
E
L
 
D
L
 
L
R
 
Y
R
 
E
S
 
V
K
 
K
H
 
K
N
 
R
G
|
G
L
 
F
S
 
S
D
 
D
R
 
K
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
F
L
 
A
R
 
T
P
 
K
E
 
T
L
 
T
A
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
G
 
-
V
 
V
R
 
R
V
 
T
L
 
K
R
 
R
Q
 
I
R
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
V
H
 
V
P
 
P
V
 
S
F
 
Y
K
 
K
T
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
E
A
 
A
R
 
H
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
H
 
M
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
E
 
D
L
 
V
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
E
T
 
C
E
 
E
V
 
S
A
 
A
P
 
P
Q
 
N
A
 
N
E
 
K
R
 
K
P
 
-
K
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
C
 
C
V
 
C
H
 
H
A
 
T
A
 
S
T
 
F
T
 
A
L
 
L
T
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
V
 
I
M
 
M
I
 
L
N
 
N
C
 
S
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
L
T
 
T
F
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
N
I
 
V
Y
 
I
Y
 
D
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
P
S
 
D
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
I
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
E
 
H
R
 
Y
L
 
L
E
 
D
K
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
M
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
P
V
 
V
P
 
R
I
 
I
V
 
W
G
 
G
T
 
T
L
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
S
I
 
I
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
N
E
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
D
R
 
E
A
 
L
G
 
K
L
 
I
P
 
E
A
 
Q
P
 
P
R
 
K
F
 
G
G
 
G
M
 
I
A
 
A
T
 
K
S
 
S
F
 
E
D
 
A
Q
 
D
A
 
A
R
 
L
R
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
E
 
S
T
 
R
L
 
L
E
 
I
G
 
T
Y
 
Y
I
 
L
T
 
E
R
 
N
A
|
A
T
 
V
E
 
Q
L
 
V
S
 
D
P
 
P
E
 
E
H
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
L
 
L
E
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
T
L
 
L
C
 
T
D
 
D
G
 
S
T
 
Y
-
 
G
E
 
N
V
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
M
L
 
L
P
 
P
P
 
T
V
 
Q
T
 
T
L
 
I
G
 
P
R
 
A
S
 
S
D
 
C
I
 
L
E
 
Q
A
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
T
A
 
W
T
 
T
E
 
T
A
 
K
I
 
L
A
 
A
F
 
K
G
 
K
I
 
L
G
 
N
V
 
V
V
 
C
G
 
G
L
 
L
L
 
M
N
 
N
V
 
C
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
K
 
T
D
 
T
-
 
S
-
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
-
Y
 
F
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
G
V
 
H
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
Y
C
 
A
A
 
A
R
 
L
I
 
V
M
 
M
L
 
S
G
 
G
A
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
L
 
L
R
 
N
E
 
F
E
 
E
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
K
A
 
E
V
 
V
T
 
I
A
 
P
R
 
K
N
 
H
A
 
-
P
 
-
V
 
V
A
 
S
V
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
F
P
 
P
F
 
F
H
 
E
R
 
K
F
 
F
R
 
Q
K
 
G
A
 
C
D
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
D
S
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
|
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
S
I
 
I
A
 
S
A
 
S
D
 
E
F
 
F
G
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
M
S
 
A
Q
 
Q
T
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
G
G
 
Q
S
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
L
Q
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
F
V
 
L
S
 
S
V
 
L
A
 
N
N
 
D
R
 
M
D
 
T
K
 
K
R
 
P
S
 
H
L
 
L
V
 
E
F
 
K
P
 
I
V
 
A
K
 
V
R
 
S
L
 
F
A
 
L
D
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
F
R
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
T
E
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
H
M
 
F
L
 
L
R
 
E
R
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
P
C
 
V
E
 
E
E
 
R
V
 
V
R
 
L
K
 
K
H
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
F
 
L
S
 
H
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
Q
 
H
M
 
-
S
 
-
A
 
A
V
 
A
D
 
D
A
 
M
I
 
V
K
 
A
A
 
N
G
 
G
H
 
Q
V
 
I
D
 
H
M
 
L
V
 
M
I
 
L
N
 
I
T
 
T
P
 
S
Y
 
S
G
 
G
N
 
D
S
 
A
G
 
L
P
 
D
R
 
Q
I
 
K
D
 
D
G
 
G
Y
 
R
E
 
Q
I
 
L
R
 
R
S
 
Q
A
 
M
A
 
A
V
 
L
S
 
A
M
 
Y
N
 
K
I
 
V
P
 
P
C
 
V
V
 
I
T
 
T
T
 
T
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
L
A
 
A
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
K
A
 
S
G
 
L
I
 
K
R
 
S
G
 
S
D
 
A
I
 
I
G
 
K
V
 
M
R
 
T
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
L
 
F

1t36A Crystal structure of e. Coli carbamoyl phosphate synthetase small subunit mutant c248d complexed with uridine 5'-monophosphate (see paper)
51% identity, 100% coverage: 1:1110/1112 of query aligns to 1:1057/1058 of 1t36A

query
sites
1t36A
M
 
M
P
 
P
R
 
K
R
 
R
P
 
T
D
 
D
L
 
I
N
 
K
H
 
S
V
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
R
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Y
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
S
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
M
 
M
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
Y
 
M
A
 
A
D
 
D
H
 
A
T
 
T
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
P
 
P
I
 
I
T
 
H
A
 
W
E
 
E
F
 
V
V
 
V
E
 
R
K
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
Q
 
E
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
R
I
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
C
A
 
A
V
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
E
E
 
R
N
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
E
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
T
F
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
R
 
K
G
 
A
E
 
E
D
 
D
R
|
R
Q
 
R
K
 
R
F
 
F
K
 
D
D
 
V
I
 
A
V
 
M
T
 
K
K
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
G
V
 
I
C
 
A
F
 
H
T
 
T
M
 
M
D
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
L
D
 
A
T
 
V
V
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
F
P
 
P
V
 
C
V
x
I
V
 
I
R
|
R
P
 
P
S
 
S
F
 
F
T
 
T
M
|
M
G
|
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
S
 
N
A
 
R
E
 
E
D
 
E
V
 
F
E
 
E
R
 
E
M
 
I
A
 
C
G
 
A
D
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
T
A
x
K
N
 
E
V
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
D
E
|
E
S
 
S
I
x
L
Y
x
I
G
 
G
W
 
W
K
 
K
E
|
E
Y
 
Y
E
 
E
L
 
M
E
 
E
L
 
V
M
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
K
H
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
C
V
 
I
V
 
I
V
 
V
C
 
C
S
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
A
M
|
M
G
|
G
V
x
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
K
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
I
M
 
M
R
 
R
T
 
N
L
 
A
G
 
S
I
 
M
E
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
S
N
|
N
I
 
V
Q
|
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
K
 
K
D
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
I
|
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
V
S
 
S
R
|
R
S
|
S
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
P
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
L
V
 
M
N
 
N
D
|
D
I
 
I
T
 
T
-
 
G
K
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
C
 
S
F
 
F
E
 
E
P
 
P
T
 
S
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
I
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
N
F
 
F
E
 
E
K
 
K
F
 
F
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
D
T
 
R
L
 
L
T
 
T
T
|
T
T
 
Q
M
 
M
K
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
V
M
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
T
F
 
Q
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
L
G
 
Q
K
 
K
V
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
A
A
 
T
G
 
G
F
 
F
W
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
K
G
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
-
 
D
-
 
P
E
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
E
L
 
L
H
 
K
T
 
D
A
 
A
T
 
G
D
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
I
Y
 
W
D
 
Y
I
 
I
E
 
A
Y
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
V
A
 
F
V
 
N
A
 
L
S
 
T
G
 
N
V
 
I
D
 
D
P
 
R
W
 
W
F
 
F
V
 
L
E
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
E
A
 
E
E
 
K
L
 
V
I
 
A
D
 
E
A
 
V
P
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
L
 
L
G
 
N
E
 
A
E
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
S
 
L
K
 
K
H
 
R
N
 
K
G
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
R
 
A
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
L
 
L
A
 
A
G
|
G
-
 
V
-
 
R
E
 
E
M
 
A
G
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
R
 
Q
L
 
Y
G
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
K
 
K
T
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
T
C
 
C
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
A
A
 
T
R
 
D
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
H
 
M
Y
 
Y
S
 
S
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
L
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
E
E
 
E
T
 
C
E
 
E
V
 
A
A
 
N
P
 
P
Q
 
S
A
 
T
E
 
D
R
 
R
P
 
E
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
S
 
C
C
 
C
V
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
S
T
 
L
T
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
E
A
 
D
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
V
 
I
M
 
M
I
 
V
N
 
N
C
 
C
N
 
N
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
T
F
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
Y
 
R
A
 
I
E
 
E
Q
x
K
A
 
P
S
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
R
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
G
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
Q
E
 
H
V
 
A
L
 
V
R
 
E
R
 
R
A
 
L
G
 
K
L
 
L
P
 
K
A
 
Q
P
 
P
R
 
A
F
 
N
G
 
A
M
 
T
A
 
V
T
 
T
S
 
A
F
 
I
D
 
E
Q
 
M
A
 
A
R
 
V
R
 
E
I
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
L
L
 
V
V
 
V
R
|
R
P
 
P
S
 
A
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
|
M
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
E
 
A
T
 
D
L
 
L
E
 
R
G
 
R
Y
 
Y
I
 
F
T
 
Q
R
 
T
A
 
A
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
V
L
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
H
F
|
F
L
|
L
E
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
V
E
|
E
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
C
 
C
D
|
D
G
 
G
T
 
E
E
 
M
V
 
V
Y
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
M
 
M
E
 
E
H
 
H
I
 
I
E
|
E
E
 
Q
A
|
A
G
|
G
I
x
V
H
|
H
S
 
S
G
 
G
D
|
D
S
 
S
A
 
A
C
 
C
A
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
V
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
S
R
 
Q
S
 
E
D
 
I
I
 
Q
E
 
D
A
 
V
V
 
M
R
 
R
R
 
Q
A
 
Q
T
 
V
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
E
I
 
L
G
 
Q
V
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
M
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
Y
 
F
A
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
N
D
 
N
V
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
L
 
I
E
|
E
A
 
V
N
|
N
P
 
P
R
 
R
A
 
A
S
 
A
R
|
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
V
M
 
M
L
 
A
G
 
G
A
 
K
T
 
S
I
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
T
 
T
A
 
K
R
 
E
N
 
V
A
 
I
P
 
P
-
 
P
-
 
Y
V
 
Y
A
 
S
V
 
V
K
 
K
E
|
E
A
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
H
 
N
R
 
K
F
 
F
R
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
x
P
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
|
L
G
 
G
P
|
P
E
 
E
M
 
M
K
 
R
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
G
A
 
R
D
 
T
F
 
F
G
 
A
S
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
A
Q
 
Q
T
 
L
A
 
G
A
 
S
Y
 
N
G
 
S
S
 
T
L
 
M
P
 
K
A
 
K
Q
 
H
G
 
G
T
 
R
V
 
A
F
 
L
V
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
R
N
 
E
R
 
G
D
 
D
K
|
K
R
 
E
S
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
D
P
 
L
V
 
A
K
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
L
D
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
E
V
 
L
L
 
D
A
 
A
T
|
T
E
 
H
G
|
G
T
|
T
A
 
A
E
 
I
M
 
V
L
 
L
R
 
G
R
 
E
N
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
N
C
 
P
E
 
R
E
 
L
V
 
V
R
 
N
K
|
K
H
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
F
 
V
S
 
H
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
S
 
Q
A
 
-
V
 
-
D
 
D
A
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
N
G
 
G
H
 
E
V
 
Y
D
 
T
M
 
Y
V
 
I
I
 
I
N
|
N
T
|
T
P
x
T
Y
 
S
G
 
G
N
 
R
S
 
R
G
 
A
P
 
I
R
 
E
I
 
-
D
 
D
G
x
S
Y
 
R
E
 
V
I
|
I
R
 
R
S
 
R
A
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
Q
M
 
Y
N
 
K
I
 
V
P
 
H
C
 
Y
V
x
D
T
|
T
T
 
T
V
 
L
Q
 
N
G
 
G
A
 
G
S
 
F
A
 
A
A
 
T
V
 
A
Q
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
D
I
 
-
R
 
-
G
 
A
D
 
T
I
 
E
G
 
K
V
 
V
R
 
I
S
 
S
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
M
H
 
H
S
 
A
A
 
Q
L
 
I